BLM I 7: TEXT KE STUDIU

Podobné dokumenty
Základní pojmy. Je násobkem zvětšení objektivu a okuláru

MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ

Mikroskopické metody Přednáška č. 3. Základy mikroskopie. Kontrast ve světelném mikroskopu

Základní pojmy a vztahy: Vlnová délka (λ): vzdálenost dvou nejbližších bodů vlnění kmitajících ve stejné fázi

M I K R O S K O P I E

Zoologická mikrotechnika - FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE

Elektronová mikroskopie SEM, TEM, AFM

Fluorescenční vyšetření rostlinných surovin. 10. cvičení

1. Teorie mikroskopových metod

Proč elektronový mikroskop?

Optika pro mikroskopii materiálů I

Typy světelných mikroskopů

Využití a princip fluorescenční mikroskopie

Nízký nebo téměř žádný kontrast u biologických objektů

Neživá příroda I. Optické vlastnosti minerálů

VLNOVÁ OPTIKA. Mgr. Jan Ptáčník - GJVJ - Fyzika - Optika - 3. ročník

Fluorescenční mikroskopie

Fotografický aparát. Fotografický aparát. Fotografický aparát. Fotografický aparát. Fotografický aparát. Fotografický aparát

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Základy mikroskopie. Úkoly měření: Použité přístroje a pomůcky: Základní pojmy, teoretický úvod: Úloha č. 10

Fluorescenční mikroskopie

Základy světelné mikroskopie

Rozdělení přístroje zobrazovací

FYZIKÁLNÍ PRAKTIKUM FJFI ČVUT V PRAZE

Viková, M. : MIKROSKOPIE I Mikroskopie I M. Viková

Vlnová délka světla je cca 0,4 µm => rozlišovací schopnost cca. 0,2 µm 1000 x víc než oko

Geometrická optika. předmětu. Obrazový prostor prostor za optickou soustavou (většinou vpravo), v němž může ležet obraz

Viková, M. : MIKROSKOPIE II Mikroskopie II M. Viková

Úkoly. 1 Teoretický úvod. 1.1 Mikroskop

Techniky mikroskopie povrchů

Mikroskop ECLIPSE E200 STUDENTSKÝ NÁVOD K POUŽITÍ. určeno pro studenty ČZU v Praze

Příloha C. zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

Laboratorní cvičení z obecné mikrobiologie

příloha C zadávací dokumentace pro veřejnou zakázku malého rozsahu Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

3. Diferenciální interferenční kontrast (DIC)

vede sice ke zvýšení kontrastu, zároveň se ale snižuje rozlišení a ostrost obrazu (Obr. 46).

Optické metody a jejich aplikace v kompozitech s polymerní matricí

VÝUKOVÝ SOFTWARE PRO ANALÝZU A VIZUALIZACI INTERFERENČNÍCH JEVŮ

Digitální učební materiál

Optická (světelná) Mikroskopie pro TM I

Geometrická optika. Optické přístroje a soustavy. převážně jsou založeny na vzájemné interakci světelného pole s látkou nebo s jiným fyzikálním polem

5.3.5 Ohyb světla na překážkách

Historie světelné mikroskopie. Světelná mikroskopie. Robert Hook (1670) a Antonie van Leeuwenhoek (1670) zakladatelé světelné mikroskopie

F l u o r e s c e n c e

3.3. Mikroskopie Základní součásti světelného mikroskopu

Fytopatologická praktika

Světelný mikroskop - základní pracovní nástroj

Polarizace čtvrtvlnovou destičkou

27. Vlnové vlastnosti světla

1. Z přiložených objektivů vyberte dva, použijte je jako lupy a změřte jejich zvětšení a zorná pole přímou metodou.

C Mapy Kikuchiho linií 263. D Bodové difraktogramy 271. E Počítačové simulace pomocí programu JEMS 281. F Literatura pro další studium 289

FYZIKÁLNÍ PRAKTIKUM FJFI ČVUT V PRAZE

Světelný mikroskop - základní pracovní nástroj

Lupa a mikroskop příručka pro učitele

Bioimaging rostlinných buněk, CV.2

Základy mikroskopování

DIFRAKCE ELEKTRONŮ V KRYSTALECH, ZOBRAZENÍ ATOMŮ

Přednáška č.14. Optika

7 FYZIKÁLNÍ OPTIKA. Interference Ohyb Polarizace. Co je to ohyb? 27.2 Ohyb

3. Diferenciální interferenční kontrast (DIC)

ELEKTRONOVÁ MIKROSKOPIE V TEXTILNÍ METROLOGII

FYZIKÁLNÍ PRAKTIKUM FJFI ČVUT V PRAZE

Praktické cvičení č. 1.

