Izolace, separace a detekce proteinů a nukleových kyselin a jejich význam VOJTĚCH ADAM
|
|
- Bohuslav Marek
- před 8 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Izolace, separace a detekce proteinů a nukleových kyselin a jejich význam VOJTĚCH ADAM
2 Životní prostředí
3 Obranné mechanismy Rostlinná buňka Živočišná buňka 2GS - M M GSH VAKUOLA GSH GSH *Aktivace* PC - M 2GS - M Fytochelatin syntáza M PC - M (γ-glu-cys) n -gly Fytochelatiny MTF-1 MTI MTF-1 MRE (b) MTI MTF-1 (c) (a) M M mrna MT (d) Ionty kovů (M) O. Zitka, et al. (2011) Int. J. Electro. Sci., 192, V. Adam, et al. (2010) TRAC-Trends Anal. Chem., 29,
4 I. Genová exprese Obsah II. Rostlinné obranné mechanismy III. Živočišné obranné mechanismy
5 I. Genová exprese Obsah II. Rostlinné obranné mechanismy III. Živočišné obranné mechanismy
6 I. Genová exprese Pokročilé materiály v izolaci nukleových kyselin A. Přidání vzorku B. Izolace nukleové kyseliny C. Separace pomocí magnetu D. Promývání E. Ohřev 85 C F. Získání cílové molekuly G. Adsorpce na povrch molekuly H. Promytí I. Měření Referentní elektroda Pracovní elektroda Pomocná elektroda Potenciostat/ Galvanostat D. Huska et al. (2009) Talanta, 79,
7 POTENCIOSTAT GALVANOSTAT Poloautomatická I. Genová exprese Izolace nukleových kyselin Automatická Promývání 3x A D 9 16 B C 85 C Promývání 3x A Elektrochemická detekce potenciostat Elektrochemická detekce Signal D. Huska et al. (2009) Talanta, 79,
8 Výška píku (%) I. Genová exprese Optimalizace elektrochemické detekce nukleových kyselin A B C 100 Square wave voltametrie (na) Výška píku (%) Výška píku (%) Potenciál (V) Frekvence (Hz) D E F Výška píku (%) Výška píku Doba akumulace (s) y = x R 2 = Teplota ( C) ph Koncentrace poly(a) (µg/ml) D. Huska et al. (2009) Talanta, 79,
9 I. Genová exprese Je separace založená na paramagnetických částicích v kombinaci s elektrochemickou detekcí využitelná pro analýzu reálných vzorků?
10 I. Genová exprese Izolace mrna z reálného vzorku Kontrolní rostliny 50 mm Cd(II) Aplikovaná koncentrace kadmia (µm) kořen stonek Obsah mrna (%) mm Cd(II) Aplikovaná koncentrace kadmia (µm) Doba kultivace (hod.) D. Huska et al. (2009) Talanta, 79, D. Huska et al. (2009) Chem. Listy, 103, s167-s171.
11 I. Genová exprese Obsah II.Rostlinné obranné mechanismy III. Živočišné obranné mechanismy
12 II. Rostlinné obranné mechanismy Fytochelatiny Sírany Významný rostlinný peptid, který má základní strukturu ( -Glu-Cys) n -Gly. Dipeptidická repetice glutamové Methionin kyseliny a cysteinu ( -Glu-Cys) se cystein může opakovat 2 až 11krát. Molekula glutathionu (γ-glu-cys-gly) Protein je substrátem pro syntézu fytochelatinů. Redukovaný glutathion Hlavní funkce této skupiny peptidů je detoxikace těžkých kovů, která probíhá vazbou na thiolové skupiny peptidu schopnost interakce. Fytochelatin2
13 II. Rostlinné obranné mechanismy Fytochelatin syntáza 2GS - Cd GSH Cd 2+ VAKUOLA GSH PC - Cd 2GS - Cd GSH FYTOCHELATIN SYNTÁZA PC - Cd (γ-glu-cys) n -gly FYTOCHELATINY γ-glu-cys-gly + γ-glu-cys-gly γ-glu-cys-γ-glu-cys-gly + gly (γ-glu-cys) n=2 gly γ-glu-cys-gly *AKTIVACE* Cd 2+ Cd 2+ FYTOCHELATIN SYNTÁZA γ-glu-cys- γ-glu-cys-γ-glu-cys-gly + gly (γ-glu-cys) n=3 -gly γ-glu-cys-gly n = 4 O. Zitka, et al. (2011) Int. J. Electro. Sci., 6, n = 5
