6.4 Zpracování elektroencefalografických záznamů pomocí umělých neuronových sítí

Podobné dokumenty
Algoritmy a struktury neuropočítačů ASN - P10. Aplikace UNS v biomedicíně

Bioelektromagnetismus. Zdeněk Tošner

Měření EEG, spánek, hodnocení EEG záznamů a následná vizualizace

ZPRACOVÁNÍ A ANALÝZA BIOSIGNÁLŮ V. Institut biostatistiky a analýz

10. PŘEDNÁŠKA 27. dubna 2017 Artefakty v EEG Abnormální EEG abnormality základní aktivity paroxysmální abnormality epileptiformní interiktální

Elektroencefalografie

8. PŘEDNÁŠKA 20. dubna 2017

Laboratorní úloha č. 8: Elektroencefalogram

Processing of EEG Data Marek Penhaker Konference IT4Innovations, Ostrava

Elektroencefalografie. X31ZLE Základy lékařské elektroniky Jan Havlík Katedra teorie obvodů

Diagnostika infarktu myokardu pomocí pravidlových systémů

Biologické signály. X31ZLE Základy lékařské elektroniky Jan Havlík Katedra teorie obvodů

Elektroencefalografie. X31LET Lékařská technika Jan Havlík Katedra teorie obvodů

OKRUHY MODELOVÝCH SITUACÍ

Katedra biomedicínské techniky

VYŠETŘENÍ NERVOVÉHO SYSTÉMU. seminář z patologické fyziologie

Algoritmy a struktury neuropočítačů ASN - P11

Elektrické biosignály lidského těla měřené ISESem

Spánek. Neurobiologie chování a paměti. Eduard Kelemen. Národní ústav duševního zdraví, Klecany

Monitorování kontinuálního EEG v intenzivní péči. Mgr. Moravčík Branislav, KARIM FN Brno Mgr. Flajšingrová Jana, KARIM FN Brno

SIMULTÁNNÍ EEG-fMRI. EEG-fMRI. Radek Mareček MULTIMODÁLNÍ FUNKČNÍ ZOBRAZOVÁNÍ. EEG-fMRI. pozorování jevu z různých úhlú lepší pochopení

Etiologie epilepsie. Epilepsie nevychází z centra jizvy nebo postmalatické pseudocysty, ale spíše z jejího okraje, kde přežívají poškozené neurony.

diogram III. II. Úvod: Elektrokardiografie elektrod) potenciálu mezi danou a svorkou Amplituda [mv] < 0,25 0,8 1,2 < 0,5 Elektrická

Elektrofyziologické metody a studium chování a paměti

Elektroencefalografie v intenzivní péči. Petr Aulický

Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám

Elektrokardiografie. X31ZLE Základy lékařské elektroniky Jan Havlík Katedra teorie obvodů

Aktivační metody v průběhu EEG - výhody a rizika. Petr Zlonický

Klasifikace předmětů a jevů

Úvod do medicínské informatiky pro Bc. studium. 6. přednáška

Neuronové sítě v DPZ

Moderní systémy pro získávání znalostí z informací a dat

Krevní tlak/blood Pressure EKG/ECG

12. PŘEDNÁŠKA 10. května 2018

z p r a c o v a l a : M g r. E v a S t r n a d o v á

Automatická detekce anomálií při geofyzikálním průzkumu. Lenka Kosková Třísková NTI TUL Doktorandský seminář,

EOG. ERG Polysomnografie. spánkové cykly poruchy spánku. Úvod ke cvičení

5. Umělé neuronové sítě. Neuronové sítě

Merkur perfekt Challenge Studijní materiály

Elektrokardiografie. X31LET Lékařská technika Jan Havlík Katedra teorie obvodů

Rozpoznávání písmen. Jiří Šejnoha Rudolf Kadlec (c) 2005

Snímání a hodnocení EKG aktivity u člověka

PaedDr. Lenka Dohnalová RNDr. Tomáš Fürst, PhD. Katedra Hv PdF UP Olomouc

Neurofeedback. Úvod. Princip

MĚŘENÍ BIOPOTENCIÁLŮ

malý TesT Použité zkratky: OO - otevřené oči, ZO - zavřené oči, FO - fokus

Elektronický systém a programové vybavení pro detekci a optimalizaci pulzů kardiostimulátoru

Úvod do zpracování signálů

Ambasadoři přírodovědných a technických oborů. Ing. Michal Řepka Březen - duben 2013

