UNIVERZITA OBRANY BRNO FAKULTA VOJENSKÉHO ZDRAVOTNICTVÍ HRADEC KRÁLOVÉ
|
|
- Daniel Mach
- před 5 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 UNIVERZITA OBRANY BRNO FAKULTA VOJENSKÉHO ZDRAVOTNICTVÍ HRADEC KRÁLOVÉ AUTOREFERÁT DISERTAČNÍ PRÁCE Diagnostika mykobakterií a rezistentních kmenů Mycobacterium tuberculosis molekulárně biologickými metodami Ing. Monika Coufalová Doktorský studijní program Lékařská mikrobiologie Hradec Králové
2 1 Cíl práce Cílem této práce bylo prověření molekulárně biologických metod za účelem rozšíření spektra diagnostických metod u mykobakterií a urychlení stanovení lékové citlivosti u MDR-TB a XDR-TB v rutinní klinické laboratorní diagnostice. 1. Porovnání molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MTB/NTM Detection se zlatým standardem v diagnostice M. tuberculosis a atypických mykobakterií z přímého klinického materiálu od pacientů, tedy porovnání s kultivačními metodami na mykobakterie. Navíc s porovnáním mikroskopického vyšetření a kultivačních metod. 2. Testování molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MDR-TB Detection pro detekci M. tuberculosis a stanovení citlivosti na rifampicin a isoniazid z přímého klinického materiálu k detekci MDR-TB a porovnání výsledků citlivostí s vykultivovanými kmeny metodou minimálních inhibičních koncentrací (MIC). 3. Testování molekulárně biologické metody Anyplex TM II MTB/MDR/XDR Detection ke stanovení citlivosti M. tuberculosis k antituberkulotikům při detekci MDR a XDR TB u již vykultivovaných kmenů a porovnání výsledků citlivosti s vykultivovanými kmeny metodou minimálních inhibičních koncentrací (MIC). 2
3 2 Vědecké metody V rámci této studie byly porovnány tři molekulárně biologické metody a mikroskopie mykobakterií se zlatým standardem kultivačními metodami v rutinní klinické mykobakteriální diagnostice. První z molekulárně biologických metod Anyplex TM plus MTB/NTM Detection prokazovala Mycobacterium tuberculosis a atypické mykobakterie. Druhá metoda Anyplex TM plus MDR-TB Detection zjišťovala genovou citlivost na isoniazid a rifampicin u M. tuberculosis. Třetí metoda Anyplex TM II MTB/MDR/XDR Detection zjišťovala genetickou citlivost pro určení kmenů MDR a XDR. V této práci byly hodnoceny klinické matriály získané ze dvou pracovišť, z Oddělení klinické mikrobiologie Thomayerovy nemocnice v Praze a z Centra klinických laboratoří při Zdravotním ústavu v Ostravě. Klinické materiály byly získány od pacientů s podezřením na tuberkulózu, mykobakteriózu nebo k vyloučení těchto onemocnění. Klinické materiály byly získávány v období od ledna do prosince Po získání klinického materiálu od pacienta byl tento vzorek rozdělen na dvě části pro zpracování na mikroskopii a kultivaci mykobakterií a na testování molekulárně biologickou metodou Anyplex TM plus MTB/NTM Detection, které byly testovány ke stanovení Mycobacterium tuberculosis a atypických mykobakterií. Téměř všechny klinické vzorky byly současně testovány mikroskopickou, kultivační a molekulárně biologickou metodou, kromě vzorků močí a laryngeálních výtěrů, kde nebyla provedena mikroskopie. Před mikroskopickým a kultivačním vyšetřením byla provedena homogenizace, dekontaminace a koncentrace vzorku pomocí centrifugace. Pro mikroskopii se vytvořil nátěr kapky sedimentu na podložní sklíčko a následovalo barvení fluorescenční nebo podle Ziehl-Neelsena. Pro kultivaci mykobakterií následovala inokulace materiálu na různé kultivační půdy v závislosti na vstupním klinickém materiálu. V případě pozitivní kultivace byla prováděna identifikace mykobakterií. Stanovení citlivosti u atypických mykobakterií nebylo standardně prováděno. Pro diagnostiku molekulárně biologickými testy byla nejprve z klinického materiálu od pacienta izolována/extrahována nukleová kyselina. V dalším kroku následovala amplifikace a detekce cílených sekvencí nukleotidů. V případě molekulárně 3
4 biologického testu byly zvlášť hodnoceny M. tuberculosis a atypické mykobakterie. V případě pozitivní detekce M. tuberculosis molekulárně biologickou metodou Anyplex TM plus MTB/NTM Detection byla použita další diagnostická souprava pro zjištění rezistence k rifampicinu a isoniazidu (Anyplex TM plus MDR-TB Detection). Tato metoda byla porovnána s kultivační metodou ke stanovení citlivosti základní řady antituberkulotik. Pro M. tuberculosis komplex byla použita metoda minimálních inhibičních koncentrací. Obrázek Znázornění průběhu testovaných klinických materiálů 4
5 Legenda: AccuProbe detekční souprava; HAIN CM, AS detekční soupravy GenoType ; L-J půda Löwenstein-Jensenova; MGIT půda Mycobacteria Growth Indicator Tube; MIC metoda minimální inhibiční koncentrace; NK nukleová kyselina Poslední třetí molekulárně biologická metoda Anyplex TM II MTB/MDR/XDR Detection byla použita ke stanovení kmenů MDR-TB a XDR-TB. Testované vzorky byly použity z archivovaných vykultivovaných kultur Mycobacterium tuberculosis získaných z pracovišť Oddělení klinické mikrobiologie Thomayerovy nemocnice v Praze a z Centra klinických laboratoří Zdravotního ústavu v Ostravě. Metoda Anyplex TM II MTB/MDR/XDR Detection byla porovnána s kultivační metodou ke stanovení citlivosti antituberkulotik. Pro stanovení citlivosti základní řady antituberkulotik u M. tuberculosis komplex byla použita metoda minimálních inhibičních koncentrací. Pro stanovení rozšířené citlivosti na antituberkulotika byly kmeny testovány v Národní referenční laboratoři pro mykobakterie ve Státním zdravotním ústavu v Praze. Celkové schéma práce znázorňuje Obrázek. 5
6 3 Výsledky 3.1 Klinický materiál Vzorky testované na MTB a NTM, metoda Anyplex TM plus MTB/NTM Detection, mikroskopie a kultivace Celkem bylo vyšetřeno kultivací a molekulárně biologickou metodou 1521 vzorků. Vzhledem k tomu, že se neprovádělo mikroskopické vyšetření u vzorků močí a laryngálních výtěrů, bylo mikroskopií vyšetřeno pouze 1464 vzorků. Vlivem občasné kontaminace některých vzorků v některých metodách nebylo možné zahrnout tyto kontaminované vzorky do porovnání těchto metod. Největší zastoupení klinických vzorků tvořil materiál získaný z dýchacího systému, zejména sputum s celkovým zastoupením 50,8 % a materiál z dolních cest dýchacích 25,8 % (bronchoalveolární laváže, aspiráty, odsátí, sekret). Dále byly testovány tkáně (převážně plicní ložiska, uzliny), punktáty, moč, výtěry z laryngu, hrudní výpotky, stěry, sekrety, likvor, žaludeční laváž a jiné materiály (obsah abscesu, hnis, atd.) Vzorky testované na MDR-TB, metoda Anyplex TM plus MDR-TB Detection a metoda MIC Při testování MDR-TB bylo otestováno celkem 64 rutinně získaných klinický vzorků z obou výše uvedených pracovišť a 5 vzorků bylo získaných z Národní referenční laboratoře pro mykobakterie, SZÚ Praha. Vzorky byly testované v období od ledna do prosince roku Vzorky byly současně otestovány kultivační metodou minimální inhibiční koncentrace pro stanovení citlivosti na antituberkulotika. Nejčastějším klinickým vzorkem bylo sputum (63,8 %), dále jiné materiály (obsah abscesu, obsah břišního drénu, ložisko, katetry, hnis, gynekologický materiál, atd.) byly zastoupeny (v 13,0 %), tkáně (7,3 %), materiály z dolních cest dýchacích (5,8 %), punktáty (2,9 %) a hrudní výpotek, stěr, sekret, likvor a žaludeční laváž v 1,5 %. 6
