Historie poznání enzymů
|
|
- Emil Staněk
- před 7 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Historie poznání enzymů 1835 Jacob Berzelius katalytická fce diastasy pol. 18.stol. Luis Pasteur vitalismus 1878 Frederic W. Kühn enzym 1894 Emil Fischer teorie zámku a klíče 1897 Büchnerův pokus 1926 James Sumner krystalisace ureasy 30. léta Northrop a Kunitz - aktivita enzymu úměrná konc. proteinu 1963 primární struktura ribonukleasy A 1965 rentgenostrukturní analysa lysozymu
2 Enzymy = biokatalyzátory Téměř každá (metabolická) reakce má svůj enzym
3 Enzymy biologické katalyzátory Platí o nich totéž co o chemických katalyzátorech Katalyzátor je jiná látka než reaktant a produkt reakce Zvyšuje rychlost reakce v obou směrech, snižuje aktivační energii obou reakcí Z toho plyne, že zkracuje dobu potřebnou k dosažení rovnováhy ale neovlivňuje tuto rovnováhu!!!!!! Může se uplatnit pouze v reakcích, které probíhají i bez jeho přítomnosti (i když jen velmi pomalu) Vystupuje z reakce nezměněn
4 Enzym = buď jednoduchá bílkovina nebo apoenzym (peptidový řetězec) + kofaktor = holoenzym Kofaktor: nepeptidová součást enzymu, která se přímo účastní chemické reakce (bez něj by to nešlo), častá souvislost s vitaminy Prosthetická skupina - pevně vázána na peptidový řetězec Koenzym - volně vázaná molekula
5 prosthetická skupina (př. FAD, PLP, hem) E-Pr + S1 E-Pr* + P1 E-Pr* + S2 E-Pr + P2 (regenerace kofaktoru) E-Pr S1 + S2 P1 + P2 β-d-glukosa + 2 β-d-glukonolakton + H 2 2
6 koenzym (druhý substrát) (př. NAD(P),CoA, ATP) E1 S1 + K P1 + K* E2 K* + S2 K + P2 S1 + S2 P1 + P2 CH 3 -CH 2 H + NAD + CH 3 -CH + NADH + H + NADH + H + + Q NAD + + QH 2
7 Enzymy biologické katalyzátory.platí o nich totéž co o chemických katalyzátorech, ale mají něco navíc: účinné snížení aktivační energie specifita (účinku, substrátová) regulovatelnost účinnosti (aktivity) P
8 Aktivační energie rozkladu peroxidu vodíku H 2 2 2H Katalyzátor Reakční rychlost (mol.l -1.s -1 ) E a (kj.mol -1 ) Žádný ,1 HBr ,2 Fe(H) 2 -triethylen tetraamin ,3 Katalasa ,4
9 Enzymy biologické katalyzátory.platí o nich totéž co o chemických katalyzátorech, ale mají něco navíc: účinné snížení aktivační energie specifita regulovatelnost účinnosti (aktivity)
10 Základní znaky enzymu bílkoviny ( x ribozymy) aktivní místo - vazebné skupiny - katalytické skupiny - regiospecifita - stereospecifita Geometrie aktivního místa
11 Specifita enzymu Enzymy vykazují různý stupeň specifity: - Absolutní katalyzují přeměnu jediného substrátu (ureasa) - Skupinovou katalyzují jeden typ reakce při přeměně podobných substrátů (hexokinasa) - Přeměnu určitého typu vazby v různých substrátech (hydrolasy)
12 Základní znaky enzymu mechanismus působení vazba substrátu - zámek a klíč - indukované přizpůsobení úloha "zbytku molekuly
13 Teorie zámku a klíče: - Aktivní místo má rigidní tvar - Mohou se vázat pouze substráty odpovídající tvarem
14 Model indukovaného zapadnutí - aktivní místo je flexibilní - geometrie aktivního místa se přizpůsobí tvaru substrátu až v jeho přítomnosti - širší substrátová specifita
15 Změna konformace hexokinasy způsobená vazbou substrátu (hexosa) D-glc + ATP D-glc-6-fosfát + ADP
16 Faktory přispívající k vysoké účinnosti enzymů Proximita a orientace aktivního místa a substrátu (ů) Vytěsnění molekul vody Konformační změny Elektrostatické efekty Koncentrační efekt
17 Molekulární mechanismus účinku chymotrypsinu: 1. nukleofilní atak kyslíku Ser 2. Tvorba a stabilisace prvního intermediátu 3. Vznik prvního produktu reakce 4. Nukleofilní atak kyslíku molekuly vody 5. Tvorba druhého intermediátu 6. Uvolnění druhého produktu reakce
18 Názvosloví a nomenklatura enzymů NÁZVSLVÍ ENZYMŮ triviální, "polosystematické", systematické, -asa x áza Systematické: Nomenklatura katalog enzymů: http// ExPASy Proteomics Server (Expert Protein Analysis System) proteomics server of the Swiss Institute of Bioinformatics Enzyme Commission (EC) IUBMB EC alkoholdehydrogenasa
19 EC X.Y.Z.W Třída 1-6 Typ reakce Podtřída substrát Podpodtřída Speciální vlastnosti Pořadové číslo Akceptor apod
