obsah Úvodní slovo vedoucího lékaře... 5 IV. Preimplantační diagnostika (PGD)... 8 V. Postnatální laboratorní diagnostika I. Úvod...

Transkript

1 2012 VÝROČNÍ ZPRÁVA

2

3 obsah Úvodní slovo vedoucího lékaře... 5 I. Úvod... 6 II. Výsledky prenatální diagnostiky... 6 III. Výsledky centra asistované reprodukce... 7 IV. Preimplantační diagnostika (PGD)... 8 V. Postnatální laboratorní diagnostika VI. Kontrola kvality VII. Personální obsazení GENNET... 13

4

5 ÚVODNÍ SLOVO VEDOUCÍHO LÉKAŘE Vážení pacienti, kolegové a spolupracovníci, dostává se Vám do rukou výroční zpráva společnosti GENNET, ve které si Vás dovolujeme seznámit s výsledky za rok Tento rok pro nás hlavně znamenal expanzi do zahraničí a zavedení nové unikátní technologie, která změní prenatální diagnostiku neinvazivní prenatální diagnostiky trizomií (NIFTY). Vytvořili jsme asociaci s největší genomickou společností na světě BGI a společně s Asociací center lékařské genetiky ČR jsme představili projekt PRENASCAN ( který zavádí do klinické praxe v České a Slovenské republice neinvazivní prenatální test trizomie chromozomů č. 21 Downova syndromu, č. 18 Edwardsova syndromua č. 13 Patauova syndromu. V Londýně jsme otevřeli Centrum asistované reprodukce a fetální medicíny na adrese 16 St John Street, London, EC1M 4NT. Centrum nese název CITY FERTILITY a je první z našich zahraničních poboček. Zavedli jsme preimplantační screening aneuploidií novou metodou Array CGH, což nám umožní kontrolu počtu všech chromozomů v embryonálních buňkách s cílem zvýšit úspěšnost léčby neplodnosti u indikovaných párů. Naším cílem je poskytovat pacientům tu nejkvalitnější péči, a proto jsme opět kladli nejvyšší důraz na kvalitu a po splnění podmínek kontrolního auditu jsou nyní naše IVF a genetické laboratoře akreditovány dle normy ČSN EN ISO 15189:2007, a to až do května roku Stali jsme se partnerem MOVEMBERu, akce zaměřené na mužské zdraví, a zařadili jsme se tak mezi propagátory sloganu změňme tvář mužského zdraví. Náš tým také posílili další zkušení kolegové, a proto věříme, že i rok 2013 bude stejně úspěšný. Děkujeme za Vaši důvěru. MUDr. David Stejskal vedoucí lékař Výroční zpráva 2012 stránka 5

