INFORMAČNÍ TECHNOLOGIE PRO ZPRACOVÁNÍ EEG I

Transkript

1 INFORMAČNÍ TECHNOLOGIE PRO ZPRACOVÁNÍ EEG I PRAKTICKÉ ZKUŠENOSTI Z PRÁCE S INFORMACEMI NA NEUROLOGICKÉM ODDĚLENÍ VE FN NA BULOVCE doc. Ing. Vladimír Krajča CSc.

2 1. Zadání úkolu- 2. Hierarchie a vazby systému 3. Použité informační technologie v elektroencefalografii 4. Praktické ukázky výsledků

3 1. Úkol: a. Číst a zobrazit digitalizovaná data EEG různých výrobců s různými formáty dat b. Číst a využít archív a databázi pacientů MS Access u EEG přístrojů BrainQuick c. Výsledky využít pro i. Čtení EEG dat ii. Tvobu popisů výsledků EEG hodnocení lékaři iii. Automatizované zpracování výkonů v EEG laboratoři pro pojišťovny

4 3. Použité informační technologie v elektroencefalografii a. EEG přístroje v LAN síti (záznamové a vyhodnocovací stanice) b. Object Oriented Programovací jazyk C++ (všechny přístroje) c. Relační databáze pacientů v MS ACCESS (součást EEG přístroje BrainQuick) d. ODBC (EEG BrainQuick) / WIN XP, WIN 7 Wimdows/SysWow64 e. SQL QUERY (dotaz na EEG stanice BrainQuick) f. OpenGL Library pro 3-D Brain Mapping - grafika

5 4. Praktické ukázky výsledků a. Popis EEG a jeho začlenění do NIS b. Tvorba údajů pro pojišťovny c. Výběr pacienta a zobrazení a analýza EEG záznamu d. Zpracování a analýza ambulantních i dlouhodobých EEG záznamů

6 1. Úkol: a. Číst a zobrazit digitalizovaná data EEG různých výrobců s různými formáty dat b. Číst a využít archív a databázi pacientů MS Access u EEG přístrojů BrainQuick c. Výsledky využít pro i. Čtení EEG dat ii. Tvobu popisů výsledků EEG hodnocení lékaři iii. Automatizované zpracování výkonů v EEG laboratoři pro pojišťovny 2. Hierarchie a vazby systému 3. Použité informační technologie v elektroencefalografii a. EEG přístroje v LAN síti (záznamové a vyhodnocovací stanice) b. OO Programovací jazyk C++ (všechny přístroje) c. Relační databáze pacientů v MS ACCESS (EEG přístroj BrainQuick) d. ODBC (EEG BrainQuick) / WIN XP, WIN 7 - SysWow64 e. SQL QUERY (EEG BrainQuick) f. OpenGL Library pro 3-D Brain Mapping 4. Praktické ukázky výsledků a. Popis EEG a jeho začlenění do NIS b. Tvorba údajů pro pojišťovny c. Výběr pacienta a zobrazení a analýza EEG záznamu d. Zpracování a analýza ambulantních i dlouhodobých EEG záznamů

7 2. Hierarchie a vazby systému Blokové schéma toků informací v IS NIS Unis, Steiner s.r.o. CT, MRI zobrazení, PROPOUŠTĚCÍ ZPRÁVY, LABORATOŘE - BIOCHEMIE, POPISY EEG, HOSPITALIZACE, Žádanky vyšetření, atd. PROPOUŠTĚCÍ ZPRÁVY, NEUROLOGIE EEG LABORATOŘE POPIS EEG ASCII Soubor vytvořený z Access tabulek a sdílený systémem

8 PROSTŘEDKY A STRUKTURA POUŽITÝCH INFORMAČNÍCH TECHNOLOGIÍ U EEG PŘÍSTROJŮ Pacientská databáze v MS Access Zobrazení a analýza ODBC BDE Borland Database Engine Digitalizovaná EEG data TDatabase, TTable, TQuery, TdataSource,... DB nástroje C++ Embarcadero/Borland C++ RAD (rapid developement) Studio

9 Jednotný SW pro hodnocení EEG přístrojů různých výrobců, C++ EEG LABORATOŘE PŘÍSTROJE Další podporované formáty mimo NB NEUROSCAN (VYŘAZEN) BrainQuick, Micromed Italy Ambulance 3 stanice (2x záznam+1x hodnocení) ALIEN AMBULANCE +MONITORACE SCHWARZER BrainLab Videomonitorování 1+1 Walter Graphtec v síti (další podporované formáty) BrainScope v síti (další podporované formáty) 1. Jednotný SW pro hodnocení EEG napsaný v Borland (Embarcadero) C++ pro všechny přístroje na odd. neurologie. Signal browser, brain mapping, spektrální ananlýza, hodnocení dlouhodobých záznamů. Lékaři si nemusí zvykat na ovládání a zobrazení EEG signálů od různých výrobců každý z nich má svůj systém Export / Import dat 2. Žádanky, pojišťovna (výkazy), zprávy o hodnocení EEG. Jen pro systém BQ, který má pacientskou databázi v Accessu. Demografické informace získané z MS ACCESS tabulek EEG systému BrainQuick, Italy. Přenesou se do Borland QuickReport z databáze EEG přístroje. Není nutné znovu zadávat údaje zadané již jednou EEG laborantkami při začátku natáčení. Počítají se automaticky údaje pro pojišťovnu (jednou měsíčně) ASCII EDF (European Data Format) EXCEL

