MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/ Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin Úvodní přednáška Petr Bureš

Podobné dokumenty
MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/ Systém a evoluce vyšších rostlin Úvodní přednáška Petr Bureš

Systém a evoluce vyšších rostlin Petr Bureš. Petr Bureš: Prezentace přednášky Systém a evoluce vyšších rostlin - část 1.

Systematická biologie je věda o rozmanitosti organizmů (E. Mayr 1969: Principles of systematic zoology. Mac Graw Hill Book Co., New York X+428 p.).

Základy botaniky vyšších rostlin. Zdeňka Lososová

Taxonomický systém a jeho význam v biologii

Reprodukční systémy vyšších rostlin

Úvod do studia biologie vyučující: Mgr. Blažena Brabcová, Ph.D. RNDr. Zdeňka Lososová, Ph.D. Mgr. Robert Vlk, Ph.D. Mgr. Martina Jančová, Ph.D.

Biologie - Oktáva, 4. ročník (přírodovědná větev)

Populační genetika III. Radka Reifová

Biologie - Oktáva, 4. ročník (humanitní větev)

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Cytotypová variabilita, kryptická diverzita a hybridizace u lakušníků (Ranunculus sect. Batrachium)

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Paleogenetika člověka

Gymnázium Aloise Jiráska, Litomyšl, T. G. Masaryka 590

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Systém rostlin Část vyšší rostliny

Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Speciace a extinkce. Druh

Jaro 2010 Kateřina Slavíčková

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?

Reálné gymnázium a základní škola města Prostějova 5.26 Učební osnovy: Seminář a cvičení z biologie

Modulární systém dalšího vzdělávání pedagogických pracovníků JmK v přírodních vědách a informatice CZ.1.07/1.3.10/ Brožura dobré praxe

Typologická koncepce druhu

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Podmínky pro hodnocení žáka v předmětu biologie

World of Plants Sources for Botanical Courses. Zemědělská botanika. Cvičení 8 (po 8. přednášce) Identifikace druhů*

Podmínky pro hodnocení žáka v předmětu biologie

Pěstování pokusných rostlin

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin

Průřezová témata, souvislosti, metody Environmentální výchova Výchova ke zdraví. Výstupy Učivo téma Konkretizace

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Didaktika přírodopisu 2. Mgr. Libuše VODOVÁ Katedra biologie PdF MU

Podmínky pro hodnocení žáka v předmětu biologie

Okruhy otázek ke zkoušce

Strom života. Cíle. Stručná anotace

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě MU

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy

Zvyšování konkurenceschopnosti studentů oboru botanika a učitelství biologie CZ.1.07/2.2.00/

Jan S u d a Přehled pedagogické činnosti

Konzervační genetika INBREEDING. Dana Šafářová Katedra buněčné biologie a genetiky Univerzita Palackého, Olomouc OPVK (CZ.1.07/2.2.00/28.

Charakterizace hybridních trav pomocí cytogenetických a molekulárních metod

Bi8240 GENETIKA ROSTLIN

Sylabus kurzu: Biologie

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Populační genetika II. Radka Reifová

obecné vlastnosti živých soustav soustav teorie evoluce Zeměpis, Dějepis 1. ročník prokaryotní a eukaryotní buňka buňka - stavba a funkce

Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok A) Molekulární genetika

II. Nástroje a metody, kterými ověřujeme plnění cílů

- taxonomicky jeden z nejobtížnějších rodů v Evropě (ca druhů)

GENETIKA 1. Úvod do světa dědičnosti. Historie

36-47-M/01 Chovatelství

Harmonogram pro státní zkoušky 2016

Vypracovaly: Mirka Hladilová, Kateřina Pecová, Petra Pospíšilová

Příklady z populační genetiky volně žijících živočichů

Důsledky ex-situ kultivace pro populace vzácných druhů

Dědičnost a pohlaví. KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Populační genetika Radka Reifová

M A T U R I T N Í T É M A T A

Výukové environmentální programy s mezipředmětovými vazbami

Název: Čeledi rostlin

Příkaz ředitele č. 03/06-07

Pozvolná speciace a hybridizace, význam hybridizace evoluci, hybridogenní druhy

OBECNÁ CHARAKTERISTIKA ŽIVÝCH ORGANISMŮ - PRACOVNÍ LIST

Modrá kniha biodiverzita

Populační genetika a fylogeneze jedle bělokoré analyzována pomocí izoenzymových genových markerů a variability mtdna

