STUDIUM LIPOPROTEINŮ METODOU SEC-LLSD
|
|
- Milada Benešová
- před 6 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta Katedra analytické chemie STUDIUM LIPOPROTEINŮ METODOU SEC-LLSD Lipoprotein Study by the SEC-LLSD Method Diplomová práce studijního oboru Analytická chemie Praha 2014 Bc. Simona Šinglárová
2 Prohlášení Prohlašuji, že jsem závěrečnou práci vypracovala samostatně a že jsem uvedla všechny použité informační zdroje a literaturu. Tato práce ani její podstatná část nebyla předložena k získání jiného nebo stejného akademického titulu. Jsem si vědoma toho, že případné využití výsledků, získaných v této práci, mimo Univerzitu Karlovu v Praze je možné pouze po písemném souhlasu této univerzity. V Praze dne podpis
3 Poděkování Ráda bych zde poděkovala své školitelce RNDr. Evě Tvrzické, CSc. za odborné vedení, všestrannou pomoc, ochotu a cenné připomínky k mojí diplomové práci. Dále bych chtěla poděkovat prof. RNDr. Věře Pacákové, CSc. za odborné konzultace, mým přátelům a rodině za pomoc a trpělivost.
4 Abstrakt Pro diagnostiku poruch lipidového metabolismu, které je třeba podrobně sledovat u řady společensky závažných onemocnění, se v posledních 10 letech ukazuje jako velmi přínosné stanovení velikosti částic jednotlivých lipoproteinových tříd, především lipoproteinu o nízké hustotě. Z několika známých metod jsme zvolili gelovou filtraci s detektorem rozptylu světla. Lipoproteinové frakce byly separovány ultracentrifugací z plazmy čtyř dárců. Rutinně byly stanoveny biochemické parametry celkový cholesterol, triacylglycerol a celková bílkovina pro plazmu i pro jednotlivé frakce. Kolona plněná silikagelem BioBasic SEC 300x7,8 mm byla kalibrována proteiny thyroglobulinem, ovalbuminem a angiotenzinem II s UV detekcí (280 nm). Tyto proteiny nejsou vhodné (velikostí) pro kalibraci metody SEC- LLSD. Proto byly vyzkoušeny latexové kuličky různých modifikací a velikostí. Jediný záznam se podařilo získat od latexových kuliček barvených tmavě modře o velikosti 55 nm, ostatní zůstaly zadržené v koloně. Lipoproteinové frakce VLDL a LDL byly zkoumány metodou SEC-LLSD při různém ph (7,3; 7,5; 7,7; 8,0) a iontové síle (0,1M fosfátový pufr, 0,1M fosfátový pufr a 0,9% NaCl, 0,05M fosfátový pufr a 0,9% NaCl). Optimální mobilní fáze je 0,1M fosfátový pufr a 0,9% NaCl. Dále byla provedena analýza spojených frakcí VLDL a LDL, která poskytla dva nedokonale rozdělené píky. Pro stanovení střední molekulové hmotnosti by rozdělení bylo vyhovující, pro sledování kvantitativních vztahů by bylo třeba dokonalejšího rozdělení spojením více kolon v sérii, případně volbou jiné stacionární fáze.
5 Abstract The disorders of the lipid metabolism have to be monitored for a number of socially significant diseases. For the diagnosis of these disorders, it turned out in the last 10 years as very beneficial to determine the particle size of the individual lipoprotein classes, in particular the low-density lipoprotein. Among several known methods, we have chosen gel filtration with the light scattering detector. Lipoprotein fractions were separated by ultracentrifugation from the plasma of four donors. Three biochemical parameters total cholesterol, triacylglycerol, and total protein were routinely determined for plasma and for each fraction. The silica column BioBasic SEC 300x7,8 mm was calibrated by the proteins thyroglobulin, ovalbumin and angiotensin II with UV detection (280 nm). These proteins are not suitable (due to the size) for the calibration method SEC-LLSD. Therefore, latex beads of various modifications and sizes were tested. The only usable measurement was obtained for the deep-blue latex beads of the size 55 nm, the others remained retained in the column. The lipoprotein fractions of VLDL and LDL were examined by the SEC-LLSD method at different ph (7.3, 7.5, 7.7, 8.0) and ionic strength (0.1M phosphate buffer, 0.1M phosphate buffer and 0.9% NaCl, 0.05M phosphate buffer and 0.9% NaCl). The optimal mobile phase is the 0.1M phosphate buffer and 0.9% NaCl. Further, the mixture of the VLDL and LDL fractions was analyzed, which yielded two imperfectly divided peaks. To determine the average molar mass, this distribution would be acceptable. However, to analyze the quantitative relations more accurately, a more precise distribution would be needed. It could be achieved by combining multiple columns in a series or by selecting a different stationary phase.
6 Obsah 1 Úvod Teoretická část Lipoproteiny Charakteristika lipoproteinů Dělení lipoproteinů Lipoproteiny o velmi nízké hustotě (VLDL) Lipoproteiny o nízké hustotě (LDL) Separace lipoproteinů Detekce pro separaci lipoproteinů Gelová permeační chromatografie Princip separace gelovou permeační chromatografií Náplně kolon Detektor rozptylu světla Metody absolutního měření Historický vývoj detekce rozptylu světla Parametry detektoru Cíl práce Experimentální část Aparatura a reagencie Příprava hustotních roztoků pro ultracentrifugaci Hustotní roztok ρ = 1,006 g/ml Hustotní roztok ρ = 1,157 g/ml Hustotní roztok ρ = 1,182 g/ml Hustotní roztok ρ = 1,210 g/ml Pyknometrické měření hustoty roztoků Fosfátový pufr... 26
7 4.4 Fyziologický roztok Příprava standardů Příprava vzorků Výsledky a diskuze Ověření retenčních časů Kalibrace pomocí latexových kuliček Reprodukovatelnost retenčních časů VLDL a LDL Analýzy lipoproteinových tříd VLDL a LDL Chromatogramy VLDL a LDL vzorku A vliv ph Chromatogramy VLDL a LDL vzorku B vliv ph Chromatogramy VLDL a LDL vzorku C vliv ph Chromatogramy VLDL a LDL vzorku D vliv ph Analýza vzorku B při různém složení mobilní fáze Společná analýza lipoproteinových frakcí VLDL a LDL Závěr Literatura... 47
8 Seznam symbolů a zkratek AK CB CL ER HDL CH IDL LCAT LDL LLSD LPL MK NEMK RSD SD SEC TAG TC VLDL aminokyseliny celková bílkovina chylomikrony endoplazmatické retikulum lipoproteiny o vysoké hustotě cholesterol lipoproteiny o střední hustotě lecitin:cholesterol acyltransferáza lipoproteiny o nízké hustotě detektor rozptylu světla lipoproteinová lipáza mastné kyseliny volné mastné kyseliny relativní směrodatná odchylka směrodatná odchylka gelová permeační chromatografie triacylglyceroly celkový cholesterol lipoproteiny o velmi nízké hustotě
9 1 Úvod Metody pro studium lipidového metabolismu i pro diagnostiku jeho poruch zaznamenaly v posledních 50 letech značný rozvoj. Na počátku 70. let minulého století byla prakticky jediným diagnostickým parametrem koncentrace celkového cholesterolu. Vyšetření tzv. celkové lipemie spektrofotometricky, které spočívalo v měření intenzity produktu sulfofosfovanilinové reakce lipidů, bylo nespecifické a nemělo prakticky žádnou diagnostickou hodnotu. 1 Dnes pod pojmem celková lipémie rozumíme gravimetrické stanovení celkových lipidů v krevním séru; separovaný produkt může být výchozím materiálem pro detailnější chromatografické analýzy. V polovině 70. let tak vyvstala potřeba spolehlivějšího parametru pro diagnostiku metabolických poruch, postupně se rozšířilo stanovení triacylglycerolů. Jejich chemické stanovení bylo založeno na měření oxidačních produktů uvolněného glycerolu, ze vzorku však bylo třeba odstranit rušící fosfolipidy (především lecitin). Konečné řešení přinesly až enzymatické metody založené na selektivní hydrolýze triacylglycerolů specifickými enzymy. Asi v polovině 80. let minulého století bylo dostupné i stanovení fosfolipidů, založené na stanovení lipidního fosforu jako fosfomolybdenové modři. V současné době se již neprovádí. Existence lipoproteinů je známa již od 60. let. 2 Jejich detailní analýza je nejvýznamnějším přínosem pro diagnostiku, ale přes všechny pokroky ještě konečného výsledku nebylo dosaženo. Prvním krokem v tomto směru bylo stanovení cholesterolu v lipoproteinu o vysoké hustotě (HDL-cholesterolu), k tomu přibylo stanovení charakteristické bílkoviny pro lipoprotein HDL apolipoproteinu AI. Analýza vyžaduje specifickou precipitaci lipoproteinů o nízké a velmi nízké hustotě (LDL a VLDL). V 80. letech se k rutinním analýzám přidalo ještě stanovení cholesterolu v lipoproteinu LDL, jeho charakteristického apolipoproteinu B100, a rovněž elektroforetické stanovení celkového profilu lipoproteinů s detekcí bílkoviny. 3 Lipoprotein LDL je znám 9
10 jako aterogenní částice, jeho zvýšená koncentrace je jedním z rizikových faktorů aterosklerózy a jejích komplikací. Proto se upřel zájem výzkumných pracovníků právě na studium tohoto lipoproteinu. V 90. letech se objevily studie popisující výskyt aterogenní frakce LDL s malými částicemi, nazvanými malé denzní LDL, které se ve větší míře objevují u osob s metabolickými poruchami. 4,5,6 Začaly se hledat metodiky, které by velikost částic LDL i dalších lipoproteinů umožnily stanovit rutinně alespoň na specializovaných pracovištích. V první dekádě nového tisíciletí již byly publikovány studie diskutující vhodnost a objektivitu možných metod nukleární magnetické rezonance, elektroforézy na gradientu polyakrylamidu, elekroforézy na sloupci polakrylamidu 7 a gelové filtrace na kolonách plněných TSK gely a sefarózou. 8 Pro kontrolu chromatografie, někdy i pro samotný výzkum, sloužila příprava jednotlivých lipoproteinů ultracentrifugací. Detekce byla i v této době realizována UV-VIS detektorem a byly sledovány bílkoviny, pomocí tzv. post-column reaction cholesterol a triacylglyceroly, případně byla provedena chemická reakce ve sbíraných frakcích eluátu a chromatogram sestával z jednotlivých bodů. 9 Detekce pouze některé ze složek lipoproteinů však zkresluje kvantitativní vztahy. K detekci velikosti lipoproteinové částice LDL byl v minulosti již použit detektor rozptylu světla, ve srovnání s gradientovou elektroforézou na polyakrylamidu. Princip detekce v tomto případě spočíval ve sledování Brownova pohybu a velikost částic byla určena za základě difúzního koeficientu. Využili faktu, že menší částice se pohybují rychleji. 10 Všechny dosavadně používané metody jsou značně pracné a v současné době je nelze provádět rutinně. Spojení gelové filtrační chromatografie by mohlo nabídnout spolehlivou, jednoduchou a přesnou metodu měření velikosti lipoproteinových částic. 10