7 3.1.3 Vzorky testované na MDR/XDR, metoda Anyplex TM II MTB/MDR/XDR Detection a metoda MIC Molekulárně biologickou metodou Anyplex TM II MTB/MDR/XDR Detection a současně fenotypovým stanovením metodou MIC bylo celkem otestováno 47 vykultivovaných archivovaných kultur Mycobacterium tuberculosis. Fenotypové stanovení citlivosti u části kmenů bylo stanoveno již před použitím molekulárně biologické metody. U některých kmenů citlivých na základní řadu antituberkulotik již nebylo provedeno rozšířené stanovení citlivosti na fluorochinolony a injekční léčiva. 3.2 Porovnání molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MTB/NTM Detection, mikroskopie a kultivačních metod při detekci M. tuberculosis a atypických mykobakterií z klinického materiálu Byly porovnány mikroskopie a molekulárně biologická metoda k detekci M. tuberculosis a atypických mykobakterií s kultivačními metodami. Jako kultivační metody byly použity tzv. metabolická kultivační metoda MGIT a klasické kultivační metody (na půdách Löwenstein-Jensenově, Ogawově nebo tekuté půdě Šulově) Porovnání mikroskopie a metabolické kultivační metody MGIT Při porovnání mikroskopie s metabolickou kultivační metodou MGIT bylo otestováno celkem 1330 klinických vzorků. Došlo k vzájemné pozitivní shodě obou metod u 113 vzorků a k negativní shodě u 1100 vzorků. U 26 vzorků byla pozitivní mikroskopie a negativní MGIT. Naopak u 91 vzorků byla negativní mikroskopie a pozitivní metabolická kultivační metoda. Zjištěné hodnoty senzitivity vyjadřují, že mikroskopie zachytila pouze 55,4 % pozitivních výsledků detekovaných metodou MGIT. Hodnoty specificity vyjadřují, že mikroskopie zachytila v 97,7 % negativní výsledek shodně s kultivační metodou MGIT. 7
8 3.2.2 Porovnání mikroskopie s klasickými kultivačními metodami Při porovnání mikroskopie s klasickými kultivačními metodami bylo vyšetřeno 1363 vzorků. Došlo k vzájemné pozitivní shodě obou metod u 115 vzorků a k negativní shodě u 1139 vzorků. U 35 vzorků byla pozitivní mikroskopie a negativní kultivační metoda. U 74 vzorků byla negativní mikroskopie a pozitivní kultivační metoda. Zjištěné hodnoty senzitivity vyjadřují, že mikroskopie zachytila pouze 60,9 % případů pozitivních výsledků detekovaných klasickými kultivačními metodami. Hodnoty specificity vyjadřují, že mikroskopie zachytila v 97,0 % negativní výsledek shodně s klasickými kultivačními metodami Porovnání molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MTB/NTM Detection a metabolické kultivační metody MGIT Při porovnání molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MTB/NTM Detection a MGIT bylo vyšetřeno celkem 1384 klinických vzorků. Do porovnání nebyly zahrnuty vzorky, které byly kontaminovány v průběhu kultivace. Výsledky pro M. tuberculosis (MTB) a pro atypické mykobakterie (NTM) byly porovnány odděleně. Při porovnání výsledků detekce MTB molekulárně biologickou metodou a MGIT došlo k vzájemné pozitivní shodě obou metod u 94 vzorků a k negativní shodě u 1125 vzorků. U 20 vzorků byla pozitivní molekulárně biologická metoda a negativní metabolická kultivace. U 15 vzorků byla negativní molekulárně biologická metoda a pozitivní metabolická kultivace. Hodnoty senzitivity vyjadřují, že molekulárně biologické metoda Anyplex TM plus MTB/NTM Detection zachytila MTB v 86,2 % pozitivních výsledků detekovaných metodou MGIT. Hodnoty specificity vyjadřují, že molekulárně biologické metoda Anyplex TM plus MTB/NTM Detection zachytila v 98,3 % negativní výsledek na MTB shodně s kultivační metodou MGIT. Při porovnání detekce NTM molekulárně biologickou metodou a metabolickou kultivací došlo k vzájemné pozitivní shodě obou metod u 36 vzorků a k negativní shodě u 1125 vzorků. U 5 vzorků byla pozitivní molekulárně biologická metoda a negativní metabolická kultivace. U 59 vzorků byla negativní molekulárně biologická metoda a 8
9 pozitivní metabolická kultivace. Tyto hodnoty senzitivity vyjadřují, že molekulárně biologické metoda Anyplex TM plus MTB/NTM Detection zachytila NTM v 37,9 % pozitivních případech výsledků detekovaných metodou MGIT. Hodnoty specificity vyjadřují, že molekulárně biologické metoda Anyplex TM plus MTB/NTM Detection zachytila v 99,6 % negativní výsledek na NTM shodně s metodou MGIT Porovnání molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MTB/NTM Detection a klasické kultivace mykobakterií Při porovnání molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MTB/NTM Detection s klasickou kultivací mykobakterií na pevných půdách Löwenstein- Jensenově, Ogawově a v tekuté Šulově půdě bylo vyšetřeno celkem 1419 klinických vzorků. Do porovnání nebylo zahrnuto 110 vzorků, které byly kontaminovány v průběhu kultivace. Výsledky pro M. tuberculosis (MTB) a pro atypické mykobakterie (NTM) byly porovnány odděleně. Při porovnání obou metod na detekci MTB došlo k vzájemné pozitivní shodě u 97 vzorků a k negativní shodě u 1170 vzorků. U 25 vzorků byla pozitivní molekulárně biologická metoda a negativní kultivace. U 17 vzorků byla negativní molekulárně biologická metoda a pozitivní kultivace. Tyto hodnoty senzitivity vyjadřují, že molekulárně biologické metoda Anyplex TM plus MTB/NTM Detection zachytila MTB v 85,1 % pozitivních případech výsledků detekovaných kultivační metodou. Hodnoty specificity vyjadřují, že molekulárně biologické metoda Anyplex TM plus MTB/NTM Detection zachytila v 97,9 % negativní výsledek na MTB shodně s kultivační metodou. Při hodnocení diagnostiky NTM molekulárně biologickou metodou a kultivací došlo k vzájemné pozitivní shodě obou metod u 34 vzorků a k negativní shodě u 1170 vzorků. U 6 vzorků byla pozitivní molekulárně biologická metoda a negativní kultivace. U 44 vzorků byla negativní molekulárně biologická metoda a pozitivní kultivace. Tyto hodnoty senzitivity vyjadřují, že molekulárně biologické metoda Anyplex TM plus MTB/NTM Detection zachytila NTM v 43,6 % pozitivních případech výsledků detekovaných kultivační metodou. Hodnoty specificity vyjadřují, že 9
10 molekulárně biologické metoda Anyplex TM v 99,5 % negativní výsledek na NTM shodně s kultivační metodou. plus MTB/NTM Detection zachytila 3.3 Porovnání molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MDR-TB Detection pro detekci rezistence M. tuberculosis na rifampicin a isoniazid s kultivačním stanovením rezistence (MIC) z přímého klinického materiálu Při tomto porovnání byly použity pouze pozitivní amplifikační produkty na Mycobacterium tuberculosis získané z Anyplex TM 10 plus MTB/NTM Detection molekulárně biologické metody. Tato metoda určovala u Mycobacterium tuberculosis genetickou rezistenci na isoniazid a rifampicin. Získané výsledky molekulárně biologické metody byly porovnány s fenotypovým stanovením rezistence v kultivačních médiích s antituberkulotiky metodou minimálních inhibičních koncentrací (MIC). Z celkového počtu 69 testovaných vzorků se nepodařilo 3 vzorky vykultivovat pravděpodobně z důvodu špatné nebo žádné životaschopnosti mykobakterií. U zbylých 66 testovaných vzorů došlo ke stoprocentní shodě výsledků molekulárně biologické metody s fenotypovým stanovením rezistence u mykobakterií v kultivačním médiu s danými antituberkulotiky INH a RIF. U 59 testovaných kmenů se jednalo o kmeny citlivé na rifampicin a isoniazid. U 7 testovaných vzorků byla zaznamenána rezistence na alespoň jedno antituberkulotikum. Ve 4 případech se jednalo o monorezistentní kmeny, a to u 1 vzorku na rifampicin a ve 3 vzorcích na isoniazid. U 3 vzorků byla detekována rezistence na rifampicin a isoniazid. V 6 případech (9,1 %) došlo k inhibici vnitřní kontroly molekulárně biologické metody a bylo nutné test zopakovat. Počáteční množství DNA bylo nutné naředit v poměru 1:20 v destilované vodě bez RNA-áz a následně byl znovu proveden test pomocí Anyplex TM plus MTB/NTM Detection a následně i test Anyplex TM plus MDR- TB Detection. Získané výsledky po zopakování molekulárně biologické metody byly ve shodě s fenotypovým stanovením citlivosti na antituberkulotika. V jednom případě nebyl výsledek molekulárně biologické metody zcela jednoznačný, kdy vykazoval rezistenci k isoniazidu. Pro tento vzorek byla kultivační metodou stanovena senzitivita k isoniazidu s hodnotou MIC 0,125 mg/ml. Tento vzorek byl molekulárně biologickým testem zopakován s výsledkem senzitivní k isoniazidu.
