Studium vybraných buněčných linií pomocí mikroskopie atomárních sil s možným využitím v praxi

Podobné dokumenty
VLIV FOTODYNAMICKÉ TERAPIE NA CYTOMECHANIKU NÁDOROVÉ BUNĚČNÉ LINIE HELA

Analýza magnetických mikročástic mikroskopií atomárních sil

Studentská tvůrčí a odborná činnost STOČ 2012

Elektronová mikroskopie SEM, TEM, AFM

Proč elektronový mikroskop?

Mikroskop atomárních sil: základní popis instrumentace

Mikroskop atomárních sil

Mikroskopie se vzorkovací sondou. Pavel Matějka

Fyzikální sekce přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity v Brně FYZIKÁLNÍ PRAKTIKUM. Praktikum z pevných látek (F6390)

Věra Mansfeldová. Ústav fyzikální chemie Jaroslava Heyrovského AV ČR, v. v. i.

MĚŘENÍ V KONTAKTNÍM REŽIMU POMOCÍ MIKROSKOPU SOLVERNEXT

KLINICKÁ RADIOBIOLOGIE

Mikroskopie rastrující sondy

ZADÁNÍ BAKALÁŘSKÉ PRÁCE

MĚŘENÍ V SEMIKONTAKTNÍM REŽIMU POMOCÍ MIKROSKOPU SOLVER NEXT

Optická mikroskopie a spektroskopie nanoobjektů. Nanoindentace. Pavel Matějka

Mikroskopické techniky

Skenovací tunelová mikroskopie a mikroskopie atomárních sil

Ústav molekulární a translační medicíny LF UP holografický transmisní mikroskop

Jak se měří rychlost toku krve v cévách?

INTERAKCE IONTŮ S POVRCHY II.

Techniky mikroskopie povrchů

STANOVENÍ TVARU A DISTRIBUCE VELIKOSTI ČÁSTIC MODELOVÝCH TYPŮ NANOMATERIÁLŮ. Edita BRETŠNAJDROVÁ a, Ladislav SVOBODA a Jiří ZELENKA b

VÝVOJOVÉ PORUCHY ZUBŮ

Viková, M. : MIKROSKOPIE V Mikroskopie V M. Viková

Zobrazovací metody v nanotechnologiích

Mikroskopie atomárních sil

Funkční a biomechanické vlastnosti pojivových tkání (sval, vazy, chrupavka, kost, kloub)

Elastografie. Biofyzikální ústav LF MU. Projekt FRVŠ 911/2013

Mikroskopie skenující sondou (Scanning Probe Microscopy)

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie

METODY VYŠETŘOVÁNÍ BUNĚČNÉ IMUNITY. Veřejné zdravotnictví

Základem AFM je velmi ostrý hrot, který je upevněn na ohebném nosníku (angl. cantilever, tento termín se používá i v češtině).

GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI

EXKURZE DO NANOSVĚTA aneb Výlet za EM a SPM. Pracovní listy teoretická příprava

Principy a instrumentace

EVROPSKÝ FOND PRO REGIONÁLNÍ ROZVOJ PRAHA & EU - INVESTUJEME DO VAŠÍ BUDOUCNOSTI

PRAKTIKUM III. Oddělení fyzikálních praktik při Kabinetu výuky obecné fyziky MFF UK. Pracoval: Jan Polášek stud. skup. 11 dne

Podivuhodný grafen. Radek Kalousek a Jiří Spousta. Ústav fyzikálního inženýrství a CEITEC Vysoké učení technické v Brně. Čichnova

VLIV ZPŮSOBŮ OHŘEVU NA TEPLOTNÍ DEGRADACI TENKÝCH OTĚRUVZDORNÝCH PVD VRSTEV ZJIŠŤOVANÝCH POMOCÍ VYBRANÝCH METOD

Mikroskopie skenující sondou: teorie a aplikace

Co je litografie? - technologický proces sloužící pro vytváření jemných struktur (obzvláště mikrostruktur a nanostruktur)

