DALŠÍ G+ BAKTERIE praktikum č. 3

Podobné dokumenty
Diagnostika streptokoků

Lékařská mikrobiologie pro ZDRL. Týden 17: Přehled grampozitivních bakterií

LABORATOŘ MIKROBIOLOGIE II ROD STREPTOCOCCUS ROD ENTEROCOCCUS

P02 Diagnostika streptokoků

Stafylokoky v současné době patří mezi důležité bakteriální patogeny. Např. u nozokomiálních infekcí krevního řečiště jsou spolu s enterokoky

Lékařská mikrobiologie pro ZDRL

Diagnostické metody v lékařské mikrobiologii

PREGRADUÁLNÍ VZDĚLÁVÁNÍ V LÉKAŘSKÉ MIKROBIOLOGII

GRAMNEGATIVNÍ BAKTERIE II.

Návod k odečítání. Disková difuzní metoda EUCAST pro vyšetřování antibiotické citlivosti. Verze 3.0 Duben 2013

G+tyčinky. MUDr. Drahomíra Rottenbornová

Porod doma

Gram pozitivní aerobní a fakultativně anaerobní bakterie. Ivana Vítková OKM, FN Brno

Rod Corynebacterium. Prezentace pro obor: Jan Smíš. íšek

Návod k odečítání Disková difuzní metoda EUCAST pro vyšetřování antibiotické citlivosti

Alimentární intoxikace. MUDr. Miroslava Zavřelová ÚPL LF MU

Stanovení celkového počtu mikroorganismů

Zkušenosti s diagnostikou sepse pomocí testu SeptiFast Test M GRADE. Zdeňka Doubková Klinická mikrobiologie a ATB centrum VFN Praha

Cíle: Obecné zásady při odběru vzorků pro bakteriologické vyšetření

Eva Krejčí. Antibiotické středisko, Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě Lékařská fakulta Ostravské univerzity

Citlivost a rezistence mikroorganismů na antimikrobiální léčiva

Lékařská mikrobiologie II

Rod Streptococcus. Prezentace pro obor: Všeobecná sestra

Speciální mikrobiologie

STREPTOKOKOVÉ NÁKAZY. MUDr. František BEŇA

Streptokoky - průkaz fenotypu rezistence k antibiotikům ze skupiny makrolidů, linkosamidů a streptograminub

RESPIRAČNÍ INFEKCE. Milan Kolář

Ondřej Zahradníček ICQ

kolónie veľkosť farba tvar hemolýza S. aureus S. epidermidis

DIAGNOSTIKA INFEKČNÍCH CHOROB KULTIVACE V LABORATORNÍCH PODMÍNKÁCH

TEST:Mikrobiologiepodz2cz Varianta:originál Tisknuto:02/01/2017

Epidemiologie spály. MUDr. František BEŇA

Využití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči. Marek Protuš

Využití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči. Marek Protuš

Mikroskopie+kultivace: pleomorfní, VL agar/bujón, rostou za 3-5 dní Biochemie: rozmanitá, smrdí

EHK 544 Bakteriologická diagnostika-vyhodnocení

Enterobacter sakazakii neboli Cronobacter sakazakii. Leňková Lucie Grusová Kristýna Kruh 333

MIKROORGANISMY Jednobuněčné Viditelné pouze mikroskopicky Tvoří společenstva s jinými organismy Jsou vysoce odolné a adaptabilní, proto se vyskytují

Nová antibiotika v léčbě infekcí Grampozitivního. Otakar Nyč Ústav lékařské mikrobiologie 2.LF UK a FN v Motole

M KR K O R BI B OLO L GA

Odběry vzorků u pacientů s podezřením na infekci krevního řečiště

VÝVOJ REZISTENCE BAKTERIÁLNÍCH PATOGENŮ

Dezinfekce rukou a přehled výskytu mikrobiální flory na rukou nemocničního personálu

CZ.1.07/1.5.00/

Epidemiologicky závažné bakteriální infekce Vlastimil Jindrák

Enterobacter sakazakii alias Cronobacter sakazakii

Vypracovaly: Martina Hejtmánková Michaela Stapajová

GRAMPOZITIVNÍ TYČINKY A KOKY TVOŘÍCÍ ENDOSPORY

M. Laichmanová NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ

Pneumokokové pneumonie u dětí. Vilma Marešová Univerzita Karlova 2.LF I. Infekční klinika FNB Praha

VÝVOJ REZISTENCE BAKTERIÁLNÍCH PATOGENŮ

Stav rezistence bakteriálních patogenů v Karlovarském kraji.

