Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení

Podobné dokumenty
DIAGNOSTIKA A MONITOROVÁNÍ INFEKCÍ ZPŮSOBENÉ LIDSKÝMI PAPILLOMAVIRY VYSOCE RIZIKOVÉHO TYPU POMOCÍ REAL TIME PCR

DY D NE N X Hana Vlastníková

Komplexní pohled na laboratorní diagnostiku Chlamydia pneumoniae

Molekulárně biologické metody v mikrobiologii. Mgr. Martina Sittová Jaro 2014

Interpretace serologických výsledků. MUDr. Pavel Adamec Sang Lab klinická laboratoř, s.r.o.

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU

Kompletní IVF cyklus - bez úhrady ZP. IVF cyklus přerušený před odběrem oocytů. IVF cyklus s minimální stimulací do 2 oocytů

VÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII

Suchá krevní skvrna (Suchá krevní kapka, Dried Blood Spot)

DYNEX nabízí komplexní řešení v oblasti zpracování a analýzy biologických materiálů pomocí molekulárně biologických metod.

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIUDÁLNÍ CHOROBY MRD EGFR

Příloha č.5 Seznam PCR vyšetření

Suchá krevní skvrna (Suchá krevní kapka, Dried Blood Spot)

NÁVOD K POUŽITÍ PRO HER2 DNA QUANTIFICATION KIT


2018 STÁTNÍ ÚSTAV PRO KONTROLU LÉČIV

Odběr, zpracování a uchování klinických vzorků

Molekulární diagnostika

Aplikace molekulárně biologických postupů v časné detekci sepse

laboratorní technologie

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv

1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně

Pozor na záněty močových cest

Evropský den onemocnění prostaty 15. září 2005 Aktivita Evropské urologické asociace a České urologické společnosti

Využití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči. Marek Protuš

Využití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči. Marek Protuš

Zkušenosti s laboratorní diagnostikou infekcí virem Zika. Hana Zelená NRL pro arboviry Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě

ÚVOD DO TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE

Srovnání citlivosti kvantitativní PCR repetitivních oblastí AF a B1 pro detekci Toxoplasma gondii

KATALOG. Chlamydia trachomatis,neisseria gonorrhoeae, Treponema pallidum, Mycoplasma genitalium,

Zkušenosti s diagnostikou sepse pomocí testu SeptiFast Test M GRADE. Zdeňka Doubková Klinická mikrobiologie a ATB centrum VFN Praha

Epidemiologie spály. MUDr. František BEŇA

Nové technologie v mikrobiologické diagnostice a jejich přínos pro pacienty v intenzivní péči

Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2007: CGB laboratoř a.s Kořenského 10, Ostrava, Vítkovice

NA ANTIBIOTIKA NA ČOV

Mgr. Veronika Peňásová Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno

Přínos metody ELISPOT v diagnostice lymeské boreliózy

Dědičnost vázaná na X chromosom

Změny sazebníku výkonů pro mikrobiologické obory

Nové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku

Automatizace v klinické mikrobiologii

Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii

Pavel Čermák. Thomayerova nemocnice Praha - Krč výroční zasedání SLM

SKLADOVÁNÍ A STABILITA

Ceník služeb IVF DÁRCOVSKÝ PROGRAM. Kompletní IVF cyklus - bez úhrady ZP Kč. IVF cyklus přerušený před odběrem oocytů Kč.

Respirační infekce a jejich původci. MUDr. Černohorská Lenka, Ph.D.

Laboratorní di agnostik HBV HCV a Vratislav Němeček Státní zdravotní stav ústav

VĚDA A VÝZKUM V PERIOPERAČNÍ PÉČI. Mgr. Markéta Jašková Dana Svobodová Gynekologicko-porodnická klinika Fakultní nemocnice Ostrava

CZ.1.07/1.5.00/

Molekulárně biologické a cytogenetické metody

Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií

Serologické vyšetřovací metody

Návrh směrnice pro vydávání a interpretaci výsledků v molekulárně genetických laboratořích

Program časného záchytu karcinomu prostaty u populace mužů v dispenzární péči po onkologických onemocněních

Zákon č. 372/2011 Sb., o poskytování zdravotních služeb (ZPZS) Zákon č. 258/2000 Sb., o ochraně veřejného zdraví (ZOVZ) Prováděcí právní předpisy

Polymerázová řetězová reakce. Základní technika molekulární diagnostiky.

