Disková difuzní metoda EUCAST pro vyšetřování citlivosti k antibiotikům Verze 3.0 Duben 2013
Obsah Půdy Příprava inokula Očkování ploten Disky Inkubace Odečítání zón Interpretace Kontrola kvality Analýza chyb EUCAST 2013 Verze 3.0 2
EUCAST - disková difuzní metoda modifikace prezentace Verze Verze 3.0 Duben 2013 Verze 2.1 Únor 2012 Verze 2.0 Leden 2012 Verze 1.1 Červen 2010 Verze 1.0 Prosinec 2009 Modifikace Vysvětlení ohledně defibrinované koňské krve v půdě MH-F, str. 5 a 6. Pasteurella multocida, Campylobacter jejuni a C. coli přidány na str. 6 a 19. Vysvětlení ohledně výběru kolonií pro diskovou difuzi, str. 11 a 12. Přidán Campylobacter jejuni ATCC 33560, str. 30. Přidána čísla sbírek DSM and CCUG pro E. faecalis ATCC 51922, str. 31. Vysvětlení ohledně odečítání zón na str. 23 a 25. Nová terminologie (Viridující streptokoky) a přidání Listeria monocytogenes na str. 6 a 19. Vysvětlení ohledně odečítání zón na str. 24. Další výjimky u odečítání zón na str. 27. K. pneumoniae ATCC 700603 a E. faecalis ATCC 51299 přidány na str. 31. Vysvětlení ohledně výšky agaru na str. 7. Čísla španělské sbírky kultur přidána na str. 30 a 31. EUCAST poprvé zveřejňuje na webových stránkách obrázkovou prezentaci diskové difuzní metody EUCAST. EUCAST 2013 Verze 3.0 3
Půdy pro vyšetření citlivosti EUCAST 2013 Verze 3.0 4
Půdy pro vyšetření citlivosti Používá se Mueller-Hinton agar (MH). Půda pro náročné bakterie (MH-F, Mueller-Hinton Fastidious) je MH obohacený 5% mechanicky defibrinované koňské krve a 20 mg/l β-nad (nikotinamid adenin dinukleotid). EUCAST 2013 Verze 3.0 5
Půdy pro různé bakterie Bakterie Enterobacteriaceae Pseudomonas spp. Stenotrophomonas maltophilia Acinetobacter spp. Staphylococcus spp. Enterococcus spp. Mueller-Hinton agar Půda Streptococcus pneumoniae Streptokoky sk. A, B, C a G Viridující streptokoky Haemophilus spp. Moraxella catarrhalis Listeria monocytogenes Pasteurella multocida Campylobacter jejuni a coli Ostatní náročné bakterie Mueller-Hinton (MH) agar + 5 % mechanicky defibrinované koňské krve + 20 mg/l β-nad (MH-F) V přípravě EUCAST 2013 Verze 3.0 6
Vlastní příprava půd Při přípravě se postupuje podle pokynů výrobce. Krev nebo β-nad lze přidat, pouze je-li půda ochlazena na 42-45 C (je třeba zajistit příslušné nastavení teploty), poté se půda pečlivě promíchá a vylije na plotny. Půda se do ploten vylévá na rovném povrchu do jednotné výšky 4.0 +/- 0.5 mm. Pokud opakované měření prokáže výšku agaru pod nebo nad 4 mm, vylévaný objem se upraví, i když je výška agaru na plotně v rozmezí 3.5-4.5 mm. Obvykle se používají kulaté plotny o průměru 90 mm (~25 ml), 100 mm (~31 ml), 150 mm (~71 ml), nebo čtvercové plotny o straně 100 mm (~40 ml). EUCAST 2013 Verze 3.0 7
Kontrola kvality Mueller-Hinton agaru Je třeba ověřit, zda všechny používané šarže Mueller- Hinton agaru jsou v přípustném rozmezí inhibičních zón pro všechna vyšetřovaná antibiotika a bakterie. Zvláštní problémy: Inhibiční zóny aminoglykosidů u P. aeruginosa ATCC 27853 o menším/větším průměru než je dolní/horní limit ukazují na vysokou/nízkou koncentraci dvojmocných kationtů v půdě. Inhibiční zóny trimethoprim-sulfamethoxazolu u E. faecalis ATCC 29212 o menším průměru než je dolní limit ukazují na vysoký obsah thyminu a thymidinu v půdě. 8 EUCAST 2013 Verze 3.0
