Vlastnosti mikroskopovaných objektů, mikroskopické preparáty



Podobné dokumenty
Základní pojmy a vztahy: Vlnová délka (λ): vzdálenost dvou nejbližších bodů vlnění kmitajících ve stejné fázi

Základy mikroskopování

Praktické cvičení č. 1.

LABORATORNÍ CVIČENÍ Z BIOLOGIE. Téma: STAVBA A FUNKCE MIKROSKOPU, PŘÍPRAVA DOČASNÝCH PREPARÁTŮ

Vitální barvení, rostlinná buňka, buněčné organely

histologie je nauka o mikroskopické skladbě organismu zkoumá skladbu těla živočišného i rostlinného, důležitá v humánní medicíně histologický preparát

Téma: Světelná mikroskopie a preparáty v mikroskopii

Základní pojmy. Je násobkem zvětšení objektivu a okuláru

Mikroskopické metody Přednáška č. 3. Základy mikroskopie. Kontrast ve světelném mikroskopu

Typy světelných mikroskopů

1 Popis vzorku. 2 Detekční limit vyšetření. 3 Časová náročnost. 4 Zpracování vzorku. 4.1 Množství vzorku. 4.2 Odběr vzorků

PRÁCE S MIKROSKOPEM Praktická příprava mikroskopického preparátu

MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ

Metody v histologii Mikroskop Vj. 4

TRVALÝ PREPARÁT. Zhotovení roztěru

Neživá příroda I. Optické vlastnosti minerálů

vede sice ke zvýšení kontrastu, zároveň se ale snižuje rozlišení a ostrost obrazu (Obr. 46).

M I K R O S K O P I E

1. Teorie mikroskopových metod

Jak pracovat s mikroskopy Olympus

Základy mikroskopie. Úkoly měření: Použité přístroje a pomůcky: Základní pojmy, teoretický úvod: Úloha č. 10

Základy světelné mikroskopie

(cv03) Metody výroby mikroskopických preparátů z rostlinných pletiv

DIGITÁLNÍ UČEBNÍ MATERIÁL

Optika. Zápisy do sešitu

(cv04) Metody výroby mikroskopických preparátů z rostlinných pletiv (2. část) Preparáty pro dokumentaci tvorby dřeva a lýka

MIKROBIOLOGIE. Grampozitivní kokovitá bakterie STAPHYLOCOCCUS AUREUS bakteriální kmen dle ATCC 1260 (CCM 888).

Optika nauka o světle

Optické metody a jejich aplikace v kompozitech s polymerní matricí

Základní pojmy Zobrazení zrcadlem, Zobrazení čočkou Lidské oko, Optické přístroje

Mikroskop ECLIPSE E200 STUDENTSKÝ NÁVOD K POUŽITÍ. určeno pro studenty ČZU v Praze

Cvičení 4: CHEMICKÉ SLOŽENÍ BUŇKY, PROKARYOTA Jméno: PROKARYOTA PŘÍPRAVA TRVALÉHO PREPARÁTU SUCHOU CESTOU ROZTĚR BAKTERIÍ

Bioimaging rostlinných buněk, CV.2

Histologické techniky

OPTIKA. Mgr. Jan Ptáčník - GJVJ - Fyzika - Sekunda

Geometrická optika. předmětu. Obrazový prostor prostor za optickou soustavou (většinou vpravo), v němž může ležet obraz

Příprava mikroskopických preparátů

Mikroskopické preparační techniky pro analýzu rostlinných stonků

Optika pro mikroskopii materiálů I

Geometrická optika. Optické přístroje a soustavy. převážně jsou založeny na vzájemné interakci světelného pole s látkou nebo s jiným fyzikálním polem

Viková, M. : MIKROSKOPIE II Mikroskopie II M. Viková

ODRAZ A LOM SVĚTLA. Mgr. Jan Ptáčník - GJVJ - Septima - Fyzika - Optika

SBÍRKA ŘEŠENÝCH FYZIKÁLNÍCH ÚLOH

příloha C zadávací dokumentace pro veřejnou zakázku malého rozsahu Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