Popisná statistika kvantitativní veličiny

Pokročilé operace s obrazem

METODY DOLOVÁNÍ V DATECH DATOVÉ SKLADY TEREZA HYNČICOVÁ H2IGE1

K možnostem krátkodobé předpovědi úrovně znečištění ovzduší statistickými metodami. Josef Keder

fluktuace jak dob trvání po sobě jdoucích srdečních cyklů, tak hodnot Heart Rate Variability) je jev, který

SIMULTÁNNÍ EEG-fMRI. Radek Mareček

Biofyzikální ústav LF MU Brno. jarní semestr 2011

Biofyzikální laboratorní úlohy ve výuce budoucích učitelů fyziky

Merkur perfekt Challenge Studijní materiály

RÁMCOVÝ VZDĚLÁVACÍ PROGRAM PRO ZÍSKÁNÍ SPECIALIZOVANÉ ZPŮSOBILOSTI. v oboru KLINICKÁ TECHNIKA SE ZAMĚŘENÍM NA ANALÝZU A ZPRACOVÁNÍ BIOSIGNÁLŮ.

Fiala P., Karhan P., Ptáček J. Oddělení lékařské fyziky a radiační ochrany Fakultní nemocnice Olomouc

1 Modelování systémů 2. řádu

NOVÉ MOŽNOSTI HOLTEROVSKÉ DIAGNOSTIKY

ÚČINKY ELEKTRICKÉHO PROUDU NA LIDSKÝ ORGANIZMUS

Zpracování biologických signálů umělými neuronovými sítěmi

Membránové potenciály

Hemodynamický efekt komorové tachykardie

Síla myšlenky. Hladiny vědomí

aktivita A0705 Metodická a faktografická příprava řešení regionálních disparit ve fyzické dostupnosti bydlení v ČR

Elektrofyziologické metody a studium chování a paměti

Algoritmy a struktury neuropočítačů ASN P4. Vícevrstvé sítě dopředné a Elmanovy MLNN s učením zpětného šíření chyby

Biosignál snímání, zpracování, hodnocení

Elektroencefalografie. doc. MUDr. Jan Pokorný, DrSc.

Transkraniální elektrostimulace jako způsob rehabilitace částo nemocných dětí

Dobývání znalostí. Doc. RNDr. Iveta Mrázová, CSc. Katedra teoretické informatiky Matematicko-fyzikální fakulta Univerzity Karlovy v Praze

Elektrofyziologické metody a studium chování a paměti

1. Vlastnosti diskretních a číslicových metod zpracování signálů... 15

Neuronové sítě Ladislav Horký Karel Břinda

Smisitelová, J. AUDIO-Fon centr. Brno. Horný Smokovec november 2016

Laboratorní úloha č. 8: Polykardiografie

AUTOMATICKÁ SEGMENTACE DAT EEG

Algoritmy a struktury neuropočítačů ASN - P10

4. PŘEDNÁŠKA 15. března 2018

individuální TRÉNINKOVÝ PROFIL

TECHNICKÁ UNIVERZITA V LIBERCI

Algoritmy a struktury neuropočítačů ASN - P1

Diplomová práce Jednoduché BCI na bázi vizuálních evokovaných potenciálů

KONTROLNÍ A ŘÍDÍCÍ SOUSTAVY. kontrolu a řízení organismu zajišťují 2 soustavy: o nervová soustava o hormonální soustava

Trénování sítě pomocí učení s učitelem

Výukový materiál v rámci projektu OPVK 1.5 Peníze středním školám

Kontinuální EEG v intenzivní péči. Mgr. Moravčík Branislav, KARIM FN Brno

Ing. Petr Hájek, Ph.D. Podpora přednášky kurzu Aplikace umělé inteligence

Epilepsie. Silvia Čillíková FEL ČVUT. 9th May 2006

ZDRAVÝ SPÁNEK Ing. Vladimír Jelínek

StatSoft Úvod do neuronových sítí

Obsah přednášky Jaká asi bude chyba modelu na nových datech?