11 3.4 Porovnání molekulárně biologické metody pro detekci MDR a XDR kmenů M. tuberculosis Anyplex TM II MTB/MDR/XDR Detection s fenotypovým stanovením rezistence (MIC) u již vykultivovaných kmenů Při porovnání detekce MDR a XDR kmenů Mycobacterium tuberculosis molekulárně biologickou metodou Anyplex TM MTB/MDR/XDR Detection s fenotypovým stanovením metodou MIC bylo celkem otestováno 47 vykultivovaných kultur. Znázornění rezistentních výsledků získaných molekulárně biologickou metodou a kultivační metodou pro stanovení citlivosti na antituberkulotika. Podle molekulárně biologické metody bylo 25 testovaných kmenů citlivých k antituberkulotikům základní řady, isoniazidu, rifampicinu, ethambutholu a streptomycinu. To odpovídá 53,2 % všech testovaných kmenů. Při srovnání s fenotypovou metodou (MIC) došlo u 21 kmenů ke shodě ve stanovení citlivosti na testovaná léčiva. U dvou kmenů byla detekována fenotypová monorezistence na isoniazid, která však nebyla molekulárně biologickou metodou zaznamenána. U dvou kmenů nebylo fenotypové stanovení rezistence provedeno. U 22 testovaných kmenů byla zaznamenána genotypová rezistence na antituberkulotika, což odpovídá 46,8 % z celkového počtu testovaných vzorků. Molekulárně biologickou metodou bylo zjištěno 6 monorezistentních kmenů. Ve dvou případech se jednalo o rezistenci na rifampicin a ve čtyřech případech o rezistenci na isoniazid. V porovnání s fenotypovým stanovením došlo v případě těchto 6 monorezistetních kmenů pětkrát ke shodě a jednou k neshodě, kdy fenotypovým stanovením byla detekována rezistence na rifampicin i na isoniazid, kdežto molekulárně biologická metoda detekovala pouze rezistenci na rifampicin. Genotypovou metodou byly detekovány dva multirezistentní kmeny MDR-TB na rifampicin i isoniazid, což odpovídalo 4,3 % z celkového počtu všech testovaných kmenů genotypovou metodou. V porovnání s fenotypovým stanovením došlo v jednom případě ke shodě, ale ve druhém případě k neshodě, kdy kmen vykazoval pouze rezistenci na rifampicin molekulárně biologickou metodou. Největší četnost (počet 11, 52,4 % z celkového počtu) detekovaných rezistentních kmenů stanovených genetickou metodou vykazovaly kmeny současně 11
12 rezistentní k isoniazidu, rifampicinu a fluorochinolonům. Ve dvou případech došlo k plné shodě s fenotypovým stanovením. Ve dvou případech došlo ke shodě v genotypovém i fenotypovém stanovení rezistence na rifampicin a isoniazid a k neshodě v citlivosti na fluorochinolony, kde molekulárně biologická metoda falešně pozitivně určila rezistenci. V 6 případech byla shoda stanovení rezistence na rifampicin a isoniazid, avšak fenotypová citlivost na fluorochinolony nebyla provedena. V jednom případě byla stanovena shoda genotypové i fenotypové metody rezistence na isoniazid a rifampicin a neshoda pří stanovení rezistence na injekční léčiva, které byly negativní v případě molekulárně biologické metody a pozitivní v případě fenotypové metody. V 1 případě byla současně stanovena genotypovou i fenotypovou metodou rezistence na rifampicin, isoniazid a injekčně podávaná antituberkulotika s rezistencí genu rrs k streptomycinu. Molekulárně biologickou metodou byly detekovány dva kmeny multirezistentní XDR-TB. V obou případech došlo ke shodě genetické a fenotypové metody. Z celkového počtu 20 genově stanovených rezistentních kmenů na isoniazid bylo pozorována v 19 případech rezistence v oblasti katg, ve dvou případech rezistence v oblasti katg i inha a pouze u 1 kmenu byla zaznamenána rezistence pouze v oblasti inha. Ve třech případech všech testovaných vzorků byla molekulárně biologickou metodou stanovena rezistence na injekční léčiva v oblasti rrs. Při genetickém testování všech 47 kmenů metodou Anyplex TM plus MDR-TB Detection nebylo nutné žádný test opakovat z důvodu inhibice vnitřní kontroly. 12
13 4 Závěr Přínosem této práce je prověření využití nové komerční soupravy Anyplex TM plus MTB/NTM Detection k detekci M. tuberculosis a atypických mykobakterií v rutinní laboratorní diagnostice mykobakterií přímo z klinického materiálu jako doplňkové metody ke kultivačnímu stanovení. Výsledky práce ukázaly vysoké hodnoty senzitivity a specificity při detekci MTB zkoumanou molekulárně biologickou metodou. Pro detekci NTM molekulárně biologickou metodou byly výsledky senzitivity nízké. Z tohoto důvodu je stále zapotřebí kultivačních metod, které dokáží atypické mykobakterie zachytit. U všech testovaných vzorků došlo ke stoprocentní shodě výsledků molekulárně biologické metody Anyplex TM plus MDR-TB Detection s fenotypovým stanovením rezistence u mykobakterií kultivovaných v kultivačním médiu s danými antituberkulotiky isoniazidem a rifampicinem. Z tohoto důvodu je metoda výborným a velice rychlým detekčním systémem vhodným pro vyhledávací skreening MDR kmenů M. tuberculosis z přímého klinického materiálu pro klinickou laboratorní diagnostiku, který umožní rychlé zahájení adekvátní léčby tuberkulózy. Molekulárně biologická metoda Anyplex TM II MTB/MDR/XDR Detection vykazovala vysokou úspěšnost při genetickém stanovení rezistence u kmenů MDR-TB a XDR-TB M. tuberculosis. Metoda může být použita pro rutinní laboratorní mykobakteriologickou diagnostiku, která urychlí nasazení adekvátní terapie tuberkulózy. V případech výskytu méně časté oblasti rezistence na dané antituberkulotikum, na které nejsou navrženy genetické sondy testu, nebo při výskytu nových genů na rezistenci na dané antituberkulotikum nebo u falešně pozitivního výsledku, který může mít velký negativní dopad po stránce léčebné, sociální, ale i po stránce finančních nákladů s léčbou spojených, je stanovení citlivost na antituberkulotika fenotypovou metodou stále nepostradatelné. 13
14 Přínosem této práce je: Rozšíření diagnostického spektra pomocí rychlé molekulárně biologické metody i o méně častou oblast laboratorní diagnostiky, a to o atypické mykobakterie, což je významné zejména z pohledu možnosti zahájení včasné adekvátní léčby a přístupu k pacientovi. Možnost rychlé detekce multirezistentních kmenů M. tuberculosis, která pomáhá klinickým lékařům při rozhodnutí o zahájení adekvátní léčby pacienta, jeho hospitalizaci a způsobu ošetřování. Práce přináší informace o výskytu M. tuberculosis v České republice. V průběhu práce byly identifikovány rezistentní kmeny M. tuberculosis na antituberkulotika, které testované metody nedokázaly správně detekovat. Tyto kmeny mohou být využity při dalším rozšiřování schopností testovaných metod. 14
