Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice

Podobné dokumenty
Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice. konfigurace na dvojné vazbě a na šestičlenných kruzích konformace furanosového kruhu TOCSY

Základní parametry 1 H NMR spekter

LEKCE 1b. Základní parametry 1 H NMR spekter. Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

3. Konformační analýza alkanů a cykloalkanů

Nukleární Overhauserův efekt (NOE)

Základní parametry 1 H NMR spekter

Nukleární magnetická rezonance (NMR)

Studium komplexace -cyklodextrinu s diclofenacem s využitím NMR spektroskopie

LEKCE 7. Interpretace 13 C NMR spekter. Využití 2D experimentů. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova) ppm

LEKCE 3b. Využití 2D experimentů k přiřazení složitější molekuly. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova) ppm

Měření a interpretace NMR spekter

Měření a interpretace NMR spekter

O Minimální počet valencí potřebných ke spojení vícevazných atomů = (24 C + 3 O + 7 N 1) * 2 = 66 valencí

Měření a interpretace NMR spekter

spinový rotační moment (moment hybnosti) kvantové číslo jaderného spinu I pro NMR - jádra s I 0

Nukleární Overhauserův efekt (NOE)

Spektra 1 H NMR. Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský

LEKCE 2b. NMR a chiralita, posunová činidla. Interpretace 13 C NMR spekter

Metody spektrální. Metody molekulové spektroskopie NMR. Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti

Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek

Základy NMR 2D spektroskopie

Strukturní analýza. NMR spektroskopie

Postup při interpretaci NMR spekter neznámého vzorku

Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů

COSY + - podmínky měření a zpracování dat ztráta rozlišení ve spektru. inphase dublet, disperzní. antiphase dublet, absorpční

12.NMR spektrometrie při analýze roztoků

SPEKTROSKOPIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE

Symetrie molekul a stereochemie

OPVK CZ.1.07/2.2.00/

Symetrie molekul a stereochemie

Techniky měření a interpretace NMR spekter. Bohumil Dolenský VŠCHT Praha místnost A28 linka 4110

ZÁKLADY KONFORMAČNÍ ANALÝZY CYKLOHEXANU

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Naše NMR spektrometry

Spektrální metody NMR I. opakování

Digitální učební materiály slouží k zopakování a k testování získaných znalostí a dovedností.

Laboratoř NMR Strukturní analýza a 2D NMR spektra

Výpočet stechiometrického a sumárního vzorce

DRUHY ISOMERIE. KONSTITUČNÍ IZOMERY Stejný sumární vzorec, ale rozdílné pořadí atomů a vazeb KONFORMAČNÍ IZOMERY

ISOMERIE SPOUSTA VĚCÍ V PŘÍRODĚ VYPADÁ PODOBNĚ, ALE VE SKUTEČNOSTI JSOU NAPROSTO ODLIŠNÉ!

Gymnázium Jiřího Ortena, Kutná Hora

Organická chemie - úvod

Metody pro studium pevných látek

Techniky měření a interpretace NMR spekter

E K O G Y M N Á Z I U M B R N O o.p.s. přidružená škola UNESCO

Chemická struktura. Stereochemie Strukturní chemie Strukturní biologie (Nature Structural Biology Nature Structural and Molecular Biology)

Autor: martina urbanová, jiří brus. Základní experimentální postupy NMR spektroskopie pevného stavu

Nukleární magnetická rezonance (NMR)

ZÁKLADNÍ EXPERIMENTÁLNÍ

Využití NMR spektroskopie pro studium biomakromolekul RCSB PDB

H 2 O, H + H 2 O, H + oligosacharidy. Příklad: hydrolýza škrobu (polysacharid) přes maltosu (disacharid) na glukosu (monosacharid).

NMR spektroskopie Instrumentální a strukturní analýza

NMR spektroskopie. Úvod

Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek

OBECNÁ CHEMIE. Kurz chemie pro fyziky MFF-UK přednášející: Jaroslav Burda, KChFO.

