Název: Systematický (5Z,8Z,11Z,14Z)-ikosa-5,8,11,14-tetraenoát,donor vodíku:kyslík-oxidoreduktasa
|
|
|
- Bohumír Doležal
- před 5 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Názvosloví enzymů: Název: Systematický (5Z,8Z,11Z,14Z)-ikosa-5,8,11,14-tetraenoát,donor vodíku:kyslík-oxidoreduktasa Polo-triviální prostaglandin-endoperoxidsynthasa Triviální cyklooxygenasa Kód enzymové klasifikace: EC
2 Třídy enzymů: EC 1.x.x.x Oxidoreduktasy EC 2.x.x.x Transferasy EC 3.x.x.x Hydrolasy EC 4.x.x.x Lyasy EC 5.x.x.x Isomerasy EC 6.x.x.x Ligasy
3 Oxidoreduktasy: EC 1.x.x.x Systematický název česky: donor:akceptor-oxidoreduktasa Systematický název anglicky: donor:acceptor oxidoreductase Polo-triviální česky: xxxdehydrogenasa, xxxoxidasa, xxxmonooxygenasa, xxxdioxygenasa, xxxreduktasa Polo-triviální anglicky: xxx dehydrogenase, xxx oxidase, xxx monooxygenase, xxx dioxygenase, xxx reductase
4 Oxidoreduktasy: EC Systematický název česky: alkohol:nad + -oxidoreduktasa Systematický název anglicky: alcohol:nad + oxidoreductase Polo-triviální česky: alcoholdehydrogenasa Polo-triviální anglicky: alcohol dehydrogenase
5 Oxidoreduktasy: EC 1.x.x.x Donor: 1. alkohol 2. aldehyd/keton 3. vazba C-C 4. amin Akceptor: 1. NAD(P)+ 2. cytochrom 3. kyslík 4. feredoxin 6. NAD(P)H 8. sirné sloučeniny 9. cytochromy 11. peroxidasy 12. vodík 13., 14. oxygenasy 15. superoxid
6 Oxidoreduktasy: EC = glukosaoxidasa EC = galaktosaoxidasa EC = NAD(P) + -transhydrogenasa EC = NAD(P)H-oxidasa EC = cytochrom-c-oxidasa EC = laccasa EC = katalasa EC = vodíkdehydrogenasa EC = cyklooxygenasa EC = superoxiddismutasa EC = nitrogenasa
7 Transferasy: EC 2.x.x.x Systematický název česky: donor:akceptor-skupinotransferasa Systematický název anglicky: donor:acceptor grouptransferase Polo-triviální česky: xxxkinasa, xxxtransferasa, xxxsynthasa, xxxfosforylasa, xxxtransaminasa Polo-triviální anglicky: xxx kinase, xxx transferase, xxx synthase, xxx phosphorylase, xxxtransaminase
8 Transferasy: EC Systematický název česky: ATP:NADH-2'-fosfotransferasa Systematický název anglicky: ATP:NADH 2'-phosphotransferase Polo-triviální česky: NADH-kinasa Polo-triviální anglicky: NADH kinase
9 Transferasy: EC 2.x.x.x Skupina: 1. aklyl, hydroxyalkyl, karbamoyl 2. delší řetězce 3. acyl, aminoacyl, 4. glykosyl 6. amino 7. fosfo, nukleotidyl, alkylfosfo 8. sirné skupiny
10 Tranferasy: EC = citrátsynthasa EC = fosforylasa EC = glykogensynthasa EC = thymidinfosforylasa EC = aspartáttransaminasa EC = hexokinasa EC = fosforylasakinasa
11 Hydrolasy: EC 3.x.x.x Systematický název česky: substrát-skupinohydrolasa Systematický název anglicky: substrate grouphydrolase Polo-triviální česky: xxxasa, exo-xxxasa, endo-xxxasa Polo-triviální anglicky: xxxase, exo-xxxase, endo-xxxase Proteasy mají speciální názvosloví!