Sylabus témat ke zkoušce z lékařské biologie a genetiky. Struktura, reprodukce a rekombinace virů (DNA viry, RNA viry), význam v medicíně

téma: Úvodní praktikum autor: Mgr. Michal Novák cíl praktika: Seznámit žáky s náplní praktika doba trvání: 2 místo: odborná učebna

ÚVOD DO MATEMATICKÉ BIOLOGIE I. UKB, pav. A29, RECETOX, dv.č.112 Institut biostatistiky a analýz

Škola: Střední škola obchodní, České Budějovice, Husova 9. Inovace a zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY

Základní pojmy I. EVOLUCE

MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST

KLASIFIKAČNÍ ŘÁD. Obecné zásady klasifikace

Kritéria pro hodnocení přijímacích zkoušek v roce 2010

Typologická koncepce druhu

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

Vzdělávací obsah vyučovacího předmětu

Epigenetická paměť v ekologii a evoluci rostlin. Vítek Latzel

Aplikace DNA markerů v mykologii a molekulárni taxonomii

Speciace. Radka Reifová. Katedra zoologie

Proměnlivost organismu. Mgr. Aleš RUDA

Fylogeneze a diverzita obratlovců I.Úvod

Genetika kvantitativních znaků. - principy, vlastnosti a aplikace statistiky

Pedagogická činnost Jiří Neustupa

Podklady pro pololetní a výroční hodnocení prospěchu. Gymnázium, Prachatice, Zlatá stezka 137

Tomimatsu H. &OharaM. (2003): Genetic diversity and local population structure of fragmented populations of Trillium camschatcense (Trilliaceae).

Populační genetika II

Biologie a chemie. dvouletý volitelný předmět

Doprovodný materiál k práci s přípravným textem Biologické olympiády 2014/2015 pro soutěžící a organizátory kategorie B

Vzdělávací obor Přírodopis - obsah 6.ročník

Pravidla pro hodnocení výsledků vzdělávání žáků

Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám

Transkript:

MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/15.0204 Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin Úvodní přednáška Petr Bureš

K úspěšnému absolvování musíte prokázat znalosti ve dvou (třech) krocích: A. poznávací test B. písemná/ústní zkouška (C. absolvovat cvičení)

A. Poznávačka (10 druhů, probíhá zpravidla ústně) = nutná nikoli dostatečná podmínka

Odpověď na každý z 10 objektů sestává ze jména druhu a zařazení do čeledi Za jeden objekt je max. 5 bodů Př.1. lipnice luční (Poa pratensis), lipnicovité (Poaceae) = 5 b. Pravidlo č. 1. vědecká nomenklatura přebíjí českou, za kterou je méně bodů Př.2. Poa pratensis, Poaceae = 5 b. (=3+2) Př.3. lipnice luční, lipnicovité = 3 b. (=2+1) Př.4. lipnice, lipnicovité = 2 b. (=1+1) Př.5. Poa, Poaceae = 3,5 b. (=1,5+2) Př.6. Poa pratensis, lipnicovité =?

Pravidlo č. 2: pokus navíc jedenáctý je doplňkový (jednou lze mít úplné okno) Bodování: 48-50(-55) ~ A 43,5-47,5 ~ B 39-43 ~ C 34,5-38,5 ~ D 30-34 ~ E < 30 ~ F (platí 1 rok) (platí půl roku) (platí 3 měsíce) (platí 1 měsíc) (platí 2 týdny) Při každém termínu zkoušení je potřeba nechat si v případě neúspěchu u písemky písemně potvrdit úspěšné absolvování poznávačky!!!

Pravidlo č. 3: Náhlá smrt = odpovíte-li na 5 prvních objektů zcela bezchybně, jste okamžitě vyhozeni s hodnocením A

Pravidlo č. 4: Zelená šplhounům z terénního cvičení Studentům, kteří v předmětu terénní cvičení z botaniky obdrží v závěrečném přezkoušení hodnocení A je poznávací test odpuštěn. Toto odpuštění platí jeden rok. Pokud není terénní cvičení klasifikováno, zhotovte si seznam studentů a známek a nechte podepsat zkoušejícím!!! Důležité upozornění: poznávačka je způsob jak přinutit zejména budoucí učitele, aby se naučili základní druhy a nebáli se chodit se svými studenty do terénu. Neznamená to, že budou podobnou praxi aplikovat na na všechny středoškolské studenty ve Vaší budoucí pedagogické práci!!!

