Bioptická laboratoř s.r.o. a Šiklův ústav patologie Lékařské fakulty UK v Plzni

Podobné dokumenty
Sekreční karcinom slinných žláz: využití genomového profilování v personalizaci onkologické léčby: analýza 49 případů sekvenováním nové generace (NGS)

Změna paradigmatu testování HER- 2/neuu karcinomu prsu. u koho a jak?

Novinky WHO klasifikaci tumorů hlavy a krku

histopatologické klasifikace karcinomu prsu

VÝZNAM DETEKCE MUTACÍ C-KIT ONKOGENU U ADENOIDNĚ CYSTICKÝCH KARCINOMŮ SLINNÝCH ŽLÁZ. M.Brož, I.Stárek, T.Bakaj

Patologie a klasifikace karcinomu prostaty, Gleasonův systém. MUDr. Marek Grega. Ústav patologie a molekulární medicíny 2. LF UK a FN v Motole

Diagnostika genetických změn u papilárního karcinomu štítné žlázy

Laboratoř molekulární patologie

Změny ve vyšetřovacích postupech nemalobuněčných plicních karcinomů: Never-endingstory -verze 2018

Informační hodnota core cut biopsií mammy. I. Julišová, Trnková M., Juliš I. Biolab Praha V. Pecha DTC Praha

Přínos molekulární genetiky pro diagnostiku a terapii malignit GIT v posledních 10 letech

Intraduktální proliferující léze mléčné žlázy. Dušan Žiak

Studium genetické predispozice ke vzniku karcinomu prsu

RESIDENT S SHORT REVIEW

Patologie nádorů v 21. století problémy a úskalí diagnostiky a úhradového systému

VÝSLEDKY FISH ANALÝZY U NEMOCNÝCH S MM ZAŘAZENÝCH VE STUDII CMG 2002 VÝZKUMNÝ GRANT NR/ CMG CZECH GROUP M Y E L O M A Č ESKÁ MYELOMOVÁ SKUPINA

Sondy k detekci aneuploidií a mikrodelečních syndromů pro prenatální i postnatální vyšetření

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2007: CGB laboratoř a.s Kořenského 10, Ostrava, Vítkovice

Molekulárně biologické a cytogenetické metody

1.1 Nadpočetný prs nebo bradavka

BUNĚČNÁ TRANSFORMACE A NÁDOROVÉ BUŇKY

Testování biomarkerů u kolorektálního karcinomu.

ONKOGENETIKA. Spojuje: - lékařskou genetiku. - buněčnou biologii. - molekulární biologii. - cytogenetiku. - virologii

Metody detekce molekulárních prognostických a prediktivních markerů v diagnostice adenoidně cystického karcinomu slinných žláz

Mgr. Veronika Peňásová Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno

HER2 diagnostika v ČR - současný stav a očekávání do budoucnosti

1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně

Novinky ve WHO klasifikaci dětských nádorů CNS

Zuzana Zemanová 1, Filip Kramář 2

Buněčné kultury. Kontinuální kultury

Nestabilita genomu nádorových n buněk mutace a genové či i chromosomové aberace jedna z nejdůle ležitějších událost lostí při i vzniku maligního proce

Registr Herceptin Karcinom prsu

Klasifikace nádorů varlat

Staging adenokarcinomu pankreatu

Patologie prsu. záněty fibrocystické změny - neproliferativní - proliferativní nádory - epitelové - fibroepitelové

METODY MOLEKULÁRNÍ PATOLOGIE. Mgr. Jana Slováčková, Ph.D. Ústav patologie FN Brno

8. Východoslovenský bioptický seminár SD IAP, Košice Květa Michalová

CADASIL. H. Vlášková, M. Boučková Hnízdová, A. Loužecká, M. Hřebíček, R. Matěj, M. Elleder

Základy molekulární patologie nádorových onemocnění. Molekulárně biologické metody používané v molekulární patologii.

Biomarkery - diagnostika a prognóza nádorových onemocnění

Personalizovaná medicína Roche v oblasti onkologie. Olga Bálková, Roche s.r.o., Diagnostics Division Pracovní dny, Praha, 11.

