Cvičení č. 2: Pasážování buněk. 1) Teoretický základ

Podobné dokumenty
Cvičení č. 2: Pasážování buněk. 1) Teoretický základ

MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk / Jana Horáková

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

Praktický kurz Monitorování toxicity vybraných cytostatik pomocí MTT testu a real-time monitoringu xcelligence.

Přímé stanovení celkového počtu buněk kvasinek pomocí Bürkerovy komůrky Provedení vitálního testu

Protokol č. 7 Pozorování živých a mrtvých buněk kvasinek Vitální test

Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie

TEORETICKÝ ÚVOD. Počítání buněk

IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini)

Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk

Úloha č. 1 Odměřování objemů, ředění roztoků Strana 1. Úkol 1. Ředění roztoků. Teoretický úvod - viz návod

Cvičení 4: CHEMICKÉ SLOŽENÍ BUŇKY, PROKARYOTA Jméno: PROKARYOTA PŘÍPRAVA TRVALÉHO PREPARÁTU SUCHOU CESTOU ROZTĚR BAKTERIÍ

COMET ASSAY (SINGLE CELL GEL ELECTROPHORESIS)

Inovace výuky chemie. ph a neutralizace. Ch 8/09

Název práce: Rostlinná buňka a látky v ní obsažené. Odstavce Vzdělávací cíl, Pomůcky a Inovace viz následující strana

Cvičení ke kurzu Obecná ekotoxikologie. Úloha A - Stanovení ekotoxicity v testu klíčení rostlin

Kultivace bun k in vitro

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích

Řasový test ekotoxicity na mikrotitračních destičkách

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU KOBALTU METODOU ICP-MS

Základní techniky práce s tkáňovými kulturami

Zkouška inhibice růstu řas

FYZIOLOGIE ROSTLIN Laboratorní práce č. 3

RNA Blue REAGENS PRO RYCHLOU PŘÍPRAVU ČISTÉ A NEDEGRADOVANÉ RNA (katalogové číslo R011, R012, R013)

S filtračními papíry a membránou je nutno manipulovat pinzetou s tupým koncem.

DIAGNOSTIKA INFEKČNÍCH CHOROB KULTIVACE V LABORATORNÍCH PODMÍNKÁCH

5. Bioreaktory. Schematicky jsou jednotlivé typy bioreaktorů znázorněny na obr Nejpoužívanějšími bioreaktory jsou míchací tanky.

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 2. PLASMATICKÁ MEMBRÁNA

Kultivační metody stanovení mikroorganismů

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU KVASINEK RODU SACCHAROMYCES

Praktické cvičení č. 1.

ODDĚLOVÁNÍ SLOŽEK SMĚSÍ, PŘÍPRAVA ROZTOKU URČITÉHO SLOŽENÍ

POSTUPY PRÁCE. 1.1 Stanovení počtu erytrocytů

N Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie

Chemické výpočty II. Vladimíra Kvasnicová

Vitální barvení, rostlinná buňka, buněčné organely

Podklady pro cvičení: USEŇ A PERGAMEN. Určení živočišného původu kolagenového materiálu. Úkol č. 1

Bakteriální bioluminiscenční test. Stanovení účinnosti čištění odpadních vod pomocí bakteriálního bioluminiscenčního testu

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU PROBIOTICKÝCH BAKTERIÍ RODU ENTEROCOCCUS

MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction Kit B

NEUTRALIZAČNÍ ODMĚRNÁ ANALÝZA (TITRACE)

Název: POZOROVÁNÍ PLASTIDŮ,VAKUOL, BUNĚČNÉ STĚNY Autor: Paed.Dr.Ludmila Pipková

POČÍTÁNÍ BUNĚK. Část mřížky Bürkerovy komůrky. Výška prostoru, v němž jsou buňky nad mřížkou počítány, je 0,1 µm

1 Popis vzorku. 2 Detekční limit vyšetření. 3 Časová náročnost. 4 Zpracování vzorku. 4.1 Množství vzorku. 4.2 Odběr vzorků

OPTIMALIZACE PROCESU KULTIVACE ZELENÝCH ŘAS S VYUŽITÍM DIGESČNÍCH ZBYTKŮ ZE ZEMĚDĚLSKÝCH BIOPLYNOVÝCH STANIC. Ing. Pavla Hrychová

Izolace nukleových kyselin

53. ročník 2016/2017

1) Pojem biotechnologický proces a jeho fázování 2) Suroviny pro fermentaci 3) Procesy sterilizace 4) Bioreaktory a fermentory 5) Procesy kultivace,