20 NÁZVSLVÍ ENZYMŮ triviální, "polosystematické", systematické, -asa x áza Tvorba systematických názvů: substrát (y) oddělené : třída (asa) za povšimnutí stojí: prosthetické skupiny se neobjevují v názvu enzymu, koenzymy ano Příklady: H H 2 2 = H 2 H 2 2 : H 2 2 oxidoreduktasa (katalasa) β-d-glukosa + 2 δ-d-glukonolakton + H 2 2 β-d-glukosa: 2 1-oxidoreduktasa (glukosaoxidasa)
21 Třídy enzymů 1. xidoreduktasy 2. Transferasy 3. Hydrolasy 4. Lyasy 5. Isomerasy 6. Ligasy
22 1. xidoreduktasy donor + akceptor oxidovaný donor + redukovaný akceptor Systematický název: donor:akceptor-oxidoreduktasa angl.: donor:acceptor oxidoreductase Triviální názvy: dehydrogenasa reduktasa (důležitější redukce substrátu ) transhydrogenasa (vzácně, glutathion-cystin transhyhrogenasa ) oxidasa (přenos dvou elektronů na 2,obvykle vzniká H 2 2 ) oxygenasa (1 nebo 2 (mono-, di-, ) atomy jsou inkorporovány do substrátu) peroxidasa (peroxid vodíku je akceptorem elektronů, 1.11.) katalasa (disproporcionace peroxidu vodíku, též 1.11.) akceptor donor NAD + NADH + H + CH 3 -CH 2 -H CH 3 -CH
23 Kofaktory oxidoreduktas Nikotinamidadenindinukleotid Kyselina nikotinová, vit.b 3 - P 3 2- = NADP + NAD [H] NADH + H +
24 Spektrální vlastnosti význam pro analytiku NADH NAD +
25 Flavinové kofaktory oxidoreduktas Flavinadedindinukleotid (FAD) Flavinmononukleotid - FMN Riboflavin, vitamin B2
26 Flavinadedindinukleotid (FAD) Flavinadedindinukleotid v redukované formě (FADH 2 )
27 Hem prosthetická skupina N N Fe N N
28 xidoreduktasy - příklady: EC D-Glukosa: 2-1-oxidoreduktasa, glukosaoxidasa -D-glukosa + FAD -D-glukono-1,5-lakton + FADH 2 FADH FAD + H 2 2 -D-glukosa + 2 -D-glukono-1,5-lakton + H 2 2 EC alkoholdehydrogenasa CH 3 CH 2 H + NAD + CH 3 CH + NADH + H +
29 xidoreduktasy EC H 2 2 : H 2 2 -oxidoreduktasa, katalasa H H H EC donor: H 2 2 -oxidoreduktasa, peroxidasa donor + H 2 2 oxidovaný donor + 2 H 2
30 2.Transferasy donor skupiny + akceptor donor + akceptor skupiny Systematický název : donor:akceptor- skupinatransferasa Triviální názvy: methyltransferasy hydroxymethyltransferasy aminotransferasy (transaminasy) kinasy = fosfotransferasy Příklady: 2.1 Přenášející jednouhlíkatou skupinu 2.2 Přenášející aldehydické nebo ketonické skupiny 2.3 Acyltransferasy 2.4 Glykosyltransferasy 2.7 Přenášející skupiny obsahující fosfor (kinasy)
31 Kofaktory transferas Adenosin trifosfát (ATP)
32 Kofaktory transferas Koenzym A (CoA, CoASH) (vitamin B 5 )
33 Pyridoxalfosfát (B6 pyridoxol, pyridoxamin) Prostetická skupina - metabolismus AK
34 Lipoamid, kyselina lipoová (prostetická skupina)
35 Thiamindifosfát, přenos 2C zbytků, aldehydy Thiamin (B1), živočichové pouze dietou, obilné slupky, beri-beri
36 Příklady transferas EC Acyl-CoA :sn-glycerol-3-fosfát-1--acyltransferasa glycerol-3 fosfátacyltransferasa H H 2 C CH H 2 C H P H 2 C C R1 + acyl-scoa H CH + HSCoA H 2 C P
37 Příklady transferas EC L-Alanin:2-oxoglutarát aminotransferasa, alaninaminotransferasa (ALT) C C C + H 3 N CH CH C + C H 3 N CH C CH 2 CH 3 CH 2 CH 3 CH 2 C C L-Ala + 2-oxoglutarát pyruvát + L-Glu
38 Příklady transferas EC ATP:D-hexosa-6-fosfotransferasa, hexokinasa ATP + D-hexosa ADP + D-hexosa-6-fosfát
39 Hydrolasy A - B + H 2 AH + HB Systematický název: substrát (skupina) hydrolasa Triviální název: substrátasa, často zcela nesystematické názvy Dobrá zpráva: nepotřebují kofaktory
40 3. Hydrolasy 3.1 Esterasy (lipasy, fosfolipasy, nukleasy, fosfatasy) 3.2 Glykosidasy (amylasy, celulasy, pektinasy. 3.3 Působící na etherové vazby 3.4 Peptidasy (amino- a karboxypeptidasy, serinové, aspartátové, sulfhydrylové, metaloproteasy) 3.5 Působící na C_N vazbu jinou než peptidovou (nukleasy) 3.6 Působící na anhydridy kyselin 3.7 Působící na vazbu C_C 3.8 Působící na vazby halogenů 3.9 Působící na P_N vazby 3.10 Působící na S_N vazbu 3.11 Působící na C_P vazbu
41 4. LYASY substrát 1 (+ substrát2) produkt1 + produkt2 (malý) Systematický název: substrát1 (:substrát 2)- produkt2 lyasa Triviální název: dekarboxylasa, hydrolyasy (=dehydratasa), ammonialyasa, aldolasa, synthasa (velmi riskantní) 4.1 C-C lyasy 4.2 C- lyasy 4.3. C-N lyasy 4.4 C-S lyasy 4.5 C-halogen lyasy 4.6 P- lyasy statní lyasy
42 Lyasy - příklady: EC pyruvát-karboxylyasa, pyruvátdekarboxylasa CH 3 -C-CH CH 3 -CH + C 2 EC karbonát-hydrolyasa, karbonátanhydrasa, karbonátdehydratasa H 2 C 3 C 2 + H 2