% maligních nádorů u muže 4 % maligních nádorů urogenitálního traktu 5x větší incidence u bělochů než černochů. Česká republika (2000)

Metastatický renální karcinom Andrašina Tomáš

Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok A) Molekulární genetika

Chromosomové změny v plasmatických buňkách u nemocných s mnohočetným myelomem detekované metodou FISH

seminář ENTOG,

K. Rauš PČLS/NNB/ÚPMD/Karlova Universita, Praha. Preventivní chirurgické zákroky u žen s vysokým rizikem vzniku CA prsu a ovaria

Seznam vyšetření. Nesrážlivá periferní krev nebo kostní dřeň

Seznam vyšetření. Detekce markerů: F2 (protrombin) G20210A, F5 Leiden (G1691A), MTHFR C677T, MTHFR A1298C, PAI-1 4G/5G, F5 Cambridge a Hong Kong

NGS analýza dat. kroužek, Alena Musilová

Benigní endometriální polyp

Sklíčkový seminář. Případ č Květa Michalová

Cytogenetické vyšetřovací metody v onkohematologii Zuzana Zemanová

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

VYUŽITÍ CYTOLOGICKÝCH A MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÝCH METOD PŘI DETEKCI NÁDORŮ Definice problematiky Profil přístupů Nádorová heterogenita

HD - Huntingtonova chorea. monogenní choroba HDF (CAG) 6-35 (CAG) čistě genetická choroba?

Elementy signálních drah. cíle protinádorové terapie

HODNOCENÍ CYTOGENETICKÝCH A FISH NÁLEZŮ U NEMOCNÝCH S MNOHOČETNÝM MYELOMEM VE STUDII CMG ORGANIZACE VÝZKUMNÉHO GRANTU NR/

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU

Biologická léčba karcinomu prsu. Prof. MUDr. Jitka Abrahámová, DrSc. Onkologická klinika 1.LF UK a TN KOC (NNB+VFN+TN)

Předmluva 11. Seznam použitých zkratek 13. Úvod 17

EKONOMICKÉ ASPEKTY GENETICKÝCH VYŠETŘENÍ. I. Šubrt Společnost lékařské genetiky ČLS JEP

Buněčné kultury Primární kultury

Co mě může potkat při návratu onemocnění. Nové přístupy biologická léčba karcinomu prostaty. MUDr. Hana Študentová, Ph.D.

VÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII

VII. Meziregionální bioptický seminář. Případ č.11 Referuje MUDr.Fakhouri Připravil MUDr.Buzrla, MUDr.Fakhouri

Karcinom vaječníků. Představení nemoci

Jana Krejčová MOLEKULÁRNÍ PATOLOGIE ZAČÁTKU III. TISÍCILETÍ: VYUŽITÍ BIOPTICKÝCH VZORKŮ PRO MOLEKULÁRNÍ ANALÝZU. Workshop dubna 2005 Olomouc

Funkční poruchy. hypofunkce hyperfunkce. Eufunkční struma Záněty Nádory

ORL SEMINÁŘ - KAZUISTIKA

Beličková 1, J Veselá 1, E Stará 1, Z Zemanová 2, A Jonášová 2, J Čermák 1

MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE. 2. Polymerázová řetězová reakce (PCR)

UPOZORNĚNÍ PRO STUDENTY

Patologie krevního ústrojí. II. histologické praktikum 3. ročník všeobecného směru

Co by měl klinik vědět o patologické anatomii NETů a GISTů? Leoš Křen, Ústav patologie FN Brno

MÉNĚ OBVYKLÉ ÚTVARY MĚKKÝCH TKÁNÍ KRKU. MUDr. Jarmila Broulová Ústí nad Labem

ZÁPIS z XIX. pracovního setkání fóra onkologů a zástupců zdravotních pojišťoven Brno

Gynekopatologie III. (mléčná žláza) P. Škapa

Buněčné kultury. Kontinuální kultury

Standardizace imunohistologického stanovení steroidních receptorů mezi pracovišti - studie proveditelnosti.