Praktická cvičení z biologie na gymnáziu

5.3.5 Ohyb světla na překážkách

Fluorescenční mikroskopie

1 Popis vzorku. 2 Detekční limit vyšetření. 3 Časová náročnost. 4 Zpracování vzorku. 4.1 Množství vzorku. 4.2 Odběr vzorků

Jednou z nejstarších partií fyziky je nauka o světle tj. optika. Existovaly dva názory na fyzikální podstatu světla:

Protokol ke cvičení z Biologie vodních živočichů

7.ročník Optika Lom světla

Fotosyntéza a dýchání rostlin (laboratorní práce)

METALOGRAFIE I. 1. Úvod

Rostlinná buňka příprava mikroskopického preparátu (laboratorní práce)

Učební texty z fyziky 2. A OPTIKA. Obor zabývající se poznatky o a zákonitostmi světelných jevů. V posledních letech rozvoj optiky vynález a využití

Histochemie a imunohistochemie, elektronová mikroskopie

Elektronová mikroskopie SEM, TEM, AFM

Zákon odrazu. Úhel odrazu je roven úhlu dopadu, přičemž odražené paprsky zůstávají v rovině dopadu.

Technická specifikace předmětu veřejné zakázky

Praktický kurz Příprava nanočástic metodami syntézy v žížalách, charakterizace - Imunohistochemické barvení

Tvorba trvalých mikroskopických preparátů

Lupa a mikroskop příručka pro učitele

Proč elektronový mikroskop?

příjmení a jméno: den a hodina cvičení: datum:

Měření pevnosti slupky dužnatých plodin

Otázky z optiky. Fyzika 4. ročník. Základní vlastnosti, lom, odraz, index lomu

Tento materiál byl vytvořen v rámci projektu Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost.

S v ě telné jevy. Optika - nauka - o světle, jeho vlastnostech a účincích - o přístrojích, které jsou založeny na zákonech šíření světla

VLNOVÁ OPTIKA. Mgr. Jan Ptáčník - GJVJ - Fyzika - Optika - 3. ročník

Sešit pro laboratorní práci z biologie

5.1.3 Lom světla. vzduch n 1 v 1. n 2. v 2. Předpoklady: 5101, 5102

Optika OPTIKA. June 04, VY_32_INOVACE_113.notebook

Vzdělávací obsah vyučovacího předmětu

SVĚTLO A TMA ROZKLAD A MÍCHÁNÍ BAREV

5.1.3 Lom světla I. Předpoklady: 5101, Pomůcky: Miska, voda, pětikoruna, akvárium, troška mléka,

Laboratorní cvičení z obecné mikrobiologie

Fixace Uzavírací média

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Zoologická mikrotechnika - FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE

LABORATORNÍ PRÁCE Č.

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

Protokol č. 7 Pozorování živých a mrtvých buněk kvasinek Vitální test

N Laboratoř hydrobiologie a mikrobiologie

Příprava mikroskopických preparátů

PARAZITÉ Z BLÍZKA LARVY MOTOLIC (PRACOVNÍ LIST)

Mikroskopy. Světelný Konfokální Fluorescenční Elektronový

MIKROSKOPIE. Lékařská mikrobiologie cvičení, jarní semestr 2016 Mikrobiologický ústav LF MU

Světlo je elektromagnetické vlnění, které má ve vakuu vlnové délky od 390 nm do 770 nm.

