CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 ZÁVĚREČNÁ ZPRÁVA O ŘEŠENÍ ROZVOJOVÉHO PROJEKTU MŠMT Č. 185 Název: Rozvoj výuky klinických oborů moderními informačními technologiemi Řešitel: doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. Lékařská fakulta Masarykovy univerzity, Centrum biostatistiky a analýz Spoluřešitel: doc. RNDr. Václav Račanský, CSc. Ústav výpočetní techniky Masarykovy univerzity
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Obsah Zkrácený souhrn postupu a výsledků řešení v roce 2005 2 1 Výchozí podmínky a z nich vyplývající priority řešení v roce 2005 3 2 Organizační a personální zabezpečení řešení v roce 2005 4 3 Konkrétní výstupy řešení projektu 5 4 Prezentace a propagace projektu 9 5 Zpřístupnění výsledků projektu ostatním vysokým školám 11 6 Perspektivy a plány řešení v dalším období 11 7 Zdůvodnění čerpání finančních prostředků 11 Příloha A: Příloha B: Příloha C: Příloha D: Příloha E: ekonomická zpráva projektu telemedicína ve výuce (postup při zařazení obrazové studie do PACS na podporu výuky a výzkumu) zpracování digitálního videa na LF MU Report RITM (zkrácená verze sborníku s příspěvky z pořádaného semináře Informační technologie a telemedicína ve výuce klinických a zdravotnických oborů) Report RITM (elektronická verze sborníku na CD) 1
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Zkrácený souhrn postupu a výsledků řešení v roce 2005 Řešení a výsledky projektu v roce 2005 lze chápat jako první systémový vstup moderních informačních technologií do výuky klinických oborů na Lékařské fakultě Masarykovy univerzity (LF MU). Cíle projektu z tohoto důvodu zahrnovaly i organizační a personální zajištění této činnosti, které se podařilo systémově garantovat ustavením Rady pro informační technologie v medicíně (RITM), která na LF MU začala pracovat napříč odbornými sekcemi. Dalším velmi podstatným organizačním výstupem je dosažení dohody všech fakultních nemocnic v Brně zajišťující podporu klinických pracovišť pro projekt. Tvorba učebních pomůcek a informační rozvoj výuky tak nezůstává pouze v teoretické rovině, ale získává přístup k reálným klinickým datům. S využitím investiční podpory projektu se výuka s využitím moderních technologií také může realizovat přímo na klinikách a specializovaných klinických pracovištích. Projekt v roce 2005 ustavil i radu odborných garantů a výstupy řešení získaly pozitivní ohlas na většině pracovišť LF MU. Prioritou řešení v roce 2005 byly ve shodě s plánem projektu pod-projekty zaměřené na zpřístupnění obrazové dokumentace a výstupů zobrazovacích modalit do výuky klinických oborů a dále tvorba multimediálních atlasů. Výstupy se tedy v souladu s plánem projektu převážně orientují na autorská pedagogická díla zásadně modernizující výuku v strategických disciplínách současné medicíny. V roce 2005 byla zahájena a v prvotní podobě také uvedena do výuky tvorba více než 30 konkrétních atlasů, multimediálních pomůcek, digitálních videí, elektronických skript a e-learningových kurzů. Zaměřením tato díla prostupují všechny obory fakulty a lze tedy konstatovat, že výstupy projektu se minimálně v pregraduální výuce dotknou každého studenta LF MU. Vzhledem k množství výstupů a stále rostoucímu zájmu pedagogů zapojit se do této modernizace výuky bylo nutné díla systémově utřídit. Řešení roku 2005 tak položilo základ následujícím kategoriím pedagogických děl: telemedicína ve výuce, sklady klinické digitální obrazové dokumentace obrazové a multimediální výukové atlasy učební pomůcky na bázi digitálního videa hypertextová skripta e-learningové kurzy výukové weby Řešitelský kolektiv věnoval v roce 2005 značnou pozornost propagaci a prezentaci výstupů projektu. Výsledky byly prezentovány na významných celostátních konferencích (Brněnské onkologické dny, Olomoucké hematologické dny, Telemedicína Brno 2005). V průběhu roku byly pořádány pravidelné semináře a workshopy spojené i s metodickými ukázkami telekonferenční výuky. V listopadu 2005 proběhla celofakultní konference věnovaná výhradně metodickým otázkám a výstupům projektu z této konference byl vydán editovaný sborník příspěvků, který bude k dispozici i zájemcům z jiných vysokých škol. Zcela zásadním výstupem, který začal být v roce 2005 vytvářen, je oficiální webový portál Lékařské fakulty MU http://portal.med.muni.cz kde jsou multimediální výukové pomůcky přehledně tříděny a zpřístupňovány studentům. Portál je odborně garantovanou platformou, při které pracuje i ediční rada fakulty. Oficiální celorepublikové zveřejnění portálu je připraveno na počátku roku 2006. Portál umožní zveřejňování recenzovaných elektronických pedagogických děl a výrazně usnadní navazování spolupráce s ostatními vysokými školami v ČR, což je jedna z priorit dalšího rozvoje Lékařské fakulty MU v oblasti IT. V této souvislosti již byla prezentace portálu přijata na konferenci BELKOM 06 mezi hlavní přednášky o vzdělávání s podporou informačních a komunikačních technologií. Závěrem lze konstatovat, že řešení projektu probíhalo v roce 2005 zcela podle stanoveného plánu a všechny cíle byly splněny, v některých kategoriích i nad rámec původního plánu. 2