14 II. Rostlinné obranné mechanismy Jak komplexně hodnotit reakci rostliny na přítomnost těžkého kovu?
15 II. Rostlinné obranné mechanismy Tabáková BY-2 buněčná line Kultivace BY-2 buněks přídavkem různých koncentrací Cd(II) iontů během třídenní kultivace v tekutém médiu Murashige and Skoog. 0 µm 5 µm 10 µm 25 µm 50 µm 100 µm Životnost buněk stanovena pomocí esterázové aktivity CelkovýobsahCd(II)vBY-2buňkách stanoven pomocí diferenční pulzní voltametrie Obsah fytochelatinu2 jako produktu fytochelatin syntázy stanoven pomocí vysoce účinné kapalinové chromatografie s elektrochemickou detekcí O. Zitka, et al. (2011) J. Hazard. Mat., 192,
16 II. Rostlinné obranné mechanismy Aktivace fytochelatin syntázy Homogenizace Přídavek redukovaného glutathionu k alikvotům(mm) N 2 (l) Fosfátový pufr s trikarboxy(ethyl) fosfinem Centrifugace Supernatant Postup přípravy vzorku Přídavek Cd + inkubace 30 min. 35 C 5.0 Buňky BY-2 po kultivaci s Cd(II) ionty Vysoce účinná kapalinová chromatografie s elektrochemickou detekcí O. Zitka, et al. (2011) J. Hazard. Mat., 192,
17 II. Rostlinné obranné mechanismy K m fytochelatin syntázy K m [GSH (mm)] Koncentrace Cd(II) (µm) O. Zitka, et al. (2011) J. Hazard. Mat., 192,
18 I. Genová exprese Obsah II. Rostlinné obranné mechanismy III. Živočišné obranné mechanismy
19 III. Živočišné obranné mechanismy Metalothionein protein Intracelulární, nízkomolekulární, na cystein velmi bohatý protein (6 10 kda). Metalothionein se skládá ze dvou vazebných domén α a β. N-terminální část peptidu β-doména; tři vazebná místa pro dvojmocné ionty. C-terminální část peptidu -doména; čtyři vazebná místa pro dvojmocné ionty kovů. Nejčastější repetice: cystein(c) serin(s) cystein(c). Počet aminokyselin β - doména α - doména C S K G A T N E M P D Q I Aminokyseliny (C cystein, S serin, K lysin, G glycin, A alanin, T threonin, N asparagin, E kyselina glutamová, M methionin, P prolin, D kyselina asparagová, Q glutamin, I isoleucin) J. Petrlova, et al. (2006) Electrochim. Acta, 51,
20 III. Živočišné obranné mechanismy Detoxikace těžkých kovů těžké kovy (Zn, Cd, Pb, Cu?) (a) MT (f) (e) ledvina vyloučení fosforylace?? MTF-1 MTI MTF-1 MRE (b) MTI MTF-1 (c) jádro cytoplasma MT mrna (d) (a) Vstup iontů kovu do buňky. (b) Ionty interagují s inhibitorem syntézy metalothioneinu (MTI). (c) Spuštění transkripčního faktoru (MTF-1) spojeného s metaloresponsivním elementem (MRE). (d) (e) Syntéza mrna pro translaci MT. MT se váží ion těžkých kovů, komplex MT-iont těžkého kovu je transportován do ledviny nebo k regulačním proteinům závislým na těžkém kovu (f). V. Adam, et al. (2010) TRAC-Trends Anal. Chem., 29,
21 III. Živočišné obranné mechanismy Jak studovat úlohu tohoto proteinu v buňce?
22 III. Živočišné obranné mechanismy Tepelná denaturace a přenosová technika 15 min. kapka vzorku po tepelné denaturaci visící rtuťová kapková elektroda parafilm mikroskopické sklo 2 C Co(II) Adsorpce při 10 C 250 na RS 2 Co Cat1 Cat2 Co Potenciál (V) Uhlíková elektroda Brdičkova reakce Ag/AgCl/ 3M KCl omývání J. Petrlova, et al. (2006) Electrochim. Acta, 51, V. Adam, et al. (2008) Sensors, 8,
23 III. Živočišné obranné mechanismy Cisplatina a buněčné linie A B a Mateřská linie b Rezistentni linie c UKF-NB4 rezistentní k cisplatině 100 na sken 1 µg cddp/ml media 0 µg cddp/ml media MT 300 ng n.d. MT 300 ng MT v buněčném extraku MT 300 ng n.d. C D E Množství MT (%) Množství MT (%) Množství MT (%) Buněčná linie Koncentrace cisplatiny (µm) Koncentrace karboplatiny (µm) I. Fabrik, et al. (2008) Electroanalysis, 20,
24 III. Živočišné obranné mechanismy Pokročilé materiály v izolaci metalothioneinu A. Navázání protilátek B. Přidání vzorku C. Izolace cílové molekuly D. Separace pomocí magnetu E. Promývání F. Ohřev G. Získání cílové molekuly H. Adsorpce na povrch molekuly I. Promytí J. Měření Referentní elektroda Pracovní elektroda Pomocná elektroda Potenciostat/ Galvanostat M. Masarik et al. (2011) Electrophoresis, 32,
25 III. Živočišné obranné mechanismy Optimalizace postupu izolace Normalizovaný signál (%) Normalizovaný signál (%) Normalizovaný signál (%) Normalizovaný signál (%) Myší IgG Králičí IgG Vzorek Čas (min.) 22Rv1 Teplota ( C) ph M. Masarik et al. (2011) Electrophoresis, 32,
26 III. Živočišné obranné mechanismy Analýza prostatické buněčné linie 22Rv1 Metalothionein/viabilita (%) MT mrna Koncentrace Cd(II) (µm) Lyzát: tepelný Lyzát: RIPA Koncentrace Cd(II) (µm) Metalothionein/viabilita (%) MT mrna Koncentrace Cu(II) (µm) Lyzát: tepelný Lyzát: RIPA Koncentrace Cu(II) (µm) M. Masarik et al. (2011) Electrophoresis, 32,
27 Shrnutí Multi-instrumentální přístup Nové materiály založené na nanotechnologiích In situ a on line detekce Praktické aplikace
28 Pedagogický rozvoj oborů vyučovaných na Agronomické fakultě Využití moderní a robustní analytické, biochemické a biologické instrumentace v základní výuce Anorganické a Analytické chemie a Biochemie. Unikátní přístroje ve specializovaných chemických a biochemických předmětech (Bioanalytická chemie, Biotechnologie životního prostředí, Biosenzory, Biochemické pokročilé praktikum). Bakalářské a diplomové práce.
