Fotosyntéza. Ondřej Prášil

Podobné dokumenty
Fotosyntéza. Ondřej Prášil

4 Přenos energie ve FS

Fotosyntéza Světelné reakce. Ondřej Prášil Mikrobiologický ústav AVČR Laboratoř fotosyntézy v Třeboni

aneb Fluorescence chlorofylu jako indikátor stresu

Luminiscence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) fluorescence, fosforescence. chemicky (chemiluminiscence)

sekundy Femtosekundová spektroskopie, aneb

Fluorescenční rezonanční přenos energie

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Fotosyntéza Ekofyziologie. Ondřej Prášil Mikrobiologický ústav AVČR Laboratoř fotosyntézy v Třeboni

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Fotosyntéza světelná fáze. VY_32_INOVACE_Ch0214.

Fyziologie rostlin. 9. Fotosyntéza část 1. Primární fáze fotosyntézy. Alena Dostálová, Ph.D. Pedagogická fakulta ZČU, letní semestr 2013/2014

7 Fluorescence chlorofylu in vivo

Světlosběrné systémy fotosyntetických organismů Tomáš Polívka

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

Fluorescence chlorofylu

Měření množství dopadající energie světla. Fotoinhibice, fotopoškození a fotoprotekční mechanismy

12-Fotosyntéza FRVŠ 1647/2012

Vyjádření fotosyntézy základními rovnicemi

Přednáška IX: Elektronová spektroskopie II.

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

12. Zhášení fluorescence

1- Úvod do fotosyntézy

Barevné principy absorpce a fluorescence

Fotofyzikální děje během fotosyntetické přeměny zářivé energie na biochemicky využitelnou formu

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

FLUORIMETRICKÉ STANOVENÍ FLUORESCEINU

Metody spektrální. Metody molekulové spektroskopie. UV-vis oblast. Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti

KOMPLEXY EUROPIA(III) LUMINISCENČNÍ VLASTNOSTI A VYUŽITÍ V ANALYTICKÉ CHEMII. Pavla Pekárková

7. Měření fluorescence při excitaci kontinuálním světlem ( steady-state )

Spektroskopické metody. převážně ve viditelné, ultrafialové a blízké infračervené oblasti

Měření množství dopadající energie světla. Fotoinhibice, fotopoškození a fotoprotekční mechanismy. (osvětlenost ln.m -2 = lux) Ozářenost W.

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

EKOTECH Fluorescence chlorofylu in vivo 1

FOTOBIOLOGICKÉ POCHODY

SPEKTRÁLNÍ METODY. Ing. David MILDE, Ph.D. Katedra analytické chemie Tel.: ; (c) David MILDE,

Försterův rezonanční přenos energie (FRET)

- Rayleighův rozptyl turbidimetrie, nefelometrie - Ramanův rozptyl. - fluorescence - fosforescence

Barevné principy absorpce a fluorescence

Světlosběrné komplexy rostlin. Fotoinhibice, fotopoškození a fotoprotekční mechanismy. (+ světlosběrné komplexy) Rodina Lhc (light harvesting complex)

Optické spektroskopie 1 LS 2014/15

Fluorescence (luminiscence)

Barevné hry se světlem - co nám mohou říci o biomolekulách?

Energetický metabolismus rostlin. respirace

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Fotosyntéza

Anizotropie fluorescence

FOTOSYNTÉZA. Mgr. Alena Výborná Gymnázium, SOŠ a VOŠ Ledeč nad Sázavou VY_32_INOVACE_01_1_07_BI1

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

14. Fyziologie rostlin - fotosyntéza, respirace

Spektrometrické metody. Luminiscenční spektroskopie

INSTRUMENTÁLNÍ METODY

FOTOSYNTÉZA. Princip, jednotlivé fáze

Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví. René Kizek

Každá molekula kyslíku kterou právě dýcháme vznikla někdy v nějaké rostlině. Každý atom uhlíku našeho těla byl kdysi včleněn fotosyntézou do nějaké