11 2 Teoretická část 2.1 Lipoproteiny Charakteristika lipoproteinů Lipoproteiny jsou transportní forma plazmatických lipidů. Jejich tvar je většinou kulovitý. Triglyceridy a estery cholesterolu (hydrofobní lipidy) tvoří nepolární jádro a jejich transport je zajištěn asociací s polárnějšími lipidy, které jsou zde zastoupeny fosfolipidy a volným cholesterolem. Ty tvoří povrch lipoproteinu. Další složkou jsou specifické bílkoviny, nazývané apolipoproteiny či apoproteiny. Taktéž přispívají k hydrofilitě částice, transportu hydrofobních lipidů a dále zajišťují vazbu lipoproteinu na receptory buněčných membrán a enzymů či výměnu lipidů mezi lipoproteinovými třídami. Apolipoproteiny jsou na povrchu částice, zanořeny, a jejich hydrofilní část je orientována do vodného prostředí (viz Obr. 2.1). 1,11 14 Obr. 2.1: Schéma lipoproteinu 15 11
12 2.1.2 Dělení lipoproteinů Každý lipoprotein je charakterizován svým chemickým složením a fyzikálními vlastnostmi. Chemické složení je dané poměrným zastoupením jednotlivých složek: fosfolipidů, cholesterolu a jeho esterů, triglyceridů a apolipoproteinů. Lipoproteinové frakce dělíme podle hustoty, flotační konstanty (Sf), elektroforetické pohyblivosti, chemického složení, zastoupení jednotlivých apolipoproteinů. Jednotlivé lipoproteinové třídy nesou z praktických důvodů názvy charakterizující částice na základě jejich hustoty: 1) CL chylomicrons = chylomikrony (chylomikra) 2) VLDL very low density lipoproteins = lipoproteiny o velmi nízké hustotě 3) LDL low density lipoproteins = lipoproteiny o nízké hustotě 4) IDL inermediate density lipoproteins = lipoproteiny o střední hustotě 5) HDL high density lipoproteins = lipoproteiny o vysoké hustotě 1,11, Lipoproteiny o velmi nízké hustotě (VLDL) Plazmatické VLDL jsou syntetizovány v játrech parenchymovými buňkami. Tato třída lipoproteinů obsahuje v charakteristickém fosfolipidovém obalu zanořené apolipoproteiny typu Apo B-100, Apo E a všechny subtypy Apo C. Apolipoprotein B-100 je syntetizován na ribozomech endoplazmatického retikula, v hladkém endoplasmatickém retikulu je zabudován do lipoproteinu. Lipoproteiny se zabudovanou proteinovou složkou prochází Golgiho aparátem, kde jsou navázány sacharidové zbytky a jsou uvolněny z jaterní buňky splynutím sekreční vakuoly s buněčnou membránou do Disseova prostoru a následně do jaterních sinusoidů. Působením lipoproteinové lipázy (LPL) periferních tkání a za účasti lecitin:cholesterol acyltransferázy (LCAT) jsou VLDL metabolizovány přes meziprodukt (IDL) na LDL (viz Obr. 2.2). Velikost částic lipoproteinové třídy VLDL kolísá od 280 do 450 Å, střední molekulární hmotnost je 2, daltonů. 3,15,16 12
13 Obr. 2.2: Přeměna VLDL na další lipoproteinové třídy. 17 NEMK volné mastné kyseliny, TAG triacylglyceroly, C apolipoprotein C, E apolipoprotein E, B 100 apolipoprotein B-100, LPL lipoproteinová lipáza Lipoproteiny o nízké hustotě (LDL) Lipoproteiny LDL jsou produktem metabolismu VLDL. Vznikají přes meziprodukt, kdy je odštěpena část triacylglycerolů, proteinů a esterů cholesterolu. Jediným apolipoproteinem, který zůstává v částici během celého procesu, je Apo B-100. LDL jsou díky němu rozeznány specifickými receptory v buněčné membráně, dochází k pinocytóze a odbourání těchto lipoproteinů v buňce (viz Obr. 2.3). Takto se dostává cholesterol a další LDL složky (včetně vitaminů rozpustných v tucích) do cytoplazmy buněk různých tkání. Lipoproteiny o nízké hustotě jsou zastoupeny několika subfrakcemi, z medicínského hlediska jsou nejzajímavější malé denzní LDL. Obsahují méně cholesterolu než větší LDL částice, ale snáze podléhají modifikaci a díky menší velikosti snadněji pronikají do subendotelového prostoru a nejsou zachyceny LDL receptory. Ve srovnání s většími LDL mají tedy výraznější aterogenní vlastnosti. Velikost částic této lipoproteinové třídy je 120 až 200 Å, průměrná molekulární hmotnost je 2, daltonů. Složení v LDL částicích se u každého člověka liší. U lidí s normálními hodnotami lipidů se nachází přibližně stejné množství velkých a malých LDL. 7,15,18,19 13
14 Obr. 2.3: Navázání LDL na receptorech buňky, pinocytóza a odbourání; ER endoplazmatické retikulum, MK mastné kyseliny, AK aminokyseliny, CH cholesterol Separace lipoproteinů Fyzikální a chemické vlastnosti umožňují dělení lipoproteinů různými separačními metodami, zejména elektroforetickými, ultracentrifugačními, precipitačními či chromatografickými. Pro detailní studium složení lipoproteinů lze vzájemně tyto metody kombinovat. Frakce lipoproteinů prakticky nikdy není homogenní. To je důsledek variability charakterizujících znaků. Čím je hustota lipoproteinové třídy větší, tím je homogennější populace lipoproteinů. 1 Základní parametry jsou přehledně uvedeny v Tab
15 Tab. 2.1: Složení lipoproteinů v plazmě 20 Elektroforetické metody Povrchový elektrický náboj umožňuje separaci lipoproteinů elektroforetickými metodami. Je daný složením částice a určuje její elektroforetickou mobilitu. Nejčastěji používanou technikou je elektroforéza na agaróze, kterou lze dělit všechny lipoproteinové třídy. Je možné použít i jiné nosiče jako např. polyakrylamidový gel, acetát celulózy, papír. Mobilita lipoproteinových frakcí je rozdílná dle typu nosiče (viz Obr. 2.4). 1,21 Obr. 2.4: Srovnání elektroforézy lipoproteinových tříd na polyakrylamidovém gelu a agaróze 22 15
16 Po rozdělení jsou lipoproteiny fixovány a barveny barvivy specifickými buď pro lipid (Sudanová čerň) nebo pro bílkovinu (Coomassie Brilliant Blue); poté jsou usušeny a pomocí denzitometrie (metoda měření optické hustoty) se zjišťuje relativní zastoupení nebo obsah jednotlivých frakcí. Inovativní metodou elektroforézy na polyakrylamidovém gelu je tzv. Lipoprint (viz Obr. 2.5). Analyzuje lipoproteinové frakce a podskupiny ze séra i plazmy. Princip této metody je v měření cholesterolu v každé frakci, u lipoproteinů LDL rozlišuje až 7 podskupin. Podmínkou této separace je koncentrace celkového cholesterolu > 100 mg/dl. Pohyblivost lipoproteinových frakcí je ovlivněna fyzikálními vlastnostmi nosiče, náboje lipoproteinů a také koncentrací nanášených vzorků. Elektroforetické metody je nezbytné provádět precizně, častým zdrojem chyb je také nestandardní kvalita nosičů. 1 Obr. 2.5: Analýza lipoproteinových tříd krevního séra elektroforézou na polyakrylamidu: a) fyziologické rozložení, b) hyperlipoproteinemie 23 Ultracentrifugační metody Poměr apolipoproteinů vůči lipidům určuje hustotu lipoproteinové částice, což je základní rys, který umožňuje separaci jednotlivých lipoproteinových tříd ultracentrifugací. Lipoproteiny v prostředí o různé hustotě sedimentují či flotují díky gravitačnímu poli ultracentrifugy. Postupnou změnou hustoty je možné 16
17 izolovat jednotlivé frakce, které mohou následně sloužit k detailnější analýze subfrakcí a jiným studiím. Mezi ultracentrifugačním a elektroforetickým chováním lipoproteinů existují vztahy podmíněné složením lipoproteinů a vlastnostmi nosiče (viz Obr. 2.6). Kompletní izolace lipoproteinových frakcí ultracentrifugační metodou trvá několik dní a je značně pracná. 1,24,25 Obr. 2.6: Srovnání elektroforetické mobility lipoproteinů na polyakrylamidovém gelu a agaróze s dělením ultracentrifugací 22 Precipitační metody Princip těchto metod je založen na selektivním srážení lipoproteinů obsahujících Apo B-100 některými dvojmocnými ionty v přítomnosti sulfopolysacharidů. Lipoproteiny VLDL a LDL jsou vysráženy, HDL zůstávají v roztoku. Nedostatkem těchto metod je omezené použití v případě vysoké koncentrace triacylglycerolů, srážení VLDL nebývá kvantitativní. Ideální koncentrace triacylglycerolů je okolo 300 mg/dl. Precipitační metody jsou rychlé, jednoduché a bez nároků na instrumentální techniku. Je nutné dbát zvýšené opatrnosti na optimální podmínky precipitace (teplota, doba stání). 1 17
18 Chromatografické metody Pro separaci lipoproteinů je možné využít gelovou permeační chromatografii (SEC) nebo afinitní chromatografii. U SEC se pro stanovení lipoproteinových frakcí využívají kolony plněné silikagelem, metakrylátovou pryskyřicí, sefarózou (agaróza). Separace probíhá za izokratických podmínek. U afinitní chromatografie se používá kolona plněná iontovýměnnou pryskyřicí (ligand diethylaminoethyl) a dělí lipoproteiny v opačném pořadí, než je běžné HDL, LDL, VLDL. Druhou možností je stacionární fáze heparin-sefaróza. 1,11 Problémem, především u elektroforetických a chromatografických metod, je možnost kalibrace. Podobný tvar a definovanou velikost mají například latexové kuličky. Bohužel mají rozdílný povrchový náboj, tudíž jsou nevhodné pro elektroforézu a v chromatografických kolonách jsou ireverzibilně zadrženy. Jediným možným řešením je tedy sada lipoproteinových frakcí, u kterých je stanovena velikost částic pomocí elektronového mikroskopu (viz Obr. 2.7). Obr. 2.7: Lipoproteinové třídy pod elektronovým mikroskopem Detekce pro separaci lipoproteinů Pro stanovení lipoproteinů se ve většině případů používá detektor UV-VIS, jehož odezva reflektuje bílkovinu, cholesterol či triacylglyceroly s využitím tzv. post-column reaction. Tento způsob detekce nedává objektivní informaci 18
