Genetické parametry a plemenná hodnota pro hodnocení JUT skotu systémem SEUROP Ing. Zdeňka Veselá, Ph.D. vesela.zdenka@vuzv.cz
Hodnocení jatečně upravených těl systémem SEUROP Hmotnost JUT Zmasilost 6 tříd (S,E,U,R,O,P) Přečíslována 1 = P až 6 = S Protučnělost 5 tříd (1,2,3,4,5)
Hodnocení jatečně upravených těl systémem SEUROP Odhad plemenných hodnot Irsko, Švédsko, Francie, Norsko, Dánsko Interbeef plánuje zahrnout do mezinárodního hodnocení Aktuálně odstavová hmotnost Další plánované znaky: Hmotnost JUT (S)EUROP klasifikace zmasilosti a protučnělosti Obtížnost porodu
Cíl práce Výběr vhodného modelu Odhad genetických parametrů Odhad plemenných hodnot
Materiál Soubor od PLEMDAT 959224 zvířat (48% býci) Poražených 2004 2010
40% 35% 30% 25% 20% 15% 10% 5% Frekvence podle věku při porážce 0% 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26
40% 35% 30% Frekvence podle věku při porážce 25% 20% 15% 61,41% zvířat poraženo do 2 let 10% 5% 0% 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26
Soubor pro odhad plemenných hodnot Vyřazení Zvířat hodnocených v roce 2004 a 2005 Zvířata poražena ve vyšším věku než 900 dní Věk < 200 dní Hmot JUT < 150 kg Neprůkazné rodokmeny (22% souboru) Netto přírůstek od narození do porážky menší, či větší než 3SO od průměru uvnitř skupiny dle věku při porážce (v rocích) a pohlaví Chybné a chybějící údaje
Frekvence podle kategorie v celém souboru A - mladý býk (31,9%) B - býk (16%) C - volek (0,2%) D - kráva (42,7%) E - jalovice (9,2%)
Frekvence podle kategorie v souboru mladých zvířat A - mladý býk (57%) B - býk (31%) C - volek (0,3%) D - kráva (0,5%) E - jalovice (11,2%)
Frekvence podle užitkového typu Masný 14% Dojený 86%
Frekvence podle hodnocení zmasilosti v celém souboru 60% 50% 40% 30% 34,1% 41,8% 20% 10% 0% 16,8% 8,2% 0,2% 0,0% P O R U E S
Frekvence podle hodnocení zmasilosti v souboru mladých zvířat 60% 50% 48,3% 40% 35,0% 30% 20% 10% 0% 8,7% 7,7% 0,2% 0,0% P O R U E S
Frekvence podle hodnocení zmasilosti v souboru mladých zvířat masných plemen 60% 55,7% 50% 40% 30% 20% 19,1% 20,9% 10% 0% 2,3% 2,0% 0,0% P O R U E S
70% Frekvence podle hodnocení protučnělosti v celém souboru 60% 50% 54,3% 40% 30% 20% 10% 0% 26,7% 12,2% 5,2% 1,0% 1 2 3 4 5
Frekvence podle hodnocení protučnělosti v souboru mladých zvířat 70% 65,0% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% 22,0% 10,6% 2,2% 0,2% 1 2 3 4 5
Frekvence podle hodnocení protučnělosti v souboru mladých zvířat masných plemen 70% 65,4% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% 21,3% 10,5% 2,6% 0,3% 1 2 3 4 5
Frekvence podle plemene v souboru mladých zvířat Plemeno Jedinců % ČESTR 138209 41,1 Ayshire 244 0,1 Braunvieh 328 0,1 Jersey 168 0,0 Holštýn 154367 45,9 Normandský skot 302 0,1
Frekvence podle plemene v souboru mladých zvířat Plemeno Jedinců % Charolais 16174 4,8 Limousine 4944 1,5 Hereford 2940 0,9 Galloway 762 0,23 Aberdeen angus 9816 2,9 Blonde d Aquitaine 1820 0,5 Piemontese 3508 1,0 Belgické modré 1647 0,5 Gasconne 577 0,2 Salers 528 0,2 Highland 261 0,1
Frekvence podle podílu krve hlavního plemene Podíl krve % 100% 43,1 75 99% 33,6 50 74% 23,3
Soubory pro odhad genetických parametrů Masná plemena Podmínky: 5 polosourozenců po otci 5 jedinců ve skupině vrstevníků 5 hodnocených jedinců klasifikátorem 19178 jedinců s hodnocením SEUROP 78069 jedinců v rodokmenu