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 1 Výchozí podmínky a z nich vyplývající priority řešení v roce 2005 Rozvoj výuky klinických oborů moderními informačními a komunikačními technologiemi má svá objektivní specifika, která do značné míry určovala i řešení projektu v roce 2005. Situaci lze stručně vystihnout následovně: a. Informační podpora musí reflektovat současný stav medicíny a její vybavenost především v oblasti diagnostiky skutečně hodnotné učební pomůcky tedy pracují s výstupy moderních zobrazovacích metod, zpracovávají data z moderních laboratorních vyšetření apod. Takové výstupy nelze zajistit v teoretickém prostředí samotných fakult, je nutná intenzivní spolupráce s nemocnicemi a klinikami. b. Základem skutečně potřebných učebních pomůcek a materiálů musí být zpracování klinického materiálu, ať již v obrazové nebo jiné podobě. Vytváření pomůcek je tedy časově náročné a mnohdy je podmíněno analýzou objemných a dlouhodobě sbíraných dat. c. Moderní informační podpora výuky klinických oborů nemůže probíhat mimo klinické provozy a pracoviště, naopak musí jít za studenty na všechna výuková místa. Rostou tím nároky na investiční a obecně hardwarové vybavení poslucháren klinických pracovišť, roste význam telekonferenční výuky. d. Výchova budoucího lékaře má velmi významný etický rozměr a není možné studentům zpřístupňovat odborně neposouzené učební pomůcky, například obrazové diagnostické atlasy apod. Zvláště u elektronických materiálů, kde se předpokládá samostudium, roste význam odborné kontroly a garance doslova u každého jednotlivého snímku včetně jeho popisu. e. Tvorba komplexních pomůcek jako jsou např. obrazové atlasy je možná pouze se zapojením širokého kolektivu autorů a klinických specialistů. Výstup takové spolupráce lze označit za autorské dílo a je tedy nutné dbát na ochranu práv všech zapojených subjektů (fakulty, nemocnice) a autorů podle platných zákonů. f. Učební pomůcky pro klinické obory jsou postaveny na datech konkrétních pacientů a velký význam tedy hraje ochrana jejich práv. Všechny vstupy do učebních materiálů musí být důsledně anonymizovány, aby nebyla možná přímá ani nepřímá identifikace osoby pacienta. U pomůcek, kde anonymizace není možná, je nutné používat informovaný souhlas, případně žádat o souhlas etickou komisi a vedení nemocnic. Z výše uvedeného vyplývá a závěrem této části lze konstatovat, že skutečný rozvoj výuky klinických oborů informačními technologiemi není řešitelný pouhým zavedením e learningové podpory pro běžnou výuku. Základem systémového rozvoje musí být přirozené propojení výuky s vybavením a prostředím reálných klinických pracovišť a v učební pomůcky musí zhodnocovat reálný klinický materiál. Rozvoj výuky je tak závislý nejen na vlastních technologiích, ale i na eticky limitovaném zpracování značně objemných a komplikovaných dat. Řešení projektu na LF MU v roce 2005 respektovalo všechna výše uvedená specifika, včetně schválené spolupráce s fakultními nemocnicemi, ustavení rady odborných garantů a u vybraných výstupů i aplikace informovaného souhlasu ze strany pacienta. Níže popsané řešení projektu tato specifika úspěšně zvládlo, což mimo jiné vedlo i k nekonfliktnímu zařazení výstupů projektu do výuky. 3
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 2 Organizační a personální zabezpečení řešení v roce 2005 Hlavním řešitelem projektu byla Lékařská fakulta Masarykovy univerzity (LF MU), hlavním koordinátorem projektu byl doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. a průběh řešení dozorovalo Kolegium děkana LF MU. Partnerem spoluřešitelem projektu byl Ústav výpočetní techniky Masarykovy univerzity (ÚVT MU) vedený doc. RNDr. Václavem Račanským, CSc. Povaha a cíle projektu vedly k úzké spolupráci s řešiteli z fakultních nemocnic a specializovaných pracovišť MU, především s Masarykovým onkologickým ústavem, Fakultní nemocnicí Brno a Fakultní nemocnicí u svaté Anny v Brně. Spolupráce všech vyjmenovaných subjektů včetně sestavování pracovních týmů je řízena Radou pro informační technologie v medicíně, jejíž činnost a organizace je popsána v následující podkapitole. 2.1 Rada pro informační technologie v medicíně (RITM) a organizační zajištění činnosti Základním smyslem existence RITM je zajištění rozvoje LF MU v oblasti moderních informačních a komunikačních technologií (ICT). RITM pracuje jako volné sdružení odborníků, většinou řešitelů významných projektů souvisejících s aplikacemi ICT ve výuce klinických oborů. Do činnosti RITM jsou zapojeni zástupci pracovišť podílejících se na správě sítí, údržbě výpočetní techniky a výuce zdravotnické informatiky. Hlavní oblast aktivit RITM je zaměřena na výuku a na rozvojové projekty související s výukou. Činnost však zahrnuje také koordinaci výzkumných grantových projektů, podporu klinickým studiím a registraci klinických dat. Z tohoto důvodu RITM sdružuje i zástupce fakultních nemocnic spolupracujících s LF MU. RITM pracuje neziskově a veškerou podporu výuky LF MU hradí z akademických grantových projektů. Ačkoli původní návrh struktury RITM počítal s proporcionálním zastoupením jednotlivých sekcí fakulty přímo v RITM, pravidla získávání rozvojových projektů a samotná praxe si v průběhu let 2003 2004 vynutily jiné, nyní již zcela funkční uspořádání. Veškeré níže popsané aktivity jsou organizovány a odborně garantovány Centrem biostatistiky a analýz (CBA) a Centrem výpočetní techniky (CVT) LF MU. Oba týmy vkládají do aktivit RITM přibližně 5 plných pracovních úvazků hrazených ze získaných grantových projektů nebo z vlastních zdrojů. Činnost RITM je úzce spjata s fakultními nemocnicemi a specializovanými pracovišti MU, velmi cenné partnerství s ÚVT MU. Zástupci fakultních nemocnic a spolupracujících organizací jsou vybíráni ve shodě s vedením těchto institucí. Složení RITM není pevné a mění podle aktuálních potřeb a podle příspěvku konkrétních odborníků k právě řešeným problémům a projektům. Struktura RITM může být modifikována podle aktuálních problémů nebo i podle významných projektů, které budou mít v RITM své zástupce. RITM je ve struktuře LF MU začleněna na úrovni oborové sekce a vedoucí RITM je členem Kolegia děkana. Vedoucího RITM jmenuje děkan LF MU. Postavení vedoucího RITM odpovídá pozici vedoucího odborné sekce LF MU. RITM nepracuje jako samostatné pracoviště, dominantou činnosti je koordinace a podpora rozvoje v oblasti ICT na úrovni vedoucích oborových sekcí. V oblasti výuky vystupuje RITM především jako konzultační a koordinující jednotka, vlastní výuka je realizována a vykazována na úrovni samostatných pracovišť LF MU. RITM nenahrazuje činnost jednotlivých pracovišť LF MU a nepřebírá za ni odpovědnost. Do činnosti RITM se dosud zapojilo více než 20 ústavů nebo týmů LF MU a na tvorbě jednotlivých výstupů se podílí více než 100 odborníků z LF MU i fakultních nemocnic. 2.2 Ustanovení Rady odborných garantů pro využití klinického obrazového materiálu ve výuce V podprojektu Telemedicína ve výuce, jehož hlavním cílem je vytvoření a naplnění databáze klinické obrazové dokumentace vhodné pro výuku, se během roku 2005 angažovalo více než 30 odborníků z teoretických ústavů a klinik LF MU. Didaktickou vhodnost výběru snímků a 4