29 Pedagogický rozvoj oborů vyučovaných na Agronomické fakultě Odborné vedení Moderní instrumentace Nadaní studenti Biotechnologie rostlin Biotechnologie živočichů Zootechnika Chemie a technologie potravin Jakost a zdravotní nezávadnost potravin Pedagogický rozvoj
30 Pedagogický rozvoj oboru Zemědělská chemie na Agronomické fakultě Výchova mladých vědeckých pracovníků Rozvoj izolačních a separačních postupů založených na pokročilých materiálech. Lab-on-chip technologie, aplikace in situ. Praktická aplikace, studium biochemických procesů v organismech všech úrovní.
31 Vědecký rozvoj oboru Zemědělská chemie na Agronomické fakultě Základní výzkum (grantové projekty národní i evropské) GA ČR 522/07/0692 Studium tvorby thiolových sloučenin u rostlin uplatnění při remediačních technologiích EU 7H10021 MAS, Nanoelectronics for mobile AAL-Systems Zemědělská chemie Aplikovaný výzkum NAZV QI91A032 Výběr rezistentních genotypů meruněk k PPV s tržní kvalitou plodů Zahraniční spolupráce John Innes Institute (Prof. Kopřiva) The estación experimental del Zaidín (Dr. Ferrol)
32 Pedagogický a vědecký rozvoj oboru Zemědělská chemie na Agronomické fakultě In vivo zobrazovací technologie Kvantová tečka quantum dot, ohraničená oblast polovodiče oprůměru kolem 30 nm a výšce 8 nm, schopná v důsledku nižší energie ve srovnání s energií vodivostního pásu okolního polovodiče vázat elektrony. Důležitou vlastností je také optická schopnost teček se zabarvovat. Intenzita signálu > Excitace (440 nm), Emise (790 nm) kontrola 10 µm 100 µm
33 PODĚKOVÁNÍ
34 Prosinec 2005 PODĚKOVÁNÍ Laboratoř metalomiky a nanotechnologií Červen 2007 Duben 2008 Duben 2006 Listopad 2007 Září 2010 Květen 2011 Březen 2009
35 Děkuji za pozornost
Analýza biologicky aktivních látek VOJTĚCH ADAM
Analýza biologicky aktivních látek VOJTĚCH ADAM Obsah I. Nízkomolekulární biologicky aktivní thioly II. Metalothionein III.Nukleové kyseliny Obsah I. Nízkomolekulární biologicky aktivní thioly II. Metalothionein
VíceMonitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin Ing. Kateřina Tmejová, Ph. D.,
VíceMagnetické částice pro detekci nádorových onemocnění, založené na protilátkách Vojtěch Adam
Název: Školitel: Magnetické částice pro detekci nádorových onemocnění, založené na protilátkách Vojtěch Adam Datum: 7..203 Reg.č.projektu: CZ..07/2.4.00/3.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního
Vícespolupráce Vás zve na seminář: Abstrakt potenciál oblasti číslem k financování. projektu aplikacích. nicméně zůstává z důvodu administrativních
Vás zve na seminář: Projekt NANOLABSYS s názvem Mezináro odní spolupráce v oblasti "in vivo" zobrazovacích technik Prof. Ing. René Kizek, Ph.D. Abstrakt Rozvoj lidského potenciálu v oblasti výzkumu a inovací,
VíceSpecifická izolace microrna pomocí magnetizovatelných mikročástic
Název: Školitel: Specifická izolace microrna pomocí magnetizovatelných mikročástic Veronika Vlahová Datum: 21. 3. 214 Reg.č.projektu: CZ.1.7/2.3./2.148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce v oblasti
VíceMagnetické částice, izolace a detekce chřipky (hemaglutininu)
Název: Magnetické částice, izolace a detekce chřipky (hemaglutininu) Školitel: Ludmila Krejčová, MVDr. Datum: 7.11. 2013 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního
VíceZkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:
Biotechnologie interakce, polarita molekul. Hydrofilní, hydrofobní a amfifilní molekuly. Stavba a struktura prokaryotní a eukaryotní buňky. Viry a reprodukce virů. Biologické membrány. Mikrobiologie -
VíceInformace o záměru projektu AstroBioCentra
Informace o záměru projektu AstroBioCentra René Kizek Laboratoř metalomiky a nanotechnologií Mendelovy univerzity v Brně a STRATO-NANOBIOLAB Libor Lenža Hvězdárna Valašské Meziříčí, p. o. a STRATO-NANOBIOLAB
VíceRenáta Kenšová. Název: Školitel: Datum: 24. 10. 2014
Název: Školitel: Sledování distribuce zinečnatých iontů v kuřecím zárodku za využití moderních technik Monitoring the distribution of zinc ions in chicken embryo using modern techniques Renáta Kenšová
VíceUhlíkové struktury vázající ionty těžkých kovů
Uhlíkové struktury vázající ionty těžkých kovů 7. června/june 2013 9:30 h 17:30 h Laboratoř metalomiky a nanotechnologií, Mendelova univerzita v Brně a Středoevropský technologický institut Budova D, Zemědělská
VíceNázev: Stanovení železa ve vzorcích krve pomocí diferenční pulzní voltametrie
Název: Stanovení železa ve vzorcích krve pomocí diferenční pulzní voltametrie Školitel: MVDr. Ludmila Krejčová Datum: 24.2. 2012 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce
VíceSarkosin jako jednoduchý test na rakovinu prostaty analytická studie přednášky Natalia Cernei
Název: Školitel: Sarkosin jako jednoduchý test na rakovinu prostaty analytická studie přednášky Natalia Cernei Datum: 20.1.2011 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován
VíceIzolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..