LABORATORNÍ CVIČENÍ Z BIOLOGIE. Téma: STAVBA A FUNKCE MIKROSKOPU, PŘÍPRAVA DOČASNÝCH PREPARÁTŮ

Diagnostika amyloidózy z pohledu patologa Látalová P., Flodr P., Tichý M.

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

M I K R O S K O P I E

M I K R O S K O P I E

Přednáška 2_1. Konstrukce obrazu v mikroskopu Vady čoček Rozlišovací schopnost mikroskopu


ZPRACOVÁNÍ OBRAZU přednáška 3

Využití a princip fluorescenční mikroskopie

Video mikroskopická jednotka VMU

Zadání. Pracovní úkol. Pomůcky

3. Vlastnosti skla za normální teploty (mechanické, tepelné, optické, chemické, elektrické).

Základní pojmy Zobrazení zrcadlem, Zobrazení čočkou Lidské oko, Optické přístroje

Základní metody světelné mikroskopie

Nejdůležitější pojmy a vzorce učiva fyziky II. ročníku

Difrakce elektronů v krystalech a zobrazení atomů

Fyzika 2 - rámcové příklady vlnová optika, úvod do kvantové fyziky

Vitální barvení, rostlinná buňka, buněčné organely

ZJIŠŤOVÁNÍ CUKERNATOSTI VODNÝCH ROZTOKŮ OPTICKÝMI METODAMI

Měření a analýza mechanických vlastností materiálů a konstrukcí. 1. Určete moduly pružnosti E z ohybu tyče pro 4 různé materiály

Indikátory vitality dřevin (INVID)

Difrakce elektronů v krystalech, zobrazení atomů

Mikroskopie a rentgenová strukturní analýza

Spektroskopické é techniky a mikroskopie. Spektroskopie. Typy spektroskopických metod. Cirkulární dichroismus. Fluorescence UV-VIS

Charakteristiky optického záření

(Umělé) osvětlování pro analýzu obrazu

Otázky z optiky. Fyzika 4. ročník. Základní vlastnosti, lom, odraz, index lomu

Název a číslo materiálu VY_32_INOVACE_ICT_FYZIKA_OPTIKA

Technická specifikace předmětu veřejné zakázky

Světlo je elektromagnetické vlnění, které má ve vakuu vlnové délky od 390 nm do 770 nm.

1.1 Zobrazovací metody v optické mikroskopii

MULTIMEDIÁLNÍ A HYPERMEDIÁLNÍ SYSTÉMY

S v ě telné jevy. Optika - nauka - o světle, jeho vlastnostech a účincích - o přístrojích, které jsou založeny na zákonech šíření světla

Sada Optika. Kat. číslo

CÍLE CHEMICKÉ ANALÝZY

SBÍRKA ŘEŠENÝCH FYZIKÁLNÍCH ÚLOH

FYZIKA PRO IV. ROČNÍK GYMNÁZIA - OPTIKA 2. VLNOVÁ OPTIKA

Transkript:

BLM I 7: TEXT KE STUDIU ZÁKLADNÍ LITERATURA: http://www.are.cz/documents/zakladni_metody_svetelne_mikroskopie.pdf http://dml.cz/dmlcz/139719 (Plášek, Jaromír: Nové metody optické mikroskopie, 1996) http://triton.paru.cas.cz/old-lem/book/podkap/1.0.html (Elektronová mikroskopie pro biology, Jana Nebesářová, 2001) 1. K OBJEKTIVŮM: OBJEKTIVY - jsou jednou z nejvýznamnějších částí mikroskopu, která rozhoduje o jeho kvalitě, jejich vlastnosti prošly dlouhým vývojem - od jednoduché čočky až k dnešním dokonalým objektivům. Vlastnosti objektivů udávají číselné hodnoty pro zvětšení, numerickou aperturu, parfokální vzdálenost, pozorovací (pracovní) vzdálenost a průměr vstupní/výstupní pupily. Numerická apertura je součin indexu lomu prostředí mezi vstupní čočkou objektivu a preparátem (krycím sklem) a sinem poloviny otvorového úhlu objektivu. Je měřítkem pro dosažitelnou rozlišovací schopnost objektivu, a tím též pro jeho zvětšení a pro světelný tok, který může objektiv zachytit. Parfokální vzdálenost je vzdálenost od závitu objektivu k povrchu preparátu, případně krycího skla (v milimetrech). Má být pro všechny objektivy na jednom mikroskopu stejná, pak odpadá zaostřování při otáčení revolverovým nosičem. Pozorovací (pracovní) vzdálenost se měří od vstupní čočky objektivu k rovině preparátu (krycího skla), se stoupajícím zvětšením klesá až na zlomky milimetru. Vady čoček - objektiv není schopen zobrazit detaily bez zkreslení, které je způsobeno jeho zobrazovacími vadami. Nejdůležitější zobrazovací vady objektivu jsou: a) sférická odchylka b) sinusová vada c) sklenutí obrazu d) deformace obrazu (soudečkové a polštářkové) e) chromatická odchylka Objektivy se v průběhu vývoje neustále zlepšují tím, že se u nich stále více potlačují zobrazovací vady (zbytkové vady, aberace). Název objektivu naznačuje, kterou zobrazovací vadu objektiv významně potlačuje. Potlačování zbytkových vad se říká korekce. Stupeň odstranění zbytkových vad (aberace) je stejně jako u okuláru důležitým kritériem pro jakost objektivu. Optická korekce - stupeň korekce barevné (chromatické) a kulové (sférické) optické vady objektivu. Korekce těchto vad může být kombinována s korekcí vyklenutí zorného pole (plan korekcí). Achromatické objektivy (achromáty) - jsou nejčastěji používaným typem objektivů s nejnižší úrovní korekce. Jsou vhodné pro běžné pozorování, ale ne tak docela pro barevnou fotografii. Na objektivu se tato úroveň korekce neoznačuje - objektivy bez označení jsou achromatické. Jsou výhodné např. při fluorescenci, protože jsou složeny z méně čoček, takže pohlcují méně ultrafialového záření. Planachromatické objektivy mají korekci vyklenutí zorného pole, používají se hlavně pro mikrofotografické práce. Apochromatické objektivy (apochromáty) - jsou typem objektivu s velmi dobře korigovanými vadami. V důsledku své konstrukce mají při daném zvětšení vysokou NA, ta se projeví jasnějším obrazem a vyšším rozlišením, které lze těmito objektivy dosáhnout. Planapochromatické objektivy - spojují vlastnosti apochromátů s plan-objektivy, patří k nejlepším a k nejdražším objektivům (s úrovní korekcí roste složitost konstrukce a tím i cena objektivů), proto se používají pouze u kvalitních mikroskopů, určených např. pro mikrofotografii.