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 studií stejně jako jejich strukturovaný popis a parametrické zatřídění do databáze podléhá ustanovené radě odborných garantů. Radě předsedají doc. MUDr. Petr Krupa, CSc. a MUDr. Marek Mechl, Ph.D. Dále je v ní zastoupeno 15 specialistů pro jednotlivé orgánové systémy a obory. 2.3 Personální zajištění tvorby digitálního videa a e-learningu Tvorbu moderních výukových pomůcek na bázi digitálního videa a podporu pro tvorbu e-learningových kurzů na LF MU zajišťuje Centrum výpočetní techniky (CVT) pod vedením Mgr. Břetislava Regnera. Časově náročné úkony spjaté s pořizováním a zpracováním digitálních videozáznamů zajišťuje p. Jaroslav Winkler přijatý na plný úvazek pro tuto činnost. Pro bližší informace viz příloha C. 2.4 Klíčoví odborníci garantující tvorbu hlavních děl doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. prof. MUDr. Rostislav. Vyzula, CSc. prof. MUDr. Jan Žaloudík, CSc. prof. MUDr. Jiří Vorlíček, CSc. prof. MUDr. Josef Bednařík, CSc. doc. MUDr. Jaroslav Procházka, CSc. prof. MUDr. Karel Dvořák, DrSc. prof. MUDr. Vlastimil Válek, CSc. MUDr. Daniel Bartůšek MUDr. Pavel Andres Ing. Otto Dostál, CSc. RNDr. Michal Javorník prof. MUDr. Hana Kubešová, CSc. prof. MUDr. I. Šlapák, CSc. MUDr. Aleš Bourek, Ph.D. MUDr. Josef Feit, CSc. Mgr. Břetislav Regner 3 Konkrétní výstupy řešení projektu 3.1 Telemedicína ve výuce: zajištění kapacitně vyhovujícího HW a SW vybavení pro zavedení telemedicíny do výuky klinických oborů Ve spolupráci s ÚVT MU byly v průběhu řešení projektu rozšířeny možnosti výukového systému postaveného na projektu MeDiMed, který řeší problematiku sběru, zpracování a dlouhodobé archivace medicínských obrazových informací. Výukový systém je určen pro studenty lékařských oborů a pro začínající radiology. Řešení je koncipováno tak, aby splňovalo požadavky kompatibility se systémy pracujícími v reálném rutinním provozu na klinikách. Před zařazením obrazové studie, vhodné pro potřeby výuky, jsou odstraněny (modifikovány) všechny informace, které by v budoucnu mohly vést k odhalení identity pacienta, ale přitom je zachována maximální vypovídací schopnost získaného materiálu. U pacienta, jehož obrazová informace byla zařazena do výukového systému z různých zdravotnických zařízení a přístrojů, 5
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 lze takto sledovat průběh onemocnění a jeho léčby. Každá obrazová studie, zařazená do výukové databáze, musí být opatřena standardním popisem, obsahujícím vlastní popis nálezu případně vyšetřovacího postupu a sadou klíčových slov, které umožní pozdější snadné vyhledávání. V roce 2005 byl při řešení projektu kladen důraz hlavně na rozšíření HW a SW vybavení na specializovaná pracoviště fakulty tak, aby mohly být v obrazových studiích zařazeny snímky z mnoha zobrazovacích modalit. Z tohoto důvodu byly investovány prostředky do rozšíření sítě o 16 pracovních PACS (Picture Archive Communication System) stanic, ze kterých je možno ukládat anonymizované snímky do centrální databáze. Do dvou výukových učeben radiologie byly za účelem demonstrační výuky pořízeny speciální lékařské projektory. V multimediální učebně CBA je k dispozici 30 osobních počítačů s DICOM prohlížečem, pomocí něhož studenti mohou vyhledávat a prohlížet si snímky přímo z centrální databáze výukového systému PACS. Studenti se přitom dostanou pouze k anonymizovaným obrazovým studiím, které byly navíc schváleny odbornou radou garantů podprojektu Telemedicína ve výuce, viz výše. Bližší informace, viz: příloha B http://www.telemedicinabrno.cz http://portal.med.muni.cz/modules.php?name=news&new_topic=2 3.2 Telemedicína ve výuce: digitální výukové atlasy V roce 2005 byly při řešení projektu rozšířeny počty studií ve třech samostatných podprojektech v rámci výukového systému PACS: Moderní diagnostika a léčba superficiálních cévních malformací a hemangiomů: o 98 studií s dokumentací v různém stavu rozpracovanosti. Digitální výukový mamografický atlas obrazové dokumentace se zaměřením na diagnostiku karcinomu prsu: o 40 zdokumentovaných studií kombinujících snímky z mamární diagnostiky, ultrasonografie a magnetické rezonance. Digitální výukový atlas PET: o 27 zdokumentovaných studií, včetně fůzí. Studie vždy obsahují obrazovou dokumentaci a strukturovanou lékařskou zprávu s následujícími částmi: vyšetřovaný orgán, typ vyšetření, anamnéza, popis dokumentace, diff. diagnóza, konečná diagnóza, histologie, komentář. Bližší informace, viz: příloha D příloha E 3.3 Výukové pomůcky na bázi digitálního videa. V rámci podprojektu zaměřeného na pořizování a zpracování videozáznamů pro výuku na LF MU bylo během roku 2005 natočeno 21 nových videozáznamů, bylo dokončeno 15 videí z předchozího období a dále bylo digitalizováno 20 VHS videokazet. Nejvýznamnější podíl videí tvoří záznamy chirurgických zákroků, biochemie a laboratorních postupů a zákroků na oddělení hematoonkologie. Kromě vlastního natáčení a zpracování videa byly poskytovány konzultace a pomoc v menším rozsahu pracovištím, která provádějí zpracování videa ve vlastní režii. 6
