Reprodukční mechanismy rostlin Radim J. Vašut 2013

Podobné dokumenty
Reprodukční mechanismy rostlin Radim J. Vašut 2012

Bi8240 GENETIKA ROSTLIN

Reprodukční systémy vyšších rostlin

Crossing-over. Synaptonemální komplex. Crossing-over a výměna genetického materiálu. Párování homologních chromosomů

GENETIKA Monogenní dědičnost (Mendelovská) Polygenní dědičnost Multifaktoriální dědičnost

Populační genetika III. Radka Reifová

Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

Genetická variabilita. rostlinných populací

Základní pravidla dědičnosti - Mendelovy a Morganovy zákony

Základy genetiky 2a. Přípravný kurz Komb.forma studia oboru Všeobecná sestra

Dědičnost pohlaví a znaků s pohlavím souvisejících

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,

Thomas Hunt Morgan ( ) americký genetik a embryolog pokusy s octomilkou (D. melanogaster)

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Genetický polymorfismus

Základní genetické pojmy

Evoluce pohlaví a determinace pohlaví. Marie Ošlejšková

Gymnázium, Brno, Slovanské nám. 7, WORKBOOK - Biology WORKBOOK. Student:

Biologie - Oktáva, 4. ročník (humanitní větev)

- taxonomicky jeden z nejobtížnějších rodů v Evropě (ca druhů)

Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis.

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Základní pojmy I. EVOLUCE

Crossing-over. over. synaptonemální komplex

Schopnost organismů UCHOVÁVAT a PŘEDÁVAT soubor informací o fyziologických a morfologických (částečně i psychických) vlastnostech daného jedince

Biologie - Oktáva, 4. ročník (přírodovědná větev)

Chromozomová teorie dědičnosti. KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae).

M A T U R I T N Í T É M A T A

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Genetika BIOLOGICKÉ VĚDY EVA ZÁVODNÁ

Nauka o dědičnosti a proměnlivosti

Proměnlivost organismu. Mgr. Aleš RUDA

Úvod do obecné genetiky

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze

Mutace jako změna genetické informace a zdroj genetické variability

"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy

Využití průtokové cytometrie v analýze savčích chromozomů

Genotypy absolutní frekvence relativní frekvence

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 2. Přehled aplikací a otázek

Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám

Mendelistická genetika

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Dědičnost a pohlaví. KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Tomimatsu H. &OharaM. (2003): Genetic diversity and local population structure of fragmented populations of Trillium camschatcense (Trilliaceae).

Obecná genetika a zákonitosti dědičnosti. KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Semenné sady systém reprodukce a efektivita

P1 AA BB CC DD ee ff gg hh x P2 aa bb cc dd EE FF GG HH Aa Bb Cc Dd Ee Ff Gg Hh

Mutace a jejich význam pro evoluci

Reprodukční systémy polyploidního komplexu Hieracium prenanthoides

Sylabus témat ke zkoušce z lékařské biologie a genetiky. Struktura, reprodukce a rekombinace virů (DNA viry, RNA viry), význam v medicíně

Chromosomy a karyotyp člověka

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Rozvoj vzdělávání žáků karvinských základních škol v oblasti cizích jazyků Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.1.07/

ší šířen VAZEBNÁ ANALÝZA Vazba genů

Genetika zvířat - MENDELU

Struktura a analýza rostlinných genomů Jan Šafář

Cesta genetiky od hrachu v Brně po kriminálku Miami. Barbora Černá Bolfíková

Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Systém a evoluce vyšších rostlin Petr Bureš. Petr Bureš: Prezentace přednášky Systém a evoluce vyšších rostlin - část 1.

Otázka 22 Rozmnožování rostlin

Mikrosatelity (STR, SSR, VNTR)

Sylabus kurzu: Biologie

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

GENETICKÁ INFORMACE - U buněčných organismů je genetická informace uložena na CHROMOZOMECH v buněčném jádře - Chromozom je tvořen stočeným vláknem chr

Cytogenetika. chromosom jádro. telomera. centomera. telomera. buňka. histony. páry bazí. dvoušroubovice DNA

Taxonomický systém a jeho význam v biologii

Charakterizace hybridních trav pomocí cytogenetických a molekulárních metod

Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno

Evoluce fenotypu VIII.

GENETICS OF CAT S COLORS GENETIKA ZBARVENÍ KOČEK. Chaloupková L., Dvořák J. ABSTRACT ABSTRAKT ÚVOD

Metody studia historie populací. Metody studia historie populací

Genetické mapování jako nástroj ke studiu evoluce pohlavních chromosomů rodu Silene

Bi8240 GENETIKA ROSTLIN

Základní pravidla dědičnosti

Vazba genů I. I. ročník, 2. semestr, 11. týden Aleš Panczak, ÚBLG 1. LF a VFN

Klasifikace mutací. Z hlediska lokalizace mutací v genotypu. Genové mutace. Chromozomální mutace. Genomové mutace

Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Nondisjunkce v II. meiotickém dělení zygota

Populačně-genetická data

Vypracované otázky z genetiky

REPRODUKCE A ONTOGENEZE Od spermie s vajíčkem až po zralého jedince. Co bylo dřív? Slepice nebo vejce?