12 Hydrolasy: EC Systematický název česky: β-d-galaktosid-galaktohydrolasa Systematický název anglicky: β-d-galactoside galactohydrolase Polo-triviální česky: β-galaktosidasa Polo-triviální anglicky: β-galactosidase
13 Hydrolasy: EC 3.x.x.x Skupina: 1. ester, thioester, fosfát, fosfodiester, sulfát, nukleové kyseliny 2. glykosidy 4. proteiny, peptidy 5. amidy, nitrily 6. difosfáty 8. halogenidy
14 Hydrolasy: EC = acetylcholinesterasa EC = alkalická fosfatasa EC = kyselá fosfatasa EC = [fosforylasa]-fosfatasa EC = fosfolipasa C EC = DNasa I EC = α-amylasa EC = β-amylasa EC = celulasa EC = lysozym EC = chymotrypsin EC = trypsin EC = thrombin EC = papain EC = ureasa EC = nitrilasa EC = anorganická difosfatasa EC = F O F 1 -ATPasa
15 Lyasy: EC 4.x.x.x Systematický název česky: substrát-skupinolyasa Systematický název anglicky: substrate group-lyase Polo-triviální česky: xxxdekarboxylasa, xxxdehydratasa, xxxhydratasa, xxxaldolasa, xxxcyklasa, xxxsynthasa Polo-triviální anglicky: xxx decarboxylase, xxx dehydratase, xxx hydratase, xxx aldolase, xxx cyclase, xxx synthase
16 Lyasy: EC Systematický název česky: pyruvát-karboxylyasa Systematický název anglicky: pyruvate carboxy-lyase Polo-triviální česky: pyruvádekarboxylasa Polo-triviální anglicky: pyruvate decarboxylase
17 Lyasy: EC 4.x.x.x Odštěpovaná skupina: 1. dekarboxylace, aldolysace, dehydratace 2. deaminace 4. SH-lyasy 6. cyklasy
18 Lyasy: EC = pyruvátdekarboxylasa EC = fruktosabisfosfát-aldolasa EC = karbonáthydrolyasa EC = cystathionin-β-synthasa EC = argininosukcinátlyasa EC = adenylátcyklasa EC = ferochelatasa
19 Isomerasy: EC 5.x.x.x Systematický název česky: podle katalysované reakce Systematický název anglicky: podle katalysované reakce Podtřídy: recemasy, epimerasy, aldosa-ketosa-isomerasy, keto-enol-isomerasa, disulfid-isomerasy, topoisomerasy a další
20 Isomerasy: EC Systematický název česky: alaninracemasa Systematický název anglicky: alanine racemase Polo-triviální česky: alaninracemasa Polo-triviální anglicky: alanine racemase
21 Isomerasy: EC 5.x.x.x Reakce: 1. racemizace, epimerizace 3. aldosa-ketosa-isomerace, keto-enol-isomerace 99. topoisomerasy
22 Isomerasy: EC = alaninracemasa EC = triosafosfátisomerasa EC = topoisomerasa I EC = topoisomerasa II
23 Ligasy: EC 6.x.x.x Systematický název česky: substrát1:substrát2-ligasa (produkt tvořící) Systematický název anglicky: substrate1:substrate2 ligase (product forming) Polo-triviální česky: xxx-xxx-ligasa, xxxsynthetasa Polo-triviální anglicky: xxx-xxx-ligase, xxxsynthetase
24 Ligasy: EC Systematický název česky: L-tyrosin:tRNA Tyr -ligasa (AMP tvořící) Systematický název anglicky: L-tyrosine:tRNA Tyr ligase (AMP forming) Polo-triviální česky: tyrosin-trna-ligasa, tyrosyl-trna-synthetasa Polo-triviální anglicky: tyrosin-trna ligase, tyrosyl-trna synthetase
25 Ligasy: EC = tyrosin-trna-ligasa EC = mastná kyselina s dlouhým řetězcem-coa-ligasa EC = asparaginsynthetasa EC = acetyl-coa-karboxylasa EC = DNA-ligasa (ATP) EC = DNA-ligasa (NAD + )
26 Na co dát pozor: Složitější reakce: Citrátsynthasa acetyl-coa + oxalacetát + H 2 O citrát + HSCoA lyasa? (adice), hydrolasa? (hydrolysa vazby C-S), transferasa? (přenos acetátu) Od roku 1962 do roku 2002: EC Od roku 2002: EC acetyl-coa:oxaloacetát-c-acetyltransferasa [thioester-hydrolysující, (pro-s)-karboxymethyl-tvořící]
27 Na co dát pozor: Širší substrátová specificita: β-galaktosidasa (β-d-galaktosid-galaktohydrolasa, EC ) laktasa (laktosa-galaktohydrolasa, EC )
28 Na co dát pozor: Více možných reakcí: Xanthindehydrogenasa/oxidasa xanthin + NAD + + H 2 O kys. močová + NADH hypoxanthin + NAD + + H 2 O xanthin + NADH xanthin + O 2 + H 2 O kys. močová + H 2 O 2 změna z dehydrogenasy na oxidasu redukcí disulfidových můstků, částečnou proteolysou, působením těžkých kovů, zmražováním a rozmražováním a podobně
29 Na co dát pozor: Polymerní a proteinové substráty: α-amylasa 4-α-D-glukan-glukanohydrolasa [isocitrátdehydrogenasa (NADP + )]-kinasa ATP:[isocitrátdehydrogenasa (NADP + )]-fosfotransferasa
30 Na co dát pozor: Směr reakce: Hexokinasa (ATP:D-hexosa-6-fosfotransferasa, EC ) Glc + ATP Glc-6-P + ADP Pyruvátkinasa (ATP:pyruvát-2-O-fosfotransferasa, EC ) fosfoenolpyruvát + ADP pyruvát + ATP
31 Na co dát pozor: Enzym nebo enzymový komplex? pyruvátdehydrogenasový komplex: pyruvátdehydrogenasa (E1, EC ) dihydrolipoyltransacetylasa (E2, EC ) dihydrolipoyldehydrogenasa (E3, EC )
32 Zvláštní názvy: Cyklofilin 1984 objeven cyklofilin jako receptor cyklosporinu Handschumacher R.E., Harding M.W., Rice J., Drugge R.J., Speicher D.W. (1984) Science 226, objevena skupina PPIas Fischer G., Bang H., Mech C. (1984) Biomed. Biochim. Acta. 43, bylo zjištěno, že se jedná o stejné proteiny Fischer G., Wittmann-Liebold B., Lang K., Kiefhaber T., Schmid F.X. (1989) Nature 337, obě aktivity jsou víceméně nezávislé Zydowsky L.D., Etzkorn F.A., Chang H.Y., Ferguson S.B., Stolz L.A., Ho S.I., Walsh C.T. (1992) Prot. Sci. 1,
1. OXIDOREDUKTASY (14.) 11 až 18 (různé typy oxygenačních
1. OXIDOREDUKTASY donor + akceptor oxidovaný donor + redukovaný akceptor Systematický název: donor : akceptor-oxidoreduktasa angl.: donor : acceptor oxidoreduktase Triviální názvy: dehydrogenasa reduktasa
Enzymologie. Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol Matej Kohutiar. akad. rok 2017/2018
Enzymologie Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol Matej Kohutiar akad. rok 2017/2018 Osnova I. Základní principy enzymových reakcí II. Termodynamické a kinetické aspekty enzymové
Enzymy: Struktura a mechanismus působení. Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1.LF UK
Enzymy: Struktura a mechanismus působení Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1.LF UK 1 ENZYMY JAKO HOMOGENNÍ BIOKATALYZÁTORY 1. Bílkovinná povaha ( + některé RNA-enzymy - ribozymy) 2.