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Všechny nově natočené videozáznamy byly pořízeny a zpracovány ve formátu DV. Výsledné materiály byly podle požadavků a vybavenosti pracovišť předávány na CD nebo DVD ve formátu MPEG1, MPEG2 (DVD kvalita), MPEG4 nebo na VHS kazetách. Zároveň jsou archivovány v DV kvalitě na kazetách tak, aby v nich bylo možné později provádět úpravy, případně vytvářet další kopie. Záznamy získané digitalizací starších záznamů z VHS kazet byly zpracovávány podle požadavků zadavatele. Kromě standardního postupu při pořizování a zpracování videí garantovaném CVT bylo na specializovaném fakultním chirurgickém pracovišti nainstalováno videokonferenční zařízení na bázi PC a potřebného příslušenství. Spolu s vybavením získaným z jiných prostředků je možné přenášet obraz ze třech kamer včetně laparoskopu na chirurgickém sále přímo do výukové místnosti. Přenášený signál je zároveň uchováván a upravován pro pozdější možnosti demonstrační výuky. Tímto způsobem byly zpracovány tři kompletní videozáznamy typických chirurgických zákroků kýly. příloha C http://www.med.muni.cz/cvt/index.php?video http://portal.med.muni.cz/modules.php?name=news&new_topic=10 3.4 Multimediální výukové pomůcky. Multimediální učebnice patologie je s prvky prohlížečů rentgenových snímků a virtuálního mikroskopu, s anotací obrazů a s histologickými obrazy mimořádné kvality vhodnou učební pomůckou. V průběhu řešení projektu v roce 2005 byl atlas rozšířen o další obrazovou dokumentaci, v současné době atlas obsahuje 1850 snímků a další budou přidávány. Celkem se jedná asi o 6 GB dat. Výsledkem vhodného návrhu vstupních dat a možnosti verifikovat strukturu atlasu je to, že se s rostoucím rozsahem nezvyšuje komplikovanost atlasu a přidávání dalších kapitol i obrazů je jednoduché. Definovanou strukturu atlasu lze poměrně jednoduše modifikovat. Bližší informace, viz: příloha D, příloha E http://portal.med.muni.cz/modules.php?name=news&file=article&sid=311 Multimediální výukový atlas poruch řeči a příbuzných kognitivních funkcí je určen pregraduálním i postgraduálním studentům medicíny, psychologie, logopedie, a ošetřovatelství. Obsahuje obecnou část s popisem problematiky, metod a postupů. Hlavní didaktický význam má však více než 240 videozáznamů uspořádaných do více než 30 kasuistik, včetně komentované obrazové dokumentace z CT a MRI. Bližší informace, viz: příloha D, příloha E http://portal.med.muni.cz/modules.php?name=news&file=article&sid=312 3.5 Investiční program, vybavení učeben Rada pro informační technologie v medicíně (RITM) pokračovala v roce 2005 v dlouhodobém investičním programu, jehož cílem byla rekonstrukce a částečně i zřizování nových multimediálních a počítačových učeben. Bez těchto často velmi nákladných zařízení je moderní výuka se zapojením telekonferencí a telemedicíny nemyslitelná. Využití investičních prostředků v roce 2005 je shrnuto v kapitole 7.3 této zprávy. 3.6 E-learning na LF MU V rámci podprojektu E-learning ve výuce klinických a zdravotnických oborů se v roce 2005 rozvinula tvorba elektronických kurzů a testů. Vzniklé materiály budou hrát stále větší roli v 7
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 programech celoživotního vzdělávání lékařů a významně zasáhnou i výuku všech teoretických disciplín. Pro Interní lékařství pro bakalářské studium ošetřovatelství nebyl v počátečních fázích studia k dispozici žádný výukový materiál adekvátní k požadované úrovni vědomostí z vnitřního lékařství. Učebnice středoškolské ani výukové texty studentů lékařské fakulty neodpovídaly svým rozsahem. Zajištění studijních materiálů v elektronické formě a jejich vyvěšení na nově vzniklém webovém portálu LF MU pomohlo vyřešit tuto kritickou situaci. Bližší informace, viz: příloha D, příloha E http://portal.med.muni.cz/modules.php?name=news&file=article&sid=320 http://portal.med.muni.cz/modules.php?name=news&file=article&sid=319 Technologie data miningu a analýzy genových expresních map ve výuce klinických oborů V rámci řešení projektu byly připraveny výukové texty včetně praktických cvičení k tomuto kurzu, který přibližuje metody dolování dat i nematematikům. Kromě teoretického popisu metod a postupu jejich výpočtu v různých softwarech je součástí kurzu i několik řešených příkladových studií nasazení data miningu, např. na datech microarrays, ukazující možnosti a přínosy tohoto způsobu řešení analýzy dat. Bližší informace, viz: příloha D, příloha E http://portal.med.muni.cz/modules.php?name=news&file=article&sid=318 3.7 Webový portál LF MU V průběhu řešení projektu v roce 2005 byl vytvořen nový moderní webový portál, který v oblasti vývoje klasických e-learningových kurzů plně spolupracuje s celouniverzitním projektem e-learningu. Webový portál je oficiální platformou LF MU pro zveřejňování elektronických verzí pedagogických děl a multimediálních materiálů pro podporu výuky. Jeho hlavní úlohou je zpřístupnění všech elektronických didaktických materiálů vytvářených na LF MU. Kromě samotného zveřejňování výukových pomůcek poskytuje prostor a technickou podporu pro jejich umisťování v síti Internet. Uživatelé portálu jsou zejména: akademičtí pracovníci, kteří portál používají ke zveřejňování svých pedagogických děl, tvůrci multimediálních učebních pomůcek, kteří portál používají jako nástroj ke komunikaci s jejich uživateli, osoby zapojené v celoživotním vzdělávání lékařů a pracovníků ve zdravotnictví, studenti nejen lékařských fakult. Webový portál byl spuštěn pro potřeby LF MU na podzim 2005. Na konci roku 2005 mu bylo od Státní technické knihovny přiděleno identifikační číslo ISSN 1801-6103. Bližší informace, viz: příloha D, příloha E, http://portal.med.muni.cz/ 8
