Rekonstrukce biogeografické historie: outline přednášky



Podobné dokumenty
Fylogeneze a diverzita obratlovců I.Úvod

Systém a evoluce obratlovců I.Úvod

Malcomber S.T. (2000): Phylogeny of Gaertnera Lam. (Rubiaceae) based on multiple DNA markers: evidence of a rapid radiation in a widespread,

S = c.a z. log(s) = log(c) + z.log(a) Rovnovážná teorie ostrovní biogeografie. The species-area relationship. The species-area relationship

Systém a fylogeneze strunatců

Tektonika zemských desek

!!! Veškeré prezentované materiály a informace k danému předmětu na webových stránkách

World of Plants Sources for Botanical Courses

Tribsch A., Schönswetter P. & Stuessy T. (2002): Saponaria pumila (Caryophyllaceae) and the Ice Age in the European Alps. American Journal of Botany

Aplikace DNA markerů v mykologii a molekulárni taxonomii

World of Plants Sources for Botanical Courses

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Pleistocénní glaciace a biogeografie

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Šíření = disperze (dispersal) Aktivní tah. Pravidelné migrace. Aktivní tah. fundamentální biogeo procesy: evoluce, šíření & extinkce

Speciace a extinkce. Druh

Základní pojmy I. EVOLUCE

4. Úvod do kladistiky. kladogram podobnost a příbuznost homologie (sym)plesiomorfie, (syn)apomorfie polarizace znaků kritérium parsimonie

World of Plants Sources for Botanical Courses

Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae).

World of Plants Sources for Botanical Courses

1. NÁPLŇ BIOGEOGRAFIE 1.1. DEFINICE

Populační genetika a fylogeneze jedle bělokoré analyzována pomocí izoenzymových genových markerů a variability mtdna

Paleontologie a biogeografie

DRUHOVĚ NEJBOHATŠÍ LOKALITY NA ZEMI. David Zelený Masarykova univerzita Brno

World of Plants Sources for Botanical Courses

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny

Strom života. Cíle. Stručná anotace

Zobrazení distribuce druhu: bodová mapa. Distribuce popis. Zobrazení distribuce druhu: obrysová mapa. Zobrazení distribuce druhu: plošná mapa

Typologická koncepce druhu

Populační genetika III. Radka Reifová

World of Plants Sources for Botanical Courses

Paleogenetika člověka

Taxonomický systém a jeho význam v biologii

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,

Koevoluce. Závody ve zbrojení

TEORIE OSTROVNÍ BIOGEOGRAFIE (TOB)

zaměřuje se často na prvky, které v souvislosti s porozuměním sledovaných jevů nemusejí být nedůležité.

Nové směry v evoluční biologii. Jaroslav Flegr Katedra filosofie a dějin přírodních věd Přírodovědecká Fakulta UK Praha

Genetika vzácných druhů zuzmun

Příčiny krajinného uspořádání. abiotické faktory, biotické interakce, antropogenní změny (land use, land cover change)

Příklady z populační genetiky lesních dřevin

Invazní ekologie II. Transport Evžen Tošenovský FRVŠ F4b 2863/2010

Evoluce fenotypu I. web.natur.cuni.cz/~kratoch1/

2. Druh, speciace a evoluce

Vymezení druhové rozmanitosti

Druhový koncept protist

Systém a fylogeneze strunatců

Genetické rozdíly mezi populacemi aneb něco o migracích a genovém toku. Genetické rozdíly mezi populacemi

FYLOGEOGRAFIE A KOALESCENCE

Evoluce člověka a její modely

Speciace. Radka Reifová. Katedra zoologie

Tomimatsu H. &OharaM. (2003): Genetic diversity and local population structure of fragmented populations of Trillium camschatcense (Trilliaceae).

Evoluce člověka a její modely

Nika důvod biodiverzity navzdory kompetici

Populační genetika II. Radka Reifová

PROSTOROVÁ EKOLOGIE, metapopulace, kvantitativní změny populace

Ostrovní biogeografie. biogeografie. Pilíře rovnovážné teorie ostrovní. 1. Vztah počtu druhů a plochy. 2. Vztah počtu druhů a izolace. 3.

Speciace, radiace, extinkce

Zápis ze zasedání Vědecké rady Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích dne

- taxonomicky jeden z nejobtížnějších rodů v Evropě (ca druhů)

PŘÍLOHA NAŘÍZENÍ KOMISE V PŘENESENÉ PRAVOMOCI (EU) /...

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

World of Plants Sources for Botanical Courses

Potravní síť Společenstvo

BIODIVERZITA. WWF/IUCN/UNEP (1991): rozmanitost života ve všech jeho formách, úrovních a kombinacích. Zahrnuje diverzitu ekosystémů, druhů a genů.

Systematická biologie je věda o rozmanitosti organizmů (E. Mayr 1969: Principles of systematic zoology. Mac Graw Hill Book Co., New York X+428 p.).