Historie poznání enzymů
Historie poznání enzymů 1835 Jacob Berzelius katalytická fce diastasy pol. 18.stol. Luis Pasteur vitalismus 1878 Frederic W. Kühn enzym 1894 Emil Fischer teorie zámku a klíče 1897 Büchnerův pokus 1926
ENZYMY. Enzymy - jednoduché nebo složené proteiny, které katalyzují chemické přeměny v organismech
ENZYMY Enzymy - jednoduché nebo složené proteiny, které katalyzují chemické přeměny v organismech Šest hlavních kategorií enzymů: EC 1 Oxidoreduktasy: katalyzují oxidačně/redukční reakce EC 2 Transferasy:
Enzymy. Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc.
Enzymy Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. ENZYMY JAKO HOMOGENNÍ BIOKATALYZÁTORY 1. Bílkovinná povaha ( + některé RNA-enzymy - ribozymy) 2. Větší účinnost (faktor minimálně 10 6 ) 3. Specifičnost - substrátová
Enzymy = biokatalyzátory
Enzymy = biokatalyzátory Enzymy biologické katalyzátory Analogie s chemickými katalyzátory Katalyzátor je jiná látka než reaktant a produkt reakce Zvyšuje rychlost reakce v obou směrech, snižuje aktivační
7. Enzymy. klasifikace, názvosloví a funkce
7. Enzymy klasifikace, názvosloví a funkce Jsou to přírodní katalyzátory, živočišné i rostlinné Umožňují průběh biochemických reakcí Nachází se ve veškerých živých systémech Enzymy vykazují druhovou specifitu
Enzymy = biokatalyzátory
Enzymy = biokatalyzátory Enzymy biologické katalyzátory Analogie s chemickými katalyzátory -katalyzátor je jiná látka než reaktant a produkt reakce -zvyšuje rychlost reakce v obou směrech, snižuje aktivační
1. Napište strukturní vzorce aminokyselin E a W a vzorce guanosinu a uracilu
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2018 1. Napište strukturní vzorce aminokyselin E a W a vzorce guanosinu a uracilu U dalších otázek zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. ENZYMY I úvod, názvosloví, rozdělení do tříd
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ENZYMY I úvod, názvosloví, rozdělení do tříd Úvod z řeckého EN ZYME (v kvasinkách) biologický katalyzátor, protein (RNA) liší se od chemických
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie Napište vzorce aminokyselin Q a K
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2017 1. Napište vzorce aminokyselin Q a K Dále zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná odpověď) 2. Enzym tyrozinkinasu řadíme do třídy
Figure 3-23 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)
Figure 3-23 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008) Dělení bílkovin podle jejich funkce stavební a podpůrné kolageny, elastin, keratiny (fibrilární) bílkoviny cytoskeletu (tubulin, vimentin,
Enzymologie. Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů.
ENZYMOLOGIE 1 Enzymologie Věda ležící na pomezí fyz. ch. a bioch. Zabývá se problematikou biokatalyzátorů. Jak je možné, že buňka dokáže utřídit hrozivou změť chemických procesů, které v ní v každém okamžiku
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Citrátový a glyoxylátový cyklus
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Citrátový a glyoxylátový cyklus Buněčná respirace I. Fáze Energeticky bohaté látky jako glukosa, mastné kyseliny a některé aminokyseliny
Proč biokatalýza? Vyšší reakční rychlost Vyšší specificita reakce Mírnější reakční podmínky Možnost regulace
Enzymy Proč biokatalýza? Vyšší reakční rychlost Vyšší specificita reakce Mírnější reakční podmínky Možnost regulace COO - - COO NH 2 OH - COO NH 2 - COO O OH - COO Chorismate mutase - OOC O OH - COO -
9. Citrátový cyklus, oxidační dekarboxylace pyruvátu a anaplerotické dráhy
9. Citrátový cyklus, oxidační dekarboxylace pyruvátu a anaplerotické dráhy Obtížnost A Vyjmenujte kofaktory, které využívá multienzymový komplex pyruvátdehydrogenasy; které z nich řadíme mezi koenzymy
Citrátový cyklus. Tomáš Kučera.
