Problémy malých populací

Podobné dokumenty
Genetika vzácných druhů zuzmun

TEORIE OSTROVNÍ BIOGEOGRAFIE (TOB)

Genetika kvantitativních znaků

Co je populační biologie. Specifika populační biologie. rostlin

World of Plants Sources for Botanical Courses

Náhodná veličina Číselné charakteristiky diskrétních náhodných veličin Spojitá náhodná veličina. Pravděpodobnost

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

SSOS_ZE_1.14 Jedinec, druh, populace

PROSTOROVÁ EKOLOGIE, metapopulace, kvantitativní změny populace

Kooperace a Aleeho efekt. Kristýna Kopperová

Statistická analýza jednorozměrných dat

Tomimatsu H. &OharaM. (2003): Genetic diversity and local population structure of fragmented populations of Trillium camschatcense (Trilliaceae).

Hardy-Weinbergův zákon - cvičení

13. Lineární procesy

III. Úplná pravděpodobnost. Nezávislé pokusy se dvěma výsledky. Úplná pravděpodobnost Nezávislé pokusy se dvěma výsledky Náhodná veličina

Statistická analýza dat v psychologii. Věci, které můžeme přímo pozorovat, jsou téměř vždy pouze vzorky. Alfred North Whitehead

Náhodná veličina a rozdělení pravděpodobnosti

Lékařská biofyzika, výpočetní technika I. Biostatistika Josef Tvrdík (doc. Ing. CSc.)

Téma 22. Ondřej Nývlt

Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis.

Inferenční statistika - úvod. z-skóry normální rozdělení pravděpodobnost rozdělení výběrových průměrů

Pravděpodobnost a statistika I KMA/K413

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Mikrosimulační model českého důchodového systému Petr Bednařík SAV

Rozptyl a migrace. Petra Hamplová

Základní trendy aktuálního populačního vývoje ČR

Drift nejen v malých populacích (nebo při bottlenecku resp. efektu zakladatele)

LEKCE 5 STATISTICKÁ INFERENCE ANEB ZOBECŇOVÁNÍ VÝSLEDKŮ Z VÝBĚROVÉHO NA ZÁKLADNÍ SOUBOR

Péče o vnitrodruhovou diversitu na příkladu smrku v horských polohách. Antonín Jurásek, VS VÚLHM Opočno

IX. Populační dynamika

Simulace pohybu chodců pomocí celulárních modelů

Charakterizace rozdělení

Projekční algoritmus. Urychlení evolučních algoritmů pomocí regresních stromů a jejich zobecnění. Jan Klíma

Střední hodnota a rozptyl náhodné. kvantilu. Ing. Michael Rost, Ph.D.

Analýza spolehlivosti tlakové nádoby metodou Monte Carlo

Ochrana na úrovni druhů a populací

Evropská unie a Spojené státy americké podobnosti a odlišnosti demografické reprodukce

Úvod do zpracování signálů

Počet pravděpodobnosti

Základy demografie DEM

Paleodemografie PDEM

6. Lineární regresní modely

KMA/P506 Pravděpodobnost a statistika KMA/P507 Statistika na PC

Kendallova klasifikace

Všechno, co jste chtěli vědět z teorie pravděpodobnosti, z teorie informace a

Důsledky ex-situ kultivace pro populace vzácných druhů

PRAVDĚPODOBNOST A STATISTIKA

PRAVDĚPODOBNOST A STATISTIKA

1. Číselné posloupnosti - Definice posloupnosti, základní vlastnosti, operace s posloupnostmi, limita posloupnosti, vlastnosti limit posloupností,

n = 2 Sdružená distribuční funkce (joint d.f.) n. vektoru F (x, y) = P (X x, Y y)

Předpověď plemenné hodnoty Něco málo z praxe. Zdeňka Veselá

Genetika populací. KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Standardizovaný biologický monitoring rybích přechodů

Markovské metody pro modelování pravděpodobnosti

Pravděpodobnost, náhoda, kostky

RNDr. Eva Janoušová doc. RNDr. Ladislav Dušek, Dr.

Lékařská biofyzika, výpočetní technika I. Biostatistika Josef Tvrdík (doc. Ing. CSc.)

Analýza rozptylu. PSY117/454 Statistická analýza dat v psychologii Přednáška 12. Srovnávání více než dvou průměrů

Dynamika populace. - výkyvy populační hustoty (jakékoliv změny početnosti populace) - rozhodující faktory jsou natalita, mortalita, příp.