Fluoritové objektivy (semi-apochromáty, fluority) - jsou korekcí svých vad umístěny mezi achromáty a apochromáty. Jejich název fluority souvisí s kazivcem (fluoritem), který byl původně používán k výrobě některých jejich čoček. Představují obvykle cenově dostupnější řešení než apochromáty s velmi dobrou úrovní optických parametrů. Planapochromatické fluoritové objektivy, např. planfluority, využívají vynikajících optických vlastností fluoritového skla, které dobře propouští ultrafialové záření, používají se hlavně pro speciální účely, např. při fluorescenční mikroskopii. Barevné označení objektivů - objektivy jsou označeny barevnými proužky, aby se usnadnila orientace při otáčení revolverovým nosičem objektivů (různé barvy pro různě zvětšující objektivy). Odpružené objektivy - výstupní čočka objektivů s velkým zvětšením je při zaostření na preparát velmi blízko krycímu sklu a může dojít k mechanickému dotyku, proto jsou objektivy s velkým zvětšením vybaveny pružným uložením vstupní čočky, která se při dotyku krycího skla částečně zasune do pouzdra, čímž je objektiv chráněn před poškozením. Objektivy pro speciální pracovní postupy - některé metody vyžadují objektivy upravené pro tyto metody. Sem patří fázový kontrast, Hoffmanův kontrast, případně Nomarského diferenciální interferenční kontrast (DIC). Metody různých fázových kontrastů nacházejí svoje uplatnění při pozorování objektů, které nelze barvit, jako např. při fertilizaci in vitro (metoda asistované reprodukce). 2. INVERZNÍ MIKROSKOPY - mají optickou soustavu "vzhůru nohama", tj. objektivy jsou pod preparátem a kondenzor s osvětlovací soupravou nad ním. Jsou vhodné pro pozorování kultur živých buněk a mikroorganismů např. na Petriho miskách, při zkoumání tkáňových kultur, kvality vody, rozborech sedimentů vzniklých chemickou reakcí, pozorování krystalických struktur atd. 3. SPECIÁLNÍ ZPŮSOBY MIKROSKOPIE Mikroskopické pozorování živých nezbarvených buněk je prakticky velice obtížné, a to pro velice malý kontrast jejich vnitřních struktur díky vysokému obsahu vody. Pro kvalitní pozorování mikroskopických objektů je nutné uměle zvýšit kontrast (kontrast je definován rozdílem mezi jasem pozadí a jasem sledovaného objektu), kvalita obrazu nezávisí tedy pouze na zvětšení a rozlišovací schopnosti použitého mikroskopu. Kontrast lze zvýšit použitím různých barvících technik, ale chceme-li pozorovat živé buňky a pochody v nich, musíme použít speciální způsoby mikroskopování. Byla sestrojena různá pomocná zařízení, která umožňují používat např. zvláštní druh osvětlení (mikroskopie v zástinu neboli v temném poli), zvláštní druh světla (fluorescenční mikroskopie) nebo speciální zařízení (fázová kontrastní mikroskopie). Zvláštní kapitolu tvoří mikroskopie elektronová. POZOROVÁNÍ V POLARIZOVANÉM SVĚTLE Polarizační mikroskop je kombinací světelného mikroskopu a polarimetru. Využívá lineárně polarizovaného světla, které kmitá v jedné rovině. Umožňuje zviditelnit struktury, jejichž stavební materiál se vyznačuje dvojlomem. V dnešní době se používá především v mineralogii a při zkoumání některých anizotropních systémů (příčně pruhovaný sval, buněčné stěny, škrobová zrna). Při zavedení elektronového mikroskopu postupně ztratil na významu. Polarizace je uskutečněna filtry (polarizátor, analyzátor), které jsou v optické ose mikroskopu. Polarizátor - v osvětlovací soustavě (pod kondenzorem nebo v něm) Analyzátor - za objektivem (v tubusu nebo nad okulárem) a) Jednolomné látky: voda, cytoplasma, buněčné jádro - zůstávají při zkřížených filtrech tmavé (nejsou zobrazeny).

b) Dvojlomné látky: krystaly, celulózní buněčné stěny - mění rovinu polarizovaného světla, a proto jsou při zkřížených filtrech zobrazeny světle na tmavém pozadí. Původní paprsek se po průchodu vzorkem rozdělí na 2 nové, řádný a mimořádný, které jsou navzájem fázově posunuté a kmitají v různých rovinách. V analyzátoru se oba paprsky složí do stejné roviny kmitu a jejich fázový posun se projeví vznikem interferenčních barev. Metoda se užívá pro zobrazení lineárně uspořádaných a krystalických buněčných struktur, např. tonofibril, krystalických inkluzí (na obr. analýza močových kamenů), keratinových a celulózových struktur, výbrusů kostí apod. POZOROVÁNÍ V TEMNÉM POLI (V ZÁSTINU) Clona zachycuje paprsky procházející přímo do objektivu. Objekty jsou osvětleny z boku a my pozorujeme pouze světlo, které se na nich láme nebo odráží. Prázdné zorné pole je při tomto postupu tmavé. Teprve to světlo, které se rozptýlí při dopadu na preparát, prochází částečně objektivem a vytváří obraz objektu, v temném poli pak jednotlivé části preparátu intenzivně září (na obr. zooplankton). Kondenzor pro mikroskopování v zástinu se spojuje s podložním sklíčkem imerzí a apertura se nastaví na nejvyšší hodnotu. Tato metoda se používá při studiu organismů a částí buněk, které se nedají dobře

