Zdeňka Veselá Tel.: Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i.

Podobné dokumenty
Zdeňka Veselá Tel.: Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i.

Předpověď plemenné hodnoty Něco málo z praxe. Zdeňka Veselá

Základy genetiky populací

Genetika kvantitativních znaků. - principy, vlastnosti a aplikace statistiky

LINEÁRNÍ MODELY. Zdeňka Veselá

Cvičeníč. 9: Dědičnost kvantitativních znaků; Genetika populací. KBI/GENE: Mgr. Zbyněk Houdek

Biologie a genetika, BSP, LS7 2014/2015, Ivan Literák

Hodnocení plemenných + chovných + užitkových prasat

Odhad plemenné hodnoty u plemene Salers

Genetika kvantitativních znaků

Proč nový systém odhadu plemenných hodnot?

GENETIKA POPULACÍ KVANTITATIVNÍCH ZNAKŮ

Z D E Ň K A V E S E L Á, V E S E L A. Z D E N K V U Z V. C Z

Hodnocení plemenných + chovných + užitkových prasat

Základní pojmy obecné genetiky, kvalitativní a kvantitativní znaky, vztahy mezi geny

Předm luva A notace/a n n o tatio n... 15

Selekce. Zdeňka Veselá

4. Genetické základy šlechtění hospodářských zvířat

Konzervační genetika INBREEDING. Dana Šafářová Katedra buněčné biologie a genetiky Univerzita Palackého, Olomouc OPVK (CZ.1.07/2.2.00/28.

KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Ekonomické hodnoty znaků masného skotu

ŠLECHTĚNÍ MASNÉHO SKOTU

Mgr. et Mgr. Lenka Falková. Laboratoř agrogenomiky. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita

Katedra speciální zootechniky, FAPPZ ČZU Praha

8.2 PLEMENÁŘSKÁ PRÁCE V CHOVU SKOTU

Mezinárodní genetické hodnocení masného skotu

INTERAKCE NEALELNÍCH GENŮ POLYGENNÍ DĚDIČNOST

INTERAKCE NEALELNÍCH GENŮ POLYGENNÍ DĚDIČNOST

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

8 Odhad plemenné hodnoty (OPH)

Šlechtitelské + hybridizační programy

Selekční indexy v praxi. Josef Kučera

Mezinárodní genetické hodnocení skotu. Zdeňka Veselá

PŘEDPOVĚĎ PLEMENNÝCH HODNOT PRO POČET ODCHOVANÝCH JEHŇAT

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

- úvod, význam, aplikace

PŘEDPOVĚĎ PLEMENNÝCH HODNOT PRO POČET ODCHOVANÝCH JEHŇAT

Heritabilita. Heritabilita = dědivost Podíl aditivního rozptylu na celkovém fenotypovém rozptylu Výpočet heritability

Aplikace molekulárně- genetických dat ve šlechtění. Humpolíček Petr

Působení genů. Gen. Znak

SPOLEHLIVOST PŘEDPOVĚDI PLEMENNÝCH HODNOT PRO ZNAKY ZEVNĚJŠKU HODNOCENÝCH LINEÁRNÍM POPISEM U TEPLOKREVNÝCH PLEMEN KONÍ

Základy genetiky 2a. Přípravný kurz Komb.forma studia oboru Všeobecná sestra

Možnosti selekce na zlepšenou konverzi krmiva u ovcí

VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY,

CERTIFIKOVANÁ METODIKA

Popis modelu pro odhady PH mléčné užitkovosti

Popis modelu pro odhady PH mléčné užitkovosti

- Definice inbreedingu a jeho teorie

Příbuznost a inbreeding

GENOMIKA - "STATUS QUO A QUO VADIS"

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Genetické parametry a plemenná hodnota pro hodnocení JUT skotu systémem SEUROP

Popis stanovení plemenné hodnoty pro plodnost u plemene H

PŘEDPOVĚĎ PLEMENNÝCH HODNOT PRO ZNAKY ZEVNĚJŠKU HODNOCENÝCH LINEÁRNÍM POPISEM U TEPLOKREVNÝCH PLEMEN KONÍ

SPOLEHLIVOST PŘEDPOVĚDI PLEMENNÝCH HODNOT PRO SKOKOVOU VÝKONNOST U TEPLOKREVNÝCH PLEMEN KONÍ

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Geny p řevážně nepůsobí izolovan ě izolovan ale, v kontextu s okolním prostředím (vnitřním i vnějším) ě a v souladu souladu s ostatními g eny geny.