B. Vlastní zkouška (probíhá zpravidla písemně)

Písemka = testové otázky (základ je 100 bodů) Známka = 1 + (100 počet bodů) * 0,055 Příklady otázek A ~ 96 100 b. B ~ 87 95 b. C ~ 78 86 b. D ~ 69 77 b. E ~ 60 69 b. F ~ < 60 b. tipovat se nedá, ani dlouze přemýšlet!

Písemka vychází ze 100 bodů Známka = 1 + (100 počet bodů) * 0,055 A B C D E F A ~ 96 100 b. B ~ 87 95 b. 5 9 C ~ 78 86 b. 9 D ~ 69 77 b. 60 9 9 E ~ 60 69 b. F ~ < 60 b. úzká jednička

Písemka má 20 opravných pokusů celková suma bodů nebude 100, nýbrž 120! A B C D E F A ~ 96 120 b. B ~ 87 95 b. 25 C ~ 78 86 b. 9 D ~ 69 77 b. 60 E ~ 60 69 b. 9 9 9 F ~ < 60 b. široká jednička => 20krát se lze beztrestně splést

Písemka = testové otázky za aktivitu na přednášce dalších až 20 bodů předem! A ~ 96 140 b. B ~ 87 95 b. C ~ 78 86 b. D ~ 69 77 b. E ~ 60 69 b. F ~ < 60 b.

Písemka Kvalitním studentům umožní získání jedničky či jiné dobré známky bez rizika a bez stresu A ~ 96 140 b. B ~ 87 95 b. C ~ 78 86 b. D ~ 69 77 b. E ~ 60 69 b. F ~ < 60 b.

Písemka - známkování Je Occamovou břitvou, která s jistotou odřízne ty, kteří neznají ani středoškolskou botaniku A ~ 96 140 b. B ~ 87 95 b. C ~ 78 86 b. D ~ 69 77 b. E ~ 60 69 b. F ~ < 60 b.

Písemka - známkování Kdo dostane napoprvé F nebo dokonce na podruhé FF, budou mu tyto neúspěšné pokusy vymazány, pokud zkoušku úspěšně vykoná do konce příslušného A ~ 96 140 b. zkušebního období B ~ 87 95 b. POKUD C ~ 78 86 b. (BUDE MÍT ASPOŇ 80% ÚČAST D ~ 69 77 b. NA PŘEDNÁŠKÁCH) A ZÁROVEŇ E ~ 60 69 b. (NEDOJDE K ÚPRAVĚ F ~ < 60 b. IS MUNI!!!)

Klasická studijní literatura out of date Hendrych R.: Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin. SPN, Praha, 1977. Smejkal M.: Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin. In: Rosypal S. et al.: Fylogeneze, systém a biologie organismů. SPN, Praha, 1992, p.205-350., Mártonfi P.: Systematika cievnatých rastlín. UPJŠ, Košice, 2003. Základem přípravy na zkoušku je přednáška!

Elektronické studijní materiály a ostatní podklady 1. Tématický přehled cvičení: http://botzool.sci.muni.cz/study/system_vyssich_cvika/ 2. Požadavky k zápočtu ze cvičení: http://sci.muni.cz/~pvesely/vyuka/cviko_zapocet.htm 3. Pokyny ke zhotovení morfologického herbáře: http://sci.muni.cz/~pvesely/vyuka/morfoherbar.htm 4. Seznam druhů k poznávačce (povinné pensum): http://www.sci.muni.cz/botany/studium/penzumvr.htm 5. Příprava na poznávačku: http://www.sci.muni.cz/botany/studium/herbarium/ Deyl & Hísek: Naše květiny Knihovnice Studijní herbáře ve studijní místnosti knihovny místnost 117 1NP budovy A32 6. Přednáškové prezentace (starší verze - aktuální po přednášce): http://www.sci.muni.cz/botany/bures/vysrost/vysrost.htm 7. Doplňkové studijní materiály ke krytosemenným https://is.muni.cz/auth/dok/rfmgr?fakulta=1431;obdobi=6165;predmet=783252;furl=%2fel%2f1431%2fjaro2015%2fbi2030%2f 8. Sylabus a použitý systém https://is.muni.cz/auth/el/1431/jaro2011/bi2030/um/syllabus2011.doc?fakulta=1431;obdobi=4966;kod=bi2030 9. Botanická fotogalerie http://www.botanickafotogalerie.cz/poznavacka_formular.php?lng=cz Lucka Jarošová Petra Šolcová