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 4 Prezentace a propagace projektu Výsledky řešení projektu byly prezentovány na těchto akcích: Telemedicína 2005: 31. 3. 1. 4. 2005 o Na této významné konferenci byla prezentována zejména problematika telemedicíny ve výuce. o Kajan J., Krupa P.: Teleradiologie a bezfilmové nemocnice o Mechl M.: Dvojí čtení a PACS technické předpoklady o Dostál O., Javorník M.: Projekt MeDiMed na MU Brno o Javorník M., Dostál O., Dušek L., Šmíd R.: Výuka v rámci projektu MeDiMed Brněnské onkologické dny 2005: 26.-28.5.2005 o Na této významné konferenci byla problematice telemedicíny ve výuce věnována celá sekce přednášek. V celostátně distribuovaném sborníku (ISBN 80-86793-05-2) jsou otištěny 3 příspěvky: o Andres, P.: Aktuální stav provozu PACS v JmK o Krupa P., Kajan J., Kršek P., Černochová P., Molitor M., Novák Z.: PACS a jeho speciální aplikace o Javorník M., Dostál O., Andres P., Dušek L., Šmíd R.: Výukový PACS na LF MU v Brně BELCOM 06 o Ke konci roku 2005 byl příspěvek Webový portál LF MU pro multimediální podporu výuky klinických a zdravotnických oborů přijat na konferenci Building Effective Learning Communities mezi hlavní přednášky bloku Spolupráce univerzit v rámci rozvojových projektů MŠMT v oblasti ICT. Konference proběhne 6.-7.2. 2006. Pravidelné schůzky řešitelského týmu spojené s prezentací pro akademickou obci LF MU o Především pro podprojekt Telemedicína ve výuce byly pořádány pravidelné schůzky, na kterých se scházeli odborníci z teoretických pracovišť fakulty se svými kolegy z klinik a dalších odborných pracovišť (ÚVT), aby konzultovali vývoj a řešení nových problémů spojených s řešením výukového systému PACS. o Termíny veřejných schůzek: 5.5.2005, 15.5.2005, 5.10.2005, 16.11.2005, 19.12.2005 Prezentace možností videokonference několika pracovišť s demonstrací spojení mezi FN Brno, IKEM Praha, FN Hradec Králové a FN Olomouc: 28.11.2005 o Prezentace proběhla formou telekonferenční výuky zúčastnivších se desítek studentů a pedagogů LF MU. Obsahem byl popis konkrétních zákroků a jejich obrazové dokumentace na jednotlivých odborných pracovištích v ČR. 9
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Informační technologie a telemedicína ve výuce klinických a zdravotnických oborů o Celofakultní workshop se uskutečnil 11. listopadu 2005 v kongresovém centru LF MU. Před více než 100 účastníky z LF MU i jiných fakult MU byly prezentovány výsledky jednotlivých podprojektů. Příspěvky jsou dále otištěny v celostátně distribuovaném sborníku Report RITM (ISBN 80-210-3924-8). o Program workshopu: prof. MUDr. Jan Žaloudík, CSc. doc. RNDr. Ladislav Dušek, Dr. MUDr. Aleš Bourek PharmDr. Vladimír Finsterle Ing. Daniel Schwarz, Ph.D. doc. MUDr. Petr Krupa, CSc. PhDr. Milena Košťálová prof. MUDr. Vlastimil Válek, CSc. prof. MUDr. Miroslav Penka, CSc. Mgr. Břetislav Regner MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D. doc. MUDr. Jindřich Fiala, CSc. prof. MUDr. Ivo Šlapák, CSc. MUDr. Josef Feit, CSc. doc. MUDr. Jaroslav Procházka, CSc. MUDr. Monika Schneiderová doc. MUDr. Zdeněk Novák, CSc. Úvodní slovo Multimediální podpora výuky klinických oborů na LF MU přehled projektů a strategie dalšího vývoje Projekt Improhealth - virtuální centrum výuky zdravotnického managementu. Moderní podoba e-learningu pro zdravotnické obory Koncepce kontinuálního vzdělávání lékařů prostřednictvím portálu EUNI.CZ Nový webový portál LF MU pro multimediální podporu výuky klinických oborů Telemedicína ve výuce klinických oborů - koncepce, organizace a dosavadní výsledky Multimediální výukový atlas poruch řeči a příbuzných kognitivních funkcí Propojení vybraných univerzitních pracovišť v ČR pomocí videokonferenčního zařízení Polyspan - praktická ukázka spojení s IKEM Telehematologie jako projekt vedoucí k prohloubení výuky jednoho z významných interdisciplinárních oborů. Podpora e-learningu a tvorby videa na LF MU Mikrobiologie on-line Portál interaktivní edukace prevence nemocí a podpory zdraví Multimediální výuková laboratoř otolaryngologie Multimediální učebnice patologie Moderní diagnostika a léčba superficiálních cévních malformací a hemangiomů Digitální výukový mamografický atlas Přínos telekonferenční techniky na neurochirurgickém operačním sále pro výuku neurověd Bližší informace, viz: příloha D, příloha E 10
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 5 Zpřístupnění výsledků projektu ostatním vysokým školám Ucelenou prezentaci výsledků projektu představuje především sborník z celofakultního semináře Informační technologie a telemedicína ve výuce klinických a zdravotnických oborů (ISBN 80-210-3924-8). Podstatným přínosem pro ostatní vysoké školy je však hlavně nově vzniklý webový portál LF MU (ISSN 1801-6103), kde jsou výsledky řešení tohoto projektu, tj. konkrétní didaktická díla v elektronické podobě a multimediální učební pomůcky přístupná odkudkoli. Kromě studentů lékařských fakult je určen také pedagogům, kteří zde mohou svá díla zveřejnit. Režim vyvěšování a přístupu k materiálům zveřejněných na portálu je popsán v dokumentech, které jsou k dispozici na portálu ke stažení ve své aktuální verzi. Bližší informace, viz: příloha D, příloha E http://portal.med.muni.cz 6 Perspektivy a plány řešení v dalším období Výstupy řešení projektu, které byly uvedeny v kapitole 3 této zprávy, jsou připraveny pro nasazení ve výuce konkrétních kurzů nebo již byly nasazeny. Příprava takových rozsáhlých děl je však záležitostí dlouhodobou. Speciálně v oblasti tvorby multimediálních atlasů je stále otevřena otázka jejich postupného rozšiřování a neustálá modernizace technologií, pomocí kterých jsou tyto atlasy vyvíjeny. Ve velmi komplexní oblasti jakou je aplikace telemedicíny ve výuce klinických oborů musí činnost dále pokračovat, a to hlavně: investice do rozšiřování výukové sítě PACS, vyřešení anonymizace tzv. grabovaných snímků se změnou obrazové informace, rozšiřování databáze studií a tvorba speciálních podprojektů jsoucích napříč orgánovými sekcemi (chirurgie, ortopedie, atd.) Další vývoj se předpokládá také v oblasti nepřetržitého rozšiřování a modernizace webového portálu LF MU, jehož zakonzervování by bylo největší chybou. Velmi slibně se jeví možnost spolupráce s koordinátory projektu MŠMT Spolupráce vysokých škol při tvorbě standardizovaných multimediálních pomůcek, v rámci níž by mohly být výstupy zveřejněné na portálu LF MU zároveň distribuovány pomocí knihovny Dilleo (digitální knihovna primárně určená pro materiály využitelné v e-vzdelávání) s perspektivou začlenění do projektu EU Digital Library. Důležitým úkolem bude také vytvoření rutinních postupů a zajištění personálního potencionálu pro profesionální zveřejňování nově vytvořených didaktických děl a multimediálních učebních pomůcek na webovém portálu. 