19 o celkovém množství analyzované látky; např. lipoprotein VLDL poskytne velmi malou odezvu na bílkovinu i cholesterol, a vysokou odezvu na svou hlavní složku triacylglyceroly. S postupným zmenšováním částic lipoproteinů v řadě VLDL-LDL-HDL vzrůstá odezva na bílkovinu a cholesterol a pro triacylglyceroly klesá. Jedinou objektivní metodou pro detekci celkového množství je použití detektoru rozptylu světla, který detekuje množství hmoty procházející celou. 2.2 Gelová permeační chromatografie Gelová permeační (filtrační) chromatografie je speciální druh kolonové kapalinové chromatografie. Tato metoda je vhodná například pro zakoncentrování vzorků, frakcionaci, či v našem případě pro stanovení molekulové hmotnosti Princip separace gelovou permeační chromatografií Dělení není na principu ustanovení rovnováhy mezi mobilní a stacionární fází, ale stacionární fáze zde figuruje jako molekulové síto, tudíž separuje molekuly dle jejich velikosti. Chromatografická kolona je naplněna malými částicemi gelu, který obsahuje póry definovaných rozměrů. Prostor mezi částicemi gelu a póry je vyplněn roztokem mobilní fáze. K separaci dochází ve chvíli, kdy molekuly různých velikostí difundují do kapalné fáze přítomné v pórech gelu. Molekuly menší než póry gelu difundují a čím je průměr molekul menší, tím pronikají hlouběji, jsou déle retardovány a mají větší retenční čas. Velké molekuly, které mají průměr větší než póry gelu, nejsou zadrženy vůbec, jejich eluční čas je roven mrtvému objemu kolony. 26, Náplně kolon Na počátku vývoje gelové filtrační chromatografie bylo konstrukčním materiálem sklo. Mezi výhody patří chemická i tepelná odolnost, inertnost, průhlednost umožňuje kontrolu plnění kolony a stav gelového lůžka v průběhu 19
20 používání. Nevýhodou jsou mechanické vlastnosti jako například malá odolnost vůči tlaku. Proto je v současné době nejpoužívanějším konstrukčním materiálem nerezová ocel, méně často titan či nikl. Nejčastěji používané gely: Dextranové gely Dextran je produkt bakteriální přeměny sacharózy, zesíťovaný epichlorhydrinem v alkalickém prostředí. Dextranový gel se vyrábí z fragmentů dextranu. Komerční název je Sephadex. Agarózové gely Agaróza je polysacharid získávaný purifikací agaru z mořských řas. Při zpracování agaru se odstraní nabité polysacharidy, zahřátý roztok elektroneutrální agarózy po ochlazení spontánně tvoří gel. Zesíťování agarózy se dosáhne reakcí s 2,3-dibrompropanolem v alkalickém prostředí. Velikost pórů určuje podíl agarózy. Komerční název Sepharosa, Bio-Gel A. Polyakrylamidové gely Připravují se kopolymerací akrylamidu (monomer) a N,N methylenbisakrylamidu (dimer). Výhodou tohoto gelu oproti výše zmíněným je odolnost proti mikrobiálnímu růstu. Komerční název je BioGel P. Silikagel Pórovitá forma oxidu křemičitého je nejrozšířenější polární sorbent. Lze jej připravit ve velmi čisté formě. Nejčastější velikost částic náplně je 3, 5 a 10 µm. Aktivními centry na povrchu silikagelu jsou hydroxylové resp. silanové skupiny (Si-OH). Povrch silikagelu je slabě kyselý, více zadržuje bazické látky než neutrální a kyselé a může způsobit jejich chvostování. Tomu lze zabránit přídavkem slabé organické báze do mobilní fáze. Kolony mají široké komerční využití. 20
21 Dále jsou známy i gely metakrylátové, polyvinylacetátové, polystyrénové a další. 28,29, Detektor rozptylu světla Metody absolutního měření Základní metody absolutního měření jsou založeny na základních fyzikálních charakteristikách a jejich vztahu k molární hmotnosti. Mezi nejpoužívanější patří membránová osmometrie, sedimentace, hmotnostní spektrometrie a rozptyl světla. Nevýhodou měření pomocí membránové osmometrie a sedimentace je časová náročnost a schopnost objemové charakterizace pouze na jedné úrovni, bez dalšího rozlišení částic vzorku. Metody pro separaci částic o různé velikosti se začaly používat až s rozvojem chromatografie HPLC a SEC. Detektor rozptylu světla využívá těchto separačních metod a jeho výhodou je, že není nutné jej kalibrovat při provádění experimentů Historický vývoj detekce rozptylu světla Základem detekce je rozptyl světla při jeho průchodu zkoumaným vzorkem. Tato měření byla v padesátých a šedesátých letech 20. století nejprve prováděna s jedním pohyblivým senzorem (Brice-Phoenix, Sofica), který na daných pozicích zachycoval množství dopadajícího světla. V sedmdesátých letech začal být tento senzor nahrazován několika statickými, umístěnými pod příslušnými úhly (Phillips). Ve stejné době se také začal používat laserový zdroj, který nahradil konvenční zdroj světla rtuťovou výbojku. Laserový zdroj umožňuje vysílat velmi úzký paprsek, díky čemuž došlo k výraznému zvýšení přesnosti. Používá se v detektoru LALLS Low Angle Laser Light Scattering (Kaye a spol.), který slouží k měření světla dopadajícího pod úhly menšími než 10 od vysílaného laserového paprsku. Začátkem devadesátých 21
22 let byl uveden na trh první laserový detektor s více statickými senzory MALLS Multi Angle Laser Light Scattering Parametry detektoru V provedených experimentech se používá detektor rozptylu světla MALLS SECcurity SLD7000. Tento detektor měří absolutní molekulovou hmotnost, velikost a prostorovou konfiguraci molekul v roztoku. Pro určení absolutní molekulové hmotnosti je nutné určit závislost indexu lomu na koncentraci, dn/dc. Základními komponentami detektoru jsou cylindrická cela, laserový zdroj, optická vlákna a CCD senzor. Laserový zdroj o výkonu 35 mw vysílá vertikálně polarizovaný světelný paprsek o vlnové délce 635 nm, který prochází mobilní fází se zkoumanými částicemi, čímž dochází k jeho rozptylu. Intenzita nese informaci o molární hmotnosti a úhel nese informaci o velikosti částice. Senzory jsou umístěny pod úhly 35, 50, 75, 90, 105, 130, 145 (viz Obr. 2.8). Cylindrická cela má objem 100 µl. 32,33 Optická vlákna LASER Cylindrická cela Obr. 2.8: Schematické znázornění detektoru 34 22
23 3 Cíl práce Cílem práce bylo prostudovat chromatografické chování lipoproteinů LDL a VLDL metodou gelové permeační chromatografie s laserovým detektorem rozptylu světla. Bylo nezbytné se zabývat otázkou kalibrace, separovat lipoproteinové třídy metodou ultracentrifugace z plazmy a také se pokusit nalézt optimální složení mobilní fáze pro určení velikosti lipoproteinových částic. 23
24 4 Experimentální část 4.1 Aparatura a reagencie Laboratorní úprava vody Direct Q 3 UV, Millipore, Praha, ČR Multifunkční centrifuga Megafuge 16/16R, Thermo Scientific, USA Ultracentrifuga Optima L-100 XP, Beckman Coulter s.r.o, SRN Analytické váhy Sartorius Analytic AC 120 S, SRN ph metr ph 6000, Thermo Scientific, USA Autosampler Finnigan SpectraSYSTEM AS3000, Thermo Electron, USA Gradientová pumpa Finnigan SpectraSYSTEM, Thermo Electron, USA Detektor rozptylu světla SECcurity SLD7000, Brookhaven Instruments, USA Detektor UV-VIS Accela, Thermo Scientific, USA Kolona BioBasic SEC 300x7,8 mm s předkolonou 100x7,8 mm, Thermo Electron, USA Thyroglobulin, ovalbumin, angiotensin II, Sigma-Aldrich, SRN Latexové kuličky, Sigma-Aldrich, SRN Chlorid sodný, Sigma-Aldrich, SRN Bromid sodný, Sigma-Aldrich, SRN Hydrogenfosforečnan draselný trihydrát, Sigma-Aldrich, SRN Dihydrogenfosforečnan draselný, Sigma-Aldrich, SRN Azid sodný, Sigma-Aldrich, SRN Hydroxid sodný, Sigma-Aldrich, SRN Dvojsodná sůl kyseliny ethylendiamintetraoctové, Sigma-Aldrich, SRN 4.2 Příprava hustotních roztoků pro ultracentrifugaci Odlišná specifická hustota lipoproteinů, daná jejich odlišným chemickým složením, umožňuje postupnou změnou hustoty prostředí izolovat jednotlivé lipoproteinové frakce. 1 Hustotu roztoků je třeba přeměřit pomocí pyknometru a případně upravit. 24
25 4.2.1 Hustotní roztok ρ = 1,006 g/ml NaCl 23,2 g Na 2 EDTA.. 0,2 g NaN 3.. 1,0 g 1M NaOH.. 2 ml Doplnit destilovanou vodou na 2 l Hustotní roztok ρ = 1,157 g/ml NaBr... 98,7 g Doplnit hustotním roztokem o ρ = 1,006 g/ml na 500 ml Hustotní roztok ρ = 1,182 g/ml NaBr. 118,3 g Doplnit hustotním roztokem o ρ = 1,006 g/ml na 500 ml Hustotní roztok ρ = 1,210 g/ml NaBr. 140,7 g Doplnit hustotním roztokem o ρ = 1,006 g/ml na 500 ml Pyknometrické měření hustoty roztoků 1. Zvážit suchý pyknometr i se zátkou. Hmotnost zaznamenat jako m Naplnit pyknometr destilovanou vodou. Uzavřít vtlačením kapilární zátky tak, aby po nasazení přebytečná voda byla vytlačena, čímž se zamezí výskytu vzduchových bublin. Pyknometr, mimo zátky, pečlivě osušit buničinou. Kapilární zátku pyknometru jemně přejet suchým prstem. Zvážit. Provést 3x, průměr zaznamenat jako m Opakovat stejný postup plnění pyknometru s hustotním roztokem. Provést 3x, průměr zaznamenat jako m 3. Výpočet: ρ = (m 3 m 1 )/(m 2 m 1 ) 25
