BLUP. Zdeňka Veselá

HTML
DOWNLOAD

Rozměr: px

Začít zobrazení ze stránky:

Download "BLUP. Zdeňka Veselá"

Věra Bláhová
před 6 lety
Počet zobrazení:

1 BLUP deňk Veselá

2 BLUP V prxi předpověď plemenné hodnot pomocí BLUP Best Liner Unised Prediction Sstém rovnic lineárních modelů se smíšenými efekt Fixní efekt npř. věk mtk, pohlví, plemeno, rok Náhodné efekt npř. plemenná hodnot, mternální efekt, trvlé prostředí

3 BLUP Modifikovné rovnice zoecněných nejmenších čtverců Momentálně nejčstější nejrozšířenější metod předpovědi PH Doporučená litertur: MODE.A.: Liner models for the prediction for niml reeding vlues JAKUBEC V. kol.: Odhd plemenné hodnot hospodářských zvířt

4 BLUP Lineární model se smíšenými efekt = + + e n vektor pozorování, n = počet pozorování p vektor fixních efektů, p = počet úrovní fixních efektů q vektor náhodných efektů, q = počet úrovní náhodných efektů e n vektor náhodných residuálních efektů incidenční (strukturní, designová) mtice dimense n p incidenční mtice dimense n q

5 BLUP Lineární model se smíšenými efekt = + + e Lze znázornit i sklárním zápisem ijk = μ + i + β j + e ijk ijk užitkovost jedince μ průměr populce i - fixní efekt i β j náhodný efekt j s průměrem vrincí σ β e eik náhodný chový efekt (reziduum)

6 BLUP Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G Trnsponovné mtice

7 BLUP Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G Užitkovost

8 BLUP Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G ncidenční mtice fixních efektů

9 BLUP Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G ncidenční mtice náhodných efektů

10 BLUP Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G Odhdovné fixní efekt

11 BLUP Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G Předpovídné náhodné efekt

12 BLUP Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G ozptlová mtice reziduálních efektů prvidl sklární mtice σ e (rezidu nejsou korelovná mjí konstntní vrinci) Oě strn rovnice lze vnásoit

13 BLUP Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G e ozptlová mtice náhodných efektů ůzná struktur podle toho, jké náhodné efekt předpovídáme

14 Předpovídáme PH pro plemeník (otce) dle užitkovostí jejich potomků Náhodný efekt v modelu je otec Předpokládáme-li, že plemeníci mezi seou nejsou příuzní mjí stejnou vrinci σ s ozptlová mtice náhodného efektu (otec) ude G = σ s G - = (/σ s)

15 Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G e G - σ e = (σ e / σ s) = α α = σ e / σ s = (4 h ) / h

16 Soustv normálních rovnic (Henderson) Mixed Model Eqution (MME) G - σ e = (σ e / σ s) = α α = σ e / σ s = (4 h ) / h

17 PŘÍKLAD Máme k dispozici produkci mlék dcer 5 ýků z denní zkrácenou první lktci. Dcer se ncházejí ve 3 stádech (viz t). Cílem cvičení je odhdnou fixní efekt stád předpovědět plemennou hodnotu otců. Otcovské efekt předstvují náhodný výěr z množin otců se střední hodnotou rovnjící se s vrincí 45 kg. Kždá užitkovost oshuje vedle stádových otcovských efektů jeden náhodný reziduální efekt se střední hodnotou vrincí 4655 kg. Předpokládáme, že otcovské efekt jsou n soě nezávislé, tj. otcové nejsou mezi seou příuzní. Dále vpočítejte stndrdní chu předpovědi, spolehlivost přesnost předpovědi plemenných hodnot ýk. Číslo dcer Stádo Otec Produkce mlék v kg

18 PŘÍKLAD ozptlová mtice náhodných efektů σ s = 45 kg σ e = 4655 kg α = σ e / σ s = 4655 / 45 =

19 PŘÍKLAD ncidenční mtice pevného efektu stádo Dcer v. stádě Dcer v. stádě Dcer 3 v. stádě

20 PŘÍKLAD ncidenční mtice náhodného efektu otec Dcer po otci 3 Dcer po otci 5 Dcer 3 po otci

21 PŘÍKLAD ncidenční mtice náhodného efektu otec Dcer po otci 3 Dcer po otci 5 Dcer 3 po otci

22 PŘÍKLAD 5 3

23 PŘÍKLAD 5 3 V. stádě jedinci V. stádě 3 jedinci Ve 3. stádě 5 jedinců Žádný jedinec není zároveň ve stádech

24 PŘÍKLAD Otec má ve stádě dcer Otec 3 má ve stádě dceru Ve stádě je: dcer po otci dcer po otci dcer po otci 5 Otec 4 5 nemjí Žádnou dceru ve Stádě Otec 4 má dcer ve stádě 3

25 PŘÍKLAD 3 Otec má dceru Otec má dcer

26 PŘÍKLAD Součet užitkovosti plemenic ve stádě je: = 69

27 PŘÍKLAD Součet užitkovosti dcer otce 5 je: = 9

28 PŘÍKLAD

29 PŘÍKLAD ovnice smíšeného modelu: s s s s s

30 PŘÍKLAD ovnice smíšeného modelu: s s s s s

31 PŘÍKLAD ovnice smíšeného modelu: s s s s s

32 PŘÍKLAD nverze mtice LS získáme mtici C

33 PŘÍKLAD Vektor s odhdnutými fixními efekt předpovězenými náhodnými efekt 35,7 48,46 6,89 4,6 4,8 339, 38, , s s s s s

34 PŘÍKLAD Digonální prvk inverze rovnic smíšeného modelu c c c c

35 PŘÍKLAD Digonální prvk inverze rovnic smíšeného modelu c c c c

36 PŘÍKLAD Predikovná chová vrince (PEV) Stndrdní ch předpovědi (SEP) Spolehlivost předpovědi Přesnost předpovědi e d i SEP e d i PEV e d i r r r

37 PŘÍKLAD Stndrdní ch předpovědi (SEP) SEP d i e SEP, ,89 SEP, ,9 SEP, ,56 SEP, ,9 SEP, ,9

38 PŘÍKLAD Spolehlivost předpovědi i d r,9 9,4786,58 9,4956,6 9,49345,7 9,48933,33 9,5876 r r r r r

39 PŘÍKLAD Přesnost předpovědi r r,3,9,4,58,5,6,65,7,83,33 r r r r r

40 Příště: BLUP ANMAL MODEL

Podobné dokumenty

Předpověď plemenné hodnoty. Zdeňka Veselá

Předpověď plemenné hodnoty. Zdeňka Veselá Předpověď plemenné hodnot Zdeňk Veselá vesel.zdenk@vuzv.cz UŽITKOVOST Kvntittivní vlstnosti vkzující zprvidl kontinuitní rozdělení v populci Nemůžeme přímo usuzovt n genotp Jsme odkázáni n biometrické