Základy mikroskopování

Základní pojmy a vztahy: Vlnová délka (λ): vzdálenost dvou nejbližších bodů vlnění kmitajících ve stejné fázi

Stanovení mikroskopického obrazu ve vodě Petr Pumann

Speciální odběrové soupravy krácená verze pro tisk. Odběrové soupravy pro odběr žilní krve

2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

Víme, co vám nabízíme

Cvičení 5: VYŠETŘENÍ KRVE Jméno: PŘÍPRAVA TRVALÉHO PREPARÁTU SUCHOU CESTOU - KREVNÍ NÁTĚR

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - FUMONISIN B 1 A B 2

EKOTOXIKOLOGICKÉ TESTY

Protokol PT#V/5/2012 Stanovení mikroskopického obrazu v přírodních koupalištích, stanovení sinic a stanovení chlorofylu-a

MIKROBIOLOGIE. Grampozitivní kokovitá bakterie STAPHYLOCOCCUS AUREUS bakteriální kmen dle ATCC 1260 (CCM 888).

Pufry, pufrační kapacita. Oxidoredukce, elektrodové děje.

Column DNA Lego Kit UNIVERZÁLNÍ SOUPRAVY PRO RYCHLOU IZOLACI ČISTÉ DNA (Katalogové číslo D201 + D202)

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MĚDI, ŽELEZA, MANGANU A ZINKU METODOU FAAS

MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE

Fotosyntéza a dýchání rostlin (laboratorní práce)

N Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie

Médium LymphoGrow. Informace o produktu

Tvorba trvalých mikroskopických preparátů

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU 5-VINYL - 2-THIOOXAZOLIDONU (GOITRINU) METODOU GC

Protokol 04. pšeničná bílkovina. masné výrobky. zkrácená verze

LABORATORNÍ PRÁCE Č.

LIDSKÁ CYTOGENETIKA Laboratorní diagnostika

Návod k laboratornímu cvičení. Vitamíny

téma: Úvodní praktikum autor: Mgr. Michal Novák cíl praktika: Seznámit žáky s náplní praktika doba trvání: 2 místo: odborná učebna biologie

Stanovení mikroskopického obrazu ve vodě

Tkáňový homogenizátor MagNA Lyser od společnosti Roche

1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I

Projekt Pospolu. Stanovení jílovitých podílů podle ČSN EN A1 Zkouška s methylenovou modří

Laboratorní práce z chemie č. Téma: S-prvky

Jazykové gymnázium Pavla Tigrida, Ostrava-Poruba Název projektu: Podpora rozvoje praktické výchovy ve fyzice a chemii

RUŠENÁ KRYSTALIZACE A SUBLIMACE

Microbiology of food and animal feeding stuffs - General rules for microbiological examinations

Sešit pro laboratorní práci z chemie

Metody sterilní práce. Očkování a uchovávání mikroorganismů.

Návrh laboratorní směrnice pro konvenční cytogenetickou analýzu karyotypu buněk kostní dřeně a/nebo periferní krve

CS Úřední věstník Evropské unie L 54/89

Príloha č. 1: Prehľadná situácia umiestnenia navrhovanej činnosti (1:50 000) Zdroj obr.: Google maps,

3 Acidobazické reakce

LABORATORNÍ CVIČENÍ Z BIOLOGIE. Téma: STAVBA A FUNKCE MIKROSKOPU, PŘÍPRAVA DOČASNÝCH PREPARÁTŮ

REAKCE V ANORGANICKÉ CHEMII

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC

HbA1c. Axis - Shield. Společnost je zapsána v obchodním rejstříku Městského soudu v Praze, odd. C vložka 1299

Buněčné kultury. Buněčná kultura jako zdroj biologického materiálu.

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

53. ročník 2016/2017

Ústav molekulární a translační medicíny LF UP holografický transmisní mikroskop

Ústřední komise Chemické olympiády. 53. ročník 2016/2017. KRAJSKÉ KOLO kategorie C. ZADÁNÍ PRAKTICKÉ ČÁSTI (40 BODŮ) časová náročnost: 120 minut

DYNAMIKA BAKTERIÁLNÍHO RŮSTU

Návod k laboratornímu cvičení. Alkoholy

VETERINÁRNÍ A FARMACEUTICKÁ UNIVERZITA BRNO FAKULTA VETERINÁRNÍ HYGIENY A EKOLOGIE ÚSTAV EKOLOGIE A CHOROB ZVĚŘE, RYB A VČEL