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

M ASARYKŮ V ONKOLOGICKÝ ÚSTAV Žlutý kopec 7, Brno

Numerické modelování interakce proudění a pružného tělesa v lidském vokálním traktu

sil Úvod Klára Smolná objektu. vzorku jeho laserový typicky

Ultrazvukové diagnostické přístroje. X31ZLE Základy lékařské elektroniky Jan Havlík Katedra teorie obvodů

Optická konfokální mikroskopie a mikrospektroskopie. Pavel Matějka

METODY ANALÝZY POVRCHŮ

Seznam otázek pro zkoušku z biofyziky oboru lékařství pro školní rok

Biologické signály. X31ZLE Základy lékařské elektroniky Jan Havlík Katedra teorie obvodů

AFM analýza dentinových povrchů po laserové expozici

Testování nanovlákenných materiálů

Elektrická impedanční tomografie

Radiační patofyziologie. Zdroje záření. Typy ionizujícího záření: Jednotky pro měření radiace:

Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy ( LF2 > Biofyzika

elektrické filtry Jiří Petržela filtry založené na jiných fyzikálních principech

Pozitronová emisní tomografie.

Výzkum slitin titanu - od letadel po implantáty

3. Vlastnosti skla za normální teploty (mechanické, tepelné, optické, chemické, elektrické).

Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk

Morfologie částic Fe 2 O 3. studium pomocí AFM

Bezkontaktní měření vzdálenosti optickými sondami MICRO-EPSILON

Průvodce měřením SPM a tvorbou silové litografie

Ultrazvukové diagnostické přístroje. X31LET Lékařskátechnika Jan Havlík Katedra teorie obvodů

PŘEHLED OBECNÉ HISTOLOGIE

ZÁVĚREČNÝ PROTOKOL O TESTOVÁNÍ BIOAKTIVNÍCH VLASTNOSTÍ LÁTKY CYTOPROTECT

Program Letní školy SPM mikroskopie

Analýza dat na PC I.

Aplikace rázové vlny. Doc.RNDr.Roman Kubínek, CSc. Předmět: Lékařská přístrojová technika

Statistika pro geografy

CHARAKTERIZACE MORFOLOGIE POVRCHU (Optický mikroskop, SEM, STM, SNOM, AFM, TEM)

STUDIUM MECHANICKÉHO CHOVÁNÍ ROZDÍLNÝCH SYSTÉMŮ TENKÁ VRSTVA SKLO POMOCÍ INDENTAČNÍCH ZKOUŠEK

Bioimaging rostlinných buněk, CV.2

Testování nanovlákenných materiálů

Ultrasonografická diagnostika v medicíně. Daniel Smutek 3. interní klinika 1.LF UK a VFN

Co by mohl (budoucí) lékař vědět o materiálech tkáňových výztuží či náhrad. 20. března 2012

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

Západočeská univerzita v Plzni fakulta Strojní

Zkušenosti pracovišť LF UK a FN v Hradci Králové ze spolupráce s COC, s. r. o., Rybitví, při řešení společného výzkumného projektu

ANALÝZA DAT V R 2. POPISNÉ STATISTIKY. Mgr. Markéta Pavlíková Katedra pravděpodobnosti a matematické statistiky MFF UK.

Laserové technologie v praxi II. Cvičeníč.1

Přednáška 6. SPM (Scanning Probe Microscopies) - AFM (Atomic Force Microscopy) Martin Kormunda

Novinky v ocelových a dřevěných konstrukcích se zaměřením na styčníky. vrámci prezentace výstupů Evropského projektu INFASO + STYČNÍKY KULATIN

Integrita povrchu a její význam v praktickém využití

Statistika. Diskrétní data. Spojitá data. Charakteristiky polohy. Charakteristiky variability

CT-prostorové rozlišení a citlivost z

CW01 - Teorie měření a regulace

Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice. Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ

Modelování a aproximace v biomechanice

Tekuté biopsie u mnohočetného myelomu

Zápočtová práce STATISTIKA I

STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ

Experimentáln. lní toků ve VK EMO. XXX. Dny radiační ochrany Liptovský Ján Petr Okruhlica, Miroslav Mrtvý, Zdenek Kopecký.