3. Vícevrstvé dopředné sítě

Neuropočítače. podnět. vnímání (senzory)

Vytěžování znalostí z dat

KLASIFIKACE SPÁNKOVÝCH FÁZI ZA POUŽITÍ POLYSOMNOGRAFICKÝCH DAT

Algoritmy a struktury neuropočítačů ASN P3

Transkript:

PŘÍKLADY APLIKACÍ NEURONOVÝCH SÍTÍ 136 Důležité je, jako ve všech úlohách, ve kterých aplikujeme UNS, předzpracování dat. Do oblasti predikce časových řad patří např. systémy pro odhad vývoje zahraničního obchodu (Citibank London, Bank of Australia), předpověď počasí, rozpoznávání řeči, z medicíny pak předpověď a potvrzení srdečního infarktu z výstupu EKG nebo identifikace neurologických poruch z analýzy EEG. 6.4 Zpracování elektroencefalografických záznamů pomocí umělých neuronových sítí Když se řekne biologický signál(biosignál), většina posluchačů si vybaví dva názvy EKG(elektrokardiograf) a EEG(elektroencefalograf). V následujícím textu se zaměříme na EEG a ukážeme si jakým způsobem lze analyzovat záznamy EEG pomocí UNS. Tématu EEG je věnováno mnoho publikací, avšak aplikace UNS v této oblasti jsou publikovány v mnohemmenšímíře.jsoutonapř.[115], [144],[145],[43],[80], [81]a [24]. EEG je se řadí mezi elektrofyziologické vyšetřovací metody. Při vyšetření se zaznamenává aktuální elektrická aktivita mozku pomocí povrchových elektrod umístěných na povrchu lebky. V dnešní době se provádí analýza EEG záznamů na počítačích. Lékař je schopen dlouhodobě zaznamenávat a archivovat záznam elektronicky, rychle jej vyhledat, poslat na jiné pracoviště a samozřejmě, díky stále se zvyšující výkonnosti počítačů, rychle analyzovat a porovnávat výsledky analýz, a tím zrychlit a zpřesnit diagnózu. V následující podkapitole se zaměříme pouze na stručný přehled těch informací o EEG, které jsou potřebné pro správnou analýzu záznamů. Nebudeme se zabývat ani metodami měření, ani stanovením diagnózy. K tomu jsou určeny jiné publikace. 6.4.1 Elektroencefalografický záznam Bioelektrický proud je stejnosměrný, rozpětí hodnot bioelektrických mozkových potenciálůje5µvaž210 µvarychlostgenerováníelekrickýchvýbojůvcyklechzasekunduje 0.5 Hz až 40 Hz. Tyto mozkové potenciály jsou projevem funkční aktivity mozku. Zpracovávaný signál je diskrétní, aperiodický. K elektrickému výboji dochází samostatně v jednotlivých neuronech. Pomocí EEG určíme průměrné hodnoty z neuronálních polí. Jednotlivé oblasti mozku(pole) vykazují rozdílné hodnoty v závislosti na jejich funkci a poloze. Při neinvazivní metodě snímání rozdílu elektrických potenciálů(v rozsahu přibližně 10 mv) jsou na povrchu skalpu(kůže a další měkké tkáně na lebeční kosti) rozmístěny elektrody. Protékající proudy je nutné zesílit. Ze záznamu EEG lze určit např. jednotlivé fáze spánku, jeho poruchy, určit poškození mozku, zjistit epilepsii a rozlišit její druh, pomáhají diagnostikovat encefalitidu. Jak EEG pracuje? Vstupní impulz podráždí skupinu neuronů. Odezvou na tento impulz je synchronizovaný elektrický výboj. Tento výboj podráždí sousední skupinu neuronů a potlačí aktivitu pů-

PŘÍKLADY APLIKACÍ NEURONOVÝCH SÍTÍ 137 vodní skupiny. Po odeznění podnětu se přestane aktivita potlačovat a skupina excitujících neuronů je připravena na nový impulz. Celý proces se opakuje. Na množství excitujících synchronizovaných neuronů vysílajících výboje závisí velikost vln EEG, a to přímo úměrně počtu excitátorů. Tyto elektrické výboje jsou zaznamenávány pomocí EEG. Biosignál je snímán z tzv. povrchových skalpových elektrod, které jsou rozmístěny na povrchu hlavy a označeny podle mezinárodní normy. Nejčastější počet elektrod je 19 64 (to je také počet současně snímaných kanálů), viz[115]. Rozlišujeme čtyři základní pásma(hladiny) frekvencí mozkových vln, a to pásmo delta:1 3.5Hz,amplituda75 210 µv hlubokýspánek,vestavubdělostipatologické theta:4 7.5Hz,amplituda5 100 µv kreativita,usínání alfa:8 13Hz,amplituda30 80 µv relaxace,zavřenéoči beta:14 30Hz,amplituda10 30 µv koncentrace,logicko-analytickémyšlení, neklid gama: 30 Hz a více extrémní koncentrace, hluboká meditace Tvar těchto vln v jednotlivých tolerančních pásmech je schematicky znázorněn na obrázku 6.21. Hodnoty amplitud se mohou lišit, hodnoty uvedené zde jsou tedy pouze orientační. Podstatná jsou frekvenční pásma. Obrázek 6.21: Frekvenční pásma mozkových vln snímaných encefalografem Pásmo delta představuje výrazný útlum všech funkcí. Je projevem bezesného spánku nebo stavu bezvědomí. Dochází k regeneraci životních funkcí, k akumulaci energie a k pomalé látkové přeměně. Vyskytuje-li se jindy, než ve spánku, jedná se o patologický jev.