Sušení a skladování agarových ploten Na povrchu ploten před vyšetřením citlivosti nesmí být žádné viditelné kapky vody. Plotny nesmí být přesušené. Při vlastní přípravě ploten závisí podmínky pro sušení a skladování na dostupném vybavení a měly by být určeny na místě. Při skladování komerčně připravovaných půd je zapotřebí postupovat podle pokynů výrobce. EUCAST 2013 Verze 3.0 9
Inokulum Metoda vyžaduje zákal inokula odpovídající 0,5 McFarlandova standardu*. * Odpovídá přibližně 1-2 x10 8 CFU/ml u E. coli. EUCAST 2013 Verze 3.0 10
Výběr izolovaných kolonií vyrostlých přes noc na neselektivní půdě EUCAST 2013 Verze 3.0 11
Příprava inokula Sterilní kličkou nebo bavlněným tamponem se k vyloučení atypických variant odebere několik (pokud možno) morfologicky podobných kolonií, které se rozetřou ve fyziologickém roztoku tak, aby homogenní, viditelný zákal odpovídal McFarlandovu standardu 0,5. Výjimka: Streptococcus pneumoniae z krevního agaru se připraví podle zákalového stupně 0,5 McFarlanda, z čokoládového agaru podle zákalového stupně 1,0 McFarlanda. Hustotu suspenze lze upravit přidáním bakterií nebo fyziologického roztoku tak, aby odpovídala McFarlandovu zákalu 0,5. Zákal se změří nejlépe na fotometru. EUCAST 2013 Verze 3.0 12
Inokulace ploten Suspenze inokula se očkuje na plotny, nejlépe do 15 minut od přípravy, a nejpozději do 60 minut. Bavlněný tampon se ponoří do suspenze a přebytečná tekutina se odstraní jeho rotací po vnitřní stěně zkumavky. Inokulum se roztírá tamponem ve třech směrech nebo rotátorem tak, aby byl naočkován celý povrch plotny. EUCAST 2013 Verze 3.0 13
Husté inokulaci ploten je třeba se vyhnout Je důležité, aby inokulum na plotně nebylo husté. Ověří se, zda průměry ů zón kontrolních kmenů ů jsou v přípustném rozmezí. Husté inokulum vytváří zóny inhibice o menším průměru. Přebytek inokula na tamponu se před inokulací odstraní jemnou rotací po vnitřní stěně zkumavky (u grampozitivních bakterií se však nesmí tampon příliš vysušit). EUCAST 2013 Verze 3.0 14
Skladování disků s antibiotiky Disky se skladují podle podmínek daných výrobcem. Běžně používané disky se uchovávají v temnu při 4-8 C v uzavřených kontejnerech s indikátorem vlhkosti. Před otevřením je nutno kontejner s disky umístit do pokojové teploty, aby nedocházelo ke kondenzaci vody. Lépe je ponechat disky během pracovního dne při pokojové teplotě než je opakovaně ukládat do ledničky. Disky nelze používat po datu expirace uvedeném na obalu. EUCAST 2013 Verze 3.0 15
Aplikace disků s antibiotiky Disky se aplikují do 15 minut od inokulace ploten. Disky musí být pevně a celou plochou přitištěny k povrchu půdy. Počet disků na plotně je nutno omezit, aby se předešlo překrývání inhibičních zón a interferenci mezi antibiotiky. Tím lze dosáhnout spolehlivé měření průměrů zón. EUCAST 2013 Verze 3.0 16
Souhrn postupu při inokulaci Suspenze inokula se vytvoří z izolovaných kolonií vyrostlých přes noc na neselektivní půdě. Hustota inokula se upraví podle zákalu McFarlandova standardu. Inokulum se v optimálním případě naočkuje na plotny do 15 minut od vytvoření suspenze. Sterilní tampon se ponoří do inokula a přebytek tekutiny se odstraní rotací tamponu po vnitřní stěně zkumavky. Inokulum se rovnoměrně naočkuje po celém povrchu agaru. Disky se aplikují do 15 minut po inokulaci ploten a inkubace se zahájí do následujících 15 minut. EUCAST 2013 Verze 3.0 17
Inkubace ploten Do 15 min od aplikace disků se plotny obrátí víčkem dolů a dají se inkubovat. Toto omezení času predifuze předchází tvorbě zón o nežádoucím větším průměru. Počet ploten ve sloupci by měl být co nejnižší k potlačení rozdílné teploty uvnitř sloupce, která ovlivňuje průměry zón (podle možností inkubátoru). MH se inkubuje na vzduchu, MH-F na vzduchu s 4-6% CO 2. EUCAST 2013 Verze 3.0 18