itrátový cyklus Tomáš Kučera tomas.kucera@lfmotol.cuni.cz Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2. lékařská fakulta, Univerzita Karlova v Praze a Fakultní nemocnice v Motole 2017 Schéma energetického
Charakteristika složky 3) cytochrom-c NADH-Q-reduktasa cytochrom-c- oxidasa ubichinon cytochromreduktasa
8. Dýchací řetězec a fotosyntéza Obtížnost A Pomocí následující tabulky charakterizujte jednotlivé složky mitochondriálního dýchacího řetězce. SLOŽKA Pořadí v dýchacím řetězci 1) Molekulový typ 2) Charakteristika
Syntéza a degradace mastných kyselin. Martina Srbová
Syntéza a degradace mastných kyselin Martina Srbová Mastné kyseliny (fatty acids, FA) většinou sudý počet atomů uhlíku a lineární řetězec v esterifikované formě jako součást lipidů v neesterifikované formě
Ukládání energie v buňkách
Ukládání energie v buňkách Josef Fontana EB - 58 Obsah přednášky Úvod do problematiky zásobních látek lidského organismu Přehled zásobních látek v těle Metabolismus glykogenu Struktura glykogenu Syntéza
Figure 3-23 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)
Figure 3-23 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008) Lidský genom 20 tis. Genů (genom) stovky tisíc proteinů (proteom) Dělení bílkovin podle jejich funkce stavební a podpůrné kolageny, elastin,
1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2019 1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu U dalších otázek zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná
Využití enzymů v medicíně
Využití enzymů v medicíně 1. Stanovení enzymových aktivit diagnosticky významných enzymů 2. Stanovení analytů enzymovými analytickými metodami 3. Enzymy jako terapeutika Enzymy jako diagnostické nástroje
Bp1252 Biochemie. #8 Metabolismus živin
Bp1252 Biochemie #8 Metabolismus živin Chemické reakce probíhající v organismu Katabolické reakce přeměna složitějších látek na jednoduché, jsou většinou exergonické. Anabolické reakce syntéza složitějších
REGULACE ENZYMOVÉ AKTIVITY
REGULACE ENZYMOVÉ AKTIVITY Proč je nutno regulovat enzymovou aktivitu? (homeostasa) Řada úrovní: regulace množství přítomného enzymu (exprese = proteosynthesa, odbourávání) synthesa vhodného enzymu (isoenzymy)
Aminokyseliny, proteiny, enzymologie
Aminokyseliny, proteiny, enzymologie Aminokyseliny Co to je? Organické látky karboxylové kyseliny, které mají na sousedním uhlíku navázanou aminoskupinu Jak to vypadá? K čemu je to dobré? AK jsou stavební
Text zpracovala Mgr. Taťána Štosová, Ph.D PŘÍRODNÍ LÁTKY
Inovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie CZ.1.07/2.2.00/15.0324 Text zpracovala Mgr. Taťána Štosová, Ph.D PŘÍRODNÍ LÁTKY Obsah 1 Úvod do problematiky přírodních látek... 2 2 Vitamíny... 2 2.
Klinicko-biochemická diagnostika
Klinicko-biochemická diagnostika 1. Kvalitativní analýza 2. Semikvantitativní analýza diagnostické proužky 3. Kvantitativní analýza Spektroskopické metody - Absorpční Fotometrie UV/VIS (kolorimetrie) -
10. Metabolismus sacharidů
10. Metabolismus sacharidů Obtížnost A Vysvětlete rozdíly v následujících dvojicích pojmů: aldosa/ketosa; redukující/neredukující sacharid; škrob/glykogen; homopolysacharid/heteropolysacharid; amylosa/amylopektin.
POZNÁMKY K METABOLISMU SACHARIDŮ
POZNÁMKY K METABOLISMU SACHARIDŮ Prof.MUDr. Stanislav Štípek, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1.LF UK v Praze Přehled hlavních metabolických cest KATABOLISMUS Glykolysa Glykogenolysa Pentosový cyklus Oxidace
Rychlost chemické reakce je dána změnou Gibbsovy energie a aktivační energií: Tudíž zrychlení reakce pomocí katalýzy může být vyjádřeno:
Bruno Sopko Rychlost chemické reakce je dána změnou Gibbsovy energie a aktivační energií: Tudíž zrychlení reakce pomocí katalýzy může být vyjádřeno: Z předchozí rovnice vyplývá: Pokud katalýza při 25
Pentosový cyklus. osudy glykogenu. Eva Benešová
Pentosový cyklus a osudy glykogenu Eva Benešová Pentosový cyklus pentosafosfátová cesta, fosfoglukonátová cesta nebo hexosamonofosfátový zkrat Funkce: 1) výroba NADPH 2) výroba ribosa 5-fosfátu 3) zpracování
Redoxní děj v neživých a živých soustavách
Enzymy Enzymy Katalyzují chemické reakce, kdy se mění substrát na produkt Katalytickým působením se snižuje aktivační energie reagujících molekul substrátu, tím se reakce urychlí Za přítomnosti enzymu
Kofaktory enzymů. T. Kučera. (upraveno z J. Novotné)
Kofaktory enzymů T. Kučera (upraveno z J. Novotné) Kofaktory enzymů neproteinová, nízkomolekulární složka enzymu ko-katalyzátor potřebný k aktivitě enzymu pomocné molekuly v enzymové reakci holoenzym (aktivní)
ENZYMOLOGIE. Pracovní sešit k přednáškám z biochemie pro studenty biologických kombinací ZDENĚK GLATZ