DIPLOMOVÁ PRÁCE. Petr Pospí²il. Samoorganizace a p enos excita ní energie v bakteriochlorofylových agregátech

ABSORPČNÍ A EMISNÍ SPEKTRÁLNÍ METODY

KBF/FOSY Fotosyntéza a stres LRR/FOSY Fotosyntéza

Mezimolekulové interakce

Gymnázium, Brno, Slovanské nám. 7 WORKBOOK. Mathematics. Teacher: Student:

Světelné reakce fotosyntézy. - fixace energie záření

Diskutujte, jak široký bude pás spojený s fosforescencí versus fluorescencí. Udělejte odhad v cm -1.

FYZIKA VE FYZIOLOGII ROSTLIN

OPVK CZ.1.07/2.2.00/

FRET FRET. FRET: schéma. Základní vztahy. Základní vztahy. Fluorescence Resonance Energy Transfer

Interakce fluoroforu se solventem

6. Metody molekulové spektroskopie spektrofotometrie, luminiscenční metody

ATOM VODÍKU MODEL : STOJÍCÍ BODOVÉ JÁDRO A ELEKTRON VZÁJEMNĚ ELEKTROSTATICKY INTERAGUJÍCÍ SCHRÖDINGEROVA ROVNICE PRO PŘÍPAD POTENCIÁLNÍ ENERGIE.

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

VLIV SPEKTRÁLNÍHO SLOŽENÍ FOTOSYNTETICKY AKTIVNÍ RADIACE NA INDUKCI FOTOSYNTÉZY TERMOOPTICKÝ JEV

ení k tvorbě energeticky bohatých organických sloučenin

ABSORPČNÍ A LUMINISCENČNÍ SPEKTROMETRIE V UV/VIS OBLASTI SPEKTRA

Fotosyntéza (2/34) = fotosyntetická asimilace

2. Fotosensitizované reakce a jejich mechanismus. 5. Samoorganizované porfyrinové nanostruktury a jednoduché aplikace

Molekuly 2. Víceatomové molekuly s jedním centrálním atomem. Hybridizace. Hybridizace sp 3. Hybridizace

Vlastní fluorescence proteinů

FYZIOLOGIE ROSTLIN VÝŽIVA ROSTLIN 1) AUTOTROFNÍ VÝŽIVA ROSTLIN 2) HETEROTROFNÍ VÝŽIVA ROSTLIN

Teorie Molekulových Orbitalů (MO)

Fluorescenční mikroskopie. -fluorescenční mikroskopie -konfokální mikroskopie

Základní parametry 1 H NMR spekter

TKGA3. Pera a klíny. Projekt "Podpora výuky v cizích jazycích na SPŠT"

Úvod do spektrálních metod pro analýzu léčiv

FOTOSYNTÉZA I. Přednáška Fyziologie rostlin MB130P74. Katedra experimentální biologie rostlin, Z. Lhotáková

Univerzita Karlova v Praze Matematicko-fyzikální fakulta DIPLOMOVÁ PRÁCE. Zuzana Vokáčová TEORETICKÝ POPIS FOTOSYNTETICKÉHO REAKČNÍHO CENTRA

ABSORPČNÍ A LUMINISCENČNÍ SPEKTROMETRIE V UV/Vis OBLASTI SPEKTRA

Uživatelská příručka. Xperia P TV Dock DK21

Víceatomové molekuly s jedním centrálním atomem

Spektra 1 H NMR. Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský

Základy Mössbauerovy spektroskopie. Libor Machala

Fyzika IV Dynamika jader v molekulách

Přednášky z lékařské biofyziky Biofyzikální ústav Lékařské fakulty Masarykovy univerzity, Brno

1. Principy fluorescenční spektroskopie

Úvod do laserové techniky KFE FJFI ČVUT Praha Michal Němec, Plynové lasery. Plynové lasery většinou pracují v kontinuálním režimu.