Inkubace ploten Bakterie Podmínky inkubace Enterobacteriaceae 35+/-1 ºC na vzduchu po 16-20h Pseudomonas spp. 35+/-1 ºC na vzduchu po 16-20h Stenotrophomonas maltophilia 35+/-1 ºC na vzduchu po 16-20h Acinetobacter spp. 35+/-1 ºC na vzduchu po 16-20h Staphylococcus spp. 35+/-1 ºC na vzduchu po 16-20h Enterococcus spp. 35+/-1 ºC na vzduchu po 16-20h Streptococcus sk. A, B, C a G 35+/-1 ºC na vzduchu s 4-6% CO2 po 16-20h Viridující streptokoky 35+/-1 ºC na vzduchu s 4-6% CO2 po 16-20h Streptococcus pneumoniae 35+/-1 ºC na vzduchu s 4-6% CO2 po 16-20h Haemophilus spp. 35+/-1 ºC na vzduchu s 4-6% CO2 po 16-20h Moraxella catarrhalis 35+/-1 ºC na vzduchu s 4-6% CO2 po 16-20h Listeria monocytogenes 35+/-1 ºC na vzduchu s 4-6% CO2 po 16-20h Pasteurella multocida 35+/-1 ºC na vzduchu s 4-6% CO2 po 16-20h Campylobacter jejuni a C. coli 41+/-1 ºC v mikroaerobním prostředí po 24h Další náročné bakterie V přípravě EUCAST 2013 Verze 3.0 19
Pravidlo 15-15 -15 minut Plotny je třeba připravit tak, že: inokulum se očkuje do 15 minut od přípravy, nejpozději však do 60 minut, disky se kladou do 15 minut po inokulaci ploten, do 15 minut po aplikaci disků je třeba plotny začít inkubovat. EUCAST 2013 Verze 3.0 20
Prohlížení ploten po inkubaci Správné inokulum, dobře rozetřené na plotny, poskytuje splývavý nárůst. Rovnoměrný nárůst kolonií umožňuje vytvoření kruhových zón inhibice s ostrými (nevykousanými) okraji. (viz následující obrázek). Málo koncentrované inokulum vytváří izolované kolonie a vyšetření je nutno opakovat EUCAST 2013 Verze 3.0 21
Růst by měl být splývavý a rovnoměrný Plotny by měly vypadat takto... a NIKOLI takto! EUCAST 2013 Verze 3.0 22
Odečítání zón Okraje zón se odečítají ve vzdálenosti 30 cm od oka, od bodu úplné inhibice viditelné pouhým okem. Příklady: E. coli Ciprofloxacin S. aureus Erythromycin KNS Trimethoprim S. pneumoniae Rifampicin EUCAST 2013 Verze 3.0 23
Odečítání zón MH plotny se odečítají ze spodní strany proti tmavému pozadí v odraženém světle. MH-F plotny se odečítají po odstranění víčka z horní strany v odraženém světle. EUCAST 2013 Verze 3.0 24
Odečítání zón Plotny nelze odečítat v procházejícím světle (kdy je plotna umístěna proti zdroji světla) nebo pomocí lupy, pokud není stanoveno jinak (viz dále). Průměry zón lze měřit pravítkem, posuvným měřítkem nebo automatickým odečítáním zón. Zřetelné kolonie, které se vyskytnou uvnitř zóny, je třeba vyočkovat, ověřit jejich čistotu a pokud je nutno, opakovat vyšetření. EUCAST 2013 Verze 3.0 25
Odečítání zón výjimky (1) Bakterie Antibiotikum Odečítání inhibičních zón Proteus spp. Kterékoli Plazivý růst se přehlíží. Streptococcus spp. Kterékoli Odečítá se zóna inhibice růstu, nikoli hemolýzy. Kterákoli Trimethoprim Trimethoprim-sulfamethoxazol Jemný, zastřený růst v inhibiční zóně se zřetelnými okraji se ignoruje. Staphylococcus spp. Linezolid Zóna se prohlíží v procházejícím světle (proti zdroji světla). Enterococcus spp. Vankomycin Zóna se prohlíží v procházejícím světle (proti zdroji světla). Enterobacteriaceae Ampicilin Jemný růst uvnitř zóny, který se může vyskytnout u některých šarží MH agaru, se přehlíží. EUCAST 2013 Verze 3.0 26