Systematická biologie je věda o rozmanitosti (= variabilitě, = diverzitě) organizmů tuto rozmanitost se snaží 1. registrovat = identifikovat, popsat, pojmenovat (i) taxonomie a (ii) nomenklatura 2. kauzálně ji vysvětlovat = objasňovat její příčiny a následky (iii) evoluční biologie rostlin = biosystematika a (iv) fylogenetika rostlin prvoplánový cíl systematiky = vytvořit a spravovat klasifikační systém

Základním analytickým a klasifikačním prvkem systematiky je znak typ znaku příklad morfologický počet tyčinek

Základním analytickým a klasifikačním prvkem systematiky je znak typ znaku morfologický anatomicko-cytologický chemický karyologický molekulární příklad - typ květenství, - přítomnost/tvar palistů - přítomnost trachejí - přítomnost rafidů - přítomnost alkaloidů, - přítomnost inulinu - počet chromosomů, - velikost genomu - sekvence nukleotidů v DNA - sekvence aminokyselin

Klasifikační systém je hierarchický objekt klasifikace = druhy kategorie vzniklé tříděním = logické třídy = systematické jednotky (druh je také systematickou jednotkou)

Otcem metody hierarchické klasifikace = principu logického třídění objektů je řecký filosof Aristoteles. Vytvořil tímto způsobem první systém živočichů v díle Historia animalium. Klasifikace je součást metod každé vědy = umožňuje deduktivní vyvození vlastností objektů z příslušnosti k nadřazené jednotce Aristoteles 384-322 B. C.

Jednotky a taxony Hierarchické úrovně biologického klasifikačního systému nazýváme jednotky např. čeleď, řád, atd. pojmy abstraktní. oddělení

Jednotky a taxony Hierarchické úrovně biologického klasifikačního systému nazýváme jednotky např. čeleď, řád, atd. pojmy abstraktní. oddělení Naproti tomu konkrétní obsahy takových jednotek jsou taxony např. Ranunculaceae, Campanulales, Anemone nemorosa, atd.

Fylogenetický systém Kritérium moderních klasifikací = fylogenetická příbuznost organismů

Jak zohlednit míru evoluční příbuznosti v hierarchické klasifikaci? V hierarchické klasifikaci vyjadřuje míru evoluční příbuznosti dvou taxonů je dán nejnižším stupněm nadřazeného taxonu, do nějž oba tyto taxony ještě patří (= neexistuje žádný taxon nižší úrovně do nejž by ještě patřily) Anabaena flos-aquae

Jak zohlednit míru evoluční příbuznosti v hierarchické klasifikaci? V hierarchické klasifikaci vyjadřuje míru evoluční příbuznosti dvou taxonů je dán nejnižším stupněm nadřazeného taxonu, do nějž oba tyto taxony ještě patří (= neexistuje žádný taxon nižší úrovně do nejž by ještě patřily) Anabaena flos-aquae

Jak zohlednit míru evoluční příbuznosti v hierarchické klasifikaci? V hierarchické klasifikaci vyjadřuje míru evoluční příbuznosti dvou taxonů je dán nejnižším stupněm nadřazeného taxonu, do nějž oba tyto taxony ještě patří (= neexistuje žádný taxon nižší úrovně do nejž by ještě patřily) Anabaena flos-aquae Posloupnost hlavních taxonomických úrovní je od nejvyšší: říše podříše oddělení třída řád čeleď rod druh

Druhy = základní objekty klasifikace organizmů. Existují reálně = nezávisle na klasifikátorech. druh je soubor aktuálně nebo potenciálně se křížících populací oddělených reprodukční bariérou od ostatních takových souborů Ernst Mayr 1904 2005 americký ornitolog To lze vztáhnout jen na sexuálně se množící biparentální organismy. Takových je většina např. mezi živočichy. U rostlin splňují toto kriterium pouze rostliny obligátně allogamické.