ANALÝZA DAT V R 7. KONTINGENČNÍ TABULKA. Mgr. Markéta Pavlíková Katedra pravděpodobnosti a matematické statistiky MFF UK.

DIABETOLOGIČTÍ PACIENTI V REGIONECH ČESKA

Evoluční výpočetní techniky (EVT)

4 Porodnost a plodnost

Pravděpodobnost, náhoda, kostky

Státnice odborné č. 20

Bude se vylidňovat náš venkov? Co a proč obce potřebují vědět? Tomáš Kučera

ANALÝZA DAT V R 3. POPISNÉ STATISTIKY, NÁHODNÁ VELIČINA. Mgr. Markéta Pavlíková Katedra pravděpodobnosti a matematické statistiky MFF UK

Bayesovské metody. Mnohorozměrná analýza dat

Populace 2. = soubor jedinců téhož druhu vyskytující se v určitém prostoru, má atributy jednotlivců i speciální skupinové.

Dobývání znalostí. Doc. RNDr. Iveta Mrázová, CSc. Katedra teoretické informatiky Matematicko-fyzikální fakulta Univerzity Karlovy v Praze

Základy genetiky populací

UNIVERZITA OBRANY Fakulta ekonomiky a managementu. Aplikace STAT1. Výsledek řešení projektu PRO HORR2011 a PRO GRAM

Populace, populační dynamika a hmyzí gradace

LINEÁRNÍ MODELY. Zdeňka Veselá

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

KGG/STG Statistika pro geografy

Hodnocení a modelování populačních dat na příkladu epidemiologie vážných chorob: I. Analýza dat, princip predikcí.

Predace - její konsekvence pro dynamiku a evoluci společenstev

E(X) = np D(X) = np(1 p) 1 2p np(1 p) (n + 1)p 1 ˆx (n + 1)p. A 3 (X) =

Život na venkově a stárnutí Ing. Pavlína Maříková, KHV PEF ČZU ČZU Praha U3V

Grafický a číselný popis rozložení dat 3.1 Způsoby zobrazení dat Metody zobrazení kvalitativních a ordinálních dat Metody zobrazení kvan

Výpočet pravděpodobností

( ) ( ) Nezávislé jevy I. Předpoklady: 9204

KRITICKÉ FÁZE ŢIVOTNÍHO CYKLU ORCHIDEJÍ LIMITUJÍCÍ OBNOVU JEJICH POPULACÍ

Cvičná bakalářská zkouška, 1. varianta

Rybářství 4. Produktivita a produkce. Primární produkce - rozdělení. Primární produkce - PP

5EN306 Aplikované kvantitativní metody I

Inženýrská statistika pak představuje soubor postupů a aplikací teoretických principů v oblasti inženýrské činnosti.

Heritabilita. Heritabilita = dědivost Podíl aditivního rozptylu na celkovém fenotypovém rozptylu Výpočet heritability

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Dlouhodobý monitoring rysa ostrovida a vlka obecného v CHKO Beskydy a Kysuce

S = c.a z. log(s) = log(c) + z.log(a) Rovnovážná teorie ostrovní biogeografie. The species-area relationship. The species-area relationship

Survey of Health, Ageing and Retirement in Europe. Česká republika 50+:

Vliv věku a příjmu na výhodnost vstupu do důchodového spoření (II. pilíře)

MODELOVÉ SROVNÁNÍ VÝNOSOVOSTI NÍZKÉHO A VYSOKÉHO DUBOVÉHO LESA

Vybraná rozdělení náhodné veličiny

Obr. 1: Vizualizace dat pacientů, kontrolních subjektů a testovacího subjektu.

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

VÝBĚR A JEHO REPREZENTATIVNOST

Základní pojmy I. EVOLUCE

Transkript:

Problémy malých populací

Rozložení velikostí populací Velikost populace Pocet pripadu 1 2 3 4 5 6 7 3 52 12 151 21 25 3 349 399 448 497 547 596 646 695 745 794 843 893 942 992 141 191 114 119 1239 1288 1338 1387 1437 1486 1536 1585 1635 1684 1733 1783 1832 1882 1931 1981 23 279 2129 2178 2228 2277 2327 2376 2426 2475 Scorzonera hispanica

Vlivy Deterministické Ztráta opylovačů, neschopnost nalézt partnera, neschopnost obrany proti predátorům Stochastické Výsledek náhodných fluktuací bez jasného směru

Vlivy Demografické ovlivňující přímo populační dynamiku druhu Genetické vlivy přes genetickou diversitu

Demografické vlivy Demografická stochasticita Environmentální stochasticita Katastrofy Vlivy způsobené absencí dostatku sousedů stejného druhu (Allee effects)