EZYMLGIE Pracovní sešit k přednáškám z biochemie pro studenty biologických kombinací II ZDEĚK GLATZ 2004 Katalýza - Berzelius 1838 2 EZYMLGIE katalyzátor - látky urychlující chemické reakce - nemění rovnováhu
kofaktory nejsou: - stabilizující sloučeniny - allosterické aktivátory - post-translační modifikace mimo aktivní místo - proteinové podjednotky
Kofaktory, koenzymy a prosthetické skupiny kofaktory nízkomolekulární sloučeniny potřebné pro enzymovou katalýzu, účastní se katalýzy - koenzymy - prosthetické skupiny - kovalentní modifikace aminokyselinových
Úvod do buněčného metabolismu Citrátový cyklus. Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1. LF UK
Úvod do buněčného metabolismu Citrátový cyklus Prof. MUDr. Jiří Kraml, DrSc. Ústav lékařské biochemie 1. LF UK METABOLISMUS = přeměna látek v organismu - má stránku chemickou (látkovou) - reakce anabolické
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolusmus lipidů - anabolismus
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Metabolusmus lipidů - anabolismus LIPIDY Zásobárna energie Hlavní složka buněčných membrán Pigmenty (retinal, karoten), kofaktory (vitamin
11. Metabolismus lipidů
11. Metabolismus lipidů Obtížnost A Následující procesy a metabolické reakce, vedoucí ke zkrácení řetězce mastné kyseliny, vázané v triacylglycerolu, a vzniku acetyl-coa, seřaďte ve správném pořadí: a)
Stanovení vybraných enzymů. Roman Kanďár
Stanovení vybraných enzymů Roman Kanďár Takže prvně malé opakování ENZYM Protein (RNA) s katalytickou aktivitou Protein (RNA) kofaktor (prosthetická skupina, koenzym) Jaký je vlastně rozdíl mezi prosthetickou
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolismus sacharidů II
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Metabolismus sacharidů II NUTNO ZNÁT VSTUP TĚCHTO ZÁKLADNÍCH MONOSACHARIDŮ DO GLYKOLÝZY Glykogen glukosa hlavní zdroj energie pro metabolismus
Katabolismus. I. fáze aminokyseliny. II. fáze. III. fáze. proteiny. lipidy. polysacharidy. Glycerol + mastné kyseliny. glukosa ETS
Katabolismus proteiny I. fáze aminokyseliny polysacharidy glukosa lipidy Glycerol + mastné kyseliny II. fáze III. fáze ETS Acetyl-CoA (= AcSCoA nebo AcCoA) N 2 N N C 3 N N N C 2 C C C C 2 C 3 P P - 2 C
7. Roztok NaOH má ph = 10. Jaké bude výsledné ph, zředíme-li tento roztok 10x vodou? a) ph = 9 b) ph = 8,5 c) ph = 11,1 d) ph = 1
1. Ve které z dvojic sloučenin jsou oxidační čísla přechodných prvků stejná? a) NaFeO 2, Na 2 Fe(SO 4 ) 2 b) BaFeO 4, K 2 MnO 4 c) Ag 2 SO 4, K 4 [Fe(CN) 6 ] d) Na 2 CrO 4, Ti(SO 3 ) 2 2. Kolik valenčních
ENZYMY. Klasifikace enzymů
ENZYMY Enzymy jsou bílkoviny, které katalyzují chemické reakce probíhající v živých organismech. Byly identifikovány tisíce enzymů, mnohé z nich byly izolovány čisté. Klasifikace enzymů Vzhledem k tomu,
HISTORIE ENZYMOLOGIE
ENZYMY HISTORIE ENZYMOLOGIE 1. Berzelius (18.stol.) v rostlinách i živočiších probíhají tisíce katalyzovaných reakcí FERMENTY fermentace (Fabrony) 2. W.Kühne en zýme = v kvasnicích enzymy 3. J. Sumner
14. Detoxikace amoniaku. ornithinový cyklus, odbourání nukleotidů
14. Detoxikace amoniaku ornithinový cyklus, odbourání nukleotidů METABOLISMUS AMONIAKU Aminoskupiny se použijí: při synthese dusík obsahujících částí biomolekul sloučenin (aminokyseliny puriny a pirimidiny,
Aminokyseliny. Aminokyseliny. Peptidy & proteiny Enzymy Lipidy COOH H 2 N. Aminokyseliny. Aminokyseliny. Postranní řetězec
optická aktivita Peptidy & proteiny Enzymy Lipidy α-uhlík je asymetrický pouze L-aminokyseliny 2 α R rozdělení dle polarity podle počtu karboxylových skupin podle počtu bazických skupin podle polarity
POLYPEPTIDY. Provitaminy = organické sloučeniny bez vitaminózního účinku, které se v živočišném těle mění působením ÚV záření nebo enzymů na vitaminy.
POLYPEPTIDY Provitaminy = organické sloučeniny bez vitaminózního účinku, které se v živočišném těle mění působením ÚV záření nebo enzymů na vitaminy. Hormony = katalyzátory v živočišných organismech (jsou
Katabolismus - jak budeme postupovat
Katabolismus - jak budeme postupovat I. fáze aminokyseliny proteiny polysacharidy glukosa lipidy Glycerol + mastné kyseliny II. fáze III. fáze ETS itrátový cyklus yklus trikarboxylových kyselin, Krebsův
Metabolizmus aminokyselin I
Metabolizmus aminokyselin I Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol MUDr. Bc. Matej Kohutiar, Ph.D. matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2018 snova I. přednáška: Metabolizmus a meziorgánové
Oxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech
Citrátový cyklus Oxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech 1. stupeň: OXIDACE cukrů, tuků a některých aminokyselin tvorba Acetyl-CoA a akumulace elektronů v NADH a FADH 2 2.