ČA čokoládový agar EA Endův agar KA krevní agar MH Müllerův Hintonové agar Další zkratky jsou vysvětleny přímo u jednotlivých kapitol

ROZDĚLENÍ ANTIMIKROBIÁLNÍCH LÁTEK, VYŠETŘOVÁNÍ CITLIVOSTI. M.Hanslianová Antibiotické středisko OKM FN Brno

Co musí intenzivista vědět o antibiotické rezistenci?

P02. Biochemické identifikační metody. Diagnostika streptokoků

Základní mikrobiologický rozbor vody

Speciální mikrobiologie

MIKROSKOPIE. Lékařská mikrobiologie cvičení, jarní semestr 2016 Mikrobiologický ústav LF MU

pro ZDRL Týden 17: Přehled grampozitivních bakterií Ondřej Zahradníček ICQ

INTERPRETACE VÝSLEDKŮ CITLIVOSTI NA ANTIBIOTIKA. Milan Kolář Ústav mikrobiologie Fakultní nemocnice a LF UP v Olomouci

ČSN EN ISO ČSN ISO ČSN EN ISO 6579, kromě bodu

Praktické cvičenie č. 2

STANOVENÍ REZIDUÍ INHIBIČNÍCH LÁTEK V MLÉCE

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Využití antibakteriálních testů v textilním průmyslu Mgr. Irena Šlamborová, Ph.D.

Nové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku

Rod Clostridium. Prezentace pro obor: Jan Smíš. íšek

STAFYLOKOKOVÉ ENTEROTOXINY. Zdravotní nezávadnost potravin. Veronika Talianová, FPBT, kruh: 346 Angelina Anufrieva, FPBT, kruh: 336

Gramovo barvení bakterií

Jak léčím infekce vyvolané multi- rezistentními bakteriemi

SeptiFast. rychlá detekce sepse. Olga Bálková Roche s.r.o., Diagnostics Division

ANTIBIOTICKÁ LÉČBA OFF-LABEL Z POHLEDU MIKROBIOLOGA. Milan Kolář Ústav mikrobiologie FNOL a LF UP v Olomouci

POH O L H E L D E U D U M

LABORATORNÍ LISTY Vážené kolegyně a kolegové,

NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ

Respirační infekce a jejich původci. MUDr. Černohorská Lenka, Ph.D.

Stav rezistence bakteriálních patogenů v Karlovarském kraji.

Úskalí ATB léčby v těhotenství/šestinedělí. V. Adámková Klinická mikrobiologie a ATB centrum ÚLBLD 1. LF UK a VFN Praha

European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing

Odběr a transport biologického materiálu do mikrobiologické laboratoře. Jana Juránková OKM FN Brno

Moderní metody stanovení mikroorganismů

PERTUSE diagnostika a klinické projevy. Vilma Marešová I.infekční klinika UK 2.LF a IPVZ FN Na Bulovce, Praha

Infekce močových cest (IMC) Kurs Modulu IIC Horečnaté stavy Jan Smíšek ÚLM 3. LF UK 2008

NEBEZPEČÍ IMPORTU MULTIREZISTENTNÍCH (MDR) BAKTERIÍ. Milan Kolář Ústav mikrobiologie FNOL a LF UP v Olomouci

3 Přehled klinicky nejvýznamnějších bakterií

Urbánek K, Kolá M, ekanová L. Pharmacy World and Science. 2005, 27:

ANTIBIOTICKÉ LÉČBY V INTENZIVNÍ MEDICÍNĚ

MIKROBIOLOGICKÝ ATLAS UKÁZKY RŮSTU VYBRANÝCH PŮVODCŮ ALIMENTÁRNÍCH ONEMOCNĚNÍ

NEBEZPEČÍ IMPORTU MULTIREZISTENTNÍCH (MDR) BAKTERIÍ. Milan Kolář Ústav mikrobiologie FNOL a LF UP v Olomouci