F - Lom světla a optické přístroje

SVĚTLO A TMA HRANÍ SE SVĚTLEM

Protokol 04. pšeničná bílkovina. masné výrobky. zkrácená verze

Základní vyšetření zraku

Název: POZOROVÁNÍ PLASTIDŮ,VAKUOL, BUNĚČNÉ STĚNY Autor: Paed.Dr.Ludmila Pipková

O z n a č e n í m a t e r i á l u : V Y _ 3 2 _ I N O V A C E _ S T E I V _ F Y Z I K A 2 _ 1 4

Video mikroskopická jednotka VMU

VY_32_INOVACE_ / Prvoci Prvoci jednobuněční živočichové

MIKROTECHNIKY (Úvodní praktikum z botanické mikrotechniky)

3. SVĚTELNÉ JEVY. Světelné zdroje. Rychlost světla.

Název: Čočková rovnice

27. Vlnové vlastnosti světla

Transkript:

3. cvičení Vlastnosti mikroskopovaných objektů, mikroskopické preparáty Při studiu objektů za pomoci světelného mikroskopu je pozorujeme buď v odraženém nebo procházejícím světle. První možnost používáme např. u objektů víceméně neprůsvitných, u nichž nás zajímají jejich povrchové struktury (např. tělní přívěsky u hmyzu nebo charakter chlupů na listech rostlin), celkový tvar těla nebo počet objektů. Reflexní (odražené) osvětlení se také využívá při mikroskopické preparaci orgánů a tkání. Tzv. horním osvitem jsou proto vybaveny běžně stereomikroskopy. Tam, kde nás zajímají struktury ležící uvnitř tkání či buněk, potřebujeme, aby světlo prošlo studovaným orgánem či tkání, tj. aby byla daná tkáň průsvitná a průhledná. To je splněno u některých jednobuněčných organismů a jednoduchých, spíše mladých orgánů mnohobuněčných organismů (např. u mladých kořenů rostlin). U mnohobuněčných organismů je ale často podmínka průhlednosti splněna jedině tehdy, je-li studovaný orgán nařezán na velmi tenké řezy nebo je jeho tloušťka zmenšena rozmáčknutím (roztlakové preparáty) nebo rozpadem tkáně na jednotlivé buňky (macerací). Aby byl studovaný objekt v mikroskopu vidět, musí mít jiné optické vlastnosti než jeho okolí, musí být kontrastní. Lidské oko je schopné zaznamenat změnu intenzity světla (amplitudy vlny) způsobenou interakcí světla s tělesem (tělesa, která takto interagují se světlem, se nazývají amplitudová), ale není schopné zaznamenat posun fáze světla po interakci s tělesem (taková tělesa se nazývají fázová). Některé orgány či organely mají jinou hustotu (např. buněčná stěna), obsahují různá barviva (např. chloroplasty) či inkrustace. Jiné, které se svými optickými vlastnostmi při průchodu bílého světla od svého okolí neodlišují (např. arbuskuly symbiotických hub v kořenech rostlin), se buď barví speciálními barvivy nebo se pozorují speciálními mikroskopickými technikami (viz 4. a 5. cvičení). Další podmínkou, která musí být splněna, abychom mohli studovaný objekt pozorovat v mikroskopu, je jeho velikost. Ta musí být větší než mez rozlišení mikroskopu d = (1,22 * ) / (2 * NA obj ) Ve skutečnosti se na rozlišovací schopnosti mikroskopu podílí nejen objektiv, ale i kondenzor (určuje, kolik světla a pod jakým úhlem osvětluje preparát). Ve jmenovateli by tedy správně mělo být NA obj + NA kond Viditelné světlo má vlnovou délku v rozsahu přibližně 400 až 700 nm. Při použití výkonných objektivů je jejich NA (při použití imerzního media) 1 1,4. Rozlišovací schopnost mikroskopů vybavených těmito objektivy dosahuje stovek nanometrů (při použití fialového světla se přiblížíme hranici 200 nm). Představu o tom, co můžeme vidět světelným mikroskopem a na co už světelný mikroskop nestačí, nám podá Obr. 41. Obr. 41 (Kremer 2002) Opakovaně se v textu mluví o imerzním médiu a nutnosti jeho použití u objektivů, případně kondenzorů, s numerickou aperturou větší než 1. Ale proč, co to znamená? Ve druhém cvičení jsme si vysvětlili pojem