Enzymy. Názvosloví enzymů
Enzymy Enzymy jsou bílkoviny, které působí jako biologické katalyzátory. Podobně jako ostatní katalyzátory snižují aktivační energii chemické reakce a tím urychlují její průběh. Enzymy neovlivňují hodnotu
Metabolismus lipidů. Biosyntéza mastných kyselin a triacylglycerolů. Lenka Fialová kařské biochemie 1. LF UK. Hlavní rysy biosyntézy mastných kyselin
Metabolismus lipidů Biosyntéza mastných kyselin a triacylglycerolů Lenka Fialová Ústav lékal kařské biochemie 1. LF UK Hlavní rysy biosyntézy mastných kyselin syntéza MK může probíhat ve většině živočišných
Metabolizmus aminokyselin II
Metabolizmus aminokyselin II Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol MUDr. Bc. Matej Kohutiar, Ph.D. matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2018 Degradace uhlíkové kostry aminokyselin
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolismus dusíkatých látek
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Metabolismus dusíkatých látek Oxidace aminokyselin Podíl AK na metabolické E se silně liší dle organismu a jeho momentálních potřeb, např.
Hlavní koncepty a příprava dokumentace, III. část
Hlavní koncepty a příprava dokumentace, III. část Látky UVCB Gabriele CHRIST http://echa.europa.eu 1 Látka UVCB neznámé (Unknown) nebo proměnlivé (Variable) složení komplexní (Complex) reakční produkt
4. Enzymy. Obtížnost A
4. Enzymy btížnost A Enzymy a) zvyšují rychlost chemických reakcí tím, že zvyšují jejich aktivační energii; b) zvyšují rovnovážný výtěžek chemické reakce tím, že zvyšují hodnotu rovnovážné konstanty; c)
Funkce Kofaktory enzymů aktivní formy enzymová aktivita Další funkce Specifické AA Nespecifické Další látky Vitaminy?? specifická funkce??
YDRFILÍ VITAMIY Funkce Kofaktory enzymů aktivní formy enzymová aktivita Další funkce Specifické AA especifické Další látky Vitaminy?? specifická funkce?? deficience?? potřeba?? Thiamin Vitamin B1 + 3 2
CZ.1.07/2.2.00/ Obecný metabolismu. Cyklus trikarboxylových kyselin (citrátový cyklus, Krebsův cyklus) (8).
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii Z.1.07/2.2.00/28.0171 becný metabolismu. yklus trikarboxylových kyselin (citrátový cyklus, Krebsův cyklus) (8). Prof. RNDr.
Vrozené (metabolické) choroby
Vrozené (metabolické) choroby A. E. Garrod - 1908 - alkaptonurie, cystinurie, pentosurie, albinismus Geneticky podmíněna nepřítomnost nebo modifikace specifických proteinů Příčiny = mutace bodová delece
Metabolismus dusíkatých látek
Metabolismus dusíkatých látek Bílkoviny (aminokyseliny) Nukleové kyseliny (nukleotidy) Koloběh dusíku v biosféře Koloběh dusíku v biosféře: 1: působení hlízkovitých bakterií; 2: asimilace pomocí nitrátreduktasy
Chemická reaktivita NK.
Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin Bi7015 Chemická reaktivita NK. Hydrolýza NK, redukce, oxidace, nukleofily, elektrofily, alkylační činidla. Mutageny, karcinogeny, protinádorově
METABOLISMUS MONOSACHARIDŮ
METABOLISMUS MONOSACHARIDŮ Metabolismus monosacharidů (zejména jejich katabolismus) je prakticky metabolismem glukosy. Ostatní monosacharidy z ní v případě potřeby vznikají, nebo jsou na ni několika reakcemi
DYNAMICKÁ BIOCHEMIE. Daniel Nechvátal :: www.gymzn.cz/nechvatal
DYNAMICKÁ BIOCHEMIE Daniel Nechvátal :: www.gymzn.cz/nechvatal Energetický metabolismus děje potřebné pro zabezpečení života organismu ANABOLISMUS skladné reakce, spotřeba E KATABOLISMUS rozkladné reakce,
Enzymy. Názvosloví enzymů
Enzymy Enzymy jsou bílkoviny, které působí jako biologické katalyzátory. Podobně jako ostatní katalyzátory snižují aktivační energii chemické reakce a tím urychlují její průběh. Enzymy neovlivňují hodnotu
AMINOKYSELINY REAKCE
CHEMIE POTRAVIN - cvičení AMINOKYSELINY REAKCE Milena Zachariášová (milena.zachariasova@vscht.cz) Ústav chemie a analýzy potravin, VŠCHT Praha REAKCE AMINOKYSELIN část 1 ELIMINAČNÍ REAKCE DEKARBOXYLACE
Otázka: Metabolismus. Předmět: Biologie. Přidal(a): Furrow. - přeměna látek a energie
Otázka: Metabolismus Předmět: Biologie Přidal(a): Furrow - přeměna látek a energie Dělení podle typu reakcí: 1.) Katabolismus reakce, při nichž z látek složitějších vznikají látky jednodušší (uvolňuje
Metabolismus mikroorganismů
Metabolismus mikroorganismů Metabolismus organismů Souvisí s metabolismem polysacharidů, bílkovin, nukleových kyselin a lipidů Cytoplazma, mitochondrie (matrix, membrána) H 3 PO 4 Polysacharidy Pentózový
ANABOLISMUS SACHARIDŮ
zdroj sacharidů: autotrofní org. produkty fotosyntézy heterotrofní org. příjem v potravě důležitou roli hraje GLUKÓZA METABOLISMUS SACHARIDŮ ANABOLISMUS SACHARIDŮ 1. FOTOSYNTÉZA autotrofní org. 2. GLUKONEOGENEZE
Brno e) Správná odpověď není uvedena. c) KHPO4. e) Správná odpověď není uvedena. c) 49 % e) Správná odpověď není uvedena.