Multirezistentní kmeny Pseudomonas aeruginosa

Základy bakteriální cytologie a morfologie

Obsah. IMUNOLOGIE Imunitní systém Anatomický a fyziologický základ imunitní odezvy... 57

Antibiotická profylaxe v gynekologické operativě

Linezolid. Jiří Beneš Infekční klinika 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha

GRAMPOZITIVNÍ KOKY. Čeleď: STAPHYLOCOCCACEAE. Rod: Staphylococcus

Fakultní nemocnice Brno Laboratoře Oddělení klinické mikrobiologie Jihlavská 20, Brno

Blok č. 5 Termín Téma Počet hodin

LABORATOŘE EUROMEDIC s.r.o. Oddělení klinické mikrobiologie a autovakcín

Transkript:

DALŠÍ G+ BAKTERIE praktikum č. 3 Lékařská mikrobiologie cvičení Mikrobiologický ústav LF MU www.pinterest.com

Z minulých cvičení byste měli znát Základní mikrobiologické půdy Klinický význam stafylokoků, odlišení S.aureus od CoNS, význam a detekce koagulázy a hyaluronidázy, MRSA Biochemické metody identifikace - % pravděpodobnosti, T in, kataláza, oxidáza, PYR test Klinický význam streptokoků, dělení dle hemolýzy, odlišení S.pyogenes a S.agalactiae (PYR test, CAMP test), určení S.pneumoniae (optochinový test), ASLO

Přehled G+ bakterií Cvičení Tvar Zástupci P01 koky Stafylokoky (S.aureus, CoNS) P02 koky Streptokoky (viridující, hemolytické) P03 koky Enterokoky tyčky Listerie, Bacily, Korynebakteria Listerie a korynebakteria nesporulují, bacily sporulují.

Obsah cvičení Charakteristika enterokoků Charakteristika G+ tyčinek Léčba infekcí způsobených enterokoky a G+ tyčinkami Diagnostika enterokoků a G+ tyčinek Diferenciální diagnostika enterokoků a G+ tyčinek Praktické úkoly

Charakteristika enterokoků G+ koky v drobných shlucích či krátkých řetízcích Vysoká odolnost 6,5 % NaCl (pozor stafylokoky až 10 % NaCl!), žluč, azid sodný, ph 4,8-11 Kataláza NEG Klinický význam: Součást normální mikroflóry střeva Jedni z nejběžnějších původců močových infekcí Nozokomiální infekce (rány, sepse, endokarditidy, implantáty, atd.) Primární rezistence k cefalosporinům E. faecalis (90%), E. faecium a další Nebezpečné VRE vankomycin rezistentní enterokoky http://biowiki.hgtc.edu

Charakteristika G+ tyčinek - listerie G+ krátké tyčinky Výskyt: v prostředí a potravinách (mléko, sýry, zelenina, maso, půda, listí ), Vysoká odolnost - růst při nízkých teplotách (4 C lednička, sýrárny) a vysokých koncentracích NaCl či žluči Kataláza POZ L. monocytogenes, L. ivanovi, L. innocua aj. http://cit.vfu.cz

Charakteristika G+ tyčinek - listerie Klinický význam: Listerióza - gastroenteritida, horečnaté onemocnění, málokdy infekce u zdravých dospělých Riziko pro těhotné - hrozí kongenitální infekce plodu přes placentu (možný potrat) nebo (ve třetím trimestru) infekce plodu, nebo také perinatální infekce při porodu (kontaminovaný poševní sekrete). Novorozenci - typická meningitida či sepse (málo časté, vysoká letalita) Lidé s oslabenou imununitou infekce ran, sepse, meningitidy

Charakteristika G+ tyčinek - korynebakteria Korynebakteria jsou grampozitivní tyčinky kyjovitého tvaru (koryné = kyj), některá pleomorfní, mohou být gramlabilní. Odolné k vyschnutí a koncentraci NaCl, ale nerostou na MH agaru bez krve. Tvoří palisády a tzv. havraní křídla. Kataláza POZ Corynebacterium diphtheria záškrt, díky očkování vzácný Nedifterická (= nezáškrtová) korynebakteria součástí běžné mikroflóry kůže. http://pixcooler.com