numerická apertura a víme, že závisí jednak na úhlu, pod kterým do optické soustavy může vstupovat světlo, jednak na indexu lomu prostředí, kterým světlo před vstupem do soustavy prochází (viz Obr. 26). Víme také, že prostředí se mohou svým indexem lomu lišit (zatímco vzduch má index lomu téměř roven 1, sklo má index lomu 1,5 až 1,72). Pokud je mezi preparátem a objektivem vzduch, budou se paprsky po přechodu ze skla do vzduchu lámat od kolmice (z prostředí opticky hustšího do opticky řidšího). Některé z nich se odkloní natolik, že optickou soustavu objektivu minou, jiné, které na optické rozhraní krycího skla a vzduchu dopadnou hodně šikmo (nedosáhnou mezního úhlu), se odrazí zpět do skla (Obr. 42 a). Obr. 42 (http://www.olympusmicro.com/primer/anatomy/immersion.html) Pokud mezi preparát a objektiv vložíme médium o podobných optických vlastnostech jako má sklo (Obr. 42 b), nebude docházet k lomu paprsků a ty budou procházet rozhraním krycí sklo / imerzní médium / čočka objektivu přímo. Čočka objektivu tak zachytí širší kužel světla a tudíž i více informace o detailech v preparátu. Využít možnosti homogenního přechodu světla mezi preparátem a objektivem má smysl pro silnější objektivy (60x a více), které mají malou pracovní vzdálenost a velké světelné požadavky. Pro přesná měření a mikrofotografii se doporučuje použít imerzní médium nejen mezi krycí sklo a objektiv, ale i mezi horní čočku kondenzoru a podložní sklo. Kromě nejběžnějšího imerzního oleje s indexem lomu 1.515 se pro některé objektivy používá jako imerzní médium voda (n=1.33) nebo glycerin (n=1,47). Pro speciální účely se v kombinaci se speciálními objektivy používají media s velmi vysokým indexem lomu (bromonaftalen, n=1,66, methylenjodid, n=1,74). Při pozorování v mikroskopu musíme umístit sledovaný objekt přesně do určité vzdálenosti pod čelní čočku objektivu, abychom detaily viděli ostře. Přitom vidíme víceméně ostře detaily ležící v určitém rozsahu nad a pod vlastní zaostřenou rovinou. Tato oblast víceméně ostrého obrazu se nazývá hloubka ostrosti. Body ležící nad a pod oblastí viděnou ostře mohou působit rušivě nebo, dle svého charakteru (neprůsvitnost, neprůhlednost), mohou znemožňovat ostré vidění. Příprava mikroskopických preparátů Dostatečně tenké a průhledné biologické objekty, jako jsou např. prvoci, pohlavní buňky, buňky z tkáňových kultur, jedno a dvouvrstevné epitely a pokožky, lze sledovat zaživa v tzv. nativních mikroskopických preparátech. Ačkoli tak získáváme víceméně věrný obraz o stavbě biologických objektů, je třeba si uvědomit, že podmínky při mikroskopování jsou většinou pro sledovaný organismus či jeho část značně stresující (zahřívání zdrojem světla, nedostatek kyslíku atd.) a mohou vést k výskytu různých anomálií (artefaktů) nebo až ke smrti studovaného objektu. Prostředím, ve kterém objekty sledujeme, je buď voda nebo fyziologický roztok (v průběhu mikroskopování dbáme, aby tekutina nevyschla, případně ji doplňujeme). Ke zjištění fyziologického stavu buněk nebo jejich částí se používají vitální barviva. Řada barviv je pro živé systémy jedovatá, takže sice barvíme zaživa, ale současně s barvením buňky usmrcujeme. Podle techniky přípravy můžeme preparáty rozlišovat na: totální preparáty, kdy do vhodného média uzavíráme celý drobný objekt nebo průhledné části těla