43 EC ATP-pyrofosfátlyasa (cyklisující), adenylátcyklasa camp H P H H H H H 2 C H N N N N NH 2 P P H P H H H CH 2 H N N N N NH 2 P P ATP camp + PPi +
44 5. ISMERASY Triviální názvy: (různé typy isomerací podobně i v systematickém názvu) racemasy, cis-trans-isomerasy, ketolisomerasy, mutasy, atd. Systematický název: substráttyp isomerace angl.: substrate type 5.1 Racemasy a epimerasy 5.2 Cis-trans-isomerasy 5.3 Intramolekulární oxidoreduktasy 5.4 Intramolekulární transferasy (mutasy) 5.5 Intramolekulární lyasy (decyklisující, intramolekulární adice) 5.99 statní isomerasy (např. DNA-topoisomerasy)
45 Isomerasy - příklady: EC D-Glyceraldehyd-3-fosfátketolisomerasa, triosafosfátisomerasa H HC CH H 2 C P H 2 C C H 2 C D-glyceraldehyd-3-fosfát dihydroxyacetonfosfát H P EC glukosaisomerasa Glukosa fruktosa (průmyslová výroba HFCS)
46 6. LIGASY substrát1 + substrát2 + A(G) TP substrát1-substrát2 + ADP + Pi nebo substrát1 + substrát2 + ATP substrát1-substrát2 + AMP + PPi Systematický název: substrát1:substrát2-ligasa (tvořící ADP, AMP nebo GDP) Triviální názvy: pokud možno substrát1-substrát2-ligasa (synthetasy jsou možné, často se však vyskytují i synthasy)
47 6. LIGASY katalyzují energeticky náročné slučování dvou substrátů S1 + S2 + NTP + H 2 S1-S2 + NDP + Pi nebo S1 + S2 + NTP + H 2 S1-S2 + NMP + PPi. 6.1 Tvořící C- vazby (aminoacyl trna ligasy a podobné estery) 6.2 Tvořící C-S vazby (kyselina thiol ligasy) 6.3 Tvořící C-N vazby 6.4 Tvořící C-C vazby (např. karboxylasy) 6.5 Tvořící estery kyseliny fosforečné (např. DNA-ligasa)
48 Ligasy - příklady: EC L-Tyrosin:tRNATyr-ligasa (AMP-tvořící), tyrosin-trna-ligasa L-Tyr + trna Tyr + ATP L-Tyr-tRNA Tyr + AMP + PP i EC Pyruvát:oxid uhličitý-ligasa (ADP-tvořící), pyruvátkarboxylasa CH 3 -C-C - + HC 3 - +ATP -C-CH 2 -C-C - + ADP + P i EC Poly(deoxyribonukleotid): poly(deoxyribonukleotid)-ligasa (AMPtvořící), DNA-ligasa ATP + (deoxyribonukleotid) n + (deoxyribonukleotid) m (deoxyribonukleotid) n+m + AMP + PPi
49 Biotin, přenáší karboxylovou skupinu, prostetická skupina (transferasy, ligasy) Růstový faktor kvasinek, avidin-biotin komplex
50 Tetrahydrolistová kyselina, přenáší 1C zbytky vázané na N5
1. OXIDOREDUKTASY (14.) 11 až 18 (různé typy oxygenačních
1. OXIDOREDUKTASY donor + akceptor oxidovaný donor + redukovaný akceptor Systematický název: donor : akceptor-oxidoreduktasa angl.: donor : acceptor oxidoreduktase Triviální názvy: dehydrogenasa reduktasa
VíceEnzymy = biokatalyzátory
Enzymy = biokatalyzátory Enzymy biologické katalyzátory Analogie s chemickými katalyzátory Katalyzátor je jiná látka než reaktant a produkt reakce Zvyšuje rychlost reakce v obou směrech, snižuje aktivační
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. ENZYMY I úvod, názvosloví, rozdělení do tříd
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ENZYMY I úvod, názvosloví, rozdělení do tříd Úvod z řeckého EN ZYME (v kvasinkách) biologický katalyzátor, protein (RNA) liší se od chemických
VíceEnzymologie. Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol Matej Kohutiar. akad. rok 2017/2018
Enzymologie Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol Matej Kohutiar akad. rok 2017/2018 Osnova I. Základní principy enzymových reakcí II. Termodynamické a kinetické aspekty enzymové
VíceEnzymy = biokatalyzátory
Enzymy = biokatalyzátory Enzymy biologické katalyzátory Analogie s chemickými katalyzátory -katalyzátor je jiná látka než reaktant a produkt reakce -zvyšuje rychlost reakce v obou směrech, snižuje aktivační
VíceEnzymy: Struktura a mechanismus působení. Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1.LF UK
Enzymy: Struktura a mechanismus působení Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1.LF UK 1 ENZYMY JAKO HOMOGENNÍ BIOKATALYZÁTORY 1. Bílkovinná povaha ( + některé RNA-enzymy - ribozymy) 2.
VíceEnzymy. Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc.
Enzymy Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. ENZYMY JAKO HOMOGENNÍ BIOKATALYZÁTORY 1. Bílkovinná povaha ( + některé RNA-enzymy - ribozymy) 2. Větší účinnost (faktor minimálně 10 6 ) 3. Specifičnost - substrátová
VíceEnzymologie. Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů.
