Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy v Praze Katedra fyziologie a Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.

Podobné dokumenty
Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy v Praze Katedra fyziologie a Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.

Úloha membránového cholesterolu v signalizaci δ-opioidního receptoru Korelace se strukturou plazmatické membrány

OPVK CZ.1.07/2.2.00/

METABOLISMUS POJIVA PLICNÍCH CÉV PŘI CHRONICKÉ HYPOXII. Jana Novotná

Regulace translace REGULACE TRANSLACE LOKALIZACE BÍLKOVIN V BUŇCE. 4. Lokalizace bílkovin v buňce. 1. Translační aparát. 2.

Metody práce s proteinovými komplexy

Obecná biologie Fyziologie živočichů. Oddělení fyziologie a imunologie živočichů

Regulace metabolických drah na úrovni buňky

Jaterní homogenát, preparativní nanáška 2 mg, barvení koloidní Coomassie Blue 1025 spotů. ph 4 ph 7

Citrátový cyklus. Tomáš Kučera.

VÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV)

Otázka: Metabolismus. Předmět: Biologie. Přidal(a): Furrow. - přeměna látek a energie

1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu

Možnosti využití elektromigračních technik při studiu vlastností mikroorganismů. Anna Kubesová

Bakalářské práce. Magisterské práce. PhD práce

Oxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech

Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ / /0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR

DUM č. 11 v sadě. 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika

Obecný metabolismus.

Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL

Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL

OBOROVÁ RADA BIOCHEMIE A PATOBIOCHEMIE

Dýchací řetězec, oxidativní fosforylace, mitochondriální transportní systémy

MitoSeminář II: Trochu výpočtů v bioenergetice. Souhrn. MUDr. Jan Pláteník, PhD. Ústav lékařské biochemie 1.LF UK

Bílkoviny a rostlinná buňka

Gel-based a Gel-free kvantifikace v proteomice

Metabolismus mikroorganismů

Separační metody používané v proteomice

Co nás učí nádory? Prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc. Ústav patologie FN Brno Přírodovědecká a Lékařská fakulta MU Brno

Přednáška 6: Respirace u rostlin

Vliv selenu na metabolismus laboratorního potkana

Dvoudimenzionální elektroforéza

Bp1252 Biochemie. #11 Biochemie svalů

VAKUOLA. membránou ohraničený váček membrána se nazývá tonoplast. běžná u rostlin, zvířata specializované funkce či její nepřítomnost

Struktura bílkovin očima elektronové mikroskopie

PŘENOS SIGNÁLU DO BUŇKY, MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY

Bioenergetika: úloha ATP. Bioenergetika: úloha ATP. Bioenergetika: úloha ATP. Intermediární metabolizmus a energetická homeostáza

d) Kanály e) Přenašeče a co-transportéry, mediátory difúze a sekundární aktivní transport f) Intracelulární transport proteinů

OBOROVÁ RADA Fyziologie a patofyziologie člověka

Biochemie I. Úvodní přednáška

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK. Anotace. Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí Osvobození 20. Číslo projektu:

Glykolýza Glukoneogeneze Regulace. Alice Skoumalová

Stanovisko hodnotící komise

Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy v Praze (

Název: Vypracovala: Datum: Zuzana Lacková

Monitorování léků. RNDr. Bohuslava Trnková, ÚKBLD 1. LF UK. ls 1

Stres a posttraumatická stresová porucha

Marek Ladislav. Opioidní receptory a jejich signální systém v myokardu. Opioid receptors and their signaling system in the myocardium

ENDOKANABINOIDN Í RECEPTORY A ONKOLOGICKÝ PACIENT. Lubomír Večeřa OUP KNTB Zlín ARIM KNTB Zlín ZZS Zlínského kraje

strukturní (součástmi buněčných struktur) metabolická (realizují b. metabolizmus) informační (jako signály či receptory signálů)

glukóza *Ivana FELLNEROVÁ, PřF UP Olomouc*

Identifikace bakterií pomocí MALDI MS

Metabolismus proteinů a aminokyselin

SEZNAM OTÁZEK Z LÉKAŘSKÉ CHEMIE A BIOCHEMIE KE ZKOUŠCE V AKADEMICKÉM ROCE 2009/2010. I. Základy fyzikální, bioanorganické a bioorganické chemie

*Mléko a mléčné výrobky obsahují řadu bioaktivních

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Citrátový cyklus. VY_32_INOVACE_Ch0218.