Novinky v klasifikaci NSCLC, multidisciplinární konsenzus. testování NSCLC

Leukémie. - onemocnění postihující hemopoetický systém. vznik hromaděním změn v genomu kmenových buněk progenitorů jednotlivých řad

VĚDA A VÝZKUM V PERIOPERAČNÍ PÉČI. Mgr. Markéta Jašková Dana Svobodová Gynekologicko-porodnická klinika Fakultní nemocnice Ostrava

Metastatický karcinom prsu Kasuistické sdělení Česlarová K., Erhart D.

Molekulární hematologie a hematoonkologie

Spinální svalová atrofie. Vypracovali: Kateřina Teplá Monika Madrová Anna Dobrovolná Mária Čižmárová Dominika Štrbová Juraj Štipka

Ultrazvukové vyšetření lymfatických uzlin. Radka Šlaisová, Hana Petrášová Klinika radiologie a nukleární medicíny FN Brno a LF MU

Cytogenetika. chromosom jádro. telomera. centomera. telomera. buňka. histony. páry bazí. dvoušroubovice DNA

Komentář k nové WHO klasifikaci nádorů slinných žláz

CZ.1.07/1.5.00/

Crossing-over. over. synaptonemální komplex

ZÍSKANÉ CHROMOSOMOVÉ ABERACE. Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno

Co nás učí nádory? Prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc. Ústav patologie FN Brno Přírodovědecká a Lékařská fakulta MU Brno

Moderní metody analýzy genomu

Biopsie č /2012. Referuje: MUDr. Beáta Ostárková Odčítající: MUDr. Petr Buzrla FN Ostrava Ústav Patologie

Lekce z analýz genových expresních profilů u MM a návrh panelu genů pro ČR. Mgr. Silvie Dudová

PERSONALIZACE INDIVIDUALIZACE DIAGNOSTIKY A LÉČBY NOVINKA V MEDICÍNSKÉM UVAŽOVÁNÍ

Molekulární diagnostika pletencové svalové dystrofie typu 2A

Kolorektální karcinom:

Transkript:

Genové fúze NCOA4-RET a TRIM27- RETdiferencují intraduktální karcinom slinných žláz na duktální a apokrinní podtyp: analýza 18 případů pomocí sekvenování nové generace (NGS) Skálová A, Baněčková M, Martínek P, Michal M. Bioptická laboratoř s.r.o. a Šiklův ústav patologie Lékařské fakulty UK v Plzni 25. SJEZD ČESKÝCH A SLOVENSKÝCH PATOLOGŮ, 15. 16. listopadu 2018, Mikulov, hotel Galant

Intraduktálníkarcinom Intraduktální karcinom (IC) je dle WHO 2017 nové označení pro karcinomy dříve nazývané "low-grade kribriformní cystadenokarcinom" a "low-grade salivární duktální karcinom Vztah mezi IC a salivárním duktálním karcinomem (SDC)je kontroverzní odlišné nádorové jednotky

Intraduktálníkarcinom IC je vzácná low-grade malignita slinných žláz s rysy napodobujícími atypickou duktální hyperplázii prsu nebo duktální in situ karcinom Imunoprofil: difuzní pozitivita CK7/S100 proteinu/sox10 a mammaglobinu intaktní myoepiteliální vrstva kolem proliferujících epitelových struktur pozitivita myepitelií- např. p63 proteinu/calponinu a CK14 Nádorové buňky jsou negativní na myoepiteliální markry!

Intraduktální karcinom Pravidelné monomorfní duktální buňky; solidně microcystické struktury, cystopapilární, sekreční aktivita

Intraduktální karcinom Intaktní myoepiteliální vrstva, pozitivní barvení v myoepiteliích (p63)

Intraduktální karcinom Difuzní exprese S100 proteinu

Salivární duktální karcinom (SDC) SDC je agresivní, rychle progredující karcinom slinných žláz s vysokým rizikem lokoregionálních i vzdálených metastáz S100 protein/sox10 vždy negativní AR/CK7 pozitivní; HER-2/neu amplifikace u 15-50% případů SDC

Salivární duktální karcinom HER2/neu HER2 gene amplification, mutace v genech TP53, PIK3CA, PTEN a HRAS NCOA4-RET fúze?? (Wang et al. Clin Cancer Res 2016;22:6061-6068).