MATURITNÍ TÉMATA - CHEMIE. Školní rok 2012 / 2013 Třídy 4. a oktáva

Frekvenční analýza optických zobrazovacích systémů

Korelační spektroskopie jako základ multidimensionální NMR spektroskopie

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK. Anotace. Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí Osvobození 20. Číslo projektu:

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti LC-NMR 1. Jan Sýkora

Dvourozměrná NMR spektroskopie metody

Stereochemie. Přednáška 6

Seminář NMR. Mgr. Zdeněk Moravec, Ph.D.; Ústav chemie, PřF MU,

Školní vzdělávací program

Elektronové posuny. Indukční efekt (I-efekt) Indukční a mezomerní efekt. I- efekt u substituovaných karboxylových kyselin.

Třídění látek. Chemie 1.KŠPA

Stereochemie. Jan Hlaváč

NMR biomakromolekul RCSB PDB. Progr. NMR

Organická chemie - úvod

Pericycklické reakce

Chemická výměna. K ex K B

Heteronukleární korelační experimenty

INTERPRETACE INFRAČERVENÝCH SPEKTER

Dolenský, VŠCHT Praha, pracovní verze 1

Základy Mössbauerovy spektroskopie. Libor Machala

Sada 7 Název souboru Ročník Předmět Formát Název výukového materiálu Anotace

Stereochemie 7. Přednáška 7

3. Kmitočtové charakteristiky

Izomerie Reakce organických sloučenin Názvosloví organické chemie. Tomáš Hauer 2.LF UK

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

molekul organických sloučenin

4. Úvod do stereochemie organických sloučenin

I N V E S T I C E D O R O Z V O J E V Z D Ě L Á V Á N Í

Metody pro studium pevných látek

17. Organické názvosloví

PRAKTIKUM I. Oddělení fyzikálních praktik při Kabinetu výuky obecné fyziky MFF UK. Pracoval: Pavel Ševeček stud. skup.: F/F1X/11 dne:

Sekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch

N A = 6, mol -1

SADA VY_32_INOVACE_CH2

Úvod do studia organické chemie

Od kvantové mechaniky k chemii

Experimentální data pro určení struktury proteinu

LEKCE 2a. Interpretace 13 C NMR spekter. NMR a chiralita, posunová činidla. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova)

12. Predikce polymorfů. Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253

NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÁ REZONANČNÍ SPEKTROMETRIE

Chemický posun v uhlíkových NMR spektrech

SEMESTRÁLNÍ PRÁCE Z PŘEDMĚTU NÁVRH A ANALÝZA ELEKTRONICKÝCH OBVODŮ

Transkript:

LEKCE 9 Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice konfigurace na dvojné vazbě a na šestičlenných kruzích konformace furanosového kruhu TCSY T E E 1 E 1 T 0 6 T E 1 T 0 88 7 0 T E 0 0 E T 0 5 108 0 T 1 E 16 1 E 1 T E 180 T E T 1

Karplusova rovnice ve strukturní analýze J(,) = A + B cos C cos praxe A, B, C... empirické konstanty J 180 > J 0 J(trans) > J (cis) teorie Konfigurace alkenů J(cis): 6-1 z (obvykle 10) J(trans): 1-0 z (obvykle 16) J(cis) J(trans)

Konformace alkánů 180 o 0 o 60 o střídavá zákrytová gauche J(trans) > J(cis) > J(gauche) > J(90 o ) 0

Konfigurace na šestičlenných kruzích J(aa) > J(ae) = J(ee) J(aa): 10-16 z (obvykle 7-9) = 180 o J(ae) = J(ee): - 5 z (obvykle - 5) = 60 o

Konfigurace na pyranosovém kruhu Jaké je zastoupení anomerů D-glukopyranosy v roztoku D? - 1-1 J = 7.9 z J =.7 z