Měření fluorescence chlorofylu hedery helix

Fotosyntézu lze schematicky vyjádřit: hv CO H 2 O (CH 2 O)+ O 2 + H 2 O. Rozčlenění pochodů v chloroplastu na membránové a enzymové:

Born-Oppenheimerova aproximace

Fotosyntézu lze schematicky vyjádřit: hv CO2 + 2 H2O (CH2O)+ O2 + H2O. Rozčlenění pochodů v chloroplastu na membránové a enzymové:

Jiří Oswald. Fyzikální ústav AV ČR v.v.i.

LEKCE 1b. Základní parametry 1 H NMR spekter. Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

Emise vyvolaná působením fotonů nebo částic

Zobrazování účinků herbicidu na fotosyntézu mapováním chlorofylové fluorescence listů vyšších rostlin.

Transkript:

Fotosyntéza 5 Ondřej Prášil prasil@alga.cz 384-340430

Karotenoidy - polyisopreny Pomocné pigmenty, strukturní funkce a disipace energie Tetraterpeny (40 C) vytvořené z 8 isoprenových jednotek, délka 30 A Systém konjugovaných dvojných vazeb, symetrie, terminální alicyklické kruhy Syntéza v chloroplastu Car / chl 0,5 Xantofyly + atomy kyslíku

ISOPREN

3 5 7 9 11

Karotenoidy v anténách zelených rostlin L a N mají strukturní úlohu a regulují fluiditu membrán

nejběžnější xanthofyl dinofyta - obrněnky rozsivky

Pigmenty taxonomické markery fytoplanktonu

The role of carotenoids is not only to transfer energy, but also to protect the cell against damage by O 2 at high light intensities. If the antenna is flooded with light too rapidly for the reaction centers to be reoxidized, then the antenna chlorophylls discharge most of the extra energy as fluorescence and heat. However, the excited molecules also have an opportunity to evolve into an excited triplet state, inwhichthe spins of the two unpaired electrons are parallel (Fig. a). These excited triplet states are relatively long-lived. They cannot decay to the ground state (singlet) unless the electronic spin changes again, and this does not happened readily. reaction with O 2 The phosphorescence is too slow compared to a reaction between the triplet 3 Chl* and O 2

One way that they do decay is by reacting with O 2 molecules which has a triplet ground state. The reaction returns the chlorophyll to its ground state and promotes the O 2 to an excited singlet state (Fig. b) This change can have lethal consequences for the cell because singlet O 2 is extremely toxic. It reacts irreversibly with a variety of groups in proteins, nucleic acids and lipids. Carotenoids (Car) prevent these destructive side reactions by quenching the excited triplet chlorophyll before it has a chance to react with O 2 (Fig. c). In this process, the chlorophyll returns immediately to its ground state, and the carotenoid is elevated to an excited triplet state. The carotenoid triplet state cannot generate singlet O 2 because it lies below the singlet O 2 in energy. Instead, it decays harmlessly to the ground state. Carotenoids also can quench singlet O 2 itself.

Singletní kyslík velmi reaktivní (peroxidace..)

Fotoprotektivní role nefotochemické zhášení zabránění vzniku 3 Chl xantofylový cyklus violaxanthin antheraxanthin zeaxanthin diadinoxanthin - diatoxanthin (dinoxanthin)

Tvorba 1 O 2 v rostlinách a obranné mechanismy karotenoidy: a) NPQ (omezení 1 chl*) b )zhášení 3 chl* c) zhášení 1 O 2

Světlosběrná anténa vyšších rostlin LHC 3 Chl* NPQ

Antény Pigmentová anténa mechanismus pro akumulaci kvant ve slabém světle. Zvýší efektivní absorbční průřez RC více než 100 x. Kombinací různých pigmentů se využije světlo různých vlnových délek. Mechanismus ekologické adaptace na prostředí.