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolusmus lipidů - katabolismus

Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie Napište vzorce aminokyselin Q a K

1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru

Metabolismus aminokyselin - testík na procvičení - Vladimíra Kvasnicová

asné proteomiky Pavel Bouchal Laboratoř proteomiky Ústav biochemie PřF MU

Odbourávání lipidů, ketolátky

Dýchací řetězec (DŘ)

Úvod do buněčného metabolismu Citrátový cyklus. Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1. LF UK

VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ

TÉMATA BAKALÁŘSKÝCH PRACÍ VYPSANÁ INTERNÍMI PRACOVNÍKY KATEDRY

Uplatnění proteomiky v molekulární klasifikaci meduloblastomu Lenka Hernychová

Nové metody v průtokové cytometrii. Vlas T., Holubová M., Lysák D., Panzner P.

ENZYMY. RNDr. Lucie Koláčná, Ph.D.

Možná uplatnění proteomiky směrem do klinické praxe

Role hemoxygenasy a gangliosidů při estrogenové a obstrukční cholestáze

Apoptóza Onkogeny. Srbová Martina

Urychlení úpravy krvetvorby poškozené cytostatickou terapií (5-fluorouracil a cisplatina) p.o. aplikací IMUNORu

Regulace metabolických drah na úrovni buňky. SBT 116 Josef Fontana

Polyfázová identifikace kmenů Aeromonas encheleia

Molekulární základy dědičnosti. Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA

SLEDOVÁNÍ VZTAHU MEZI OBSAHEM ENZYMU RUBISCO A KONCENTRACÍ CO 2 V CHLOROPLASTU

Charakterizace proteomu piva

Charakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií

FYZIOLOGIE BUŇKY BUŇKA Základní funkce buněk: PROKARYOTICKÁ BUŇKA. Funkce zajišťují základní životní projevy buněk: EUKARYOTICKÁ BUŇKA

Toxikologie PřF UK, ZS 2016/ Toxikodynamika I.

Metabolismus pentóz, glykogenu, fruktózy a galaktózy. Alice Skoumalová

Přehled finančně podpořených témat prací SOČ pro rok 2011/2012. vedoucí

Biochemie nervové soustavy. Pavla Balínová

PROTEOMIKA 2015 SHOT-GUN LC, IEF

PILOTNÍ ZKUŠENOSTI S ORGANIZACÍ INOVATIVNÍCH KURZŮ IMUNOANALÝZY A ENDOKRINOLOGIE PRO VĚDECKÉ PRACOVNÍKY NA LÉKAŘSKÉ FAKULTĚ V PLZNI

2. Z následujících tvrzení, týkajících se prokaryotické buňky, vyberte správné:

Genomické databáze. Shlukování proteinových sekvencí. Ivana Rudolfová. školitel: doc. Ing. Jaroslav Zendulka, CSc.

Pracoviště (1) Oddělení mikrobiologie, Přírodovědecká fakulta Masarykovy, Brno, Česká republika (2)Oddělení funkční genomiky a proteomiky, Přírodověde

Důležité termíny enzymologie Kurz 2 / 210. Vladimíra Kvasnicová

SYNTETICKÉ OLIGONUKLEOTIDY

PROTEOMIKA V MOLEKULÁRNÍ TOXIKOLOGII: IDENTIFIKACE POTENCIÁLNÍCH ČASNÝCH PROTEI- NOVÝCH BIOMARKERŮ HEPATO- KARCINOGENITY U KRYS

Je použití skopolaminu v dětské anesteziologii již obsolentní? Doc. MUDr. Ladislav Hess, DrSc.