15 5 Souhrn Tuberkulóza je celosvětově se vyskytující onemocnění s vysokou morbiditou. Jedním ze základních opatření proti tuberkulóze je včasná a účinná terapie. K tomu je nutná co možná nejrychlejší a nejpřesnější diagnostika. V současné době se stále více v laboratorní diagnostice tuberkulózy používají molekulárně biologické metody. Kmeny Mycobacterium tuberculosis komplex jsou často spojeny s tuberkulózou v rozvojových zemích, zatímco mykobakteriózy se nalézají především v rozvinutých zemích. Vzhledem k tomu, že mnoho druhů atypických mykobakterií má sníženou citlivost vůči klasicky používaným antibiotikům, je léčba mykobakterióz zdlouhavá a často dochází k jejich recidivám. Z tohoto důvodu je rychlejší a přesnější diferenciální diagnostika mykobakteriálních infekcí velmi důležitá. Současnou globální hrozbu představují lékově rezistentní kmeny Mycobacterium tuberculosis (MTB). Rozlišujeme multirezistentní kmeny MTB (MDR-TB), které jsou definovány jako rezistentní nejméně ke dvěma antituberkulotikům, rifampicinu a isoniazidu, a extenzivně rezistentní kmeny MTB (XDR-TB), které jsou kromě rifampicinu a isoniazidu také rezistentní na fluorochinolony a nejméně na jedno ze tří injekčních léčiv, jako je kanamycin, capreomycin a amikacin. Terapeutické možnosti pro pacienty, kteří jsou infikováni kmeny MDR-TB a XDR-TB, jsou omezené a léčba se čtyřmi nebo více antituberkulotiky je velice zdlouhavá. Tato práce byla zaměřena na laboratorní diagnostiku M. tuberculosis a atypických mykobakterií a testování citlivosti na antituberkulotika pomocí molekulárně biologických metod. Cílem této práce bylo ověření molekulárně biologických metod ve snaze o zrychlení laboratorní diagnostiky používané v rutinní praxi. 15
16 6 Summary Tuberculosis is a globally-occurring disease with high morbidity. One of the fundamental measures against tuberculosis is an early and effective therapy. To accomplish it, an accurate and fast diagnostics is required. Nowadays more and more molecular biological methods are used in the laboratory diagnostics of tuberculosis. The strains of Mycobacterium tuberculosis complex are often associated with tuberculosis in developing countries, while mycobacteriosis are found primarily in developed countries. Given that many types of atypical mycobacteria have reduced sensitivity to classically used antibiotics, the treatment of mycobacteriosis is lengthy and often causes relapses. For this reason, faster and more accurate differential diagnostics of mycobacterial infections is very important. The current global threat represent the drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis (MTB). We distinguish multiresistant strains of MTB (MDR-TB) that are defined as resistant to at least two antituberculotics, rifampicin and isoniazid, and extensively resistant strains of MTB (XDR-TB) that are in addition to rifampicin and isoniazid also resistant to fluoroquinolones and at least one of three injectable drugs, such as kanamycin, amikacin and capreomycin. Therapeutic options for patients who are infected by strains of MDR-TB and XDR-TB are limited and treatment with four or more antitubercular drugs are very lengthy. This work is focused on laboratory diagnostics of M. tuberculosis and atypical mycobacteria and susceptibility testing on antitubercular drugs with usage of molecular biological methods. The aim of this study was to validate molecular biological techniques in an attempt to speed up laboratory diagnostics used in routine practice. 16
17 7 Seznam vlastní odborné a publikační činnosti vztahující se k tématu disertační práce 2013 Konference, Biovendor a.s., Využití rychlé detekce Mycobacterium tuberculosis v praxi, Čermák P., Coufalová, M., Jechová E., (přednáška) 2014 Coufalová M., Polcová V., Vašáková M., Smetana J., Čermák P., Němečková V.: Ojedinělý případ izolovaného výskytu Mycobacterium tuberculosis v perikardiálním výpotku, Epidemiologie Mikrobiologie Imunologie 63, 2014, č. 4, s Seminář Společnosti pro lékařskou mikrobiologii ČLS JEP, Coufalová M.: Detekce multirezistentních kmenů TBC molekulárně biologickými metodami, (přednáška) 17
Úskalí kontroly a dohledu nad TBC ve vězeňském systému
Úskalí kontroly a dohledu nad TBC ve vězeňském systému osobní zkušenosti laboratorního pracovníka z projektu Lékařů bez hranic v Kyrgyzstánu Mgr. Markéta Hajná, Ph.D. Nemocnice Strakonice, a.s.-centrální
VíceAplikace molekulárně biologických postupů v časné detekci sepse
Aplikace molekulárně biologických postupů v časné detekci sepse Mgr. Jana Ždychová, Ph.D. IKEM PLM - LLG Sepse je častou příčinou úmrtí během hospitalizace. Včasné nasazení odpovídající ATB terapie je
VíceMUDr. Wezdenková Kateřina Laboratoře Mikrochem a.s. Šumperk
MUDr. Wezdenková Kateřina Laboratoře Mikrochem a.s. Šumperk MYKOBAKTERIÁLNÍ INFEKCE Společné vlastnosti mykobakterií a) nepohyblivé, nesporulující, většinou štíhlé tyčinky b) nebarvící se dle Grama, barvíme
VíceAutomatizace v klinické mikrobiologii
Automatizace v klinické mikrobiologii 1Jaroslav Hrabák, 2Pavel Dřevínek 1Ústav mikrobiologie, Biomedicínské centrum, Lékařská fakulta a Fakultní nemocnice v Plzni, Univerzita Karlova 2Ústav lékařské mikrobiologie,
VíceZákladní přehled epidemiologické situace ve výskytu tuberkulózy v České republice v roce 2016
Centrum pro rozvoj technologické platformy registrů Národního zdravotnického informačního systému, modernizace vytěžování jejich obsahu a rozšíření jejich informační kapacity. Rozvoj technologické platformy
VíceNové technologie v mikrobiologické diagnostice a jejich přínos pro pacienty v intenzivní péči
B I O M E D I C AL Nové technologie v mikrobiologické diagnostice a jejich přínos pro pacienty v intenzivní péči Jaroslav Hrabák CHARLES UNIVERSITY IN PRAGUE Obsah prezentace ČSIM 2016 Mikrobiologická
VíceDiagnostická laboratoř Praha. Laboratorní příručka Příloha č.1. Přehled vyšetření prováděných v Laboratoři klinické mikrobiologie
Strana č: 1 Kultivační vyšetření výtěrů z horních cest dýchacích Kultivační vyšetření materiálu z dolních cest dýchacích (mimo TBC) B01/LKM B06/LKM B02/LKM Kultivační semikvantitativní vyšetření moče Typ