6 I. Úvod Na klinikách v Praze a Liberci poskytujeme našim pacientům komplexní péči v oblasti lékařské genetiky, fetální medicíny a asistované reprodukce. V roce 2012 jsme vyšetřili pacientů a rodin. II. Výsledky prenatální diagnostiky Celkové výsledky prenatální diagnostiky Bylo zjištěno celkem 260 prenatálních vrozených vad: 132 nálezů chromozomálních vrozených vad (109 závažných) 158 morfologických vad (39 chromozomální aberací) 141 těhotných požádalo o přerušení těhotenství Výsledky screeningu vrozených vad v I. a II. trimestru. Celkem bylo hodnoceno prenatálních screeningových testů ve screeningových centrech Praha a Liberec. Bylo hodnoceno: kombinovaných testů v I. trimestru (průměrný věk testovaných osob 33 let; 3,7 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/100 a vyšším) integrovaných testů v I. a II. trimestru (průměrný věk testovaných 31 let; 1,7 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/150 a vyšším) triple testů ve II. trimestru (průměrný věk testovaných 31 let; 4,4 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/250 a vyšším) Ultrazvukem bylo primárně zjištěno nebo následně potvrzeno 158 vrozených vad plodu. Celkem bylo provedeno: ultrazvukových vyšetření v I. trimestru ultrazvukových vyšetření ve II. a III. trimestru Invazivní výkony Bylo vyšetřeno: 194 odběrů choria CVS s 62 (32 %) nálezy chromozomálních vad amniocentéz AMC s 59 (3 %) nálezy chromozomálních vad. U všech vyšetření choriových klků a 81 % vyšetření plodových vod byla provedena rychlá diagnostika nejčastějších chromozomálních vad technikou QF-PCR. Prenatální vyšetření technikou SNP microarray bylo provedeno u 140 plodů. U 29 (20,7 %) byl zjištěn nález. Chromozomální VVV Downův syndrom (trizomie 21) 48 Edwardův syndrom (trizomie 18) 10 Patauův syndrom (trizomie 13) 13 Turnerův syndrom (X0) 11 Aneuploidie pohlavních chromozomů 13 Triploidie 2 Strukturální aberace 12 Všechny závažné aberace 109 Morfologické VVV (mnohočetné vvv uváděny opakovaně) Defekty neurální trubice (rozštěpy páteře) 8 Vady CNS 18 Orofaciální vady (rozštěpy rtu) 22 Srdeční vady 58 Vady hrudníku a nitrohrudních orgánů 4 Vady trávicího ústrojí 1 Vady močopohlavního ústrojí 31 Vady končetin 26 Vyšetření produktů koncepce (spontánní potraty v I. trimestru) Molekulárně genetickými technikami bylo vyšetřeno celkem 161 produktů koncepce na nejčastěji se vyskytující aneuploidie (chromozomů č. 2, 7, 13, 14, 15, 16, 18, 21, 22, X, Y), triploidie a uniparentální diploidie (kompletní mola) a trombofilní mutace (FVL Leidenská). U 19 % produktů koncepce byla zjištěna chromozomální etiologie. Neinvazivní prenatální testy (NIPT) V projektu PRENASCAN bylo dosud vyšetřeno více než 300 těhotných. Byly diagnostikovány a přímým vyšetření plodu potvrzeny tři trizomie (2x trizomie č. 21 a jednou trizomie č. 13.) Výroční zpráva 2012 stránka 6

7 III. Výsledky centra asistované reprodukce V roce 2012 se úspěšnost metod, které pacientům nabízíme, pohybovala na vysoké úrovni. Snažíme se o individuální péči, při níž má každý pacient svého lékaře, který provádí všechny výkony. Dosahujeme tak dalšího zlepšování výsledků. Také jsme začali nabízet onkologicky nemocným ženám a dívkám možnosti zachování fertility i po léčbě. Chemoterapie a radioterapie přestavuje potenciální hrozbu pro reprodukční schopnosti žen. Moderní techniky asistované reprodukce (ART) nabízejí více možností, jak uchovat fertilitu u žen po onkologické léčbě (zamražení embryí, zamražení oocytů nebo ovariální tkáně). Všechny tyto metody již úspěšně používáme. Pro zlepšení výsledků provádíme také narušení sliznice děložní pod optickou kontrolou při zavedení hysteroskopu. Jedná se o jednoduchý ambulantní zákrok trvající pár minut, který lze provést i bez celkové anestezie, pokud je to pro pacientku výhodnější. Dle současných poznatků, ověřených několika studiemi, může narušení endometria u vybraných pacientek zvýšit receptivitu endometria, respektive zlepšit jeho implantační schopnost. IVF/ICSI OPU ET Těhotenství Těhotenství na ET v% Úspěšnost dle věkových skupin: 35 < 46 % % > % % 33 % 37 % 44 % 43 % 40 % 46 % IVF/ICSI KET ET Těhotenství Těhotenství na ET v% % 26 % 22 % 36 % 33 % 39 % 39 % KET ET Těhotenství ED ET Těhotenství Těhotenství na ET v% % 54 % 53 % 61 % 69 % ED ET Těhotenství ET Těhotenství Výroční zpráva 2012 stránka 7