Molecular Ecology J. Bryja, M. Macholán MU, P. Munclinger - UK

Cvičení č. 8. KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek

World of Plants Sources for Botanical Courses

Degenerace genetického kódu

Genetika přehled zkouškových otázek:

II. ročník, zimní semestr 1. týden OPAKOVÁNÍ. Úvod do POPULAČNÍ GENETIKY

ZÁKLADY BIOLOGIE a GENETIKY ČLOVĚKA

1. Téma : Genetika shrnutí Název DUMu : VY_32_INOVACE_29_SPSOA_BIO_1_CHAM 2. Vypracovala : Hana Chamulová 3. Vytvořeno v projektu EU peníze středním

Reprodukční systémy rostlin

Pohlavní rozmnožování. Gametogeneze u rostlin a živočichů.

Transkript:

Reprodukční mechanismy rostlin Radim J. Vašut 2013 S. & K. Mandl

Outline I. Paradox sexuálního rozmnožování ( Paradox of sex ) II. Apomixie III.Taraxacum jako model pro studium apomixie

Rozmnožování u rostlin I.Sexuální rozmnožování - alogamie - autogamie II. Klonální rozmnožování (= apomixie) - vegetativní - apomixie s.str. - (přechodné)

Paradox of sex : "cost of males Albrecht Dürer, Adam a Eva (Museo del Prado, Madrid)

- DVOJNÁSOBNÁ CENA SEXU - vytvoření druhého pohlaví (které se navíc vůbec nerozmnožuje) - kompetice o zdroje (potravy) - investice do rande - investice do páření "cost of males John Maynard Smith 1971 - cost of meiosis (neefiktivní přenos genů, genome dilution ) - van Dijk, van Damme 2000

Tangled Bank Hypothesis Michael Ghiselin, 1974 Indus river Delta

Muller's ratchet Hermann Joseph Muller, 1964

Kondrashov s Hatchet Leigh van Valen, 1973

Red Queen Hypothesis Leigh van Valen, 1973 "It takes all the running you can do, to keep in the same place." constant 'arms race' Lewis Caroll, Alice in Wonderland

Red Queen Hypothesis

Apomixie Klonální rozmnožování pomocí semen Neúplný sex: nedokončená megasporogeneze Raunkiaer, 1903

Apomixie u Krytosemenných Ve 140 rodech široce rozšířená přesto vzácná Rosaceae Poaceae Asteraceae Vázana na polyploidii

Geografická partenogeneze 60N 50N 40N Rozšíření sex-apo pampelišek v EU 10W 0 10E 20E 30E

a) diplosporie Hlavní typy apomixie b) aposporie c) (embryonie) Bicknell & Koltunow 2004

Meiotická diplosporie Aposporie Především Rosaceae a Asteraceae 2 geny regulující apospori Diplosporie (DIP) Partenogeneze (PAR) Gametofyt tvořen z vegetativních buněk sporangia - analogicky některé severoamerické kapradiny

Diplosporie a) Mitotická diplosporie Antennaria, Hieracium, Trisetum, Arabis b) Meiotická diplosporie Taraxacum, Chondrilla, Youngia 3 geny regulující apospori Diplosporie (DIP) Partenogeneze (PAR)? (AUT??) Typ nejbližší meióze

Segregace apomixie (Taraxacum) Diplosporická apomixie příklad pampelišek Diplosporie DIP (microsatellites) Partenogeneze PAR (Nomarski DIC mic) Autonomní tvorba endospermu END (FCSC) Embryo Degenerated Egg Cell 3C Apomicts (3x) 6C 3C Recombinants Geny nejsou ve vazbě, mohou vznikat rostliny, které dané rostliny nesoucí jen určité geny. V přírodě extrémně vzácné.

Genetické důsledky apomixie Genetický uniformní potomstvo Evolučně vývojová slepá větev

Rodokmen Lucemburků Eliška Přemyslovna Apomiktická + + + +

Variabilita apomiktů Variabilita sexuálních druhů (genetická, morfologická, ) Variabilita sexuálních druhů (genetická, morfologická, )

Důsledky pro taxonomomii Reprodukční izolace Morfologická stálost Obvykle dobrý geografický areál Dobrý biologický druh.ale. Taraxacum prunicolor Schmid, Vašut et Oosterveld

Apomiktické druhy jsou nepřehledné Určit je mohou pouze specialisté Jejich zavádění (alespoň v některých skupinách) není užitečné l art pour l art?