Populace = soubor všech jedinců podílejících se aktuálně na nějakém společném genovém fondu Genový fond populace je odlišný od genomu jedince a populace téhož druhu mají různé genofondy. Procesy evolučních změn uvnitř druhu v populacích = mikroevoluce

U živočichů je hybridizace vzácnější než u rostlin a hybridi bývají častěji zcela sterilní

Porušení izolace = mezidruhová hybridizace Cirsium oleraceum Cirsium erisithales Cirsium palustre Cirsium oleraceum

. Důsledky mezidruhové hybridizace (1) Základní speciační mechanizmus rostlin (2) Retikularita evolučních linií (síťovitost) (3) Nejčastější příčina polyploidie a potažmo apomixie

(4) Hybridizací nejen druhy vznikají, ale také zanikají Porušení izolace může vést ke genetické korozi Populace Viola lutea subsp. sudetica (Sudetská pohoří, Západní Karpaty, Východní Alpy) se kříží s Viola tricolor subsp. tricolor (běžnou kolem cest do 700 m n.m. v celé Evropa vč. Skandinávie, na V až po Ural) došlo k zavlečení se štěrkem používaným na cesty

Druh u rostlin kompromisní vymezení jednotky vychází z koncepce biologického druhu 1. Bariéra mezi rostlinnými druhy nemusí být vždy dána geneticky ale třeba jen geograficky, ekologicky, altitudinálně, nebo temporálně (= rostlinné druhy se nemohou křížit aktuálně, potenciálně však ano). 2. Druh by měl zaujímat geografický areál rozšíření, alespoň zčásti vzniklý přirozeným způsobem. 3. Druh by měl být vázán na určitý typ prostředí ekologickou niku. 4. Znaky vymezující druh musí být dědičně stálé (geneticky podmíněná variabilita x fenotypová plasticita, která se u rostlin díky nepohyblivosti může více projevovat)

Příklady nápadných ale nedědičných odchylek

Příklady fenotypové plasticity ph půdy vítr voda

Příklady přirozené geografické distribuce (areálů) druhů

Živočichové se mohou pohybovat a mají nervovou soustavu jsou proto zpravidla odděleného pohlaví = gonochoristé = +

Rostliny se naopak pohybovat nemohou jsou proto zpravidla společného pohlaví = hermafrodité http://www.biocrawler.com/w/images/f/f5/stamens-and-pistil.jpg http://www.allbestpictures.com/flowers-violet_tulip,_pistil_and_stamens_close-up_picture.html http://farm1.static.flickr.com/33/103185745_74acfa78c3.jpg http://farm4.static.flickr.com/3629/3636943694_3df9e5be54.jpg

Z hlediska rekombinace genů je výhodnější cizosprášení (allogamie) oproti samosprášení (autogamii) cizosprášení samosprášení Hermafroditismus představuje riziko inbrední deprese, neboť autogamie je příbuzenské křížení v nejužším slova smyslu / rostliny se proto autogamii brání

Obrana proti autogamii - heterostylie

Obrana proti autogamii - protogynie

Obrana proti autogamii - protandrie

Pohlavní dimorfismus rostlin 7.5 % druhů gynodioecických ca 87 % druhů hermafroditních Hodnoty platí pro Evropu - v tropických deštných lesích stoupá podíl dvoudomých dřevin a klesá podíl gynodioecických druhů 4 % druhů dvoudomých < 0.1% druhů androdioecických Spencer CH. 2002. The evolution of plant sexual diversity. Nature Reviews Genetics 3: 274-284.

Gynodioecické druhy

Dvoudomé druhy

Dvoudomé druhy

Dvoudomé druhy

Shrnutí specifity evoluce rostlin nepohyblivost rostlin (+ absence nervové soustavy) Preference hermafroditismu (= pojistka sexu osiřenců ) spoléhají víc na geografickou izolaci roste riziko inbrední deprese porušení izolace => hybridizace různé formy obrany proti samoopylení chromosomy se v meiosi špatně párují = téměř sterilita fixovaná heterozygozita = snížení rizika inbrední deprese hybrid tvoří neredukované gamety => alopolyploidizace chromosomy allopolyploida se regulerně párují => hybrid uniká ze sterility rozšíření spektra genů = preadaptace na změnu podmínek, což eliminuje absenci možnosti utéct