10 EEG přístroje na neurologickém odd. FNB v současnosti 1. Brain Quick, Micromed, Itálie, 2 záznamové stanice a 1 vyhodnocovací v síti 2. Alien, 1 záznamová stanice 3. Schwarzer, BrainLab, 1 stanice pro celonoční videomonitorování a jedna prohlížecí stanice Sjednocený software pro jednotný interface, analýzu, zpracování a zobrazení EEG záznamu, program WaveFinder napsaný v C++

11 BrainQuick, hodnotící stanice

12 Vstup demografických údajů ukládaných do DB Access

13 Databáze pacientských záznamů EEG

14 Alien - výběr pacienta pro hodnocení

15 Alien záznam EEG

16 BrainLab-Schwarzer

17 BrainLab - původní firemní zobrazení EEG a videa

18 BrainLab - jednotné zobrazení, program WF

19 EEG přístroj BrainQuick, Micromed, Italy databáze pacientů v MS Access. Tabulka T_Patient. Klíč ID_Patient

20 Relační databáze BQ vztahy mezi tabulkami

21 MS ACCESS. Rozvinutí tabulky (kódy všech EEG záznamů zadávané laborantkami pro daného pacienta, BQ)

22 MS ACCESS. Další relacet_patient...t_exam... T_File. Datum záznamu, cesta k EEG datům v binárních souborech. Jeden pacient - mnoho záznamů - každý je uložen (cesta a datum)

23 Programovací prostředí. Databázový modul v EMBARCADERO C++ RAD Studio. Komponenty TDatabase, TTable, TQuery, TDataSource. Tabulky odpovídají tabulkám v ACCESSU, nad nimi pracuje komponenta TQuery s SQL příkazy

24 Jak je to propojeno? ODBC -> C++ RAD ODBC (Open Database Connectivity) Standardní software pro přístup k DBMS (Database Management Systems) Nezávislé na programovacích jazycích, databázových a operačních systémech (platformě) Pro hlavní DBMS existují příslušné drivery

25 Aplikace pošle ODBC příkaz driveru (ovladači) Driver příkaz přeloží a pošle DBMS DBMS provede dotaz (query) a pošle výsledek zpět ODBC driveru

26 Microsoft - ODBC Administrátor

27 Vybere se driver

28 Zvolí se jméno zdroje dat (Alias) a specifikuje se cesta k DB datům

29 EEG archív BQ - local archive systém 98 a cesta k němu

30 POZOR! Pro WIN 7 nefunguje 64-bit program ODBC pro Access. Je nutné zvolit 32-bitový driver v C:/Windows/SysWow64/Odbcad32.EXE

31 EEG program WaveFinder. Volba záznamu pacienta z databáze MS Access

32 Možnost jednoduchého přímého přístupu k datům - čteme přímo header EEG souborů (nemáme ale k dispozici komentář a další údaje z DB)

33 Nyní načteme pro daný záznam digitální EEG data

34 Provedeme různá zobrazení, analýzy a zpracování signálu

35

36 Brain Mapping

37 WF

38 Jednotný SW pro hodnocení EEG přístrojů různých výrobců, C++ EEG LABORATOŘE PŘÍSTROJE FNB Další podporované formáty NEUROSCAN (VYŘAZEN) BrainQuick, Micromed Italy Ambulance 3 stanice (2x záznam+1x hodnocení) ALIEN AMBULANCE+MO NITORACE SCHWARZER BrainLab Videomonitorován í 1+1 Walter Graphtec v síti (další podporované formáty) BrainScope v síti (další podporované formáty) 1. Jednotný SW pro hodnocení EEG napsaný v Borland (Embarcadero) C++ pro všechny přístroje na odd. neurologie. Signal browser, brain mapping, spektrální ananlýza, hodnocení dlouhodobých záznamů. Lékaři si nemusí zvykat na ovládání a zobrazení EEG signálů od různých výrobců každý z nich má svůj systém Import dat 2. Žádanky, pojišťovna (výkazy), zprávy o hodnocení EEG. Jen pro systém BQ, který má pacientskou databázi v Accessu. Demografické informace získané z MS ACCESS tabulek EEG systému BrainQuick, Italy. Přenesou se do Borland QuickReport z databáze EEG přístroje. Není nutné znovu zadávat údaje zadané již jednou EEG laborantkami při začátku natáčení. Počítají se automaticky údaje pro pojišťovnu (jednou měsíčně) ASCII EDF (European Data Format) EXCEL