Fluorescenční mikroskopie



Podobné dokumenty
Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Zoologická mikrotechnika - FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE

Fluorescenční mikroskopie

F l u o r e s c e n c e

Optická konfokální mikroskopie a mikrospektroskopie. Pavel Matějka

MOLEKULÁRNÍ METODY V EKOLOGII MIKROORGANIZMŮ

Barevné principy absorpce a fluorescence

Barevné principy absorpce a fluorescence

Fluorescenční rezonanční přenos energie

Anizotropie fluorescence

Viková, M. : MIKROSKOPIE V Mikroskopie V M. Viková

Fluorescence (luminiscence)

Využití a princip fluorescenční mikroskopie

1. Teorie mikroskopových metod

Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii

ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY

Fluorescenční vyšetření rostlinných surovin. 10. cvičení

Principy a instrumentace

MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ

Využití a princip fluorescenční mikroskopie

Mikroskopické metody Přednáška č. 3. Základy mikroskopie. Kontrast ve světelném mikroskopu

IMUNOFLUORESCENCE. Mgr. Petr Bejdák Ústav klinické imunologie a alergologie Fakultní nemocnice u sv. Anny a Lékařská fakulta MU

Konfokální mikroskop vybavený FLIM modulem pro detekci interakce molekul u živých buněk

Fluorescenční a konfokální mikroskopie

7. Měření fluorescence při excitaci kontinuálním světlem ( steady-state )

Přístrojové vybavení pro detekci absorpce a fluorescence

MIKROSKOP. Historie Jeden z prvních jednoduchých mikroskopů sestavil v roce 1676 holandský obchodník a vědec Anton van Leeuwenhoek.

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

Techniky mikroskopie povrchů

Viková, M. : MIKROSKOPIE II Mikroskopie II M. Viková

Časově rozlišená fluorescence

Fluorescenční mikroskopie. -fluorescenční mikroskopie -konfokální mikroskopie

Přístrojové vybavení pro detekci absorpce a fluorescence

HPLC - Detektory A.Braithwaite and F.J.Smith; Chromatographic Methods, Fifth edition, Blackie Academic & Professional 1996 Colin F. Poole and Salwa K.

Fluorescenční mikroskopie. principy a použití

Příloha C. zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

Nové metody v průtokové cytometrii. Vlas T., Holubová M., Lysák D., Panzner P.

Elektronová mikroskopie SEM, TEM, AFM

1.1 Zobrazovací metody v optické mikroskopii

Proč elektronový mikroskop?

- Rayleighův rozptyl turbidimetrie, nefelometrie - Ramanův rozptyl. - fluorescence - fosforescence

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Fluorescenční mikroskopie

ZÁKLADNÍ ČÁSTI SPEKTRÁLNÍCH PŘÍSTROJŮ

Základy mikroskopie. Úkoly měření: Použité přístroje a pomůcky: Základní pojmy, teoretický úvod: Úloha č. 10

VEŘEJNÁ ZAKÁZKA S NÁZVEM: Mikroskopy

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách

M I K R O S K O P I E

Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk

FLUORIMETRICKÉ STANOVENÍ FLUORESCEINU

Ustálená fluorescence (Steady State Fluorescence)

Bi4170 Bi417 Optické kon Optic trastn ké kon trastn a zobrazova a zob razova metody metody

Optická mikroskopie a spektroskopie nanoobjektů. Nanoindentace. Pavel Matějka

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Bioimaging rostlinných buněk, CV.2

A. Technická specifikace pro výběrové řízení na Dynamický smykový reometr

Luminiscence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) fluorescence, fosforescence. chemicky (chemiluminiscence)

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

ZAHRADA FLUORESCENČNÍ KORELAČNÍ SPEKTROSKOPIE. LENKA BERANOVÁ, JANA HUMPOLÍČKOVÁ a MARTIN HOF. Obsah

FTTX - Měření v optických sítích. František Tejkl

Technické parametry příloha č. 2 k veřejné zakázce s názvem: Mikroskopy pro Centrum modelových organismů

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

DETEKTORY pro kapalinovou chromatografii. Izolační a separační metody, 2018

5.3.5 Ohyb světla na překážkách

Vlastní fluorescence proteinů

Technická specifikace předmětu veřejné zakázky

MĚŘENÍ MEMBRÁNOVÉHO NAPĚTÍ POMOCÍ NAPĚŤOVĚ CITLIVÝCH BARVIV VE FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPII

Světlo 1) Světlo patří mezi elektromagnetické vlnění (jako rádiový signál, Tv signál) elmg. vlnění = elmg. záření

Základní pojmy Zobrazení zrcadlem, Zobrazení čočkou Lidské oko, Optické přístroje

-fluorescenční mikroskopie. -konfokální mikroskopie -multifotonová konfokální mikroskopie

Základní pojmy a vztahy: Vlnová délka (λ): vzdálenost dvou nejbližších bodů vlnění kmitajících ve stejné fázi

PŘIHLÁŠKA DO SOUTĚŽE

FYZIKÁLNÍ PRAKTIKUM FJFI ČVUT V PRAZE

STUDIUM DOBY ŽIVOTA A SPEKTRÁLNÍCH ZMĚN FLUORESCENCE NANOČÁSTIC V BUNĚČNÉ BIOLOGII

Spektrální charakteristiky

Spektroskopické é techniky a mikroskopie. Spektroskopie. Typy spektroskopických metod. Cirkulární dichroismus. Fluorescence UV-VIS

vede sice ke zvýšení kontrastu, zároveň se ale snižuje rozlišení a ostrost obrazu (Obr. 46).