CVIČENÍ 3: VODNÍ PROVOZ (POKRAČOVÁNÍ), MINERÁLNÍ VÝŽIVA. Pokus č. 1: Stanovení celkové a kutikulární transpirace listů analýzou transpirační křivky

Transkript:

Cvičení č. 2: Pasážování buněk 1) Teoretický základ Kultivace buněk in vitro (ve zkumavce) - Snaha o napodobení podmínek v organismu - Používání jednorázového spotřebního materiálu a speciálních chemikálií pro kultivaci buněčných kultur - Vyškolený personál (čistota a přesnost práce) Primární kultura: laboratorní zvíře, člověk (první kultura izolovaných buněk) - Množení buněk - Naředění a přenesení do nových kultivačních nádob = pasážování sekundární kultura/subkultura Primární kultura o normální tkáň omezená životnost (stárnutí kultury) o nádorová tkáň snazší kultivace (rychlá a neomezená proliferace) Kultivační podmínky - povrch kultivační nádoby - složení kultivačního média - teplota: 37 C - složení atmosféry: 5% CO 2 (odpovídá poměrům v extracelulární tekutině, podílí se na udržení ph médií s bikarbonátovým pufrem) + relativní vlhkost atmosféry 90% (zamezení odpařování vody z kultivačního média) - adherentní buněčné kultury: rostou na vhodném kultivačním povrchu (polystyrenová nádoba s hydrofilním povrchem, popř. potažená adhezními faktory polypeptidy, kolagen, fibronektin, laminin) - buněčné kultury pěstované v suspenzi (např. krevní buňky) promíchávání kultury Inkubátory pro kultivaci buněčných kultur - regulace teploty, koncentrace CO 2 - snadné čištění, dezinfekce, sterilizace povrchů Kultivační média - tvoří tenkou vrstvu kapaliny nad adherovanými buňkami dostatečně rychlá difúze O 2 a CO 2 - výměna média 2x-3x týdně - obsahuje anorganické soli, pufry, glukózu, esenciální aminokyseliny, vitaminy, bílkoviny, růstové faktory, mastné kyseliny, lipidy, stopové prvky - přídavek séra pro doplnění významných organických látek (růstové faktory, bílkoviny, vitaminy, stopové prvky) nejčastěji bovinní sérum (fetální telecí) - fetální sérum - obsahuje více růstových faktorů

- sterilizace sér filtrací, tepelnou inaktivací zabrání přenosu virové infekce - ph 7,4 - acidobazický indikátor fenolová červeň (jasně červený při ph 7,4; kyselé ph žlutý; zásadité ph fialový) - rostoucí buňky vylučují do média kyselé metabolity (zežloutnutí nutnost výměny média) - přídavek antibiotik/antimykotik - zábrana kontaminace Růst buněčné kultury A) statická fáze (lag fáze): příprava na buněčné dělení B) exponenciální (log) fáze: intenzivní množení buněk do vyčerpání živin C) stacionární fáze (plató): počet buněk se nemění, počátek akumulace toxických produktů D) fáze odumírání T (osa x)=čas L (osa y)=počet buněk v kultuře - při kultivaci snaha o udržení log fáze (exponenciální nárůst počtu buněk) - kontaktní inhibice zastavení dělení - před dosažením plató fáze se kultura naředí a nasadí do nových kultivačních nádob v takové hustotě, aby rostla opět exponenciálně - konfluence=stav, kdy je vytvořena souvislá vrstva buněk (monolayer), které se vzájemně dotýkají Pasážování buněk - uvolnění adherentních buněk od kultivačního povrchu i od sebe navzájem, přenesení do nové kultivační nádoby s čerstvým médiem - disociace buněk: odstranění dvojmocných iontů (EDTA chelatačně váže Ca 2+, Mg 2+ ) a působení proteáz (trypsin)