preparáty roztěrové a nátěrové, kdy se roztok se studovanými buňkami (např. senný nálev s prvoky, střevní obsah s parazity, krev, mokvající řez tělním orgánem) rozetře do tenké vrstvy na sklíčku a po fixaci (usmrcení) a případném obarvení se sleduje (většinou imerzním objektivem) roztlaky - buňky v tkáni se rozvolní tlakem přes krycí sklo do tenké vrstvy; používá se např. pro pozorování chromozómů mikroreliéfové a adhezivní preparáty pro studium povrchových struktur objektů, kdy se na povrch nanese tenká vrstva rychle schnoucího roztoku, např. bezbarvého laku, který se po zaschnutí buď sám, nebo s vrstvou svrchních buněk strhne a pozoruje pod mikroskopem Nejčastější jsou preparáty řezové (Obr. 43). Obr. 43 (http://www.nemjbc.cz) Příprava trvalých řezových preparátů je značně zdlouhavá (většinou trvá několik dní), ale umožňuje opakované prohlížení téhož preparátu i po delší době (roky až desítky let) nebo současné studium preparátů získaných během delšího časového úseku. Postup přípravy trvalého řezového preparátu: 1. Odběr tkáně by měl probíhat rychle a šetrně, aby byly buňky co nejméně poškozeny a aby byly vystaveny působení vnějších vlivů co nejkratší dobu. Proto máme po ruce vždy připraven fixační roztok, do kterého tkáň ihned přeneseme. Důležitá je také volba velikosti odebraného vzorku, protože příliš velký kus tkáně se nemusí dostatečně profixovat. U živočišných tkání se před přípravou vzorku ze silně prokrveného orgánu zbavíme krve propláchnutím vhodným fyziologickým roztokem (kanylací přívodní arterie) 2. Fixace je rychlé usmrcení buněk fixačním prostředkem, který zabraňuje autolytickým procesům v odumírající tkáni a tvorbě artefaktů (uměle vzniklé nebo pozměněné struktury buněk). Fixační médium by mělo fixovanou tkání rychle pronikat, nemělo by měnit strukturu buněk a fixovaná tkáň by měla zůstat barvitelná. Fixační prostředky mohou být fyzikální (teplem nebo vyschnutím, rychlým hlubokým zmrazením, kdy se nestihnou v buňkách vytvořit krystalky ledu) nebo chemické (organické i anorganické sloučeniny, nejčastěji ve směsích). Výběr fixační metody záleží na cílech studia (celkový preparát, cytologické nebo histochemické studie), metoda musí být vždy jasně definovaná a reprodukovatelná. Fixační médium musí být před dalším zpracováním vzorku důkladně vypráno, podle metody buď alkoholem nebo vodou.

