Teoretický úvod: GRAVITROPISMUS. Praktikum fyziologie rostlin

Podobné dokumenty
Teoretický úvod: FOTOTROPISMUS. Praktikum fyziologie rostlin

Hormonální regulace vývoje rostlin

Hormonální regulace vývoje rostlin

Úloha 5 k zápočtu z přednášky B130P16 (praktické základy vědecké práce)

Téma: FYTOHORMONY. Santner et al Praktikum fyziologie rostlin

Auxin - nejdéle a nejlépe známý fytohormon

Téma: FYTOHORMONY. Santner et al Praktikum fyziologie rostlin

Téma KULTIVACE IN VITRO. Praktikum fyziologie rostlin

TESTOVÁNÍ GMO Praktikum fyziologie rostlin

Bakalářské práce. Magisterské práce. PhD práce

VAKUOLY - voda v rostlinné buňce

BUNĚČNÁ STĚNA - struktura a role v rostlinné buňce

Růst a vývoj rostlin - praktikum MB130C78

Mnohobuněčné kvasinky

Zbytky zákaznického materiálu

Teoretický úvod: VODNÍ REŽIM ROSTLINY. Praktikum fyziologie rostlin

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 2. PLASMATICKÁ MEMBRÁNA

Bu?ka - maturitní otázka z biologie (6)

Vitální barvení, rostlinná buňka, buněčné organely

Cvičení ke kurzu Obecná ekotoxikologie. Úloha A - Stanovení ekotoxicity v testu klíčení rostlin

Zamení fasády stavebního objektu

Kompetice rostlin. Typy kompetice (obr. 1)

FYZIOLOGIE ROSTLIN Laboratorní práce č. 7

Název: POZOROVÁNÍ PLASTIDŮ,VAKUOL, BUNĚČNÉ STĚNY Autor: Paed.Dr.Ludmila Pipková

Bakalářské práce. Magisterské práce. PhD práce

IMPORT DAT Z TABULEK MICROSOFT EXCEL

PÍRUKA A NÁVODY PRO ÚELY: - RUTINNÍ PRÁCE S DATY

Růst a vývoj rostlin - praktikum

ROSTLINNÁ BUŇKA A JEJÍ ČÁSTI

Růst a vývoj rostlin - praktikum MB130C78

Zlepšení podmínek pro výuku na gymnáziu. III/2 - Inovace a zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT. Anotace

Protokol 04. pšeničná bílkovina. masné výrobky. zkrácená verze

Klí k urování deficiencí kukuice seté (Zea mays) autoi: E. Tylová, L. Moravcová

Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk

Na em se podílí? Umožuje napíklad pohyb, mnit výrazy oblieje, zadržovat stolici, psát i vykonávat rzné druhy manuální práce.

Respirace. (buněčné dýchání) O 2. Fotosyntéza Dýchání. Energie záření teplo BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3

IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek

Dusík. - nejdůležitější minerální živina (2-5% SH)

Bakalářské práce. Magisterské práce. PhD práce

Úvodník. Globalizace: výzva a ešení

analýza dat a interpretace výsledků

Růst a vývoj rostlin - praktikum MB130C78

1 Popis vzorku. 2 Detekční limit vyšetření. 3 Časová náročnost. 4 Zpracování vzorku. 4.1 Množství vzorku. 4.2 Odběr vzorků

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Sítání dopravy na silnici II/432 ul. Hulínská Osvoboditel v Kromíži

ORGANICKÁ CHEMIE Laboratorní práce č. 3

1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru

Dodatek dokumentace KEO-Moderní kancelá verze 7.40

Pedání smny. Popis systémového protokolování. Autor: Ing. Jaroslav Halva V Plzni Strana 1/6

Určení koncentrace proteinu fluorescenční metodou v mikrotitračních destičkách

Růst a vývoj rostlin - praktikum MB130C78

BUNĚČNÁ MOTILITA A MOLEKULÁRNÍ MOTORY

AUTOTROFNÍ A HETEROTROFNÍ VÝŽIVA ROSTLIN, VODNÍ REŽIM ROSTLIN, RŮST A POHYB ROSTLIN

Souprava na extrakci nukleových kyselin. Uživatelská příručka

Název: Vitamíny. Autor: Mgr. Jiří Vozka, Ph.D. Název školy: Gymnázium Jana Nerudy, škola hl. města Prahy

10. Minerální výživa rostlin na extrémních půdách

Příběh pátý: Auxinová signalisace

Cytologie cvičení č. 6

Auxin univerzální vývojový signál v životě rostlin

Buňka cytologie. Buňka. Autor: Katka Téma: buňka stavba Ročník: 1.