Odečítání zón výjimky (2) Bakterie Antibiotikum Odečítání inhibičních zón E. coli Mecilinam Izolované kolonie uvnitř inhibiční zóny se přehlížejí. Stafylokoky Benzylpenicilin Zóna se prohlíží v blízkosti procházejícího světla (proti zdroji světla). Stafylokoky Cefoxitin Inhibiční zóna se pečlivě prohlíží a pátrá se po koloniích uvnitř zóny. EUCAST 2013 Verze 3.0 27
Interpretace zón Před interpretací výsledků se ověří, zda průměry inhibičních zón vytvořené kontrolními kmeny jsou v přípustném rozmezí. Naměřené průměry inhibičních zón (na nejbližší milimetr) se interpretují v kategoriích citlivosti (C, I a R) podle tabulek breakpointů EUCAST (EUCAST Breakpoint Tables (www.eucast.org), česky Tabulky breakpointů EUCAST (www.szu.cz/eucast-dokumenty). EUCAST 2013 Verze 3.0 28
Kontrola vyšetření citlivosti Ke kontrole správnosti provedení je zapotřebí používat doporučené kmeny pro kontrolu kvality (viz EUCAST Quality Control Tables, česky EUCAST Tabulky pro kontrolu kvality). Kontrolní kmeny s definovanou rezistencí lze použít ke kontrole schopnosti detekovat rezistenci. Kontrolní kmeny lze koupit ze sbírek kultur nebo z komerčních zdrojů. EUCAST 2013 Verze 3.0 29
EUCAST - kmeny pro rutinní kontrolu kvality Druh Číslo sbírky kultur Vlastnosti E. coli P. aeruginosa S. aureus E. faecalis S. pneumoniae ATCC 25922; NCTC 12241; CIP 7624 DSM 1103; CCUG 17620; CECT 434; CNCTC 5276 ATCC 27853; NCTC 12903; CIP 76110 DSM 1117; CCUG 17619; CECT 108; CNCTC 5482 ATCC 29213; NCTC 12973; CIP 103429 DSM 2569; CCUG 15915; CECT 794; CNCTC 5480 ATCC 29212; NCTC 12697; CIP 103214 DSM 2570; CCUG 9997; CECT 795; CNCTC 5483 ATCC 49619; NCTC 12977; CIP 104340 DSM 11967; CCUG 33638; CNCTC 5043 Citlivý, divoký typ Citlivý, divoký typ Slabý producent β-laktamázy Citlivý, divoký typ Intermediární k penicilinu H. influenzae NCTC 8468; CIP5494; CCUG 23946; CNCTC 7425 Citlivý, divoký typ Campylobacter jejuni ATCC 33560; NCTC 11351; CIP 702 DSM 4688; CCUG 11284; CNCTC 7365 Citlivý, divoký typ EUCAST 2013 Verze 3.0 30
EUCAST - kmeny pro detekci specifických mechanizmů rezistence (ve vývoji) Druh Číslo sbírky kultur Vlastnosti E. coli ATCC 35218; NCTC 11954; CIP 102181; DSM 5564; CCUG 30600; CECT 943; CNCTC 5321 Producent TEM-1 β-laktamázy K. pneumoniae ATCC 700603; NCTC 13368; CCUG 45421; CECT 7787 Producent ESBL (SHV-18) S. aureus NCTC 12493 Heterorezistentní k oxacilinu, meca pozitivní E. faecalis ATCC 51299; NCTC 13379; CIP 104676; DSM 12956; CCUG 34289; CNCTC 5530 Rezistentní k vysoké koncentraci aminoglykosidů (HLAR) a k vankomycinu (vanb pozitivní) H. influenzae ATCC 49247; NCTC 12699; CIP 104604; DSM 9999; CCUG 26214; CNCTC 5063 β-laktamáza negativní, ampicilin- rezistentní (BLNAR) EUCAST 2013 Verze 3.0 31
Sbírky kultur ATCC, American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, MD 20852, USA. NCTC, National Collection of Type Cultures, Health Protection Agency Centre for Infections, 61 Colindale Avenue, London NW9 5HT, UK. CIP, Collection de Institut Pasteur, 25 28 Rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15 France. DSMZ, Deutsche Stammsammlung für Mikroorganismen und Zellkulturen, Mascheroder Weg 16, D-38124 Braunschweig, Germany. CCUG, The Culture Collection University of Gothenburg. http://www.ccug.se/ CECT, Colección Española de Cultivos Tipo. Universidad de Valencia. 46100. Burjassot. Valencia. Spain. http://www.cect.org CNCTC, Česká sbírka typových kultur, Státní zdravotní ústav, Šrobarova 48, 100 42, Praha, Česká republika. http://apps.szu.cz/cnctc/ EUCAST 2013 Verze 3.0 32