ENZYMOLOGIE 1 Enzymologie Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů. Jak je možné, že buňka dokáže utřídit hrozivou změť chemických procesů, které v ní v každém okamžiku
VíceNázev: Systematický (5Z,8Z,11Z,14Z)-ikosa-5,8,11,14-tetraenoát,donor vodíku:kyslík-oxidoreduktasa
Názvosloví enzymů: http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/ http://enzyme.expasy.org/ Název: Systematický (5Z,8Z,11Z,14Z)-ikosa-5,8,11,14-tetraenoát,donor vodíku:kyslík-oxidoreduktasa Polo-triviální prostaglandin-endoperoxidsynthasa
VíceENZYMY. Enzymy - jednoduché nebo složené proteiny, které katalyzují chemické přeměny v organismech
ENZYMY Enzymy - jednoduché nebo složené proteiny, které katalyzují chemické přeměny v organismech Šest hlavních kategorií enzymů: EC 1 Oxidoreduktasy: katalyzují oxidačně/redukční reakce EC 2 Transferasy:
Více7. Enzymy. klasifikace, názvosloví a funkce
7. Enzymy klasifikace, názvosloví a funkce Jsou to přírodní katalyzátory, živočišné i rostlinné Umožňují průběh biochemických reakcí Nachází se ve veškerých živých systémech Enzymy vykazují druhovou specifitu
VíceENZYMOLOGIE. Pracovní sešit k přednáškám z biochemie pro studenty biologických kombinací ZDENĚK GLATZ
EZYMLGIE Pracovní sešit k přednáškám z biochemie pro studenty biologických kombinací II ZDEĚK GLATZ 2004 Katalýza - Berzelius 1838 2 EZYMLGIE katalyzátor - látky urychlující chemické reakce - nemění rovnováhu
VíceFigure 3-23 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)
Figure 3-23 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008) Dělení bílkovin podle jejich funkce stavební a podpůrné kolageny, elastin, keratiny (fibrilární) bílkoviny cytoskeletu (tubulin, vimentin,
VíceENZYMY. RNDr. Lucie Koláčná, Ph.D.
ENZYMY RNDr. Lucie Koláčná, Ph.D. Enzymy: katalyzátory živé buňky jednoduché nebo složené proteiny Apoenzym: proteinová část Kofaktor: nízkomolekulová neaminokyselinová struktura nezbytně nutná pro funkci
VíceKofaktory enzymů. T. Kučera. (upraveno z J. Novotné)
Kofaktory enzymů T. Kučera (upraveno z J. Novotné) Kofaktory enzymů neproteinová, nízkomolekulární složka enzymu ko-katalyzátor potřebný k aktivitě enzymu pomocné molekuly v enzymové reakci holoenzym (aktivní)
VíceRychlost chemické reakce je dána změnou Gibbsovy energie a aktivační energií: Tudíž zrychlení reakce pomocí katalýzy může být vyjádřeno:
Bruno Sopko Rychlost chemické reakce je dána změnou Gibbsovy energie a aktivační energií: Tudíž zrychlení reakce pomocí katalýzy může být vyjádřeno: Z předchozí rovnice vyplývá: Pokud katalýza při 25
VíceRedoxní děj v neživých a živých soustavách
Enzymy Enzymy Katalyzují chemické reakce, kdy se mění substrát na produkt Katalytickým působením se snižuje aktivační energie reagujících molekul substrátu, tím se reakce urychlí Za přítomnosti enzymu
VíceHISTORIE ENZYMOLOGIE
ENZYMY HISTORIE ENZYMOLOGIE 1. Berzelius (18.stol.) v rostlinách i živočiších probíhají tisíce katalyzovaných reakcí FERMENTY fermentace (Fabrony) 2. W.Kühne en zýme = v kvasnicích enzymy 3. J. Sumner
VíceKatabolismus - jak budeme postupovat
Katabolismus - jak budeme postupovat I. fáze aminokyseliny proteiny polysacharidy glukosa lipidy Glycerol + mastné kyseliny II. fáze III. fáze ETS itrátový cyklus yklus trikarboxylových kyselin, Krebsův
Více1. Napište strukturní vzorce aminokyselin E a W a vzorce guanosinu a uracilu
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2018 1. Napište strukturní vzorce aminokyselin E a W a vzorce guanosinu a uracilu U dalších otázek zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná
VíceBIOKATALYZÁTORY I. ENZYMY
BIOKATALYZÁTORY I. Obecné pojmy - opakování: Katalyzátory látky, které ovlivňují průběh katalyzované reakce a samy se přitom nemění. Dělíme je na: pozitivní (aktivátory) urychlující reakce negativní (inhibitory)
VíceProč biokatalýza? Vyšší reakční rychlost Vyšší specificita reakce Mírnější reakční podmínky Možnost regulace
Enzymy Proč biokatalýza? Vyšší reakční rychlost Vyšší specificita reakce Mírnější reakční podmínky Možnost regulace COO - - COO NH 2 OH - COO NH 2 - COO O OH - COO Chorismate mutase - OOC O OH - COO -
VíceFigure 3-23 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)
Figure 3-23 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008) Lidský genom 20 tis. Genů (genom) stovky tisíc proteinů (proteom) Dělení bílkovin podle jejich funkce stavební a podpůrné kolageny, elastin,
Vícekofaktory nejsou: - stabilizující sloučeniny - allosterické aktivátory - post-translační modifikace mimo aktivní místo - proteinové podjednotky
Kofaktory, koenzymy a prosthetické skupiny kofaktory nízkomolekulární sloučeniny potřebné pro enzymovou katalýzu, účastní se katalýzy - koenzymy - prosthetické skupiny - kovalentní modifikace aminokyselinových
VíceAminokyseliny, proteiny, enzymologie
Aminokyseliny, proteiny, enzymologie Aminokyseliny Co to je? Organické látky karboxylové kyseliny, které mají na sousedním uhlíku navázanou aminoskupinu Jak to vypadá? K čemu je to dobré? AK jsou stavební
VíceText zpracovala Mgr. Taťána Štosová, Ph.D PŘÍRODNÍ LÁTKY
Inovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie CZ.1.07/2.2.00/15.0324 Text zpracovala Mgr. Taťána Štosová, Ph.D PŘÍRODNÍ LÁTKY Obsah 1 Úvod do problematiky přírodních látek... 2 2 Vitamíny... 2 2.
