3 Fotosyntetické pigmenty



Podobné dokumenty
4 Přenos energie ve FS

1- Úvod do fotosyntézy

Fotosyntéza Světelné reakce. Ondřej Prášil Mikrobiologický ústav AVČR Laboratoř fotosyntézy v Třeboni

EXTRAKCE, CHROMATOGRAFICKÉ DĚLENÍ (C18, TLC) A STANOVENÍ LISTOVÝCH BARVIV

Struktura atomů a molekul

Fyziologie rostlin. 9. Fotosyntéza část 1. Primární fáze fotosyntézy. Alena Dostálová, Ph.D. Pedagogická fakulta ZČU, letní semestr 2013/2014

Střední škola obchodu, řemesel a služeb Žamberk. Výukový materiál zpracovaný v rámci projektu EU Peníze SŠ

7 Fluorescence chlorofylu in vivo

Závěrečná práce studentského projektu Fotosyntéza - Rostlinná barviva

Fotosyntéza. Dýchání a fotosyntéza, struktura a funkce antén a reakčních center, energetika transportu elektronů a protonů.

Úloha č. 4. Návod na praktikum z fyziologie rostlin. Spekrofotometrické stanovení obsahu chlorofylu a karotenoidů v listech

14. Fyziologie rostlin - fotosyntéza, respirace

6 Přenos elektronů a protonů

Biologie. Pracovní list č. 4 žákovská verze Téma: Fotosyntéza a faktory, které ji ovlivňují. Lektor: Mgr. Naděžda Kurowská

ABSORPČNÍ A LUMINISCENČNÍ SPEKTROMETRIE V UV/Vis OBLASTI SPEKTRA

Číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/ Ročník: 1.

Sacharidy a polysacharidy (struktura a metabolismus)

Optika. VIII - Seminář

Metabolické dráhy. František Škanta. Glykolýza. Repetitorium chemie X. 2011/2012. Glykolýza. Jaký je osud pyruátu bez přítomnosti kyslíku?

2. Fotosensitizované reakce a jejich mechanismus. 5. Samoorganizované porfyrinové nanostruktury a jednoduché aplikace

Nukleární magnetická rezonance (NMR)

EKOTECH Fluorescence chlorofylu in vivo 1

Umělá fotosyntéza. Michael Hagelberg. Tomáš Polívka, Ústav fyzikální biologie

Lipidy, Izoprenoidy, polyketidy a jejich metabolismus

umožňují enzymatické systémy živé protoplazmy, nezbytný je kyslík,

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

Opakování

Co vás dnes čeká: Přednáška Fyziologie rostlin MB130P74. Katedra experimentální biologie rostlin, Z. Lhotáková

Kapitoly z fyzikální chemie KFC/KFCH. VII. Spektroskopie a fotochemie

Fluorescence chlorofylu

Fluorescenční rezonanční přenos energie

NaLékařskou.cz Přijímačky nanečisto

FIA fluorescenční imunoanalýza (fluorescence immuno-assay) CIA chemiluminiscenční imunoanalýza

Lenka Fialová kařské biochemie 1. LF UK. Mastné kyseliny (MK) v přírodě více než 100 mastných kyselin. většinou sudý počet uhlíků a lineární řetězec

Luminiscence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) fluorescence, fosforescence. chemicky (chemiluminiscence)

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Energetický metabolismus rostlin. respirace

KBF/FOSY Fotosyntéza a stres LRR/FOSY Fotosyntéza

Anorganická chemie. Povinný předmět pro 1. ročník FP a FM (nano) přednášky doc. Ing. Petr Exnar, CSc. cvičení Ing. Jan Grégr

12-Fotosyntéza FRVŠ 1647/2012

Světlosběrné systémy fotosyntetických organismů Tomáš Polívka

Jiří Oswald. Fyzikální ústav AV ČR v.v.i.

>>> E A1 + E A2. . aktivační energie potřebná k reakci bez přítomnosti katalyzátoru E A E A1. energie potřebná ke vzniku enzym-substrátového komplexu

FOTOSYNTÉZA. Mgr. Alena Výborná Gymnázium, SOŠ a VOŠ Ledeč nad Sázavou VY_32_INOVACE_01_1_07_BI1

Absorpce, rozptyl, disperze světla The Light Fantastic, kap. 11

MATURITNÍ TÉMATA - CHEMIE. Školní rok 2012 / 2013 Třídy 4. a oktáva

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Fotosyntéza světelná fáze. VY_32_INOVACE_Ch0214.

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie

02 Nevazebné interakce

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Polymorfismus kovů Při změně podmínek (zejména teploty), nebo např.mechanickým působením změna krystalické struktury.

