Konflikty genů a speciace
|
|
- Kamil Bureš
- před 6 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA KATEDRA ZOOLOGIE Bakalářská práce Konflikty genů a speciace Lucie Kropáčková Školitel: RNDr. Radka Storchová, Ph.D. Praha 2010
2 Poděkování Chtěla bych poděkovat především svojí školitelce RNDr. Radce Storchové, Ph.D. za velkou trpělivost a rady při psaní mé bakalářské práce. Dále také svým rodičům za podporu při studiu a své sestře Mgr. Petře Rampírové za cenné připomínky. Prohlašuji, že jsem bakalářskou práci vypracovala samostatně pod vedením RNDr. Radky Storchové, Ph.D. a s použitím uvedené literatury. V Praze dne Lucie Kropáčková
3 Obsah 1 Úvod Genové konflikty Meiotický tah Genomový imprinting Konflikt mezi jadernými a cytoplazmatickými geny Intrachromozomální replikace a transpozony Genové konflikty a speciace Hybridní sterilita a meiotický tah Genomový imprinting a abnormální embryonální vývoj Cytoplazmatická samčí sterilita a Wolbachia Transpozony a hybridní sterilita Návaznost na diplomou práci Závěr Použitá literatura... 19
4 Abstrakt V této bakalářské práci se budu zabývat genovými konflikty a jejich uplatněním při vzniku nových druhů. Genové konflikty mohou vést především k vytvoření postzygotické reprodukční bariéry mezi nově vznikajícími druhy. Příkladem takového konfliktu může být meiotický tah na pohlavních chromozomech, který vychyluje poměr pohlaví a zdá se, že hraje roli při vzniku hybridní sterility samců. Dalším příkladem může být genomový imprinting způsobující abnormální placenty a embryonální vývoj u mezidruhových hybridů. Koevoluční zápas mezi cytoplazmatickými a jadernými geny může být příčinou sterility pylu u hybridů rostlin. Podobně navozuje vnitrobuněčná bakterie Wolbachia cytoplazmatické nekompatibility u živočichů. Také mobilizace transpozonů může vést k poruchám ve vývoji hybridů. Klíčová slova: genové konflikty, postzygotická izolace, cytoplazmatická samčí sterilita, hybridní sterilita, cytoplazmatická nekompatibilita, abnormální placenty a embryonální vývoj Abstract In this thesis I ll examine the role of genetic conflicts in the origin of new species. Genetic conflicts can lead to an origin of reproductive barrier between the emerging species, especially postzygotic reproductive isolation. An example of such conflict could be meiotic drive on sex chromosomes, which distort sex ratio and seems to act a role in a hybrid male sterility. Another example may be genomic imprinting causing an abnormal placenta and embryo development in interspecies hybrids. Coevolution between cytoplasmic and nuclear genes can cause sterility of pollen in hybrids from plants. Similarly, the intracellular bacterium Wolbachia induces cytoplasmic incompatibility in animals. Mobilization of transposons may also lead to hybrid dysgenesis. Key words: genetic conflicts, postzygotic isolation, hybrid sterility, cytoplasmic male sterility, cytoplasmic incompatibility, abnormal placenta and embryo development 4
5 1 Úvod Podle teorie sobeckého genu (Dawkins 2003) se geny organismu snaží maximalizovat pravděpodobnost svého přenosu do další generace. Většina genů se toho snaží dosáhnout tím, že pozitivně přispívá k přežití a rozmnožování svého nositele (zvyšuje zdatnost jedince neboli fitness). Některé geny si však našly způsob jak se šířit bez přispívání k větší zdatnosti organismu. Těmto genům se říká sobecké genové elementy. Mezi geny s různými strategiemi svého šíření pak vznikají konflikty. Důvody konfliktů mohou být různorodé. Například u některých genů dochází k jevu, kdy se jedna alela dokáže během meiózy přenést do více než 50% germinálních buněk na úkor alternativní alely (tomuto jevu se říká meiotický tah; Presgraves 2008). Toho může dosáhnout tak, že způsobí zánik všech gamet, které nesou alternativní alelu. Tím ale může snížit reprodukční potenciál svého nositele a poškodit i jiné geny v genomu. Mezi geny způsobujícími meiotický tah a ostatními geny v genomu pak dochází ke konfliktu. Další typ konfliktů zahrnuje geny různě naprogramované svými rodiči. Protože matka a otec mají jiné zájmy ohledně svých potomků, mohou naprogramovat své geny tak, aby ovlivňovali své potomky různým způsobem. Tomuto jevu se říká genomový imprinting (Mochizuki et al. 1996). Další typ konfliktů může vznikat mezi geny s různým způsobem dědičnosti. Například mitochondriální DNA, která se obvykle dědí jen po mateřské linii, může poškozovat samce, protože pro ní představují slepou evoluční linii. Tím se dostává do konfliktu s jadernými geny, které se dědí skrze obě pohlaví (Frank 1989). Jiné sobecké genové elementy se mohou přenášet do další generace tak, že upřednostňují častěji vlastní replikaci před jinými geny v organismu (transpozony; Michalak 2009). Většina genů v genomu je replikována pouze jednou za buněčný cyklus, transpozony jsou ale schopny tento mechanismus překonat. Protože sobecké genové elementy často poškozují své nositele a tím i většinu ostatních genů, které s nimi nejsou ve vazbě, vzniká selekční tlak na potlačení jejich účinků. V genomu se proto rychle fixují mutace, které potlačují účinek sobeckých elementů. Těmto mutacím se říká supresory (Burt & Trivers 2006). Mezi sobeckými genovými elementy a jejich supresory dochází k rychlé koevoluci podobným principem jako mezi parazity a hostiteli (princip červené královny; Ridley 1999). Díky rychlé koevoluci mezi sobeckými genovými elementy a jejich supresory, dochází k rychlé molekulární evoluci sobeckých elementů, což může mít důležité následky pro evoluci organismu. Rychlá evoluce může například vést ke vzniku reprodukční izolace mezi různými populacemi jednoho druhu, tedy ke speciaci. 5
6 Hlavním cílem této bakalářské práce je shromáždit příklady, kdy vnitrogenomové konflikty pravděpodobně vedly ke vzniku nových druhů. Práce je rozdělena do dvou hlavních kapitol. První kapitola popisuje různé typy genových konfliktů. Druhá kapitola pak shrnuje jednotlivé příklady, kdy se genové konflikty mohly uplatnit při vzniku reprodukční izolace. Na závěr pak krátce popíši, jak bych chtěla studovat roli genových konfliktů ve speciaci v rámci své budoucí diplomové práce. 2 Genové konflikty V této kapitole se budu zabývat obecně genovými konflikty mezi různými typy genů; jak a kdy vznikají a jakým způsobem mohou být potlačeny. Konkrétně se jedná o (1) genové konflikty zahrnující geny způsobující meiotický tah, (2) konflikty mezi maternálně a paternálně zděděnými geny, (3) konflikty mezi cytoplazmatickými a jadernými geny a (4) konflikty mezi transpozony a ostatními geny v genomu. 2.1 Meiotický tah Meiotický tah je jev, kdy se jedna alela dostane do více než poloviny gamet. Alely způsobující meiotický tah se nazývají segregation distorters. Geny způsobující meiotický tah mohou manipulovat oogenezí (Rutkowska & Badyaev 2008) i spermatogenezí (Price et al. 2009). Při oogenezi vzniká z jedné diploidní buňky 1 haploidní vajíčko a 2-3 pólové buňky. Alely sobeckých elementů se snaží preferenčně proniknout do vajíčka na úkor jiných alel, které se dostanou do pólových buněk, skrze které se už nemohou dostat do další generace. U samců vznikají během meiózy z jedné diploidní buňky 4 haploidní spermatidy. Meiotický tah u samců často nastává až postmeioticky na úrovni spermatid, kdy spermie nesoucí jednu alelu mohou zabíjet spermie vlastnící jinou alelu, protože vznikající spermie jsou propojeny cytoplazmatickými můstky. Geny způsobující meiotický tah se častěji vyskytují na pohlavních chromozomech než na autozomech, protože pohlavní chromozomy kromě krátké pseudoautozomální oblasti nerekombinují (Jaenike 2001). Meiotický tah je totiž většinou způsoben alelami více genů, 6
7 které musí být ve vazbě. Například pokud jedna alela produkuje jed, který zabíjí ostatní spermie, musí se zároveň vytvořit protijed, aby jed nezabíjel i spermie nesoucí stejnou alelu. To může nastat jen pokud chromozomy nerekombinují. Na autozomech dochází k meiotickému tahu obvykle jen v oblastech, které nerekombinují - například v oblastech inverzí jako je t-haplotyp na 17. chromozomu u myší (Lyon 1991). Dalším důvodem, proč se meiotický tah častěji vyskytuje na pohlavních chromozomech, může být rozdílná velikost pohlavních chromozomů. X u savců nese více genů než Y, který degeneruje. Stejně tak u většiny ptáků patří chromozom Z mezi největší, zatímco W chromozom je podstatně menší. Velikost chromozomů u ptáků ovlivňuje pohyb a stabilitu pohlavních chromozomů během párování při meióze, což může vést k tomu, že se jeden pohlavní chromozom může častěji dostávat do vajíčka než druhý (Rutkowska & Badyaev 2008). Dále by mohla být segregace pohlavních chromozomů ovlivněna polohou centromery a proteiny vázanými na chromozomy (protein bodies), které mají důležitou roli v pohybu chromozomů (Rutkowska & Badyaev 2008). U samců může meiotický tah způsobit likvidaci poloviny gamet a tím snížit plodnost jedince (Price et al. 2009, Montchamp-Moreau & Joly 1997). Meiotický tah na pohlavních chromozomech také způsobuje vychýlení poměru pohlaví. To je pro jedince také nevýhodné, protože jeho potomci budou mít problém v populaci, kde převažuje jedno pohlaví, nalézt partnera (Jaenike 2001). V obou případech vede meiotický tah ke vzniku supresorů, které potlačují škodlivý efekt meotického tahu. Supresorová mutace může vzniknou na jakémkoli místě v genomu, které není ve vazbě s genem způsobujícím meiotický tah (Hurst & Pomiankowski 1991, Frank 1991). V případě meiotického tahu na pohlavních chromozomech supresory nemusejí vznikat jen na autozomech, ale i na druhém pohlavním chromozomu. Pokud je tedy tah na X, bude důležitým supresorem Y (Hurst & Pomiankowski 1991). Meiotický tah najdeme u živočichů (Montchamp-Moreau et al. 2006), ale i u hub (Van der Gaag et al. 2000) a rostlin (Buckler et al. 1999). Kvůli častému vzniku meiotického tahu na pohlavních chromozomech u heterogametického pohlaví se mohl vytvořit mechanismus, který těmto konfliktům předem zabraňuje (Meiklejohn & Tao 2009), tím je meiotická inaktivace pohlavních chromozomů u heterogametického pohlaví. Umlčování nastává během meiotické fáze spermatogeneze v pachytene, když dochází k párování neboli synapsi homologních chromozomů. Meiotická inaktivace pohlavních chromozomů je zprostředkována epigenetickými modifikacemi pohlavních chromozomů a byla nalezena u savců (Turner et al. 2002), octomilky (Hense et al. 2007) i háďátka C. elegans (Kelly et al. 2002). Nedávno bylo ukázáno, že k ní dochází také 7