STRUKTURA EUKARYONTNÍCH BUNĚK

ÚVOD DO TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE

Mechanismy hormonální regulace metabolismu. Vladimíra Kvasnicová

Hořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku

Síra. Deficience síry: řepka. - 0,2-0,5% SH, nedostatek při poklesu obsahu síranů pod 0,01% SH

Uran v pitné vodě aktuální toxikologické informace

Transkript:

Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy v Praze Katedra fyziologie a Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i. Morfiem navozené změny membránových a solubilních bílkovin frontální mozkové kůry potkana Mgr. Hana Ujčíková Doktorandská dizertační práce 2014 Školitel: Doc. RNDr. Petr Svoboda, DrSc. FYZIOLOGICKÝ ÚSTAV AV ČR Biochemie membránových receptorů

endogenní opioidní peptidy opiové alkaloidy Opioidy polosyntetické opioidy syntetické opioidy Opioidní receptory MOR, DOR, KOR, NOP-OR Waldhoer a kol., 2004. Annu Rev Biochem 73, 953-990.

Opiové alkaloidy morfium Desetidenní expozice potkanů samců kmene Wistar: 10 mg/kg (den 1. a 2.) 15 mg/kg (den 3. a 4.) 20 mg/kg (den 5. a 6.) 30 mg/kg (den 7. a 8.) 40 mg/kg (den 9.) 50 mg/kg (den 10.) kontroly: 0,9% NaCl

Adenylylcykláza (AC) vazebné místo pro Forskolin vazebné místo pro Mg 2+ vazebné místo pro ATP Převzato a upraveno podle Pierre a kol., 2009, Nat Rev Drug Discov 8, 321-335.

Regulace AC vazebné místo pro Forskolin vazebné místo pro Mg 2+ vazebné místo pro ATP AC I, AC III, AC VIII AC II, AC IV, AC VII AC V, AC VI AC IX solubilní AC vazebné místo pro Forskolin vazebné místo pro Mg 2+ vazebné místo pro ATP

Cíle dizertační práce: stanovení obsahu všech izoforem adenylylcyklázy (AC I-IX) ve frakcích PM (morfium/kontrola, usmrceni 24 hodin po aplikaci poslední dávky morfia) provedení stejné analýzy ve vzorcích PM izolovaných z potkanů, kteří byli vystaveni stejné expozici morfia, ale byli usmrceni 20 dní po podání poslední dávky stanovení obsahu všech hlavních tříd G proteinů a Na, K-ATPázy detekce kvantitativních změn indukovaných morfiem ve frakcích PNS a PM proteomická analýza frakcí PNS a PM detekce a proteomická analýza Gβ podjednotek

Adenylylcykláza I Kontrola Morfin Adenylylcykláza II Kontrola Morfin Na, K-ATPáza Kontrola Morfin Kontrola 20D Morfin 20D Kontrola 20D Morfin 20D Kontrola 20D Morfin 20D Adenylylcykláza I Adenylylcykláza II Na,K-ATPáza Kontrola Kontrola 20D Morfin 20D Kontrola Morfin Kontrola 20D Morfin 20D Kontrola Morfin Kontrola 20D Morfin 20D Morfin Ujcikova, H., Dlouha, K., Roubalova, L., Vosahlikova, M., Kagan, D., Svoboda, P. (2011). Up-regulation of adenylylcyclases I and II induced by long-term adaptation of rats to morphine fades away 20 days after morphine withdrawal. BBA General Subjects 1810: 1220-1229.

Adenylylcykláza III Kontrola Morfin Srdce Adenylylcykláza VII Kontrola Morfin Srdce % 120 100 80 % 120 100 80 Adenylylcykláza IV Kontrola Morfin Srdce Adenylylcykláza VIII Kontrola Morfin Srdce % 120 100 80 % 120 100 80 Adenylylcykláza V/VI Kontrola Morfin Srdce Adenylylcykláza IX Kontrola Morfin Srdce % 120 100 80 % 120 100 80 Ujcikova, H., Dlouha, K., Roubalova, L., Vosahlikova, M., Kagan, D., Svoboda, P. (2011). Up-regulation of adenylylcyclases I and II induced by long-term adaptation of rats to morphine fades away 20 days after morphine withdrawal. BBA General Subjects 1810: 1220-1229.