Charakteristika G+ tyčinek - korynebakteria Klinický význam: Záškrt - pseudomembranózní angina (pablány, otok). Vznik pouze pokud kmen bakterie produkuje difterický toxin (ten do buňky vnáší tzv. β-fág). Charakteristický oteklý krk, při absenci terapie smrt udušením. www.wikipedia.org

Charakteristika G+ tyčinek - bacily G+ mohutné tyčinky s rovnými konci Pohyblivé, sporulující - jedna endospora (terminální, subterminální či centrální) Kataláza POZ Většina zástupců neškodné mikroby vnějšího prostředí. V klinice většinou kontaminace. Několik významných zástupců Bacillus anthracis, Bacillus cereus, Geobacillus (dříve Bacillus) stearothermophillus a Bacillus subtilis www.cropsoil.uga.edu

Charakteristika G+ tyčinek - bacily Klinický význam: Bacillus anthracis - obligátní patogen, původce veterinárního onemocnění antraxu potenciál biologické zbraně. Jedna z prvních nákaz, na kterých byla zkoušena vakcinace. Bacillus cereus enterotoxikózy, infekce oka. Imunokompromitované osoby - infekce ran, endokarditidy, sepse. Geobacillus stearothemophillus a Bacillus subtilis - schopnost přežívat při velmi vysokých teplotách použití: indikátory účinnosti sterilizátorů.

Enterokoky a G+ tyčinky: léčba Enterokoky a listerie primární rezistence na cefalosporin. Enterokoky také primárně rezistentní na makrolidy, linkosamidy. E.faecalis citlivý na ampicilin, ale E.faecium primárně rezistentní. Možné použití ko-trimoxazolu, doxycyklinu, jako rezerva vankomycin. VRE vankomycin rezistentní kmeny (hlavně u hematoonkoligkých pacientů) linezolid (ZYVOXID), případně dalfopristin/quinupristin (SYNERCID).

Enterokoky a G+ tyčinky: diagnostika přehled kultivace a mikroskopie Mikroskopie Kultivace Enterokoky Listerie Korynebakteria Bacily G+ tyčinky G+ tyčinky skládající se G+ robustní G+ koky v řetězící se vedle sebe jako tyčinky, krátkých za sebou, palisády možná řetízcích palisády nebo "havraní sporulace křídla" šedavé, většinou bez hemolýzy (ale možná viridace i hemolýza) podobné enterokokům, hemolýza možná velmi drobné kolonie (podobné mouce) plsťovité kolonie, někdy výrazná hemolýza

Diagnostika: enterokoky Kataláza NEG Růst na žluč eskulinové půdě, na Slanetz Bartleyho agaru. Biochemie štěpení arabinosy (E. faecalis neštěpí půda je zelená, E. faecium štěpí půda žloutne) Antigenní analýza - zpravidla se nepoužívá. Testy citlivosti běžný MH agara. Existují i půdy na screening VRE. Foto: archiv ústavu

Diagnostika: G+ tyčinky Kataláza POZ u všech tří skupin (ale např. u rodu Arcanobacterium blízkého korynebakteriím je negativní!) Biochemickyé rozlišení koryneformních tyčinek navzájem API Coryne, Remel) Diagnostika listerií růst při nízkých teplotách, vysokých koncentracích NaCl a hemolytické interakce. Průkaz antigenu průkaz difterického toxinu Elekovým testem (viz. dále).

Diferenciální diagnostika: enterokoky Gramovo barvení: grampozitivní koky x grampozitivní tyčinky x ostatní bakterie. Stafylokoky odliší pozitivní kataláza a růst na NaCl (10 %!). Streptokoky odliší nepřítomnost růstu na Slanetz Bartleyho či žluč eskulinové půdě, popř. PYR testem (kromě S. pyogenes negativní). Vzájemné rozlišení je možné arabinózovým testem nebo složitějším testem ENCOCCUS test 8 reakcí.

Diferenciální diagnostika: bacily Gramovo barvení: grampozitivní koky x grampozitivní tyčinky x ostatní bakterie. Bacily se navíc projeví už v Gramově barvení coby velmi rozměrné (robustní) tyčinky. Často, ale ne vždy, můžeme také pozorovat tvorbu endospor. Kultivace velké, plsťovité kolonie. Druhové určení je možné biochemickými testy, testy citlivosti na antibiotika apod. U G+ tyčinek ale není jednoznačný algoritmus!

