MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ

Transkript

1 MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ Mezinárodní organizace sbírek kultur mikroorganizmů VÚRV Ruzyně, Ivo Sedláček, Monika Laichmanová

2 Sbírky mikroorganizmů Mikroorganizmy - rezervoár mikrobiálních genetických zdrojů - zajištění stability a funkce přírodních ekosystémů - producenti (farmaceutický, potravinářský, chemický průmysl; zemědělství) - biodegradační schopnost (likvidace toxických odpadů) X - přirozená mikroflóra, původci onemocnění Ochrana mikroorganizmů in situ velmi obtížná až nemožná (velikost, nepředvídatelnost výskytu, genetická nestabilita, možnost zániku druhů vázaných na rostliny či živočichy) Sbírky kultur

3 Sbírky kultur mikroorganizmů - ex situ uchování mikroorganizmů v živém a geneticky nezměněném stavu - kultury mikroorganizmů (uchovávané, konzervované) opakovaně využívány - modifikovány metodami genového inženýrství - DNA, viry, prokaryota, kvasinky, houby, protozoa, buněčné linie Servisní sbírky kultury všem zájemcům (za poplatek) Ústavní sbírky pro potřeby organizace, kultury nebývají k dispozici Výzkumné sbírky budovány pracovníky pro výzkum (zánik!)

4 K čemu slouží veřejné servisní sbírky mikroorganizmů? Hlavní aktivity sbírek: Sbírka dále uchovává: - deponování - patentové kultury - uchovávání - bezpečné uložení - distribuce kultur (deponovaný materiál x informace) Servisní činnost (volitelná) - servisní kryokonzervace - rozbory vzorků - typizace a identifikace - taxonomické analýzy - poradenská činnost (klasifikace, nomenklatura, patogenita) Sbírka průběžně doplňuje své fondy o nové kmeny (kultury mající význam pro základní i aplikovaný výzkum; pro taxonomii; pro biotechnologie; regionální izoláty nově popsaných druhů /biodiverzita/; vzácně se vyskytující druhy /z klinického materiálu aj./).

5 Seznam sbírek mikroorganizmů ČR a SR - CCM, CAPM, CNCTC, CCF, CCY,. - CCDM, RIBM, DBM, RIVE,.. - CRIPP, CCALA, CCBAS, CCWDF.. (Federace českých a slovenských sbírek mikroorganizmů, FCCM; EU a svět - DSMZ, LMG, CCUG, NCTC, CIP,.. - ATCC, ACM, VKM, TISTR,. Sbírky jsou zde pro mikrobiology

6 Sbírky a mezinárodní společenství Světová federace sbírek kultur (WFCC, založena v roce 1970 (CCM má pořadové číslo 65) koordinace spolupráce zabezpečení pravidelné výměny zkušeností (uchovávání, identifikace, taxonomie, bioinformatika aj.) Při WFCC bylo zřízeno databázové centrum (WDCM, Japonsko Čína; shromažďuje a poskytuje informace o sbírkách registrovaných ve WFCC Evropská organizace sbírek kultur (ECCO, vznikla v roce 1982 potřeba těsnější spolupráce včasné operativní výměny zkušeností na evropské úrovni schůzky pravidelně každý rok v některé z členských sbírek (aktuální potřeby MTA, GMO)

7 WFCC Vydává doporučení členský poplatek 150 Eur Organizuje mezinárodní konference (Peking 2014, Singapur 2017) - výměna zkušeností - vzájemné kontakty CCM je: (1) řádným členem WFCC (pod pořadovým číslem 65) > 50 let; (2)zakládajícím a aktivním členem ECCO; (3) aktivně spolupracuje s mnoha zahraničními sbírkami; (4) spolupracuje s některými tuzemskými sbírkami sdruženými ve Federaci českých a slovenských sbírek mikroorganizmů (FCCM;

8 14th ICCC WFCC ve 21. století, převod na BRC - Databáze, WDCM (Čína) - Management kvality, patenty a biotechnologie - Nagojský protokol - Specializované sbírky pro průmysl a biotechnologie - Biologická bezpečnost (laboratoř, personál, transport, informace)

9 IV. ICCC

10 WFCC = Sbírky jako centra biologických zdrojů Formování center biologických zdrojů: - propojení vědeckého výzkumu a biotechnologií (bioinformace) - pracovní skupina pro biotechnologie při OECD - sbírky mikroorganizmů = základ center biologických zdrojů - OECD ISBN (standardizují se data, formát výměny informací, metodiky kryokonzervačních postupů aj.) WDCM Katalog

11 WFCC, ECCO Sbírky a spolupráce (1) - Fenotypizace - - Genotypizace - izolát

12 WFCC, ECCO Sbírky a spolupráce (2) klinický materiál x prostředí izoláty ČR x celý svět

13 ECCO Spolupráce na vnitřních normách: - GLP - Nagojský protokol - MTA - core MDA - Biotechnology -- Biobanking -- General requirements for biobanking (ISO/DIS 20387) Národní koordinátor? - spolupráce s editory časopisů Spolupráce na projektech EU: - MIRRI - EMbaRC 2 Roční členský poplatek ECCO: 50 Eur (?200?) Školení (BCCM, Westerdijk Fungal Biodiversity Institute)

14 1985: ECCO-IV M. Kocur (CCM) zakládající člen Brno, červen 1985: organizace IV. konference ECCO 2017 UKB Bohunice

15 ECCO 2017 společenský program

16 Standardizace, certifikace - základní nutnost pro BRC

17 Děkuji za pozornost