7 Zdůvodnění čerpání finančních prostředků 7.1 Zdůvodnění čerpání financí v kategorii osobní náklady Čerpané mzdy (celkem 437 000 Kč) byly využity na krytí částečných úvazků u personálu fakulty, který se podílel především na náročné přípravě obrazových materiálů pro program Telemedicína ve výuce a na přípravě videa pro učební pomůcky především tam, kde povaha činnosti vyžadovala určitý stupeň trvalého pracovního nasazení po celý rok (pracovník podílející se na digitalizaci videa, archivace obrazových materiálů,.. apod.). Celkem 337 000 Kč bylo takto využito na Lékařské fakultě MU a 100 000 Kč u spoluřešitele ÚVT MU. Tyto mzdové prostředky byly využity pro 4 pracovníky. 11
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Pohyblivé složky mzdy (celkem 1 141 000 Kč) byly v souladu s plánem využity jako odměny 38 pracovníkům podílejícím se na přípravě nadstandardních učebních pomůcek plánovaných v projektu (odměny autorům a spoluautorům multimediálních a obrazových atlasů, odměny osobám podílejícím se na centrální správě výukového PACS. Tyto mimořádné odměny byly v naprosté většině uděleny pracovníkům, kteří se podílejí na přípravě materiálů z pozice vyučujících lékařů a klinických specialistů a přípravu takto náročných děl nelze považovat za součást jejich pracovních povinností. Část odměn byla udělena koordinátorům projektu. Drobné korektury v položkách mzdy/pohyblivé složky mzdy souvisejí se změnami ve složení řešitelského týmu v průběhu řešení projektu. Ostatní osobní náklady (celkem 210 000 Kč) byly využity podle stejného principu jako výše popsané pohyblivé složky mzdy, avšak specialistům pracujícím v zdravotnických zařízeních a tedy bez stálého úvazku na Masarykově univerzitě. Využití prostředků zajistilo tak zcela jejich strategickou účast při vylisování obrazových materiálů, přípravě podkladů pro multimediální atlasy. Část prostředků byla udělena i zdravotnickému personálu, který pro potřeby výukových materiálů pracoval s pacienty a zajišťoval přípravu videí a jiných komponent (např. u multimediálního atlasu poruch řeči). Tyto prostředky byly využity celkem pro 10 pracovníků. 7.2 Zdůvodnění čerpání financí v kategorii neinvestiční prostředky: Prostředky byly v souladu s plánem využity na vybavení a doplnění vybavení učeben LF MU, ve kterých probíhá výuka s využitím multimediálních pomůcek. Část drobných nákupů byla použita na doplnění a obměnu běžného vybavení počítačů u vyučujících připravujících materiály. Bylo zakoupeno videokonferenční zařízení umožňující tento typ přímé výuky. V průběhu řešení byly minimalizovány náklady na běžné kancelářské potřeby, paměťová média a tonery tyto náklady byly převážně hrazeny z vnitřních zdrojů fakulty a pracovišť a projekt jimi nebyl zatěžován. Detailnější sumarizace této kategorie nákladů je následující: PC a drobné vybavení počítačů (385 917 Kč) Paměťová média (27 052 Kč) Videokonfereční zařízení (39 950 Kč) Literatura (50 573 Kč) Kancelářský materiál a tonery (15 906 Kč) 12
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 7.3 Zdůvodnění čerpání financí v kategorii investiční prostředky 255 589 Kč Výpočetní technika 5x notebook IBM Výkonné počítače pro managery/vyučující využívající výstupů programu Telemedicína ve výuce; investice umožnila mobilitu přednášejících i s výukovými materiály relativně náročnými na hardware. 155 890 Kč Diskové pole Diskobolos Profi III Diskový prostor nezbytný pro archivaci anonymizovaných obrazových materiálů a zabezpečení práce s nimi; plánované vybavení pro centrální učebnu fakulty zaměřenou na výuku na bázi telemedicíny. 80 996 Kč SW InstallShield Premier 11 Softwarový balík InstallShield Premiér 11 byl použit pro vývoj multimediálních výukových pomůcek distribuovaných na nosičích CD a DVD. 100 662 Kč SW S+ verze 7 (statistický software) Investice do SW, který byl v rámci řešení využit pro přípravu e-learningových kurzů se zaměřením na Data mining klinických dat ; tento SW byl vybrán pro nadstandardní vybavení umožňující i zpracování genomických dat a expresních genových map vytvoření elektronických kurzů s tímto zaměřením bylo v původním plánu projektu 98 294 Kč 2 x digitální fotoaparát k mikroskopu Nutná investice umožňující iniciaci výukového programu Telehematologie ve výuce klinických oborů ; zařízení je využito na dvou zapojených výukových pracovištích LF MU, kde probíhá primární tvorba výukových materiálů pro ostatní obory LF MU 87 389 Kč Digitální kamera k mikroskopu (patologie) Zařízení zakoupené v souladu s plánem projektu, tj. plnění úkolu vývoj multimediálních výukových atlasů; zařízení slouží k primární tvorbě výukových materiálů 99 960 Kč Radiologická diagnostická výuková stanice Investice do zařízení umožňující zapojení výstupů telemedicíny do reálné výuky klinických oborů 840 000 Kč ÚVT TomoCon Workstation (pracovní stanice PACS) Prostředky spoluřešitele projektu (ÚVT MU). Strategická investice, který rozšiřuje možnosti PACS systému a umožňuje jeho zapojení do výuky. Investice byla potřebná k výrazné úpravě stávajícího řešení včetně úpravy speciálních komponent pro účely výuky. Tento systém je nyní koncipován tak, aby současně splňoval všechny požadavky kompatibility, které jsou kladeny na systémy pracující v reálném provozu. 