PŘÍKLADY APLIKACÍ NEURONOVÝCH SÍTÍ 138 Pásmo theta je charakterizováno rovněž útlumem všech funkcí, nedochází k žádné reakci na smyslové podněty, ale dochází k uvolňování obrazových informací z podvědomí a k tvorbě snů(slabá radiace vln alfa a beta). Toto pásmo charakterizuje především ospalost, usínání, hluboké uvolnění, ale také poruchy pozornosti a lehkou mozkovou dysfunkci (LMD). Zvýšený výskyt je považován neurology za patologický. Pásmo alfa vyjadřuje stav bez napětí, nedochází k reakcím na vnější podněty, ani k soustředěnému myšlení. Pásmo alfa popisuje úplnou bdělost doprovázenou příjemnými pocity. V tomto stavu se posilují a regenerují všechny životní funkce a většinou se dá vyhnout onemocnění. Jedná se o bdění se zavřenýma očima, při relaxaci. Tento stav mizí po otevření očí a při soustředění pozornosti na nějaký problém. Je to základní pásmo u dospělých. Pásmo beta charakterizuje vědomé smyslové soustředění na okolí, akceschopnost, napětí; objeví-li se toto pásmo při zavřených očích, jedná se o stav náladových změn, podrážděnost a úzkostnost. Charakterizuje také pohyb. Toto pásmo můžeme ještě dále rozdělit na oblastdo18hz:běžnýstavbdělosti, oblast22 24Hz:energetickázátěž,zhoršujícíseschopnostakvalitapřeměnya regenerace tkání, oblast nad 30 Hz: podráždění, tréma, úzkost, vysoce náročné životní situace. Do nejvyšších hodnot pásma beta se dostáváme i při psychoneurologických poruchách anemocech. Toto teoretické dělení je ve skutečnosti složitější. Výše popsané hladiny vzniknou v mozku pouze tehdy, je-li určité konkrétní pásmo(např. pásmo alfa) dominantní. To obvykle trvá velmi krátce(řádově několik minut). Při soustředění mysli začnou mozková centra vysílatvlnyvrozmezí10 40Hz.Kesjednocenína10 12Hz,resp.2 3Hzdochází s rostoucím útlumem. Hodnoty frekvencí a amplitudy elektrického proudu, který vzniká z potenciálů mezi jednotlivými neurony, jsou závislé na druhu činnosti, při které vznikají a souvisíisoblastímozku,kterájezadanoučinnostodpovědná(tolzepoznatzrozmístění elektrod na skalpu). Obtížnost těchto analýz je zapříčiněna individualitou sledovaného člověka, ale také šumem v záznamu signálu. Frekvenční charakteristika je také závislá na věku(u novorozenců se vyskytují delta vlny, později theta vlny a alfa vlny se stávají dominantními až kolem 18. roku). Pokud chceme klasifikovat EEG signál, je nutné znát další pojmy z neurologie. Epileptické grafoelementy identifikujeme v EEG záznamu jako hroty, ostré vlny, komplexy hrotů a ostrých vln, ostrých a pomalých vln(mnoho ukázek EEG záznamů, reálných, ne pouze schematických, lze najít v[22]). Přianalýzáchserozlišujídvěfázespánku,atoNONREMsečtyřmifázemia REM (RapidEyeMovements).REMspáneksedostavívprůměruza90 120minutpousnutí,

