PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY

Transkript

1 RNDr. Pavel Lízal, Ph.D. Přírodovědecká fakulta MU Ústav experimentální biologie Oddělení genetiky a molekulární biologie lizal@sci.muni.cz

2 1) Praktikum z obecné genetiky 2) Praktikum z genetiky rostlin 3) Praktikum z genetiky populací

3 Vyučující: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.; doc. Jana Řepková, CSc.; Mgr. Aneta Mikulášová zájem se pohybuje v průměru kolem 200 studentů ~ 1/3 (78/245) má předmět povinný Molekulární biologie a genetika Lékařská genetika a mol. diagnostika Antropologie ostatní si volí dobrovolně Speciální biologie Ekologická a evoluční biologie Matematická biologie (2. ročník) Biologie se zaměřením na vzdělávání (4. ročník)

4 rozdělení do seminárních skupin po 18 až 20 studentech

5 Podmínky splnění: 80% docházka vyřešené zápočtové příklady odevzdaných 5 protokolů úspěšně složený zápočtový test (75 %)

6 Úspěšnost získání zápočtu: v průměru kolem 85 %

7 Struktura praktika (2 h, 90 min) úvodní prezentace tématu praktika experiment praktický, simulovaný řešení zápočtových příkladů na téma praktika

8 Experimenty především s využitím modelových organizmů Arabidopsis thaliana Drosophila melanogaster

9 Experimenty 1) Pozorování štěpení recesivně letálního znaku albina u monohybrida modelového organizmu Arabidopsis thaliana seznámení se s výhodami genetického modelu rozpoznávání vybraných mutantů

10 Experimenty seznámení se s výhodami genetického modelu rozpoznávání vybraných mutantů založení pokusu pro sledování segregace znaku v potomstvu monohybrida

11 Experimenty seznámení se s výhodami genetického modelu rozpoznávání vybraných mutantů založení pokusu pro sledování segregace znaku v potomstvu monohybrida

12 Experimenty

13 Experimenty 2) Pozorování dědičnosti s vazbou na pohlaví u modelového organizmu Drosophila melanogaster (mutace white) seznámení s modelem nácvik manipulace rozpoznávání vybraných mutantů rozpoznávání pohlaví

14 Experimenty založení pokusu v lichých týdnech usmrcení rodičů

15 Experimenty založení pokusu v lichých týdnech usmrcení rodičů v sudých týdnech vyhodnocování první a druhé generace potomků (celkem 1 měsíc s octomilkou)

16 Experimenty 3) Sledování dědičnosti kvantitativního znaku u modelového organizmu Drosophila melanogaster základní charakteristika kvantitativních znaků popis vzniku populace jedinců F 2 pro vyhodnocení stanovení počtu chloupků na vzorku 20 jedinců

17 Experimenty vyhodnocení pokusu

18 Experimenty 4) konstrukce vlastního rodokmenu seznámení s pravidly tvorby rodokmenů pokyny pro tvorbu

19 Experimenty 4) konstrukce vlastního rodokmenu seznámení s pravidly tvorby rodokmenů pokyny pro tvorbu v následujících 4 týdnech si zvolí znak, zjistí výskyt u příbuzných a namalují rodokmen klepněte na obrázek pro přesměrování na video Klepněte pro přímý odkaz do aplikace

20 Experimenty 4) konstrukce vlastního rodokmenu

21 Experimenty 5) sestavení karyotypu neznámého člověka seznámení s pravidly pro identifikaci lidských chromozomů obdrží vyfotografované chromozomy polovina sestavených, polovina neidentifikovaných = mají zařadit do páru

22 Experimenty 5) sestavení karyotypu neznámého člověka mohou si vyzkoušet také elektronicky klepněte na obrázek pro přesměrování na video Klepněte pro přímý odkaz do aplikace

23 Další dovednosti 6) ověření znalostí pomocí animací z e-skript segregace vloh, kombinace vloh, vazba genů klepněte na obrázek pro přesměrování na video Klepněte pro přímý odkaz do aplikace

24 Další dovednosti 6) ověření znalostí pomocí animací z e-skript genetické mapování Klepněte pro přímý odkaz do aplikace klepněte na obrázek pro přesměrování na video

25 Elektronická skripta jsou volně k dispozici přes elportál MU

26 Elektronická skripta jsou volně k dispozici přes elportál MU Klepněte pro přímý odkaz do aplikace klepněte na obrázek pro přesměrování na video

27 Koncepce vzhledem k zájmu (200 a více studentů) praktika navržena tak, aby: nebyla finančně nákladná byla realizovatelná ve standardních prostorách a přitom byla pro studenty přínosná a zajímavá Ohlasy

28 PRAKTIKUM Z GENETIKY ROSTLIN Vyučující: doc. Jana Řepková, CSc. Zaměření na metody genetické analýzy rostlin a problematiku genetických markerů 1. Genetická analýza a identifikace počtu genů odolnosti k padlí u planého ječmene Hordeum vulgare subsp. spontaneum. 2. Určení mikrosatelitních DNA markerů v genetické vazbě s genem odolnosti k padlí travnímu u ječmene. 3. Genetické mapování genů odolnosti k padlí travnímu u ječmene. Využití softwaru pro mapování. 4. Identifikace transgenních rostlin Arabidopsis thaliana prostřednictvím genu rezistence k antibiotiku. 5. Expresní analýza genu pro polyfenoloxidázu u jetele lučního pomocí RT-PCR.

29 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Vyučující: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D. zájem se pohybuje v průměru kolem 60 studentů úspěšnost kolem 92 % 54 má dvě části: výpočtovou praktickou (pro omezený počet zájemců) - obvykle 15 až 20 studentů

30 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Výpočtová část řešení populačně-genetických příkladů formou e-learningu

31 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Výpočtová část řešení populačně-genetických příkladů formou e-learningu klepněte na obrázek pro přesměrování na video

32 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část pracují v 5 členných týmech 1) Celosemestrální pokus s octomilkou Sledování ustavení Hardy-Weinbergovy rovnováhy pro znak vázaný na pohlaví

33 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část vyhodnocování populace v generacích t+1 až t+4 odevzdání týmových protokolů

34 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 2) Vyhodnocení dotazníků z populačního výzkumu v populaci člověka Stanovení Snyderových podílů, ověření HW rovnováhy pro dva znaky v populaci člověka a výpočet podílů heterozygotů mezi fenotypově dominantními jedinci

35 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část každá skupina pracuje s 50 dotazníky

36 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 3) Stanovení shody v profilu DNA

37 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 3) Stanovení shody v profilu DNA

38 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 3) Stanovení shody v profilu DNA

39 PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ 4) Exkurze na Ústavu soudního lékařství a v Laboratoři forenzní genetiky

40 Děkuji za pozornost