Stereochemie. Jan Hlaváč

Podobné dokumenty
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Symetrie molekul a stereochemie

Symetrie molekul a stereochemie

Izomerie a stereochemie

ISOMERIE SPOUSTA VĚCÍ V PŘÍRODĚ VYPADÁ PODOBNĚ, ALE VE SKUTEČNOSTI JSOU NAPROSTO ODLIŠNÉ!

DRUHY ISOMERIE. KONSTITUČNÍ IZOMERY Stejný sumární vzorec, ale rozdílné pořadí atomů a vazeb KONFORMAČNÍ IZOMERY

4. Úvod do stereochemie organických sloučenin

Stereochemie 7. Přednáška 7

Stereochemie. Přednáška 6

Struktura organických sloučenin

Stereochemie. Přednáška č. 3

I N V E S T I C E D O R O Z V O J E V Z D Ě L Á V Á N Í

Fyzikální korespondenční seminář UK MFF V. E

Typy vzorců v organické chemii

Izomerie Reakce organických sloučenin Názvosloví organické chemie. Tomáš Hauer 2.LF UK

3. Konformační analýza alkanů a cykloalkanů

Elektronové posuny. Indukční efekt (I-efekt) Indukční a mezomerní efekt. I- efekt u substituovaných karboxylových kyselin.

Refraktometrie, interferometrie, polarimetrie, nefelometrie, turbidimetrie

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, Vysoké Mýto

17. Organické názvosloví

25. SACHARIDY. 1. Základní sacharidy. 2. Porovnání mezi achirální a chirální sloučeninou. Methan (vlevo) a kyselina mléčná.

ORGANICKÁ CHEMIE I pro bakalářský stud. program (Varianta A) Jméno a příjmení... Datum... Kroužek/Fakulta.../... Zápočet udělil(a)...

ORGANICKÉ SLOUČENINY

Prostorové uspořádání molekul organických sloučenin

Organická chemie - úvod

LMF 2. Optická aktivita látek. Postup :

Organická chemie. Stručný úvod do stereochemie. Ing. Libuše Arnoštová, CSc. ÚLB, 1.LF UK

APO seminář 5: OPTICKÉ METODY v APO

Organická chemie 1. RNDr. Petr Cankař, Ph.D. Katedra organické chemie Přírodovědecká fakulta Univerzita Palackého v Olomouci

Úvod do studia organické chemie

Výpočet stechiometrického a sumárního vzorce

molekul organických sloučenin

Teploty tání a varu jsou měřítkem čistoty organické sloučeniny Čisté sloučeniny tají, nebo vřou při malém teplotním rozmezí (1-2 C) a celkem vysoké

Skupenské stavy. Kapalina Částečně neuspořádané Volný pohyb částic nebo skupin částic Částice blíže u sebe

Organická chemie - úvod

16.IZOMERIE a UHLOVODÍKY 1) Co je to izomerie a jak se dělí? 2) Co je konstituce, konfigurace a konformace? 3) V čem se izomery shodují a v čem liší?

Alkany a cykloalkany

Spektra 1 H NMR. Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský

Třídění látek. Chemie 1.KŠPA

ORGANICKÁ CHEMIE I pro bakalářský stud. program (Varianta A) Jméno a příjmení... Datum... Kroužek/Fakulta.../... Vyučující na semináři...

SPEKTROSKOPIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE

CHEMIE - Úvod do organické chemie

LEKCE 1b. Základní parametry 1 H NMR spekter. Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

ZÁKLADY KONFORMAČNÍ ANALÝZY CYKLOHEXANU

Prostorové uspořádání molekul organických sloučenin Jaromír Literák

2. Struktura organických sloučenin a její zobrazení

Molekulární krystal vazebné poměry. Bohumil Kratochvíl

Fluorescence (luminiscence)

K objasnění podstaty optické aktivity je třeba vymezení několika nezbytných pojmů:

02 Nevazebné interakce

Chemická struktura. Stereochemie Strukturní chemie Strukturní biologie (Nature Structural Biology Nature Structural and Molecular Biology)

Mgr. Jakub Janíček VY_32_INOVACE_Ch1r0118

Valenční elektrony a chemická vazba

Teorie chemické vazby a molekulární geometrie Molekulární geometrie VSEPR

PRAKTIKUM III. Oddělení fyzikálních praktik při Kabinetu výuky obecné fyziky MFF UK. Úlohač.XI. Název: Měření stočení polarizační roviny

16.UHLOVODÍKY A IZOMERIE ORGANICKÝCH SLOUČENIN IZOMERIE:

Organická chemie pro biochemiky I část 6 a 7 I-67-1

Skupenské stavy látek. Mezimolekulární síly

Gymnázium, Milevsko, Masarykova 183 Školní vzdělávací program (ŠVP) pro vyšší stupeň osmiletého studia a čtyřleté studium 4.