Izolace RNA doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD.. Metodiky izolace RNA celková buněčná RNA ( total RNA) zahrnuje řadu typů RNA, které se mohou lišit svými fyzikálněchemickými vlastnostmi a tedy i nároky na jejich
VíceIZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod: detekce přímo v buňkách - fluorescenční barvení
VíceAminokyseliny. Gymnázium a Jazyková škola s právem státní jazykové zkoušky Zlín. Tematická oblast Datum vytvoření Ročník Stručný obsah Způsob využití
Aminokyseliny Tematická oblast Datum vytvoření Ročník Stručný obsah Způsob využití Autor Kód Chemie přírodních látek proteiny 18.7.2012 3. ročník čtyřletého G Určování postranních řetězců aminokyselin
VíceProteiny Genová exprese. 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D.
Proteiny Genová exprese 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D. Bílkoviny (proteiny), 15% 1g = 17 kj Monomer = aminokyseliny aminová skupina karboxylová skupina α -uhlík postranní řetězec Znát obecný vzorec
VíceIzolace nukleových kyselin
Izolace nukleových kyselin Požadavky na izolaci nukleových kyselin V nativním stavu z přirozeného materiálu v dostatečném množství požadované čistotě. Nukleové kyseliny je třeba zbavit všech látek, které
VíceAminokyseliny, proteiny, enzymy Základy lékařské chemie a biochemie 2014/2015 Ing. Jarmila Krotká Metabolismus základní projev života látková přeměna souhrn veškerých dějů, které probíhají uvnitř organismu
VíceTranslace (druhý krok genové exprese)
Translace (druhý krok genové exprese) Od RN k proteinu Milada Roštejnská Helena Klímová 1 enetický kód trn minoacyl-trn-synthetasa Translace probíhá na ribosomech Iniciace translace Elongace translace
VíceANALYTICAL METHODS FOR DETERMINATION OF METAL- BINDING PEPTIDES AND PROTEINS ANALYTICKÉ METODY PRO STANOVENÍ PEPTIDŮ A PROTEINŮ VÁZAJÍCÍCH KOVY
ANALYTICAL METHODS FOR DETERMINATION OF METAL- BINDING PEPTIDES AND PROTEINS ANALYTICKÉ METODY PRO STANOVENÍ PEPTIDŮ A PROTEINŮ VÁZAJÍCÍCH KOVY Vacek J. 1,2, Kizek R. 1, Havel L. 2, Klejdus B. 1 1 Ústav
VíceNázev: Vypracovala: Datum: 7. 2. 2014. Zuzana Lacková
Název: Vypracovala: Zuzana Lacková Datum: 7. 2. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu MĚLI BYCHOM ZNÁT: informace,
VíceNanotransportéry pro teranostické aplikace
Název: Nanotransportéry pro teranostické aplikace Školitel: Simona Dostálová, Markéta Vaculovičová Datum: 21. 3. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce v oblasti
VíceGymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, 566 01 Vysoké Mýto
Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, 566 01 Vysoké Mýto SUBSTITUČNÍ DERIVÁTY KARBOXYLOVÝCH O KYSELIN R C O X karboxylových kyselin - substituce na vedlejším uhlovodíkovém řetězci aminokyseliny - hydroxykyseliny
Více10. Minerální výživa rostlin na extrémních půdách
10. Minerální výživa rostlin na extrémních půdách Extrémní půdy: Kyselé Alkalické Zasolené Kontaminované těžkými kovy Kyselé půdy Procesy vedoucí k acidifikaci (abnormálnímu okyselení): Zvětrávání hornin
VíceELEKTROCHEMIE JAKO NÁSTROJ PRO STUDIUM INTERAKCE MATRIXOVÉ METALOPROTEINÁZY-9 A KOLAGENU. univerzita v Brně, Zemědělská 1, 613 00 Brno
ELEKTROCHEMIE JAKO NÁSTROJ PRO STUDIUM INTERAKCE MATRIXOVÉ METALOPROTEINÁZY-9 A KOLAGENU Ondřej Zítka 1,2, Dalibor Húska 2, Vojtěch Adam 2,3, Libuše Trnková 4, René Kizek 2 1 Ústav biochemie, Přírodovědecká
VíceELEKTROCHEMIE JAKO NÁSTROJ PRO STUDIUM INTERAKCE MATRIXOVÉ METALOPROTEINASY-9 A KOLAGENU
ELEKTROCHEMIE JAKO NÁSTROJ PRO STUDIUM INTERAKCE MATRIXOVÉ METALOPROTEINASY-9 A KOLAGENU ONDŘEJ ZÍTKA a,b, DALIBOR HÚSKA b, VOJTĚCH ADAM b,c, LIBUŠE TRNKOVÁ d a RENÉ KIZEK b a Ústav biochemie, Přírodovědecká
VíceBÍLKOVINY HLÍZ BRAMBOR
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích ZEMĚDĚLSKÁ FAKULTA BÍLKOVINY HLÍZ BRAMBOR jejich izolace a možnosti uplatnění Jan Bárta a kol. 19. května 2015, České Budějovice Kancelář transferu technologií
VíceStruktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová
Struktura proteinů - testík na procvičení Vladimíra Kvasnicová Mezi proteinogenní aminokyseliny patří a) kyselina asparagová b) kyselina glutarová c) kyselina acetoctová d) kyselina glutamová Mezi proteinogenní
VíceVYUŽITÍ TEPELNÉHO ZMLŽOVAČE V AAS
1 VYUŽITÍ TEPELNÉHO ZMLŽOVAČE V AAS JAN KNÁPEK Katedra analytické chemie, Přírodovědecká fakulta MU, Kotlářská 2, Brno 611 37 Obsah 1. Úvod 2. Tepelný zmlžovač 2.1 Princip 2.2 Konstrukce 2.3 Optimalizace
VíceNázev: Školitel: Datum:
Název: Školitel: Sledování distribuce kademnatých iontů v kuřecím zárodku za využití moderních technik Monitoring the distribution of cadmium ions in chicken embryo using modern techniques Renáta Kenšová
VíceNANOMATERIÁLY, NANOTECHNOLOGIE, NANOMEDICÍNA
NANOMATERIÁLY, NANOTECHNOLOGIE, NANOMEDICÍNA Nano je z řečtiny = trpaslík. 10-9, 1 nm = cca deset tisícin průměru lidského vlasu Nanotechnologie věda a technologie na atomární a molekulární úrovni Mnoho
VíceBílkoviny - proteiny
Bílkoviny - proteiny Proteiny jsou složeny z 20 kódovaných aminokyselin L-enantiomery Chemická struktura aminokyselin R představuje jeden z 20 různých typů postranních řetězců R Hlavní řetězec je neměnný
VíceVYUŢITÍ GENETICKY MODIFIKOVANÝCH ROSTLIN PRO REMEDIACI KONTAMINOVANÝCH ZEMIN
VYUŢITÍ GENETICKY MODIFIKOVANÝCH ROSTLIN PRO REMEDIACI KONTAMINOVANÝCH ZEMIN Martina Nováková, Martina Macková, Jan Fišer, Jáchym Šuman, Veronika Kurzawová, Tomáš Macek suram@vscht.cz Vysoká škola chemicko-technologická
VíceAMINOKYSELINY STANOVENÍ AMINOKYSELINOVÉHO SLOŽENÍ BÍLKOVIN. Stanovení sirných aminokyselin. Obecná struktura
AMIKYSELIY becná struktura STAVEÍ AMIKYSELIVÉH SLŽEÍ BÍLKVI 1. IZLAE (jen v některých případech) 2. HYDLÝZA kyselá hydrolýza pomocí Hl ( c = 5 mol.dm -3 ) klasicky: 105-120, 18-24 h, inertní atmosféra,
VícePřehled pedagogické činnosti RNDr. Václav Martínek, Ph.D. Pedagogická činnost
Přehled pedagogické činnosti RNDr. Václav Martínek, Ph.D. Pedagogická činnost Akademický rok: 2003/2004 Studijní program: Chemie se zaměřením na vzdělávání Počítače a internet v chemii (C280S24), povinný
VíceTento rámcový přehled je určen všem studentům zajímajícím se o aktivní vědeckou práci.
Tento rámcový přehled je určen všem studentům zajímajícím se o aktivní vědeckou práci. Konkrétní témata bakalářských a diplomových prací se odvíjejí od jednotlivých projektů uvedených dále. Ústav analytické
VíceVÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV)
VÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV) Oddělení biofyziky - absolvování magisterského studia v oboru biofyzika, biochemie nebo v biologickém oboru - prezenční Ph.D. studium
VíceNázev: Vypracovala: Datum: Zuzana Lacková. záleží na tom, co chceme dělat 1) METHALOTIONEIN 2) GFP
Název: Vypracovala: Zuzana Lacková Datum: 7. 2. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/323 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu MĚLI BYCHOM ZNÁT: informace, které
VíceMETODY VYŠETŘOVÁNÍ BUNĚČNÉ IMUNITY. Veřejné zdravotnictví
METODY VYŠETŘOVÁNÍ BUNĚČNÉ IMUNITY Veřejné zdravotnictví METODY VYŠETŘOVÁNÍ BUNĚČNÉ IMUNITY průtoková cytometrie metody stanovení funkční aktivity lymfocytů testy fagocytárních funkcí Průtoková cytometrie
VícePROTEINY. Biochemický ústav LF MU (H.P.)
PROTEINY Biochemický ústav LF MU 2013 - (H.P.) 1 proteiny peptidy aminokyseliny 2 Aminokyseliny 3 Charakteristika základní stavební jednotky proteinů geneticky kódované 20 základních aminokyselin 4 a-aminokyselina
VíceImunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky
Imunochemické metody na principu vazby antigenu a protilátky ANTIGEN (Ag) specifická látka (struktura) vyvolávající imunitní reakci a schopná vazby na protilátku PROTILÁTKA (Ab antibody) molekula bílkoviny
VíceGenetický kód. Jakmile vznikne funkční mrna, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu.