Brno 2019 1. Vyberte vzoreček hydrogenfosforečnanu draselného. a) K2HP4 d) K3P4 b) K(HP4)2 c) KHP4 2. Vyjádřete hmotnostní procenta síry v kyselině thiosírové. Ar(S) = 32, Ar() = 16, Ar(H) = 1 a) 28 %
12. Metabolismus lipidů a glycerolu. funkce karnitinu a β-oxidace
12. Metabolismus lipidů a glycerolu funkce karnitinu a β-oxidace LIPOPROTEINY Řadí se mezi složené lipidy Vznikají spojením (hydrofobními interakcemi nepolárních oblastí obou složek) lipidů se specifickými
Stanovení aktivity enzymů
Stanovení aktivity enzymů Obecné schema: Detekce enzymu chceme zjistit, jestli je ve vzorku aktivní enzym Stanovení katalytické aktivity chceme zjistit kolik je ve vzorku aktivního enzymu Měření katalytických
Odbourávání lipidů, ketolátky
dbourávání lipidů, ketolátky Josef Fontana EB - 56 bsah přednášky Energetický význam TAG Jednotlivé dráhy metabolismu lipidů lipidy jako zdroj energie degradace TAG v buňkách, β-oxidace MK tvorba a využití
Integrace a regulace savčího energetického metabolismu
Základy biochemie KBC / BCH Integrace a regulace savčího energetického metabolismu Inovace studia biochemie prostřednictvím e-learningu CZ.04.1.03/3.2.15.3/0407 Tento projekt je spolufinancován Evropským
Obecný metabolismus.
mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii CZ.1.07/2.2.00/28.0171 Obecný metabolismus. Regulace glykolýzy a glukoneogeneze (5). Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Katedra biochemie,
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Glykolýza a neoglukogenese
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Glykolýza a neoglukogenese z řečtiny glykos sladký, lysis uvolňování sled metabolických reakcí od glukosy přes fruktosa-1,6-bisfosfát
pátek, 24. července 15 GLYKOLÝZA
pátek,. července 15 GLYKLÝZ sacharosa threalosa laktosa sacharasa threlasa laktasa D-glukosa D-fruktosa T T hexokinasa T hexokinasa glykogen - škrob fosforylasa D-galaktosa UD-galaktosa UD-glukosa fruktokinasa
Regulace metabolických drah na úrovni buňky
Regulace metabolických drah na úrovni buňky EB Obsah přednášky Obecné principy regulace metabolických drah na úrovni buňky regulace zajištěná kompartmentací metabolických dějů změna absolutní koncentrace
Eva Benešová. Dýchací řetězec
Eva Benešová Dýchací řetězec Dýchací řetězec Během oxidace látek vstupujících do různých metabolických cyklů (glykolýza, CC, beta-oxidace MK) vznikají NADH a FADH 2, které následně vstupují do DŘ. V DŘ
Intermediární metabolismus. Vladimíra Kvasnicová
Intermediární metabolismus Vladimíra Kvasnicová Vztahy v intermediárním metabolismu (sacharidy, lipidy, proteiny) 1. po jídle (přísun energie z vnějšku) oxidace CO 2, H 2 O, urea + ATP tvorba zásob glykogen,
Metabolismus xenobiotik. Vladimíra Kvasnicová
Metabolismus xenobiotik Vladimíra Kvasnicová XENOBIOTIKA = sloučeniny, které jsou pro tělo cizí 1. VSTUP DO ORGANISMU trávicí trakt krev JÁTRA plíce krev kůže krev Metabolismus xenobiotik probíhá nejvíce
Historie. Pozor! né vždy jen bílkovinná část
Enzymy a hormony Enzymy = biokatalyzátory jejich působení je umožněn souhrn chemických přeměn v organismu (metabolismus) jednoduché, složené bílkoviny globulární v porovnání s katalyzátory účinnější, netoxické,
Metabolizmus aminokyselin II
Metabolizmus aminokyselin II Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol dr. Matej Kohutiar, doc. Jana Novotná matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2017 Degradace uhlíkové kostry aminokyselin
Metabolické dráhy. František Škanta. Glykolýza. Repetitorium chemie X. 2011/2012. Glykolýza. Jaký je osud pyruátu bez přítomnosti kyslíku?