Adenylylcykláza I Adenylyl cyclase I Adenylylcykláza Adenylyl cyclase II II B 0 10 15 20 30 40 50 0 10 15 20 30 40 50 % 120 % 120 100 100 80 0 10 15 20 30 40 50 morphine morfin mg/kg mg/kg 80 0 10 15 20 30 40 50 morphine morfin mg/kg mg/kg Ujcikova, H., Dlouha, K., Roubalova, L., Vosahlikova, M., Kagan, D., Svoboda, P. (2011). Up-regulation of adenylylcyclases I and II induced by long-term adaptation of rats to morphine fades away 20 days after morphine withdrawal. BBA General Subjects 1810: 1220-1229.

Adenylylcykláza I Kontrola Morfin Adenylylcykláza II Kontrola Morfin Na, K-ATPáza Kontrola Morfin Kontrola 20D Morfin 20D Kontrola 20D Morfin 20D Kontrola 20D Morfin 20D Adenylylcykláza I Adenylylcykláza II Na,K-ATPáza Kontrola Kontrola 20D Morfin 20D Kontrola Morfin Kontrola 20D Morfin 20D Kontrola Morfin Kontrola 20D Morfin 20D Morfin Ujcikova, H., Dlouha, K., Roubalova, L., Vosahlikova, M., Kagan, D., Svoboda, P. (2011). Up-regulation of adenylylcyclases I and II induced by long-term adaptation of rats to morphine fades away 20 days after morphine withdrawal. BBA General Subjects 1810: 1220-1229.

G S α Kontrola Morfin Kontrola Morfin G q /G 11 α Kontrola Morfin Kontrola Morfin Kontrola Morfin Kontrola Morfin Ujcikova, H., Dlouha, K., Roubalova, L., Vosahlikova, M., Kagan, D., Svoboda, P. (2011). Up-regulation of adenylylcyclases I and II induced by long-term adaptation of rats to morphine fades away 20 days after morphine withdrawal. BBA General Subjects 1810: 1220-1229.

Shrnutí první části dizertační práce: byl prokázán specifický vzestup AC I (8x) a AC II (2,5x) ve vzorcích PM izolovaných z potkanů usmrcených 24 hodin po aplikaci poslední dávky morfia (10-50 mg/kg, 10 dní) hladina obsahu AC III-IX se nezměnila krátkodobá expozice zvířat morfiu neměla vliv na změnu AC I a AC II specifický vzestup AC I a AC II se projevil jako plně reverzibilní hladina obsahu všech hlavních tříd G proteinů a Na, K-ATPázy se nezměnila

2D elektroforéza strip IF alkylace vizualizace redukce SDS-PAGE analýza obrazu, MS analýza M.w. (kda) 180 116 90 58 48,5 36,5 26,6 3 pi 11

Identifikace proteinů PNS analýza pomocí MALDI-TOF MS/MS M.w. (kda) 180 116 90 58 48,5 36,5 26,6 Mitochondrie (3) Buněčná membrána (1) Lumen ER (1) Cytoplazma (5) 3 pi 11 M.w. (kda) Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.

Identifikace proteinů PNS analýza pomocí MALDI-TOF MS/MS Spot Označení Název proteinu Násobek proteinu změny 1 gi 148747414 guanin deamináza 2,5 2 gi 17105370 V-ATPáza, mozková izoforma 2,6 3 gi 1352384 protein disulfid-izomeráza A3 3,4 4 gi 40254595 dihydropyrimidinázový příbuzný protein 2 3,6 5 gi 149054470 N-etylmaleimid senzitivní fúzní protein, izoforma CRA_a 2,0 6 gi 42476181 malát dehydrogenáza, mitochondriální prekurzor 1,4 7 gi 62653546 glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenáza 1,6 8 gi 202837 aldoláza A 1,3 9 gi 31542401 kreatin kináza typ-b 0,86 10 gi 40538860 akonitát hydratáza, mitochondriální prekurzor 1,26 Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.

Identifikace proteinů PM - analýza pomocí LC-MS/MS Vnitřní mitoch. membrána (1) Myelinová membrána (1) Buněčná membrána (2) Matrix mitochondrie (3) Cytoplazma (11) Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.

