Histochemické techniky u rostlin. Fixace Zalévání Krájení řezů Inkubace řezů

Podobné dokumenty
Histochemie. Histochemie. Histochemie Příklady histochemických metod: Ionty. Histochemie Příklady histochemických metod: Ionty

Modul IB. Histochemie. CBO Odd. histologie a embryologie. MUDr. Martin Špaček

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

IMUNOCYTOCHEMICKÁ METODA JEJÍ PRINCIP A VYUŽITÍ V LABORATOŘI

Přehled histologických barvení včetně imunohistochemie

Protokol 04. pšeničná bílkovina. masné výrobky. zkrácená verze

Speciální metody v histologii

histologie je nauka o mikroskopické skladbě organismu zkoumá skladbu těla živočišného i rostlinného, důležitá v humánní medicíně histologický preparát

Struktura a skladba potravin Magisterský studijní program. Přednáška 4.

Popis N-Histofine Simple Stain MAX PO (MULTI) (Univerzální imuno-peroxidázový polymer, anti-myší a antikráličí):

Imunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky

Řezové preparáty Barvení histologické a histochemické. Řezy ruční žiletka, břitva, ruční mikrotom Řezy připravené mikrotomem

Řezové preparáty Barvení histologické a histochemické. Řezy ruční žiletka, břitva, ruční mikrotom Řezy připravené mikrotomem

V organismu se bílkoviny nedají nahradit žádnými jinými sloučeninami, jen jako zdroj energie je mohou nahradit sacharidy a lipidy.

5. BEZPEČNOSTNÍ OPATŘENÍ PŘI POUŽITÍ A MANIPULACI

1 Popis vzorku. 2 Detekční limit vyšetření. 3 Časová náročnost. 4 Zpracování vzorku. 4.1 Množství vzorku. 4.2 Odběr vzorků

BÍLKOVINY. V organismu se nedají nahradit jinými sloučeninami, jen jako zdroj energie je mohou nahradit sacharidy a lipidy.

Fluorescenční vyšetření rostlinných surovin. 10. cvičení

Metody v histologii Mikroskop Vj. 4

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

Název školy: Střední odborná škola stavební Karlovy Vary Sabinovo náměstí 16, Karlovy Vary Autor: Hana Turoňová Název materiálu:

BUNĚČ ORGANISMŮ KLÍČOVÁ SLOVA:

Chemie 2018 CAUS strana 1 (celkem 5)

Oligobiogenní prvky bývají běžnou součástí organismů, ale v těle jich již podstatně méně (do 1%) než prvků makrobiogenních.

Histochemie a imunohistochemie, elektronová mikroskopie

Vzdělávací oblast: Člověk a příroda. Vyučovací předmět: Chemie. Třída: kvarta. Očekávané výstupy. Poznámky. Přesahy. Průřezová témata.

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Buňka cytologie. Buňka. Autor: Katka Téma: buňka stavba Ročník: 1.

2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

HYDROXYDERIVÁTY UHLOVODÍKŮ

10 CHEMIE Charakteristika vyučovacího předmětu Vzdělávací obsah

Fixace Uzavírací média

HYDROXYDERIVÁTY. Alkoholy Fenoly Bc. Miroslava Wilczková

Vymezení biochemie moderní vědní obor, který chemickými metodami zkoumá biologické děje (bios = řecky život) spojuje chemii s biologií poznatky velmi

Principy a příklady imunohistochemie

Chelatometrie. Stanovení tvrdosti vody

8. Polysacharidy, glykoproteiny a proteoglykany

Aldehydy, ketony, karboxylové kyseliny

IMUNOHISTOCHEMIE

Vitální barvení, rostlinná buňka, buněčné organely

Obecná Zoologie Pro kombinované i denní studium biologie Doplněk skript Opora OZ, kap. 8

CHE NÁRODNÍ SROVNÁVACÍ ZKOUŠKY DUBNA : 28. dubna 2018 : 30

2) Připravte si 7 sad po pěti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

Buňka buňka je základní stavební a funkční jednotka živých organismů

Základy imunologických metod: interakce antigen-protilátka využití v laboratorních metodách

ZŠ ÚnO, Bratří Čapků 1332

BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ

Antiparalelní beta list

BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ

1. ročník Počet hodin

Protokol 04. pšeničná bílkovina. masné výrobky. plná verze

2. Karbonylové sloučeniny

Části postižených tkání či orgánů / záněty, benigní či

Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii

První testový úkol aminokyseliny a jejich vlastnosti

Vazivo. Chrupavka. Kost

Základem je vazba molekul imunoglobulinů s molekulami antigenů ve tkáni.