Cytotypová variabilita, kryptická diverzita a hybridizace u lakušníků (Ranunculus sect. Batrachium)

Geografická variabilita

2. Maximální úspornost (Maximum Parsimony, MP)

Typologická koncepce druhu

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Drift nejen v malých populacích (nebo při bottlenecku resp. efektu zakladatele)

Vypracovaly: Mirka Hladilová, Kateřina Pecová, Petra Pospíšilová

NIKA A KOEXISTENCE. Populační ekologie živočichů

Ekologická společenstva

Předmluva Hodnota biodiverzity 71 Ekologická ekonomie 74 Přímé ekonomické hodnoty 79

Osud jednotlivých kopií genů v populaci genové stromy

EVOLUCE ČLOVĚKA. úlohy k tématu + autorské řešení. Radka M. Dvořáková, Karolína Absolonová

EKOLOGICKÁ BIOGEOGRAFIE (JAK PROSTŘEDÍ OVLIVŇUJE ROZŠÍŘENÍ ORGANISMŮ)

Ekologie základní pojmy. Michal Hejcman

Druhový koncept a asexuální organismy

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?

Predace - její konsekvence pro dynamiku a evoluci společenstev

Populační genetika II

Rozptyl a migrace. Petra Hamplová

World of Plants Sources for Botanical Courses

Jak měříme genetickou vzdálenost a co nám říká F ST


Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Proměnlivost a evoluce rostlin

Pozvolná speciace a hybridizace, význam hybridizace evoluci, hybridogenní druhy

Vytvořen. ení genetické databanky vybraných druhů savců ČR ití pro udržitelný rozvoj dopravy. Tomáš. Libosvár

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Invazní druhy a invaze

č.1 Konvergence představuje proces č.2 Rozdíl mezi alopatrickou a sympatrickou speciací spočívá

Hardy-Weinbergův zákon - cvičení

Biologické invaze z pohledu ekologie společenstev a makroekologie

Transkript:

Rekonstrukce biogeografické historie: outline přednášky tradiční přístupy (do 80-ých let) a jejich slabiny Croizatova panbiogeografie a její slabiny Hennigovo progression rule a jeho slabiny disperzní biogeografie a její slabiny vikarianční biogeografie a její slabiny kladistická biogeografie Rekonstrukce biogeografické historie distribuce se mění v čase, kde jsou tedy: centra vzniku (centers of origin) rodiště taxonu Proč jsou centra vzniku zajímavá/důležitá? kolébky: biodiverzity překryvy center vzniku mnoha taxonů určení míst vzniku, šíření, diverzifikace a zániku evolučních linií Co je příčinou úspěšnosti a šíření konkrétních taxonů? a) vznik evol. linií v mírném pásu šíření do tropů (Buffon 1761) b) vznik evol. linií v tropech šíření na sever a jih (Darlington 1959) Jsou tropy zdrojem nových taxonů, nebo refugiem, nebo obojím?

Rekonstrukce biogeografické historie: tradiční postup Tradiční kritéria (chybně) používaná pro určení centra vzniku: místo s největší diverzitou daného taxonu (vs sekundární radiace!) místo s největší abundancí (vs kolonizace; lingvistika angličtina) místo výskytu nejprimitivnější formy (vs přežívání v izolaci bez kompetice) místo s výskytem největších jedinců místo s největší stabilitou a produktivitou místo, kde konvergují disperzní linie místo, kde začínají kliny směr naznačení tahovými cestami ptáků vzestup zastoupení dominantních genů Rekonstrukce biogeografické historie: pěkný příklad vodnáři (Hydrophiidae) mořští hadi Pelamis platurus (pelagický)

Rekonstrukce biogeografické historie: kudy ne koncentrace druhů v indo-pacifiku (nejprimitivnější tamtéž) nejbližší outgroup v australských mokřadech (překryv areálů) stenotermie nad 20 ºC mladá skupina problém tohoto ad hoc příběhu: je to jen hypotéza predikce je třeba testovat vše nepřímé důkazy chybí fosílie chybí fylogenetická analýza chybí souvislost s historickými událostmi Rekonstrukce biogeografické historie: panbiogeografie Leon Croizat (Venezuela) nepříbuzné taxony podobné disjunkce a endemismy společné disjunkce fragmentace celých společenstev spojení oblastí výskytu endemitů multiple = generalized tracks odmítnutí šíření na velké vzdálenosti odmítnutí kontinentálního driftu mechanismus: zaniklé zemské mosty a kontinenty (konekcionisti!) Přínos: dříve ad hoc vysvětlení, taxonově specifické mechanismy Croizat: konzistentní metodika, aplikace na všechny taxony Problém: netestované příběhy