26 Pokud výsledný roztok nemá požadovanou hustotu, je nezbytné jí upravit. Při vyšší hodnotě se přidá destilovaná voda, při nižší sodná sůl. 4.3 Fosfátový pufr K 2 HPO 4.3H 2 O... 22,82 g KH 2 PO ,61 g Každou navážku doplnit destilovanou vodou na 1 l. Za stálého míchání titrovat první roztok druhým do dosažení požadovaného ph = 7, Fyziologický roztok NaCl. 9,0 g Doplnit destilovanou vodou na 1 l. 4.5 Příprava standardů Thyroglobulin... 10,0 mg Ovalbumin..10,0 mg Angiotensin II...10,0 mg Každou navážku rozpustit v 1 ml fyziologického roztoku. 4.6 Příprava vzorků Do zkumavek s K 3 EDTA byly odebrány vzorky krve. Biologický materiál byl nejdříve stočen 15 minut při 1500 ot/min. Automatickou pipetou byl odebrán vrchní díl. Plazmu je třeba odebírat se zvýšenou opatrností, nad spodní částí s erytrocyty je velmi špatně viditelná vrstva leukocytů. Plazma je dále pipetována do ultracentrifugačních zkumavek společně s hustotními roztoky. Přidává se vždy ke 3 ml plazmy 1,5 ml hustotního roztoku. Hustotní roztok je vybrán na základě Tab. 2.2 podle požadované frakce. 26
27 Tab. 2.2: Přehled flotujících frakcí při dané hustotě hustotního roztoku Materiál Flotující frakce Hustota roztoku ρ (g/ml) Plasma VLDL 1,006 Plazma VLDL + IDL 1,045 Plazma bez VLDL IDL + LDL 1,183 Plazma bez VLDL a IDL LDL 1,153 Do ultracentrifugační zkumavky se pipetuje 3 ml plazmy a udělá se ryska v menisku. Přidá se hustotní roztok. Ultracentrifugace probíhá 20 hod při 36 tis. ot/min a 10 C. Po stočení se odebere vrchní díl frakce VLDL či VLDL+IDL po vyznačenou rysku (viz Obr. 4.1). Přidá se opět 1,5 ml hustotního roztoku a pečlivě rozmíchá tyčinkou. Další frakce se točí při stejných podmínkách. Pokud by se odebralo více, než ukazuje ryska, je nezbytné nejdříve po značku přidat hustotní roztok ρ = 1,006 g/ml a pak až námi zvolený. Lipoproteiny v separovaných frakcích mají dvojnásobnou koncentraci ve srovnání s plazmou. Obr. 4.1: Separované lipoproteinové frakce: a) VLDL, b) LDL 27
28 5 Výsledky a diskuze Pro studium lipoproteinů jsme využili dvou detektorů zapojených v sérii. Detektor UV-VIS měřil při vlnové délce 200 nm, která je uváděná pro většinu lipidů, a dále při délce 280 nm charakteristické pro proteiny. Detektor LLSD poskytoval odezvu paprsku pod 7 úhly (35 o, 50 o, 75 o, 90 o, 135 o, 150 o a 175 o ). 5.1 Ověření retenčních časů Před zahájením analýz lipoproteinů bylo nezbytné zkontrolovat funkčnost kolony. Přiložený chromatogram proteinových standardů od výrobce byl získán na koloně stejného typu, ale jiných parametrů (Tab. 5.1). Srovnání retenčních časů u obou kolon uvádí Tab Tab. 5.1: Parametry kolon Podmínky Dodaná kolona Vzorový chromatogram BioBasic SEC 300, 5μm 300x7.8 mm 300x4.6 mm Velikost pórů 300 Ǻ 300 Ǻ Mobilní fáze 0,1M fosfátový pufr ph = 7,0 0,1M fosfátový pufr ph = 7,0 Průtok 1 ml/min 0,35 ml/min Vlnová délka 280 nm 280 nm Nástřik 20 µl 20 µl Tab. 5.2: Retenční časy proteinových standardů Standard \ rozměr kolony SEC 300x7,8 mm 300x4,6 mm thyroglobulin 7,35 min 6,33 min ovalbumin 9,96 min 8,62 min angiotenzin II 13,08 min 11,13 min Jednotlivé chromatogramy s UV detekcí při vlnové délce 280 nm získané na koloně o rozměrech 300x7,8 mm jsou uvedeny na Obr
29 Obr. 5.1: Chromatogramy proteinových standardů Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,0, 1 ml/min Analýza thyroglobulinu s detekcí LLSD a UV o vlnových délkách 200 nm a 280 nm na koloně SEC 300x7,8 mm je uvedena na Obr Obr. 5.2: Záznam chromatogramu thyroglobulinu s detekcí a) UV, b) LLSD Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,0, 1 ml/min 29
30 Získané analýzy prokázaly, že kolona poskytuje obdobné chromatogramy jako vzorový chromatogram od výrobce. Kalibrační závislost logaritmu molekulové hmotnosti na retenčním čase je uvedena v Tab. 5.3 a na Obr Tab. 5.3: Deklarovaná molekulová hmotnost v závislosti na retenčním čase Protein Retenční čas (min) Molekulová hmotnost (kda) log M r thyroglobulin 7,35 660,0 2,82 ovalbumin 9,96 45,0 1,65 angiotenzin II 13,08 1,045 0,02 Obr. 5.3: Kalibrační závislost molekulové hmotnosti (kda) na retenčním čase Naměřená závislost odpovídá údajům od výrobce. Použití této závislosti pro určení molekulových hmotností lipoproteinů je sporné, protože převážně leží mimo měřenou oblast. Navíc lipoproteiny nejsou homogenní makromolekuly, ale heterogenní částice s obsahem řady různých molekul. Optimální pro kalibraci by byly částice definovaného rozměru a kulovitého tvaru, jako mají lipoproteiny. Proto jsme vyzkoušeli vzorky latexových kuliček. 30
31 5.2 Kalibrace pomocí latexových kuliček Pro experiment byla zvolena kalibrace pomocí latexových kuliček. K dispozici byly následující latexové kuličky od firmy Sigma o specifické velikosti: Latexové kuličky polystyrenové, velikost částic 0,1 µm Latexové kuličky obarvené tmavě modře (deep blue dyed), velikost částic 0,055 µm Latexové kuličky obarvené tmavě modře (deep blue dyed), velikost částic 0,24 µm Latexové kuličky polystyrenové modifikované sulfátem (sulfate-modified polystyrene), velikost částic 0,1 µm Latexové kuličky polystyrenové modifikované karboxylem, fluoreskující žluto-zeleně (carboxylate-modified polystyrene, fluorescent yellow-green), velikost částic 0,03 µm Tato metoda kalibrace by byla použitelná, pokud by latexové kuličky o alespoň třech různých velikostech dávaly vhodnou odezvu. Ze všech testovaných vzorků jsme obdrželi odezvu pouze z kuliček obarvených modře o velikosti 0,055 µm, ostatní vzorky zůstaly zadržené v koloně. Záznam tohoto vzorku je uveden na Obr
32 Obr. 5.4: Chromatogram latexových kuliček deep blue o velikosti 0,055 µm Vzorek: latexové kuličky o velikosti 0,055 µm, naředěn 1:1, nástřik: 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,5 a 0,9% NaCl, 1 ml/min Vzorek latexových kuliček poskytl chvostující pík, který zřejmě v maximu odpovídá deklarované velikosti, ale pravděpodobně obsahuje ještě populaci dalších částic s postupně klesající velikostí. Bohužel nebylo v našich možnostech tuto hypotézu ověřit. Řešením by mohlo být proměření vzorku elektronovým mikroskopem, který v době měření nebyl dostupný. 5.3 Reprodukovatelnost retenčních časů VLDL a LDL Pro test aparatury jsme provedli sérii měření obou lipoproteinových frakcí. Statistické zhodnocení retenčních časů (min) je uvedeno v Tab Měření bylo provedeno v mobilní fázi o ph 7,5. Výsledek považujeme za uspokojivý, je opět v souladu s údaji uváděnými výrobcem kolony. 41 Tab. 5.4: Statistické zhodnocení reprodukovatelnosti retenčních časů Měření / frakce RRT 1 (min) RRT 2 (min) RRT 3 (min) RRT 4 (min) RRT 5 (min) Medián (min) SD (min) RSD (%) VLDL 5,13 5,31 5,16 5,22 5,19 5,19 6, ,21 LDL 6,01 5,99 5,90 6,04 6,05 6,01 5, ,88 32
33 5.4 Analýzy lipoproteinových tříd VLDL a LDL Pro optimalizaci metody bylo nezbytné proměřit různé podmínky pro analýzy VLDL a LDL a najít nejvhodnější. Přirozeným prostředím pro lipoproteiny v živém organismu je fyziologický roztok pufrovaný fosfátem. Využití tohoto roztoku pro chromatografické dělení lipoproteinových frakcí bylo popsáno řadou autorů. 35,36 Zkoumali jsme vliv ph a iontové síly na retenční čas, tvar píku a jeho velikost. Analyzovali jsme separované lipoproteiny LDL a VLDL 4 osob dobrovolných dárců. V plazmě a jednotlivých frakcích byly změřeny koncentrace celkového cholesterolu (TC), triacylglycerolů (TAG) a celkové bílkoviny (CB) rutinními vyšetřovacími metodami. Vyšetření bylo provedeno v Centrálních laboratořích Ústavu klinické biochemie a laboratorní diagnostiky Všeobecné fakultní nemocnice v Praze. 33
34 5.4.1 Chromatogramy VLDL a LDL vzorku A vliv ph Vzorek A: muž, 55 let Biochemické parametry v plazmě: TC 5,34 mmol/l, TAG 1,65 mmol/l, CB 70,5 g/l Obr. 5.5: Vliv ph na chromatogram VLDL vzorku A. Značka v čase 5,50 ukazuje retenční čas standardu velikosti částic 55 nm. Biochemické parametry frakce: TC 0,46 mmol/l, TAG 1,26 mmol/l, CB 0,8 g/l, nástřik: 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,3; 7,5; 7,7; 8,0; průtok 1 ml/min 34
35 Obr. 5.6: Vliv ph na chromatogram LDL vzorku A. Značka v čase 5,50 ukazuje retenční čas standardu velikosti částic 55 nm. Biochemické parametry frakce: TC 2,54 mmol/l, TAG 0,23 mmol/l, CB 1,0 g/l, nástřik: 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,3; 7,5; 7,7; 8,0; průtok 1 ml/min 35
36 5.4.2 Chromatogramy VLDL a LDL vzorku B vliv ph Vzorek B: žena, 54 let Biochemické parametry v plazmě: TC 5,55 mmol/l, TAG 1,20 mmol/l, CB 71,6 g/l Obr. 5.7: Vliv ph na chromatogram VLDL vzorku B. Značka v čase 5,50 ukazuje retenční čas standardu velikosti částic 55 nm. Biochemické parametry frakce: TC 0,40 mmol/l, TAG 0,81 mmol/l, CB 1,0 g/l, nástřik 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,3; 7,5; 7,7; 8,0; průtok 1 ml/min 36
37 Obr. 5.8: Vliv ph na chromatogram LDL vzorku B. Značka v čase 5,50 ukazuje retenční čas standardu velikosti částic 55 nm. Biochemické parametry frakce: TC 3,48 mmol/l, TAG 0,24 mmol/l, CB 1,6 g/l, nástřik 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,3; 7,5; 7,7; 8,0; průtok 1 ml/min 37
38 5.4.3 Chromatogramy VLDL a LDL vzorku C vliv ph Vzorek C: žena, 25 let Biochemické parametry v plazmě: TC 5,05 mmol/l, TAG 0,78 mmol/l, CB 68,6 g/l Obr. 5.9: Vliv ph na chromatogram VLDL vzorku C. Značka v čase 5,50 ukazuje retenční čas standardu velikosti částic 55 nm. Biochemické parametry frakce: TC 0,19 mmol/l, TAG 0,46 mmol/l, CB 0,9 g/l, nástřik: 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,3; 7,5; 7,7; 8,0; průtok 1 ml/min 38
39 Obr. 5.10: Vliv ph na chromatogram LDL vzorku C. Značka v čase 5,50 ukazuje retenční čas standardu velikosti částic 55 nm. Biochemické parametry frakce: TC 2,74 mmol/l, TAG 0,17 mmol/l, CB 1,1 g/l, nástřik: 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,3; 7,5; 7,7; 8,0; průtok 1 ml/min 39