ŘEŠENÍ. PÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE Bakalářský studijní obor Bioorganická chemie a chemická biologie 2016

Aglutinace Mgr. Jana Nechvátalová

Aminokyseliny, peptidy a bílkoviny

Western blotting. 10% APS 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl

Rychlost chemické reakce je dána změnou Gibbsovy energie a aktivační energií: Tudíž zrychlení reakce pomocí katalýzy může být vyjádřeno:

!STUDENTI DONESOU! PET

Sekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch

PÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE Bakalářský studijní obor Bioorganická chemie a chemická biologie 2016

Rozdělení imunologických laboratorních metod

Precipitace, radioimunodifúze (RID), nefelometrie, turbidimetrie

Fluorescenční mikroskopie

Kultivační metody stanovení mikroorganismů

Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová

Charakteristika Teorie kyselin a zásad. Příprava kyselin Vlastnosti + typické reakce. Významné kyseliny. Arrheniova teorie Teorie Brönsted-Lowryho

Chemické složení organism? - maturitní otázka z biologie

PÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE bakalářský studijní obor Bioorganická chemie 2011

(cv04) Metody výroby mikroskopických preparátů z rostlinných pletiv (2. část) Preparáty pro dokumentaci tvorby dřeva a lýka

CHE NÁRODNÍ SROVNÁVACÍ ZKOUŠKY BŘEZNA : 29. března : 237

Teorie: Trávení: proces rozkladu molekul na menší molekuly za pomoci enzymů trávícího traktu

Precipitace, radioimunodifúze (RID), nefelometrie, turbidimetrie

POLYPEPTIDY. Provitaminy = organické sloučeniny bez vitaminózního účinku, které se v živočišném těle mění působením ÚV záření nebo enzymů na vitaminy.

Přijímací test z chemie a biologie, bakalářský obor Bioinformatika,

IMUNOFLUORESCENCE. Mgr. Petr Bejdák Ústav klinické imunologie a alergologie Fakultní nemocnice u sv. Anny a Lékařská fakulta MU

Projekt realizovaný na SPŠ Nové Město nad Metují

Energetický metabolizmus buňky

OBSAH 1 ÚVOD Výrobek a materiál Přehled a klasifikace materiálů pro výrobu ZDROJE DŘEVA... 13

Látky jako uhlík, dusík, kyslík a. z vnějšku a opět z něj vystupuje.

Prokaryota x Eukaryota. Vibrio cholerae

Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám

ÚVOD DO HISTOLOGICKÉ TECHNIKY A ZPRACOVÁNÍ VZORKŮ PRO SVĚTELNOU A ELEKTRONOVOU MIKROSKOPII ÚHE LF MU, 2016

FORMALDEHYD VE VNITŘNÍM OVZDUŠÍ STAVEB

Výukový materiál v rámci projektu OPVK 1.5 Peníze středním školám

Chemie 2015 CAU strana 1 (celkem 5)

Sada 7 Název souboru Ročník Předmět Formát Název výukového materiálu Anotace

Izolace nukleových kyselin

F l u o r e s c e n c e

Fluorescenční mikroskopie

UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 3. LÉKAŘSKÁ FAKULTA (tématické okruhy požadavků pro přijímací zkoušku)

Chemie 2016 CAU strana 1 (celkem 5) 1. Zápis 39

(cv03) Metody výroby mikroskopických preparátů z rostlinných pletiv

TEST + ŘEŠENÍ. PÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE bakalářský studijní obor Bioorganická chemie 2010

MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk / Jana Horáková

Transkript:

Histochemické techniky u rostlin Fixace Zalévání Krájení řezů Inkubace řezů

Histologie a histochemie původ názvu = z řečtiny: histos = tkáň logos = slovo, nauka histologie - vědní disciplína, která se zabývá studiem mikroskopické stavby živočišných tkání a rostlinných pletiv histochemie chemické reakce na úrovni živočišných tkání a rostlinných pletiv používají speciální techniky přípravy preparátů a mikroskop

Fixace fyzikální vymrazování chemická fixativa koagulující (alkoholy, kyselina octová, kyselina chrómová, osmium - koagulace cytoplazmatických proteinů ničí jejich aktivitu a strukturu organel (např. mitochondrie) fixativa nekoagulující formaldehyd, glutaraldehyd - zachovávají aktivitu proteinů i organely (pro histochemii a EM)

Fixace zachování buněk a pletiv ve stavu co nejbližšímu k živému stavu snížení strukturálních změn a změn chemického složení strukturální proteiny a jiné sloučeniny se musí změnit na nerozpustné ve všech reagenciích, se kterými přijdou v průběhu celého procesu do styku perfektní fixace = jen teoretická