8 IV. Preimplantační diagnostika (PGD) PGD provádíme v našem centru úspěšně již několik let. Naše akreditované laboratoře pracují i pro ostatní IVF centra v Čechách i v zahraničí. V současnosti jsou dostupné tyto metody: PGS screening aneuploidií metodou FISH, v případech indikovaných genetikem vyšetření pohlaví PGS screening aneuploidií metodou Array CGH PGD metodou FISH u nosičů translokace PGD metodou PCR u monogenních chorob Zavedli jsme do praxe novou metodu PGS Array CGH pro vyšetření 24 chromozomů. Pro optimální výsledek doporučujeme metodu tzv. PGD dislokace, kdy k transferu dochází v následujícím cyklu po vitrifikaci embryí a jejich vyšetření. Dislokace má kromě výrazného ekonomického efektu tyto výhody: 1. Koncentrace pouze na stimulaci a OPU a následně na transfer 2. Relativní indikace ICSI 3. Naturální selekce embryí do 5. dne 4. Nižší pravděpodobnost poškození embryí biopsií trofoektodemu 5. Více materiálu pro PGD a více času k uzavření diagnózy 6. Pravděpodobně lepší kvalita potomstva ve srovnání s fresh transfery Druhá naturální selekce při rozmrazování embryí Lepší příprava endometria a lepší placentace PGD metodou PCR byla v roce 2012 provedena v 69 cyklech, celkem bylo provedeno již 243 cyklů. Pro vyšetření monogenních chorob používáme nepřímou metodu užívající výsledky haplotypové rodinné analýzy. Tuto metodu lze použít prakticky u všech monogenních chorob. Rok PGD monogenních onemocnění Dokončené přípravy (nové geny) Výsledky Počet cyklů (SC) 225 Embryotransfer (ET) 161 Klinické těhotenství (CP) 77 CP/ET 40 % Provedené cykly Celkem PGD metodou FISH byla v roce 2012 provedena v 57 cyklech. Metodou FISH provádíme převážně vyšetření dědičných chromozomálních translokací. Výsledky PGD/PGS metodou FISH GENNET CHA X-váz PGS Celk. Páry Započatý cyklus (SC) Biopsie embrya Embryotransfer (ET) Klinické těhotenství (CP) CP/ET 34 % 42 % 36 % 37 % PGD metodou Array CGH byla provedena doposud v 16 cyklech s těmito výsledky: Počet cyklů 16 Bioptovaná embrya 46 Úspěšná amplifikace DNA 46 Úspěšná PGD array (44z 46) % Norma (14 ze 44) % Počet pacientek s doporučeným KET % Výroční zpráva 2012 stránka 8