2) Praktické cvičení: a) Pasážování buněk Pasážování se provádí, pokud jsou buňky konfluentní ze 70-80% (pokrývají 70-80% povrchu kultivační nádoby). Zkontrolujte mikroskopicky nárůst buněk a uveďte stupeň konfluence do protokolu. K pasáži jedné 25 cm 2 kultivační lahvičky je potřeba: 1 ml trypsinu, 2 ml pufru PBS, kompletní médium (DMEM+10% FBS+1% atb). Před vlastním pasážováním si do boxu připravit vše potřebné. Vždy postříkat etanolem (zejména víčka), otřít a vložit do boxu. Připravené médium má stabilitu cca týden, je možné připravit si do zásoby. Příprava: pipety (dle počtu a velikosti pasážovaných kultivačních lahviček) pasterky odpadní kádinku PBS pufr médium zahřáté na 37 C Trypsin zahřátý na 37 C Médium: 87 ml DMEM High Glucose 10 ml inaktivovaného FBS (vyndat z mrazáku a rozmrazit) 1 ml antibiotik (vyndat z mrazáku a rozmrazit) 1 ml L-Glutaminu (vyndat z mrazáku a rozmrazit) 20 µl sterilního 7,5% NaHCO 3 Připravené médium přefiltrovat přes 0,2 µm filtr do sterilní skleněné lahvičky. Pasážování: 1. Z kultivační lahvičky (25 cm 2 ) odsát médium, přidat k buňkám cca 2 ml sterilního PBS pufru. Buňky opláchnout a pufr odsát. 2. Přidat 0,5 ml nahřátého trypsinu. Buňky opláchnout a trypsin odsát. 3. Přidat 0,5 ml nahřátého trypsinu a kultivační lahvičku vložit na 2 minuty do termostatu (mikroskopická kontrola- zakulacení buněk, plavání v médiu). 4. Po trypsinizaci buňky jemně mechanicky sklepat ze dna a přidat 1 ml připraveného nahřátého média (DMEM / MEM). Buňky šetrně resuspendovat v tomto médiu (rozbít shluky buněk). 5. Určit počet buněk v 1 ml pomocí Bürkerovy komůrky (viz další úkol) 6. Přenést 1x10 5 buněk do nové 25 cm 2 kultivační lahvičky a přidat čerstvé médium (celkový objem 5 ml). 7. Popsat lahvičku typ buněk, pasáž, datum, jméno

8. Buňky v nové kultivační lahvičce zkontrolovat pod mikroskopem a vložit do termostatu. Ukončení práce: Jednorázový spotřební materiál vyhodit do biologického odpadu, zbytek umýt. Povrchy v boxu vytřít etanolem a nechat vysvítit UV po dobu 20 min. Úkoly: Buňky pozorujte pod optickým mikroskopem a zakreslete jejich strukturu, popište jejich části, uveďte zvětšení mikroskopu. b) Stanovení počtu živých buněk pomocí Bürkerovy komůrky 1. K 0,5 ml dobře promíchané buněčné suspenzi se přidá 0,5 ml roztoku trypanové modři. 2. Po 5 až 15 minutách se suspenze dobře promíchá a pomocí 1 ml automatické pipety se jí naplní obě poloviny Bürkerovy komůrky. Je třeba aplikovat takové množství vzorku, aby se komůrka právě naplnila, roztok nesmí přetékat do okolních žlábků. 3. Pod světelným mikroskopem se při nejmenším zvětšení počítají zvlášť živé (bezbarvé) a mrtvé (modré) buňky. Počítá se nejprve 5 čtverců (4 rohové a středový) 1 1 mm v jedné polovině komůrky. Je-li celkový počet buněk menší než 100, počítají se buňky i v dalších 5 čtvercích ve druhé polovině komůrky. Za hranici čtverce se považuje prostřední linka z trojité čáry. Z buněk, které leží na okraji čtverce, se počítají ty, které se i jen dotýkají levého nebo horního okraje, a naopak se nepočítají buňky, které se i jen dotýkají pravého nebo dolního okraje. 4. Počet buněk se vypočítá podle vzorce, kde: P je počet buněk na 1 ml suspenze N je celkový počet buněk D = 2 (ředění suspenze) H = 0,1 (objem čtverce, ve kterém buňky počítáme) S je počet čtverců 5. Vypočítá se podíl živých buněk v procentech

Úkoly: Uveďte, jak jste postupovali při počítání buněk v Bürkerově komůrce i s dílčími výpočty, zapište výsledek c) Nativní preparát buněk bukální sliznice Materiál a pomůcky: Podložní a krycí sklíčka, vatové tyčinky, stěr z bukální sliznice, destilovaná voda, kádinky, čtverek buničité vaty. Vlastní pokus: Před odebráním bukální sliznice si důkladně vodou vypláchněte ústa, aby se odstranily baktérie a zbytky jídla. Potom jedním koncem vatové tyčinky několikrát seškrábnete povrch bukální sliznice a získaný materiál rychle rozetřete v tenké vrstvě na čisté podložní sklo, přikryjete krycím sklíčkem a přes buničitou vatu bříškem palce přitlačíte. Tento nativní preparát pozorujete v normálním světlém poli. 1,8 mm 900 μm 450μm 100x 200x 400x Úkoly: Zakreslete buňky s pozorovanými detaily, uveďte zvětšení mikroskopu a odhad velikosti buňky.