Identifikace proteinů PM - analýza pomocí LC-MS/MS Spot Označení Název proteinu Násobek proteinu změny 1 BASP1_RAT membránový neuronální signální protein 1 2,1 2 GBB1_RAT G beta podjednotka-1 2,0 3 KCRB_RAT kreatin kináza typ-b 2,6 4 AINX_RAT alfa-internexin 5,2 5 DPYL2_RAT dihydropyrimidinázový příbuzný protein 2 4,9 6 SIRT2_RAT NAD-dependentní deacetyláza sirtuin-2 2,5 7 SYUA_RAT alfa-synuklein 2,0 8 PRDX2_RAT peroxiredoxin-2 2,2 9 TERA_RAT tranzitorní ATPáza endoplazmatického retikula 2,1 10 DHE3_RAT glutamát dehydrogenáza 1, mitochondriální 2,7 11 SCOT1_RAT sukcinyl-coa:3-ketoacyl-koenzym A transferáza 1, mitochondriální 2,2 12 AATM_RAT aspartát aminotransferáza, mitochondriální 2,2 13 UCHL1_RAT ubikvitin karboxyl-terminální hydroláza L1 2,0 14 PHB_RAT prohibitin 2,2 15 COR1A_RAT koronin-1a 5,4 16 SEP11_RAT septin-11 2,2 17 MBP_RAT základní myelinový protein S 2,5 18 RL12_RAT 60S ribozomální protein L12 2,7 Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.

Gβ Gβpodjednotka subunit A M.w. Control Kontrola M.w. Morphine Morfin 26,6 kda 26,6 kda 1 2 3 4 5 6 7 8 1 2 3 4 5 6 7 8 [%] 110 100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 Kontrola Control Morphine Morfin B Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.

Gβ Gβ podjednotka subunit A M.w. 10% 10% Acrylamide/0.26% akrylamid/0.26% Bis Bis 4-12% gel, Invitrogen M.w. 36,5 kda 36,5 kda 26,6 kda 2 3 4 5 6 7 8 9 26,6 kda 2 3 4 5 6 7 8 9 [%] 110 100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 Kontrola Control Morphine Morfin [%] 110 100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 Kontrola Control Morphine Morfin B Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.

Shrnutí druhé části dizertační práce: analýza 10 proteinů PNS identifikovala vzestup bílkovin funkčně spojených především s oxidativním stresem, apoptózou a změnou energetického metabolismu analýza 18 proteinů frakcí PM identifikovala jediného zástupce GPCR-signálních kaskád - Gβ podjednotku ( 2x) byla stanovena specifická aktivníčást Gβ, která byla změněna vlivem morfia, celkový signál klesl pouze nepatrně (1,2x)

Děkuji Vám za pozornost.

10 mg/kg (den 1. a 2.) 20 mg/kg (den 3. a 4.) 40 mg/kg (den 5. a 6.) 80 mg/kg (den 7. a 8.) 160 mg/kg (den 9. a 10.) 320 mg/kg (den 11. a 12.) Převzato podle Sim a kol., 1996, J Neurosci 16, 2684-2692.

Převzato a upraveno podle Williams a kol., 2013, Pharmacol Rev 65, 223-254.

Identifikace proteinů PNS analýza pomocí MALDI-TOF MS/MS PNS 6 5 oxidativní stres metabolismus 4 3 2 1 0 transport apoptóza Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.

Identifikace proteinů PM - analýza pomocí LC-MS/MS 6 5 4 apoptóza PM oxidativní stres metabolismus neuronální vývoj regulace 3 2 1 signalizace 0 Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.

Identifikace Gβ podjednotek pomocí LC MS/MS Spot Označení Název proteinu Skóre Počet přiřaz. [%] Pokrytí MH a pi b proteinu proteinu peptidů sekvence (kda) 3 GBB1_RAT G beta podjednotka-1 184,3 6 16,8 37,4 5,6 4 GBB1_RAT G beta podjednotka-1 471,0 12 32,9 37,4 5,6 4 GBB2_RAT G beta podjednotka-2 413,9 10 14,4 37,3 5,6 5 GBB1_RAT G beta podjednotka-1 199,1 5 14,1 37,4 5,6 5 GBB2_RAT G beta podjednotka-2 188,7 5 3,50 37,3 5,6 Ujcikova, H., Eckhardt, A., Kagan, D., Roubalova, L., Svoboda, P. 2014. Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and Percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine. Proteome Sci 12:11.