Genetický kód Jakmile vznikne funkční, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu. Pravidla, kterými se řídí prostřednictvím přenos z nukleotidové sekvence DNA do aminokyselinové
VíceAminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin. doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie
Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 1. 20 aminokyselin, kódovány standardním genetickým kódem, proteinogenní, stavebními
VíceFakulta životního prostředí v Ústí nad Labem. Pokročilé metody studia speciace polutantů. (prozatímní učební text, srpen 2012)
Fakulta životního prostředí v Ústí nad Labem Pokročilé metody studia speciace polutantů (prozatímní učební text, srpen 2012) Obsah kurzu: 1. Obecné strategie speciační analýzy. a. Úvod do problematiky
VíceStanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů
Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů Bioanalytické metody Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Úvod Kritéria výběru metod stanovení koncentrace proteinů jsou založena na možnostech pro vlastní analýzu,
VíceTémata bakalářské a diplomové práce Počátek řešení v roce 2012
Laboratoř pokročilých průtokových technik 1. Téma: Use of mass spectrometry technique (MALDI-TOF) for the characterization of metallothionein in biological systems Anotace: Metallothioneins (MT) are intracellular,
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY ELEKTROFORÉZA K čemu to je? kritérium čistoty preparátu stanovení molekulové hmotnosti makromolekul stanovení izoelektrického
VíceAminokyseliny a dlouhodobá parenterální výživa. Luboš Sobotka
Aminokyseliny a dlouhodobá parenterální výživa Luboš Sobotka Reakce na hladovění a stres jsou stejné asi 4000000 let Přežít hladovění a akutní stav Metody sledování kvality AK roztoků Vylučovací metoda
VíceStudijní program: Analytická a forenzní chemie
Studijní program: Analytická a forenzní chemie Studijní program: Analytická a forenzní chemie První rok je studium společné a dělí se až od druhého roku na specializace Specializace 1: Analytická chemie,
VíceONLINE BIOSENZORY PŘI HLEDÁNÍ KONTAMINACE PITNÉ VODY
ONLINE BIOSENZORY PŘI HLEDÁNÍ KONTAMINACE PITNÉ VODY Ing. Jana Zuzáková Ing. Jana Zuzáková, Doc. RNDr. Jana Říhová Ambrožová, PhD., Ing. Dana Vejmelková, PhD., Ing. Roman Effenberg, RNDr. Miroslav Ledvina
VíceAbiotický stres - sucho
FYZIOLOGIE STRESU Typy stresů Abiotický (vliv vnějších podmínek) sucho, zamokření, zasolení půd, kontaminace prostředí toxickými látkami, chlad, mráz, vysoké teploty... Biotický (způsobený jiným druhem
VíceMinerální výživa na extrémních půdách. Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů
Minerální výživa na extrémních půdách Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů Procesy vedoucí k acidifikaci půd Zvětrávání hornin s následným vymýváním kationtů (draslík,
Víceve školní nebo zdravotnické laboratoři?
Praktická cvičení z klinické biochemie ve školní nebo zdravotnické laboratoři? Jiří Kukačka a kol. Ústav klinické biochemie a patobiochemie UK 2.LF a FN Motol Předměty garantované ústavem Magisterské studium-všeobecné
VíceAminokyseliny, peptidy a bílkoviny
Aminokyseliny, peptidy a bílkoviny Dělení aminokyselin Z hlediska obsahu v živé hmotě Z hlediska významu ve výživě Z chemického hlediska Z hlediska rozpustnosti Dělení aminokyselin Z hlediska obsahu v
VíceObsah. Sarkosin Charakterizace slepičích protilátek proti sarkosinu. Dagmar Uhlířová
Investice do rozvoje vzdělávání Charakterizace slepičích protilátek proti sarkosinu Dagmar Uhlířová 7.2.2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 NanoBioMetalNet Název projektu: Partnerská síť centra
VíceVýzkumné centrum genomiky a proteomiky. Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Výzkumné centrum genomiky a proteomiky Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i. Systém pro sekvenování Systém pro čipovou analýzu Systém pro proteinovou analýzu Automatický sběrač buněk Systém pro sekvenování
VíceLuminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii
Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii Kvantitativní analýza: F = k φ Φ o Vysoká citlivost metody: 2.3 c l ε použití laserů odezva na relativně malé změny v okolí
VíceOPTIMALIZACE METODY ANODICKÉ ROZPOUŠTĚCÍ VOLTAMETRIE PRO ANALÝZU BIOLOGICKÝCH VZORKŮ S OBSAHEM RTUTI
Středoškolská technika 212 Setkání a prezentace prací středoškolských studentů na ČVUT OPTIMALIZACE METODY ANODICKÉ ROZPOUŠTĚCÍ VOLTAMETRIE PRO ANALÝZU BIOLOGICKÝCH VZORKŮ S OBSAHEM RTUTI Eliška Marková
VíceHořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku
Hořčík Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku Příjem a pohyb v rostlině Příjem jako ion Mg 2+, pasivní, iont. kanály Mobilní ion v xylému i ve floému, možná retranslokace V místě funkce vázán
VíceKvantové tečky. a jejich využití v bioanalýze. Jiří Kudr SPOLEČNĚ PRO VÝZKUM, ROZVOJ A INOVACE CZ/FMP.17A/0436
SPOLEČNĚ PRO VÝZKUM, ROZVOJ A INOVACE CZ/FMP.17A/0436 Kvantové tečky a jejich využití v bioanalýze Jiří Kudr Datum: 9.4.2015 Hvězdárna Valašské Meziříčí, p.o, Vsetínská 78, Valašské Meziříčí, Nanotechnologie
VíceSylabus pro předmět Biochemie pro jakost
Sylabus pro předmět Biochemie pro jakost Kód předmětu: BCHJ Název v jazyce výuky: Biochemie pro Jakost Název česky: Biochemie pro Jakost Název anglicky: Biochemistry Počet přidělených ECTS kreditů: 6 Forma
VícePokročilé AFM mody Příprava nosičů a vzorků. Verze 20110707 Jan Přibyl, pribyl@nanobio.cz
Pokročilé AFM mody Příprava nosičů a vzorků Verze 20110707 Jan Přibyl, pribyl@nanobio.cz bsah prezentace 1 Pokročilé AFM módy Kontaktní mód - Konstatní výška - Konstantní síla - Chybový profil - Modulace
VíceMáte rádi kuřata??? Jiří Hanika. Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i., Praha
Máte rádi kuřata??? Jiří Hanika Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i., Praha 1 Domácí chov? 2 Velkochov? 3 Budoucí rodinný oběd pro 4? 10 000 000 lidí si pochutná na více než 150 000 000 kuřat ročně!!!