Sérologická diagnostika chřipky možnosti a diagnostická úskalí

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Paratuberkulóza u masného skotu

Závěrečná zpráva. PT#M/34/2016 (č. 953) Průkaz DNA HSV a VZV. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)

SeptiFast. rychlá detekce sepse. Olga Bálková Roche s.r.o., Diagnostics Division

Lékařská mikrobiologie II

Laboratorní diagnostika příušnic v Nemocnici České Budějovice a.s.

Původci morbiliformního exantému v anglické, vysoce proočkované populaci (Causes of morbilliform rash in a highly immunised English population)

Diagnostická laboratoř Praha. Laboratorní příručka Příloha č.1. Přehled vyšetření prováděných v Laboratoři klinické mikrobiologie

Tekuté biopsie u mnohočetného myelomu

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

KATALOG PRODUKTŮ 2015

EUROArray. laboratorní diagnostiku. Praha RNDr. Tereza Gürtlerová. Podtitul, název produktu

Projekt FR-TI2/075 MPO příklad spolupráce farmaceutů s komerčním sektorem. Milan Bartoš. Forum veterinarium, Brno 2010

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche

Kvantitativní detekce houbových patogenů v rostlinných pletivech s využitím metod molekulární biologie

Optimalizace metody PCR pro její využití na vzorky KONTAMINOVANÝCH PITNÝCH VOD

Externí kontrola kvality sekvenačních analýz


CHLAMYDIA ANTIGEN TEST 004A170

INTERPRETACE VÝSLEDKŮ CITLIVOSTI NA ANTIBIOTIKA. Milan Kolář Ústav mikrobiologie Fakultní nemocnice a LF UP v Olomouci

Vzdělávací materiál projektu Zlepšení podmínek výuky v ZŠ Sloup

CHLAMYDIOVÁ UROGENITÁLNÍ INFEKCE

Závěrečná zpráva. PT#M/34/2017 (č. 998) Průkaz DNA HSV a VZV. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)

Real time PCR detekce bakterií Legionella pneumophila+micdadei, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae a Bordetella pertussis

Sada artus HBV QS-RGQ

Diagnostika ostatních střevních patogenů. V. IBD pracovní dny, Hořovice 2019 Jana Matějková

HIV / AIDS MUDr. Miroslava Zavřelová Ústav preventivního lékařství LF MU

Metody testování humorální imunity

Problematika chlamydiových infekcí. L. Petroušová, L. Hozáková Klinika infekčního lékařství, FN Ostrava

CENÍK PRO SAMOPLÁTCE - INFEKČNÍ SÉROLOGIE

Cíle: Obecné zásady při odběru vzorků pro bakteriologické vyšetření

Validace a verifikace molekulárně biologických metod v analýze humánního a extrahumánního genomu

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Yi TPMT. Diagnostická souprava. Návod k použití. Haasova 27 Brno Česká republika. tel.:

EKONOMICKÉ ASPEKTY GENETICKÝCH VYŠETŘENÍ. I. Šubrt Společnost lékařské genetiky ČLS JEP

Pilotní projekt Optimalizace programu screeningu kolorektálního karcinomu

Laboratorní workshop s teoreticko praktickou ukázkou molekulárně biologických technik ve spolupráci s firmou ROCHE

DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová

Genetický screening predispozice k celiakii

Diagnostika a epidemiologie HIV. Vratislav Němeček, Marek Malý NRL pro HIV/AIDS, Státní zdravotní ústav, Praha

10. přehledu o provedení krevní transfúze v uplynulých

Transkript:

Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení Mgr. Klára Vilimovská Dědečková, Ph.D. Synlab genetics s.r.o. Molekulární detekce patogenů klara.vilimovska@synlab.cz www.synlab-genetics.cz

Chlamydia trachomatis Intracelulární bakteriální patogen Nejběžnější sexuálně přenosná bakterie Příznaky infekce: bolest při močení uretritida horečka bolesti v podbřišku Neléčení infekce může vést ke sterilitě Obtížné laboratorní stanovení kultivace - neprovádí se z důvodu dlouhé inkubace na tkáňových kulturách serologické stanovení nevypovídá o aktuálním stavu, přítomnosti/nepřítomnosti bakterie v buňkách, zkřížená reaktivita molekulárně genetické vyšetření detekce DNA bakterie metoda real time PCR (polymerázová řetězová reakce) vyšší citlivost, rychlost, vyšší specificita