Model pro odhad genetických parametrů a plemenných hodnot Multitrait model pro všechny znaky společně HMOT JUT ZMAS PROT
Model pro odhad genetických parametrů a plemenných hodnot Zohledněné prostřeďové efekty Klasifikátor fixní efekt SRO (skupina vrstevníků) náhodný efekt Chov rok období - jatka Heterozní efekt fixní lineární regrese Věk při porážce * pohlaví * plemeno Fixní regrese na věk při porážce pomocí Legendreova polynomu druhého stupně Samostatně podle plemene a pohlaví
Vliv klasifikátorů na výsledky hodnocení JUT metodou SEUROP Poměrně vysoký především u hodnocení zmasilosti a protučnělosti Směrodatné odchylky vlivu klasifikátora HMOT JUT 20,86 ZMAS 0,52 PROT 0,34
Vliv SRO na výsledky hodnocení JUT metodou SEUROP Vyšší, než u klasifikátorů pro HMOT JUT Nižší, než u klasifikátorů pro ZMAS a PROT Směrodatné odchylky vlivu SRO HMOT JUT 28,20 ZMAS 0,24 PROT 0,27
Vliv heterozního efektu na hodnocení JUT metodou SEUROP Poměrně nízký HMOT JUT 4,49 ZMAS - 0,01 PROT 0,03
Hmotnost JUT (kg) Závislost hmotnosti JUT na věku při porážce (ve dnech) 250 200 150 100 50 0 200 300 400 500 600 700 800 900-50 Věk při porážce (dny)
Zmasilost (body) Závislost hodnocení zmasilosti na věku při porážce (ve dnech) 2 1,5 1 0,5 0 200 300 400 500 600 700 800 900 Věk při porážce (dny)
Protučnělost (body) Závislost hodnocení protučnělosti na věku při porážce (ve dnech) 2 1,5 1 0,5 0 200 300 400 500 600 700 800 900 Věk při porážce (dny)
Koeficienty dědivosti h 2 (na diagonále) a genetické korelace σ g HMOT ZMAS PROT HMOT 0,26 0,78 0,48 ZMAS 0,22 0,16 PROT 0,12
Koeficienty dědivosti h 2 (na diagonále) a genetické korelace σ g HMOT ZMAS PROT HMOT 0,26 0,78 0,48 ZMAS 0,22 0,16 PROT 0,12
Koeficienty dědivosti h 2 (na diagonále) a genetické korelace σ g HMOT ZMAS PROT HMOT 0,26 0,78 0,48 ZMAS 0,22 0,16 PROT 0,12
Model pro odhad genetických parametrů a plemenných hodnot Vysoká korelace mezi HMOT a ZMAS PH pro ZMAS budou velmi podobné jako PH pro HMOT Možnost očistit PH pro ZMAS a PROT o HMOT pomocí regrese Multitrait model pro zmasilost a protučnělost Přidán efekt Hmotnost JUT fixní regrese pomocí Legendreova polynomu druhého stupně ČZMAS, ČPROT
Koeficienty dědivosti h 2 (na diagonále) a genetické korelace σ g ČZMAS ČPROT ČZMAS 0,13-0,44 ČPROT 0,11
Koeficienty dědivosti h 2 (na diagonále) a genetické korelace σ g ČZMAS ČPROT ČZMAS 0,13-0,44 ČPROT 0,11
Koeficienty dědivosti h 2 (na diagonále) a genetické korelace σ g ČZMAS ČPROT ČZMAS 0,13-0,44 ČPROT 0,11
Hodnocení (body) Závislost hodnocení zmasilosti a protučnělosti na hmotnosti JUT 2 1,5 1 0,5 ZMAS PROT 0 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600-0,5-1 Hmotnost (kg)
Hodnocení (body) Závislost hodnocení zmasilosti a protučnělosti na hmotnosti JUT 2 1,5 Vyšší genetická korelace mezi HMOT a ZMAS 1 0,5 ZMAS PROT 0 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600-0,5-1 Hmotnost (kg)
Odhad plemenných hodnot Do výpočtu vstupují všechna mladá zvířata dojená i masná S cílem využití co největšího množství informací Vstupní genetické parametry získané pro masná plemena S cílem získat PH pro masná plemena Ale využít i vzájemné provázanosti a příbuznosti s dojenými plemeny
Soubor pro odhad plemenných hodnot 336595 poražených jedinců 1126926 jedinců v rodokmenu 97 jatek 196 klasifikátorů 13789 chovů 6840 otců
Soubor pro odhad plemenných hodnot Prům SO Min Max HMOT 336,2 65,4 150 804 ZMAS 2,65 0,78 1 6 PROT 2,16 0,64 1 5