Infračervená spektroskopie

Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví. René Kizek

M I K R O S K O P I E

Určení koncentrace proteinu fluorescenční metodou v mikrotitračních destičkách

ECOVISION série BIOLOGICKÉ MIKROSKOPY

MĚŘENÍ ABSOLUTNÍ VLHKOSTI VZDUCHU NA ZÁKLADĚ SPEKTRÁLNÍ ANALÝZY Measurement of Absolute Humidity on the Basis of Spectral Analysis

Lupa a mikroskop příručka pro učitele

Neživá příroda I. Optické vlastnosti minerálů

Vybrané spektroskopické metody

Základní pojmy. Je násobkem zvětšení objektivu a okuláru

Optika pro mikroskopii materiálů I

Spektrometr pro měření Ramanovy optické aktivity: proč a jak. Optická sestava a využití motorizovaných jednotek.

DELFIA Dissociation-Enhanced Lanthanide Fluorescent ImmunoAssay

6. Metody molekulové spektroskopie spektrofotometrie, luminiscenční metody

Moderní metody rozpoznávání a zpracování obrazových informací 15

3.3. Mikroskopie Základní součásti světelného mikroskopu

Dalekohledy. y τ τ F 1 F 2. f 2. f 1. Předpoklady: 5211

MĚŘENÍ MEMBRÁNOVÉHO NAPĚTÍ POMOCÍ NAPĚŤOVĚ CITLIVÝCH BARVIV

10/21/2013. K. Záruba. Chování a vlastnosti nanočástic ovlivňuje. velikost a tvar (distribuce) povrchové atomy, funkční skupiny porozita stabilita

Fluorescenční mikroskopie

Typy světelných mikroskopů

EXPERIMENTÁLNÍ A SIMULAČNÍ SADA ÚLOH Z FOTONIKY

Transkript:

Fluorescenční mikroskopie Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1

VYUŽITÍ FLUORESCENCE, PŘÍMÁ FLUORESCENCE, PŘÍMÁ A NEPŘÍMA IMUNOFLUORESCENCE, BIOTIN-AVIDINOVÁ METODA IMUNOFLUORESCENCE Fluorescenční metody se používají především, pokud potřebujeme zviditelnit určité látky a struktury v buňce. Některé fluorochromy (DAPI, ethidium bromid, Hoechst, propidium jodid) se sami o sobě váží na určité molekuly (např. na DNA) a můžeme je tedy použít na zviditelnění těchto molekul. Tento postup se nazývá přímá fluorescence. Pro většinu struktur v buňce bychom však nenašli fluorochrom, který by se na ně specificky vázal. V takovém případě používáme metody imunofluorescence. Jsou vypracovány postupy, s jejichž pomocí si dokážeme vyrobit protilátku, která se specificky váže na téměř jakýkoli druh molekuly. Máme-li takovouto protilátku, můžeme na ni kovalentně navázat fluorofor a vyrobit tak fluoreskující molekulu specificky rozeznávající to, co potřebujeme. V tomto případě hovoříme o přímé imunofluorescenci. Příprava tohoto kombinované molekuly (konjugátu) není úplně jednoduchá, a proto se často používá nepřímá imunofluorescence. U této metody si nejdříve připravíme v určitém zvířecím druhu (např. v králíkovi) specifická protilátku proti naší molekule (primární protilátka) a necháme ji navázat na molekulu nebo strukturu, kterou chceme lokalizovat. Po odmytí přebytečné primární protilátky se na preparát přidá komerčně dodávaná protilátka konjugovaná s fluoresceinem, která specificky rozeznává všechny protilátky daného zvířecího druhu (v našem případě králíka). Ta se naváže na primární protilátku a zviditelní námi hledanou strukturu. Nevýhodou nepřímé fluorescence oproti přímé fluorescenci je nižší specifita. Biotin-avidinová imunofluorescence využívá silné vazby biotinu a bazického glykoproteinu avidinu. Biotin lze snadno navázat na molekuly primárních protilátek, na které se pak místo sekundárních protilátek s fluorochromem váže fluorochromem značený avidin. Výsledkem je jasná a ostrá fluorescence. Protože máme k dispozici celé barevné spektrum fluorochromů, můžeme zviditelnit více různých struktur v téže buňce a sledovat tak jejich vzájemnou lokalizaci. http://www.natur.cuni.cz/~parazit/parpages/mikroskopickatechnika/fluorescencni.htm 2