Design a metodika Detekce fúzních transkriptů 53 genů byla provedena u 18 případů IC metodou sekvenování nové generace (NGS) kitem Fusion Plex Solid Tumor (ArcherDX) Identifikované genové fúze byly dále potvrzeny metodami FISH break apart sondami a v některých případech i fúzními FISH sondami a metodou reverzní transkripční polymerázové řetězové reakce (RT-PCR) Všechny analyzované případy byly negativní na zlom ETV6 genu metodou FISH a ETV6-NTRK3 fúzi metodou RT- PCR Pro porovnání bylo stejným NGS panelem vyšetřeno 9 případů SDC

Intraduktálníkarcinom IC je jen částečně geneticky definovaný Pouze v několika případech byl popsán zlom v genu RET a NCOA4-RET genová fúze 1případ IC-fúze NCOA4-RET pomocí NGS 6 dalších případů zlom genu RET pomocí FISH (6/15 =47%) Am J Surg Pathol 2018;42:442-452

Intraduktálníkarcinom NGS analysis prokázala NCOA4-RET fúzi exonu 7 a 8 NCOA4 genu a exonu 12 RET genu v 6 případech (6/17; 38%) novátrim27-ret fúze exonu 3 a 12 byla nalezena ve 2 případech IC s apokriními rysy Am J Surg Pathol 2018;42:1445-1455

Intraduktální karcinom s NCOA4RET fúzí, klasická varianta Typ IC s intercalated duct-like difereniciací S100 protein pozitivní

NCOA4-RET fusion transcript (exons 8-12 joining) by NGS

Intraduktální karcinom s TRIM27-RET fúzí,apokrinní varianta Androgen receptor

TRIM27-RET fusion transcript (exons 3-12 joining) by NGS

Výsledky- IC NGS analýzou byl v 6 případech IC duktálního typu nalezen NCOA4-RET fúzní transkript sdružující exon 7 nebo 8 NCOA4 genu a exon 12 RET genu Novým nálezem je průkaz TRIM27-RET fúze mezi exony 3 a 12 ve dvou IC apokrinního typu Více než 50% všech IC bylo charakterizováno RET fúzí Tyto translokace nebyly nalezeny v žádném případu SDC

Výsledky-SDC Onkogenní mutace nalezeny v genech HRAS (3/9) (HRAS: c.182a>g p.gln61arg, HRAS: c.37g>c p.gly13arg) AKT1: c.49g>a p.glu17lys, TERT, a PTEN amplifikaceher2/neu genu pomocí FISH a potvrzena NGS (3/9) Homozygotní delece lokusu 9p21 (CDKN2A) (1/9) Amplifikace genu MDM2 u pacientky se současnou amplifikací HER2/neu a mutací v genu PTEN (1/9) mutace genu MYB, pomocí FISH (2/9)

Intraduktální karcinom parotis s NCOA4-RET fúzí, u 35-letého muže Metastáza v periglandulární LU CK7, S100 protein, SOX10 a mammaglobin- pozitivní AR/GATA3 a DOG1 - negativní

Intraduktální karcinom NCOA4-RET fúzí a metastázou v lymfatické uzlině Detekce fúzních transkriptu pomocí FusionPlex Solid Tumor Kitu (ArcherDx).* Prokázána fúze genů NCOA4-RET

Intraduktální karcinom s NCOA4-RET fúzí a invazí Absence myoepiteliální vrstvy p63 protein Široce infiltrativní růst s desmoplastickou reakcí a perineurální invazí

Závěry Potvrdili jsme, že NCOA4-RET je dominantní genovou fúzí v IC duktálního typu, včetně 3 případů s invazí, jeden s metastázou v LU Novým nálezem je objev TRIM27-RET translokace v IC apokrinního typu Absence uvedených translokací v případech klasického SDC dále potvrzuje odlišnost IC a SDC

Děkuji za pozornost 25. SJEZD ČESKÝCH A SLOVENSKÝCH PATOLOGŮ, 15. 16. listopadu 2018, Mikulov, hotel Galant