Rekonstrukce biogeografické historie: panbiogeografie Rekonstrukce biogeografické historie: progression rule Willi Hennig (1950 1966) fylogenetická systematika, kladistika evoluce vyrábí fylogenetickou hierarchii podobností hierarchický pattern předek-potomek má i prostorovou historii větvení evol. linií odráží geografickou dynamiku areálů fylogeneze + biogeografie progression rule (pravidlo posloupnosti) Predikce: taxony v centru vzniku ancestrální znaky taxony, které dispergovaly odvozené znaky Přínos: zavedení fylogenetických metod do studia biogeografické historie Problém: evoluce apomorfií v centru vzniku (vysoká diverzita konkurence intenzivní anageneze smazání fylogenetické informace)

Rekonstrukce biogeografické historie: vikarianční biogeografie Hennig + Croizat (= progression rule + patterny endemismu) = vicariance biogeography dichotomie: dispersal biogeography organismy migrují přes pre-existující bariéry vicariance biogeography tvorba nových bariér fragmentuje dříve kontinuitní areály vznik bariéry před/po migraci daného taxonu? směr migrace? vikarianční biogeografie jen pro 3 a více disjunktivních sub-areálů Rekonstrukce biogeografické historie: vikarianční biogeografie Předpoklady: speciace způsobena geografickou izolací minulá geografie se odráží v dnešních distribucích taxonů fylog. vztahy ~ pořadí oddělování dnes disjunktivních skupin kladistická fylogeneze podává: fylogenetickou hypotézu o vztazích předek-potomek mezi taxony biogeografickou hypotézu o historických vztazích mezi geografickými areály

Vikarianční biogeografie: area cladogram sdílení společných předků a společných geografických oblastí taxonový kladogram = hypotéza o příbuzenských vztazích areálový kladogram = hypotéza o sekvenci historických událostí Kontinentální drift & area cladogram

Kontinentální drift & taxon cladogram těžko falzifikovatelné long-distance dispersal a překročení bariéry je nepravděpodobné co se podaří jednou, podaří se i podruhé a po (narušení předpokladu: minulá geografie se odráží v dnešních distribucích taxonů ) opakovaná kolonizace a extinkce vymazává důkazy biogeo. historie Disperzní biogeografie: problémy

Vikarianční biogeografie: area cladogram test: konfrontace s geologickými údaji (pořadí vzniku bariér vs speciací) konfrontace s klimatickými údaji (i klima je bariéra) kongruence areálových kladogramů mezi více sympatrickými taxony falzifikace: fosílie taxonu 2 a/nebo 3 v oblasti A fosílie taxonu 3 v oblasti B fosílie taxonu 2 v oblasti C areálové kladogramy sympatrických taxonů na sebe nesedí pytlonošovití (Geomyidae) vs všenky (Mallophaga) Kongruence kladogramů: kospeciace vs kolonizace

Párová koevoluce: kospeciace vs host-switching kongruence kladogramů nutně nedokazuje kospeciaci! nezávislá kolonizace test: molekulární hodiny Vikarianční biogeografie: problémy nerealistické předpoklady: všechny speciace jsou alopatrické (geografickou izolací) nedochází k šíření na větší vzdálenosti (nebo to nelze analyzovat v rámci vikarianční biogeografie) geografická izolace, jež v vedla ke speciacím, je zachována v současné poloze areálů (vs velmi recentní změny glaciace) kongruence areálových kladogramů parazita a hostitele může být dána podobnými životními podmínkami a ne koevolucí (primáti vs lentiviry nezávislá kolonizace)

Rekonstrukce biogeografické historie: dnes phylogeography, cladistic biogeography, historical biogeography co zůstalo z vikarianční biogeografie: důraz na rigorózní logiku a testování hypotéz staví na fylogenetické systematice využívá areálové kladogramy co se přidalo k vikarianční biogeografii: více typů dat (fosílie, geologické důkazy) solidnější kladogramy více mechanismů (včetně šíření na velké vzdálenosti) molekulární hodiny absolutní (nejen relativní!) časování speciací vyřešení dlouho diskutovaných problémů, např.: hypotéza pleistocénních refugií (Amazonie, S. Am. glaciální relikty) fylogenetické a geografické vztahy ryb Etheostoma spp. biogeo-vztahy odrazem minulých vodních propojení Kladistická biogeografie

Areálový kladogram: 1. pohled pouze zobrazení distribuce taxonů geogr. distrib. je vynesena na kladogram vyrobený podle fylog. znaků Areálový kladogram: 2. pohled consensus area cladogram distribuce taxonů a linií jako znaky do analýzy kladogram = explicitní hypotéza o historii a biotických výměnách Nothofagus, Fagus, pakomáři rosničky, běžci, hrabaví, ryby

Areálový kladogram: Hawaii OG = outgroup areálový kladogram: predikce areálový kladogram: test Běžci a gondwanská disjunkce

Fylogeografie: morfologická vs. genetická diferenciace genetická diferenciace malá vysoká malá bottleneck, nedávná kolonizace dlouhá izolace, slabá selekce morfologická diferenciace vysoká rychlé šíření, silná selekce dlouhá izolace, silná selekce Jak se dostal blboun na Mauritius? Shapiro B. et al. 2002: Flight of the dodo. Science 295: 1683 1683.