Histochemie histologická metoda užívaná k průkazu různých látek přímo v pletivech a buňkách látkové složení katalytická histochemie imunohistochemie lektinová histochemie in situ hybridizace (ISH)

Odběr materiálu rychlý pokud je nutná preparace raději již ve fixáži velikost vzorků přiměřená pro rychlý průnik fixáže do celého objektu volba segmentů podle plánovaného studia

Formaldehyd je plyn s bodem varu -21 C používá se jako vodný roztok plynu (37-40%) formalín nebo pevný polymer - paraformaldehyd během skladování se zhoršuje kvalita formalínu vlivem tzv. Canizariho reakce, kdy vzniká kyselina mravenčí = prudké snižování ph neutralizace, pufry po primární vazbě na různé funkční skupiny se vytvářejí křížové vazby ( kroslinky ) - dochází k zesíťování molekul proteinů = nekoagulační fixace

Glutaraldehyd bezbarvá kapalina štiplavého zápachu je toxický a způsobuje vážné podráždění očí, nosu, krku a plic, bolesti hlavy, ospalost a závratě pracovat v digestoři, dodržovat zásady práce s toxickými látkami! používá se samostatně nebo ve směsi s formaldehydem zesíťování bílkovin pletiva po fixáži GA je mnohem pevnější - způsobuje větší tvrdost pletiv

Fixační směsi FA (PFA) 4% formalín v 0,1M TRIS / HCl pufru, ph 7,2 pufr ph 7,2: (4 ml 36% formaldehydu +32 ml pufru ) 0,2M TRIS 25 ml 0,1N HCl 45 ml doplnit destil. vodou do 100 ml Doba fixace 2 hod. (u citlivějšího materiálu 0,5 hod. na ledu při 0 o C) Propírání fixáže a kryoprezervace 7,5 % sacharózou ve stejném pufru

Kryostat příprava řezů

Druhy a způsoby barvení podle výsledku a aplikace Barvení in toto barvení celých objektů před zalitím a krájením řezů Barvení řezů řezy volné ( free floating sections ) řezy přilepené na podložním skle

Lepení řezů 1890 Mayer: glycerol bílek + fenol (thymol) chromová želatina ( gelatin and chrome alum ) poly-l-lysin podložní skla SuperFrost Ultra Plus - není nutno používat adheziva sušení na teplé ploténce

Látkové složení ionty (Ca 2+, Fe 2+, Fe 3+, Zn 2+, Cu 2+, Pb 2+ ) organické funkční skupiny cukry, polysacharidy (škrob, celulóza, kalóza) tuky DNA, RNA lignin

Průkaz tuků barví se barvivy rozpustnými v tucích Sudan IV, sudanová čerň, olejová červeň, nilská modř užívá se zpravidla fixace zmražením s následným krájením v kryostatu

Důkaz DNA - Feulgenova reakce hydrolýza 1N HCl RNA se rozpustí DNA hydrolyzuje částečně (odstraní se báze) vznik aldehydových skupin jejich následná reakce se Schiffovým reagens výsledek = nerozpustný červený reakční produkt

Fluorescenční vizualizace DNA DAPI = 4',6-diamidino-2-fenylindol fluorescenční barvivo, které se silně váže na DNA může procházet přes intaktní membrány (= je toxické a mutagenní) - může být použito pro barvení živých i fixovaných buněk často se používá pro barvení jader, detekci mykoplazmat a virové DNA v buněčných kulturách

Důkaz RNA organely obsahující RNA se barví bazickými barvivy např.: toluidinovou modří, methylenovou modří RNA však není jedinou bazofilní látkou v pletivech tkáních - nezbytná negativní kontrola = kontrolní preparát inkubovaná ribonukleázou

Cukry PAS (Periodic Acid Schiff) - pozitivní látky: polysacharidy(škrob, celulóza, kalóza, glykogen) glykosaminoglykany/ mukopolysacharidy/ (hyaluronová kys., chondroitinsulfát) proteoglykany glykoproteiny(thyreoglobulin, kolagen) glykolipidy(lipofuscin)

Katalytická histochemie lokalizace aktivity enzymů enzymy jsou katalyzátory většiny biochemických reakcí zpravidla fixace zmražením nebo aldehydy Princip: první reakce (histochemická): enzym + substrát reakční produkt druhá reakce (vizualizační): tvorba barevného nebo elektrondensního reakčního produktu Vždy nutnost kontrolních řezů (inaktivace, bez substrátu )

Katalytická histochemie vizualizační reakce precipitace s kationty kovů (Gomori) vznik barevné nerozpustné soli Pb, Co simultánní azokopulace reakční produkt I. reakce (naftol) se převede na azobarvivo indigogenní reakce štěpení substrátu na indoxyl a jeho dimerace a oxidace na indigo tetrazoliová metoda redukce tetrazoliové soli na barevný formazan spřažená peroxidázová reakce oxidace DAB