8 během oogeneze u organismů s heterogametickými samicemi (Schoenmakers et al. 2009, Namekawa & Lee 2009). Meiotická inaktivace pohlavních chromozomů je iniciována několika DNA opravnými proteiny a je udržována působením histonových modifikací jako je histonová deacetylace, methylace, ubiquitinace a inserce jiných histonových variant (Turner 2007). U savců přetrvává částečná inaktivace chromozomu X až do konce spermatogeneze (Turner 2007). 2.2 Genomový imprinting U placentálních savců bylo pozorováno, že u některých genů dochází k rodičovsky specifické genové expresi, tzn. gen je exprimovaný jen z jedné alely, buď otcovské nebo mateřské. Tomuto jevu se říká genomový imprinting (Reik & Walter 2001). Je způsoben epigenetickými modifikacemi DNA a chromatinu (jako je například metylace cytosinu). To znamená, že maternální a paternální alely se liší v expresi, i když mají stejnou nukleotidovou sekvenci. K epigenetickému značkování imprintovaných genů dochází u samců v germinálních buňkách před meiózou, zatímco u samic v oocytech, když je meióza zastavena a oocyty rostou (Reik & Walter 2001). Genomový imprinting určitého genu se může lišit mezi druhy a mezi tkáněmi stejného jedince (Mochizuki et al. 1996). V savčím genomu je známa asi stovka imprintovaných genů (Morison et al. 2005, Williamson et al. 2009). Většina imprintovaných genů se známou funkcí hraje roli při růstu embryí. Některé imprintované geny kódují růstový faktor nebo jeho inhibitor a proto ovlivňují vývoj placenty a embrya, zatímco ostatní geny jsou spojované s funkcí kojení a polykacího reflexu, chutí a přitahováním pozornosti matky (Mochizuki et al. 1996). Genomový imprinting byl objeven díky pozorování růstové retardace a smrti embryí, které nesou maternální duplikace a paternální deficience (nebo i obráceně) jednoho chromozomu nebo celého genomu (Solter 1988). Retardace nebo smrt embrya nastala v důsledku nevyváženého počtu maternálních a paternálních chromozomů, které způsobí, že některé imprintované geny jsou exprimovány více nebo naopak méně, než by odpovídalo normálu. Teorií proč ke genovému konfliktu dochází je několik, ale nejpravděpodobnější je asi teorie rodičovského konfliktu (tug of war; Zeh & Zeh 1996). Podle této teorie genomový imprinting nastává u druhů, kde se samice, která dlouho vyživuje mládě, páří s několika samci a potomci mají různé otce. Samčí genom se snaží, aby embryo (jeho potomek) získalo co nejvíc živin od matky a nezajímá se o ostatní embrya (potomky jiných samců). Naopak geny 8
9 od matky se snaží tyto otcovské geny potlačovat, aby všechna embrya byla vyživována stejně, protože všichni potomci nesou 50% její genetické informace. U vejcorodých savců genomový imprinting není, což je v souladu s teorií rodičovského konfliktu. Zajímavé je, že podobný jev jako je genomový imprinting u savců byl pozorován u krytosemených rostlin, ale dochází k němu pouze v endospermu, což je extraembryonální triploidní (3n) pletivo vyživující embryo. U rostlin bylo pozorováno jen několik málo imprintovaných genů. Ve většině případů je aktivní maternální alela a paternální je utlumena například DNA methyltransferázou 1 (Jullien et al. 2006, 2008). PHERES1 (PHE) je jediný gen, který je paternálně aktivní a maternálně potlačen trimetilací H3K27 (Makarevich et al. 2006). 2.3 Konflikt mezi jadernými a cytoplazmatickými geny Cytoplazmatické geny, tj. geny v mitochondriální či plastidové DNA, se dědí typicky uniparentálně; ve většině případů pouze po mateřské linii. Samci tak znamenají smrtelný konec pro cytoplazmatické geny. Zabíjením či sterilizací samců mohou cytoplazmatické geny přesměrovat zdroje k jejich příbuzným v samičích potomcích. Tím ovšem uškodí všem ostatním genům v samcích. Zabíjení samčích jedinců také vychýlí poměr pohlaví v populaci ve prospěch samic. Obojí pak vytváří selekční tlak na vznik supresorů v jaderné DNA. Vznik supresorů je podporován na všech chromozomech kromě chromozomu Z. Na chromozomu Z se supresory nevyvíjí, protože se tento chromozom dědí podobně jako cytoplazmatické elementy, tzn. převážně po mateřské linii. Z tohoto důvodu se mohou i na chromozomu Z vytvářet mutace, které škodí samcům (Hurst & Pomiankowski 1991). Otázkou zůstává, jak mitochondriální geny rozpoznají, že se nacházejí v samcích. Y vázaný růstový promotor může poskytnout mitochondrii jednoznačný signál, že embryo je samec, a může být tudíž zlikvidováno (Zeh & Zeh 2008). Chromozom Y se naopak od mitochondriální DNA dědí pouze po otci. Tento diametrální rozdíl umístil geny na Y a mitochondriální geny v přímý konflikt proti sobě. Sterilita samců způsobená mitochondriálními geny je často pozorovaná u rostlin a je nazývána jako cytoplasmic male sterility. Je většinou způsobena expresí různých proteinů mitochondriální DNA. Tento jev vede ke sterilitě pylu a byl pozorován u mnoha druhů vyšších rostlin, například u petúnie (Nivison et al. 1989, 1994), kukuřice (Dewey et al. 1987) a slunečnice (Laver et al. 1991, Monéger et al. 1994). Cytoplazmatická samčí sterilita vede často ke vzniku populace složené z rostlin nesoucích samčí i samičí květy a rostlin nesoucích 9
10 pouze samičí květy (samčí jsou sterilní). U živočichů zabíjení či sterilizace samců způsobená mitochondriálními geny není známá, což může souviset se skutečností, že mtdna živočichů nese jen málo genů, protože většina genů z mtdna se přestěhovala do jádra. Dalším důvodem může být, že většina rostlin je jednodomá. U takových rostlin dojde jen ke sterilizaci pylu a rostlina poté může více energie investovat do tvorby vajíček. Podobně jako mitochondrie nebo chloroplast se dědí bakterie žijící uvnitř buňky, která je přenášena do další generace napadnutím hostitelských vajíček, čili je přenášena pouze po mateřské linii, zatímco spermie tuto bakterii nepřenáší. Bakteriální geny se proto mohou chovat stejně jako geny mitochondrií a plastidů. Bylo pozorováno, že bakterie může způsobit zabíjení mužských potomků (Jiggins et al. 2001), přeměnu samce na samici (Rigaud et al. 1991), partenogenezi (Stouthamer & Werren 1993) a cytoplazmatickou nekompatibilitu (Breeuwer & Werren 1990). Příkladem takové bakterie může být Wolbachia nalezená u členovců (Arthropoda; Bordenstein & Werren 1998) a hlístů (Nematoda; Rao 2005). 2.4 Intrachromozomální replikace a transpozony Transpozony jsou mobilní sobecké genové elementy, které zvětšují svoji vlastní frekvenci přenosu vkládáním kopií na nová místa v genomu. Mají také schopnost pohybu mezi druhy (Burt & Trivers 2006). Horizontální transfer byl pozorován například u Mariner-like transpozomálního elementu (Lohe et al. 1995), ale princip je zatím stále neznámý. Existuje mnoho typů transpozonů, které využívají různé strategie množení. DNA transpozony typicky kódují jeden protein transposásu, který rozpozná konec elementu, vyřízne jej ven a znovu vloží na jiné místo v genomu. Tento mechanismus se nazývá cut-and-paste. Jiné transpozony mohou kódovat i více než jeden protein a množit se prostřednictvím činnosti reverzní transkriptázy, jenž přepisuje RNA transkript na DNA, který se následně vmezeří do genomomu (mechanismus copy and paste ). Transpozony slouží jako zdroj genetických změn. Většina genetických změn způsobena transpozony má negativní vliv na fitness jedince. Například pokud se transpozon inzertuje do funčního genu, může ho inaktivovat. Některé transpozony nesou silné promotory a jejich inzerce poblíž určitého genu může zvýšit míru exprese tohoto genu (Hayes 2003). Nadměrné množení transpozonů může vést až k buněčné smrti, protože buňka nebude stíhat opravovat DNA. Jen velmi malé množství nových inzercí transpozonů a přesmyků mohou mít na hostitele prospěšný vliv a mohou být pozitivně selektovány. 10