VíceANALYSIS OF CYSTEINE, GLUTATHIONE AND PHYTOCHELATINS BY HIGH-PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY WITH ELECTROCHEMICAL DETECTION
ANALYSIS F CYSTEINE, GLUTATHINE AND PHYTCHELATINS BY HIGH-PERFRMANCE LIQUID CHRMATGRAPHY WITH ELECTRCHEMICAL DETECTIN ANALÝZA CYSTEINU, GLUTATHINU A FYTCHELATINU PMCÍ VYSK-ÚČINNÉ KAPALINVÉ CHRMATGRAFIE
VícePLNĚ AUTOMATIZOVANÁ IZOLACE CELKOVÉ mrna Z IN VITRO KULTIVOVANÝCH ROSTLIN VE SPOJENÍ S ELEKTROCHEMICKOU DETEKCÍ
PLNĚ AUTOMATIZOVANÁ IZOLACE CELKOVÉ mrna Z IN VITRO KULTIVOVANÝCH ROSTLIN VE SPOJENÍ S ELEKTROCHEMICKOU DETEKCÍ DALIBOR HÚSKA a, VOJTĚCH ADAM a,b, PETR BABULA c a RENÉ KIZEK a a Ústav chemie a biochemie,
VíceSeminář izolačních technologií
Seminář izolačních technologií Zpracoval: Karel Bílek a Kateřina Svobodová Podpořeno FRVŠ 2385/2007 a 1305/2009 Úpravy a aktualizace: Pavla Chalupová ÚMFGZ MZLU v Brně 1 Lokalizace jaderné DNA 2 http://www.paternityexperts.com/basicgenetics.html
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í I ti d j dělá á í Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním
VíceÚloha 5 k zápočtu z přednášky B130P16 (praktické základy vědecké práce)
Úloha 5 k zápočtu z přednášky B130P16 (praktické základy vědecké práce) Úkol: Sepište krátký rukopis vědeckého původního článku na téma "Směrovaný transport auxinu přes plazmatickou membránu hraje úlohu
VícePrvní testový úkol aminokyseliny a jejich vlastnosti
První testový úkol aminokyseliny a jejich vlastnosti Vysvětlete co znamená pojem α-aminokyselina Jaký je rozdíl mezi D a L řadou aminokyselin Kolik je základních stavebních aminokyselin a z čeho jsou odvozeny
VíceLABIFEL: Laboratoře Biofyzikální Chemie a Elektrochemie
LABIFEL: Laboratoře Biofyzikální Chemie a Elektrochemie doc. RNDr., CSc. doc. Jan Hrbáč, Dr., Mgr. Libor Gurecký, Bc. Aneta Večeřová, Markéta Bosáková CO? JAK? Protonační a komplexotvorné rovnováhy DNA,
VíceStruktura a ceník služeb Ústavu chemie a biochemie
ROZHODNUTÍ DĚKANA 1 / 2019 Struktura a ceník služeb Ústavu chemie a biochemie Ostatním součástem AF Určeno: č. j.: 19470/2019-291 ze dne: 28. 8. 2019 a MENDELU Zpracovatel: doc. RNDr. Ondřej Zítka, Ph.D.
VíceKOMPLEXY EUROPIA(III) LUMINISCENČNÍ VLASTNOSTI A VYUŽITÍ V ANALYTICKÉ CHEMII. Pavla Pekárková
KOMPLEXY EUROPIA(III) LUMINISCENČNÍ VLASTNOSTI A VYUŽITÍ V ANALYTICKÉ CHEMII Pavla Pekárková Katedra analytické chemie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Kotlářská 2, 611 37 Brno E-mail: 78145@mail.muni.cz
VíceU = E a - E k + IR Znamená to, že vložené napětí je vyrovnáváno
Voltametrie a polarografie Princip. Do roztoku vzorku (elektrolytu) jsou ponořeny dvě elektrody (na rozdíl od potenciometrie prochází obvodem el. proud) - je vytvořen elektrochemický článek. Na elektrody
VíceBÍLKOVINY R 2. sféroproteiny (globulární bílkoviny): - rozpustné ve vodě, globulární struktura - odlišné funkce (zásobní, protilátky, enzymy,...
BÍLKVIY - látky peptidické povahy tvořené více než 100 aminokyselinami - aminokyseliny jsou poutány...: R 1 2 + R 2 R 1 R 2 2 2. Dělení bílkovin - vznikají proteosyntézou Struktura bílkovin primární sekundární
VíceTématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky Obor Povinný okruh Volitelný okruh (jeden ze dvou) Forenzní biologická Biochemie, pathobiochemie a Toxikologie a bioterorismus analýza genové inženýrství Kriminalistické
VíceText zpracovala Mgr. Taťána Štosová, Ph.D PŘÍRODNÍ LÁTKY
Inovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie CZ.1.07/2.2.00/15.0324 Text zpracovala Mgr. Taťána Štosová, Ph.D PŘÍRODNÍ LÁTKY Obsah 1 Úvod do problematiky přírodních látek... 2 2 Vitamíny... 2 2.