Genetika přehled zkouškových otázek:

OBECNÁ GENETIKA. Gen ást DNA, schopná funkn zabezpeit syntézu aktivní jednotky. Genotyp soubor gen, uruje rozsah a míru fenotypových možností

Předpověď plemenné hodnoty. Zdeňka Veselá

BLUP. Zdeňka Veselá

Genetické hodnocení rodní? Josef Kučera

P1 AA BB CC DD ee ff gg hh x P2 aa bb cc dd EE FF GG HH Aa Bb Cc Dd Ee Ff Gg Hh

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

CERTIFIKOVANÁ METODIKA

Základní pravidla dědičnosti

Předpověď plemenné hodnoty neboli skokový index v chovatelské praxi

Metody plemenitby. plemenitba = záměrné a cílevědomé připařování + rozmnožování zvířat zlepšování tvarových + především užitkových vlastností

Nauka o dědičnosti a proměnlivosti

Základní principy šlechtění a hodnocení skotu v ČR

Schváleno členským shromážděním dne ŠLECHTITELSKÝ PROGRAM ČESKÉHO HOLŠTÝNSKÉHO SKOTU

Genetika vzácných druhů zuzmun

PŘEDPOVĚĎ PLEMENNÝCH HODNOT PRO ZNAKY ZEVNĚJŠKU POPISOVANÉ LINEÁRNÍM POPISEM U CHLADNOKREVNÝCH KONÍ: českomoravský belgik, norik a slezský norik

Odhad plemenné hodnoty

PhD. České Budějovice

Koncept heritability

Selekční efekt. Úvod do šlechtění zvířat 1

Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/

Mendelistická genetika

Využití sonografie při hodnocení růstu zvířat Ježková, A. Stádník, L. Louda, F. Dvořáková, J. Kolářský, F.

Genotypy absolutní frekvence relativní frekvence

Experiment s dlouhodobou selekcí krav na ukazatele produkce a zdravotního stavu v Norsku Ing. Pavel Bucek, Českomoravská společnost chovatelů, a.s.

QTL u koní. Kmen je skupina koní v rámci plemene, odlišných morfologických a užitkových vlastností (šlechtění na tažné a jezdecké využití).

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Kontrola užitkovosti a dědičnosti

Cvičení č. 8. KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/

genů - komplementarita

Hardy-Weinbergův zákon - cvičení

SELEKCE.

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

1 VÝZKUM V OBLASTI ŠLECHTĚNÍ ZVÍŘAT

Příklady z populační genetiky volně žijících živočichů

GZW / SIC. Kdo, nebo co určuje směřování plemene?

Katedra speciální zootechniky, FAPPZ ČZU Praha. Šlechtění masného skotu v ČR

MENDELOVA UNIVERZITA V BRNĚ AGRONOMICKÁ FAKULTA BAKALÁŘSKÁ PRÁCE

VYHODNOCENÍ PRODUKČNÍCH UKAZATELŮ U VYBRANÝCH HYBRIDNÍCH KOMBINACÍ JATEČNÝCH PRASAT V PODMÍNKÁCH TESTAČNÍHO ZAŘÍZENÍ

Transkript:

BIOTECHNOLOGICKÉ METODY VE ŠLECHTĚNÍ HOSPODÁŘSKÝCH ZVÍŘAT Zdeňka Veselá vesela.zdenka@vuzv.cz Tel.: 267009571 Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i.