11 Transpozony jsou všudypřítomné; byly nalezeny u eubakterií, archebakterií i eukaryot. U bakterií mohou transpozony způsobit například rezistenci proti antibiotikům (Hayes 2003). Množství transpozonů v genomu je různé u jednotlivých organismů a druhů. Počet transpozonů v genomu často odráží velikost genomu. Druhy s velkým množstvím transpozonů mají velký genom, zatímco druhy bez transpozonů mají malý genom (Burt & Trivers 2006). Většina druhů má mnoho různých typů transpozibilních elementů. Transpozony se dělí na DNA transpozony a retrotranspozony ty se dále rozdělují na LINEs (long interspersed nuclear elements), SINEs (short interspersed nuclear elements) a retrotranspozony obsahující LTR (long terminar repeat), každý typ je přítomný v genomu v mnoha kopiích. Díky takovému množství mají transpozony zaručen vážný vliv na jejich hostitele. Hostitel se může bránit škodlivému vlivu transpozonů jejich inaktivací (například metylací) či vystřižením z genomu, ke kterému dochází v buněčném cyklu mezi DNA replikací a mitózou. 3 Genové konflikty a speciace Speciace je proces, během kterého dochází ke vzniku reprodukční bariéry mezi dvěma populacemi, což vede ke vzniku nových druhů. Reprodukční bariéry mohou být prezygotické (nedochází při nich k páření jedinců a vzniku hybridů) nebo postzygotické (dochází ke vzniku hybridů, ale ti se dál nerozmnožují, protože jsou například sterilní či neživotaschopní). Nejčastěji vzniká reprodukční izolace v alopatrii, tzn. když jsou populace oddělené, a je důsledkem genetické divergence obou populací, která způsobí nekompatibilitu mezi genomy nově vznikajících druhů. Jedním z důležitých faktorů, který může způsobit vznik nekompatibility mezi populacemi, jsou vnitrogenomové konflikty, které vedou k rychlé koevoluci mezi jednotlivými aktéry konfliktů. V této kapitole popíšu známé příklady, kdy genové konflikty vedly ke vzniku reprodukční izolace mezi populacemi. 11
12 3.1 Hybridní sterilita a meiotický tah Jak bylo popsáno výše, k meiotickému tahu dochází především na pohlavních chromozomech. Chromozom X a Y (případně Z a W) mezi sebou soupeří o to, který se dostane do většího počtu germinálních buněk. Meiotický tah na pohlavních chromozomech způsobuje vychýlení poměru pohlaví v populaci, což vede ke vzniku supresorů na autozomech. Pokud dojde k oddělení dvou populací, může v každé populaci dojít ke vzniku jiných genů způsobujících meiotický tah a jiných supresorů. Po zkřížení takovýchto populací může dojít k nerovnováze mezi geny způsobujícími meiotický tah a jejich supresory. To může vést buď k objevení meiotického tahu u hybridů, v extrémním případě až ke vzniku hybridní sterility (Frank 1991). Sterilita mezidruhových hybridů často postihuje pouze heterogametické pohlaví, tzn. samce u organismů s XY systémem určení pohlaví a samice u organismů se ZW chromozomy. Tento jev (tzv. Haldaneovo pravidlo; Haldane 1922) by mohl být způsobený právě meiotickým tahem. V poslední době se skutečně pro to objevují první důkazy. Tao et al. (2001) vytvořili imbrední linie octomilek, které nesou na genetickém pozadí Drosophila simulans krátké úseky D. mauritiana. Linie nesoucí krátký úsek (80 kb) chromozomu 3 vykazovala meiotický tah. Je zajímavé, že ve stejné oblasti byl zmapovaný gen způsobující F1 samčí hybridní sterilitu. Tento autozomální lokus na chromozomu 3 (nazvaný Too much yin - Tmy) se zdá být dominantním autozomálním supresorem X vázaného meiotického tahu u D. simulans. Další důkaz toho, že hybridní sterilita samců může souviset s meiotickým tahem, byl objeven u hybridů mezi dvěma poddruhy octomilek D. pseudoobscura (D. p. pseudoobscura a D. p. bogotana). Hybridní samci vykazují neúplnou sterilitu - plodnost hybridů je velmi nízká a hybridní samci obvykle produkují potomky jen ve věku několika týdnů. Zároveň u nich byl pozorovaný meiotický tah na chromozomu X způsobující, že naprostá většina potomků těchto hybridů jsou samice. Jak hybridní sterilita, tak meiotický tah je způsoben několika geny na chromozomu X. Je zajímavé, že tyto geny mapují do stejných oblastí, což naznačuje, že sterilita hybridů by mohla být způsobena právě meiotickým tahem (Orr & Irving 2005). Geny na X chromozomu způsobují meiotický tah jen v hybridech, ale ne u poddruhu D. p. bogotana, protože ten nese na autozomech supresory. Pří detailnějším mapování jednoho lokusu na chromozomu X bylo zjištěno, že stejný gen způsobuje sníženou fertilitu hybridů i meiotický tah. Tento gen byl nazvaný Overdrive (Ovd; Phadnis & Orr 2009). 12
13 Mus musculus musculus a Mus musculus domesticus představují dva nedávno oddělené myší poddruhy, které se v přírodě kříží v oblasti úzké hybridní zóny (Macholán et al. 2007). V myší hybridní zóně bylo pozorováno, že M. m. musculus Y infiltroval do genomu M. m. domesticus na Česko-Bavorské straně kontaktní zóny. Y invaze způsobuje manipulaci poměrem pohlaví ve prospěch samců. V normálních populacích je poměr pohlaví vychýlen k samicím. Naproti tomu, v oblasti introgrese chromozomu Y je poměr pohlaví víc v rovnováze a signifikantě odlišný od ostatních populací (Macholán et al. 2008). V tomto případě však meiotický tah nezpůsobuje hybridní sterilitu, ale naopak tím, že usnadňuje mezidruhovou introgresi chromozomu Y, může způsobit oslabení mezidruhové reprodukční bariéry. 3.2 Genomový imprinting a abnormální embryonální vývoj Rychlá molekulární evoluce imprintovaných genů by také mohla souviset se vznikem reprodukční bariéry mezi druhy, jak naznačují některé studie. Vrana et al studovali úlohu genového imprintingu u abnornálně velikých embryí mezidruhových hybridů u rodu Peromyscus. P. maniculatus je polygamní druh, kdežto P. polionotus je monogamní. Hybridní embrya P. maniculatus x P. polionotus jsou o 40% menší ve srovnání s oběma rodičovskými druhy. Naopak reciproká hybridní embrya P. polionotus x P. maniculatus jsou přerostlá a většinou hynou. Autoři předpokládali, že porucha v embryogenezi hybridů, by mohla být způsobena absencí imprintingu u monogamního druhu (viz teorie rodičovských konfliktů). Kupodivu, imprinting se zdál být zachovalý u obou druhů, co ale vyšlo najevo je, že imprinting byl porušený u hybridů. Konkrétně ze čtyř testovaných imprintovaných genů (Igf2, Peg3, Snrpn, Mest), tři vykazovaly biparentální expresi u přerostlých embryí (Vrana et al. 1998). U Peromyscus byly nalezeny dvě oblasti genomu (Mex1 na chromozomu X a Esx1 na autozomu) odpovědné za přerůstání embryí při křížení P. polionotus x P. maniculatus (Loschiavo et al. 2007). Pro obě oblasti byli nalezeny kandidátní geny; pro Mexl maternálně exprimovaný Esx1 a pro Peal paternálně exprimovaný Pw1/Peg3. V jiné studii pozorovali rozdíly v expresi imprintovaných genů mezi placentální a somatickou tkání u hybridů Peromyscus (Wiley et al. 2008). Rozdílná exprese v placentální a embryonální tkáni byla pozorována například u genu Dio3. U některých genů nebyl prokázán rozdíl v expresi, u jiných byl rozdíl jen v určitém směru křížení. Například u genu Peg10 byla pozorována rozdílná exprese při křížení P. polionotus x P. maniculatus, zatímco u opačného křížení byla 13
14 exprese vždy paternální. Dalšími studovanými geny byly Dcn, Plagl1, Kcnq1ot1, Peg3, Meg3. Dále pozorovali rozdílnou expresi některých imprintovaných genů v mozku a ostatních tkání. Existence regulačních odchylek u nedávno rozdělených druhů naznačuje roli v reprodukční izolaci (Wiley et al. 2008). Placentální fenotyp u hybridů Peromyscus je podobný hybridům mezi dvěma druhy myší, Mus musculus a Mus spretus (Rogers & Dawson 1970, Zechner et al. 1996). Kříženci M. musculus x M. spretus vykazují zmenšenou placentu, kdežto v opačném směru křížení je placenta zvětšená. Byla pozorována pouze slabá nebo žádná souvislost váhy placenty s velikostí embrya (Kurz et al. 1999). Genetická analýza ukázala, že velikost placenty mezi kříženci M. musculus x M. spretus mapuje na lokus Interspecific hybrid placental dysplazia (Ihpd) na proximální části chromozomu X (Zechner et al. 1996). Do stejného lokusu Ihpd mapuje i hybridní sterilita samců (Elliott et al. 2001). Je proto možná souvislost mezi abnormálním růstem embryí a sterilitou samců u hybridů. V objevené oblasti však zatím nebyl identifikovaný konkrétní gen (geny), který je za pozorované fenotypy odpovědný. Myší X chromozom je imprintovaný ve většině extraembryonálních membránách včetně trofoblastu, zde jsou aktivní jen maternálně dědičné geny a paternální X chromozom je inaktivovaný (Zechner et al. 1996, 1997). Bylo proto zkoumáno, jestli abnormální velikost placent u hybridů nesouvisí s poruchou imprintingu chromozomu X u samic. Zdá se ale, že tomu tak není, protože abnormální placenty jsou jak u hybridních samců tak u samic (Zechner et al. 1996). Také většina autozomálních genů je imprintovaná u hybridních embryí myší, což naznačuje, že porucha imprintingu nehraje u abnormálně rostlých embryí myší tak důležitou roli jako u Peromyscus (Zechner et al. 2004). Existují ale výjimky, například Peg1 gen, který je normálně exprimovaný pouze z paternální alely, je u hybridů často exprimovaný bialelicky (Shi et al. 2004). Rychlá koevoluce mezi embryem a matkou a nebo mezi mateřským a otcovským zděděným genomem uvnitř embrya, může zesílit důležitost postzygotické izolace jako speciačního mechanismu mezi živorodými taxony (Zeh & Zeh 2000). Genetický efekt X chromozomu na embryo a placentální vývoj je pozorován u Mus a Peromyscus, zatímco epigenetický efekt X inaktivace je unikátní pro Peromyscus (Zechner et al. 2004, Vrana et al. 2000). U Peromyscus interakce Peg3 (exprimovaného bialelicky v placentě) a chromozomu X má vliv na abnormality placenty (Vrana et al. 2000), zatímco u myší toto nebylo pozorováno (Zechner et al. 2004). Tyto výsledky ukazují, že u blízce příbuzných skupin můžou být různé molekulární mechanismy vzniku reprodukční bariéry i přesto, že fenotypický projev je stejný. 14