Metodika vyšetření Odběr klinického materiálu u lékaře (moč, výtěr, ejakulát) Izolace DNA C. trachomatis Kvantitativní detekce DNA C. trachomatis pomocí real time PCR BioRobot M48 (Qiagen) MagAttract Mini M48 kit (Qiagen) Real time PCR cykler Rotorgene (Qiagen) Odběrová sada: remel MicroTest (Thermo Scientific) Odběrová nádoba na moč: Sarstetd

Real time PCR C. trachomatis Primery a sonda cílené na plazmid C. trachomatis Zmožení úseku DNA (amplifikace) během 50 cyklů složených ze 3 kroků Standard Amplifikace o známé DNA koncentraci se projeví změnou fluorescence v určitém cyklu Pozitivní záchyt Kvantitativní výsledek přepočet dle kalibrační křivky na počet genomických kopií v 1 ml vzorku S každou reakcí provádíme: kontrolu odběru vzorku (gen albumin) Negativní kontrola kontrolu PCR reakce (standardní vzorek, pozitivní kontrola) kontrolu laboratorní kontaminace (negativní kontrola) Negativní vzorek

Cíl studie Shrnout výsledky vyšetření detekce C. trachomatis pomocí real time PCR za období 1. ledna 2013 31.12.2015

Populace pacientů ve studii Gynekologické ambulance, nemocnice Urologické ambulance Dermatovenerologické ambulance Zdravotnická zařízení zabývající se léčbou neplodností Zařízení hledající potenciální dárce buněk a tkání zákon ukládá každého potenciálního dárce vyšetřit na pohlavně přenosné onemocnění Celkem: 612 pracovišť, 213 pracovišť pouze 1x Věk: 5 82 let Průměr: 37 let Medián: 34 roků

Rozložení pracovišť dle krajů 12 153 vyšetření 33 IČP 619 2610 14 IČP 117 IČP 11 IČP 291 258 7 IČP 2 27 IČP 1699 vyšetření 21 IČP 30 1 IČP 2 IČP 9 937 14 IČP 651 98 IČP 1320 9 IČP 11 160 IČP interní číslo pracoviště

Výsledky 8000 7000 6000 5000 4000 3000 2000 1000 2013 2014 2015

počet vyšetření real time PCR počet vyšetření real time PCR počet vyšetření real time PCR Výsledky 8000 7000 6000 7569 6351 6572 5000 4000 3000 2000 1000 2013 2014 2015

počet vyšetření real time PCR počet vyšetření real time PCR počet vyšetření real time PCR Výsledky 8000 7569 7000 6000 6688 6351 5667 6572 6074 5000 4000 3000 2000 1000 2013 2014 2015

počet vyšetření real time PCR pts s C. trachomatis počet vyšetření real time PCR pts s C. trachomatis počet vyšetření real time PCR pts s C. trachomatis Výsledky 8000 7569 7000 6000 6688 6351 5667 6572 6074 5000 4000 3000 2000 1000 332 291 264 2013 2014 2015

počet vyšetření real time PCR pts s C. trachomatis ženy s C. trachomatis počet vyšetření real time PCR pts s C. trachomatis ženy s C. trachomatis počet vyšetření real time PCR pts s C. trachomatis ženy s C. trachomatis Výsledky 8000 7569 7000 6000 6688 6351 5667 6572 6074 5000 4000 3000 2000 1000 332 291 264 176 162 164 2013 2014 2015

počet vyšetření real time PCR pts s C. trachomatis ženy s C. trachomatis Pacienti s neplodností (2013-2015) 8000 7602 7000 6948 6000 5000 4000 3000 2000 1000 121 70

počet vyšetření real time PCR počet dárců dárci s C. trachomatis ženy s C. trachomatis Vyšetřování dárců (2013-2015) 2000 1879 1500 1000 1078 500 73 62

Závěr Každý rok jsme diagnostikovali infekci C. trachomatis téměř u 300 pacientů, více u žen. Problémy s neplodností pacientů nebyly u většiny způsobeny infekcí C. trachomatis. Ze zákona povinné vyšetřování potenciálních dárců na C. trachomatis má význam. 73 potenciálních dárců mělo infekci C. trachomatis

Poděkování Všem lékařům za projevenou důvěru. Pořadatelům za příležitost prezentovat naše výsledky.