VíceZákladní přehled epidemiologické situace ve výskytu tuberkulózy v České republice v roce 2015
Centrum pro rozvoj technologické platformy registrů Národního zdravotnického informačního systému, modernizace vytěžování jejich obsahu a rozšíření jejich informační kapacity. Rozvoj technologické platformy
VíceZákladní přehled epidemiologické situace ve výskytu tuberkulózy v České republice v roce 2017
Centrum pro rozvoj technologické platformy registrů Národního zdravotnického informačního systému, modernizace vytěžování jejich obsahu a rozšíření jejich informační kapacity. Rozvoj technologické platformy
VíceNové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku
B I O M E D I C AL Nové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku Jaroslav Hrabák CHARLES UNIVERSITY Obsah prezentace Historie, vývoj a trendy
VíceVýroční zpráva o mykobakteriologické diagnostice v České republice v roce 2006
Acta hygienica, epidemiologica et microbiologica Číslo 2/2007 Výroční zpráva o mykobakteriologické diagnostice v České republice v roce 2006 Praha, říjen 2007 Předseda redakční rady: doc. MUDr. L. Komárek,
VíceZávěrečná zpráva. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Poskytovatel programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA podle ČSN EN ISO/IEC 17043, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady
VíceVýskyt tuberkulózy v České republice v roce 2012. Incidence of tuberculosis in the Czech Republic in 2012
Aktuální informace Ústavu zdravotnických informací a statistiky České republiky Praha 1. 7. 2013 21 Souhrn Výskyt tuberkulózy v České republice v roce 2012 Incidence of tuberculosis in the Czech Republic
VíceOdběr a transport biologického materiálu do mikrobiologické laboratoře. Jana Juránková OKM FN Brno
Odběr a transport biologického materiálu do mikrobiologické laboratoře Jana Juránková OKM FN Brno Správný výsledek mikrobiologického vyšetření začíná správným odběrem biologického materiálu a jeho správným
VíceVýskyt tuberkulózy v České republice v roce 2013. Incidence of tuberculosis in the Czech Republic in 2013
Aktuální informace Ústavu zdravotnických informací a statistiky České republiky Praha 19. 11. 2014 30 Souhrn Výskyt tuberkulózy v České republice v roce 2013 Incidence of tuberculosis in the Czech Republic
VíceInterpretace výsledků bakteriologických vyšetření
Interpretace výsledků bakteriologických vyšetření Veškeré nálezy vyšetření je nutno hodnotit vzhledem k diagnóze, věku, zánětlivým parametrům, klinickému stavu pacienta, ev. k dalším důležitým anamnestickým
VíceSOUČASNÉ KLINICKÉ OBRAZY TUBERKULÓZY. POHLED PNEUMOLOGA. Martina Vašáková Pneumologická klinika 1. LF UK, Thomayerova nemocnice Praha
SOUČASNÉ KLINICKÉ OBRAZY TUBERKULÓZY. POHLED PNEUMOLOGA. Martina Vašáková Pneumologická klinika 1. LF UK, Thomayerova nemocnice Praha Tuberkulóza a historie TB- provází lidstvo po celou dobu jeho historického
VíceVýskyt tuberkulózy v České republice v roce Incidence of tuberculosis in the Czech Republic in 2011
Aktuální informace Ústavu zdravotnických informací a statistiky České republiky Praha 21. 8. 2012 35 Souhrn Výskyt tuberkulózy v České republice v roce 2011 Incidence of tuberculosis in the Czech Republic
VíceKontakt Telefon: 485 313 020 Služba : 485 313 033 ATB : 485 313 029
Klinický materiál odeslaný do laboratoře je zpracován dle standardních postupů (SOP) a vyšetření je kódováno dle sazebníku zdravotnických. O dalším vyšetřovacím postupu rozhoduje lékař se specializovanou
VíceDIAGNOSTIKA INFEKČNÍCH CHOROB KULTIVACE V LABORATORNÍCH PODMÍNKÁCH
STŘEDNÍ ZDRAVOTNICKÁ ŠKOLA A VYŠŠÍ ODBORNÁ ŠKOLA ZDRAVOTNICKÁ ŽĎÁR NAD SÁZAVOU DIAGNOSTIKA INFEKČNÍCH CHOROB KULTIVACE V LABORATORNÍCH PODMÍNKÁCH MGR. IVA COUFALOVÁ DIAGNOSTIKA INFEKČNÍCH CHOROB KULTIVACE
VíceZávěrečná zpráva. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Poskytovatel programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA podle ČSN EN ISO/IEC 17043, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady
VíceZávěrečná zpráva. PT#M/1/2019(č. 1055) MYKOBAKTERIE izolace a identifikace. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Poskytovatel programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA podle ČSN EN ISO/IEC 17043, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady
VíceVýroční zpráva o mykobakteriologické diagnostice v České republice v roce 2005
Acta hygienica, epidemiologica et microbiologica Číslo 4/2006 Výroční zpráva o mykobakteriologické diagnostice v České republice v roce 2005 Praha, listopad 2006 Předseda redakční rady: doc. MUDr. L. Komárek,
VíceExterní kontrola kvality sekvenačních analýz
Externí kontrola kvality sekvenačních analýz Radka Bolehovská 1, Lenka Plíšková 2, Kateřina Hrochová 2 Úsek molekulární biologie, 1 Ústav klinické mikrobiologie 2 Ústav klinické biochemie a diagnostiky
VíceVyšetření: 1. Kvantitativní stanovení látkové koncentrace kyseliny močové [Kyselina močová] fotometricky
Vyšetření: 801 - Klinická biochemie 1. Kvantitativní stanovení kyseliny močové [Kyselina močová] SOPV-OKL/B-02 2. Kvantitativní stanovení SOPV-OKL/B-05 močoviny [Urea] 3. Kvantitativní stanovení SOPV-OKL/B-09
VíceDiagnostické metody v lékařské mikrobiologii
Diagnostické metody v lékařské mikrobiologii Výuková prezentace z: Lékařské mikrobiologie Jan Smíšek ÚLM 3. LF UK 2009 Princip identifikace Soubor znaků s rozdílnou diskriminační hodnotou Základní problémy
VíceZávěrečná zpráva. PT#M/1/2017(č.955) MYKOBAKTERIE izolace a identifikace. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Poskytovatel programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA podle ČSN EN ISO/IEC 17043, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady
VíceDiagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení
Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení Mgr. Klára Vilimovská Dědečková, Ph.D. Synlab genetics s.r.o. Molekulární
VíceVýroční zpráva o mykobakteriologické diagnostice v České a Slovenské republice v roce 2004
Acta hygienica, epidemiologica et microbiologica Číslo 4/2005 Výroční zpráva o mykobakteriologické diagnostice v České a Slovenské republice v roce 2004 Praha, listopad 2005 Předseda redakční rady: doc.