Více>>> E A1 + E A2. . aktivační energie potřebná k reakci bez přítomnosti katalyzátoru E A E A1. energie potřebná ke vzniku enzym-substrátového komplexu
Enzymy Charakteristika enzymů- fermentů katalyzátory biochem. reakcí biokatalyzátory umožňují a urychlují průběh rcí v organismu nachází se ve všech živých systémech z chemického hlediska jednoduché nebo
VíceVyužití enzymů pro analytické a výzkumné účely
Využití enzymů pro analytické a výzkumné účely Enzymy jako analytická činidla Stanovení enzymových aktivit Diagnostika (klinická biochemie) Indikátory technologických a jakostních změn v potravinářství
VíceBp1252 Biochemie. #8 Metabolismus živin
Bp1252 Biochemie #8 Metabolismus živin Chemické reakce probíhající v organismu Katabolické reakce přeměna složitějších látek na jednoduché, jsou většinou exergonické. Anabolické reakce syntéza složitějších
Více9. Citrátový cyklus, oxidační dekarboxylace pyruvátu a anaplerotické dráhy
9. Citrátový cyklus, oxidační dekarboxylace pyruvátu a anaplerotické dráhy Obtížnost A Vyjmenujte kofaktory, které využívá multienzymový komplex pyruvátdehydrogenasy; které z nich řadíme mezi koenzymy
VíceEva Benešová. Dýchací řetězec
Eva Benešová Dýchací řetězec Dýchací řetězec Během oxidace látek vstupujících do různých metabolických cyklů (glykolýza, CC, beta-oxidace MK) vznikají NADH a FADH 2, které následně vstupují do DŘ. V DŘ
Více13. Enzymy aktivační energie katalýza makroergické sloučeniny
13. Enzymy Průběh chemických reakcí závisí též na schopnosti molekul přiblížit se dostatečně blízko a překonat repulsní energetickou bariéru. K tomu je zapotřebí energie typické pro každou reakci, tzv.
VíceHistorie. Pozor! né vždy jen bílkovinná část
Enzymy a hormony Enzymy = biokatalyzátory jejich působení je umožněn souhrn chemických přeměn v organismu (metabolismus) jednoduché, složené bílkoviny globulární v porovnání s katalyzátory účinnější, netoxické,
VíceStanovení vybraných enzymů. Roman Kanďár
Stanovení vybraných enzymů Roman Kanďár Takže prvně malé opakování ENZYM Protein (RNA) s katalytickou aktivitou Protein (RNA) kofaktor (prosthetická skupina, koenzym) Jaký je vlastně rozdíl mezi prosthetickou
VíceFunkce Kofaktory enzymů aktivní formy enzymová aktivita Další funkce Specifické AA Nespecifické Další látky Vitaminy?? specifická funkce??
YDRFILÍ VITAMIY Funkce Kofaktory enzymů aktivní formy enzymová aktivita Další funkce Specifické AA especifické Další látky Vitaminy?? specifická funkce?? deficience?? potřeba?? Thiamin Vitamin B1 + 3 2
VíceEnzymy charakteristika a katalytický účinek
Enzymy charakteristika a katalytický účinek Tematická oblast Datum vytvoření Ročník Stručný obsah Způsob využití Autor Kód Chemie přírodních látek enzymy 28.7.2012 3. ročník čtyřletého G Charakteristika
VíceCHEMICKÉ ZNAKY ŽIVÝCH SOUSTAV
CHEMICKÉ ZNAKY ŽIVÝCH SOUSTAV a) Chemické složení a. biogenní prvky makrobiogenní nad 0,OO5% (C, O, N, H, S, P, Ca.) - mikrobiogenní pod 0,005%(Fe,Zn, Cu, Si ) b. voda 60 90% každého organismu - 90% příjem
VíceEnzymy. Názvosloví enzymů
Enzymy Enzymy jsou bílkoviny, které působí jako biologické katalyzátory. Podobně jako ostatní katalyzátory snižují aktivační energii chemické reakce a tím urychlují její průběh. Enzymy neovlivňují hodnotu
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Citrátový a glyoxylátový cyklus
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Citrátový a glyoxylátový cyklus Buněčná respirace I. Fáze Energeticky bohaté látky jako glukosa, mastné kyseliny a některé aminokyseliny
VícePOLYPEPTIDY. Provitaminy = organické sloučeniny bez vitaminózního účinku, které se v živočišném těle mění působením ÚV záření nebo enzymů na vitaminy.