Stochasticita Demografická aplikace fixních pravděpodobností na limitovaném počtu jedinců Environmentální aplikace variabilních pravděpodobností

Demografická stochasticita

Demografická stochasticita Aplikace pravděpodobností události na konečně velikém vzorku (mortalita, reprodukce.) Problém pouze při malých počtech

1.75 Pomer.5.25 5 1 15 2 25 3 Pocet pokusu

Data Pravděpodobnosti přechodu mezi jednotlivými částmi životního cyklu

Lathyrus vernus

Killer whale Data

Populační přechodové matice Růstová rychlost Stabilní velikostní složení

Jak modelovat demografickou Násobení matic stochasticitu? Vegetativní Kvetoucí Vegetativní 2 Kvetoucí.5 3 Velikost populace 2.5 2 1.5 1 2 4 6 8 1 12 14 Čas

Aplikace pravděpodobnosti na každého jedince zvlášť 18 16 14 Velikost populace 12 1 8 6 4 2 Průměr Štěstí Smůla 2 4 6 8 Čas Výpočetně neefektivní

Alternativa Využití znalosti o rozložení jednotlivých proměnných Pravděpodobnosti přechodů Multinomické rozdělení Reprodukce binomické či Poissonovo

Killer whales 1: yearling 2: juvenile 3: mature females 4: post reproductive females

= 4 3 3 2 2 1 3 2 P G P G P G F F A F = 3 2 F F = 4 3 3 2 2 1 P G P G P G T

Killer whale Pouze 1 potomek na samici, počet potomků má binomické rozdělení Ostatní přechody multinomické rozdělení

Killer whale Populace začínající se 4 jedinci

Velikost populace Pravděpodobnost vymření.5.45.4.35.3.25.2.15.1.5 2 4 6 8 1 12 14 16 18 Velikost populace Killer whale

Projekce velikosti populace v čase

Demografická či environmentální stochasticita? Je pravděpodobné, že se jedinec nereprodukuje po danou dobu? Doba bez reprodukce killer whale (pravděpodobnost 5 let bez reprodukce)

Extinkce genetických linií Branching process models

Environmentální stochasticita

Environmentální stochasticita Variabilita demografie v čase Kombinace dobrých a špatných roků

Data Variabilita v pravděpodobnostech jednotlivých přechodů v matici v čase Záměna časové a prostorové variability

Modely environmentální stochasticity Nezávislé chování mezi lety Markov chains závislost stavů prostředí mezi lety Autoregresivní techniky kontinuální změny kvality

Nezávislé chování mezi lety Náhodná kombinace kvalit v čase Každá kvalita stejnou pravděpodobnost Data o časové (či prostorové) variabilitě demografie = tj. soubor více demografických matic

Variabilita přechodů Celé matice vs. jednotlivé přechody Kovariance

Scorzonera hispanica 1 1 1 a1 b1 c1 d1 a1 b1 c1 d1 1 1 2 4 6 8 1 12

Thomas 199, simulace

Variabilita vs. průměr Variabilita pdp. přežití u menších populací Průměr - Dlouhodobé trendy

Jak spočítat průměrnou růstovou rychlost ve stochastickém prostředí Nelze průměr závisí na stabilním velikostním složení Simulace mnohonásobná kombinace všech matic

Dlouhodobá růstová rychlost populace

Demo. a env. stochasticita

Extinkce Demo. stochasticita celá čísla Env. stochasticita frakce, nutno ošetřit

Disturbance

Vliv disturbancí Vztah velikosti disturbance a její frekvence Problém kvantifikace

Song et al. 21 Disturbance

Bez disturbancí S disturbancemi Mangel & Tier 1994, simul

Allee effect

Allee effect Snížená možnost najít partnera v důsledku nízké populační hustoty

Limitace počtem opylovačů Ågren, J. (1996), Lythrum salicaria

Limitace pylem Jak zjistit separovat od vitality kytky, kvality stanoviště

Ågren, J. (1996), Lythrum salicaria

Velikost populace a přežití kombinace faktorů Berger 199, bighorn sheep

Demografická stochasticita Význam demografické stochasticity pro velikost populace Vliv velikosti populace na význam demografické stochasticity Pravděpodobnost extinkce v důsledku demografické stochasticity Význam demografie druhu pro vliv demografické stochasticity Environmentální stochasticita Projekce druhu v čase (Scorzonera, Succisa) Dlouhodobá růstová rychlost Růstová rychlost vs. variabilita