barvit a jsou přitom malé, takže se špatně rozlišují normálním světleným mikroskopem (spirochety, velké viry, mitochondrie, centrioly, lysozómy, peroxizómy). Používá se buď speciálních kondenzorů (paraboloidních), nebo se pod kondenzor vloží clonka s neprostupným středem, takže nepropouští středové paprsky. Podobného efektu dosáhneme tím, že na zdroj světla položíme minci. FÁZOVÝ KONTRAST V roce 1953 získal Frits Zernike za fázový kontrast Nobelovu cenu v oblasti fyziky. Princip fázového kontrastu spočívá v tom, že fázové rozdíly světelných paprsků procházejících buňkou, které lidské oko nevnímá, se mění příslušným zařízením v rozdíly amplitudy, které rozeznáváme jako světlejší a tmavší místa objektu (na obr. kofein). Na kondenzor se umístí maska s kruhovou štěrbinou, kterou proniká světlo do objektu. V objektivu, v místě obrazu kondenzorové masky, je umístěna fázová maska. V místě štěrbiny u kondenzorové masky je u masky fázové napařena polopropustná vrstva kovu, který mění fázi světla o čtvrtinu vlnové délky. Díky tomuto uspořádání prochází nedifraktované (neohnuté) záření ze zdroje (štěrbiny kondenzorové masky) tou částí fázové masky, která mění fázi světla. Ostatní vlnění, které se na objektu ohnulo nebo zlomilo, projde beze změny. Při interferenci vln v obrazové rovině se části objektu, které různým způsobem mění fázi světla, projeví různou intenzitou světla. FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE Fluorescenční mikroskopie umožňuje zobrazit určité látky obsažené v buňkách často v minimálním množství. Metoda je založena na skutečnosti, že některé chemické látky (fluorochromy) po dopadu světla o kratší vlnové délce září světlem o delší vlnové délce - tedy světlem jiné barvy. Tento jev se nazývá fluorescence. Je projevem intramolekulové energetické změny vzbuzené v látce absorbovaným zářením. U látek, které jsou samy o sobě schopné fluorescence, mluvíme o primární fluorescenci (autofluorescenci). Fluorescenci můžeme také vyvolat navázáním fluorescenčního barviva nebo sondy na nefluorescenční cíl a indukujeme tak sekundární (nepřímou) fluorescenci. Látky, které jsou fluorescence schopné a které používáme k fluorescenčnímu barvení, se označují jako fluorochromy. Často jsou konjugované do komplexu fluorescenční sondy s dalšími složkami, např. krátkými řetězci nukleových kyselin nebo protilátkami, které specifikují jejich interakci s cílovými molekulami a strukturami. Princip nejčastěji užívaného postupu spočívá ve vazbě fluorochromu na určitou buněčnou složku (polysacharid, protein), která pak např. v modrém budícím světle září světlem žlutým. Aby modré