POLYPEPTIDY Provitaminy = organické sloučeniny bez vitaminózního účinku, které se v živočišném těle mění působením ÚV záření nebo enzymů na vitaminy. Hormony = katalyzátory v živočišných organismech (jsou
VíceÚvod do buněčného metabolismu Citrátový cyklus. Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1. LF UK
Úvod do buněčného metabolismu Citrátový cyklus Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1. LF UK METABOLISMUS = přeměna látek v organismu - má stránku chemickou (látkovou) - reakce anabolické
VíceENZYMY. Klasifikace enzymů
ENZYMY Enzymy jsou bílkoviny, které katalyzují chemické reakce probíhající v živých organismech. Byly identifikovány tisíce enzymů, mnohé z nich byly izolovány čisté. Klasifikace enzymů Vzhledem k tomu,
VíceCharakteristika složky 3) cytochrom-c NADH-Q-reduktasa cytochrom-c- oxidasa ubichinon cytochromreduktasa
8. Dýchací řetězec a fotosyntéza Obtížnost A Pomocí následující tabulky charakterizujte jednotlivé složky mitochondriálního dýchacího řetězce. SLOŽKA Pořadí v dýchacím řetězci 1) Molekulový typ 2) Charakteristika
VíceHistorie poznávání enzymů
Enzymy (en-zýme -- v kvasnicích) Charakteristika enzymů- fermentů katalyzátory biochem. reakcí biokatalyzátory umožňují a urychlují průběh rcí v organismu nachází se ve všech živých systémech-jejich působením
VíceDYNAMICKÁ BIOCHEMIE. Daniel Nechvátal :: www.gymzn.cz/nechvatal
DYNAMICKÁ BIOCHEMIE Daniel Nechvátal :: www.gymzn.cz/nechvatal Energetický metabolismus děje potřebné pro zabezpečení života organismu ANABOLISMUS skladné reakce, spotřeba E KATABOLISMUS rozkladné reakce,
Více11. Metabolismus lipidů
11. Metabolismus lipidů Obtížnost A Následující procesy a metabolické reakce, vedoucí ke zkrácení řetězce mastné kyseliny, vázané v triacylglycerolu, a vzniku acetyl-coa, seřaďte ve správném pořadí: a)
VíceTest pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie Napište vzorce aminokyselin Q a K
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2017 1. Napište vzorce aminokyselin Q a K Dále zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná odpověď) 2. Enzym tyrozinkinasu řadíme do třídy
VíceMetabolismus aminokyselin I. Jana Novotná 2. LF UK, Ústav lékařské chemie a klinické biochemie
Metabolismus aminokyselin I Jana Novotná 2. LF UK, Ústav lékařské chemie a klinické biochemie Metabolismus aminokyselin PROTEINY Z POTRAVY GLYKOLÝZA KREBSŮV CYCLUS Proteosyntéza Trávení Transaminace TĚLESNÉ
VíceEnzymy. Názvosloví enzymů
Enzymy Enzymy jsou bílkoviny, které působí jako biologické katalyzátory. Podobně jako ostatní katalyzátory snižují aktivační energii chemické reakce a tím urychlují její průběh. Enzymy neovlivňují hodnotu
VíceGymnázium Jana Nerudy. Závěrečná práce studentského projektu. Enzymatická aktivita
Gymnázium Jana Nerudy Evropský sociální fond Praha a EU Investujeme do vaší budoucnosti Závěrečná práce studentského projektu Enzymatická aktivita Vedoucí práce: Mgr. Jiří Vozka RNDr. Lenka Simonianová
Více4. Enzymy. Obtížnost A
4. Enzymy btížnost A Enzymy a) zvyšují rychlost chemických reakcí tím, že zvyšují jejich aktivační energii; b) zvyšují rovnovážný výtěžek chemické reakce tím, že zvyšují hodnotu rovnovážné konstanty; c)
VíceMETABOLISMUS SACHARIDŮ
METABOLISMUS SAHARIDŮ A. Odbourávání sacharidů - nejdůležitější zdroj energie pro heterotrofy - oxidací sacharidů až na. získávají aerobní organismy energii ve formě. - úplná oxidace glukosy: složitý proces
VíceObecný metabolismus.
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 Obecný metabolismus. Regulace glykolýzy a glukoneogeneze (5). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie,
VíceMetabolické dráhy. František Škanta. Glykolýza. Repetitorium chemie X. 2011/2012. Glykolýza. Jaký je osud pyruátu bez přítomnosti kyslíku?
Repetitorium chemie X. 2011/2012 Metabolické dráhy František Škanta Metabolické dráhy xidativní fosforylace xidace mastných kyselin 1. fosforylace 2. štěpení hexosy na dvě vzájemně převoditelné triosy
VíceOXIDATIVNÍ FOSFORYLACE
OXIDATIVNÍ FOSFORYLACE OBSAH Mitochondrie Elektronový transport Oxidativní fosforylace Kontrolní systém oxidativního metabolismu. Oxidace a syntéza ATP jsou spojeny transmembránovým tokem protonů Dýchací
Více- metabolismus soubor chemických reakcí probíhajících v živých organismech a mezi organismy a jejich životním prostředím
Otázka: Obecné rysy metabolismu Předmět: Chemie Přidal(a): Bára V. ZÁKLADY LÁTKOVÉHO A ENERGETICKÉHO METABOLISMU - metabolismus soubor chemických reakcí probíhajících v živých organismech a mezi organismy
VíceAminokyseliny. Aminokyseliny. Peptidy & proteiny Enzymy Lipidy COOH H 2 N. Aminokyseliny. Aminokyseliny. Postranní řetězec
optická aktivita Peptidy & proteiny Enzymy Lipidy α-uhlík je asymetrický pouze L-aminokyseliny 2 α R rozdělení dle polarity podle počtu karboxylových skupin podle počtu bazických skupin podle polarity
VíceENZYMY enzymová katalýza
Základy biochemie KB / B EZYMY enzymová katalýza Inovace studia biochemie prostřednictvím e-learningu Z.04.1.03/3.2.15.3/0407 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem
Více9. Dýchací řetězec a oxidativní fosforylace. mitochondriální syntéza ATP a fotosyntéza
9. Dýchací řetězec a oxidativní fosforylace mitochondriální syntéza ATP a fotosyntéza CHEMIOSMOTICKÁ TEORIE SYNTÉZY ATP Heterotrofní organismy získávají hlavní podíl energie (cca 90%) uložené ve struktuře
VíceZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI
ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI FAKULTA PEDAGOGICKÁ KATEDRA CHEMIE Enzymy ve výuce na vyšším stupni gymnázia DIPLOMOVÁ PRÁCE Jakub Král Učitelství pro střední školy, obor Ch - Ge Vedoucí práce: Mgr. Milan
Více1. ročník Počet hodin
SOUSTAVY LÁTEK A JEJICH SLOŽENÍ rozdělení přírodních látek a vlastnosti chemických látek soustavy látek a jejich složení STAVBA ATOMU historie pohledu na atom složení a struktura atomu stavba atomu VELIČINY
VíceEnzymy (katalýza biochemických reakcí)
Enzymy (katalýza biochemických reakcí) Enzymy (fermenty) Biokatalyzátory chemických reakcí (globulární proteiny) Ve velmi malých množstvích specificky urychlují průběh chemických reakcí tak, že snižují
VíceEnergetický metabolizmus buňky
Energetický metabolizmus buňky Buňky vyžadují neustálý přísun energie pro tvorbu a udržování biologického pořádku (život). Tato energie pochází z energie chemických vazeb v molekulách potravy (energie
VíceVyužití enzymů v medicíně
Využití enzymů v medicíně 1. Stanovení enzymových aktivit diagnosticky významných enzymů 2. Stanovení analytů enzymovými analytickými metodami 3. Enzymy jako terapeutika Enzymy jako diagnostické nástroje
VíceMetabolismus lipidů. (pozn. o nerozpustnosti)
Metabolismus lipidů (pozn. o nerozpustnosti) Trávení lipidů Lipidy v potravě - většinou v hydrolyzovatelné podobě, především jako triacylglayceroly (TAG), fosfatidáty a sfingolipidy. V trávicím traktu
VíceAMINOKYSELINY REAKCE
CHEMIE POTRAVIN - cvičení AMINOKYSELINY REAKCE Milena Zachariášová (milena.zachariasova@vscht.cz) Ústav chemie a analýzy potravin, VŠCHT Praha REAKCE AMINOKYSELIN část 1 ELIMINAČNÍ REAKCE DEKARBOXYLACE
VíceVýukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0996
Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0996 Šablona: III/2 č. materiálu: VY_32_INOVACE_CHE_419 Jméno autora: Třída/ročník: Mgr. Alena
VíceCitrátový cyklus. Tomáš Kučera.