VíceBílkoviny a rostlinná buňka
Bílkoviny a rostlinná buňka Bílkoviny Rostliny --- kontinuální diferenciace vytváření orgánů: - mitotická dělení -zvětšování buněk a tvorba buněčné stěny syntéza bílkovin --- fotosyntéza syntéza bílkovin
VíceHořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku
Hořčík Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku Příjem a pohyb v rostlině Příjem jako ion Mg 2+, pasivní, iont. kanály Mobilní ion v xylému i ve floému, možná retranslokace V místě funkce vázán
VíceJihočeská univerzita v Českých Budějovicích Zemědělská fakulta
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích OP Vzdělávání pro konkurenceschopnost CZ.1.072.4.00/12.0045 Koordinátor: Mgr. Martin Šlachta, Ph.D. Metodik: prof. Ing. Jan Frelich, CSc. Finanční manažerka:
VíceChemická reaktivita NK.
Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin Bi7015 Chemická reaktivita NK. Hydrolýza NK, redukce, oxidace, nukleofily, elektrofily, alkylační činidla. Mutageny, karcinogeny, protinádorově
VícePÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE Bakalářský studijní obor Bioorganická chemie a chemická biologie 2016
Kód uchazeče.. Datum.. PÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE Bakalářský studijní obor Bioorganická chemie a chemická biologie 016 1 otázek Maximum 60 bodů Při výběru z několika možností je jen jedna
VíceIntermediární metabolismus. Vladimíra Kvasnicová
Intermediární metabolismus Vladimíra Kvasnicová Vztahy v intermediárním metabolismu (sacharidy, lipidy, proteiny) 1. po jídle (přísun energie z vnějšku) oxidace CO 2, H 2 O, urea + ATP tvorba zásob glykogen,
VíceSíra. Deficience síry: řepka. - 0,2-0,5% SH, nedostatek při poklesu obsahu síranů pod 0,01% SH
Síra řepka - 0,2-0,5% SH, nedostatek při poklesu obsahu síranů pod 0,01% SH - toxicita není příliščastá (nad 4000 mg SO 4 2- l -1 ), poškození může vyvolat SO 2 (nad 1-1,5 mg m 3 1 ) fazol Deficience síry:
Více1) Pojem biotechnologický proces a jeho fázování 2) Suroviny pro fermentaci 3) Procesy sterilizace 4) Bioreaktory a fermentory 5) Procesy kultivace,
1) Pojem biotechnologický proces a jeho fázování 2) Suroviny pro fermentaci 3) Procesy sterilizace 4) Bioreaktory a fermentory 5) Procesy kultivace, růstové parametry buněčných kultur 2 Biomasa Extracelulární
VícePraktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie Nastavení průtokového cytometru a jeho
VícePLNĚ AUTOMATIZOVANÁ IZOLACE CELKOVÉ mrna Z IN VITRO KULTIVOVANÝCH ROSTLIN VE SPOJENÍ S ELEKTROCHEMICKOU DETEKCÍ. univerzita, Zemědělská 1, 613 00 Brno
PLNĚ AUTOMATIZOVANÁ IZOLACE CELKOVÉ mrna Z IN VITRO KULTIVOVANÝCH ROSTLIN VE SPOJENÍ S ELEKTROCHEMICKOU DETEKCÍ Dalibor Húska 1, Vojtěch Adam 1,2, Petr Babula 3, René Kizek 1 1 Ústav chemie a biochemie
VícePřehled pedagogické činnosti - doc. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.
Přehled pedagogické činnosti - doc. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D. Pedagogická činnost Akademický rok 2003/2004 Přednáška: Biofyzikální chemie (C260P43) volitelná pro všechny obory rozsah: 2/1, Zk, letní semestr
VícePokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii
Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1/1 Proč biofyzikální metody? Biofyzikální metody využívají fyzikální principy ke studiu biologických systémů Poskytují kvantitativní
VíceMATEMATICKÁ BIOLOGIE
INSTITUT BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita MATEMATICKÁ BIOLOGIE Přírodovědecká fakulta Masarykova univerzita, Brno Studijní obor Matematická biologie Masarykova
VíceFAF UK NABÍDKA SPOLUPRÁCE. Alexandr Hrabálek
FAF UK NABÍDKA SPOLUPRÁCE Alexandr Hrabálek Farmaceutická fakulta UK v Hradci Králové Největší farmaceutická fakulta v ČR Jedna z vědecky nejvýkonnějších institucí v rámci UK Akreditovány 4 doktorské studijní
VíceBiologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat
Biologie buňky 1665 - Robert Hook (korek, cellulae = buňka) Cytologie - věda zabývající se studiem buňek Buňka ozákladní funkční a stavební jednotka živých organismů onejmenší známý uspořádaný dynamický
VíceUrčení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi
Cvičení Určení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi ) 1)( ( ) ( H m z H m z M k j j j m z z zh M Molekula o hmotnosti M se nabije z-krát protonem, pík iontu ve spektru je na m z : ) ( H m z M z Pro dva
Víceenergetického využití odpadů, odstraňování produktů energetického využití odpadů, hodnocení dopadů těchto technologií na prostředí.
Příjemce projektu: Partner projektu: Místo realizace: Ředitel výzkumného institutu: Celkové způsobilé výdaje projektu: Dotace poskytnutá EU: Dotace ze státního rozpočtu ČR: VŠB Technická univerzita Ostrava
VíceKód Studijní program Studijní obor Studium v AJ. Forma studia Forma přijímací zkoušky. Počet přijímaných studentů
P5206 Farmacie Farmaceutická analýza ano P ústní 6 Instrumentální metody používané v kvalitativní a kvantitativní analýze, základy chemické analýzy, lékopisné kontrolně-analytické metody hodnocení léčiv.
Více