3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

Podobné dokumenty
3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

Paleogenetika člověka

3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

Genetické rozdíly mezi populacemi aneb něco o migracích a genovém toku. Genetické rozdíly mezi populacemi

Zajímavost -mtdna a Y v R

Co víme o původu psa na základě analýzy DNA

Kolik jsme měli předků?

1) Velikost populace a demografická historie. 1) Velikost populace a demografická historie. 1) Velikost populace a demografická historie

Jak měříme genetickou vzdálenost a co nám říká F ST

Metody studia historie populací. Metody studia historie populací

Analýza archaické DNA

Evoluce člověka a její modely

Evoluce člověka a její modely

Populační genetika a fylogeneze jedle bělokoré analyzována pomocí izoenzymových genových markerů a variability mtdna

Co víme o původu psa na základě analýzy DNA

Testování lidské identity

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,

Populační genetika III. Radka Reifová

Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin

Jak to, že máme spole ného p edka?

Genotypy absolutní frekvence relativní frekvence

Jak jsme osídlili svět podle mtdna a chromozomu Y

Jak jsme osídlili svět podle mtdna a chromozomu Y

Coalesce spojit se, splynout, sloučit se. Didaktická simulace Coalescence = splynutí linií

Migrace. 1) Jednosměrná migrace. 2) Obousměrná migrace. 3) Genový tok a historie populací. 4) Migrace a genetická odlišnost mezi populacemi

Bi5130 Základy práce s lidskou adna

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

Metody studia historie populací. Metody studia historie populací. 1) Metody studiagenetickérozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky.

FYLOGEOGRAFIE A KOALESCENCE

Osud jednotlivých kopií genů v populaci genové stromy

Genetický polymorfismus

Úvod do studia historie moderního člověka

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?

Pes. Moje oblíbené zvíře

Mgr. et Mgr. Lenka Falková. Laboratoř agrogenomiky. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita

Metody studia historie populací

Genetická determinace zbarvení vlasů u člověka. Genetická determinace zbarvení očí u člověka

Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.

Předmět:: Zeměpis. Opakování učiva z 6. ročníku Informační zdroje v geografii Mapy. Pojem: světadíl, oceán, kontinent

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Intervalové odhady. Interval spolehlivosti pro střední hodnotu v N(µ, σ 2 ) Interpretace intervalu spolehlivosti. Interval spolehlivosti ilustrace

Intervalové odhady. Interval spolehlivosti pro střední hodnotu v N(µ, σ 2 ) Interpretace intervalu spolehlivosti. Interval spolehlivosti ilustrace

Předmět:: Zeměpis. Informační zdroje v geografii. Činnosti s mapami, grafy, diagramy a se zeměpisnými atlasy

"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy

Testování hypotéz. 1. vymezení základních pojmů 2. testování hypotéz o rozdílu průměrů 3. jednovýběrový t-test

Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae).

Genetická diverzita masného skotu v ČR

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

Základní pojmy obecné genetiky, kvalitativní a kvantitativní znaky, vztahy mezi geny

Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis.

Paleolitická adna. Mitochondriální DNA Nukleární DNA Y Porovnání současné DNA (Paleogenetika, National Geographic )

Základní pravidla dědičnosti

LEKCE 5 STATISTICKÁ INFERENCE ANEB ZOBECŇOVÁNÍ VÝSLEDKŮ Z VÝBĚROVÉHO NA ZÁKLADNÍ SOUBOR

Genetika populací. KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Crossing-over. Synaptonemální komplex. Crossing-over a výměna genetického materiálu. Párování homologních chromosomů

Základy ekonometrie. XI. Vektorové autoregresní modely. Základy ekonometrie (ZAEK) XI. VAR modely Podzim / 28

Jednostranné intervaly spolehlivosti

Analýza archaické DNA

EXPERIMENTÁLNÍ MECHANIKA 2 Přednáška 5 - Chyby a nejistoty měření. Jan Krystek

Statistické vyhodnocení průzkumu funkční gramotnosti žáků 4. ročníku ZŠ

geneticko-genealogický projekt

Zadavatel: KRONEN LABE spol. s r. o. Tylova 410/24, Trmice

Statistika. Teorie odhadu statistická indukce. Roman Biskup. (zapálený) statistik ve výslužbě, aktuálně analytik v praxi ;-) roman.biskup(at) .