Základy koloidní chemie

Antioxidační sloučeniny řas. Hana Fojtíková

IDENTIFIKACE LÉČIVA V TABLETÁCH POMOCÍ RAMANOVY SPEKTROMETRIE

DYNAMICKÁ BIOCHEMIE. Daniel Nechvátal ::

Fyzika IV Dynamika jader v molekulách

Přednáška IX: Elektronová spektroskopie II.

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

VI. skupina PS, ns 2 np4 Kyslík, síra, selen, tellur, polonium

Sekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch

Aerobní odbourávání cukrů+elektronový transportní řetězec

Úvod do moderní fyziky. lekce 9 fyzika pevných látek (vedení elektřiny v pevných látkách)

37 MOLEKULY. Molekuly s iontovou vazbou Molekuly s kovalentní vazbou Molekulová spektra

Elektrické vlastnosti pevných látek

Fotosyntézu lze schematicky vyjádřit: hv CO H 2 O (CH 2 O)+ O 2 + H 2 O. Rozčlenění pochodů v chloroplastu na membránové a enzymové:

Skupenské stavy. Kapalina Částečně neuspořádané Volný pohyb částic nebo skupin částic Částice blíže u sebe

Luminiscence. Luminiscence = studené světlo Inkandescence = teplé světlo

KBF/FOSY Fotosyntéza a stres LRR/FOSY Fotosyntéza

Molekulová absorpční spektrometrie (Spektrometrie ve viditelné a UV oblasti)

Vzorce a tvary víceatomových molekul nekovů Lewisova teorie kyselin a bází

Optické spektroskopie 1 LS 2014/15

UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 3. LÉKAŘSKÁ FAKULTA (tématické okruhy požadavků pro přijímací zkoušku)

Infračervená spektroskopie

Měření množství dopadající energie světla. Fotoinhibice, fotopoškození a fotoprotekční mechanismy

Chemické výpočty II. Převod jednotek. Převod jednotek. Převod jednotek. pmol/l nmol/l µmol/l mmol/l mol/l. Cvičení. µg mg g. Vladimíra Kvasnicová

NANOMATERIÁLY, NANOTECHNOLOGIE, NANOMEDICÍNA

ALKENY NENASYCENÉ UHLOVODÍKY

Jméno autora: Mgr. Ladislav Kažimír Datum vytvoření: Číslo DUMu: VY_32_INOVACE_09_Ch_OB Ročník: I. Vzdělávací oblast: Přírodovědné

Chemická vazba. John Dalton Amadeo Avogadro

Světelné reakce fotosyntézy. - fixace energie záření

Deriváty karboxylových kyselin, aminokyseliny, estery

Tabulace učebního plánu. Obecná chemie. Vzdělávací obsah pro vyučovací předmět : Ročník: 1.ročník a kvinta

Absorpční fotometrie

FYZIKA 4. ROČNÍK. Kvantová fyzika. Fotoelektrický jev (FJ)

Diskutujte, jak široký bude pás spojený s fosforescencí versus fluorescencí. Udělejte odhad v cm -1.

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

Dekapling, koherentní transfer polarizace, nukleární Overhauserův jev

SPEKTRÁLNÍ METODY. Ing. David MILDE, Ph.D. Katedra analytické chemie Tel.: ; (c) David MILDE,

Referát z Fyziky. Detektory ionizujícího záření. Vypracoval: Valenčík Dušan. MVT-bak.

Ideální krystalová mřížka periodický potenciál v krystalu. pásová struktura polovodiče

B4, 2007/2008, I. Literák

BÍLKOVINY R 2. sféroproteiny (globulární bílkoviny): - rozpustné ve vodě, globulární struktura - odlišné funkce (zásobní, protilátky, enzymy,...

Jméno autora: Mgr. Ladislav Kažimír Datum vytvoření: Číslo DUMu: VY_32_INOVACE_08_Ch_OB Ročník: I. Vzdělávací oblast: Přírodovědné

10A1_IR spektroskopie

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

Mezimolekulové interakce

Transkript:

3 Fotosyntetické pigmenty Petr Ilík KBF a CRH, PřF UP Funkce světlosběrných pigmentů - Světlosběrný fotosyntetický aparát - 3 funkce: Absorpce světla pigment ve světlosběrné anténě nebo v RC Přenos energie (excitací) - ze světlosběrné antény do RC (po energetické spádnici - obr. pro různé organismy ) Přenos elektronu v RC - Závislost na fyzikálně-chemických vlastnostech pigmentů - hlavní světlosběrné pigmenty - chl, bchl v RC - přídavné světlosběrné pigmenty absorbují záření v jiných spektrálních oblastech než hlavní přenos energie do RC využití širšího spektra záření pro fotosyntézu