15 3.3 Cytoplazmatická samčí sterilita a Wolbachia Také konflikt mezi cytoplazmatickými geny přenášenými pouze po maternální linii a jadernými geny děděnými oběma pohlavími by teoreticky mohl vést ke vzniku reprodukční izolace mezi druhy. Protože se cytoplazmatické geny dědí pouze po maternální linii, mohou zabíjet či sterilizovat samce. To je uvnitř druhu potlačeno jadernými geny, ale může se to projevit u hybridů. Toto bylo pozorováno při křížení cizosprašné Mimulus guttatus a samosprašné M. nasutus. F2 hybridi s cytoplazmou M. guttatus neprodukují pyl (Fishman & Willis 2006). Podobně jako mitochondrie či plastidy by se mohly chovat i vnitrobuněčné bakterie jako je Wolbachia. Tato endosymbiotická alpha-proteobakterie se do další generace dostává pouze po mateřské linii a přenáší se cytoplazmou vajíčka. Zdá se, že se uplatňuje při vzniku reprodukční bariéry mezi druhy. Reprodukční bariéra může vzniknout cytoplazmatickou nekompatibilitou. Cytoplazmatická nekompatibilita může být jednosměrná i obousměrná. Jednosměrná cytoplazmatická nekompatibilita způsobuje, že páření mezi nakaženým samcem a nenakaženou samicí je neplodné, protože bakterie uvolňuje toxin do protoplastu spermie, což vede k zastavení vývoje zygoty. Párování mezi nakaženým samcem a nakaženou samicí ovlivněno není, protože nakažená samice si tvoří antitoxiny (viz obrázek 1). Obousměrná 15
16 cytoplazmatická nekompatibilita vzniká u populace, která je nakažena více druhy Wolbachia. Pouze jedinci nakaženi stejným druhem bakterie jsou schopni se mezi sebou rozmnožovat, mezi jedinci nakaženými různými druhy bakterie je rozmnožování nemožné (viz obrázek 2). Takováto nekompatibilita může vést i ke vzniku reprodukční bariéry a tedy ke vzniku nových druhů (Bordenstein & Werren 1998). Bylo to ukázáno na příkladu blanokřídlého hmyzu Nasonia. Obousměrná cytoplazmatická nekompatibilita způsobuje kompletní reprodukční izolaci mezi blízce příbuznými druhy N. vitripennis a N. giraulti, která však může být odstraněna eliminací mikroorganismu pomocí antibiotika (Breeuwer & Werren 1990). Jedinec však může být nakažen i více druhy bakterie najednou. Při nakažení více druhy mohou mezi bakteriálními druhy v hostiteli probíhat genetické výměny (Werren et al. 1995). Dvojitá infekce může posílit reprodukční izolaci vytvořením více nekompatibilních křížení (Bordenstein & Werren 1998). 3.4 Transpozony a hybridní sterilita Transpozibilní elementy jsou všudypřítomné složky prokaryotického a eukaryotického genomu. Zvýšená míra transpozice může vést k různým jevům jako jsou chromozomální přestavby, zvýšená míra rekombinace, nondisjunkce či vznik sterility. Bylo předpovězeno, že míra transpozice může vzrůst u mezidruhových hybridů a vést k jejich sterilitě. Transpozony tak mohou vést ke vzniku reprodukční izolace. Zvýšená míra transpozice byla pozorována při mezidruhovém křížení mezi Drosophila buzzatii a D. koepferae. U mezidruhových hybridů byla míra transpozice signifikantně vyšší než u rodičovských druhů (Labrador et al. 1999). Poruchy ve vývoji způsobené mobilizací P, hobo (Blackman et al. 1989) nebo I (Gauthier et al. 2000) transpozonálního elemetu byly pozorovány při křížení divokých populací Drosophila melanogaster s laboratorními kmeny odvozenými z tohoto druhu před mnoha lety. P element byl nalezen v divoké populaci (P kmen), ale ne v laboratorních kmenech s dlouhou historií. Proto lze předpokládat, že pronikl do genomu D. melanogaster až ve 20. století (Kidwell 1983). Naopak u laboratorních kmenů s dlouhou historií byl nalezen kmen M. Při křížení mezi kmeny M a P dochází u hybridů ke sterilitě, chromozomálním přestavbám a vyšší mutační frekvenci (Kidwell et al. 1977). U D. virilis byla pozorována hybridní sterilita pouze při křížení mezi samicí z divoké populace a samcem z laboratorního kmene. Podobný mechanismus jako u D. melanogaster je spojený s nedostatečným růstem gonád u hybridních potomků obou pohlaví. Tento fenomen 16
17 byl citlivý na teplotu při vývoji (Lozovskaya et al. 1990). Čtyři strukturálně odlišné transpozibilní elementy, které mohou způsobit poruchu ve vývoji u hybridů jsou - Ulysses (retrotranspozon obsahující LTR), Penelope (retrotranspozon obsahující invertní opakování připomínající DIRS-1 element Dictyostelium), Helena (element podobný LINE) a Paris (element podobný mariner/tcl) (Petrov et al. 1995, Lozovskaya et al. 1990, Blumenstiel & Hartl 2005). Nadměrná mobilizace transpozonů byla pozorována i u hybridů rostlin. Například u hybridů mezi kultivovanou rýží a divokou rýží (Zizania latifolia) bylo zaznamenáno zvýšené zmnožení mping a Pong tranpozibilních elementů (Shan et al. 2005). Transpozice může mít také důležitou roli při vzniku nových druhů hybridizací. Například u slunečnice, starověká hybridizace rodičovských druhů Helianthus annuus a H. petiolaris dala vznik třem hybridním taxonům H. anomalus, H. deserticola a H. paradoxus (Ungerer et al. 2006). Všechny tři taxony mají nukleární genom o 50% větší než jejich rodičovské druhy a liší se karyotypy. Předpokládá se, že při hybridizaci došlo k aktivaci transpozonů, které usnadnili chromozomální přestavby. To mohlo změnit vlastnosti rostlin a usnadnit tak přežití nových druhů rostlin například tím, že se snížila konkurence mezi rodičovskými druhy a nově vzniklými druhy hybridizací. 4 Návaznost na diplomou práci V diplomové práci se budu zabývat rolí konfliktů při vzniku dvou poddruhů myši domácí Mus musculus domesticus a M. m. musculus. Již bylo zjištěno, že sterilita F1 hybridních samců je způsobena geny na chromozomu X (Storchová et al. 2004). Budu se snažit zjistit, zda u dvou myších poddruhů dochází ke vzniku hyperplázií/hypoplázií placent či k zvýšenému/sníženému růstu embryí. V případě, že ano, pokusím se zmapovat lokusy odpovědné za pozorované fenotypy a zjistit jakou roli zde hraje chromozom X. Případně jestli hraje nějakou roli genomový imprinting. 17
18 5 Závěr Některé genové konflikty vedou ke vzniku postzygotické reprodukční bariéry, ale příkladů kdy to bylo prokázáno není mnoho. U octomilky byly nalezeny geny způsobující meiotický tah i hybridní sterilitu samců na stejném lokusu X chromozomu. To ukazuje, že hybridní sterilita by mohla souviset s meiotickým tahem. Na rozdíl od toho se také zdá, že by mohl meiotický tah na chromozomu Y oslabit reprodukční bariéru mezi poddruhy myší. U placentálních savců hraje důležitou roli při tvorbě postzygotické izolace rychlá koevoluce mezi genomem zděděným od matky a otce uvnitř embrya. Bylo prokázáno, že genomový imprinting odpovídá za abnormální placenty a embrya. U rostlin může konflikt mezi cytoplazmatickými a jadernými geny vést ke sterilitě samčích pohlavních buněk (pylu), což bývá způsobeno mutací v mitochondriálním genomu, zatímco bakterie mohou způsobit nekompatibility mezi druhy nebo populacemi u živočichů. Existuje spousta důkazů o tom, že u hybridů je vyšší míra transpozice, ale zatím je méně důkazů o tom, že by to způsobovalo sterilitu. To platí pro rostliny i pro octomilku. Jak je vidět, tak role genových konfliktů ve speciaci není zatím úplně jasná, ale existující studie naznačují, že vnitrogenomové konflikty hrají důležitou roli při vzniku postzygotické reprodukční izolace a to zejména při vzniku hybridní sterility nebo neživotaschopnosti. 18
19 6 Použitá literatura Blackman, R. K., Koehler, M. M. D., Grimaila, R. and Gelbart, W. M Identification of a fully-functional hobo transposable element and its use for germ-line transformation of Drosophila. EMBO J. 8: Blumenstiel, J. P. and Hartl, D. L Evidence for maternally transmitted small interfering RNA in the repression of transposition in Drosophila virilis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102: Breeuwer, J. A. 1. and Werren, J. H Microoganisms associated with chromosome destruction and reproductive isolation between two insect species. Nature 346: Bordenstein, S. R. and Werren, J. H Effects of A a B Wolbachia and host genotype on interspecies cytoplasmic incompatibility in Nasonia. Genetics 148: Buckler, E. S. IV, Phelps-Durr, T. L., Buckler C. S. K., Dawe, R. K., Doebley, J. F. and Holtsford, T. P Meiotic drive of chromosomal knobs reshaped the maize genome. Genetics 153: Burt, A. and Trivers, R Genes in conflict: The biology of selfish genetic elements. Belknap Press of Harvard University Press Dewey, R. E., Timothy, D. H. and Levings, C. S. III A mitochondrial protein associated with cytoplasmic male sterility in the T cytoplasm of maize. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: Dawkins, R Sobecký gen. Mladá fronta Elliott, R. W., Miller, D. R., Pearsall, R. S., Hohman, C., Zhang, Y., Poslinski, D., Tabaczynski, D. A. and Chapman, V. M Genetic analysis of testis weight and fertility in an interspecies hybrid congenic strain for chromosome X. Mammalian Genome 12: Fishman, L. and Willis, J. H A cytonuclear incompatibility causes anther sterility in Mimulus hybrids. Evolution 60: Frank, S. A The evolutionary dynamics of cytoplasmic male sterility. Am. Nat. 133: Frank, S. A Divergence of meiotic drive-suppression systems as an explanation for sex-biased hybrid sterility and inviability. Evolution 45: Gauthier, E., Tatout, C. and Pinon, H Artificial and epigenetic regulation of the I factor, a nonviral retrotransposon of Drosophila melanogaster. Genetics 156:
20 Haldane, J. B. S Sex ratio and unisexual sterility in hybrid animals. J. Genet. 12: Hayes, F Transposon-based strategies for microbial functional genomics and proteomics. Annu. Rev. Genet. 37: 3-29 Hense, W., Baines, J. F. and Parsch, J X chromosome inactivation during Drosophila spermatogenesis. PloS Biol. 5: e273 Hurst, L. D. and Pomiankowski, A Causes of sex ratio bias may account for unisexual sterility in hybrids: A new explanation of Haldane s rule and related phenomena. Genetics 128: Hurst, L. D. and Randerson, J. P Parasitic sex puppeteers. Sci. Am. 286: Jaenike, J Sex chromosome meiotic drive. Annu. Rev. Ecol. Syst. 32: Jiggins, F. M., Hurst, G. D. D., Schulenburg J. H. G. V. D., Majerus, M. E. N Two male-killing Wolbachia strains coexist within a population of the butterfly Acraea encedon. Heredity 86: Jullien, P. E., Kinoshita, T., Ohad, N. and Berger, F Maintenance of DNA methylation during the Arabidopsis life cycle is essential for parental imprinting. Plant Cell 18: Jullien, P. E., Mosquna, A., Ingouff, M., Sakata, T., Ohad, N. and Berger, F Retinoblastoma and its binding partner MSI1 control imprinting in Arabidopsis. PloS Biol. 6: e194 Kelly, W. G., Schaner, C. E., Dernburg, A. F., Lee, M.-H., Kim, S. K., Villeneuve, A. M. and Reinke, V X-chromosome silencing in the germline of C. elegans. Development 129: Kidwell, M. G., Kidwell, J. F. and Sved, J. A Hybrid dysgenesis in Drosophila melanogaster: A syndrom of aberrant traits including mutation, sterility and male recombination. Genetics 86: Kidwell, M. G Evolution of hybrid dysgenesis determinants in Drosophila melanogaster. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: Kurz, H., Zechner, U., Orth, A. and Fundele R Lack of correlation between placenta and offspring size in mouse interspecific crosses. Anat. Embryol. 200: Labrador, M., Farré, M., Utzet, F. and Fontdevila, A Interspecific hybridization increases transposition rates of Osvaldo. Mol. Biol. Evol. 16:
21 Laver, H. K., Reynolds, S. J., Moneger, F. and Leaver, C. J Mitochondrial genome organization and expression associated with cytoplasmic male sterility in sunflower (Helianthus annuus). Plant J. 1: Lohe, A. R., Moriyama, E. N., Lidholm, D.-A. and Hartl, D. L Horizontal transmission, vertical inactivation, and stochastic loss of Mariner-like transposable elements. Mol. Biol. Evol. 12: Loschiavo, M., Nguyen, Q. K., Duselis, A. R. and Vrana, P. B Mapping and identification of candidate loci responsible for Peromyscus hybrid overgrowth. Mammalian genome 18: Lozovskaya, E. R., Scheinker, V. Sh. and Evgen ev, M. B A hybrid dysgenesis syndrome in Drosophila virilis. Genetics 126: Lyon, M. F The genetic basis of transmission-ratio distortion and male sterility due to the t complex. Am. Nat. 137: Macholán, M., Muclinger, P., Šugerková, M., Dufková, P., Bímová, B., Božíková, E., Zima, J. and Piálek, J Genetic analysis of autosomal and X-linked markers across a mouse hybrid zone. Evolution 61: Macholán, M., Baird, S. JE, Muclinger, P., Dufková, P., Bímová, B. and Piálek, J Genetic conflict outweighs heterogametic incompatibility in the mouse hybrid zone? BMC Evol. Biol. 8: 271 Makarevich, G., Leroy, O., Akinci, U., Schubert, D., Clarenz, O., Goodrich, J., Grossniklaus, U. and Köhler, C Different Polycomb group complexes regulate common target genes in Arabidopsis. EMBO J. 7: Meiklejohn, C. D. and Tao, Y Genetic conflict and sex chromosome evolution. Trends Ekol. Evol. 25: Michalak, P Epigenetic, transposon and small RNA determinants of hybrid dysfunctions. Heredity 102: Mochizuki, A., Takeda. Y. and Iwasa, Y The evolution of genomic imprinting. Genetics 144: Monéger, F., Smart, C. J. and Leaver, C. J Nuclear restoration of cytoplasmic male sterility in sunflower is associated with the tissue-specific regulation of a novel mitochondrial gene. EMBO J. 13: 8-17 Montchamp-Moreau, C. and Joly, D Abnormal spermiogenesis is associated with the X-linked sex-ratio trait in Drosophila simulans. Heredity 79:
22 Montchamp-Moreau, C., Ogereau, D., Chaminade, N., Colard, A. and Aulard S Organization of the sex-ratio meiotic drive region in Drosophila simulans. Genetics 174: Morison, I. M., Ramsay, J. P., Spencer, H. G A census of mammalian imprinting. Trends Genet. 21: Namekawa, S. H. and Lee, J. T XY and ZW: Is meiotic sex chromosome inactivation the rule in evolution? PloS Genet. 5: e Nivison, H. T. and Hanson, M. R Identification of a mitochondrial protein associated with cytoplasmic male sterility in Petunia. Plant Cell 1: Nivison, H. T., Sutton, C. A. Wilson, R. K. and Hanson, M. R Sequencing, processing, and localization of the petunia CMS-associated mitochondrial protein. Plant J. 5: Orr, H. A. and Irving, S Segregation distortion in hybrids between the Bogota and USA subspecies of Drosophila pseudoobscura. Genetics 169: Petrov, D. A., Schutzman, J. L., Hartl, D. L. and Lozovskaya, E. R Diverse transposable elements are mobilized in hybrid dysgenesis in Drosophila virilis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92: Phadnis, N. and Orr, H. A A single gene causes both male sterility and segregation distortion in Drosophila hybrids. Science 323: Presgraves, D. C Sex chromosomes and speciation in Drosophila. Trends Genet. 24: Price, T., Lewis, Z. and Wedell, N Sperm dumping as a defense against meiotic drive. J. Biol. 8: 6 Rao, R. U Endosymbiotic Wolbachia of parasitic filarial nematodes as drug targets. Indian J. Med. Res. 122: Reik, W. and Walter, J Genomic imprinting: Parental influence on the genome. Nat. Rev. Genet. 2: Ridley, M Červená královna, Sexualita a vývoj lidské přirozenosti. Mladá fronta Rigaud, T., Souty-Grosset, C., Raimond, R., Mocquard, J.-P. and Juchault P Feminizing endocytobiosis in the terrestrial crustacean Armadillidium vulgare Latr. (Isopoda): Recent acquisitions. Endocytobiosis & Cell Res. 7: Rogers, J. F. and Dawson, W. D Foetal and placental size in a Peromyscus species cross. J. Reprod. Fert. 21:
23 Rutkowska, J. and Badyaev, A. V Meiotic drive and sex determination: Molecular and cytological mechanisms of sex ratio adjustment in birds. Phil. Trans. R. Soc. B 363: Schoenmakers, S., Wassenaar, E., Hoogerbrugge, J. W., Laven, J. S. E., Grootegoed, J. A. and Baarends, W. M Female meiotic sex chromosome inactivation in chicken. PloS Genet. 5: e Shan, X., Liu, Z., Dong, Z., Wang, Y., Chen, Y., Lin, X., Long, L., Han, F., Dong, Y. and Liu, B Mobilization of the active MITE transposons mping and Pong in rice by introgression from wild rice (Zizania latifolia Griseb.). Mol. Biol. Evol. 22: Shi, W., Lefebvre, L., Yu, Y., Otto, S., Krella, A., Orth, A. and Fundele, R Loss-ofimprinting of Peg1 in mouse interspecies hybrids is correlated with altered growth. Genesis 39: Solter, D Differential imprinting and expression of maternal and paternal genomes. Annu. Rev. Genet. 22: Storchová, R., Gregorová, S., Buckiová, D., Kyselová, V., Divina, P. and Forejt, J Genetic analysis of X-linked hybrid sterility in the house mouse. Mammalian Genome 15: Stouthamer, R. and Werren, J. H Microbes associated with parthenogenesis in wasps of the genus Trichogramma. J. Invertebr. Pathol. 61: 6-9 Tao, Y., Hartl, D. L. and Laurie, C. C Sex-ratio segregation distortion associated with reproductive isolation in Drosophila. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98: Turner, J. M. A., Mahadevaiah, S. K., Elliott, D. J., Garchon, H.-J., Pehrson, J. R., Jeanisch, R. and Burgoyne, P. S Meiotic sex chromosome inactivation in male mice with targeted disruptions of Xist. J. Cell Sci. 115: Turner, J. M. A Meiotic sex chromosome inactivation. Development 134: Ungerer, M. C., Strakosh, S. C. and Zhen, Y Genome expansion in three hybrid sunflower species is associated with retrotransposon proliferation. Current Biology 16: R872-R873 Van der Gaag, M., Debets, A. J. M., Oosterhof, J., Slakhorst, M., Thijssen, J. A. G. M. and Hoekstra, R. F Spore-killing meiotic drive factors in a natural population of the fungus Podospora anserina. Genetics 156: Vrana, P. B., Guan, X.-J., Ingram, R. S. and Tilghman, S. M Genomic imprinting is disrupted in interspecific Peromyscus hybrids. Nat. Genet. 20:
24 Vrana, P. B., Fossella, J. A., Matteson, P., del Rio, T., O Neill, M. J. and Tilghman, S. M Genetic and epigenetic incompatibilities underlie hybrid dysgenesis in Peromyscus. Nat. Genet. 25: Wiley, C. D., Matundan, H. H., Duselis, A. R., Isaacs, A. T. and Vrana, P. B Patterns of hybrid loss of imprinting reveal tissue and cluster-specific regulation. PlosOne 3: e3572 Williamson, C. M., Blake, A., Thomas, S., Beechey, C. V., Hancock, J., Cattanach, B. M., and Peters, J. (2009), MRC Harwell, Oxfordshire. World Wide Web Site - Mouse Imprinting Data and References - Werren, J. H., Zhang, W. and Guo, L. R Evolution and phylogeny of Wolbachia: Reproductive parasites of arthropods. Proc. R. Soc. Lond. B 261: Zechner, U., Reule, M., Orth, A., Bonhomme, F., Strack, B., Guénet, J.-L., Hameister, H. and Fundele, R An X-chromosome linked locus contributes to abnormal placental development in mouse interspecific hybrids. Nat. Genet. 12: Zechner, U., Reule, M., Burgoyne, P. S., Schubert, A., Orth, A., Hameister, H. and Fundele, R Paternal transmission of X-linked placental dysplasia in mouse interspecific hybrids. Genetics 146: Zechner, U., Shi, W., Hemberger, M., Himmelbauer, H., Otto, S., Orth, A., Kalscheuer, V., Fischer, U., Elango, R., Reis, A., Vogel, W., Ropers, H., Rüschendorf, F. and Fundele, R Divergent genetic and epigenetic post-zygotic isolation mechanisms in Mus and Peromyscus. J. Evol. Biol. 17: Zeh, J. A. and Zeh, D. W The evolution of polyandry I: Intragenomic conflict and genetic incompatibility. Proc. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 263: Zeh, D. W. and Zeh, J. A Reproductive mode and speciation: The viviparity-driven conflict hypothesis. BioEssays 22: Zeh, J. A. and Zeh, D. W Viviparity-driven conflict: More to speciation than meets the fly. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1133:
Populační genetika III. Radka Reifová
Populační genetika III Radka Reifová Genealogie, speciace a fylogeneze Genové genealogie Rodokmeny jednotlivých kopií určitého genu v populaci. Popisují vztahy mezi kopiemi určitého genu v populaci napříč
Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno
GONOSOMY GONOSOMY CHROMOSOMY X, Y Obr. 1 (Nussbaum, 2004) autosomy v chromosomovém páru homologní po celé délce chromosomů crossingover MEIÓZA Obr. 2 (Nussbaum, 2004) GONOSOMY CHROMOSOMY X, Y ODLIŠNOSTI
Chromosomy a karyotyp člověka
Chromosomy a karyotyp člověka Chromosom - 1 a více - u eukaryotických buněk uložen v jádře karyotyp - soubor všech chromosomů v jádře jedné buňky - tvořen z vláknem chromatinem = DNA + histony - malé bazické
Deoxyribonukleová kyselina (DNA)
Genetika Dědičností rozumíme schopnost rodičů předávat své vlastnosti potomkům a zachovat tak rozličnost druhů v přírodě. Dědičností a proměnlivostí jedinců se zabývá vědní obor genetika. Základní jednotkou
"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy
"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy 1/75 Genetika = věda o dědičnosti Studuje biologickou informaci. Organizmy uchovávají,
Dědičnost mísením (Blending inheritance)
Dědičnost Dědičnost Dědičnost mísením (Blending inheritance) Mendelova teorie dědičnosti (1866) 1. Zákon o čistotě a segregaci vloh Vlohy pro jednotlivé znaky se vzájemně nemísí a v dalších generacích
Determinace pohlaví a evoluce pohlavních chromosomů
Determinace pohlaví a evoluce pohlavních chromosomů Radka Reifová Katedra zoologie Prezentaci naleznete na: http://web.natur.cuni.cz/~radkas/ v záložce Courses Jak vznikají dvě pohlaví Mechanismy determinace
Dědičnost a pohlaví. KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek
Dědičnost a pohlaví KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek Dědičnost pohlavně vázaná Gonozomy se v evoluci vytvořily z autozomů, proto obsahují nejen geny řídící vznik pohlavních rozdílů i další jiné geny. V těchto
Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze
Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze Studium biologie na PřF UK v Praze Bakalářské studijní programy / obory Biologie Biologie ( duhový bakalář ) Ekologická a evoluční biologie ( zelený
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Pohlavní typy Drosophila Protenor Člověk Lymantria/Abraxas (bekyně) Habrobracon/haplodiploidie
Směsná dědičnost (blending inheritance)
Dědičnost Dědičnost Směsná dědičnost (blending inheritance) Fleeming Jenkin kritizuje Darwinovu teorii evoluce. Mendelova teorie dědičnosti (1866) 1. Zákon o čistotě a segregaci vloh Vlohy pro jednotlivé
MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST
MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST Gen Část molekuly DNA nesoucí genetickou informaci pro syntézu specifického proteinu (strukturní gen) nebo pro syntézu RNA Různě dlouhá sekvence nukleotidů Jednotka funkce Genotyp
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Mendelovská genetika - Základy přenosové genetiky Základy genetiky Gregor (Johann)
P1 AA BB CC DD ee ff gg hh x P2 aa bb cc dd EE FF GG HH Aa Bb Cc Dd Ee Ff Gg Hh
Heteroze jev, kdy v F1 po křížení geneticky rozdílných genotypů lze pozorovat zvětšení a mohutnost orgánů, zvýšení výnosu, životnosti, ranosti, odolnosti ve srovnání s lepším rodičem = heterózní efekt
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
Speciace. Radka Reifová. Katedra zoologie
Speciace Radka Reifová Katedra zoologie Speciace Proces vzniku nových druhů Biologická diverzita je diskontinuální. Druhy objektivně existují. Jak je definovat? Nebudu zde ani probírat různé definice pojmu
EPIGENETIKA reverzibilních změn funkce genů, Epigenetické faktory ovlivňují fenotyp bez změny genotypu. Epigenetická
EPIGENETIKA Epigenetika se zabývá studiem reverzibilních změn funkce genů, aniž by při tom došlo ke změnám v sekvenci jaderné DNA. Epigenetické faktory ovlivňují fenotyp bez změny genotypu. Epigenetická
Základy genetiky 2a. Přípravný kurz Komb.forma studia oboru Všeobecná sestra
Základy genetiky 2a Přípravný kurz Komb.forma studia oboru Všeobecná sestra Základní genetické pojmy: GEN - úsek DNA molekuly, který svojí primární strukturou určuje primární strukturu jiné makromolekuly
Úloha pohlavních chromosomů ve speciaci
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA KATEDRA ZOOLOGIE BAKALÁŘSKÁ PRÁCE Úloha pohlavních chromosomů ve speciaci Jitka Fischerová školitel: RNDr. Radka Storchová, Ph.D. PRAHA 2009 Abstrakt Jakým
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/..00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG) Tento
Základní pravidla dědičnosti
Mendelova genetika v příkladech Základní pravidla dědičnosti Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/28.0018 Mendelovy zákony dědičnosti
RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA
RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA 1. Genotyp a jeho variabilita, mutace a rekombinace Specifická imunitní odpověď Prevence a časná diagnostika vrozených vad 2. Genotyp a prostředí Regulace buněčného
Genetika pohlaví genetická determinace pohlaví
Genetika pohlaví Genetická determinace pohlaví Způsoby rozmnožování U nižších organizmů může docházet i k ovlivnění pohlaví jedince podmínkami prostředí (např. teplotní závislost pohlavní determinace u
Od sekvencí k chromozómům: výzkum repetitivní DNA rostlin v Laboratoři molekulární cytogenetiky BC AVČR
ENBIK 2014 Od sekvencí k chromozómům: výzkum repetitivní DNA rostlin v Laboratoři molekulární cytogenetiky BC AVČR Jiří Macas Biologické centrum AVČR Ústav molekulární biologie rostlin České Budějovice
Glosář - Cestina. Odchylka počtu chromozomů v jádře buňky od normy. Např. 45 nebo 47 chromozomů místo obvyklých 46. Příkladem je trizomie 21
Glosář - Cestina alely aneuploidie asistovaná reprodukce autozomálně dominantní autozomálně recesivní BRCA chromozom chromozomová aberace cytogenetický laborant de novo Různé formy genu, které se nacházejí
44 somatických chromozomů pohlavní hormony (X,Y) 46 chromozomů
Buněčný cyklus MUDr.Kateřina Kapounková Inovace studijního oboru Regenerace a výţiva ve sportu (CZ.107/2.2.00/15.0209) 1 DNA,geny genom = soubor všech genů a všechna DNA buňky; kompletní genetický materiál
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny Teorie neutrální evoluce Konec 60. a začátek 70. let 20. stol. Ukazuje jak bude vypadat genetická variabilita v populaci a jaká bude rychlost evoluce v případě,
Rodičovské konflikty a speciace u myši domácí
Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Katedra zoologie Oddělení Genetika volně žijících živočichů Diplomová práce Rodičovské konflikty a speciace u myši domácí Bc. Lucie Kropáčková Školitel:
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Genetika populací Studium dědičnosti a proměnlivosti skupin jedinců (populací)
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny Teorie neutrální evoluce Konec 60. a začátek 70. let 20. stol. Ukazuje jak bude vypadat genetická variabilita v populaci a jaká bude rychlost divergence druhů
Cvičení č. 8. KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek
Cvičení č. 8 KBI/GENE Mgr. Zbyněk Houdek Genové interakce Vzájemný vztah mezi geny nebo formami existence genů alelami. Jeden znak je ovládán alelami působícími na více lokusech. Nebo je to uplatnění 2
Základní pravidla dědičnosti - Mendelovy a Morganovy zákony
Obecná genetika Základní pravidla dědičnosti - Mendelovy a Morganovy zákony Ing. Roman LONGAUER, CSc. Doc. RNDr. Ing. Eva PALÁTOVÁ, PhD. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je
Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám
http://vtm.zive.cz/aktuality/vzorek-dna-prozradi-priblizny-vek-pachatele Autorem materiálu a všech jeho částí, není-li uvedeno jinak, je Mgr. Eva Strnadová. Dostupné z Metodického portálu www.rvp.cz ;
Molekulární procesy po fertilizacinormální či abnormální po ART?