Praktická cvičení. Anotace

Koloidní zlato: tradiční rekvizita alchymistů v minulosti - sofistikovaný (nano)nástroj budoucnosti?

VYUŽITÍ MĚŘICÍ METODY SPM V TECHNOLOGII VÝROBY KRYSTALICKÝCH SOLÁRNÍCH ČLÁNKŮ

Transkript:

Studium vybraných buněčných linií pomocí mikroskopie atomárních sil s možným využitím v praxi Petr Kolář, Kateřina Tománková, Jakub Malohlava, Hana Kolářová, ÚLB Olomouc 2013

atomic force microscopy mikroskopie atomárních sil (AFM) se zdá být vhodným nástrojem nejen pro zobrazení biologických struktur, ale i k jejich manipulaci s nimi v nativním stavu a v přirozeném prostředí AFM skenování buňky je účinným nástrojem pro studium membránových a sub-membránových buněčných struktur AFM lze efektivně využít při vyšetřování fyzikálních vlastností a dynamiky cytoskeletu, například po poškození fotodynamickou reakcí

Sonda skenuje povrch vzorku Signál - vzniká interakcí povrchu vzorku a sondy Hrot je upevněný na konci pružného nosníku a těsným přiblížením hrotu k povrchu jsou mapovány povrchové síly, přičemž přitažlivé nebo odpudivé síly ohýbají raménko. Na konec raménka je fokusován laserový paprsek, který se odráží na fotodiodový detektor Posun hrotu po vzorku zajišťuje skenovací systém, kde jádrem je piezoelektrická keramika

Pomocí AFM je možné vyvolat lokální deformaci povrchu buňky jejím kontaktem s ostrou špičkou, která je umístěná na volném konci nosníku. Použité síly jsou poté odhadnuty snímáním výchylky nosníku pomocí laserového paprsku dopadajícího z konce odrazivé plochy raménka do fotodiody Je známo, že Youngův modul nádorové a normální buňky se liší a to díky rozdílné organizaci cytoskeletu Metastatická nádorová buňka je měkčí než zdravá buňka

HeLa buněčná linie (karcinom děložního hrdla virového původu) Skenující prostředí: DMEM (10% fetálního bovinního séra) Sensitizer ClAlPcS 2, LED diody 660 nm pro navození fotodynamického jevu Thermanox plastové krycí sklo pokryté poly-l-lysinem pro zvýšení adheze buněk, fixace glutaraldehydem pro zobrazení buněk Měření bylo prováděno na AFM Ntegra Aura (NT-MDT), Bioscope Catalyst (Bruker) s inverzním optickým mikroskopem Olympus

PDT Fotodynamická terapie Sensitizer ClAlPcS 2 byl přidán do DMEM media v koncentraci 0 (kontrola) a 5 µm. Inkubace byla 24h při 37 C a 5% CO 2. Po inkubaci byly buňky opláchnuty PBS a ozářeny 15 J.cm -2 pomocí LED diod. Po ozáření byly buňky inkubovány dalších 6h v čerstvém DMEM médiu.

Příprava buňečných kultur 100 000 HeLa buněk bylo kultivováno ve 2 ml DMEM media v atomosférě 5% CO 2 po dobu 24h při 37 C na plastových discích Thermanox modifikovaných poly-l-lysinem (0,01% PLL) Buňky byly skenovány v čerstvém DMEM médiu maximálně po dobu 2h, aby se zabránilo teplotním poškozením