40 5.4.4 Chromatogramy VLDL a LDL vzorku D vliv ph Vzorek D: žena, 69 let Biochemické parametry v plazmě: TC 5,97 mmol/l, TAG 2,15 mmol/l, CB 76,7 g/l Obr. 5.11: Vliv ph na chromatogram VLDL vzorku D. Značka v čase 5,50 ukazuje retenční čas standardu velikosti částic 55 nm. Biochemické parametry frakce: TC 0,45 mmol/l, TAG 1,45 mmol/l, CB 0,7 g/l, nástřik: 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,3; 7,5; 7,7; 8,0; průtok 1 ml/min 40
41 Obr. 5.12: Vliv ph na chromatogram LDL vzorku D. Značka v čase 5,50 ukazuje retenční čas standardu velikosti částic 55 nm. Biochemické parametry frakce: TC 3,72 mmol/l, TAG 0,46 mmol/l, CB 1,3 g/l, nástřik: 20 µl Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,3; 7,5; 7,7; 8,0; průtok 1 ml/min 41
42 Chování lipoproteinů bylo sledováno při hodnotách ph mobilní fáze 7,3, 7,5, 7,7 a 8,0 (viz Obr ). Z uvedených chromatogramů je zřejmé, že ph ovlivňuje jak retenční čas píku, tak i velikost odezvy. Posun retenčního času k vyšším hodnotám odpovídá zmenšení velikosti částice. Je možné, že obal lipoproteinu, který obsahuje cholinovou hlavu fosfolipidu, volný cholesterol a bílkovinné složky (apolipoproteiny), reaguje na změnu acidity změnou konformace jednotlivých složek. Je známo, že na lipoproteiny jsou vázány lipolytické enzymy (převážně pankreatická lipáza), jejíž ph optimum je 9; dlouhodobým skladováním vzorků došlo k prakticky úplnému rozštěpení. V rámci analýzy tento trend není patrný, ale při ph 8 je na záznamech vidět další pík při 280 nm, který odpovídá nízkomolekulárním složkám. Tento efekt je mnohem výraznější u LDL než u VLDL. Pro další studium jsme zvolili hodnotu ph mobilní fáze 7,5. Dále je možné, že změnou ph dochází k určité modifikaci stacionární fáze silikagel je znám svou citlivostí vůči alkalickému prostředí
43 5.5 Analýza vzorku B při různém složení mobilní fáze Obr. 5.13: Vliv iontové síly na chromatogram VLDL vzorku B a) 0,1M fosfátový pufr s 0,9% NaCl, ph 7,5 b) 0,1M fosfátový pufr bez NaCl, ph 7,5 c) 0,05M fosfátový pufr s 0,9 % NaCl, ph 7,5 Přidání NaCl do mobilní fáze v koncentraci odpovídající fyziologickému roztoku snížilo retenční čas, což odpovídá zvětšení částice; snížení koncentrace fosfátu za přítomnosti NaCl retenční čas zvýšilo a částice za těchto podmínek má menší rozměr, viz Obr Pro další studie proto navrhujeme složení mobilní fáze chromatogramu a), které se nejvíc blíží fyziologickým podmínkám. Zvyšování koncentrace NaCl by ovlivnilo konformaci proteinů na povrchu lipoproteinu a pravděpodobně změnilo velikost částice. Cílem je určení velikosti za fyziologických podmínek. Asymetrie píku může být důsledkem přítomnosti širší populace velikosti částic a pravděpodobně tvoří obalovou křivku. 43
44 5.6 Společná analýza lipoproteinových frakcí VLDL a LDL Dalším krokem byl pokus o analýzu spojených frakcí LDL a VLDL (viz Obr. 5.14), což by umožnilo stanovit průměrnou velikost částic obou lipoproteinových tříd na základě jedné ultracentrifugační separace. Zde jsme sledovali především vliv průtoku, jelikož nejvhodnější prostředí již bylo vybráno při analýzách samostatných frakcí. Obr. 5.14: Analýza spojených frakcí VLDL a LDL vzorku B Mobilní fáze: 0,1M fosfátový pufr ph = 7,5 s 0,9% NaCl, 1 ml/min (a) a 0,5 ml/min (b) Analýzou spojených frakcí jsme dostali dva nedokonale rozdělené píky, u kterých by bylo možné určit střední velikost částic. Protože latexové standardy neposkytly až na jednu výjimku odezvy, nemohli jsme určit kalibrační závislost molekulové hmotnosti na retenčním čase. Vzorky VLDL ve srovnání 44
45 s latexovým standardem o velikosti 55 nm vykazovaly větší velikost částic, vzorky LDL menší velikost. Konkrétní číselné hodnoty nebylo možné zjistit. Spolehlivou kalibraci kolony lze provést pomocí separovaných lipoproteinů, jejichž velikost byla určena elektronovým mikroskopem. Tato technika bohužel nebyla v době vypracování studie k dispozici. Dělení všech lipoproteinových tříd včetně HDL sledovali Carroll a Rudel 38 na kolonách TSK SW 3000, TSK SW 4000 (silikagel) a TSK PW 5000 (metakrylát). Kolony měly rozměr 600x7,5 mm a byly zapojeny v sérii v různých kombinacích. Nejlepšího rozdělení lipoproteinů LDL a VLDL bylo dosaženo spojením všech tří kolon, což představuje celkovou délku 1800 mm, tedy šestkrát větší než naše kolona. Lze předpokládat, že spojením alespoň 2 kolon bychom rovněž dosáhli lepšího rozdělení. Ze srovnání analýz je zřejmé, že kolona BioBasic SEC 300 má lepší separační vlastnosti. Autoři poukázali také na nižší stabilitu i životnost kolon plněných silikagelem ve srovnání s kolonou plněnou metakrylátem. Další autoři 35 rozdělili lipoproteiny izolované ultracentrifugací na koloně 300x10 mm plněné sefarózou. Velikost LDL stanovili pomocí 2 kalibrátorů LDL o známé velikosti. Referenční metodou byla elektroforéza na gradientu polyakrylamidu. V novější studii sledovali Nanjee et al. 39 chemické složení lipoproteinových tříd separovaných rovněž na sefaróze. Záznam chromatogramu byl sestaven z jednotlivých eluovaných frakcí, ve kterých byly analyzovány jednotlivé lipidy. Frakce lipoproteinů byly dokumentovány elektronovým mikroskopem, změřené velikosti částic však nesloužily ke kalibraci kolony. 45
46 6 Závěr Cílem práce bylo optimalizovat metodu SEC-LLSD, tedy najít vhodné podmínky pro analýzu lipoproteinových frakcí VLDL a LDL. Z výsledků lze určit optimální mobilní fázi o složení 0,1M fosfátový pufr a 0,9% NaCl, ph 7,5 a průtoku 1 ml/min. Eluční křivky chvostují, což může být způsobeno jednak nehomogenitou lipoproteinových frakcí, jednak faktem, že kolona plněná silikagelem je citlivá na ph > 7, a možná i mírně bazickým charakterem lipoproteinů. Dalším pokusem byla společná analýza lipoproteinových tříd VLDL a LDL. Dokonale oddělit obě frakce se nezdařilo, zlepšení by se dalo docílit spojením dvou nebo více kolon v sérii. V kolonách pro řešení této problematiky je velmi malý výběr. V budoucnu by bylo vhodné zkusit separaci na koloně plněné sefarózou. Neúspěšné analýzy latexových kuliček vypovídají o nevhodnosti daného materiálu ke kalibraci. Nejspíš byly trvale zadrženy ve stacionární fázi. Bohužel se tímto přišlo o nejsnazší a nejekonomičtější možnost kalibrace. Nejspolehlivější, i když ekonomicky náročnější, je kalibrace samotnými lipoproteiny předem změřenými elektronovým mikroskopem, což by mohlo být předmětem další práce. 46
47 7 Literatura [1] J. Skořepa a spolupracovníci: Lipidy a riziko koronární aterosklerózy, Praha, Univerzita Karlova,1980 [2] Alaupovic P.: Recent advances in metabolism of plasma lipoproteins, Prog. Biochem Pharmacol, 4, , 1968 [3] Novák F.: Úvod do klinické biochemie, Karolinum, Praha 2002 [4] Ambrosch A., Müller R., Freytag C., Borgmann S., Kraus J., Dierkes J., Neumann K. H., König W.: Small-sized low-density lipoproteins of subclass B from patients with end-stage renal disease effectively augment tumor necrosis factor-α-induced adhesive properties in human endothelial cells, American Journal of Kidney Diseases, 39, , 2002 [5] Mykkanen L., Kuusisto J., Haffner S. M., Pyorala K., Laakso M.: Hyperinsulinemia Predicts Multiple Atherogenic Changes in Lipoproteins in Elderly Subjects, Arterioscler Thromb Vasc Biol, 14, , 1994 [6] Kamigaki A. S., Siscovick D. S., Schwartz S. M., Psaty B. M., Edwards K. L., Raghunathan T. E., Austin M. A.: Low Density Lipoprotein Particle Size and Risk of Early- Onset Myocardial Infarction in Women, Am. J. Epidemiol., 153(10):939-45, 2001 [7] Stein E. A.: Are Measurements of LDL Particles Ready for Prime Time?, Clinical Chemistry, 52, , 2006 [8] S. Usui, Y. Hara, S. Hosaki, M. Okazaki: A new on-line dual enzymatic method for simultaneous quantification of cholesterol and triglycerides in lipoproteins by HPLC, Journal Lipid Research, 43, , 2002 [9] Maki K. C., Davidson M. H., Cyrowski M. S. et al.: Low-density lipoprotein subclass distribution pattern and adiposity-associated dyslipidemia in postmenopausal women, Journal of the American College of Nutrition, 19, 23-30, 2000 [10] O'Neil D., Harrip P., Dragicevic G., Rae D., Best J.D.: A comparison of LDL size determination using gradient gel electrophoresis and light-scattering methods, Journal od Lipid research, 39, , 1998 [11] Tvrzická E.: Chromatografické metody v analýze lipidů, Vysokoúčinné analytické separace biologicky aktivních látek, VŠCHT, Praha [12] Swinkels D. W., Hak-Lemmers H. L., Demacker P. N.: Single spin density gradient ultracenrifugation method for the detection and isolation of light and heavy low denstiy lipoprotein subractions, J. Lipid. Res. 28, , 1987 [13] Kraus R. M., Blanche P. J.: Detection and quantification of LDL subractions, Curr. Opin. Lipidol, 3, ,