Molekulární procesy po fertilizacinormální či abnormální po ART? Aleš Hampl Již více jak MILION dětí bylo na světě počato pomocí ART ART jako zdroj zvýšeného rizika:? Kongenitální malformace (Ericson and
Typologická koncepce druhu
Speciace Co je to druh? Nebudu zde ani probírat různé definice pojmu druh. Žádná z nich až dosud neuspokojila všechny přírodovědce, ale každý přírodovědec zhruba ví, co míní tím, když mluví o druhu. (Charles
"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Molekulární základy genetiky
"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Molekulární základy genetiky 1/76 GENY Označení GEN se používá ve dvou základních významech: 1. Jako synonymum pro vlohu
Bakteriální transpozony
Bakteriální transpozony Transpozon = sekvence DNA schopná transpozice, tj. přemístění z jednoho místa v genomu do jiného místa Transpozice = proces přemístění transpozonu Transponáza (transpozáza) = enzym
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Investice do rozvoje vzdělávání Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Investice do rozvoje vzdělávání
GENETIKA 1. Úvod do světa dědičnosti. Historie
GENETIKA 1. Úvod do světa dědičnosti Historie Základní informace Genetika = věda zabývající se dědičností a proměnlivostí živých soustav sleduje variabilitu (=rozdílnost) a přenos druhových a dědičných
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
Degenerace genetického kódu
AJ: degeneracy x degeneration CJ: degenerace x degenerace Degenerace genetického kódu Genetický kód je degenerovaný, resp. redundantní, což znamená, že dva či více kodonů může kódovat jednu a tutéž aminokyselinu.
Vztah genotyp fenotyp
Evoluce fenotypu II Vztah genotyp fenotyp plán? počítačový program? knihovna? genotypová astrologie (Jablonka a Lamb) Modely RNA - různé vážení: A-U, G-C, G-U interakcí, penalizace za neodpovídající si
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 KBB/ZGEN Základy genetiky Dana Šafářová KBB/ZGEN Základy genetiky Rozsah: 2+1
Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování
Dědičnost pohlaví Vznik pohlaví (pohlavnost), tj. komplexu znaků, vlastností a funkcí, které vymezují exteriérové i funkční diference mezi příslušníky téhož druhu, je výsledkem velmi komplikované série
Transpozony - mobilní genetické elementy
Transpozony - mobilní genetické elementy Tvoří pravidelnou součást genomu prokaryot i eukaryot (až 50% genomu) Navozují mutace genů (inzerční inaktivace, polární mutace, změny exprese genů) Jsou zodpovědné
Speciace. Proces vzniku nových druhů
Speciace Speciace Proces vzniku nových druhů Biologická diverzita je diskontinuální. Druhy objektivně existují. Jak je definovat? Co je to druh? Biologická koncepce druhu (Ernst Mayr, 1942) Druh je skupina
Základní genetické pojmy
Základní genetické pojmy Genetika Věda o dědičnosti a proměnlivosti organismů Používá především pokusné metody (např. křížení). K vyhodnocování používá statistické metody. Variabilita v rámci druhu Francouzský
Mendelistická genetika
Mendelistická genetika Základní pracovní metodou je křížení křížení = vzájemné oplozování organizmů s různými genotypy Základní pojmy Gen úsek DNA se specifickou funkcí. Strukturní gen úsek DNA nesoucí
Projekt realizovaný na SPŠ Nové Město nad Metují
Projekt realizovaný na SPŠ Nové Město nad Metují s finanční podporou v Operačním programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost Královéhradeckého kraje Modul 02 Přírodovědné předměty Hana Gajdušková 1 Viry
Genetika zvířat - MENDELU
Genetika zvířat Gregor Mendel a jeho experimenty Gregor Johann Mendel (1822-1884) se narodil v Heinzendorfu, nynějších Hynčicích. Během období, v kterém Mendel vyvíjel svou teorii dědičnosti, byl knězem
lní Gonozomáln Chromozomové určení pohlaví autozomy x gonozomy gonozomů ení Mgr. Aleš RUDA XY: : pohlaví heterogametické
Gonozomáln lní dědičnost Mgr. Aleš RUDA Chromozomové určení pohlaví autozomy gonozomy člověk má 22 párůp autozomů a 1 pár p gonozomů označen ení pohlavních chromozomů: : X a Y. jsou možné celkem 3 kombinace:
Epigenetické regulace. (Viz také speciální přednáška P. Svobody - Epigenetika)
Epigenetické regulace (Viz také speciální přednáška P. Svobody - Epigenetika) Epigenetická dědičnost Epigenetická regulace genové exprese Definice: Heritabilní změna genové exprese beze změn DNA sekvence.
GENETIKA. Dědičnost a pohlaví
GENETIKA Dědičnost a pohlaví Chromozómové určení pohlaví Dvoudomé rostliny a gonochoristé (živočichové odděleného pohlaví) mají pohlaví určeno dědičně chromozómovou výbavou jedince = dvojicí pohlavních
Evoluce pohlaví a determinace pohlaví. Marie Ošlejšková
Evoluce pohlaví a determinace pohlaví Marie Ošlejšková Rozmnožování organismů evolučně původnější nepohlavní pohlavní evolučně odvozenější typické pro organismy na nižším stupni fylogenetického vývoje
Struktura a organizace genomů
CG020 Genomika Přednáška 8 Struktura a organizace genomů Markéta Pernisová Funkční genomika a proteomika rostlin, Mendelovo centrum genomiky a proteomiky rostlin, Středoevropský technologický institut
Cvičeníč. 10 Dědičnost a pohlaví. Mgr. Zbyněk Houdek
Cvičeníč. 10 Dědičnost a pohlaví Mgr. Zbyněk Houdek Dědičnost a pohlaví Gonozomy se v evoluci vytvořily z autozomů, proto obsahují nejen geny řídící vznik pohlavních rozdílů, ale i další geny. V těchto
Typologická koncepce druhu
Speciace Co je to druh? Nebudu zde ani probírat různé definice pojmu druh. Žádná z nich až dosud neuspokojila všechny přírodovědce, ale každý přírodovědec zhruba ví, co míní tím, když mluví o druhu. (Charles
Působení genů. Gen. Znak
Genové interakce Působení genů Gen Znak Dědičnost Potomek získává predispozice k vlastnostem z rodičovské buňky nebo organismu. Vlastnosti přenášené do další generace nemusí být zcela totožné s vlastnostmi
7. Regulace genové exprese, diferenciace buněk a epigenetika
7. Regulace genové exprese, diferenciace buněk a epigenetika Aby mohl mnohobuněčný organismus efektivně fungovat, je třeba, aby se jednotlivé buňky specializovaly na určité funkce. Nový jedinec přitom
Crossing-over. Synaptonemální komplex. Crossing-over a výměna genetického materiálu. Párování homologních chromosomů
Vazba genů Crossing-over V průběhu profáze I meiózy Princip rekombinace genetického materiálu mezi maternálním a paternálním chromosomem Synaptonemální komplex Zlomy a nová spojení chromatinových řetězců
Biologie - Oktáva, 4. ročník (humanitní větev)
- Oktáva, 4. ročník (humanitní větev) Biologie Výchovné a vzdělávací strategie Kompetence k řešení problémů Kompetence komunikativní Kompetence sociální a personální Kompetence občanská Kompetence k podnikavosti
Populační genetika II
Populační genetika II 4. Mechanismy měnící frekvence alel v populaci Genetický draft (genetické svezení se) Genetický draft = zvýšení frekvence alely díky genetické vazbě s výhodnou mutací. Selekční vymetení
MOBILNÍ GENETICKÉ ELEMENTY. Lekce 13 kurzu GENETIKA Doc. RNDr. Jindřich Bříza, CSc.