Biologie - Oktáva, 4. ročník (přírodovědná větev)

Kategorická data METODOLOGICKÝ PROSEMINÁŘ II TÝDEN 7 4. DUBNA dubna 2018 Lukáš Hájek, Karel Höfer Metodologický proseminář II 1

Biologie - Oktáva, 4. ročník (humanitní větev)

Populační genetika II

MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST

Malcomber S.T. (2000): Phylogeny of Gaertnera Lam. (Rubiaceae) based on multiple DNA markers: evidence of a rapid radiation in a widespread,

Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/

POKRÝVKA HLAVY Thor Ewing

GENETIKA 1. Úvod do světa dědičnosti. Historie

Jednofaktorová analýza rozptylu

Cvičení č. 8. KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek

Zesouladení ( sjednocení ) poznatků genetiky a evolucionistických teorií

Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY

Inferenční statistika - úvod. z-skóry normální rozdělení pravděpodobnost rozdělení výběrových průměrů

STATISTICKÉ ODHADY Odhady populačních charakteristik

Test z teorie VÝBĚROVÉ CHARAKTERISTIKY A INTERVALOVÉ ODHADY


Hardy-Weinbergův zákon - cvičení

Paleolitická kolonizace

Jak se matematika poučila v biologii

Chromozomální aberace nalezené u párů s poruchou reprodukce v letech

Molecular Ecology J. Bryja, M. Macholán MU, P. Munclinger - UK

Dobývání znalostí. Doc. RNDr. Iveta Mrázová, CSc. Katedra teoretické informatiky Matematicko-fyzikální fakulta Univerzity Karlovy v Praze

Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok A) Molekulární genetika

Ekologické a evoluční aspekty genetiky

Úvod do teorie odhadu. Ing. Michael Rost, Ph.D.

Tabulka 1 Rizikové online zážitky v závislosti na místě přístupu k internetu N M SD Min Max. Přístup ve vlastním pokoji ,61 1,61 0,00 5,00

Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/

2. Z následujících tvrzení, týkajících se prokaryotické buňky, vyberte správné:

Příloha IV. Vědecké závěry a zdůvodnění změny podmínek rozhodnutí o registraci

Sociologický výzkum (stručný úvod) Michal Peliš

Bi5130 Základy práce s lidskou adna

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

HUMÁNNÍ GEOGRAFIE SEMINÁŘ

Základy genetiky populací

Transkript:

Hledání našeho společného předkap 1) Jak to, že máme společného předka 2) Metodika výzkumu mtdna 3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila 4) Problémy a názory proti 5) Analýza chromozomu Y 6) Jak jsme osídlili svět podle mtdna a chromozomu Y 7) Další analýzy a co z toho vyplývá 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR

Problém: Analýzou mtdna a chromozomu Y však sledujeme buď evoluční historii žen nebo mužů pohlaví se mohou v různých populacích lišit mírou, jakou se uplatňují na genovém toku ať už v rámci populace nebo mezi populacemi patriarchát vs. matriarchát pohyb např. mužů za obchodem v patriarchální společnosti na genovém toku se pak uplatňují více než ženy vedení válek z poražené populace je asimilováno pouze malé procento mužů, avšak většina žen je včleněna do vítězné populace = větší podíl na genovém toku tak mají ženy z poražené populace než jejich muži

Výsledky dalších analýz Hledání našeho společného předka Diploidní znaky (dědí se od obou rodičů), jaderné geny Wei Huang et al. (1998) gen ZFX, společný předek žil před 306 000 lety (162 000 až 952 000) Ingman et al. (2000) analyzovali oblast Xq13.3, společný předek žil před 479 000 let Rosalinda Harding et al. (1997) gen pro beta-globin, stáří společného předka odhadli na 750 000 (400 000 až 1 300 000) Oponenti výsledky pro diploidní a jaderné markery se liší od mtdna a chr. Y = nepodporují model nahrazení tyto výsledky jsou 4x větší avšak u těchto znaků se nejedná o uniparentální dědičnost, nutný přepočet pro beta-globin 750 000 / 4 = 187 500 pro ZFX a Xq13.3 306 000 / 3 = 102 000 a 479 000 / 3 = 159 666