Růst a vývoj rostlin - praktikum

VZTAH GENOTYPU A FENOTYPU

Biologie I. Buňka II. Campbell, Reece: Biology 6 th edition Pearson Education, Inc, publishing as Benjamin Cummings

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Bioscience Imaging Centre

MOOVODY Moovody se oznaují trubice, které vybíhají z moové pánviky ledvin a odvádí vzniklou mo do moového mchýe.

Western blotting. 10% APS 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl

BAREVNÁ VENKOVNÍ KAMEROVÁ JEDNOTKA DRC-4CP NÁVOD K INSTALACI A POUŽITÍ DOMÁCÍ VIDEOVRÁTNÝ

TUBULIN-FOLDING COFACTOR A (TFC A) u Arabidopsis

Síra. Deficience síry: řepka. - 0,2-0,5% SH, nedostatek při poklesu obsahu síranů pod 0,01% SH

Transformace ptdna tabáku genem E7/GUS a eliminace selekčního genu za využití homologní rekombinace

P ehled nep ítomnosti

Efektivní uení. Žádná zpráva dobrá zpráva. (Structured training) Schopnost pracovat nezávisí od IQ. Marc Gold

Karyotyplov. lovka. Karyotyp soubor chromozom v jáde buky. Význam v genetickém poradenství ke stanovení zmn ve struktue a potu chromozom

1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I

2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

Fluorescenční mikroskopie. -fluorescenční mikroskopie -konfokální mikroskopie

2) Připravte si 7 sad po pěti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

ÚLOHA C Klonování PCR produktu do plasmidu

5. Příjem, asimilace a fyziologické dopady anorganického dusíku. 5. Příjem, asimilace a fyziologické dopady anorganického dusíku

2.1 Pokyny k otev eným úlohám. 2.2 Pokyny k uzav eným úlohám. Testový sešit neotvírejte, po kejte na pokyn!

VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ

3) Role světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin

Struktura a skladba potravin Magisterský studijní program. Přednáška 4.

SDS polyakrylamidová gelová elektroforéza (SDS PAGE)

A. TBOS SYSTEM. 1. Popis systému TBOS. 3. Vlastnosti: TBOS verze UNIK verze UNIK. (stará verze) (stará verze) cívka 9V. 2. Doplky.

Tkáňové kultury rostlin. Mikropropagace

Program: Institucionální program pro veřejné vysoké školy pro rok 2016 Poskytovatel: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

7) Dormance a klíčení semen

Správa obsahu ízené dokumentace v aplikaci SPM Vema

Video signal copy decoder Obj..:

Binokulární mikroskop BX-3 40 /1 000 Kat. íslo

ICS Identifikaní systémy a.s.!"#$%&

Regulace růstu a vývoje

Zemědělská botanika. Vít Joza

téma: Úvodní praktikum autor: Mgr. Michal Novák cíl praktika: Seznámit žáky s náplní praktika doba trvání: 2 místo: odborná učebna biologie

Růst a vývoj rostlin - praktikum

Regulace metabolických drah na úrovni buňky

Transkript:

Teoretický úvod: GRAVITROPISMUS Praktikum fyziologie rostlin 1

Teoretický úvod: GRAVITROPISMUS Gravitropismus koenové špiky náleží mezi vitální ohybové pohyby rostlin. adí se mezi pohyby paratonické povahy, tj. je vyvolán vnjším podráždním. Tak jako další tropismy (nap. fototropismus i thigmotropismus) je i gravitropismu orientován vi stimulu, v tomto pípad zemské tíži. Pozitivní gravitropismus koene zprostedkovaný ohybem koenové špiky ve smru gravitaního vektoru byl pozorován již v experimentech Charlese Darwina a jeho syna Francise (1881). Tato schopnost je u rostlin dležitá pro jejich ukotvení v pd, primárn souvisí se zprostedkováním dostupnosti živin, které koeny pijímají z pdy. V celém procesu ohybu koenové špiky hrají dležitou roli statocyty, buky v centrální ásti koenové epiky obsahující statolity v podob plastid asto obsahujících pesýpavý škrob (Obr. 1). Jedním z objevitel tohoto pesýpavého škrobu byl na konci 19. století Prof. Bohumil Nmec, zakladatel ústavu, na nmž práv probíhají tato praktika. Obr. 1: Tídenní semenáek Arabidopsis thaliana rostoucí ve tm umístný na 24 h horizontáln ohýbá koenovou špiku smrem dol (a). Zvtšená ást koenové špiky (b, c) s koenovou epikou. Fialov jsou Lugolovým roztokem (trijodid draselný) oznaeny buky obsahující plastidy (amyloplasty) obsahující pesýpavý škrob, tyv. statocyty. Schematické zobrazení statocytu (d) s bunným jádrem (N), vakuolou (V), statolitovým amyloplastem (A) a endoplazmatickým retikulem (ER). Pevzato z Morita (2010). Mechanismus, kterým dochází k pedání informace od plastid se škrobem (amyloplast) pesouvajících se v koenové špice ve smru gravitaního vektoru, stále není pesn poznán. Zapojeny jsou v nm složky aktinového cytoskeletu a následná signální kaskáda vyvolávající pesun auxinového penašee PIN3 v bukách kolumely koenové epiky z pvodn spodní plazmatické membrány na pvodn laterální plazmatickou membránu. Tento pesun zpsobí, že 2