Anisotropní efekt anomerních protonů 5.18 ppm.97 ppm.78 ppm.69 ppm

Konfigurace na pyranosovém kruhu 6 5 9.6 z.0 z dd ddd 1.8 z.0 z 1.8 z J(,eq) = J(,ax) = J(ax,eq) = J(eq,) = J(ax,) = J(,5ax) J(,5eq) = J(5ax,5eq) J(5ax,6) J(5eq,6) = m 5 1.8 z 1.7 z 9.6 z ddd 1 z 5 ddd

Případ konformační rovnováhy.6 z eq 5. z.6 z 7. z 1.9 z dd ddd ax 5. z 5.9 z 1.9 z ddd Et C 6 5 R Et Et Et R R cis trans Et Et R R J(,eq) =.6 z J(,ax) = 5. z J(ax,eq) = 1.9 z J(eq,) = 7. z J(ax,) = 5.9 z

6a, 6b Ac Ac 5 Ac Ac dečítání interakčních konstant J(6a,6b)=10.8 z J(6a,5)= 7.6z J(6b,6a)=11.8 z J(6a,5)= 5.0z J(,)=1.1 z J(,)=1.0 z J(,)=.9 z J(,)=.8 z J(,5)=. z J(5,)=? J(5,6a)=? J(5,6b)=? 5 6a 6b odečet J není přesný J v interagujících multipletech nejsou totožné J složitějších multipletů nelze odečíst vůbec získání přesných hodnot J: simulací spinových systémů (např. Mnova, Perch)

Spinová simulace (Mnova) Naměřené spektrum 6a, 6b 5 5 Simulované spektrum 6a 6b

Konformace furanosového kruhu cyklopentan - nelze rozlišit konformery zavedení substituentu nebo heteroatomu do cyklopentanového kruhu má za následek zvýšení energetické bariéry možnost identifikace konformerů furanosový kruh - většinou není planární - vyskytuje se ve dvou konformacích E, T obálková (E, envelope) zkřížená položidlička (T, twist ) E 1 E T C 5 ' N ' ' 1'

Pseudorotační itinerář přechody mezi konformery furanosového kruhu lze popsat v pseudorotačním itineráři prostřednictvím nezávislých parametrů: fázovým úhlem pseudorotace P (poloha v pseudorotačním itineráři) pucker amplitudou m (vychýlení atomů z roviny) 1 T 0 E 0 1 T 1 E 88 E T E 0 6 T 7 E 0 T 0 E většina furanos: P = 0-6 o - N typ P = 1-180 o - S typ m = - o T 0 5 108 0 T 1 E 16 1 E 1 T 180 T 1 E T E

Výpočet konformace furanosového kruhu (zobecněná Karplusova rovnice) předpoklad: furanosa se vyskytuje v 1 konformaci zobecněná Karplusova rovnice (aasnoot, Leeuw, Altona): respektuje počet, elektronegativity a orientace substituentů byl parametrizován použitím geometrických dat (X-ray) a experimentálních hodnot J(,) velkého souboru sloučenin J(a,b) = P1 cos P cos P + i (P + P5 cos ( i + P6 i ))

Výpočet konformace furanosového kruhu (parametry) J(a,b) = P1 cos P cos P + i (P + P5 cos ( i + P6 i )) i = i -P7 i,j i, i,j rozdíly ugginsových elektronegativit mezi nebo substituentem a vodíkem: 1. (), 0. (C), 0.85 (N), -0.05 (P) i parametr, který vyjadřuje orientaci substituentu: i = +1, je-li úhel a -C-S i = +10 o i = -1, je-li úhel a -C-S i = -10 o odnoty parametrů P1 až P7 závisí na počtu substituentů Počet P1 P P P P5 P6 P7 substituentů 1.89-0.96 0 1.0 -.0 1.9 0. 1. -0.99 0 0.87 -.6 19.9 0.00 1. -0.91 0 0.5 -.1 15.5 0.19

Výpočet konformace furanosového kruhu (schematický postup při výpočtu) Experimentálně zjištěné interakční konstanty Karplusova rovnice Dihedrální úhly Empirický vztah mezi dihedrálními úhly a konformační parametry pro příslušnou furanosu 1 =. + 1.10 m cos (P - 1) např. -D-xylosa: = -119.8 +1.090 m cos P = -.9 + 1.095 m cos (P + 1) Konformační parametry P, m