Denní provádění kontroly kvality pro posouzení celkového provozu Kontrolní testy by měly být prováděny a vyhodnocovány denně, zejména s antibiotiky, která jsou v rutinní sestavě. Každý den, kdy se vyšetření provede, se prohlédnou výsledky posledních 20 konsekutivních testů. Prozkoumají se výsledky trendů a zón, které opakovaně spadají nad nebo pod přípustné rozmezí. Pokud dva nebo více z 20 testů jsou mimo přípustné rozmezí, je zapotřebí vyšetřit příčinu. EUCAST 2013 Verze 3.0 33
Monitoring provádění testů Průměr zóny (mm) 25 20 15 10 5 0 Jednotlivé výsledky mimo kontrolní limity Všechny výsledky na jedné straně limitu 0 5 10 15 20 25 30 35 40 Den Horní limit rozmezí Cíl Dolní limit rozmezí Konsekutivní výsledky mimo limity na stejné straně EUCAST 2013 Verze 3.0 34
Postup při výsledcích kontrolních kmenů mimo limit Pokud jsou hodnoty dvou nekonsekutivních průměrů inhibičních zón kontrolních kmenů z 20 testů mimo přípustné rozmezí, lze sice výsledky vyšetření citlivosti hlásit, je však třeba vyšetřit příčinu. Pokud jsou hodnoty dvou konsekutivních průměrů inhibičních zón kontrolních kmenů z 20 testů mimo přípustné rozmezí, je zapotřebí vyšetřit příčinu před hlášením výsledků vyšetření citlivosti. Vyšetření citlivosti je zapotřebí opakovat. Pokud je ve stejném dni více disků (>2) mimo rozmezí, je zapotřebí vyšetřit příčinu před hlášením výsledků vyšetření citlivosti. Vyšetření citlivosti je zapotřebí opakovat. Pokud není prokázána rezistence u kontrolního kmene pro rezistenci, pozastaví se hlášení výsledků, vyšetří se příčina a vyšetření se opakuje. EUCAST 2013 Verze 3.0 35
Uchování a subkultivace kontrolních kmenů Kmeny se uchovávají při -70 C v glycerolovém bujónu nebo na korálcích: jedna lahvička pro použití, jedna pro archiv. Alternativně lze použít lyofilizáty nebo komerční zdroje kmenů. Z lahvičky "pro použití" lze týdně kmeny vyočkovat na neselektivní půdy a kontrolovat čistotu kolonií. Čistou kulturu lze vyočkovávat a používat denně do 7 dnů. Náročné bakterie lze postupně vyočkovávat pouze po 6 dnů. Po spotřebování lahvičky pro použití se subkultivuje lahvička "pro archiv" a připraví se další lahvička pro použití. EUCAST 2013 Verze 3.0 36
Možné příčiny chyb (1) Půda Podmínky vyšetření Uchovávání ploten Nedodržení postupu při přípravě Variabilita šarží nebo změna dodavatele Suplementy (variabilita šarží, chybná navážka, prošlá expirace) ph Výška agaru/objem agaru Datum expirace Nedodržení pravidla 15-15-15 (suspenze naočkována do 15 min, disky kladeny do 15 min, inkubace do 15 min) Inkubace (teplota, prostředí a čas) Inokulum (málo/hodně koncentrované, nebo nehomogenní) Způsob odečítání Odečítání okraje zón EUCAST 2013 Verze 3.0 37
Možné příčiny chyb (2) Disky Kontr olní kmeny Nesprávný disk (chybný druh nebo obsah disku) Síla disku (nesprávné uchování, labilita, datum expirace) Nevyrovnání na pokojovou teplotu po otevření zásobníku disků Mnoho disků na plotně (interference mezi látkami) Nesprávný kontrolní kmen Mutace Kontaminace Stáří kultury EUCAST 2013 Verze 3.0 38
webová stránka EUCAST Webová stránka EUCAST uvádí pravidelné aktualizace metody vyšetření, rozmezí kontrolních kmenů ů a breakpointů. www.eucast.org Jakékoli komentáře e a návrhy lze posílat na adresu erika.matuschek@ltkronoberg.se nebo na sekretariát EUCAST (viz webová stránka). EUCAST 2013 Verze 3.0 39
X EUCAST EUROPEAN COMMITTEE ON ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBIILITY TESTING European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
EUCAST český překlad na stránkách SZÚ http://www.szu.cz/eucast-dokumenty