48 [14] Nichols A. V., Kraus R. M., Musliner T. A.: Nondenaturing polyacrylamide gradient gel electrophoresis, Methods Enzymol. 128, , 1986 [15] Jitka Horáková: Kreditní kurz Lipidy. CEVA [online] 28. červen 2012, poslední aktualizace 28. červen 2012 [cit ]. Dostupný z: ISSN [16] Murray R. K., Granner D. K., Mayes P. A., Rodwell V. W.: Harperova biochemie, Nakladatelství H+H, Jinočany 2002 [17] Ledvina, M., Stoklasová, A., Cerman, J.: Metabolické osudy lipidů a cholesterolu v těle, Biochemie pro studující medicíny, I. Díl, Praha: Karolinum, , 2004 [18 ]Wikiskripta Ateroskleréza, [cit ], dostupné z: [19] Rizzo M., Berneis K.: Low density lipoprotein size and cardiovascular risk assesment. Q. J. Med., 99, 1 14, 2006 [20] Pultarová K.: Refraktometrická studie lipoproteinů o nízké hustotě (LDL), Univerzita Karlova v Praze, Přírodovědecká fakulta, 2012 [21] Fredrickson D. S., Levy R. I., Lees R. S.: Fat transport in lipoproteins. An integrated approach to mechanism and disorders. N. Engl. J Med., 145, 34, 1967 [22] Tvrzická E.: Analysa lipidů a lipoproteinů, Univerzita Karlova v Praze, 1. lékařská fakulta, 2006 [23] Lipoprint A Breaktrough In Cholesterol Management, Quantimetrix Corporation, [cit ], dostupné z: [24] Beaumont J. L., Carlson L. A., Cooper G. R., Fejfar Z., Fredrickson D. S., Strasser T.: Classification of hyperlipidemias and hyperlipoproteinemias. Bull. WHO, 43, 891, 1970 [25] Warnick G. R., Cheung M. C., Albers J. J.: Comparison of current methods for highdensity lipoprotein cholesterol quantitation, Clin.Chem., 25, 596, 1979 [26] Churáček J. a kolektiv. Analytická separace látek. Praha: SNTL Nakladatelství echnické literatury, 1990, s ISBN [27] Mori S., Barth H. G.: Size Exclusion Chromatography, Springer, 1999 [28] Berek D., Kubín M., Marcinka K., Dressler M.: Gélová chromatografia, Bratislava, VEDA, 1983, s. 91. [29] Chromatografické metody, Kapalinová chromatografie, PPT dokument, 2012, [cit ], dostupné z: [30] Absolute Technique, Wyatt Technology Europe, [cit ], dostupné z: 48
49 [31] Wikipedia Multiangle Light Scattering, [cit ], dostupné z: < [32] PSS Polymer Standards Service, [cit ], dostupné z: < [33] Static Light Scattering, Wyatt Technology Europe, [cit ], dostupné z: < [34] Kilz P., Hans-Ulrich Ehmcke H. U.: SEC Analysis of Polymers with Light Scattering Detection, G.I.T. Laboratory Journal, 2004 [35] Scheffer P. G., Akker S. J. l., Heine R. J., Teerlink T.: Measurement of low density lipoproteid particle size by high performance gel filtration chromatography, 43: , 1997 [36] Westerlund J., Yao Z.: Elution of lipoprotein fractions containing apolipoproteins E and A-I in size exclusion on Superose 6 columns is sensitive to mobile phase ph and ionic strength, J Chromatogr A., 718, 59 66, 1995 [37] Nordestgaard B.G., Zilvetsmi D. B.: Large lipoproteins are excluded from the arterial wall in diabetic cholesterol-fed rabbits, Journal od Lipid research, 29, , 1988 [38] R. M. Carroll, L. L. Rudel: Lipoprotein separation and low density lipoprotein molecular weight determination using high performance gel-filtration chromatography, Journal Lipid Research, 24, , 1983 [39] Nanjee M.N., Doran, J. E., Lerch P. G., Miller N. E.: Acute Effects of Intravenous Infusion of ApoA1/Phosphatidylcholine Discs on Plasma Lipoproteins in Humans, Arterioscler Thromb Vasc Biol., 19, , 1999 [40] Adsorbenty a chemicky vázané fáze, [cit ], dostupné z: [41] BioBasic HPLC Columns Technical Guide, [cit ], dostupné z: 49
Gelová permeační chromatografie
Gelová permeační chromatografie (Gel Permeation Chromatography - GPC) - separační a čisticí metoda - umožňuje separaci skupin sloučenin s podobnou molekulovou hmotností (frakcionace) - analyty jsou po
Analýza kofeinu v kávě pomocí kapalinové chromatografie
Analýza kofeinu v kávě pomocí kapalinové chromatografie Kofein (obr.1) se jako přírodní alkaloid vyskytuje v mnoha rostlinách (např. fazolích, kakaových bobech, černém čaji apod.) avšak nejvíce je spojován
Chromatografie polymerů III.: IC+LC CC+LC LC. FFF-Field flow fractionation (Frakcionace tokem v silovém poli)
Přednáška 3 Chromatografie polymerů III.: IC+LC CC+LC LC FFF-Field flow fractionation (Frakcionace tokem v silovém poli) Studijní opora pro studenty registrované v akademickém roce 2013/2014 na předmět:
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY ELEKTROFORÉZA K čemu to je? kritérium čistoty preparátu stanovení molekulové hmotnosti makromolekul stanovení izoelektrického
Seminář izolačních technologií
Seminář izolačních technologií Zpracoval: Karel Bílek a Kateřina Svobodová Podpořeno FRVŠ 2385/2007 a 1305/2009 Úpravy a aktualizace: Pavla Chalupová ÚMFGZ MZLU v Brně 1 Lokalizace jaderné DNA 2 http://www.paternityexperts.com/basicgenetics.html
Vysokoúčinná kapalinová chromatografie. Petr Kozlík Katedra analytické chemie
Vysokoúčinná kapalinová chromatografie Petr Kozlík Katedra analytické chemie e-mail: kozlik@natur.cuni.cz http://web.natur.cuni.cz/~kozlik/ 1 Vysokoúčinná kapalinová chromatografie Teorie HPLC Praktické
Izolace nukleových kyselin
Izolace nukleových kyselin Požadavky na izolaci nukleových kyselin V nativním stavu z přirozeného materiálu v dostatečném množství požadované čistotě. Nukleové kyseliny je třeba zbavit všech látek, které
Charakteristika analýzy: Identifikace: APOLIPOPROTEIN A-I (APO-AI) Využití: negativní rizikový faktor aterosklerózy Referenční mez : g/l
Charakteristika analýzy: Identifikace: APOLIPOPROTEIN A-I (APO-AI) Využití: negativní rizikový faktor aterosklerózy Referenční mez : g/l Pohlaví Věk od Mez spodní Mez horní M 4 let 1,110 1,900 Z 50 let
Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253
Příprava materiálu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 Část 16 Iontová chromatografie Iontová chromatografie je speciální technika vyvinutá pro separaci anorganických iontů a organických
Metabolismus lipidů a lipoproteinů. trávení a absorpce tuků
Metabolismus lipidů a lipoproteinů lipidy ~ 98-99% - triacylglyceroly zbytek cholesterol (fytosteroly, ergosterol,..) fosfolipidy DAG, MAG, vitamíny rozp. v tucích, steroidy, terpeny, volné mastné kyseliny
Název: Vypracovala: Datum: 7. 2. 2014. Zuzana Lacková
Název: Vypracovala: Zuzana Lacková Datum: 7. 2. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu MĚLI BYCHOM ZNÁT: informace,
ZÁSADY SPRÁVNÉ LABORATORNÍ PRAXE VYBRANÁ USTANOVENÍ PRAKTICKÉ APLIKACE
ZÁSADY SPRÁVNÉ LABORATORNÍ PRAXE VYBRANÁ USTANOVENÍ PRAKTICKÉ APLIKACE Zabezpečování jakosti v laboratorní praxi je významnou součástí práce každé laboratoře. Problematiku jakosti řeší řada předpisů, z
CHROMATOGRAFIE ÚVOD Společný rys působením nemísících fází: jedna fáze je nepohyblivá (stacionární), druhá pohyblivá (mobilní).
CHROMATOGRAFIE ÚOD Existují různé chromatografické metody, viz rozdělení metod níže. Společný rys chromatografických dělení: vzorek jako směs látek - složek se dělí na jednotlivé složky působením dvou
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU SEMDURAMICINU METODOU HPLC
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU SEMDURAMICINU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Postup specifikuje podmínky pro stanovení obsahu semduramicinu v krmivech metodou vysokoúčinné kapalinové chromatografie (HPLC) v koncentračním
REFRAKTOMETRICKÁ STUDIE LIPOPROTEINU O VELMI NÍZKÉ HUSTOTĚ (VLDL) Refractometric study of very low density lipoprotein (VLDL)
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta Katedra analytické chemie REFRAKTOMETRICKÁ STUDIE LIPOPROTEINU O VELMI NÍZKÉ HUSTOTĚ (VLDL) Refractometric study of very low density lipoprotein (VLDL)
Lipidy. RNDr. Bohuslava Trnková ÚKBLD 1.LF UK. ls 1
Lipidy RNDr. Bohuslava Trnková ÚKBLD 1.LF UK ls 1 Lipidy estery vyšších mastných kyselin a alkoholů (příp. jejich derivátů) lipidy jednoduché = acylglyceroly (tuky a vosky) lipidy složené = fosfoacylglyceroly,
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod: detekce přímo v buňkách - fluorescenční barvení
Kurz 1 Úvod k biochemickému praktiku
Kurz 1 Úvod k biochemickému praktiku Pavla Balínová http://vyuka.lf3.cuni.cz/ Důležité informace Kroužkový asistent: RNDr. Pavla Balínová e-mailová adresa: pavla.balinova@lf3.cuni.cz místnost: 410 studijní
CS Úřední věstník Evropské unie L 54/89
26.2.2009 CS Úřední věstník Evropské unie L 54/89 c) při vlnové délce mezi 230 a 320 nm se nesmí spektrum vzestupné části, vrcholu a sestupné části píku zkoušeného vzorku lišit od ostatních částí spektra
Úvod k biochemickému. mu praktiku. Vladimíra Kvasnicová
Úvod k biochemickému mu praktiku Vladimíra Kvasnicová organizace praktik pravidla bezpečné práce v laboratoři laboratorní vybavení práce s automatickou pipetou návody: viz. aplikace Výuka automatická pipeta
Chromatofokusace. separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení. není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost
Chromatofokusace separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost Polypufry - amfolyty Stacionární fáze Polybuffer 96 - ph 9-6
BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ
BIOMEMRÁNA BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA - všechny buňky na povrchu plazmatickou membránu - Prokaryontní buňky (viry, bakterie, sinice) - Eukaryontní buňky vnitřní členění do soustavy membrán KOMPARTMENTŮ - za
TUKY. Autor: Mgr. Stanislava Bubíková. Datum (období) tvorby: 15. 3. 2013. Ročník: devátý
TUKY Autor: Mgr. Stanislava Bubíková Datum (období) tvorby: 15. 3. 2013 Ročník: devátý Vzdělávací oblast: Člověk a příroda / Chemie / Organické sloučeniny 1 Anotace: Žáci se seznámí s lipidy. V rámci tohoto
L 54/116 CS Úřední věstník Evropské unie
L 54/116 CS Úřední věstník Evropské unie 26.2.2009 8. Výsledky kruhových testů V rámci ES byly provedeny kruhové testy, při nichž až 13 laboratoří zkoušelo čtyři vzorky krmiva pro selata, včetně jednoho
Vysokoúčinná kapalinová chromatografie High-Performance Liquid Chromatography (HPLC) Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 Kapalinová chromatografie (LC) 1.1. Teorie kapalinové
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti CHROMATOGRAFIE
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti CHROMATOGRAFIE Chromatografie co je to? : široká škála fyzikálních metod pro analýzu nebo separaci komplexních směsí proč je to super?