9 Seznam monogenních chorob připravených pro preimplantační diagnostiku NÁZEV ONEMOCNĚNÍ ZKRATKA TYP DĚDIČNOSTI GEN CHROMOZOM NÁZEV ONEMOCNĚNÍ ZKRATKA TYP DĚDIČNOSTI GEN CHROMOZOM Charcot-Marie-Tooth typu 1A CMT 1A AD PMP22 17p12 Cystická fibróza CF AR CFTR 7q31.2 Marfanův syndrom MS AD FBN1 15q21.1 Huntingtonova chorea HCH AD IT15 4p16.3 RhD aloimunizace RhD AD RHD 1p36.11 Myotonická dystrofie typu 1 MD1 AD DMPK 19q13.32 Syndrom fragilního X FRAXA XD FMR1 Xq27.3 X-vázaná těžká kombinovaná imunodeficience SCID XR IL2RG Xq13.1 Hemofilie A XR Factor VIII Xq28 Polycystické ledviny autozomálně recesivní forma AR dědičná hluchota Hereditární sensorická neuropatie 1 ARPKD AR PKHD1 6p12.2 AR GJB2 (Connexin26) 13q12.11 HSN1 AD SPTLC1 9q22.31 Morbus Crouzon AD FGFR2 10q26.13 BRCA1 BRCA1 AD BRCA1 17q21.31 Duchennova svalová dystrofie DMD XR dystrofin Xp21.1 Neurofibromatóza 1 NF1 AD NF1 17q11.2 Spinální muskulární atrofie SMA AR SMN1 5q Currarino syndrom CS AD HLXB9 7q36.3 Treacher Collins syndrom TCS AD TCOF1 5q33.1 EPP AD FECH 18q21.3 IPEX syndrom IPEX XR FOXP3 Xp11.23 Propionová acidémie PA AR PCCB 3q21-3q22.3 Alagillův syndrom AS AD JAG-1 20p12 Epidermolysis bullosa EB AD keratin 14 (KRT14) 17q21.2 Lynchův syndrom HNPCC AD MLH1 3p22.2 Erytropoetická protoporfýrie Pelizaeus-Merzbacher syndrom Charcot-Marie-Tooth gonozomálně dominantní typ Leidenská mutace, faktor V PMD XR PLP1 Xq22.2 CMTX1 XD GJB1,Cx32 Xq13.1 FV AR Factor V 1q24.2 Fábryho choroba FD XD GLA Xq22.1 Polycystické ledviny autozomálně dominantní forma ADPKD AD PKD1 16p13.3 Hemofilie B XR Factor IX Xq27.1 Junkční epidermolysis bullosa JEB AR LAMB3 1q32.2 BRCA2 BRCA2 AD BRCA2 13q13.1 Porucha mitochondriální beta-oxidace MK, deficit LCHAD LCHAD AR HADHA 2p23.3 Alportův syndom AS XR COL4A5 Xq22.3 Deficit adenylosukcinátlyáz Von Hippel-Lindaův syndrom Deficit adenosindeaminázy Mukopolysacharidóza I AR ADSL 22q13.1-q13.2 VHL AD VHL 3p25-p26 AR ADA 20q13.12 MPS1 AR IDUA 4p16.3 Incontinentia pigmenti IP XD NEMO Xq28 MYH9 related disorders (e.g. Epstain syndrome) Facioscapulohumerální muskulární dystrofie Smith-Lemli-Opitz syndrom Kongenitální adrenální hyperplazie Mukopolysacharidóza III, typ A (Sanfilipův syndrom) Deficit alfa1-antitrypsinu Mnohočetná endokrinní neoplázie 2A Zadní polymorfní dystrofie rohovky Waardenburgův syndrom AD MYH9 22q12.3 FSHD AD FRG1 4q35 SLOS AR DHCR7 11q13.4 CAH AR CYP21 6p2.1-3 MPS3 AR SGSH 17q25.3 A1AT AR SERPINA1 14q32.1 MEN2A AD RET 10q11.2 PCCD1 AD celý lokus 20p11.2 WS AD PAX3 2q35-2q37 Ichthyosis vulgaris IV AD FLG1 1q21.3 Hypofosfatázie AR ALPL 1p36.12 Okulocerebrorenální syndrom (Loweho syndrom) OCRL XR OCRL Xq Lynchův syndrom AD MSH2 2p21 OTC deficit (porucha ornitintranskarbamylázy) OTC XR Delece OTC (okolních genů RPGR+T- SPAN7) Xp21.1-Xp11.4 Fenylketonurie PKU AR PAH 12q23.2 Hypertrofická myopatie HKMP AD MYH7 14q12 Tuberkulózní skleróza TSC1 AD TSC1 9q34.13 Výroční zpráva 2012 stránka 9

10 V. Postnatální laboratorní diagnostika Cytogenetická laboratoř provedla postnatálních vyšetření. U 2,7 % případů byl nález patologický. Metody molekulární cytogenetiky (FISH) byly použity u 183 případů. Metodou SNP microarray bylo vyšetřeno 513 případů. U 11,9 % případů byl nález pozitivní. Molekulárně genetická laboratoř vyšetřila postnatálně celkem vzorků. Seznam provedených vyšetření: vyšetření trombofilních mutací vyšetření mutací CFTR genu 145 vyšetření delecí dlouhého raménka chr. Y 692 vyšetření polymorfismu N680S pro FSHr 67 vyšetření expanze v genu pro FRAXA 32 vyšetření delecí genu SMN1 92 vyšetření genů BRCA1, BRCA2 12 vyšetření nejčastějších mutací HFE genu 43 vyšetření genů SPG3,SPG4,SPG vyšetření genu COX26 3 vyšetření genu SOD1 3 vyšetření genu MARVELD2 1 vyšetření genu NBS1 6 vyšetření mutace CMS_1267del G 5 vyšetření mikrosatelitové nestability - MSI VI. Kontrola kvality Naším cílem je, aby výsledek každé léčby byl úspěšný. K dosažení tohoto cíle je nutné, abychom pacientům poskytovali kvalitní a odbornou péči, což potvrzujeme každý rok při absolvování auditu certifikace systému řízení jakosti podle normy ČSN EN ISO 9001:2009, zároveň jsme také držiteli akreditace ČSN EN ISO 15189:2007 pro naši zdravotnickou laboratoř č Výroční zpráva 2012 stránka 10