Diferenciální diagnostika: listerie a koryneformní tyčinky Gramovo barvení: grampozitivní koky x grampozitivní tyčinky x ostatní bakterie. Nesporulují, nejsou robustní vyloučeny bacily. Spolehlivější dourčení biochemie, růst při různých teplotách (listerie 4 C), testy hemolytických interakcí. U G+ tyčinek ale není jednoznačný algoritmus!

Diferenciální diagnostika: listerie Chromogenní půda na diagnostiku listerií ALOA modré zbarvení kolonií listerií, patogenní druhy mají kolem sebe tzv. HALO = odlišně zbarvené okolí. www.oxoid.com

Diferenciální diagnostika: koryneformní tyčinky Detekce difterického toxinu za použití speciálního papírku s antitoxinem položen na povrch agaru, kam se posléze očkují testované kmeny. Pozitivní výsledek = precipitační linie. http://www.rahulgladwin.com

Úkol č. 1 Gramovo barvení Obarvěte podle Grama osm podezřelých kmenů (pro zopakování: natřít nechat uschnout fixovat plamenem poté barvit: Gram 30 s Lugol 20-30 s opláchnout vodou alkohol 15-20 s opláchnout vodou safranin 60 opláchnout vodou osušit filtračním papírem (nedrhnout buničinou ani ničím jiným!) imerzní objektiv - olej) Odlišíte jednu G- bakterii. Zbytek budou G+ koky a tyčinky.

Úkol č. 2 Morfologie kolonií Popište všechny kmeny, které se v úkolu č. 1 barvily jako grampozitivní. Popište velikost, barvu, tvar, profil a hemolytické vlastnosti. Podle možnosti popište i další (povrch, okraje, konzistence, průhlednost, zápach). Pokuste se odhadnout, který z G+ koků by mohl být stafylokok (bílý, máslovité kolonie) Pokuste se odhadnout, která z G+ tyčinek je Listeria, Bacillus a Corynebacterium.

Úkol č. 3 Kataláza, ŽE, Slanetz- Bartley 3a) Kataláza enterokoky negativní, G+ tyčinky pozitivní (pozitivní také G+ stafylokok, negativní také G+ streptokok). 3b) Růst na Slanetz-Bartleyho půdě (přídavek azidu sodného) rostou enterokoky. 3c) Růst na žluč-eskulinovém agaru kmen, který zde roste a zároveň neroste na Slanetz-Bartleyho půdě Listeria.

Úkol č. 4 Vzájemné rozlišení enterokoků 4a) Arabinózový test kolonie se smísily s arabinózou inkubace. E. faecalis neštěpí půda je zelená, E. faecium štěpí půda žloutne. 4b) ENCOCCUStest 8 reakcí. Neurčujte index typičnosti a % pravděpodobnosti (nemáte jak).

Úkol č. 5 Diagnostika listerií 5a) Růst při 4 C jediná Listeria dokáže růst při chladničkových teplotách (z jiných bakterií např. Yersinia, některé druhy pseudomonád apod.). 5b) Růst listerie na chromogenní půdě ALOA půda pro Listeria monocytogenes (slide 19).

Úkol č. 6 Testy citlivosti 6a) Odečtěte difúzní diskový test.všímejte si, které druhy potřebují pro kultivaci MH agar s přídavkem krve a které ne. 6b) E.faecalis citlivý na ampicilin, ale E.faecium primárně rezistentní. 6c) VRE vankomycin rezistentní enterokoky.

Úkol č. 7 Elekův test Zakreslete výsledek Elekova testu na testování difterického toxinu. Nezapomeňte na popisky!

Po tomto cvičení byste měli znát: Klinický význam a diagnostiku enterokoků jak je odlišit od stafylokoků, streptokoků. Význam zkratky VRE. Klinický význam a diagnostiku G+ tyčinek které sporulují, které ne, význačné vlastnosti jednotlivých zástupců (růst při nízkých teplotách, růst na diagnostických půdách atd.). Možnosti terapie infekcí způsobených G+ tyčinkami a enterokoky rezistence, léky volby. Princip a význam Elekova testu.