Výpočet konformace furanosového kruhu (příklad) R N N 1 naměřené interakční J(1,) =.6 konstanty J(,): J(,) = 0.5 R J(,) =.5 R = CEt C C Výpočet vlivu elektronegativity i na segmentech C 1 -C, C -C, C -C : J(,5a) =. J(,5b) = 0 i = i -P7 i,j 1. (), 0. (C), 0.85 (N) C N C C C 1 C C 1 C 1 C C C C C C 1 N C 1 N C 1 C C 1 C C N N 5 1 C C 5 N 5 1 = 1. - 0.19 * 0. = 1. = 0. - 0.19 * (0.85 + 0.) = 0.61 = 1. - 0.19 * 0. = 1. = 1. - 0.19 * 0. = 1. 1 = 0. - 0.19 * (1. + 1.) = -0.09 = 0.85-0.19 * (0. + 0.85) = 0.61 = 1. - 0.19 * 0. = 1. = 0. - 0.19 * (0. + 1.) = 0.077 1 = 0.85-0.19 * (0.85 + 0.) = 0.61 = 0. - 0.19 * 0.85 = 0.9 = 0. - 0.19 * (0. + 1.) = 0.077 = 1. - 0.19 * 0. = 1.

Výpočet konformace furanosového kruhu (výsledky) P = 57.5 o m = 6.5 o severní typ pravděpodobná konformace:e E T E N CEt 1 E 1 T 0 6 T E EtC N 1 T 0 88 7 0 T C E 0 T 0 5 108 0 E 0 T 1 C E 16 1 E 1 T E 180 T E T 1 Dvořáková, ana, Moravcová, Jitka, nepublikované výsledky.

Výpočet konformace furanosového kruhu (ověření výsledků) Jak víme, že se furanosa vyskytuje v jedné konformaci? při výpočtu P a m fit konverguje, vede k minimu výpočet vede ke konformacím N nebo S typu, které se vyskytují nejčastěji: P = 0-6 o - N typ, P = 1-180 o - S typ pokud výpočet nekonverguje nebo P nemá uvedené hodnoty, zvažujeme: - jedná se skutečné o 1 konformer (X-ray, simulace)? - jedná se o konformační rovnováhu? N- konformer S- konformer Výpočet konformační rovnováhy je obtížnější!!!!! pozorované interakční konstanty jsou průměrné hodnoty J obs = X N J N +(1-X N )J S,X N... molární zlomek N- konformeru vicinální interakční konstanta je tedy funkcí příslušných konformačních parametrů J(a,b) = f( P N, N, P S, S, X N )

TCSY (Ttal Correlation SpectroscopY) využití koherentního přenosu magnetizace zprostředkovaného interakční konstantou z z y x 90 B SL (x) y B SL B o B SL 100 až 800 Mz až 5 kz využití spin-locku (práce při nižších polích) B SL << B 0 chemických posunech minimalizace rozdílu v A B C D X J nezávisí na externím poli magnetizace (koherence) volně přechází mezi spiny v rámci spinového systému (množina NMR aktivních jader, ve které jsou členové provázání J-interakcemi)

TCSY vs. CSY C C ar. -C=C C C 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0.5.0.5.0.5.0 1.5 1.0 TCSY přenos

Využití TCSY k přiřazení 1 signálů pyranos eqme 5 6 R Et eq CSY přenos TCSY přenos 5ax ax eq 5eq ax ax 6 diagonalní krospík

Využití TCSY k přiřazení 1 signálů maltosy 6' C 6 C ' 5' 1 ' ' 1' 5

Využití TCSY k přiřazení 1 signálů maltosy 5, 6 1 1 5 6 6 6' C 6 C 1 1 ' 5' 1 ' ' 1' 5 5, 6 5 6 6 1 1