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU DEKOCHINÁTU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Tato metoda specifikuje podmínky pro stanovení dekochinátu metodou vysokoúčinné kapalinové chromatografie
Stanovení sacharidů ve vybraných přírodních matricích pomocí kapalinové chromatografie s odpařovacím detektorem rozptylu světla (HPLC-ELSD)
Stanovení sacharidů ve vybraných přírodních matricích pomocí kapalinové chromatografie s odpařovacím detektorem rozptylu světla (HPLC-ELSD) A) Ultrazvuková extrakce Ultrazvuková extrakce je významnou extrakční
Separační metody Historie: Rozvoj separačních metod od minulého století Postavení separačních metod v rámci analytické chemie Význam chromatografie a
Úvod do separačních metod pro analýzu léčiv Příprava předmětu byla podpořena projektem OPP č. CZ..7/3..00/3353 Separační metody Historie: Rozvoj separačních metod od minulého století Postavení separačních
Název: Vypracovala: Datum: Zuzana Lacková. záleží na tom, co chceme dělat 1) METHALOTIONEIN 2) GFP
Název: Vypracovala: Zuzana Lacková Datum: 7. 2. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/323 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu MĚLI BYCHOM ZNÁT: informace, které
VYUŽITÍ TEPELNÉHO ZMLŽOVAČE V AAS
1 VYUŽITÍ TEPELNÉHO ZMLŽOVAČE V AAS JAN KNÁPEK Katedra analytické chemie, Přírodovědecká fakulta MU, Kotlářská 2, Brno 611 37 Obsah 1. Úvod 2. Tepelný zmlžovač 2.1 Princip 2.2 Konstrukce 2.3 Optimalizace
VYUŽITÍ BEZKONTAKTNÍ VODIVOSTNÍ DETEKCE PRO HPLC SEPARACI POLYKARBOXYLÁTOVÝCH DERIVÁTŮ CYKLENU. Anna Hamplová
VYUŽITÍ BEZKOTAKTÍ VODIVOSTÍ DETEKCE PRO HPLC SEPARACI POLYKARBOXYLÁTOVÝCH DERIVÁTŮ CYKLEU Anna Hamplová Univerzita Karlova v Praze, Přírodovědecká fakulta, Katedra analytické chemie Albertov 6, 128 43
HPLC - Detektory A.Braithwaite and F.J.Smith; Chromatographic Methods, Fifth edition, Blackie Academic & Professional 1996 Colin F. Poole and Salwa K.
Vysokoúčinná kapalinová chromatografie - Detektory - I Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 HPLC - Detektory A.Braithwaite and F.J.Smith; Chromatographic Methods, Fifth
LIPIDY. Enzymové metody Hydrolýza m že být provedena klasicky pomocí roztoku hydroxidu za zvýšené teploty nebo pomocí enzymu cholesterolesterasy:
LIPIDY Cholesterol Obrázek. 1. P evzato z Textbook of Biochemistry T.M. Devlin a kol, 2006. Cholesterol (obrázek.1) stanovujeme celkový suma cholesterolu a jeho ester. 60-70% cholesterolu v séru je esterifikováno.
VYLUČOVACÍ CHROMATOGRAFIE. Jana Sobotníková
VYLUČOVACÍ CHROMATOGRAFIE Jana Sobotníková Vylučovací chromatografie (Size Exclusion Chromatography, SEC) gelová filtrační chromatografie (GFC), gelová permeační chromatografie (GPC), gelová chromatografie,
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv Stanovení obsahu celkového a volného tryptofanu metodou HPLC
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU CELKOVÉHO A VOLNÉHO TRYPTOFANU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení obsahu celkového a volného tryptofanu v krmivech metodou vysokoúčinné kapalinové
Lipidy Lipoproteiny Apolipoproteiny Petr Breinek
Lipidy Lipoproteiny Apolipoproteiny Petr Breinek Lipidy_2014 1 Lipos = tuk Lipidy Význam lipidů v organismu 1) Zdroj energie (tukové buňky) + zdroj esenciálních mastných kyselin 2) Strukturní funkce (součást
Jana Fauknerová Matějčková
Jana Fauknerová Matějčková převody jednotek výpočet ph ph vodných roztoků ph silných kyselin a zásad ph slabých kyselin a zásad, disociační konstanta, pk ph pufrů koncentace 1000mg př. g/dl mg/l = = *10000
Při reálném chromatografickém ději nikdy nedojde k ustavení rovnováhy mezi oběma fázemi První ucelená teorie respektující uvedenou skutečnost byla
Teorie chromatografie - III Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 4.3.3 Teorie dynamická Při reálném chromatografickém ději nikdy nedojde k ustavení rovnováhy mezi oběma
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MELAMINU A KYSELINY KYANUROVÉ METODOU LC-MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MELAMINU A KYSELINY KYANUROVÉ METODOU LC-MS 1 Rozsah a účel Postup je určen pro stanovení obsahu melaminu a kyseliny kyanurové v krmivech. 2 Princip
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - FUMONISIN B 1 A B 2
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - FUMONISIN B 1 A B 2 1 Rozsah a účel Metoda je vhodná pro stanovení fumonisinů B 1 a B 2 v krmivech. 2 Princip Fumonisiny
STANOVENÍ AZOBARVIV VE SMĚSI METODOU RP-HPLC SE SPEKTROFOTOMETRICKOU DETEKCÍ
STANOVENÍ AZOBARVIV VE SMĚSI METODOU RP-HPLC SE SPEKTROFOTOMETRICKOU DETEKCÍ 1 Úkol Separovat a metodou kalibrační křivky stanovit azobarviva (methyloranž - MO, dimethylová žluť - DMŽ) ve směsi metodou
METABOLISMUS TUKŮ VĚČNĚ DISKUTOVANÉ TÉMA
METABOLISMUS TUKŮ VĚČNĚ DISKUTOVANÉ TÉMA Ing. Vladimír Jelínek V dnešním kongresovém příspěvku budeme hledat odpovědi na následující otázky: Co jsou to tuky Na co jsou organismu prospěšné a při stavbě
Chromatografie. Petr Breinek
Chromatografie Petr Breinek Chromatografie-I 2012 Společným znakem všech chromatografických metod je kontinuální dělení složek analyzované směsi mezi dvěma fázemi. Pohyblivá fáze (mobilní), eluent Nepohyblivá
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU 5-VINYL - 2-THIOOXAZOLIDONU (GOITRINU) METODOU GC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU 5-VINYL - 2-THIOOXAZOLIDONU (GOITRINU) METODOU GC 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení vinylthiooxazolidonu (dále VOT) v krmivech.
ZÁKLADNÍ MODELY TOKU PORÉZNÍ MEMBRÁNOU
ZÁKLADNÍ MODELY TOKU PORÉZNÍ MEMBRÁNOU Znázornění odporů způsobujících snižování průtoku permeátu nástřik porézní membrána Druhy odporů R p blokování pórů R p R a R m R a R m R g R cp adsorbce membrána
Metabolismus lipoproteinů. Vladimíra Kvasnicová
Metabolismus lipoproteinů Vladimíra Kvasnicová animace: http://www.wiley.com/college/fob/quiz/quiz19/19-5.html Obrázek převzat z knihy Grundy, S.M.: Atlas of lipid disorders, unit 1. Gower Medical Publishing,
urychlit sedimentaci pevných částic v hustota, viskozita
Centrifugace Literatura Centrifugace Důvodem použití centrifug je nutnost urychlit sedimentaci pevných částic v kapalném prostředí. Nasedimentacimávliv 1. vlastnost látky: velikost, tvar, hustota 2. vlastnost
Úvod k biochemickému praktiku. Pavel Jirásek
Úvod k biochemickému praktiku Pavel Jirásek Úvodní informace 4 praktika B1 B2 B3 B4 4 týdny 8 pracovních stolů rozdělení kruhu do 8 pracovních skupin (v každé 2-3 studenti) Co s sebou na praktika plášť
UNIVERZITA PARDUBICE FAKULTA CHEMICKO-TECHNOLOGICKÁ DISERTAČNÍ PRÁCE
UNIVERZITA PARDUBICE FAKULTA CHEMICKO-TECHNOLOGICKÁ DISERTAČNÍ PRÁCE 2009 Ing. David Kahoun UNIVERZITA PARDUBICE FAKULTA CHEMICKO-TECHNOLOGICKÁ ANALÝZA BIOLOGICKY AKTIVNÍCH LÁTEK V MEDOVINÁCH METODOU HPLC
Stanovení asialotransferinu
Stanovení asialotransferinu v mozkomíšním moku metodou HPLC Pracovní den ČSKB Brno 10.11.2010 J. Gottwaldová, M. Dastych OKBH FN Brno Transferin transportní glykoprotein pro železo, váže 2 atomy Fe 3+
UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie. Nám. Čs. Legií 565, Pardubice.
UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Nám. Čs. Legií 565, 532 10 Pardubice 15. licenční studium INTERAKTIVNÍ STATISTICKÁ ANALÝZA DAT Semestrální práce VYUŽITÍ TABULKOVÉHO
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU D METODOU LC/MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU D METODOU LC/MS 1 Účel a rozsah Tento postup specifikuje podmínky pro stanovení vitamínu D3 v krmivech metodou LC/MS. 2 Princip Zkušební
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU A A VITAMÍNU E METODOU HPLC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU A A VITAMÍNU E METODOU HPLC 1 Účel a rozsah Postup specifikuje podmínky pro stanovení vitamínu A a vitamínu E v krmivech a premixech. 2 Princip
Víme, co vám nabízíme
PDF vygenerováno: 30.12.2016 5:20: Katalog / Laboratorní pomůcky / ace / Nástavce a filtrační špičky na injekční stříkačky Nástavec filtrační na injekční stříkačky MACHEREY-NAGEL Jednoúčelové nástavce
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU D METODOU HPLC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU VITAMÍNU D METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Tato metoda specifikuje podmínky pro stanovení vitamínu D v premixech pro výrobu krmných směsí metodou HPLC.