Substituční deriváty karboxylových kyselin

Polymery struktura. Vlastnosti polymerů určeny jejich fyzikální a chemickou strukturou

Opakování

Periodická tabulka prvků

1. ročník Počet hodin

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice

Přílohy. NÁZEV: Molekulární modely ve výuce organické chemie na gymnáziu. AUTOR: Milan Marek. KATEDRA: Katedra chemie a didaktiky chemie

Nekovalentní interakce

Úvod do asymetrické katalýzy Petr. FARMAK, a.s.

Nekovalentní interakce


Mezimolekulové interakce

Chemická vazba. Příčinou nestability atomů a jejich ochoty tvořit vazbu je jejich elektronový obal.

8 b) POLARIMETRIE. nepolarizovaná vlna

Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů

Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

Spektrální metody - porovnání

Překryv orbitalů. Vznik vazby překryvem orbitalů na dvou různých atomech A, B Obsazeno dvojicí elektronů Ψ = Ψ A Ψ Β

Gymnázium a Střední odborná škola, Rokycany, Mládežníků 1115

Molekula = soubor atomů. charakteristika molekuly: sumární vzorec H 2 O, C 2 H 6,... strukturní vzorec

Látkové množství. 6, atomů C. Přípravný kurz Chemie 07. n = N. Doporučená literatura. Látkové množství n. Avogadrova konstanta N A

2.3 CHEMICKÁ VAZBA. Molekula bílého fosforu P 4 a kyseliny sírové H 2 SO 4. Předpona piko p je dílčí jednotkou a udává velikost m.

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. ENZYMY I úvod, názvosloví, rozdělení do tříd

MO 1 - Základní chemické pojmy

LEKCE 2b. NMR a chiralita, posunová činidla. Interpretace 13 C NMR spekter

Procvičování uhlovodíky pracovní list

Vazby v pevných látkách

Gymnázium Jiřího Ortena, Kutná Hora

Řešené příklady k procvičení

Sekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch

Uhlík Ch_025_Uhlovodíky_Uhlík Autor: Ing. Mariana Mrázková

Základní parametry 1 H NMR spekter

Jádro se skládá z kladně nabitých protonů a neutrálních neutronů -> nukleony

Jak již bylo řečeno, isomery se zde liší základním strukturním uspořádáním a prostorové uspořádání nás v tomto ohledu nezajímá.

Voda polární rozpouštědlo

Částicové složení látek atom,molekula, nuklid a izotop

Spektrometr pro měření Ramanovy optické aktivity: proč a jak. Optická sestava a využití motorizovaných jednotek.

Transkript:

Stereochemie Jan laváč

Pravidla Zápočet Průběžný test: Opravný test: 2 x písemný test v semestru test č. 1 přednášky 1-4 test č. 2 přednášky 5-9 nutno celkově 60% bodů, přičemž každý test musí být splněn aspoň na 50% bodů pouze 2 termíny začátek ledna obsah přednášek 1-9; nutno splnit na 60 % Absence na průběžném testu: nutno absolvovat opravný test a splnit na 60 %

Pravidla Zkouška Ústní přezkoušení z celého obsahu učiva Nutnost znalosti předmětu O2 podmíněný předmět!! Termíny: 1 x týdně ve zkouškovém období 1 x měsíc v LS Poslední termín: červen 2015

Pravidla Udělení výjimky Neexistuje!!! Jak mě lze snadno výmluvou rozčílit: měl jsem zlomenou nohu měli jsme úmrtí v rodině (nevlastní strýc z Nového Zélandu) všechno už mám, jen ta stereochemie mi chybí musím chodit na brigádu

Úvod Stereo (řecky pevný, prostorový, tělesný) Stereos the anadian pop rock band

Rozdělení Statická stereochemie Geometrie, prostorové uspořádání atomů v prostoru Dynamická stereochemie konfigurace během chemických reakcí, jejím vlivu na chemickou rychlost či rovnováhu

istorie 1801- francouzský mineralog aüy hemiedrie Enantiomorfní enantios opačný (řec.)

1809 - francouzský fyzik Malus - polarizované světlo

1812 - francouzský fyzik Biot - optická rotace. 1815 - Biot rozšíření pojmu optické rotace na řadu organických molekul, jako byly terpentin, roztoky cukrů, kafru, kyseliny vinné apod. Biotovy zákony Velikost stočení polarizační roviny je úměrná vzdálenosti, kterou světlo v látce urazilo. Velikost pravotočivého a levotočivého stočení stejné látky se odlišuje pouze znaménkem. Velikost stočení způsobené několika vrstvami látky se algebraicky sčítá. Velikost stočení klesá s rostoucí vlnovou délkou světla úměrně druhé mocnině.