PŘÍKLADY APLIKACÍ NEURONOVÝCH SÍTÍ 139 opakujeseběhemnoci4 6krát,uzdravýchdospělýchtvoří20%,tatohodnotases věkem mění. Tato část popisující základní vlastnosti EEG signálu a jeho záznamů má tvořit pouze nezbytné neurologické minimum pro každého, kdo se chce pokusit o klasifikaci EEG záznamů pomocí UNS. Více informací je nutné hledat v odborné lékařské literatuře. 6.4.2 Analýza EEG záznamu Mluvíme-li o analýze EEG, znamená to, že určujeme např. frekvenční charakteristiku, časovou spektrální analýzu, používáme expertní systém s diagnostikou nebo neuronovou síť. V této publikaci se soustředím na posledně jmenovanou metodu. ProtutoaplikacilzepoužítobahlavnítypyUNSpopisovanévtétoknížce,tedyMLNN i SOM. Záleží na konkrétním požadavku. Tak jako ve všech úlohách, ve kterých aplikujeme neuronové sítě, i pro tento účel musíme věnovat velkou pozornost fázi předzpracování. Signál EKG je tedy digitalizován, jednotlivé složka jsou snímány klouzajícím oknem. Architektura sítě je vrstevnatá dopředná, počet vstupních neuronů je roven počtu vzorků v okně. Používá se jedna nebo několik skrytých vrstev. Počet neuronů ve výstupní vrstvě je roven počtu tříd, do kterých je třeba klasifikovat. Počet učebních vzorů by měl být několikanásobkem počtu klasifikačních tříd. Princip vytvoření vstupních trénovacích dat z EEG signáluajejichpřivedenínavstupunsjeobdobnéjakoupredikcenaobrázku6.20. Pokud chceme vyhledat v EEG záznamu nějaké artefakty nebo nestandardní průběhy zapříčiněné např. epileptickými výboji, bude se jednat o klasifikaci do dvou tříd. Pak lze použít SOM, zvláště pokud EEG záznam nebude popsán lékařem. Výsledky SOM map charakterizují odchylky mezi jednotlivými kategoriemi aktivity. Tyto různé druhy aktivit se promítnou do různých oblastí mapy. Změny v aktivitě mozku jsou monitorovány pomocí vizualizace trajektorií. Častěji se však používá vícevrstvá neuronová síť MLNN s algoritmem učení BPG. V tomto případě je UNS trénovaná na rozpoznání tzv. HVS vzorků(high Voltage spike-and-wave Spindle). Dobře natrénovaná a optimalizovaná síť je schopna detekovat např. existenci HVS ve 12-ti hodinovém spánkovém EEG záznamu s 93 99% úspěšností. Ale počet chybně detekovaných událostí(např. artefaktů) je v rozmezí 18 40%.Tytovýsledkynásopravňujíkdoměnce,žejemožnépoužítUNSpřirozpoznání EEG vzorků a konstruovat automatický evaluační systém pro detekci, sledování a označení epileptiformních vzorků. V jiné úloze, pro EEG záznamy dětí, se v článku[80] uvádí úspěšnostklasifikaceeegvzorkůdo6-titřídvhodnotě65 80%. EEG a UNS můžeme také použít s hledáním souvislostí mezi Brocovým a Wernickeovým centrem(viz 6.17, tedy s mozkovými centry zpracovávajícími řeč a jazyk([148]). Bude se jednat o vizualizaci problému. 6.5 Analýza EKG křivky Elektrokardiogram EKG je vyšetření, které umožnuje odhalení většiny závěžnějších srdečních onemocnění(např. známky nedokrevnosti srdečního svalu, proběhlý infakrt

PŘÍKLADY APLIKACÍ NEURONOVÝCH SÍTÍ 140 myokardu, neléčenou chlopenní vadu, atd.) Zvláštní význam má EKG při studiu poruch srdečního rytmu. EKG snímá časovou závislost elektrické aktivity srdce. V současné době se jako standardní vyšetření využívá tzv. 12.svodové EKG, při kterém se zaznamenává 6 bipolárních svodů z končetin a 6 unipolárních svodů z povrchu hrudníku. Na normálním záznamuekgsepopisujívlnyp,t,uakmityq,r,s.přianalýzeekgseobvykle Obrázek 6.22: EKG křivka postupuje konvenčními metodami, mezi než počítáme matematické a statistické algoritmy analýzy EKG signálů. Je však také možné aplikovat UNS. Docílíme zlepšení přesnosti diagnózy, a to i při výskytu komplikací, umožníme automatické rozpoznání událostí s malou četností i náročné vyhodnocení. Signál EKG je digitalizován, jednotlivé složky jsou snímány klouzajícím oknem. Architektura neuronové sítě je vrstevnatá dopředná, počet vstupních neuronů je roven počtu vzorků v okně, používá se jedna nebo několik skrytých vrstev. Počet neuronů ve výstupní vrstvě je roven počtu tříd, do kterých je třeba klasifikovat. Počet učebních vzorů by měl být několikanásobkem počtu klasifikačních tříd. 6.6 Řízení a monitorování funkce strojů Průmyslová zařízení jsou obvykle velmi složité systémy, popsatelné stavovými proměnnými, často v nelineárním prostředí. V jejich funkci ale existuje mnoho charakteristických