Fluorescenční mikroskop 3

Možné uspořádání Transmitted light microscopy Epi fluorescence microscopy 4

Transmisní fluorescenční mikroskop (Transmition light fluorescence microscope) http://www.natur.cuni.cz/~parazit/parpages/mikrosk opickatechnika/fluorescencni.htm U tohoto typu mikroskopu prochází světlo excitačním filtrem a na preparát přichází zespodu jako u klasického světelného mikroskopu. Pro osvětlení preparátu se však používá kondenzor zástinový, který odráží světlo tak, že dopadá na preparát světlo zboku. Procházející excitační světlo tak prochází mimo objektiv a do objektivu se dostane emitovaná fluorescence. 5

Epifluorescenční mikroskop (Reflected light fluorescence microscope) excitační světlo prochází objektivem, dopadá na preparát a emisní světlo se vrací zpět do objektivu nutno použít zvláštní typ zrcadla, které odráží excitační světlo do objektivu a propouští emisní světlo do okuláru používá se dichroické zrcadlo, které propouští a odráží světlo podle toho, jakou má vlnovou délku. Používá se tedy vždy takový typ zrcadla, který maximum excitačního světla odráží a maximum emisního světa propouští. epifluorescenční typ mikroskopu je v současnosti více oblíbený než transmisní typ 6

Excitační a barierový (emisní) filtr Abychom mohli dobře pozorovat emisní záření jehož intenzita je vždy mnohem nižší než intenzita excitačního záření, používáme dvojici filtrů. Excitační filtr propouští z barevného spektra pouze část potřebnou pro excitaci fluorescence a zabraňuje průchodu světla o stejné či podobné vlnové délce jako světlo emisní, které by vytvářelo pozadí. Bariérový filtr propouští pouze emisní část spektra a zabraňuje průchodu excitačnímu světlu. Excitační světlo se od emisního sice liší barvou, ale je mnohem intenzivnější, takže by v něm fluorescenční emisní světlo, které nám zejména jde, nebylo lidským okem rozlišitelné. http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/fluorescence/opticalpaths/index.html 7

Funkce dichroického zrcadla Dichroické zrcadlo propouští a odráží světlo podle toho, jakou má vlnovou délku. Používá se vždy takový typ zrcadla, který odráží maximum excitačního světla a propouští maximum emisního světa podle excitačního a emisního maxima daného fluoroforu 8

Filtry Vhodná kombinace dichroického zrcadla, excitačního a emisního filtru pro použitý druh fluorochromu se do epifluorescenčního mikroskopu se vkládá pohromadě jako tzv. kostka, jejíž dvě stěny jsou tvořeny filtry a úhlopříčka dichroickým zrcadlem. Kostky jsou umístěny na výměníku a je možné je vyměňovat podle potřeby. http://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/lightpaths/fluorescence/index.html 9

Konfokální mikroskop Konfokální mikroskop umožňuje odstranit z obrazu objektu šum, který vytváří světlo nebo fluorescence emitovaná z těch rovin vzorku, na které není zaostřena optika. Zdrojem světla je zpravidla laser, světlo prochází úzkou štěrbinou(source pinhole) a je zaostřeno do jednoho bodu vzorku. Světlo emitované z tohoto bodu je pak snímáno detektorem. Aby dopadlo na detektor, musí opět projít úzkou šterbino(detector pinhole), která leží v místě, kam objektiv zaměřuje světlo ze zaostřeného bodu objektu. Světlo emitované z osvětlených, ale nezaostřených bodů je fokusováno mimo stěrbinu a do detektoru nedopadá. Signál z detektoru je odeslán do počítače, který zároveň dostává informaci o souřadnicích snímaného bodu. Tímto způsobem je bod po bodu proskenován celý objekt v různých optických rovinách. Toto skenování je automatizováno a ovládáno řídícím počítačem. Z nashromážděných informací počítač sestaví celkový obraz. http://www.olympusconfocal.com/java/confocalsimulator/index.html 10

Virtuální mikroskopie http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/fluorescence/index.html http://www.olympusmicro.com/galleries/fluorescence/pages/microtubulef ilamentsmall.html http://www.microscopyu.com/tutorials/java/kohler/index.html 11

Praktická ukázka fluorescenčního mikroskopu

Literatura Lakowicz J.R.: Principles of Fluorescence Spectroscopy. Third Edition, Springer + Business Media, New York, 2006. Fišar Z.: FLUORESCENČNÍ SPEKTROSKOPIE V NEUROVĚDÁCH http://www1.lf1.cuni.cz/~zfisar/fluorescence/default.htm Poděkování Grafika z knihy Principles o Fluorescence byla pro účely této přednášky laskavě poskytnuta profesorem J.R. Lakowitzem. 13