auxin je dopraven do povrchových pletiv na spodní stran koene a tato strana se pak prodlužuje mén než horní strana. Následkem je ohyb koene smrem dol (Obr. 2). Obr. 2: Pesun auxinu bhem gravistimulace koenové špiky semenáku Arabidopsis thaliana. Auxinový penaše PIN3 pvodn distribuuje auxin (zelená barva) picházející do koenové špiky seshora rovnomrn do obou laterálních smr. Amyloplasty se škrobem jsou též orientovány na spodní stran statocyt. Po položení koene horizontáln se pesunou jak amyloplasty, tak PIN3 na spodní stranu a auxin (zelená barva) je pumpován smrem dol (A). Po ase se koen ohýbá smrem dol. Koncentrace auxinu lze nepímo sledovat pomocí zeleného fluorescenního proteinu (GFP) pipojeného za promotorem, který je citlivý na auxin (DR5::GFP). Fluorescence GFP se po gravistimulaci jasn pesouvá na spodní stranu koene, což naznauje pesun auxinu (B). Pevzato z Michniewicz a kol. (2007). Literatura: Darwin, C. and Darwin, F. (1881). The power of movement in plants. New York: D. Appleton and Company, 1, 3, and 5 Bond Street. Michniewicz, M., Brewer, P.B., Friml, J. (2007). Polar Auxin Transport and Asymmetric Auxin Distribution Source: The Arabidopsis Book, Number 5. Published By: The American Society of Plant Biologists URL: http://www.bioone.org/doi/full/10.1199/tab.0108 Morita, M.T. (2010). Directional Gravity Sensing in Gravitropism. In Annual Review of Plant Biology 61, S. Merchant, W.R. Briggs, and D. Ort, eds, pp. 705-720. Rashotte, A.M., DeLong, A., and Muday, G.K. (2001). Genetic and chemical reductions in protein phosphatase activity alter auxin transport, gravity response, and lateral root growth. Plant Cell 13, 1683-1697. Ulmasov, T., Murfett, J., Hagen, G., and Guilfoyle, T.J. (1997). Aux/IAA proteins repress expression of reporter genes containing natural and highly active synthetic auxin response elements. Plant Cell 9, 1963-1971. 3

Zadání praktických úloh k tématu: GRAVITROPISMUS Pehled úloh k vypracování: Úkol 1: Role auxinu v gravitropickém ohybu koene rostlin 1a) Prokažte pesun auxinu na spodní ást koene semenáku Arabidopsis thaliana, který je vystaven psobení gravitaní síly kolmo na pvodní smr rstu. 1b) Prokažte dležitost smrovaného toku auxinu v tomto procesu pomocí inhibitoru transportu auxinu z bunk, kyseliny 1-N-naftylftalamové (NPA) 4

Úkol 1: Role auxinu v gravitropickém ohybu koene rostlin Cíl: Demonstrovat význam fytohormonu auxinu v regulaci rstu a vývoje rostliny. Hypotéza, kterou bhem práce ovíme: Smrovaný tok auxinu je nezbytný pro gravitropickou odpov rostliny. Nezbytnost lze prokázat s použitím specifického inhibitoru transportu auxinu, pohyb auxinu lze vizualizovat pomocí reportérových gen. Dílí úlohy: 1a) Prokažte pesun auxinu na spodní ást koene semenáku Arabidopsis thaliana, který je vystaven psobení gravitaní síly kolmo na pvodní smr rstu. 1b) Prokažte dležitost smrovaného toku auxinu v tomto procesu pomocí inhibitoru transportu auxinu z bunk, kyseliny 1-N-naftylftalamové (NPA). Rozhodnte, které ze dvou pedložených variant jsou kontrolní rostliny (DR5::GFP i DR5::GUS) a které jsou rostliny ovlivnné NPA. Princip: Dosáhnte obou cíl pomocí mikroskopického sledování lokalizace genové exprese ízené auxinem v bukách koenové epiky mladých rostlin Arabidopsis thaliana. Rostliny jsou pro úely tohoto experimentu transformovány fúzními genovými konstrukty obsahujícími syntetický promotor (tzv. DR5) citlivý na hormon auxin (Ulmasov a kol., 1997). Tento promotor je bu translan spojen s genem kódujícím zelený fluorescenní protein (GFP) (Obr. 2B) anebo s genem kódujícím enzym ß-glukuronidázu (GUS) (Obr 3). Pouze tam, kde je dostatek auxinu se spustí exprese bu GFP a nebo enzymu GUS. Lokalizace GFP se dá pozorovat pímo fluorescenním mikroskopem. Aktivita GUS naproti tomu zpsobí vytvoení modré sraženiny, pokud se pidá k rostlinám chromogenní substrát X-gluc (5-bromo-4-chloro-3-indolyl ß-Dglucuronide). V rostlinách se normáln proteiny GFP a GUS nevyskytují a proto se oba úspšn využívají (v translaních fúzích) pro sledování lokalizací aktivit promotor i pímo lokalizací protein. Inhibitor NPA (kyselina 1-N-naftylftalamová) je znám pro svou schopnost blokovat aktivitu penaše auxinu z bunk, které jsou zodpovdné za pesun auxinu po gravistimulaci. Dle lokalizace GFP i GUS se pokuste urit, které rostliny pedložené do experimentu jsou ovlivnné NPA a které jsou kontrolní. 5