Klasifikace enzymů 1. hydrolytické enzymy (hydrolázy) fosfatázy (hydrolyzují estery a amidy kyseliny fosforečné) alkalické fosfatázy kyselé fosfatázy glukoso-6-fosfatázy adenosin trifosfatázy karboxylester-hydrolázy nespecifické esterázy lipázy cholinesterázy glykosidázy kyselé -glukosidázy -glukosidázy -galaktosidázy kyselé -galaktosidázy -glukuronidázy disacharidázy peptidázy sulfatázy

Klasifikace enzymů 2. transferázy 3. oxidoreduktázy a. oxidázy i. cytochrom c oxidáza ii. peroxidázy b. dehydrogenázy 4. lyázy i. koenzym-independentní dehydrogenázy 1. sukcinát dehydrogenáza 2. glycerol-3-fosfát-dehydrogenáza ii. tetrazolium reduktázy iii.koenzym-dependentní dehydrogenázy např. glutamát dehydrogenáza, malát dehydrogenáza, laktát dehydrogenáza

Gomoriho průkaz aktivity kyselé fosfatázy (precipitace s kationty kovů) řez pletivem + inkubační médium se substrátem štěpeným enzymem (např. glycerofosfát sodný) uvolnění fosfátových iontů jejich reakce s dusičnanem olovnatým výsledek: elektrodenzní precipitát Pb 3 (PO 4 ) 2

Indigo Indigofera tinctoria Indigofera sumatrana Isatis tinctoria dnes již vyráběné synteticky pro vlastní barvení řezů se nepoužívá, ale v histochemii jsou často používány tzv. indigogenní metody, při kterých je indigo výsledným produktem reakce

Indigogenní metoda 1. krok = štěpení substrátu enzymem kryostatový řez listem tabáku po inkubaci v médiu se substrátem tloušťka řezu 30 m 2. krok = dimerace a oxidace na indigo detekce aktivity -glukosidasy: substrátem pro enzym je 5-bromo-4-chloro-3-indoxyl- -D-glukopyranosid

Indigogenní metoda histochemické lokalizace aktivity β-glukosidasy Zm-p60.1 inkubace celé rostlinky, kultivace 28 DAS na MS s t-z transgenní tabák se Zm-p60.1 netransgenní kontrola substrát: 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-glukopyranosid Chmelík et al. 2010

Imunohistochemie slouží k průkazu tkáňových či buněčných antigenů pomocí vazby mezi antigenem a protilátkou antigeny = proteiny, glykoproteiny, proteoglykany protilátky = sérové proteiny imunoglobuliny (jsou vytvářeny plazmatickými buňkami) v imunohistochemii se nejčastěji používá třída IgG

Protilátka imunoglobulin IgG skládá se ze čtyř polypeptidových řetězců spojených disulfidickými můstky: 2 identických lehkých řetězců a 2 identických těžkých řetězců vazebná místa pro receptory

Epitopy = specifické místo antigenu, na které se váže protilátka, (antigenní determinanta) většina antigenů má více epitopů, které vyvolávají při imunizaci vznik skupiny různých protilátek (polyklonálních), namířených proti jednotlivým epitopům

Polyklonální protilátka Monoklonální protilátka

Přímá metoda značení protilátky Ab FITC TRITC Texas Red Cy3 Cy5 phycoeryt. HRP ALPase epitop

Nepřímá 2-stupňová metoda FITC TRITC Texas Red Cy3 Cy5 phycoeryt. HRP ALPase Ab2 Ab1 univerzálnější (různé primární protilátky (Ab1) reagují s jednou sekundární protilátkou (Ab2) citlivější

Montáž řezů nabarvené řezy je ještě potřeba zakonzervovat na podložním skle - říkáme zamontovat 1844 - J.E. Purkyně roku a jeho žák Oschatz popsali svoji metodu montování tak, že nabarvený řez prostě potřeli lakem. Užívali tzv. kopálovou pryskyřici, získanou z tropických stromů, ale znali již i kanadský balzám. Jejich preparáty z té doby jsou stále v dobrém stavu. kanadský balzám se užívá dodnes, ale používají se i syntetické pryskyřice

Odkazy na zajímavé stránky http://www.bristol.ac.uk/vetpath/cpl/histmeth.htm protokoly imunohistochemie http://www.ihcworld.com/antibody_staining.htm protokoly barvení pro pletiva zalitá v pryskyřici http://www.ebsciences.com/staining/orcein.htm encyklopedie http://en.wikipedia.org/wiki/staining