420 000 Kč ÚVT 2x projektor vhodný pro radiologii Prostředky spoluřešitele projektu (ÚVT MU) jediná změna nákupu oproti původnímu plánu projektu. Původně bylo ve stejné ceně plánováno zakoupení IDE diskového pole, ale v průběhu roku 2005 získal spoluřešitel na diskové pole prostředky z jiných zdrojů. Proto byla v červnu 2005 vznesena žádost na Rektorát MU o změnu investičního plánu a po konzultaci s MŠMT následně realizována. Zdůvodnění žádosti je zde: Namísto původně plánovaného zakoupení 1 ks IDE diskového pole pro archivaci obrazové informace pro podporu výuky a speciálně upravených diagnostických stanic žádáme o možnost částečné změny ve smyslu nákupu dvou kusů vysoce specializovaných DICOM projektorů, které umožní kvalitní zobrazení medicínské obrazové informace. Požadavek na nákup původně požadovaných diagnostických stanic zůstává zachován. Zdůvodnění: Nákup diskového pole se nám podařilo zrealizovat z jiných zdrojů. Získaná kapacita pro archivaci je v současné době pro potřeby tohoto projektu dostatečná. Po konzultaci s radiology, kteří budou prostřednictvím tohoto systému zajišťovat výuku a s odstupem více než půl roku od specifikace původního návrhu si dovolujeme požádat o změnu původního požadavku. Požadované výše investičních prostředků zůstane zachována. CELKEM 2 139 tis. Kč 13
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 ZÁVĚREČNÁ ZPRÁVA O ŘEŠENÍ ROZVOJOVÉHO PROJEKTU MŠMT Č. 185 Příloha A: ekonomická zpráva projektu
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Přidělené prostředky byly řešiteli vyčerpány v plné výši v souladu s plněním vytýčených cílů. Níže uvedené tabulky představují přehled čerpání dotace v dílčích položkách jednak souhrnně (Tab. 1) a dále čerpání hlavním řešitelem a spoluřešitelem (Tab. 2). Součástí věcné části závěrečné zprávy je také kapitola zdůvodňující podrobně čerpání přidělených prostředků. Tabulka 1: Přehled skutečného čerpání finanční dotace (v tis. Kč) souhrnná tabulka Kapitálové finanční prostředky Celkové náklady na řešení projektu Z toho dotace ze st. rozpočtu (ukazatel I) Celkem 2 139 2 139 Z toho Dlouhodobý nehmotný majetek (SW, licence) 182 182 Samostatné věci movité (stroje, zařízení) 1 957 1 957 Běžné finanční prostředky Celkové náklady na řešení projektu Z toho dotace ze st. rozpočtu (ukazatel I) Celkem 2 858 2 858 Mzdy 434 434 Z toho Pohyblivé složky mzdy 1 141 1 141 Odměny dle dohod o pracích konaných mimo pracovní poměr 210 210 Odvody na sociální a zdravotní pojištění 554 554 Drobný majetek 405 405 Materiální náklady 114 114 Služby a náklady nevýrobní povahy 0 0 Cestovní náhrady 0 0 Stipendia 0 0 Celkem (běžné a kapitálové) finanční prostředky ze státního rozpočtu (ukazatel I) na řešení projektu 4 997
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Tabulka 2: Přehled skutečného čerpání finanční dotace (v tis. Kč) hlavní řešitel (LF MU) a spoluřešitel (ÚVT MU) Kapitálové finanční prostředky LF MU ÚVT MU Celkem 879 1 260 Z toho Dlouhodobý nehmotný majetek (SW, licence) 182 0 Samostatné věci movité (stroje, zařízení) 697 1 260 Běžné finanční prostředky LF MU ÚVT MU Celkem 2 561 297 Mzdy 336 98 Z toho Pohyblivé složky mzdy 1 021 120 Odměny dle dohod o pracích konaných mimo pracovní poměr 210 0 Odvody na sociální a zdravotní pojištění 475 79 Drobný majetek 405 0 Materiální náklady 114 0 Služby a náklady nevýrobní povahy 0 0 Cestovní náhrady 0 0 Stipendia 0 0 Celkem (běžné a kapitálové) finanční prostředky ze státního rozpočtu na řešení projektu 4 997
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 ZÁVĚREČNÁ ZPRÁVA O ŘEŠENÍ ROZVOJOVÉHO PROJEKTU MŠMT Č. 185 Příloha B: Telemedicína ve výuce postup při zařazení obrazové studie do PACS na podporu výuky a výzkumu
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Postup při zařazení obrazové studie do PACS na podporu výuky a výzkumu Ing. Otto Dostál, CSc., RNDr. Michal Javorník, Ing. Vladimír Zatloukal Úvod Jádrem výukového systému je vyhrazený PACS (Picture Archiving and Communication System) vyvíjený a provozovaný na Ústavu výpočetní techniky Masarykovy univerzity v Brně v rámci projektu MeDiMed. Služby výukového serveru jsou dostupné pouze pro autentizované uživatele. Autentizační formulář se zobrazí při prvním požadavku na službu serveru, případně opakovaně, pokud uživatel využívá prohlížecí stanici TomoCon Workstation současně pro autentizovaný přístup k jinému serveru. Pro zařazení obrazové studie do výukové databáze se využívají speciálně upravené prohlížecí stanice, které jsou konfigurované tak, aby bylo možno vhodné obrazové studie, získané při rutinním provozu nemocnice, opatřit popisem, sadou klíčových slov, anonymizovat a zařadit do výukové databáze. Popis obrazové studie (lékařská zpráva) se vytváří ve formátu Structured Report (SR) podle normy DICOM. V průběhu postupných kroků (vytvoření nového popisu, opakovaná editace, překlad do angličtiny, kontrola garantem) bude SR obrazové studie postupně procházet stavy Partial (Otevřená) -> Complete (Kompletní) -> Verified (Podepsaná). Při opětovném otevření a úpravě textu popisu ve stavu Partial v lokálních studiích se nevytváří automaticky další verze popisu, ale provádí se editace stávající verze. Stav Partial se pro nový SR nastaví automaticky, stavy Complete a Verified se nastavují prostřednictvím tlačítek Uzavřít zprávu a Podepsat zprávu v levé části okna editoru strukturovaného popisu. Editace SR ve stavu Complete má za následek vytvoření nové verze SR ve stavu Partial. Starou verzi SR je možno/třeba smazat tlačítkem Smazat zprávu. Výběr obrazové studie vhodné pro výukové účely a její uložení do lokálního prohlížeče TomoCon výběrem z nemocničního PACSu digitalizací analogového záznamu a konverzí do formátu DICOM Obrazová studie je uložena na lokálním PC a přístupná pod záložkou Lokální studie. Doplnění popisu obrazové studie V prohlížeči otevřete požadovanou studii. V hlavní nabídce zvolte Studie->Lékařské zprávy V nově otevřeném okně stiskněte levé horní tlačítko Vytvořit novou zprávu. Zvolte šablonu pro popis obrazové studie v českém jazyce.
