Transkripční faktor CCAAT/enhancer binding protein alpha (CEBPA) a prognostický význam mutací v jeho genu u akutní myeloidní leukemie Ota Fuchs, Arnošt t Kostečka, Monika Holická,, Martin Vostrý, ÚHKT Praha
Transkripční faktor C/EBPα transaktivační oblasti oblast pro vazbu k DNA oblast leucinového zipu odpovědná za homodimerizaci nebo heterodimerizaci 1. místo iniciace translace ATG TAD1 TAD2 DBD ZIP 2. místo iniciace translace ATG 7 14 12126 2 286 36 317 345 358aa N-konec C-konec 21 312 36378 6 858 918 951 135 174nt C/EBPα-42 C/EBPα-3 (42kDa) (3kDa)
Zejména pro s normálním karyotypem (4-45% případů ) je významná analýza důležitých prognotických faktorů: mutace transkripčního faktoru CCAAT/enhancerbinding protein (C/EBP) alfa (CEBPA) a mutace nukleofosminu (NPM1), oboje spojené s lepší než průměrnou prognózou.
Tabulka 1 Přehled vzorků pacientů a zdravých jedinců odpovídajícího stáří analyzovaných na přítomnost polymorfizmu a mutací CEBPA Analyzované osoby Zdraví jedinci MDS MM NHL Počet 71 173 181 39 56 a P1 hom. e P1 het. f 1 3 1 1 b P2 hom. P2 het. 1 5 3 2 1 c P3 hom. 2 1 4 1 P3 het. 12 38 45 8 14 d P4 het. 2 8 8 4 3 Mutace het. 15 6 2 2 a b c d e f P1-polymorfizmus 42 G>A podle GenBank Accesion No. NM_4364 a 993 G>A podle GenBank Accesion No. U347 P2-polymorfizmus 573 C>T podle GenBank Accesion No. NM_4364 a 1164 C>T podle GenBank Accesion No. U347 P3-polymorfizmus 69 G>T podle GenBank Accesion No. NM_4364 a 1281 G>T podle GenBank Accesion No. U347 P4-polymorfizmus 584-589dup podle GenBank Accesion No. NM_4364 a 1175-118dup podle GenBank Accesion No. U347 homozygotní heterozygotní
Tabulka 2 Přehled P detekovaných mutací v kódujk dující oblasti CEBPA Číslo Pacien -ta Choro -ba Věk/ pohl FAB Cytogeneti ka Změna nukleotido -vé sekvence b Změna nukleotidové sekvence c Změna aminokyselino -vé sekvence Důsledky mutace 14618 63/F ND 46,XX,inv( 9)[22] 6_155 del 1191_1646del H2_K352de l insq delece oblastí TAD2, DBD a ZIP 11858 76/F ND 41-45,XX,kom plex.změna karyotypu 924_925ins TG 1515_1516insTG E39fsX318 posun čtecího rámce (frameshift) mezi oblastmi DBD a ZIP, ukončení-stop kodon v ZIP 638_1114 del 1229_175del C213_A358de latgdelx243 1741 79/F ND 46,XX[22] 541del 1132del Y181fsX316 posun čtecího rámce mezi oblastmi TAD1 a TAD2, ukončení- stop kodon mezi DBD a ZIP B42 48/F M1 46,XX[13] 542_543ins A 1133_1134insA Y181X ukončení- stop kodon mezi TAD1 a TAD2 1 29/M M1 46,XY,22p +[22] 68del 659del P23fsX159 posun čtecího rámce před TAD1, ukončení- stop kodon mezi TAD1 a TAD2 912_929del 153_152del Q35_T31de l delece v DBD 8 68/F ND 46,XX[22] 68del 659del P23fsX159 posun čtecího rámce před TAD1, ukončení- stop kodon mezi TAD1 a TAD2