itrátový cyklus Tomáš Kučera tomas.kucera@lfmotol.cuni.cz Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2. lékařská fakulta, Univerzita Karlova v Praze a Fakultní nemocnice v Motole 2017 Schéma energetického
VíceCZ.1.07/2.2.00/ Obecný metabolismus. Energetický metabolismus (obecně) (1).
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 becný metabolismus Energetický metabolismus (obecně) (1). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie,
VícePentosový cyklus. osudy glykogenu. Eva Benešová
Pentosový cyklus a osudy glykogenu Eva Benešová Pentosový cyklus pentosafosfátová cesta, fosfoglukonátová cesta nebo hexosamonofosfátový zkrat Funkce: 1) výroba NADPH 2) výroba ribosa 5-fosfátu 3) zpracování
VíceObecný metabolismus.
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 becný metabolismus. Mechanismy enzymové katalýzy (7). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie Přírodovědecká
VíceMETABOLISMUS SACHARIDŮ
METABLISMUS SAHARIDŮ GLUKNEGENEZE GLUKNEGENEZE entrální úloha glukosy Palivo Prekursor strukturních sacharidů a jiných molekul Syntéza glukosy z necukerných prekurzorů Laktát Aminokyseliny (uhlíkatý řetězec
VíceCentrální dogma molekulární biologie
řípravný kurz LF MU 2011/12 Centrální dogma molekulární biologie Nukleové kyseliny 1865 zákony dědičnosti (Johann Gregor Mendel) 1869 objev nukleových kyselin (Miescher) 1944 genetická informace v nukleových
VíceObecný metabolismus.
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 Obecný metabolismus. Enzymy biokatalyzátory (6). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie, Přírodovědecká
VíceOtázka: Metabolismus. Předmět: Biologie. Přidal(a): Furrow. - přeměna látek a energie
Otázka: Metabolismus Předmět: Biologie Přidal(a): Furrow - přeměna látek a energie Dělení podle typu reakcí: 1.) Katabolismus reakce, při nichž z látek složitějších vznikají látky jednodušší (uvolňuje
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolismus dusíkatých látek
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Metabolismus dusíkatých látek Oxidace aminokyselin Podíl AK na metabolické E se silně liší dle organismu a jeho momentálních potřeb, např.
VíceMetabolismus krok za krokem - volitelný předmět -
Metabolismus krok za krokem - volitelný předmět - Vladimíra Kvasnicová pracovna: 411, tel. 267 102 411, vladimira.kvasnicova@lf3.cuni.cz informace, studijní materiály: http://vyuka.lf3.cuni.cz Sylabus
VíceOPVK CZ.1.07/2.2.00/
OPVK CZ.1.07/2.2.00/28.0184 Základní principy vývoje nových léčiv OCH/ZPVNL Mgr. Radim Nencka, Ph.D. ZS 2012/2013 Molekulární interakce SAR Možné interakce jednotlivých funkčních skupin 1. Interakce alkoholů
VíceSacharidy a polysacharidy (struktura a metabolismus)
Sacharidy a polysacharidy (struktura a metabolismus) Sacharidy Živočišné tkáně kolem 2 %, rostlinné 85-90 % V buňkách rozličné fce: Zdroj a zásobárna energie (glukóza, škrob, glykogen) Výztuž a ochrana
VíceCo jsou to enzymy? pozoruhodné chemické katalyzátory
Enzymy Co jsou to enzymy? pozoruhodné chemické katalyzátory Vyšší reakční rychlost (6-12 řádů) Mírnější podmínky reakce (nižší teplota, atmosférický tlak, neutrální ph) Vyšší specifita reakce (specifické
VíceCitrátový cyklus a Dýchací řetězec. Milada Roštejnská Helena Klímová
Citrátový cyklus a Dýchací řetězec Milada oštejnská elena Klímová 1 bsah 1 Citrátový cyklus Citrátový cyklus (reakce) Citrátový cyklus (schéma) espirace (dýchání) Vnější a vnitřní respirace Dýchací řetězec
VíceVzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/34.0211. Anotace. Metabolismus sacharidů. VY_32_INOVACE_Ch0216.