HbA1c. Axis - Shield. Společnost je zapsána v obchodním rejstříku Městského soudu v Praze, odd. C vložka 1299
Lékařská technika a speciální zdravotní materiál Společnost je zapsána v obchodním rejstříku Městského soudu v Praze, odd. C vložka 1299 Obchodní 110, 251 70 Praha Čestlice Tel. +420 296 328 300 Fax. +420
DETEKTORY pro kapalinovou chromatografii. Izolační a separační metody, 2018
DETEKTORY pro kapalinovou chromatografii Izolační a separační metody, 2018 Detektory v kapalinové chromatografii Typ detektoru Zkratka Měřená veličina Refraktometrický detektor RID index lomu Spektrofotometrický
Hemolyzační promývací roztok 80 H
NÁVOD K POUŽITÍ Hemolyzační promývací roztok 80 H KATALOGOVÉ ČÍSLO P 213.01 POUŽITÍ Hemolyzační promývací roztok 80 H se používá jako hemolyzační roztok pro automatické analyzátory glykovaného hemoglobinu
Stanovení složení mastných kyselin
LABORATOŘ ANALÝZY POTRAVIN A PŘÍRODNÍCH PRODUKTŮ Stanovení složení mastných kyselin (metoda: plynová chromatografie s plamenovým ionizačním detektorem) Garant úlohy: Ing. Jana Kohoutková, Ph.D. 1 Obsah
Metody separace. přírodních látek
Metody separace přírodních látek (5) Chromatografie; základní definice a klasifikace ruzných metod; kapalinová chromatografie, plynová chromatografie, přístrojová technika. Chromatografie «F(+)d» 1897
Stručný úvod ke cvičnému programu purifikace proteinů:
Stručný úvod ke cvičnému programu purifikace proteinů: zopakovaní základních principů a postupů Mirka Šafaříková Tel. 38777 5627 mirkasaf@usbe.cas.cz Na Sádkách 7, 1. patro, č. dveří 140 Acidobazické rovnováhy
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - aflatoxin B1, B2, G1 a G2
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU LC-MS - aflatoxin B1, B2, G1 a G2 1 Rozsah a účel Metoda je vhodná pro stanovení aflatoxinů B1, B2, G1 a G2 v krmivech. 2 Princip
Metody práce s proteinovými komplexy
Metody práce s proteinovými komplexy Zora Nováková, Zdeněk Hodný Proteinové komplexy tvořeny dvěma a více proteiny spojenými nekovalentními vazbami Van der Waalsovy síly vodíkové můstky hydrofobní interakce
Produkce kyselin v metabolismu Těkavé: 15,000 mmol/den kyseliny uhličité, vyloučena plícemi jako CO 2 Netěkavé kyseliny (1 mmol/kg/den) jsou vyloučeny
Vnitřní prostředí a acidobazická rovnováha 13.12.2004 Vnitřní prostředí Sestává z posuzování složení extracelulární tekutiny z hlediska izohydrie (= optimální koncentrace ph) izoionie (= optimální koncentrace
Analýza magnetických mikročástic mikroskopií atomárních sil
Analýza magnetických mikročástic mikroskopií atomárních sil Zapletalová 1 H., Tvrdíková 2 J., Kolářová 1 H. 1 Ústav lékařské biofyziky, LF UP Olomouc 2 Ústav chemie potravin a biotechnologií, CHF VUT Brno
Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech
Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Organismy se skládají z molekul rozličných látek Jednotlivé látky si organismus vytváří sám z jiných látek,
Obsah Protein Gel Electrophoresis Kitu a jeho skladování
Obsah Protein Gel Electrophoresis Kitu a jeho skladování Protein Gel Electrophoresis Kit obsahuje veškerý potřebný materiál provádění vertikální polyakrilamidové gelové elektroforézy. Experiment provádějí
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - OCHRATOXIN A
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - OCHRATOXIN A 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení ochratoxinu A v krmivech. 1 Ochratoxin A patří mezi
Zajištění správnosti výsledků analýzy kotininu a kreatininu
Zajištění správnosti výsledků analýzy kotininu a kreatininu Š.Dušková, I.Šperlingová, L. Dabrowská, M. Tvrdíková, M. Šubrtová duskova@szu.cz sperling@szu.cz Oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám
VYŠETŘENÍ META BOLISM U LIPIDŮ A
VYŠETŘENÍ META BOLISM U LIPIDŮ A CHOLESTEROLU Úvod Problematika poruch lipidového metabolismu se dostává do popředí zájmu především v souvislosti s prevencí a léčbou kardiovaskulárních onemocnění. Základní
Chemické výpočty II. Vladimíra Kvasnicová
Chemické výpočty II Vladimíra Kvasnicová Převod jednotek pmol/l nmol/l µmol/l mmol/l mol/l 10-12 10-9 10-6 10-3 mol/l µg mg g 10-6 10-3 g µl ml dl L 10-6 10-3 10-1 L Cvičení 12) cholesterol (MW=386,7g/mol):
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv Vydání 1 STANOVENÍ OBSAHU KOKCIDIOSTATIK METODOU LC-MS
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU KOKCIDIOSTATIK METODOU LC-MS 1 Účel a rozsah Postup specifikuje podmínky pro stanovení diclazurilu, halofuginonu, lasalocidu, maduramicinu, monensinu, narasinu, nikarbazinu, robenidinu,
1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru
Protokol č.: F1-4 Datum: 20.12.2010 Metodika: analýza efektivity přípravy výběr z výsledků ze zkušebních provozů výroby antigenů. Vypracoval: Ing. Václav Filištein, Mgr. Tereza Chrudimská, Spolupracující
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU SELENU METODOU ICP-OES
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU SELENU METODOU ICP-OES 1 Rozsah a účel Postup specifikuje podmínky pro stanovení celkového obsahu selenu v minerálních krmivech a premixech metodou optické emisní spektrometrie
urychlit sedimentaci pevných částic v hustota, viskozita
Centrifugace Literatura Centrifugace Důvodem použití centrifug je nutnost urychlit sedimentaci pevných částic v kapalném prostředí. Nasedimentacimávliv 1. vlastnost látky: velikost, tvar, hustota 2. vlastnost
2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.
CVIČENÍ Z ENZYMOLOGIE 1) Stanovení Michaelisovy konstanty trypsinu pomocí chromogenního substrátu. Aktivita trypsinu se určí změřením rychlosti hydrolýzy chromogenního substrátu BAPNA (Nα-benzoyl-L-arginin-p-nitroanilid)
laktoferin BSA α S2 -CN α S1 -CN Popis: BSA bovinní sérový albumin, CN kasein, LG- laktoglobulin, LA- laktalbumin
Aktivita KA 2340/4-8up Stanovení bílkovin v mléce pomocí SDS PAGE (elektroforéza na polyakrylamidovém gelu s přídavkem dodecyl sulfátu sodného) vypracovala: MVDr. Michaela Králová, Ph.D. Princip: Metoda
Teorie chromatografie - I
Teorie chromatografie - I Veronika R. Meyer Practical High-Performance Liquid Chromatography, Wiley, 2010 http://onlinelibrary.wiley.com/book/10.1002/9780470688427 Příprava předmětu byla podpořena projektem
Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche
Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche Charakteristika testu: Set AMPLICOR HPV vyráběný firmou Roche je určený pro detekci vysoko-rizikových typů lidských
Kamila Pultarová REFRAKTOMETRICKÁ STUDIE LIPOPROTEINU O NÍZKÉ HUSTOTĚ (LDL) Refractometric study of low density lipoprotein (LDL)
U N I V E R Z I T A K A R L O V A V P R A Z E P ř í r o d o v ě d e c k á f a k u l t a Studijní program: Klinická a toxikologická analýza Kamila Pultarová REFRAKTOMETRICKÁ STUDIE LIPOPROTEINU O NÍZKÉ
Automatická potenciometrická titrace Klinická a toxikologická analýza Chemie životního prostředí Geologické obory
Automatická potenciometrická titrace Klinická a toxikologická analýza Chemie životního prostředí Geologické obory Titrace je spolehlivý a celkem nenáročný postup, jak zjistit koncentraci analytu, její
1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I
1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I Vazba bromfenolové modři na sérový albumin Princip úlohy Albumin má unikátní vlastnost vázat menší molekuly mnoha typů. Díky struktuře, tvořené
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU NEPOVOLENÝCH DOPLŇKOVÝCH LÁTEK METODOU LC-MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU NEPOVOLENÝCH DOPLŇKOVÝCH LÁTEK METODOU LC-MS 1 Účel a rozsah Tato metoda specifikuje podmínky pro stanovení nepovolených doplňkových látek Zn-bacitracinu,
Hmotnostní spektrometrie
Hmotnostní spektrometrie Princip: 1. Ze vzorku jsou tvořeny ionty na úrovni molekul, nebo jejich zlomků (fragmentů), nebo až volných atomů dodáváním energie, např. uvolnění atomů ze vzorku nebo přímo rozštěpení
Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů
Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů Bioanalytické metody Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Úvod Kritéria výběru metod stanovení koncentrace proteinů jsou založena na možnostech pro vlastní analýzu,
Stanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou
Stanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou Úkol Stanovte obsah cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce pomocí kapilární elektroforézy. Teoretická část Cholesterol je steroidní
Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MADURAMICINU A SEMDURAMICINU METODOU HPLC
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MADURAMICINU A SEMDURAMICINU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení maduramicinu a semduramicinu v krmivech a premixech.
BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ
BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ SPOLEČNÉ ZNAKY ŽIVÉHO - schopnost získávat energii z živin pro své životní potřeby - síla aktivně odpovídat na změny prostředí - možnost růstu, diferenciace a reprodukce
Izolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..
Izolace RNA doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD.. Metodiky izolace RNA celková buněčná RNA ( total RNA) zahrnuje řadu typů RNA, které se mohou lišit svými fyzikálněchemickými vlastnostmi a tedy i nároky na jejich
L 54/80 CS Úřední věstník Evropské unie
L 54/80 CS Úřední věstník Evropské unie 26.2.2009 7.1.2 Detektor diodového pole Výsledky jsou posuzovány podle následujících kritérií: a) při vlnové délce maximální absorpce vzorku i standardu musí být
ÚSTAV CHEMIE A ANALÝZY POTRAVIN
VYSOKÁ ŠKOLA CHEMICKO-TECHNOLOGICKÁ V PRAZE ÚSTAV CHEMIE A ANALÝZY POTRAVIN Technická 5, 166 28 Praha 6 tel./fax.: + 420 220 443 185; jana.hajslova@vscht.cz LABORATOŘ Z ANALÝZY POTRAVIN A PŘÍRODNÍCH PRODUKTŮ
Proteiny krevní plazmy SFST - 194
Plazmatické proteiny Proteiny krevní plazmy SFST - 194 zahrnují proteiny krevní plazmy a intersticiální tekutiny Vladimíra Kvasnicová Distribuce v tělních tekutinách protein M r (x 10 3 ) intravaskulárně
Aspartátaminotransferáza (AST)
1 Aspartátaminotransferáza (AST) AST je buněčný enzym přítomný v řadě tkání, jako jsou srdce, kosterní svaly, ledviny, mozek, játra, pankreas či erytrocyty. Vyskytuje se ve dvou izoformách, cytoplazmatické
L 54/32 CS Úřední věstník Evropské unie
L 54/32 CS Úřední věstník Evropské unie 26.2.2009 Lineární rozsah přístroje je nutno zkontrolovat pro všechny aminokyseliny. Standardní roztok se ředí citrátovým tlumivým roztokem tak, aby se dosáhlo ploch
Úvod do biochemie. Vypracoval: RNDr. Milan Zimpl, Ph.D.
Úvod do biochemie Vypracoval: RNDr. Milan Zimpl, Ph.D. TENTO PROJEKT JE SPOLUFINANCOVÁN EVROPSKÝM SOCIÁLNÍM FONDEM A STÁTNÍM ROZPOČTEM ČESKÉ REPUBLIKY Co je to biochemie? Biochemie je chemií živých soustav.
1. Proteiny. relativní. proteinu. Tento. České republiky.
Určení koncentrace celkových proteinů v krevním séru za využití různých metod Teoretická část: krátký úvod k metodám pro stanovení, analýzu a separaci proteinů. Praktická část: testt tří různých technik