MOBILNÍ GENETICKÉ ELEMENTY Lekce 13 kurzu GENETIKA Doc. RNDr. Jindřich Bříza, CSc. Demerec (1937) popsal nestabilní mutace u D. melanogaster B. McClintocková (1902-1992, Nobelova cena 1983) ukázala ve
GENETIKA Monogenní dědičnost (Mendelovská) Polygenní dědičnost Multifaktoriální dědičnost
GENETIKA vědecké studium dědičnosti a jejich variant studium kontinuity života ve vztahu ke konečné délce života individuálních organismů Monogenní dědičnost (Mendelovská) Polygenní dědičnost Multifaktoriální
REPRODUKCE A ONTOGENEZE Od spermie s vajíčkem až po zralého jedince. Co bylo dřív? Slepice nebo vejce?
REPRODUKCE A ONTOGENEZE Od spermie s vajíčkem až po zralého jedince Co bylo dřív? Slepice nebo vejce? Rozmnožování Rozmnožování (reprodukce) může být nepohlavní (vegetativní, asexuální) pohlavní (sexuální;
1. Téma : Genetika shrnutí Název DUMu : VY_32_INOVACE_29_SPSOA_BIO_1_CHAM 2. Vypracovala : Hana Chamulová 3. Vytvořeno v projektu EU peníze středním
1. Téma : Genetika shrnutí Název DUMu : VY_32_INOVACE_29_SPSOA_BIO_1_CHAM 2. Vypracovala : Hana Chamulová 3. Vytvořeno v projektu EU peníze středním školám Genetika - shrnutí TL2 1. Doplň: heterozygot,
Genetika speciace
Genetika speciace Příroda je diskontinuitní Jedince většinou zařadíme do druhů Biological nature is discontinuous Species exist How do we define them? Why do they exist? Biologické pojetí druhu Druh
Souhrnný test - genetika
Souhrnný test - genetika 1. Molekuly DNA a RNA se shodují v tom, že a) jsou nositelé genetické informace, b) jsou tvořeny dvěma polynukleotidovými řetězci,, c) jsou tvořeny řetězci vzájemně spojených nukleotidů,
Sylabus témat ke zkoušce z lékařské biologie a genetiky. Struktura, reprodukce a rekombinace virů (DNA viry, RNA viry), význam v medicíně
Sylabus témat ke zkoušce z lékařské biologie a genetiky Buněčná podstata reprodukce a dědičnosti Struktura a funkce prokaryot Struktura, reprodukce a rekombinace virů (DNA viry, RNA viry), význam v medicíně
Genotypy absolutní frekvence relativní frekvence
Genetika populací vychází z: Genetická data populace mohou být vyjádřena jako rekvence (četnosti) alel a genotypů. Každý gen má nejméně dvě alely (diploidní organizmy). Součet všech rekvencí alel v populaci
Počet chromosomů v buňkách. Genom
Počet chromosomů v buňkách V každé buňce těla je stejný počet chromosomů. Výjimkou jsou buňky pohlavní, v nich je počet chromosomů poloviční. Spojením pohlavních buněk vzniká zárodečná buňka s celistvým
Struktura a analýza rostlinných genomů Jan Šafář
Struktura a analýza rostlinných genomů Jan Šafář Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum Proč rostliny? Proč genom? Norman E. Borlaug Zelená
Semenné sady systém reprodukce a efektivita
Genetika a šlechtění lesních dřevin Semenné sady systém reprodukce a efektivita Doc. Ing. RNDr. Eva Palátová, PhD. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován Evropským
DUM č. 3 v sadě. 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika
projekt GML Brno Docens DUM č. 3 v sadě 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika Autor: Martin Krejčí Datum: 02.06.2014 Ročník: 6AF, 6BF Anotace DUMu: chromatin - stavba, organizace a struktura
Nondisjunkce v II. meiotickém dělení zygota
2. semestr, 1. výukový týden OPAKOVÁNÍ str. 1 OPAKOVÁNÍ VYBRANÉ PŘÍKLADY letního semestru: 1. u Downova a Klinefelterova syndromu, 2. Hodnocení karyotypu s aberací, 3. Mono- a dihybridismus, 4. Vazba genů
Epigenetická paměť v ekologii a evoluci rostlin. Vítek Latzel
Epigenetická paměť v ekologii a evoluci rostlin Vítek Latzel Epigenetika Věda zabývající se změnami v expresi genů. Lidské tělo jedna DNA, ale buňky velmi rozdílné Jaterní buňky Kožní buňky Nervové buňky
Vliv věku rodičů při početí na zdraví dítěte
Vliv věku rodičů při početí na zdraví dítěte Antonín Šípek Jr 1,2, Vladimír Gregor 2,3, Antonín Šípek 2,3,4 1) Ústav biologie a lékařské genetiky 1. LF UK a VFN, Praha 2) Oddělení lékařské genetiky, Thomayerova
Nauka o dědičnosti a proměnlivosti
Nauka o dědičnosti a proměnlivosti Genetika Dědičnost na úrovni nukleových kyselin molekulární buněk organismů populací Předávání vloh z buňky na buňku Předávání vlastností mezi jednotlivci Dědičnost znaků
DĚDIČNOST MÍSENÍM (BLENDING INHERITANCE)
Dědičnost DĚDIČNOST MÍSENÍM (BLENDING INHERITANCE) Pokud by dědičnost fungovala takto, tak by se všechny příznivé vlastnosti v každé následující generaci ředily, dokud by nevymizely. Darwinova evoluční
GENETICKÁ INFORMACE - U buněčných organismů je genetická informace uložena na CHROMOZOMECH v buněčném jádře - Chromozom je tvořen stočeným vláknem chr
GENETIKA VĚDA, KTERÁ SE ZABÝVÁ PROJEVY DĚDIČNOSTI A PROMĚNLIVOSTI Klíčové pojmy: CHROMOZOM, ALELA, GEN, MITÓZA, MEIÓZA, GENOTYP, FENOTYP, ÚPLNÁ DOMINANCE, NEÚPLNÁ DOMINANCE, KODOMINANCE, HETEROZYGOT, HOMOZYGOT
Pohlavní rozmnožování. Gametogeneze u rostlin a živočichů.
"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Pohlavní rozmnožování Gametogeneze u rostlin a živočichů. 2/65 Pohlavní rozmnožování obecně zajišťuje variabilitu druhu
Biologie - Oktáva, 4. ročník (přírodovědná větev)
- Oktáva, 4. ročník (přírodovědná větev) Biologie Výchovné a vzdělávací strategie Kompetence k řešení problémů Kompetence komunikativní Kompetence sociální a personální Kompetence občanská Kompetence k
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
Populační genetika II. Radka Reifová
Populační genetika II Radka Reifová Literatura An Introduction to Population Genetics. Rasmus Nielsen and Montgomery Slatkin. 2013. (v knihovně) Elements of Evolutionary Genetics (2010) Brian Charlesworth
VY_32_INOVACE_11.18 1/6 3.2.11.18 Genetika Genetika
1/6 3.2.11.18 Cíl chápat pojmy dědičnost, proměnlivost, gen, DNA, dominantní, recesivní, aleoly - vnímat význam vědního oboru - odvodit jeho využití, ale i zneužití Tajemství genů - dědičnost schopnost
A. chromozómy jsou rozděleny na 2 chromatidy spojené jen v místě centromery. B. vlákna dělícího vřeténka jsou připojena k chromozómům
Karlova univerzita, Lékařská fakulta Hradec Králové Obor: všeobecné lékařství - test z biologie Vyberte tu z nabídnutých odpovědí (1-5), která je nejúplnější. Otázka Odpověď 1. Mezi organely membránového
Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 10. Další metody
Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin 10. Další metody Další molekulární markery trflp ISSRs (retro)transpozony kombinace a modifikace různých metod real-time PCR trflp
Buněčné dělení ŘÍZENÍ BUNĚČNÉHO CYKLU
BUNĚČNÝ CYKLUS Buněčné dělení Cykliny a na cyklinech závislé proteinkinázy (Cyclin- Dependent Protein Kinases; Cdk-proteinkinázy) - proteiny, které jsou součástí řídícího systému buněčného cyklu 8 cyklinů
Typy nukleových kyselin. deoxyribonukleová (DNA); ribonukleová (RNA).
Typy nukleových kyselin Existují dva typy nukleových kyselin (NA, z anglických slov nucleic acid): deoxyribonukleová (DNA); ribonukleová (RNA). DNA je lokalizována v buněčném jádře, RNA v cytoplasmě a
Základní pojmy obecné genetiky, kvalitativní a kvantitativní znaky, vztahy mezi geny
Obecná genetika Základní pojmy obecné genetiky, kvalitativní a kvantitativní znaky, vztahy mezi geny Doc. RNDr. Ing. Eva PALÁTOVÁ, PhD. Ing. Roman LONGAUER, CSc. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Základy genetiky - Alelové a Genové interakce (Spolu)Působení genů Fenotypový
8 cyklinů (A, B, C, D, E, F, G a H) - v jednotlivých fázích buněčného cyklu jsou přítomny určité typy cyklinů
Buněč ěčné dělení BUNĚČ ĚČNÝ CYKLUS ŘÍZENÍ BUNĚČ ĚČNÉHO CYKLU cykliny a na cyklinech závislé proteinkinázy (Cyclin-Dependent Protein Kinases; Cdk-proteinkinázy) - proteiny, které jsou součástí řídícího
O původu života na Zemi Václav Pačes
O původu života na Zemi Václav Pačes Ústav molekulární genetiky Akademie věd ČR centrální dogma replikace transkripce DNA RNA protein reverzní transkripce translace informace funkce Exon 1 Intron (413
Buněčný cyklus. Replikace DNA a dělení buňky
Buněčný cyklus Replikace DNA a dělení buňky 2 Regulace buněčného dělení buněčný cyklus: buněčné dělení buněčný růst kontrola kvality potomstva (dceřinných buněk) bránípřenosu nekompletně zreplikovaných
6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?
6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života? Pamatujete na to, co se objevilo v pracích Charlese Darwina a Alfreda Wallace ohledně vývoje druhů? Aby mohl mechanismus přírodního