Historie Robert Emerson a William Arnold, 1932 Chlorella 1 O 2 ~ 2500 chl Gaffron a Wohl 1936: fotosyntetická jednotka možná alternativní vysvětlení: pomalý fotoenzym pohyblivý fotoenzym

Proč antény?? maximální intenzita PAR ~1800 mol kvant.m -2.s -1 I = 1,1 x 10 21 fotonů.m -2.s -1 = 1100 fotonů.nm -2.s -1 fyzický průřez chl ~ 2 nm 2 = 25 mm -1 cm -1 = 2303 /N A = 9,6x10-17 cm 2 optický průřez ~ 0,01 nm 2 absorbce ~ 10 fotonů/chl.sec

Univerzální architektura antén: pigment - proteinové komplexy Vnitřní- u reakčního centra, pevné, neměnné, někdy přímo spojené s reakčním centrem Vnější- plastické, přizpůsobení prostředí Vnější periferní - vněmembránové zelené sirné bakterie,sinice, ruduchy, skrytěnky integrální - vnitromembránové hydrofobní alfa šroubovice purpurové fotosyntetické bakterie, řasy (kromě ruduch a skrytěnek), vyšší rostliny.

Principy přenosu energie v anténách: trychtýř

purpurové bakterie Možné modely organizace fotosyntetických jednotek

Jak lze potvrdit vzájemné propojení antén? 1/ f = 1/ o f -px

Fluorescenční excitační spektra přímý důkaz přenosu energie energie je absorbována pigmentem A a přenesena na pigment B, který část vyzáří jako fluorescenci srovnání absorbčního spektra páru AB a excitačního spektra fluorescence z B > účinnost přenosu z A na B.

Příklad - zelená bakterie Chloroflexus aurantiacus Bchl c ~ 70% Bchl a Bchl a ~ 100%

Mechanismy přenosu excitační energie Zářivý přenos excitační energie: D * D + h h + A A * Účinnost přenosu energie závisí na: Kvantovém výtěžku emise donoru Počtu molekul akceptoru ve hodné orientaci Extinkčním koeficientu akceptoru Překryvu emisního spektra donoru a absorpčního spektra akceptoru J I D E A d

Försterův rezonanční přenos excitační energie Popisuje nezářivý přenos energie mezi chlorofyly. Thomas Förster 1948 Nepřenáší se elektrony, jen energie Analogie ladičky Molekuly jako dipóly (, 0 ) Dipól dipólová Coulombovská interakce Interakce dvou dipólů: D a A Energie interakce mezi dipóly E D A 3 R DA Rychlost přenosu energie K ET ~ E 2 = K ET ~ 10 12 10 14 s -1 Účinnost přenosu energie závisí na: Dipólových momentech 2 Vzdálenosti mezi pigmenty 6 Je vždy po spádu energií downhill Přenos energie i na delší vzdálenosti 2 2 D A 6 R DA

Dexterův koherentní přenos excitační energie exciton coupling Popisuje přenos excitonu na krátké vzdálenosti (<10 Å) mezi chlorofyly a karotenoidy K ET = K J e (-2R/L) K je úměrné překryvu molekulárních orbitalů J je spektrální překryv emisních a absorbčních pásů R je vzdálenost mezi D-A L je atomový nebo molekulární poloměr Účinnost přenosu energie tímto mechanismem: Nezávisí na dipólových vlastnostech interagujících molekul Počtu molekul akceptoru ve hodné orientaci Nemusí být z vyšší na nižší energetickou hladinu

Přenos excitace z antény do reakčního centra RC pasti s různou hloubkou 1. hluboká past (purpurové baktérie) 2. mělká past vícenásobné zachycení (Fotosystém I) 3. extrémně mělká past (Fotosystém II) Doba života excitace v anténách připojených k RC je ~ stovky ps izolované antény ~ ns mezipigmentový přenos ~ subps

Limitace velikosti antén s velikostí antén se prodlužuje doba přenosu excitace A. energy-transfer limited t ET =N ln(nt ss ) t ss ~ 100 fs t ET ~ 50-100 ps pro N 200-300 t exc ~ 1-3 ns max účinnost 90% B. trap-limited rychlý přenos, ale náhodný (RC má stejnou energii) k cs = k int /N Φ CS = k cs /(k rad + k nr + k cs ) k cs musí být >2ns -1