1821 - britský astronom Sir John erschel vztah mezi optickou rotací a hemiedrií. 1858 Kekule - objev čtyřvazného uhlíku. D D B A A B

1860 - Louis Pasteur rozdělení hemiedrických krystalů sodnoamonné soli kyseliny vinné. Převedl pojem enantiomorfní do oblasti organických molekul. Molekula a její zrcadlový obraz, které nejsou identické se nazývají enantiomery.

1874 - Pojem - chirální (z řeckého cheir neboli ruka). 60. léta 20. stol. - Ingold, ahn a Prelog - asymetrická molekula hristopher Kelk Ingold Robert Sidney ahn Vladimir Prelog 1893-1970 1899-1981 1906-1998

STRUKTURA Délka vazby, A r B vazebný úhel B r 1 r 2 A torzní úhel A r 1 B r2 r 3 D

Konstituce - počet, druh a spojení atomů v molekule O O 3 O 3 O 3 3 Konstituční isomery

Konfigurace Relativní Absolutní O O O O O O O O O O O O O O O O 2 O 2 O 2 O 2 O sloučeniny se stejnou konstitucí a různou relativní konfigurací

a) y -z y -z F F -x x -x Br Br x z z -y -y b) O O O O O O O O 2 O 2 O sloučeniny se stejnou konstitucí, stejnou relativní a různou absolutní konfigurací

Konformace - popis jednotlivých torzních úhlů v dané molekule O OO O O O OO O OO OO OO OO O různé konformace kyseliny meso-vinné různé konformace cyklohexanového cyklu

Kovalentní atomové poloměry Vazba Délka vazby (nm) Prvek Kovalentní poloměr (nm) - 0.154 0.077 = 0.133 0.0665 0.121 0.0605-0.110 0.033 -O 0.143 O 0.074 =O 0.121 O 0.062 -N 0.147 N 0.074 =N 0.127 N 0.062 N 0.115 N 0.055-0.177 0.100 -Br 0.191 Br 0.114 -I 0.210 I 0.133 Van der Waalsovy poloměry 0.120 O 0.140 N 0.150 0.180 0.150 S 0.185 P 0.190 Br 0.195 3 0.200 Se 0.200 F 0.135 I 0.215

Vodíková vazba hodnota energie 8-40 kj mol 1 typická délka vazby 0.3 nm. O O N O O O intramolekulární vazba intermolekulární vodíková vazba

Rotace kolem vazby a změny dihedrálních úhlů Volná rotace, zbržděná rotace, zamezení rotace Rotace kolem jednoduché vazby - volná Rotace kolem dvojné vazby - zamezená 3 3 3 cis-isomer Z-isomer trans-isomer E-isomer 3

Bredtovo pravidlo (1924) U bicyklických sloučenin, v nichž jsou více než dva atomy společné dvěma kruhům, nemůže s prostorových důvodů vycházet dvojná vazba z atomu, na němž nastává větvení. Konrad J. Bredt 1855-1937 Příklady sloučenin neexistujících díky Bredtovu pravidlu - Zbržděná rotace 2 5 O 2 5 O N N 3 3 3 3

OPTIKÁ AKTIVITA, OPTIKÁ ROTAE A POLARIMETRIE Měření optické aktivity, tj. úhlu stočení polarizovaného světla, se měří polarimetrem. Pozorovaný úhel otočení - optická rotace - je označován symbolem. odnota optické rotace je dána vztahem = [ ]lc Faktory, které ovlivňují velikost optické rotace jsou: charakter vzorku rozpouštědlo teplota vlnová délka použitého záření

teplota, při které se měření provádí rozpouštědlo, ve kterém se měření provádí ] 20 546-76,3 ±0,3 (c = 5,77g, 95% ethanol) vlnová délka použitého záření koncentrace měřené sloučeniny teplota, při které se měření provádí ] 25 D + 52 (neat) vlnová délka sodíkové čáry (589 nm) značí, že se jedná o čistou kapalinu (někdy se též uvádí "homog" )

Molekulární symetrie a chiralita O 3 3 O 3 OO OO Příklady sloučenin s asymetrickým atomem, které nevykazují optickou aktivitu. 3 3 Br Příklady sloučenin, které nemají asymetrický atom a přesto vykazují optickou aktivitu

Prvky symetrie jednoduchá osa symetrie 2 3 6 2 2 Příklady sloučenin obsahujících jednoduchou osu symetrie

rovina symetrie 2 2 Příklad sloučeniny obsahující rovinu symetrie

střed symetrie OO O OO OO O OO Příklad sloučenin obsahujících střed symetrie

Alternující osa symetrie (rotačně reflexní) OO 180 o OO OO S 2 = i S 2 OO O OO OO OO 180 o O O S 1 = O S 2 OO N 90 o N S 4 S 4

