RNDr. Pavel Lízal, Ph.D. Přírodovědecká fakulta MU Ústav experimentální biologie Oddělení genetiky a molekulární biologie lizal@sci.muni.cz
1) Praktikum z obecné genetiky 2) Praktikum z genetiky rostlin 3) Praktikum z genetiky populací
Vyučující: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.; doc. Jana Řepková, CSc.; Mgr. Aneta Mikulášová zájem se pohybuje v průměru kolem 200 studentů ~ 1/3 (78/245) má předmět povinný Molekulární biologie a genetika Lékařská genetika a mol. diagnostika Antropologie ostatní si volí dobrovolně Speciální biologie Ekologická a evoluční biologie Matematická biologie (2. ročník) Biologie se zaměřením na vzdělávání (4. ročník)
rozdělení do seminárních skupin po 18 až 20 studentech
Podmínky splnění: 80% docházka vyřešené zápočtové příklady odevzdaných 5 protokolů úspěšně složený zápočtový test (75 %)
Úspěšnost získání zápočtu: v průměru kolem 85 %
Struktura praktika (2 h, 90 min) úvodní prezentace tématu praktika experiment praktický, simulovaný řešení zápočtových příkladů na téma praktika
Experimenty především s využitím modelových organizmů Arabidopsis thaliana Drosophila melanogaster
Experimenty 1) Pozorování štěpení recesivně letálního znaku albina u monohybrida modelového organizmu Arabidopsis thaliana seznámení se s výhodami genetického modelu rozpoznávání vybraných mutantů
Experimenty seznámení se s výhodami genetického modelu rozpoznávání vybraných mutantů založení pokusu pro sledování segregace znaku v potomstvu monohybrida
Experimenty seznámení se s výhodami genetického modelu rozpoznávání vybraných mutantů založení pokusu pro sledování segregace znaku v potomstvu monohybrida
Experimenty
Experimenty 2) Pozorování dědičnosti s vazbou na pohlaví u modelového organizmu Drosophila melanogaster (mutace white) seznámení s modelem nácvik manipulace rozpoznávání vybraných mutantů rozpoznávání pohlaví
Experimenty založení pokusu v lichých týdnech usmrcení rodičů
Experimenty založení pokusu v lichých týdnech usmrcení rodičů v sudých týdnech vyhodnocování první a druhé generace potomků (celkem 1 měsíc s octomilkou)
Experimenty 3) Sledování dědičnosti kvantitativního znaku u modelového organizmu Drosophila melanogaster základní charakteristika kvantitativních znaků popis vzniku populace jedinců F 2 pro vyhodnocení stanovení počtu chloupků na vzorku 20 jedinců
Experimenty vyhodnocení pokusu
Experimenty 4) konstrukce vlastního rodokmenu seznámení s pravidly tvorby rodokmenů pokyny pro tvorbu
Experimenty 4) konstrukce vlastního rodokmenu seznámení s pravidly tvorby rodokmenů pokyny pro tvorbu v následujících 4 týdnech si zvolí znak, zjistí výskyt u příbuzných a namalují rodokmen klepněte na obrázek pro přesměrování na video Klepněte pro přímý odkaz do aplikace
Experimenty 4) konstrukce vlastního rodokmenu
Experimenty 5) sestavení karyotypu neznámého člověka seznámení s pravidly pro identifikaci lidských chromozomů obdrží vyfotografované chromozomy polovina sestavených, polovina neidentifikovaných = mají zařadit do páru
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764 Experimenty 5) sestavení karyotypu neznámého člověka mohou si vyzkoušet také elektronicky klepněte na obrázek pro přesměrování na video Klepněte pro přímý odkaz do aplikace
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764 Další dovednosti 6) ověření znalostí pomocí animací z e-skript segregace vloh, kombinace vloh, vazba genů klepněte na obrázek pro přesměrování na video Klepněte pro přímý odkaz do aplikace
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764 Další dovednosti 6) ověření znalostí pomocí animací z e-skript genetické mapování Klepněte pro přímý odkaz do aplikace klepněte na obrázek pro přesměrování na video
Elektronická skripta jsou volně k dispozici přes elportál MU http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764
Elektronická skripta jsou volně k dispozici přes elportál MU http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764 Klepněte pro přímý odkaz do aplikace klepněte na obrázek pro přesměrování na video
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764 Koncepce vzhledem k zájmu (200 a více studentů) praktika navržena tak, aby: nebyla finančně nákladná byla realizovatelná ve standardních prostorách a přitom byla pro studenty přínosná a zajímavá Ohlasy
PRAKTIKUM Z GENETIKY ROSTLIN Vyučující: doc. Jana Řepková, CSc. Zaměření na metody genetické analýzy rostlin a problematiku genetických markerů 1. Genetická analýza a identifikace počtu genů odolnosti k padlí u planého ječmene Hordeum vulgare subsp. spontaneum. 2. Určení mikrosatelitních DNA markerů v genetické vazbě s genem odolnosti k padlí travnímu u ječmene. 3. Genetické mapování genů odolnosti k padlí travnímu u ječmene. Využití softwaru pro mapování. 4. Identifikace transgenních rostlin Arabidopsis thaliana prostřednictvím genu rezistence k antibiotiku. 5. Expresní analýza genu pro polyfenoloxidázu u jetele lučního pomocí RT-PCR.
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Vyučující: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D. zájem se pohybuje v průměru kolem 60 studentů úspěšnost kolem 92 % 54 má dvě části: výpočtovou praktickou (pro omezený počet zájemců) - obvykle 15 až 20 studentů
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Výpočtová část řešení populačně-genetických příkladů formou e-learningu
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Výpočtová část řešení populačně-genetických příkladů formou e-learningu klepněte na obrázek pro přesměrování na video
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část pracují v 5 členných týmech 1) Celosemestrální pokus s octomilkou Sledování ustavení Hardy-Weinbergovy rovnováhy pro znak vázaný na pohlaví
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část vyhodnocování populace v generacích t+1 až t+4 odevzdání týmových protokolů
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 2) Vyhodnocení dotazníků z populačního výzkumu v populaci člověka Stanovení Snyderových podílů, ověření HW rovnováhy pro dva znaky v populaci člověka a výpočet podílů heterozygotů mezi fenotypově dominantními jedinci
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část každá skupina pracuje s 50 dotazníky
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 3) Stanovení shody v profilu DNA
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 3) Stanovení shody v profilu DNA
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 3) Stanovení shody v profilu DNA
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ 4) Exkurze na Ústavu soudního lékařství a v Laboratoři forenzní genetiky
Děkuji za pozornost