Co je šlechtění? Soustavné zlepšování genetických schopností zvířat a zlepšování ekonomické efektivnosti chovu Jedna z nejefektivnějších činností s největší návratností vložených prostředků

O čem budeme mluvit? Genetické základy kvantitativních vlastností Základní zásady šlechtění Předpověď plemenné hodnoty Lineární modely BLUP sire model, animal model Spolehlivost předpovědi plemenné hodnoty Selekce, selekční indexy a ekonomické hodnoty Optimalizace selekčních programů, metoda toku genů a stochastické simulace Genomická selekce Mezinárodní genetické hodnocení Hybridizace Předpověď plemenné hodnoty praxe

Doporučená literatura JAKUBEC V., BEZDÍČEK J., LOUDA F. Selekce inbríding hybridizace. Agrovýzkum Rapotín s.r.o., s. 382, 2010. JAKUBEC V., ŘÍHA J., GOLDA J., MAJZLÍK I. Odhad plemenné hodnoty hospodářských zvířat. Rapotín, s. 177, 1999. MRODE R.A., THOMPSON R. Linear Models for the Prediction of Animal Breeding Values, CABI Publishing. s. 344, 2005.

Doporučená literatura JAKUBEC V., BEZDÍČEK J., LOUDA F. Selekce inbríding hybridizace. Agrovýzkum Rapotín s.r.o., s. 382, 2010. http://www.vuchs.cz/

Doporučená literatura JAKUBEC V., ŘÍHA J., GOLDA J., MAJZLÍK I. Odhad plemenné hodnoty hospodářských zvířat. Rapotín, s. 177, 1999.

Doporučená literatura MRODE R.A., THOMPSON R. Linear Models for the Prediction of Animal Breeding Values, CABI Publishing. s. 344, 2005.

Doporučená literatura PRIBYL et al. Genetic evaluation by linear models using own algorithms and standard software, VÚŽV, 2014. http://www.vuzv.cz/index.php?p=vydavatels ka_cinnost_kategorie&id=123

Genetické základy kvantitativních vlastností Kvalitativní vlastnosti (znaky) Diskontinuitní proměnlivost - Bezrohost - Zbarvení srsti - Krevní skupiny - Geny velkého účinku Majorgeny Kvantitativní vlastnosti Kontinuitní proměnlivost - Hmotnost zvířat - Produkce mléka - Produkce masa - Geny malého účinku Polygeny Vlastnosti měřitelné

Genetické základy kvantitativních vlastností Kvalitativní vlastnosti (znaky) Kvantitativní vlastnosti MENDELISTICKÁ GENETIKA KVANTITATIVNÍ GENETIKA

Kvantitativní vlastnosti Geny malého účinku polygeny Polygenní proměnlivost Vlastnosti užitkovosti a výkonnosti

Kvantitativní vlastnosti Kontinuitní - Hmotnost zvířat - Produkce mléka - Produkce masa - Diskontinuitní (Prahové) - Velikost vrhu - Popis zevnějšku - - podmíněné polygeny - ale nevykazují spojitou proměnlivost

Kvantitativní vlastnosti Kontinuitní Diskontinuitní (Prahové)

Kvantitativní genetika Ve skutečnosti aplikovaná statistika

Šlechtění

Kvantitativní vlastnosti První krok statistická analýza Vykazuje rozdělení četností vlastnosti normální hodnocení? SAS: proc univariate Průměry, směrodatné odchylky, variance SAS: proc means

S čím pracujeme? Základní statistické analýzy a sestavení souborů SAS http://www.sas.com/offices/europe/czech/ R project http://www.r-project.org/

SAS Jak získat? SAS University Edition ZDARMA KE STAŽENÍ http://www.sas.com/cs_cz/software/universityedition.html Od školy Školy v akademickém programu SAS (např. ČZU) SAS OnDemand for Academics CLOUD http://www.sas.com/en_us/industry/highereducation/on-demand-for-academics.html

SAS University Edition http://www.sas.com/cs_cz/software/university-edition.html

SAS Jak se naučit? E-learning kurzy http://www.sas.com/images/email/temp/corporate/26 626.html Kdykoliv, odkudkoliv, zdarma