Vzdělávací materiál vytvořený v projektu VK Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí svobození 20 Číslo projektu: Název projektu: Číslo a název klíčové aktivity: CZ.1.07/1.5.00/34.0211 Zlepšení podmínek
VíceENZYMY A NUKLEOVÉ KYSELINY
ENZYMY A NUKLEOVÉ KYSELINY Autor: Mgr. Stanislava Bubíková Datum (období) tvorby: 28. 3. 2013 Ročník: devátý Vzdělávací oblast: Člověk a příroda / Chemie / Organické sloučeniny 1 Anotace: Žáci se seznámí
VíceChemie nukleotidů a nukleových kyselin. Centrální dogma molekulární biologie (existují vyjímky)
Chemie nukleotidů a nukleových kyselin Centrální dogma molekulární biologie (existují vyjímky) NH 2 N N báze O N N -O P O - O H 2 C H H O H H cukr OH OH nukleosid nukleotid Nukleosidy vznikají buď syntézou
VíceEnzymy. aneb. Není umění dělat co tě baví, ale najít zalíbení v tom, co udělati musíš. Luboš Paznocht
Enzymy aneb Není umění dělat co tě baví, ale najít zalíbení v tom, co udělati musíš. Luboš Paznocht Umožňují rychlý a koordinovaný průběh chemických přeměn v organismu Kinetika biochemických reakcí řád
VíceOBECNÝ METABOLISMUS ENZYMY
OBECNÝ METABOLISMUS ENZYMY Enzymy - základní terminologie Katalyzátor je látka, která zvyšuje rychlost chemické reakce, ale nemění chemickou rovnováhu Enzymy jsou katalyzátory biologických systémů umožňující
VíceMETABOLISMUS SLOUČENINY S MAKROERGNÍMI VAZBAMI
METABOLISMUS SLOUČENINY S MAKROERGNÍMI VAZBAMI Obsah Formy organismů Energetika reakcí Metabolické reakce Makroergické sloučeniny Formy organismů Autotrofní x heterotrofní organismy Práce a energie Energie
VíceMetabolismus proteinů a aminokyselin
Metabolismus proteinů a aminokyselin Proteiny jsou nejdůležitější složkou potravy všech živočichů, nelze je nahradit ani cukry, ani lipidy. Je to proto, že organismus živočichů nedokáže ve svých metabolických
VíceDidaktické testy z biochemie 2
Didaktické testy z biochemie 2 Metabolismus Milada Roštejnská Helena Klímová br. 1. Schéma metabolismu Zažívací trubice Sacharidy Bílkoviny Lipidy Ukládány jako glykogen v játrech Ukládány Ukládány jako
VíceMETABOLISMUS SACHARIDŮ
METABOLISMUS SACHARIDŮ PRINCIP Rozštěpené sacharidy vstřebávání střevní sliznicí do krevního oběhu dopraveny vrátnicovou žílou do jater. V játrech enzymaticky hexózy štěpeny na GLUKÓZU vyplavována do krve
VíceENZYMY. Charakteristika enzymaticky katalyzovaných reakcí:
ENZYMY Definice: Enzymy (biokatalyzátory) jsou jednoduché či složené makromolekulární bílkoviny s katalytickou aktivitou. Urychlují reakce v organismech tím, že snižují aktivační energii (Ea) potřebnou
VíceKA 2340/4-8up Chemické laboratorní metody v analýze potravin H1CL. Studijní podklady
KA 2340/4-8up Chemické laboratorní metody v analýze potravin H1CL Studijní podklady Téma: Principy enzymových metod v analýze potravin živočišného původu Vypracovala Prof. MVDr. Lenka Vorlová, Ph.D. Úvod:
Více1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2019 1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu U dalších otázek zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná
VíceDýchací řetězec (DŘ)
Dýchací řetězec (DŘ) Vladimíra Kvasnicová animace na internetu: http://vcell.ndsu.nodak.edu/animations/etc/index.htm http://vcell.ndsu.nodak.edu/animations/atpgradient/index.htm http://www.wiley.com/college/pratt/0471393878/student/animations/oxidative_phosphorylation/index.html
Vícenepolární polární kyselý bazický
opticky aktivní rozdělení α-uhlík je asymetrický pouze L-aminokyseliny (D-aminokyseliny: bakterie, antibiotika, ) 2 α R podle počtu karboxylových skupin podle počtu aminoskupin podle polarity postranního
VíceGymnázium Jiřího Ortena, Kutná Hora
Předmět: Náplň: Třída: Počet hodin: Pomůcky: Chemie (CHE) Organická chemie, biochemie 3. ročník a septima 2 hodiny týdně Školní tabule, interaktivní tabule, tyčinkové a kalotové modely molekul, zpětný
VíceTEST + ŘEŠENÍ. PÍSEMNÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKOUŠKY Z CHEMIE bakalářský studijní obor Bioorganická chemie 2010
30 otázek maximum: 60 bodů TEST + ŘEŠEÍ PÍSEMÁ ČÁST PŘIJÍMACÍ ZKUŠKY Z CEMIE bakalářský studijní obor Bioorganická chemie 2010 1. apište názvy anorganických sloučenin: (4 body) 4 BaCr 4 kyselina peroxodusičná
VíceDýchací řetězec, oxidativní fosforylace, mitochondriální transportní systémy
Dýchací řetězec, oxidativní fosforylace, mitochondriální transportní systémy JAN ILLNER Dýchací řetězec & oxidativní fosforylace Tvorba energie v živých systémech ATP zdroj E pro biochemické procesy Tvorba
VíceAerobní odbourávání cukrů+elektronový transportní řetězec
Aerobní odbourávání cukrů+elektronový transportní řetězec Dochází k němu v procesu jménem aerobní respirace. Skládá se z kroků: K1) Glykolýza K2) oxidativní dekarboxylace pyruvátu K3) Krebsův cyklus K4)
Více