Mikroskopie atomárních sil Skenovací rychlost 0,1 až 0,6 Hz Pro zobrazení buněk byl použit hrot NSG10 (NT-MDT) s rezonanční frekvencí 190-325 khz a konstantou tuhosti 0,01-0,5 N.m -1 Pro mechanické mapování elasticity buněk byl použit hrot CSG10 (NT-MDT) s rezonanční frekvencí 8-39 khz a konstantou tuhosti 0,01 0,5 N.m -1 Zobrazení buněk probíhalo v módu semi-kontaktního měření Snímky byly zpracovány pomocí SW programu Nova (NT-MDT) a Nanoscope analysis (Bruker) F-d křivky byly analyzovány progamem SPIP (Image metrologie) Buňky byly nejprve naskenovány v topografickém módu a poté byl hrot umístěn nad jadernou oblast buňky a oblast cytoplazmy Bylo provedeno přibližně 30 měření silových křivek v každé skupině a data následně podrobena statistické analýze

2D AFM před PDT Buňky tvoří monovrstvu Liniový profil Liniový profil 3D AFM zobrazení HeLa buňečné linie Výška kontrolních buňek byla 1,33 µm, délka 40,18 µm a šířka 18,06 µm Liniový profil ukazuje oblast buňečného jádra, nejvyššího bodu buňky a oblast mimo jádro Youngův modul nepoškozené buňky byl (medián, kvartil 25 a kvartil 75 ): 35,283 (28,061, 50,416) kpa na jádře a 107,442 (97,185, 125,270) kpa mimo jádro

Liniový profil 2D AFM po PDT Buňky jsou rozprostřeny individuálně po povrchu substrátu 3D AFM zobrazení HeLa buňečné linie Po PDT (byl přidán fotosensitizer ClAlPcS 2 v koncentraci 5 µm Ozáření diodami dávkou 15 J.cm -2. Výška buňek po PDT byla 1,78 µm, délka 21,06 µm in length a šířka 20,8 Youngův modul fotodynamicky poškozené buňky byl (medián, kvartil 25 a kvartil 75 ): 61.144 (50.814, 88.866) kpa na jádře a 193.605 (174.196, 217.614) kpa mimo jádro.

Obraz a morfologie z AFM koresponduje s morfologií z obrazu SEM Buňky po terapii mění svou velikost, 3D topografii i elastické vlastnosti

Distribuce naměřených hodnot pomocí kvartilů. Spodní oblast čtverce je první kvartil, linie uprostřed je medián a horní oblast grafu koresponduje s třetím kvartilem. Histogram četností Youngova modulu na jádře (N) a mino oblast jádra

Elastický modulus neporušených (kontrolních) a fotodynamicky narušených buněk (5 µm ClAlPcS 2, 15 J.cm -2 ) Distribuce naměřených hodnot je určena velkým rozptylem dat a určuje nám, že každá buňka má svou specifickou tuhost i přesto, že se jedná o stejnou buněčnou kulturu. Buňky kontrolní skupiny vykazují signifikantně nižší tuhost v jaderné oblasti, než buňky po PDT Čím vyšší je Youngův modul, tím je buňka méně elastická a tvrdší. Po fotodynamickém narušení buněčné struktury je jaderná oblast i oblast cytoplazmy buňky signifikantně tužší. Můžeme tedy pomocí AFM morfologicky klasifikovat vliv fotodynamické terapie na nádorovou buňku dále detekovat vliv různých faktorů (fyzikálních, chemických, biologických) na mechanické vlastnosti živých buněk a odhad mechanických vlastností buněk.

Vytvoření katalogu elastických vlastností nádorových a nenádorových buněčných linií a poté využít AFM v diagnostice Nadále v praxi využití tvrdosti a tuhosti v kombinaci s adherencí k nanovláknové matrix může v budoucnu nahradit některé chirurgické výkony. Náhrady tkání, chrupavek, kostních defektů ortopedie.

Poděkování Tato práce vznikla za podpory Institutu molekulární a translační medicíny CZ.1.05/2.1.00/01.0030 a Ústavu lékařské biofyziky LF_2013_006 Děkuji za pozornost