Fyzikálně-chemické vlastnosti (b)chl - vinyl formyl acetyl 2 3 4 8 7 0 9 6 5 Fyzikálně-chemické vlastnosti (b)chl - 2 - Metaloporfyrin derivát porfyrinu s atomem Mg uprostřed - Porfyrinová hlava cyklický tetrapyrol,,5 x,5 nm, hydrofilní, rovinná (skupiny na vnějších hranách), 2 ( bchl) konjugovaných dvojných vazeb delokalizovanéπ elektrony velká plocha pro záchyt fotonu, osy x a y označují směry dipólových momentů elektronových přechodů (osa y: N N 3, osa x: N 2 N 4 ) - Fytylový řetězec fytol, navázaný esterovou vazbou na zbytek kys, propionové 4. pyrolového cyklu, jedna dvojná vazba, hydrofóbní, důležitý pro interakci s lipidy a proteiny - Molekula jako celek amfipatická převládá lipofilní (hydrofóbní) charakter dobrá rozpustnost v organických rozpouštědlech (polárních i nepolárních) - Schopnost být donorem elektronu (b)chl v RC, donace e - z volných el. párů u O v C=0 na cyklu V, donorové schopnosti klesají v pořadí C 9, C 0, C 7, v nepolárních rozpouštědlech (CCl 4 ) dimery chl:c 9 =0 Mg - Schopnost být akceptorem elektronu Mg není koordinačně nasycený, je ve formě Mg 2+ (s 2, 2s 2, 2p 6 ), hybridizace 3 sp 3 d 2 oktaedr, 4 rovnocenné koordinačně kovalentní vazby od N -4, d orbitaly kolmo k rovině porfyrinové hlavy vazba chl na proteiny (His, > λ abs ), v alkoholech monosolvát chl L, v nepolárních rozp. disolvát chl L 2 2

Absorpční spektrum (bakterio)chlorofylů - (0-0) Q Y (0-) (0-0) Absorpční spektrum (bakterio)chlorofylů - 2 - Hlavní absorpční pásy (b)chl (rozpouštědlo éter) - 430 (450, 370) nm - chl a(b, bchl a) přechod S 0 -S 2 (Soretův pás) modrá - 660 (640, 760) nm chl a(b, bchl a) - přechod S 0 -S červená - závislost na rozpouštědle zejména hlavní maximum 660 675 nm (pohyb díky silné dipól dipólové interakci mezi rozpouštědlem a (b)chl), závislost na agregaci (b)chl - výrazný rozdíl v absorpčních pásech chl a, b, bchl a spektrofotometrické stanovení obsahu pigmentů bez separace, měření v červené oblasti spektra (není překryv s karotenoidy) - Absorpční spektrum odráží přechody mezi elektronovými hladinami - Přechody v červené oblasti Q, v modré oblasti B - Přechod je závislý na polarizaci dopadajícího záření x, y osy porfyrinu - Např. Q X (0-0) přechod z S 0 do S, polarizace podél osy x, přechod z vibr. hladiny 0 stavu S 0 do vibrační hladiny 0 stavu S ) přechod maximum [nm] - Hlavní abs. pásy chl a v 80 % acetonu (Lichtenthaler 987) Q y 0-0 663,2 Q y 0-68,2 Q x 0-0 582,4 B x(y) 0-0 43,2 3

Absorpční a emisní pásy chlorofylu Chlav éteru 2 S 0 Pravděpodobnost obsazení S 0 (0) a S 0 (): n n S0 () S0 (0) = e E RT Bolzmanův vztah energie 65 728 662 666 S 2 0 0 Stokesův posuv - 4 nm odpovídá ztrátě rotační energie E. Rozdíl energií S 0 (0) a S 0 () pro chl a 4 kj/mol RT. univerzální plynová konstanta * absolutní teplota (2,48 kj/mol) n S0() /n S0(0) = e -5,65 = 0,0035 tj. z 300 molekul je v S 0 () Fluoresceční emisní pásy: Hlavní 666 nm, vedlejší 728 nm (vibrační satelit) Rozdíl - 62 nm ~ 5 kj/mol Interakce chl aminokyselina: posun absorpce i emise o i desítky nm do červené oblasti pološířka absorpčního pásu -0 nm ~ 3 kj/mol - odpovídá spektru rotačních energií interakce se sousedy Chlorofyly in vivo 4

Degradace chlorofylu Ztráta Mg 2+ - ve slabě kyselém prostředí Ztráta fytolu roztoky hydroxidů alkalických kovů Destrukce porfyrinu silné kyseliny nebo vysoká ozářenost v prostředí s O 2 ( 3 chl * + 3 O 2 chl + O 2 * nevratná oxidace porfyrinového skeletu vybělování photobleaching, princip fotodynamické terapie) Chrorofyly v reakčním centru - 820nm P700 + P680 + 5