3. Zalévá se do roztoku rychle tuhnoucího média, které zpevní tkáň a umožní její řezání. Postup zalévání závisí na použitém médiu. Při zalévání do parafinu musí být tkáň nejdříve odvodněna (provedením preparátu vzestupnou alkoholovou řadou), poté je prosycena rozpouštědlem parafínu ((benzenem), roztokem parafínu v benzenu, a nakonec vlastním parafínem. Po prosycení je objekt zalit parafínem v papírové zalévací komůrce a do ztuhnutí ponechán ve vodní lázni. Tukové tkáně a řídké tkáně, které by se v jiném médiu smrštily, se zalévají do želatiny (fixáž se vypírá vodou), pro elektronovou mikroskopii do umělých pryskyřic. 4. Řezání se většinou provádí na mikrotomech (Obr. 44), které umožňují přípravu řezů o známé tloušťce (několik mikrometrů). Především v botanice se příprava preparátu může urychlit ručním řezáním, kdy se objekt bez předchozí fixace a zalévání řeže buď přímo v ruce žiletkou (u větších pevných kusů, např. stonků), nebo se nejdříve upevní do kousku bezové duše, mrkve, bramboru či řepy a žiletkou nebo ručním mikrotomem se pak řeže spolu s okolním zpevňujícím pletivem. Obr. 44 (http://www.nemjbc.cz) Před vlastním řezáním se ztuhlý bloček ořeže tak, aby kolem studovaného objektu zůstaly 3 až 4 mm zpevňující hmoty. Pro krájení parafinových řezů se používají sáňkové nebo rotační mikrotomy, pro řezání nezalitých tkání nebo tkání zalitých v želatině se používá zmrazovací mikrotom. Pokud chceme znát vzdálenost jednotlivých řezů nebo jejich pořadí (třeba pro následnou prostorovou rekonstrukci studovaného objektu), musíme přenášet řezy na podložní sklo v pořadí, ve kterém byly uříznuty, a celou sérii necháme pak natáhnout a vyrovnat na regulovatelné plotýnce při teplotě 40 až 45 o C.. Pokud na pořadí nezáleží, přenášíme řezy do misky s teplou vodou, kde se jednotlivé řezy natáhnou a vyrovnají, a následně štětečkem na podložní sklo. Podložní skla se před nanesením řezů potírají glycerin-bílkem, aby se na ně řezy přilepily, což usnadní jejich pozdější barvení. 5. Barvením řezů se zviditelní nebo zvýrazní buněčné nebo tkáňové struktury, které by jinak byly těžko odlišitelné od okolní tkáně. Před vlastním barvením musíme z tkáně odstranit parafín (opačným postupem, než byl použit při zalévání) a sestupnou alkoholovou řadou řezy převedeme do destilované vody. Vlastní barvení se provádí ve speciálních kyvetách s drážkami na zasunutí podložních skel podle přesných návodů (Obr. 45).

Obr. 45 (http://www.nemjbc.cz) 6. Na závěr se řezy opět odvodňují vzestupnou alkoholovou řadou, zakápnou se kanadským balzámem a přikryjí krycím sklem. Pro střednědobé uchování (několik měsíců) je některé objekty možno po obarvení zakápnout na krycím skle odbarvovacím roztokem a po přiložení krycího skla omezit odpařování roztoku (a vznik bublin) přetřením okrajů kanadským balzámem nebo levnějším bezbarvým lakem na nehty (používá se např. u roztlakových preparátů kořenů barvených pro studium arbuskulární mykorrhizy). Úloha č. 4: arbuskulárně mykorhizní houby v kořenech jitrocele kopinatého (Plantago lanceolata L.) roztlakový preparát, 2 metody barvení (inkoustem a chlorazolem black E) Úloha č. 5: rozsivky, pozorování s imerzí Použití imerzního média 1. zaostříme objekt nejsilnějším neimerzním objektivem 2. revolverový nosič objektivů pootočíme do polohy mezi tento a imerzní objektiv 3. na vyhledané místo v preparátu kápneme imerzní médium 4. pootočíme revolverovým nosičem na imerzní objektiv, takže se jeho čelní čočka ponoří do média (při této proceduře nesjíždíme stolkem, přišli bychom o přibližné zaostření objektu!) 5. pokud v okuláru vidíme hledaný objekt, lehce doostříme mikrošroubem; pokud nevidíme hledaný objekt, opatrně přiblížíme při pohledu zboku stolek s preparátem co nejblíže k čočce objektivu a při pohledu do okulárů stolek oddalujeme, až nalezneme hledaný objekt. Doostříme mikrošroubem. Pokud opakovaně nenalezneme hledaný objekt, opakujeme celý postup od 1. (Pozor, aby se do oleje nenamočily neimerzní objektivy!) 6. po ukončení práce s imerzním objektivem očistíme jeho čelní čočku gázou namočenou v benzínu, čistící směsi (7 dílů éteru : 3 díly alkoholu) nebo xylenu. Pokud jsme mikroskopovali trvalý preparát, očistíme také krycí sklo. Nikdy nenecháme na stolku preparát s objektivem namočeným v imerzním oleji (olej vyschne, zatvrdne a může zcela znehodnotit imerzní objektiv)! 7. Pro práci s imerzním olejem používáme pouze objektivy k tomu určené!