SAS Podporuje studenty! www.sas.com/academic SAS Prize Uzávěrka většinou na podzim http://support.sas.com/learn /ap/student/amb.html Kontakt: academic@cze.sas.com

Kvantitativní vlastnosti První krok statistická analýza Vykazuje rozdělení četností vlastnosti normální hodnocení? SAS: proc univariate Průměry, směrodatné odchylky, variance SAS: proc means

Normální rozdělení N(μ,σ 2 )

Kvantitativní vlastnosti První krok statistická analýza Vykazuje rozdělení četností vlastnosti normální hodnocení? SAS: proc univariate Průměry, směrodatné odchylky, variance SAS: proc means

Fenotypová hodnota Naměřená hodnota (užitkovost) P = G + E P fenotypová hodnota G genotypová hodnota Dědičný základ jedince E odchylka způsobená prostředím Všechny negenetické vlivy

Fenotypová hodnota Pro celou populaci platí: E 0 Z toho plyne: Střední hodnota P G

Genotypová hodnota G = A + D G genotypová hodnota A plemenná hodnota aditivně genetický efekt D hodnota dominance

GENOTYPOVÁ HODNOTA GENOTYP Genotypová hodnota Aditivně-dominantní model s 1 lokusem a 2 alelami A 2 A 2 A 1 A 2 A 1 A 1 - a 0 d + a Závisí na stupni dominance

GENOTYPOVÁ HODNOTA GENOTYP Genotypová hodnota Aditivně-dominantní model s 1 lokusem a 2 alelami A 2 A 2 A 1 A 2 A 1 A 1 - a 0 d + a Neúplná dominance

GENOTYPOVÁ HODNOTA GENOTYP Genotypová hodnota Aditivně-dominantní model s 1 lokusem a 2 alelami A 2 A 2 A 1 A 2 A 1 A 1 - a d = 0 + a Neexistuje dominance

GENOTYPOVÁ HODNOTA GENOTYP Genotypová hodnota Aditivně-dominantní model s 1 lokusem a 2 alelami A 1 A 2 A 2 A 2 A 1 A 1 - a 0 d = + a Úplná dominance

GENOTYPOVÁ HODNOTA GENOTYP Genotypová hodnota Aditivně-dominantní model s 1 lokusem a 2 alelami A 2 A 2 A 1 A 1 A 1 A 2 - a 0 + a d Superdominance

Plemenná hodnota Genotyp podmíněný aditivním působením genů A (aditivně genetický efekt) G = A + D G genotypová hodnota A plemenná hodnota aditivně genetický efekt D hodnota dominance

Plemenná hodnota Genotyp podmíněný aditivním působením genů A (aditivně genetický efekt) Lze vyjádřit V absolutních jednotkách Odchylka od populačního průměru Součet průměrných účinků genů nalézajících se u jedince přes všechny páry alel a všechny lokusy

Plemenná hodnota Přírůstek jehňat (průměrný účinek genů) A a = 20 g / den B b = 20 g / den C c = 20 g / den

Plemenná hodnota Součet všech plemenných hodnot v populaci = 0 (resp. průměrné hodnotě fenotypové / genotypové pokud je PH vyjádřena v absolutních jednotkách)

Kvantitativní vlastnosti První krok statistická analýza Vykazuje rozdělení četností vlastnosti normální hodnocení? SAS: proc univariate Průměry, směrodatné odchylky, variance SAS: proc means

Variance Proměnlivost σ 2

Fenotypová variance σ P2 = σ G 2 + σ E 2 σ P 2 fenotypová variance σ G2 genotypová variance σ E 2 variance prostředí σ G 2 = σ A 2 + σ D 2 + σ I 2 σ A 2 aditivní variance σ D 2 variance dominance (intralokusová) σ I 2 variance interakce (interlokusová)

Aditivně genetická variance σ A 2 aditivní variance = aditivně genetická variance 1. Hlavní parametr pro popis příbuznosti mezi příbuznými jedinci 2. Důležitý faktor selekčního pokroku 3. Slouží k odvození koeficientu dědivosti h 2 = σ A 2 / σ P 2

CVIČENÍ