Chrorofyly v reakčním centru - 2 Přídavné pigmenty - obecně - zejména pro záchyt fotonů a předávání excitací (energie) - Chlorofyl b hlavní přídavný pigment ve světlosběrných anténách řas a nižších a vyšších rostlin, 00 % přenos energie na chl a ve světlosběrných anténách (není měřitelná fluorescence chl b in vivo), není vázan na protein kovalentně (H můstky a hydrofóbní interakce) stejně jako u chl a - Fykobiliny hlavní přídavný pigment u ruduch a sinic - Karotenoidy ve všech fotosyntetických organismech (i ochranná funkce) 6

Fykobiliny - - hlavní přídavný pigment u sinic a ruduch - Fyko(Phyco) mořská řasa, biliny látky podobné žlučovým proteinům ( bile - žluč, pojmenování R. Lemberg ve 20. letech minulého stolení) - Lineární (na rozdíl od (b)chl) tetrapyroly, kovalentní vazba na protein Hlavní fykobiliny: fykoerytrobilin (PE) (+ protein = Fykoerytrin), λ max 530-570 nm načervenalý, 7 konjugovaných dvoj. vazeb fykocyanobilin (PC) (+ protein = Fykocyanin), λ max 60-660 nm namodralý, 9 konjugovaných dvoj. vazeb absorbance Fykobiliny - 2 - Fykobiliny organizovány ve fykobilizomech (300-800 fykobilinů) - Fykobilizomy navázány na RC PSII, možnost odpojení a připojení na RC PSI 7

Distribuce řas podle přídavných pigmentů green algae (chl b) brown algae (fukoxanthin) λ abs : 425 560 nm - 20 m - 00 m red algae (PE, PC) (změna spektr. složení světla mění zastoupení PE a PC) (carotenoid) Absorpční spektra přídavných pigmentů Absorbance 8

Karotenoidy - obecně - u všech fotosyntetických organismů (světlosběrná), absorpce cca 400 530 nm, zodpovědné za barvy listů při senescenci na podzim (degradace chl), důležité pro živočichy neumí je syntetizovat (např. zbarvení kanárů a plameňáků) - účinnost přenosu energie do RC i nižší spíše ochranná funkce!!! - 40-C terpenoidy izoprenoidy (z 8 izoprénů ) - 3 nm molekuly s 9 a více konjugovanými = - Počet konjugovaných = rozhoduje o absorpci: vyšší počet = vyšší λ max absorpce i mol. ext. koef. Počet konjugovanýc h = λ max (nm) pro n-hexan 3 286 5 347 7 400 9 440 472 3 500 - in vivo posun o 20-30 nm k vyšším vlnovým délkám - Čím rozsáhlejší konjugovaný systém, tím širší spektrum energií základního a excitovaného stavu (průměrná energie zákl. a exc. stavu je stejná) - stačí méně energie na přechod do excitovaného stavu Karotény (bez kyslíku) - oranžové pigmenty, rozpustné v tucích Karotény a xantofyly - β-karotén hlavní karotén v listech, symetrická molekula, konj. = (α-karotén změna pozice =) - účinnost přenosu energie na chl 30 40 % (α) energie lutein v etanolu 2 S 2 0 477 447 420 S 0 0 2 Xantofyly (s kyslíkem) - vznik oxidace karoténů. liší se v pozici kyslíku na koncových cyklech (epoxy-, hydroxy-, metoxy-, ketoskupiny), účinnost přenosu energie na chl až 80 % - lutein hlavní xantofyl v listech (0 konj.=) - violaxantin, antera-, zea-, neo-, fuko- Absorbance 0-2 0-0-0 9

Xantofyly xantofylového cyklu 9 konj. =, 2 epoxy sk. 0 konj. =, epoxy sk. konj. =, není epoxy sk. Ochranná funkce karotenoidů - - ochrana před oxidativním poštozením - 2 mechanismy: ) Převod energie z 3 chl * na car 0

Ochranná funkce karotenoidů - 2 ) Převod energie z 3 chl * na karotenoid (Jablonského schéma), 0 x rychlejší než na chl (vyměnná rezonance nutná blízkost molekul) chlorofyl karotenoid S 2 2 0 S 2 k VK T 2 energie k! k 2 S k S-T T 2 0 T 2 0 S k A ka2 k FL k VK2 k VK4 k FO teplo S 0 S 0 Ochranná funkce karotenoidů - 3 2) Likvidace singletního kyslíku ( O 2* ), který vzniká při reakci T chl * + T O 2 ( O 2 * + chl) O 2 * + car 3 O 2 + 3 car *

Ochranná funkce karotenoidů - 4 3) Přenos energie z chl * na karotenoid iniciovaný acidifikaci lumenu thylakoidu a následnou konformační změnou proteinu v souvislosti s deepoxidací violaxantinu na zeaxantin 2