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Poznámka: Šablony lékařských zpráv jsou samostatné soubory uložené v poddadresáři Templates (např. c:\program Files\TatraMed s.r.o\tomocon 3.0 Workstation\Templates\) a dají se tedy volně kopírovat na další prohlížecí stanice. Do předepsaných odstavců doplňte příslušný text. Přidání nového odstavce případně jiného objektu popisu, zrušení aktuálního odstavce, změna pořadí odstavců se provádí prostřednictvím tlačítek v levé části formuláře.
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Nově vytvořený popis se automaticky uloží ve stavu Partial. Je-li popis studie úplný, převeďte jej tlačítkem Uzavřít zprávu do stavu Complete. Stiskněte tlačítko Uzavřít. Doplnění klíčových slov a odeslání obrazové studie z lokálního PC do výukového PACSu Pod záložkou Lokální studie zvolte obrazovou studii (již doplněnou o popis ve stavu Complete) a stiskněte tlačítko Poslat v levé dolní části okna. Zobrazí se seznam destinací, kam je možno obrazovou studii odeslat. Zvolte Výukový PACS stiskněte OK.
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Zobrazí se formulář s přidělenou anonymní identifikací pacienta, jeho upraveným datem narození a jménem autora popisu (uživatel aktuálně přihlášený v prohlížeči). Poslední řádek tohoto formuláře opatřený ikonou obsahuje prostor pro klíčová slova. Klikněte na ikonu a v následně otevřeném okně Klíčová slova se v jeho levé polovině nabídne slovník klíčových slov ve formě rozbalovacího stromu. Pomocí šipek vytvoříme z tohoto slovníku v pravé polovině okna seznam relevantních klíčových slov. Výběr klíčových slov potvrdíme tlačítkem OK a odeslání studie do PACSu dokončíme v okně Anonymizovat studii tlačítkem OK.
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno Překlad popisu do angličtiny http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Jako překladatel si prostřednictvím záložky Výukový PACS formuláře pro vyhledávání studií otevřte (zkopírujte do svého lokálního prohlížeče) obrazovou studii s popisem určeným k překladu. Otevřete studii v okně prohlížeče v nabídce Studie -> Lékařské zprávy, označte existující českou verzi zprávy a otevřte ji tlačítkem Zobrazit zprávu. Následně si v předchozím okně Lékařské zprávy stiskem tlačítka Vytvořit novou zprávu otevřte okno s nabídkou šablon. Vyberte Template (english) a potvrďte OK. V okně prohlížeče tak získáte ve dvou oknech českou a anglickou verzi lékařské zprávy. Jejich umístění vedle sebe vám usnadní překlad SR do angličtiny. Nově vytvořený popis se standardně uloží ve stavu Partial (při opětovném otevření a úpravě textu na lokálním PC se opět nevytváří automaticky další verze popisu). Je-li popis úplný, převeďte jej tlačítkem Uzavřít zprávu do stavu Complete. Pod záložkou Lokální studie zvolte obrazovou studii (již doplněnou o popis v anglickém jazyce) a stiskněte tlačítko Poslat v levé dolní části okna. Zobrazí se seznam destinací, kam je možno obrazovou studii odeslat. Zvolte Výukový PACS stiskněte OK. Na výukovém PACSu se tak uloží nová obrazová studie obsahující českou a anglickou lékařskou zprávu. Anonymizace se v tomto případě již neprovádí, neboť jsme pracovali s anonymní studií.
Kontrola garantem CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Jako garant si prostřednictvím záložky Výukový PACS otevřte (zkopírujte do svého lokálního prohlížeče) obrazovou studii určenou ke kontrole. Po kontrole obsahové správnosti převeďte popis české i anglické verze lékařské zprávy obrazové studie do stavu Verified (tlačítko Podepsat zprávu), doplňte své jméno a jméno organizace a stiskněte tlačítko Podepsat. Pod záložkou Lokální studie v okně Vyhledávání studií prohlížeče zvolte obrazovou studii (již zkontrolovanou a převedenou do stavu Verified/Podepsaná) a stiskněte tlačítko Poslat v levé dolní části okna. Zobrazí se seznam destinací, kam je možno obrazovou studii odeslat. Zvolte Výukový PACS a stiskněte OK. Zpřístupnění garantovaných obrazových studií koncovým uživatelům (studentům) O zpřístupnění jednotlivých obrazových studií pro konkrétní cílovou skupinu uživatelů rozhodují garanti. Garanti rozhodují o právu přístupu pro každou konkrétní cílovou skupinu koncových uživatelů. Práva nastavuje administrátor Výukového PACS.
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 ZÁVĚREČNÁ ZPRÁVA O ŘEŠENÍ ROZVOJOVÉHO PROJEKTU MŠMT Č. 185 Příloha C: zpracování digitálního videa na LF MU
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kamenice 126 / 3 625 00 Brno http://www.cba.muni.cz e-mail: cba@cba.muni.cz tel.: 549 493 826 fax: 549 492 855 Pořizování a zpracování videozáznamů V Centru výpočetní techniky (CVT) vzniklo na konci roku 2003 pracoviště zaměřené na pořizování a zpracování videozáznamů a bylo vybaveno nezbytnou technikou. Od května 2004 je v CVT zaměstnán technik, který zájemcům z LF MU zajišťuje veškeré služby související se zpracováním videa. Jedná se především o následující úkony: natáčení záznamů pomocí kvalitní tříčipové digitální kamery Canon XM2, převod záznamů do počítače, střih, ozvučení, doplnění titulků a jednoduché animace, export, překódování záznamů, uložení na média, zpracování vlastních záznamů lékařů, digitalizace VHS kazet (starší výuková videa apod.) pro použití na počítači, konzultace. Vytvořené videozáznamy za rok 2005 Hotové videozáznamy: Sádrová fixace horní končetiny/dolní končetiny; Gluteoplastika; Cholecystektomie laparoskopicky; Lipom 1, Lipom 2; Atherom; Implantace venózního portu; Implantace venózního portu alternativním postupem; Elektrofyziologické vyšetření srdce; Automatizace robotizace; Laboratorní diagnostika preanylitická fáze; Sternální punkce; Trepanobiopsie; Odběr a zpracování kostní dřeně. Natočené videozáznamy - v různém stupni rozpracovanosti: Gluteoplastika s implantáty; Blotting; Operace kýly; Předoperační příprava; Zdvojení d. cysticus; Resekce tlustého střeva; Resekce tenkého střeva; Radiofrekvenční ablace 1, 2, 3;