!" #$" %! "& '() *' %" " & " ( % +,-./0#1)( 2 ()%"#/(( "345567# Laboratorní postup: Poteby pro úlohy 1a: Semenáky Arabidopsis thaliana DR5::GUS a DR5::GFP pstované in vitro na kontrolním pevném médiu a na médiu s 10 µm NPA (kyselinou 1-Nnaftylftalamovou). Složení kultivaního média: 1% sacharóza, 1% agar, 2,15g/l MS salts Sigma M5524, ph 5.7. Oznaení obou variant je 1 a 2, varianta s NPA mže být 1 i 2. 1 M Fosfátový pufr, ph=7.2: 100 ml pufru s ph 7.2 vznikne smícháním 28 ml 1M KH 2 PO 4 a 72 ml K 2 HPO 4. Barvící roztok obsahující 5-bromo-4-chloro-3-indolyl ß-D-glucuronide (X-Gluc). Složení: 0,1 M fosfátový pufr, 0,5 mm Hexakyanoželezitan draselný (ervená krevní sl) K 3 [Fe(CN) 6 ], 0,5 mm Hexakyanoželeznatan draselný (žlutá krevní sl) K 4 [Fe(CN) 6 ], X-Gluc 1 mg/ml, 0,1% Tween 20. 70% ethanol. Provedení úloh: 1) Pinzetou odeberte 4 semenáky Arabidopsis thaliana DR5::GUS a peneste je do cca 1 ml fosfátového pufru (ph 7,2) v pipravených komrkách. Komrky pedem oznate íslem varianty a napipetujte pufr, aby rostlinky bhem manipulace nevyschly. Rostlinám již byla 3-4 h ped zaátkem praktik zmnna poloha v gravitaním poli (misky byly ve vertikální poloze otoeny o 135 ). Pvodní gravitaní vektor je oznaen na miskách (provedl vedoucí praktika). Pozn: lze udlit i klasický stimul 90 (jako na obr. 1a a 2A), ale stimulace by nebyla tak rychlá jako pi výraznjším otoení o 135. 6

2) Rostliny dvakrát krátce propláchnte 1ml fosfátového pufru (odsajte stávající roztok pipetou a napipetujte nový). 3) Odsajte fosfátový pufr a pipetujte 0,5ml barvícího roztoku do každé komrky. Ponechte 30 minut barvit pi 37 C (lze provést ve vodní lázni nebo v sušárn). Barvící roztok pipravte do falkonky smícháním (sms protepejte na vortexu): 2ml fosfátového pufru 28µl zás. roztoku ervené krevní soli 28µl zás. roztoku žluté krevní soli 20µl zás. roztoku X-gluc 4) Bhem této doby peneste rostliny 4 semenáky DR5::GFP na mikroskopické sklíko do kapky vody a pomocí fluorescenního mikroskopu a pipojené kamery nasnímejte fluorescenci v koenové špice. Nezapomete na sklíkách oznait varianty, ze kterých jste rostliny odebírali. 5) Po 30 minutách barvení rostlin DR5::GUS zkontrolujte pítomnost modrého zabarvení na invertovaném mikroskopu a v pípad, že je již dostaten vidt, jej nasnímejte. 6) Urete u kolika rostlin DR5::GFP a DR5::GUS je patrný pesun modrého zabarvení a rozhodnte, která varianta byla ovlivnna NPA. Vyhodnocení experimentu: V protokolu popište experiment svými slovy, doplte obrazovou dokumentaci. Vysvtlete, jakým zpsobem se projevila aplikace NPA na experimentální rostliny. Zkuste odpovdt na následující otázky: Dokážete vysvtlit princip vizualizace s pomocí GFP a GUS?? Byla by zmna distribuce auxinu v koenech patrná, pokud bychom provedli pozorování až následující den po zmn polohy v gravitaním poli? 7