Repetitorium chemie X. 2011/2012 Metabolické dráhy František Škanta Metabolické dráhy xidativní fosforylace xidace mastných kyselin 1. fosforylace 2. štěpení hexosy na dvě vzájemně převoditelné triosy
nepolární polární kyselý bazický
opticky aktivní rozdělení α-uhlík je asymetrický pouze L-aminokyseliny (D-aminokyseliny: bakterie, antibiotika, ) 2 α R podle počtu karboxylových skupin podle počtu aminoskupin podle polarity postranního
METABOLISMUS SACHARIDŮ
METABOLISMUS SACHARIDŮ PRINCIP Rozštěpené sacharidy vstřebávání střevní sliznicí do krevního oběhu dopraveny vrátnicovou žílou do jater. V játrech enzymaticky hexózy štěpeny na GLUKÓZU vyplavována do krve
Metabolismus aminokyselin I. Jana Novotná 2. LF UK, Ústav lékařské chemie a klinické biochemie
Metabolismus aminokyselin I Jana Novotná 2. LF UK, Ústav lékařské chemie a klinické biochemie Metabolismus aminokyselin PROTEINY Z POTRAVY GLYKOLÝZA KREBSŮV CYCLUS Proteosyntéza Trávení Transaminace TĚLESNÉ
Sacharidy a polysacharidy (struktura a metabolismus)
Sacharidy a polysacharidy (struktura a metabolismus) Sacharidy Živočišné tkáně kolem 2 %, rostlinné 85-90 % V buňkách rozličné fce: Zdroj a zásobárna energie (glukóza, škrob, glykogen) Výztuž a ochrana
OXIDATIVNÍ FOSFORYLACE
OXIDATIVNÍ FOSFORYLACE OBSAH Mitochondrie Elektronový transport Oxidativní fosforylace Kontrolní systém oxidativního metabolismu. Oxidace a syntéza ATP jsou spojeny transmembránovým tokem protonů Dýchací
Regulace enzymových aktivit
Regulace enzymových aktivit Regulace enzymových aktivit: Změny množství enzymu v kompartmentu, buňce, orgánu: - změna exprese, degradace atd. - změna lokalizace Skutečné regulace: - aktivace/inhibice nízkomolekulárními
Karbonylové sloučeniny
Aldehydy a ketony Karbonylové sloučeniny ' edoxní reakce Nukleofilní adice Aldolová kondenzace aldehyd formaldehyd = keton Aldehydy a ketony edoxní reakce aldehydů/ketonů E + Aldehydy oxidace mírnými oxidačními
Rychlost vzniku produktu podle rovnice Michaelise-Mentenové: je maximální rychlost max je maxim i saturaci substrátem: v = K = (k + k )/k
ENZYMOVÉ BIOSENSORY BIOKATALYTICKÉ SENSORY rekognikační prvek je enzym = bílkovina, která biokatalyticky přemění určitý specifický substrát na produkt. V nejjednodušším případě lze popsat schématem: k
Konsultační hodina. základy biochemie pro 1. ročník. Přírodní látky Úvod do metabolismu Glykolysa Krebsův cyklus Dýchací řetězec Fotosynthesa
Konsultační hodina základy biochemie pro 1. ročník Přírodní látky Úvod do metabolismu Glykolysa Krebsův cyklus Dýchací řetězec Fotosynthesa Přírodní látky 1 Co to je? Cukry (Sacharidy) Organické látky,
Karboxylové kyseliny
Karboxylové kyseliny Názvosloví pokud je karboxylováskupina součástířetězce, sloučenina mákoncovku -ovákyselina. Pokud je mimo řetězec má sloučenina koncovku karboxylová kyselina. butanová kyselina cyklohexankarboxylová
CYKLUS TRIKARBOXYLOVÝCH KYSELIN A GLYOXYLÁTOVÝ CYKLUS
YKLUS TRIKARBXYLVÝ KYSELIN A GLYXYLÁTVÝ YKLUS BSA Základní charakteristika istorie Pyruvátdehydrogenasový komplex itátový cyklus dílčí reakce itátový cyklus výtěžek itátový cyklus regulace Anapleroticé
1. ročník Počet hodin
SOUSTAVY LÁTEK A JEJICH SLOŽENÍ rozdělení přírodních látek a vlastnosti chemických látek soustavy látek a jejich složení STAVBA ATOMU historie pohledu na atom složení a struktura atomu stavba atomu VELIČINY
Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/34.0211. Anotace. Metabolismus sacharidů. VY_32_INOVACE_Ch0216.
Vzdělávací materiál vytvořený v projektu VK Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí svobození 20 Číslo projektu: Název projektu: Číslo a název klíčové aktivity: CZ.1.07/1.5.00/34.0211 Zlepšení podmínek
BIOCHEMICKÉ METABOLICKÉ DRÁHY PRO STUDENTY VFU BRNO
VETERINÁRNÍ A FARMACEUTICKÁ UNIVERZITA BRNO Fakulta veterinární hygieny a ekologie Ústav biochemie a biofyziky (Projekt IVA 2014FVHE/2110/018) BIOCHEMICKÉ METABOLICKÉ DRÁHY PRO STUDENTY VFU BRNO VETERINÁRNÍ
Metabolismus krok za krokem - volitelný předmět -
Metabolismus krok za krokem - volitelný předmět - Vladimíra Kvasnicová pracovna: 411, tel. 267 102 411, vladimira.kvasnicova@lf3.cuni.cz informace, studijní materiály: http://vyuka.lf3.cuni.cz Sylabus