Přehled výsledků výpočtů stáří společného předka moderního člověka mtdna Cann et al. 1987 214 000 let (teorie koalescence 290 000 let) Vigilantová et al. 1991 208 000 let (tk 225 000) Ingmann et al. 2000 171 500 let (kódující oblast mtdna) Chromozom Y Dorit et al. 1995 270 000 let (intronová sekvence) Hammer 1995 188 000 let (nekódující fragment) Hammer et al. 1998 147 000 let (široký polymorfizmus) Underhill et al. 1997 162 000 let (široký polymorfizmus) 186 000 let (široký polymorfizmus) Thomson et al. 2000 59 000 let (3 geny) Underhill et al. 2000 62 000 let (NRY) ZFX Huang et al. 1998 102 000 let Xq13.3 Ingman et al. 2000 159 666 let Gen pro beta-globin Hardingová et al. 1997 187 000 let kódující sekvence - mají nižší variabilitu

Shrnutí výsledky a závěry analýzy mtdna a chromozomu Y jsou navzájem kompatibilní = = můžeme je považovat za správné (včetně diploidních a jaderných znaků) společný předek moderních lidí žil v Africe - Model afrického původu = OK - Multiregionální model = OK + i jinde společný předek žil v Africe zhruba před 200 000 lety vezmeme-li však v úvahu rozptyl pro 95% interval spolehlivosti, pak se údaje vzdalují od modelu afrického původu a přibližují se k multiregionálnímu modelu nebo podporují další model Out of Africa again and again na základě geografického výskytu jednotlivých haploskupin lze rekonstruovat osidlování jednotlivých regionů z Afriky do Asie postup migrace

Shrnutí Pozoruhodný výsledek Hardingová et al. (1997) získali analýzou sekvencí genu pro beta-globin zajímavé výsledky právě ve vztahu ke geografické distribuci výskyt jimi nalezených haplotypů naznačuje, že před více než 200 000 lety existovala starobylá populace předků nejenom v Africe, ale také v Asii specifické asijské haplotypy starší 200 000 let pak jsou zde ale také haplotypy rozšířené po celém světě to možná naznačuje opakovaný genový tok tam a zpět mezi Afrikou a Asií to je v rozporu s modelem nahrazení, který uvažuje pouze jednosměrný genový tok z Afriky do Asie

Shrnutí Zpochybnění modelu nahrazení Z výsledků Templetona (omezený genový tok mezi Asií a Afrikou), Hammera (chr. Y) a Hardingové (beta-globin) vyplývá, že: naše zjednodušená představa o oddělení zakladatelské populace/populací s následnou izolací nemusí být zcela správná naši moderní předchůdci mohli žít na minimálně dvou místech v Africe a Asii = vše ukáží až další výsledky a pozorování (doposud žádný nový důkaz) Pravděpodobný závěr: asijské populace mají buď původ africký nebo mají původ čistě asijský (asijský předek) a africké znaky jsou u nich důsledkem opakovaného jednostranného genového toku a migrací (při oboustranném by byly asijské haplotypy v Africe x vzdálenost) evropské populace mají africký a asijský původ vznikly migrací z Afriky přes Asii, v Evropě pak nahradily neandrtálské populace

Shrnutí Tyto analýzy poskytují zajímavé výsledky, ale samy o sobě nestačí k úplnému a uspokojivému vysvětlení původu moderního člověka. Neboli výsledky jsou jasné, obtížná a nejasná je však již jejich interpretace

Celkový závěr: Zatím tedy ještě nelze uspokojivě odpovědět, který ze dvou základních modelů původu moderního člověka je správný. Out of Africa x Multiregionální model Hledání společného předka