VícePříloha č.5 Seznam PCR vyšetření
Příloha č.5 Seznam PCR vyšetření Obsah Virus hepatitidy B - kvalitativní průkaz... 2 Virus hepatitidy B - kvantita... 2 Virus hepatitidy C kvalitativní průkaz... 3 Virus hepatitidy C - kvantita... 3 Virus
VíceMIKROBIOLOGICKÁ LABORATOŘ NEMOCNICE ŠUMPERK
Objednávající lékař (oddělení): Objednal: Pracoviště: Datum objednání: Objed. číslo Odběrová souprava Kusů Urogenitální mykoplazmata transportní médium Doporučujeme v kombinaci s 1672 nebo 1656 (stěr před
VíceTUBERKULÓZA (TB) A LATENTNÍ TUBERKULÓZNÍ INFEKCE (LTBI) U PACIENTŮ PŘED A PO TRANSPLANTACI SOLIDNÍCH ORGÁNŮ ČI HEMATOPOETICKÝCH KMENOVÝCH BUNĚK
TUBERKULÓZA (TB) A LATENTNÍ TUBERKULÓZNÍ INFEKCE (LTBI) U PACIENTŮ PŘED A PO TRANSPLANTACI SOLIDNÍCH ORGÁNŮ ČI HEMATOPOETICKÝCH KMENOVÝCH BUNĚK (Doporučený postup diagnostiky a léčby) [KAP. 4.5] Sekce
VíceOdběr a transport biologického materiálu do mikrobiologické laboratoře. Jana Juránková OKM FN Brno
Odběr a transport biologického materiálu do mikrobiologické laboratoře Jana Juránková OKM FN Brno Specifika odběrů pro bakteriologická vyšetření Správný výsledek mikrobiologického vyšetření začíná správným
VíceTisková zpráva závěrečné zprávy projektu
Tisková zpráva závěrečné zprávy projektu QJ1210119 Vývoj a výroba veterinárních setů pro stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek standardizovanou mikrodiluční metodou a nový
VíceTuberkulóza vzniklá z nejlepších úmyslů
Tuberkulóza vzniklá z nejlepších úmyslů Lacina L. 1, Kozmová K. 1, Dryák P. 2, Pauk N. 1 1) Klinika pneumologie a hrudní chirurgie, Nemocnice Na Bulovce 2) Oddělení mikrobiologie, Nemocnice Na Bulovce
VíceVyužití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči. Marek Protuš
Využití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči Marek Protuš Sepsis - 3 Sepse je definovaná jako život ohrožující orgánová dysfunkce způsobená dysregulovanou odpovědí
VíceVyužití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči. Marek Protuš
Využití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči Marek Protuš Sepsis - 3 Sepse je definovaná jako život ohrožující orgánová dysfunkce způsobená dysregulovanou odpovědí
VícePavel Čermák. Thomayerova nemocnice Praha - Krč. 14.2.2013 výroční zasedání SLM
Pavel Čermák Thomayerova nemocnice Praha - Krč Úkoly na rok 2012 Vytvoření seznamu přístrojů Doplnění podkladů pro kalkulaci Možná úprava některých stávajících výkonů?? Revize pracovních časů u všech výkonů
VíceZávažná onemocnění způsobená Haemophilus influenzae v České republice v období
ZPRÁVY CENTRA EPIDEMIOLOGIE A MIKROBIOLOGIE (SZÚ, PRAHA) 2017; 26(5) INFORMACE Z NRL A ODBORNÝCH PRACOVIŠŤ CEM INFORMATION FROM THE NRL AND RESEARCH GROUPS OF THE CEM Závažná onemocnění způsobená Haemophilus
VíceVÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII
VÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII Plíšková L., Hrochová K., Kutová R. Ústav klinické biochemie a diagnostiky FN Hradec Králové PREANALYTICKÁ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII
VíceEXTERNÍ HODNOCENÍ KVALITY PT#M/1/2018, EHK Mykobakterie izolace a identifikace
Vzorky obsahují patogenní a podmíněně patogenní mikroorganizmy. Při manipulaci s materiálem je tedy nezbytné zachovávat všechny zásady bezpečné laboratorní praxe pro práci s těmito činiteli, včetně správné
VíceANTIBIOTICKÉ LÉČBY V INTENZIVNÍ MEDICÍNĚ
PRINCIPY ANTIBIOTICKÉ LÉČBY V INTENZIVNÍ MEDICÍNĚ Milan Kolář Ústav mikrobiologie Fakultní nemocnice Olomouc Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci Bakteriální infekce byly, jsou a s velkou pravděpodobností
VíceZávěrečná zpráva. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality) PT#M/32/2010 (č. 677) Identifikace herpetických virů
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Organizátor programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady Závěrečná zpráva Zkoušení
VíceDY D NE N X Hana Vlastníková
DYNEX Hana Vlastníková Molekulární biologie: Vybavení laboratoře na klíč Přístrojová technika Kompatibilní diagnostické soupravy Profesionální přístup SOP Technická podpora Servis Přístrojové vybavení:
VíceFunkční vzorek 5454/2017. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u Pseudomonas spp.
Funkční vzorek 5454/2017 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Pseudomonas spp. Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního lékařství,
VíceK čemu slouží záznam provedených výkonů logbook?
K čemu slouží záznam provedených výkonů logbook? Předkládaný Záznam provedených výkonů ve specializačním vzdělávání neboli logbook je součástí vzdělávacího programu a slouží k evidenci průběhu odborné
VíceLÉČBA VENTILÁTOROVÉ PNEUMONIE SPOLUPRÁCE INTENZIVISTY A MIKROBIOLOGA
LÉČBA VENTILÁTOROVÉ PNEUMONIE SPOLUPRÁCE INTENZIVISTY A MIKROBIOLOGA Chytra I 1., Bergerová T 2. ARK FN v Plzeň 1 Ústav mikrobiologie, FN Plzeň 2 VAP definice, rozdělení spolupráce intenzivisty a mikrobiologa
Více1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně
Obsah Předmluvy 1. Definice a historie oboru molekulární medicína 1.1. Historie molekulární medicíny 2. Základní principy molekulární biologie 2.1. Historie molekulární biologie 2.2. DNA a chromozomy 2.3.
VícePCT kontrolovaná ATB terapie nosokomiální pneumonie ventilovaných nemocných
PCT kontrolovaná ATB terapie nosokomiální pneumonie ventilovaných nemocných Pavel Dostál Klinika anesteziologie, resuscitace a intenzivní medicíny Univerzita Karlova v Praze, Lékařská fakulta v Hradci
VíceLaboratorní di agnostik HBV HCV a Vratislav Němeček Státní zdravotní stav ústav
Laboratorní diagnostika HBV a HCV Vratislav Němeček Státní zdravotní ústav Rozdílná role sexuálního 30 přenosu HBV a HCV 25 Rozdíly v četnosti virové nálože 20 15 10 HCV RNA HBV DNA HBV 5 hlavní způsoby
VíceFakultní nemocnice Brno Laboratoře Oddělení klinické mikrobiologie Jihlavská 20, Brno
Vyšetření: 802 - Lékařská mikrobiologie, 804 Lékařská parazitologie, 805 Lékařská virologie, 822 Lékařská mykologie 1. Vyšetření mikroorganismů z klinického materiálu a z kultur mikroskopicky - barvený
VíceZávažná onemocnění způsobená Haemophilus influenzae v České republice v období
Závažná onemocnění způsobená Haemophilus influenzae v České republice v období 2009 2015 Invasive Haemophilus influenzae disease in the Czech Republic in 2009-2015 Věra Lebedová, Helena Šebestová, Pavla
VíceFunkční vzorek 5456/2017. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u Enterococcus spp.
Funkční vzorek 5456/2017 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Enterococcus spp. Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního lékařství,
VíceTéměř polovina Evropanů se mylně domnívá, že antibiotika působí proti nachlazení a chřipce
TISKOVÁ ZPRÁVA 18. 11. 2014 Téměř polovina Evropanů se mylně domnívá, že antibiotika působí proti nachlazení a chřipce U příležitosti již sedmého Evropského antibiotického dne, který se koná každoročně
VíceEUC Laboratoře s.r.o. EUC Laboratoře Praha Palackého 720/5, Praha 1
Pracoviště zdravotnické laboratoře:. Laboratoř biochemická a hematologická Palackého 70/5, 0 00 Praha. Laboratoř biochemická a hematologická Sokolovská /55,80 00 Praha 8. Laboratoř imunologická a alergologická
VíceZpracovaly pracovnice KHS Stč. kraje: MUDr. Markéta Korcinová, vedoucí protiepidemického odboru Kateřina Jedličková, referentka protiepidemického
Zpracovaly pracovnice KHS Stč. kraje: MUDr. Markéta Korcinová, vedoucí protiepidemického odboru Kateřina Jedličková, referentka protiepidemického odboru Datum zpracování: 30/04/2011 VÝROČNÍ ZPRÁVA O EPIDEMIOLOGICKÉ
Vícekrku, mandlí, hltanu A kultivační tampon v TPA pokojová teplota, 24 hod. 3 dny Neisseria meningitidis, MRSA - označit na žádance cílené kultivační na
Strana 1 z 5 Výtisk č.2 1) Bakteriologie /N výtěr z nosu, nosohltanu, Corynebacterium diphteriae, krku, mandlí, hltanu kultivační tampon v TP 3 dny Neisseria meningitidis, a hrtanu MRS - označit na žádance
VíceProjekt FR-TI2/075 MPO příklad spolupráce farmaceutů s komerčním sektorem. Milan Bartoš. Forum veterinarium, Brno 2010
Projekt FR-TI2/075 MPO příklad spolupráce farmaceutů s komerčním sektorem Milan Bartoš Forum veterinarium, Brno 2010 Vývoj farmakogenetické diagnostické soupravy pro stanovení genetických polymorfismů
Vícekultivační tampon v TPA pokojová teplota, 24 hod. 3 dny sterilní zkumavka, sterilní 2-8ºC, 18 hod. pokojová teplota, 1 hod. pokojová teplota, 24 hod.