Achirální sloučeniny - sloučeniny, které jsou identické se svým zrcadlovým obrazem, neprojevují optickou aktivitu zrcadlo 3 3 3 O 2 N 180 o NO 2 O 2 N O O O O O O 60 o

hirální sloučeniny - struktura není identická se svým zrcadlovým obrazem, dává vznik optické aktivitě zrcadlo F 3 F 3 3 O 2 N 180 o NO 2 F O 2 N O O O O O O 60 o

Enantiomery sloučeniny se stejnou relativní, ale různou absolutní konfigurací - sloučeniny, které nejsou identické, ale jsou si zrcadlovým obrazem - jsou vždy opticky aktivní - jedna opticky aktivní látka má k sobě pouze jeden enantiomer O 3 3 O OO F F OO F 3 F 3 O 2 N NO 2

Diastereoisomery sloučeniny s různou relativní konfigurací - mohou být, ale nemusí být opticky aktivní - jedna látka může mít k sobě více diastereoizomerů OO O O OO O OO O OO O OO O OO O O O O

Stereoisomerie klasifikace založená na symetrii Dvě molekuly s identickým sumárním vzorcem shodné molekuly ano ne homomery isomery stejné spojení mezi příslušnými atomy ano ne stereoizomery konstituční izomery obě molekuly jsou si zrcadlovým obrazem ano enantiomery ne diastereoisomery

Stereoisomerie klasifikace založená na energetických kritériích konfigurační izomery - stereoizomery lišící se vysokou hodnotou energetické bariéry ( 100 kj/mol) jsou stálé za normálních podmínek a izolovatelné. konformační izomery - stereoizomery lišící se nízkou hodnotou energetické bariéry ( 60 kj/mol). Jsou lehce konvertovatelné již za normálních podmínek.

konfigurační enantiomery OO OO O O OO OO OO OO

konformační enantiomery OO OO OO OO

konfigurační diastereoisomery OO OO OO OO OO OO OO OO

Konformační diastereoisomery F Br F Br F Br

konstituční (strukturní) isomery 3 O OO OO OO OO O O 3 O 5 8 O 6 5 8 O 6 OO Et OO Et OO OO 10 16 O 4 10 16 O 4

Stereoisomerie - shrnutí 1. enantiomery jsou sobě zrcadlovým obrazem 2. molekula může mít pouze jeden zrcadlový obraz. Enantiomery proto mohou existovat pouze jako pár. Počet diastereoizomerů je omezen pouze strukturními podmínkami 3. žádné dva stereoizomery nemohou být zároveň enantiomery a diastereoizomery 4. diastereoizomer může být chirální, pokud vykazuje enantiomerismus (není identický se svým zrcadlovým obrazem) 5. ve smyslu nového pojetí jsou diastereoizomery všechny stereoizomery opticky aktivní diastereoizomery, geometrické izomery (cis-trans izomery). 6. v chirální molekule mají atomy přesně stejné relativní polohy s ohledem na meziatomové vzdálenosti a interakce jako v jejím enantiomeru 7. dva enantiomery mají shodné geometrické parametry a liší se pouze absolutní orientací v prostoru. Diastereoizomery se liší i v geometrických parametrech 8. dva enantiomery se liší svými vlastnostmi pouze v chirálním prostředí nebo za použití chirálních činidel. Diastereoizomery se liší svými vlastnostmi i v achirálním prostředí. 9. pojmy enantiomer a diastereoizomer odrážejí vztahy mezi více molekulami

SEMINÁŘ 1. Nakreslete ribosu ve Fisherově projekci, Newmanově projekci, v prostorovém uspořádání. 2. Určete, která látka je opticky aktivní. Překreslete každou látku do Fischerovy projekce a projekčního vzorce F Br F Br Br Br F F Br F F Br F Br Br F

SEMINÁŘ 3. Zaveďte vhodný substituent na benzenové jádro u L-fenylalaninu tak, abyste dostali achirální sloučeninu. 4. Určete, které uvedené sloučeniny jsou opticky aktivní. Nakreslete u nich enantiomer.

SEMINÁŘ úkoly na doma 1. Nakreslete kyselinu meso-vinou v Nevmanově projekci a určete, zda může tvořit konformační enantiomery či diastereoisomery 2. Nakreslete dipeptid Ala-ys a jeho enantiomer. Jaký isomer bude k němu dipeptid ys-ala? 3. Uveďte příklad, kdy chemickým spojením dvou opticky aktivních amk získáte achirální sloučeninu. 4. Nakreslete uridin a k němu enantiomer. Určete, kolik může mít diastereoisomerů. 5. Zopakujte úkol č. 4 pro d-ur. Jak se bude lišit počet diastereoisomerů?