světlo budící fluorescenci nevadilo při pozorování, musí být odstraněno bariérovým filtrem. Ten pohltí modré světlo vycházející z preparátu do objektivu a do okuláru propustí jen světlo žluté. Výsledkem je tedy obraz žlutě zářících struktur v temném poli. Varianta této metody s použitím mnoha různých fluorochromů se užívá k vizualizaci buněčných jader, chromozomů, jadérek, cytoskeletu a jeho složek, specifických buněčných antigenů a dalších struktur. V mikrobiologii slouží k mikroskopickému průkazu mikroorganismů v klinických vzorcích (sputum, moč, kožní šupiny aj.). V imunodiagnostice se užívá k detekci buněčných antigenů sdružených s určitými chorobami. Podstata této imunofluorescenční metody je v tom, že molekuly protilátky (zpravidla monoklonální) označené navázaným fluorochromem se specificky vážou s molekulami buněčných a tkáňových antigenů, čímž vznikají komplexy (antigen + protilátka + fluorochrom), které ve vhodném budícím záření v mikroskopu fluoreskují a tím indikují přítomnost antigenu v buňce či tkáni. Obr. průběh mitózy klokan, ledviny, epiteliální buňky. ELEKTRONOVÝ MIKROSKOP Elektronové mikroskopy pracují s proudem elektronů ve vakuu. Proud elektronů je záření velmi malé vlnové délky. Dva typy - transmisní a rastrovací elektronový mikroskop. Transmisní elektronový mikroskop Viditelný obraz se vytváří na fluorescenčním stínítku svazkem elektronů, které prošly studovaným vzorkem nebo ve vzorku difraktovaly. Zdrojem proudu elektronů je kovová katoda, která po rozžhavení vysílá elektrony urychlované elektrickým polem o napětí 50 200 kv. Proud elektronů prochází tzv. elektronovou čočkou, kterou tvoří elektrické pole zvláštního kondenzátoru nebo magnetické pole cívky. Tato elektronová čočka soustřeďuje elektrony na pozorovaný předmět. Vrstva preparátu musí být velmi tenká, přibližně 1 µm, aby nepohlcovala elektrony. Proud elektronů pak prochází další elektronovou čočkou objektivem a vytvoří první elektronový obraz. Část tohoto obrazu se elektronovou čočkou projektivem znovu zvětší a výsledný obrazec se promítá buď na stínítko, nebo se zachytí na fotografické desce či filmu. Tyto, a samozřejmě i další součásti elektronového mikroskopu, jsou uloženy ve vzduchotěsné válcové nádobě, z níž je vyčerpán vzduch, aby se proud elektronů nezeslaboval.

K přípravě vzorků pro transmisní elektronový mikroskop se používá několik metod: metoda obtisků (replik) - povrch silnější než 10-50 nm se pokrývá replikou. To může být např. roztok celulózy, který se nakápne na pozorovaný povrch a nechá se roztéct. Po zaschnutí repliku sejmeme a pozorujeme. příprava ultratenkých řezů - používá se ultramikrotom. Fixace glutaraldehydem - fixuje rychleji, účinněji a lépe jak formol, kyselinou osmičelou, atp., zalévání do umělých pryskyřic, skleněný nůž, řez 50 80 nm. elektrochemické leptání - vzorek je elektrochemicky leptán nebo iontově poprašován. V místě, kde se vzorek proleptá, jej pozorujeme. Výhody a nevýhody elektronové mikroskopie Mezi největší výhody patří velmi velké zvětšení - řádově až 1 000 000. Rastrovací (skenovací) elektronový mikroskop Rastrovací elektronový mikroskop pracuje tak, že postupně na všechna místa vzorku dopadá tenký svazek elektronů. Odražený (emitovaný) paprsek se převádí na viditelný obraz. Preparát se před pozorováním pokryje tenkou (10-20 nm) vrstvou kovu (vakuovým napařováním, iontovým naprašováním, impregnací. Mechanická clona - vybírá pouze část elektronů, které dopadnou na preparát. Projekční čočka - způsobí, aby zaostřený svazek elektronů dopadl na preparát. U transmisních el. mikroskopů je nutné, aby vzorek byl velmi tenký, což lze považovat za nevýhodu. Další podstatná nevýhoda je to, že preparát musí být umístěn ve vakuu, což neumožňuje pozorovat živé organismy. El. mikroskop má velké rozlišení (0,1 nm) a velkou hloubku ostrosti. Pohyb svazku elektronů lze řídit pomocí počítače, což umožňuje využít veškerý komfort, který tato technika poskytuje (zobrazit pouze výřez, odstranit šum snížením rastrovací rychlosti, tisknout obraz...) Za nevýhody lze považovat velké nároky na prostor a vysokou pořizovací cenu. Obr. mitochondrie v transmisním a rastrovacím elektronovém mikroskopu