11 Každoročně se cytogenetická a molekulárně genetická laboratoř účastní mezilaboratorních kontrol kvality, a to na republikové i mezinárodní úrovni. CEQA (Cytogenetic European Quality Assessment): v tomto hodnocení dosáhla cytogenetická laboratoř plného počtu bodů. Mezilaboratorní externí kontrola kvality: stanovení vrozených genetických trombofilních markerů Československá společnosti pro forenzní genetiku: Mezilaboratorní porovnávání forenzně genetických zkoušek 2012 Výroční zpráva 2012 stránka 11

12 UK Neqas for molecular genetics: Preimplantation Genetic Diagnosis Molecular Genetics External Quality Assurance Pilot Schemes External Quality Assessment Scheme: Haemochromatosis (whole blood) Splněním podmínek a kritérií potřebných pro získání certifikátů kontroly kvality a akreditace jsme potvrdili svou odbornost, objektivitu a nezávislost nezbytnou pro vykonávání naší práce. Výroční zpráva 2012 stránka 12

13 VII. Personální obsazení GENNET Vedoucí lékař prim. MUDr. David Stejskal Vedoucí lékař oddělení fetální medicíny prim. MUDr. Dagmar Smetanová, CSc. Vedoucí IVF programu a GENNET Scientific Board prim. MUDr. Milada Brandejská PRAHA LETNÁ Lékařská genetika prim. MUDr. Eva Hlavová MUDr. Michaela Hejtmánková MUDr. Věra Krutílková MUDr. Dagmar Rašková MUDr. David Stejskal Fetální medicína prim. MUDr. Dagmar Smetanová, CSc. MUDr. Eduard Kulovaný, CSc. MUDr. Martin Hynek MUDr. Sabina Březinová MUDr. Dita Kilijánová MUDr. Martin Doležal Centrum asistované reprodukce prim. MUDr. Milada Brandejská MUDr. Alena Langerová MUDr. Lenka Vykysalá MUDr. Radka Jarošová MUDr. Simona Bukvová Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Ing. Josef Míka, Csc. Laboratoř molekulárně genetická vedoucí laboratoře RNDr. Martina Putzová, Ph.D. Laboratoř cytogenetická vedoucí laboratoře RNDr. Jiří Horáček Fetální kardiologie (privátní) Doc. MUDr. Jan Marek, Ph.D. MUDr. Viktor Tomek Dětská kardiologie MUDr. Jiří Gilík Neurologie (privátní) MUDr. Jana Zárubová Andrologie MUDr. Viktor Vik Vrchní sestra Ivana Hrodějová PRAHA ARCHA Centrum asistované reprodukce MUDr. Milan Daněk MUDr. Michaela Bartošová MUDr. Tereza Kosová MUDr. Miroslav Landfeld MUDr. Jiří Vokroj Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Ing. Vlastimil Weber Lékařská genetika Doc. MUDr. Alice Baxová, CSc. Urologie a andrologie MUDr. Viktor Vik Gynekologie Doc. MUDr. Jozef Záhumenský, PhD. Vrchní sestra Blanka Koutková Výroční zpráva 2012 stránka 13

14 LIBEREC Lékařská genetika prim. MUDr. David Stejskal MUDr. Gabriela Křečková Fetální medicína MUDr. Vendula Johannová MUDr. Jaroslav Soukeník Centrum asistované reprodukce prim. MUDr. Ivo Petr MUDr. Veronika Mokrá Laboratoř IVF prim. MUDr. Ivo Petr Laboratoř cytogenetická vedoucí laboratoře Ing. Jitka Zatloukalová Vrchní sestra genetiky Jana Vacková Vrchní sestra IVF Jana Benešová, DiS LONDON CITY FERTILITY Centrum asistované reprodukce MUDr. Martin Hrehorčák MUDr. Vivienne Hall Vrchní sestra Jane Holman Konzultant Gosia Heeley Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Maria Bonada Koordinátor Suky Kaur Výroční zpráva 2012 stránka 14

15

16 CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Na Poříčí 26, Praha 1 CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Kostelní 9, Praha 7 CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Liliová 1, Liberec CITY FERTILITY LONDON 16 St John Street, London EC1M 4NT info@gennet.cz