Variabilita apomiktů Variabilita populace apomiktů

Variabilita apomiktů Genetická variabilita apomiktů (Taraxacum amplum z okruhu T. officinale agg.) Mikrodruhy geneticky diskrétní Jsou tvořeny shlukem podobných genotypů genetických kamarádů (tzv. clone mates ) Majeský et al. 2012 Plos One 7: e41868

Rodokmen Lucemburků Eliška Přemyslovna Apomiktická + + + +

Genetické důsledky apomixie Genetický uniformní potomstvo Evolučně vývojová slepá větev SEX APO cyklus (2x 3x cyklus) van Dijk 2003, Vašut, van Dijk et al. in prep.

Random Random diploid diploid sexual sexual from from the the population Random diploid diploid sexual sexual from from the the population Mixed Mixed sexual-apomictic population - - Triploid apomicts Hybridization Hybridization recombination crossing-over Repeated hybridization recombination crossing-over; under natural selection Mutation accumulation Mutation accumulation Purely Purely apomictic apomictic population - Triploid - Triploid apomicts

Random diploid sexual from the population Random diploid sexual from the population Mixed sexual-apomictic population - Triploid apomicts Hybridization Hybridization recombination crossing-over Repeated hybridization recombination crossing-over; under natural selection Mutation accumulation Mutation accumulation Purely apomictic population - Triploid apomicts

Random diploid sexual from the population Random diploid sexual from the population Mixed sexual-apomictic population - Triploid apomicts Hybridization Hybridization recombination crossing-over Repeated hybridization recombination crossing-over; under natural selection Mutation accumulation Mutation accumulation Purely apomictic population - Triploid apomicts

A) Lokalizace DIP v genomu Vijverberg et al. TAG 2004

DIP BACs obsahují repetitivní sekvence BACs close to DIP are highly repetitive S7 S8 S4 S7 (3x) S10 (3x) S4 (4x) S4 S7 DIP S10 S11 S4-BAC No. 83 S4-BAC No. 85? S4-BAC No. xxx S7-BAC No. 3? S7-BAC No. xx S10-BAC No. 56? Vijverberg & Vašut et al. Plant Reprod subm.

DIP BACs obsahují repetitivní sekvence, kondenzovány do určitých segmentů * = NOR Chromosome * * * * Vijverberg & Vašut et al. Plant Reprod subm.

DIP je na NOR chromozómu AS68 (3x) PAX (4x) * Vijverberg & Vašut et al. Plant Reprod subm.

B) Segregace mikrosatelitů Microsatellites analysed in order to see how the chromosomes segregates in male meiosis Diploid Sexual Triploid Apomict gametes x gametes Two SSR markers are linked to DIP; one to PAR DIP and PAR belong to different linkage groups Significant absence of alleles linked to DIP and PAR has been observed in haploid pollen grains

B) Segregace mikrosatelitů distribution of single alleles in haploid pollen grains of triploid apomict msta53 msta67 msta 64 msta 105 msta 78 msta 74 msta 131 msta 44b expected ratio distribution of single alleles in diploid pollen grains of triploid apomict msta53 msta67 msta 64 msta 105 msta 78 msta 74 msta 131 msta 44b expected ratio

C) Detekce hybridizace v přirozených populacích Majeský, Vašut & Kitner, unpublished.

Paralela APO regionu s Y-chromozómem - Determinace Sexu - Rekombinační suprese - Akumulace mutací - Absence funkčních genů - Delší fylogenetické stáří

Apomixie v rodu Taraxacum Meiotická diplosporie 3 geny regulující apomixii Diplosporie (DIP) Partenogeneze (PAR)? ca. 55 sekcí většinou apomikté

Segregace apomixie u pampelišek DIP (3x) PAR (3x) END (3x) 3x DIP (2x) PAR (2x) END (2x) 2x?

Kde leží DIP region? Nepřímý důkaz, že DIP je na NOR chromozómu: absence 1 NOR chromozómu Slabá vazba s 45S rdna (Sörensen, van Dijk) msta78 5.0cM msta53 DIP 3.3cM 2.6cM msta78 msta53 S4 0.7cM S8 0.5cM 31.0cM S7 0.5cM DIP 0.2cM S10 45S rdna IGS 2x (sex) Van Dijk 2004 4x (apo) Vijverberg, unpubl.

Evoluce apomixie Dominantní gen (převažující názor) Recesivní gen (Mogie, Richards) Hybridizace (Carman) Hörandl 2006

Apomixie v rodu Taraxacum Ruderalia Erythrosperma Alpina Antarctica Tibetana Scariosa Parvula Leucantha Mongolica

2n = 3x DIP locus příbuzné taxony 2n = 4x Erythrosperma T. sect. Erythrosperma (stř. Evropa) Stenoloba T. sect. Stenoloba (Ladakh, India) Scariosa T. sect. Leucantha (Ladakh, India) Leucantha T. sect. Scariosa (Malta)

Jsou samečci nepotřební? Male apomixis Androgenesis Cupressus dupreziana (Alžírsko) Jádro vajíčka je po splynutí gamet nahrazeno vajíčkem z pylové láčky Nava et al. 2010, Heredity 104

Literatura