Strana 1 z 5 Výtisk č. 2 1) Bakteriologie výtěr z nosu, krku, nosohlt mandlí, hrtanu a hrtanu výtěr z hrtanu,nosohltanu cílené na Bordetella pertussis a Bordetella parapertussis tampon na drátě v TPA pokojová
VíceANTIBIOTICKÁ LÉČBA OFF-LABEL Z POHLEDU MIKROBIOLOGA. Milan Kolář Ústav mikrobiologie FNOL a LF UP v Olomouci
ANTIBIOTICKÁ LÉČBA OFF-LABEL Z POHLEDU MIKROBIOLOGA Milan Kolář Ústav mikrobiologie FNOL a LF UP v Olomouci Septický pacient s nozokomiální pneumonií Endosekret: KLPN + ESCO Terapie: PPT + GEN INTERPRETACE?
Více- Dynex 407 0,37. 0,23 4 hc2 HR HPV Test Qiagen, - - Dynex 528 9,13. 1,85/1,22 8 hc2 HR HPV Test Qiagen, - - Dynex 696
4. Souhrny výsledků Tabulka č. 2: Přehled výsledků testů uvedených laboratořemi, které používají neamplifikační metody detekce HPV, včetně bodového hodnocení TEST KÓD LAB VZOREK č.1 VZOREK č.2 VZOREK č.3
VíceMikrobiologické vyšetření jako podklad pro racionální cílenou antibiotickou terapii. Význam správné indikace vyšetření a dodržování
Mikrobiologické vyšetření jako podklad pro racionální cílenou antibiotickou terapii. Význam správné indikace vyšetření a dodržování preanalytické fáze Tamara Bergerová Ústav mikrobiologie FN Plzeň Mikrobiologické
VíceFunkční vzorek 5452/2017. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u gramnegativních bakterií II.
Funkční vzorek 5452/2017 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u gramnegativních bakterií II. řada Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního
VícePříloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 33/2018 ze dne:
Pracoviště zdravotnické laboratoře: 1. Pracoviště Olomouc Nezvalova 984/2, 779 00 Olomouc 2. Pracoviště Přerov Čechova 8, 750 02 Přerov 3. Pracoviště Šumperk Nerudova 34, 787 01 Šumperk 4. Pracoviště Valašské
Více4. Souhrny výsledků. LEGENDA chyba detekce - test neumožňuje stanovení LR HPV typů laboratoř získala certifikát
4. Souhrny výsledků Tabulka č.2: Přehled výsledků testů uvedených laboratořemi, které používají neamplifikační metody detekce HPV, včetně bodového hodnocení TEST KÓD LAB VZOREK č.1 VZOREK č.2 VZOREK č.3
VíceZávěrečná zpráva. PT#M/32/2016 (č. 946) Identifikace herpetických virů. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Organizátor programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA Podle ČSN EN ISO/IEC 17043, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady
VícePracovní skupina pro molekulární mikrobiologii TIDE
16.9.2009 Pracovní skupina pro molekulární mikrobiologii TIDE Josef Scharfen NRL pro patogenní aktinomycety Oddělení lékařské mikrobiologie a imunologie Oblastní nemocnice Trutnov, a.s. SEMINÁŘ SLM PSMM
VíceProblematika dialyzovaných pacientů s MRSA
Problematika dialyzovaných pacientů s MRSA Mgr. Irena Stašková Petra Lacinová Dialyzační středisko Praha Homolka B. Braun Avitum s.r.o. MRSA Methicilin rezistentní S. aureus Představuje významnou zdravotní
VíceANTIBIOTICKÉ DISKY Antibiotické disky pro testování citlivosti
ANTIBIOTICKÉ DISKY Antibiotické disky pro testování citlivosti POPIS ANTIBIOTICKÉ DISKY jsou papírové disky se speciálními vlastnostmi, které jsou impregnované antibiotiky a používají se pro testy citlivosti
VíceSARS - Severe Acute Respiratory Syndrome (těžký akutní respirační syndrom).
SARS - Severe Acute Respiratory Syndrome (těžký akutní respirační syndrom). Charakteristika: SARS je závažné respirační onemocnění probíhající převážně jako těžká atypická pneumonie, komplikovaná respirační
VíceIdentifikace postupu vyšetření Lékařská mikrobiologie, 804 Lékařská parazitologie, 805 Lékařská virologie, 822 Laboratoř lékařské mykologie
Pracoviště zdravotnické laboratoře: 1. Pracoviště Olomouc Nezvalova 984/2, 779 00 Olomouc 2. Pracoviště Přerov Čechova 8, 750 02 Přerov 3. Pracoviště Šumperk Nerudova 34, 787 01 Šumperk 4. Pracoviště Valašské
Více1. Pracoviště Olomouc V. Nezvala 984/2, Olomouc. 2. Pracoviště Přerov Čechova 8, Přerov
a.s. Pracoviště zdravotnické laboratoře: 1. Pracoviště Olomouc V. Nezvala 984/2, 779 00 Olomouc 2. Pracoviště Přerov Čechova 8, 750 02 Přerov 3. Pracoviště Šumperk Nerudova 41, 787 01 Šumperk 4. Pracoviště
VíceBakteriologická analýza potravin
Bakteriologická analýza potravin a. Souhrn Ve studii zaměřené na bakteriologickou analýzu potravin jsme sledovali výskyt vybraných patogenních agens v potravinách z tržní sítě. Výběr vyšetřovaných komodit
VíceGenetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.
Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské praxi doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc. Historie forenzní genetiky 1985-1986 Alec Jeffreys a satelitní DNA 1980 Ray
VíceZávěrečná zpráva. PT#M/34/2016 (č. 953) Průkaz DNA HSV a VZV. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Poskytovatel programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA, Podle ČSN EN ISO/IEC 17043, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady
VíceCitlivost a rezistence mikroorganismů na antimikrobiální léčiva
Citlivost a rezistence mikroorganismů na antimikrobiální léčiva Sylva Janovská Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra biologických a biochemických věd Centralizovaný rozvojový projekt
VíceTuberkulóza. MUDr. Drahomíra Rottenbornová. ZDZ-1 Tuberkulóza 1
Tuberkulóza MUDr. Drahomíra Rottenbornová ZDZ-1 Tuberkulóza 1 Tuberkulóza Provází člověka po celou jeho existenci V 19. a do poloviny 20. století byla nejčastější infekční příčinou úmrtí Václav II. 34
VíceMolekulárně biologické metody v mikrobiologii. Mgr. Martina Sittová Jaro 2014
Molekulárně biologické metody v mikrobiologii Mgr. Martina Sittová Jaro 2014 Harmonogram 1. den Izolace DNA 2. den Měření koncentrace DNA spektrofotometricky, real-time PCR 3. den Elektroforéza Molekulární
VíceVERSATREK Lahvičky na testování citlivosti mykobakterií k pyrazinamidu
VERSATREK Lahvičky na testování citlivosti mykobakterií k pyrazinamidu VersaTREK Myco PZA Kit, 7116-70 ZAMÝŠLENÉ POUŽITÍ Souprava VersaTREK Myco PZA je rychlým kvalitativním postupem pro in vitro testování
VíceVzdělávání zdravotních laborantek v oblasti molekulární biologie
Vzdělávání zdravotních laborantek v oblasti molekulární biologie Beránek M., Drastíková M. Ústav klinické biochemie a diagnostiky, Lékařská fakulta UK a Fakultní nemocnice Hradec Králové beranek@lfhk.cuni.cz
VíceDIAGNOSTIKA A MONITOROVÁNÍ INFEKCÍ ZPŮSOBENÉ LIDSKÝMI PAPILLOMAVIRY VYSOCE RIZIKOVÉHO TYPU POMOCÍ REAL TIME PCR
DIAGNOSTIKA A MONITOROVÁNÍ INFEKCÍ ZPŮSOBENÉ LIDSKÝMI PAPILLOMAVIRY VYSOCE RIZIKOVÉHO TYPU POMOCÍ REAL TIME PCR Michaela Kavanová, DiS. tel.: +420 221 985 476 mobil: +420 725 004 523 e-mail: michaela.kavanova@synlab.cz
VíceTuberkulóza. Prof. MUDr. K. Křepela, CSc. Klinika pediatrie IPVZ a 1. LF UK Fakultní Thomayerova nemocnice Praha - Krč
Tuberkulóza Prof. MUDr. K. Křepela, CSc. Klinika pediatrie IPVZ a 1. LF UK Fakultní Thomayerova nemocnice Praha - Krč Robert Koch objevitel bacila TBC 24. 3. 1882 TBC komplex Mycobacterium tuberculosis
VíceExterní hodnocení kvality činnosti mikrobiologických laboratoří v ČR v letech
Externí hodnocení kvality činnosti mikrobiologických laboratoří v ČR v letech 1993 2010 External quality assessment scheme for good clinical microbiology laboratory practice in the Czech Republic in 1993-2010
VíceStátní veterinární ústav Praha. Odd. bakteriologie. Černý Tomáš
Trendy vývoje antimikrobiální rezistence vybraných zoonotických bakterií v České republice v letech 2008-2015 a jejich srovnání s daty publikovanými EFSA Státní veterinární ústav Praha Odd. bakteriologie
VíceTuberkulóza. Ladislav Lacina KPHCH, Nemocnice Na Bulovce, 2017
Tuberkulóza Ladislav Lacina KPHCH, Nemocnice Na Bulovce, 2017 Tuberkulóza Jde o nemoc způsobenou bakterií ze kmene Mycobacterium Tuberculosis complex (skupina druhů mající alespoň 95% shodu s M.Tuberculosis)
VíceFunkční vzorek 4595/2018. Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních. látek u Streptococcus suis
Funkční vzorek 4595/2018 Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Streptococcus suis Autoři: MVDr. Kateřina Nedbalcová, Ph.D., Výzkumný ústav veterinárního lékařství,
VíceMOLEKULÁRNĚ-BIOLOGICKÉ METODY V SURVEILLANCE A ŠETŘENÍ EPIDEMIÍ
Využití molekulárně epidemiologických metod v praxi epidemiologa KHS P. Pazdiora Konference MOLEKULÁRNĚ-BIOLOGICKÉ METODY V SURVEILLANCE A ŠETŘENÍ EPIDEMIÍ Praha, 28.3.2019 Prokázané sekvenační typy legionel
VíceEDUKAČNÍ MATERIÁL PŘÍRUČKA PRO PŘEDEPISUJÍCÍHO LÉKAŘE
EDUKAČNÍ MATERIÁL PŘÍRUČKA PRO PŘEDEPISUJÍCÍHO LÉKAŘE Příručka pro předepisujícího lékaře Pokyny pro zdravotnické pracovníky ohledně předepisování přípravku Cerdelga (eliglustat) Tento léčivý přípravek
VíceKazuistika 3. Blahut L., Vágnerová I., Štosová T. Colours of Sepsis, Ostrava 2019 FAKULTNÍ NEMOCNICE OLOMOUC
Kazuistika 3 Blahut L., Vágnerová I., Štosová T. FAKULTNÍ NEMOCNICE OLOMOUC Colours of Sepsis, Ostrava 2019 R. R., žena, 53 let IPCHO: 11. 16.6.2018 Karcinomatosa peritonea; rozsáhlá cytoredukční operace
VíceVÝVOJ REZISTENCE BAKTERIÁLNÍCH PATOGENŮ
LABORATORNÍ LISTY Listopad č.29/2016 2016 Vážené kolegyně a kolegové, v tomto čísle našich Laboratorních listů Vám předkládáme statistiku rezistencí hlavních bakteriálních patogenů. Kmeny jsme testovali
VíceSeptiFast. rychlá detekce sepse. Olga Bálková Roche s.r.o., Diagnostics Division
SeptiFast rychlá detekce sepse Olga Bálková Roche s.r.o., Diagnostics Division Požadavky kliniků Rychlá detekce a identifikace patogenů způsobujících sepsi Rychlé výsledky Výsledky do několika hodin Jednoznačné
VíceSTANDARD POSKYTOVÁNÍ DISPENZÁRNÍ PÉČE NEMOCNÝM TUBERKULÓZOU A JINÝMI MYKOBAKTERIÓZAMI A OSOBÁM S VYŠŠÍM RIZIKEM VZNIKU TĚCHTO ONEMOCNĚNÍ [KAP. 4.
STANDARD POSKYTOVÁNÍ DISPENZÁRNÍ PÉČE NEMOCNÝM TUBERKULÓZOU A JINÝMI MYKOBAKTERIÓZAMI A OSOBÁM S VYŠŠÍM RIZIKEM VZNIKU TĚCHTO ONEMOCNĚNÍ [KAP. 4.6] Sekce pro tuberkulózu ČPFS prof. MUDr. Vítězslav Kolek,
VíceStreptokoky - průkaz fenotypu rezistence k antibiotikům ze skupiny makrolidů, linkosamidů a streptograminub
Streptokoky - průkaz fenotypu rezistence k antibiotikům ze skupiny makrolidů, linkosamidů a streptograminub Revize 27. 1. 2014 A. Klinické vzorky pro vyšetření citlivosti Citlivost k antibiotikům (včetně
VíceVýskyt tuberkulózy v ČR v roce Incidence of tuberculosis in 2004
Aktuální informace Ústavu zdravotnických informací a statistiky České republiky Praha 16.6.25 26 Výskyt tuberkulózy v ČR v roce 24 Incidence of tuberculosis in 24 Souhrn Podle dat z Registru TBC se vyskytlo
VíceINTERPRETACE VÝSLEDKŮ CITLIVOSTI NA ANTIBIOTIKA. Milan Kolář Ústav mikrobiologie Fakultní nemocnice a LF UP v Olomouci
INTERPRETACE VÝSLEDKŮ CITLIVOSTI NA ANTIBIOTIKA Milan Kolář Ústav mikrobiologie Fakultní nemocnice a LF UP v Olomouci Současná medicína je charakteristická svým multidisciplinárním přístupem k řešení mnoha
VíceLékařská mikrobiologie II
Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy (https://www.lf2.cuni.cz) LF2 > Lékařská mikrobiologie II Lékařská mikrobiologie II Napsal uživatel Marie Havlová dne 8. Březen 2013-0:00. Sylabus praktických
VíceEKONOMICKÉ ASPEKTY GENETICKÝCH VYŠETŘENÍ. I. Šubrt Společnost lékařské genetiky ČLS JEP
EKONOMICKÉ ASPEKTY GENETICKÝCH VYŠETŘENÍ I. Šubrt Společnost lékařské genetiky ČLS JEP Lékařská genetika Lékařský obor zabývající se diagnostikou a managementem dědičných onemocnění Genetická prevence
VíceObecné požadavky na laboratorní informační systém v oboru lékařské mikrobiologie (LIMS) (návrh nepodkročitelného minima)
Obecné požadavky na laboratorní informační systém v oboru lékařské mikrobiologie (LIMS) (návrh nepodkročitelného minima) Pracovní skupina pro správnou laboratorní práci (PSSLP), vypracoval J.Scharfen Projednáno
VíceAkreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2007: CGB laboratoř a.s Kořenského 10, Ostrava, Vítkovice
List 1 z 6 Pracoviště zdravotnické laboratoře: 1., Laboratoř klinické patologie a cytologie Kořenského 10, 70300 Ostrava Vítkovice Postupy vyšetření: 1 Histologická vyšetření tkání 2 Peroperační histologická
VíceMolekulárně biologické a cytogenetické metody
Molekulárně biologické a cytogenetické metody Molekulárně biologickému vyšetření obvykle předchází na rozdíl od všech předcházejících izolace nukleových kyselin, což je ve většině případů DNA jako nositelka
Více