1645 79/F ND ND 311_313del 92_94del G14del delece v TAD1 15671 8/M ND 46,XY[1]/47,X Y,+8[1] 26_411del 851_12del Q87fsX119 posun čtecího rámce a ukončení-stop kodon v TAD2, delece oblasti TAD1 1171 68/M M4 46,XY[22] 392_393ins A 983_984insA Y131X ukončení-stop kodon mezi TAD1 a TAD2 912_913ins TTG 153_154ins TTG K34_Q35insL inserce v oblasti DBD 14747 74/M M4 46,XY[9]/47,XY, +8[13] 722 _746 del 1313_1337del L241fsX313 posun čtecíhorámce v DBD, ukončení- stop kodon mezi DBD a ZIP 1569 67/M M6 46,XY[16]/44~54 XY, heterodiploidie [4] 899 G>T 149 G>T R3L záměna v DBD 18 61/M ND 46,XY[22] 656_794del 1247_1385del H219fsX272 delece, posun čtecího rámce a ukončení-stop kodon mezi TAD1 a TAD2 15296 5/F M 46,XX[5] 238_239ins G 829_83insG D8fsX17 posun čtecího rámce a ukončení-stop kodon mezi TAD1 a TAD 2, mutace indukovaná terapií
1591 MDS 76/F N D ND 18_389del 69_98del Y7_G13del delece v oblasti TAD1 15523 MDS 25/F N D 46,XX[18] 26_411del 851_12del Q87fsX119 posun čtecího rámce a ukončení-stop kodon v TAD2, delece TAD1 15899 MDS 75/F N D ND 5_52del 191_193de l E167del delece mezi TAD1 a TAD2 15928 MDS 53/F N D ND 311_313del 92_94del G14del delece v TAD1 123 MDS- RAEB 6/F 46,XX[22] 477_478ins GTCCCCC 168_169in sgtccccc I16fsX171 ukončení- stop kodon v TAD2 14849 MDS- RAEB 65/ M 46,XY[19]/47,XY,+8[3] 169_173 del 166_1664 del A358fs X42 posun čtecího rámce r v oblasti stop kodonu a delší protein
Overall survival [% ] 1 9 P =.3338 8 7 6 n = 15 5 n = 223 4 3 n = 13 2 1 24 48 72 96 12 144 168 Months CEBPA mutated/flt3 wild type CEBPA mutated/flt3 mutated CEBPA wild type
Overall survival [%] 1 9 8 7 6 5 4 3 2 1 P =.584 n = 2 n = 169 24 48 72 96 12 144 168 Months mut CEBPA/wt Flt3/nT wt CEBPA/wt FLT3/nT
Overall survival [%] 1 9 8 7 6 5 4 3 2 1 P =.278 n = 292 n = 15 24 48 72 96 12 144 168 Months mut CEBPA/mut Flt3 wt CEBPA
Fuchs O., Provaznikova D., Kocova M., Kostecka A., Neuwirtova R., Kobylka P., Cermak J., Brezinova J., Schwarz J., Salaj P., Klamova H., Maaloufova J., Lemez P., Novakova L., Benesova K. (28) CEBPA polymorphisms and mutations in patients with acute myeloid leukemia, myelodysplastic syndrome, multiple myeloma and non- Hodgkin s lymphoma. Blood Cells Mol.Diseases 4, 41-45. 45.
Fuchs O.: Growth-inhibiting activity of transcription factor C/EBP EBPα,, its role in haematopoiesis and its tumour suppressor or oncogenic properties in leukaemias Folia Biologica 53, 97-18 (27). Fuchs O. Transcrription Factor C/EBP EBPα and its Effects on Cell Cycle Regulation,, in Cell Cycle Control: New Research,editors Nathan H.Leroy and Noah T.Fournier Fournier,, NOVA Publishers 28
Fuchs O, Kostecka A, Provaznikova D, Krasna B, Brezinova J, Filkukova J, Kotlin R, Kouba M, Kobylka P, Neuwirtova R, Jonasova A, Caniga M, Schwarz J, Markova J, Maaloufova J, Sponerova D, Novakova L, Cermak J: Nature of Frequent Deletions in CEBPA -Blood Cells Mol.Diseases 43, 26-263 263 (29).
Poděkov kování patří Mgr. Daně Provazníkov kové, která se s námi n podílela na zavedení analýzy mutací,, RNDr. Janě Březinové za cytogenetická vyšet etření,, Ing. Janě Markové za některn které vzorky pro retrospektivní analýzu a všem v klinickým lékařům, kteří nám m poslali kostní dřeň nebo periferní krev k analýze.