Průměrné plemenné hodnoty pro hmotnost JUT podle plemen Limousine Charolais Salers Gasconne Normandský skot Blonde d'aquitaine Belgické modré Aberdeen angus Piemontesse Highland ČESTR Hereford Braunvieh Galloway Holštýn Jersey Ayshire -15,0000-10,0000-5,0000 0,0000 5,0000 10,0000 15,0000 20,0000 Plemenné hodnoty
Průměrné plemenné hodnoty pro zmasilost podle plemen Belgické modré Limousine Salers Charolais Piemontesse Blonde d'aquitaine Gasconne Normandský skot Highland ČESTR Galloway Aberdeen angus Hereford Braunvieh Jersey Ayshire Holštýn -0,3-0,2-0,1 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 Plemenné hodnoty
Průměrné plemenné hodnoty pro čistou zmasilost (ČZMAS) podle plemen Belgické modré Piemontesse Salers Limousine Charolais Blonde d'aquitaine Gasconne Galloway Highland Normandský skot ČESTR Hereford Aberdeen angus Jersey Ayshire Braunvieh Holštýn -0,3-0,2-0,1 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 Plemenné hodnoty
Průměrné plemenné hodnoty pro protučnělost podle plemen Aberdeen angus Ayshire Hereford Holštýn ČESTR Highland Jersey Normandský skot Charolais Braunvieh Blonde d'aquitaine Gasconne Salers Limousine Galloway Belgické modré Piemontesse -0,2-0,15-0,1-0,05 0 0,05 0,1 Plemenné hodnoty
Průměrné plemenné hodnoty pro čistou protučnělost (ČPROT) podle plemen Ayshire Hereford Aberdeen angus Jersey Holštýn ČESTR Braunvieh Highland Galloway Normandský skot Blonde d'aquitaine Charolais Gasconne Salers Limousine Belgické modré Piemontesse -0,2-0,15-0,1-0,05 0 0,05 0,1 Plemenné hodnoty
Vztah SEUROP k ostatním vlastnostem u masného skotu 1. Polní test 10 PH pro 5 vlastností (maternální efekt) 2. Odchovny plemenných býků 1 PH pro 1 vlastnost - vlastní přírůstek býků 3. Popis zevnějšku mladých zvířat 10 PH pro 10 znaků 4. SEUROP 3 (resp. 5) PH pro 3 vlastnosti
Korelace PH pro SEUROP s PH pro polní test HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT PHobt 0,02-0,13-0,19-0,09-0,11 PHnar 0,10 0,22 0,25 0,04 0,00 PH120 0,14-0,04-0,15-0,06-0,15 PH210 0,13-0,04-0,15-0,04-0,13 PH365 0,19 0,19 0,14 0,09-0,02 Maobt -0,02 0,13 0,19 0,05 0,07 Manar -0,16-0,13-0,07 0,06 0,15 Ma120 0,01 0,12 0,16 0,09 0,09 Ma210 0,01 0,13 0,17 0,08 0,08 Ma365 0,06 0,13 0,14 0,02-0,01
Korelace PH pro SEUROP s PH pro polní test HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT PHobt 0,02-0,13-0,19-0,09-0,11 PHnar 0,10 0,22 0,25 0,04 0,00 PH120 0,14-0,04-0,15-0,06-0,15 PH210 0,13-0,04-0,15-0,04-0,13 PH365 0,19 0,19 0,14 0,09-0,02 Maobt -0,02 0,13 0,19 0,05 0,07 Manar -0,16-0,13-0,07 0,06 0,15 Ma120 0,01 0,12 0,16 0,09 0,09 Ma210 0,01 0,13 0,17 0,08 0,08 Ma365 0,06 0,13 0,14 0,02-0,01
Korelace PH pro SEUROP s PH pro polní test HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT PHobt 0,02-0,13-0,19-0,09-0,11 PHnar 0,10 0,22 0,25 0,04 0,00 PH120 0,14-0,04-0,15-0,06-0,15 PH210 0,13-0,04-0,15-0,04-0,13 PH365 0,19 0,19 0,14 0,09-0,02 Maobt -0,02 0,13 0,19 0,05 0,07 Manar -0,16-0,13-0,07 0,06 0,15 Ma120 0,01 0,12 0,16 0,09 0,09 Ma210 0,01 0,13 0,17 0,08 0,08 Ma365 0,06 0,13 0,14 0,02-0,01
Korelace PH pro SEUROP s PH pro přírůstky býků v odchovnách HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT Odchovny 0,08 0,03-0,01 0,10 0,05
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT KRIZ -0,07-0,06-0,07 0,00 0,04 DELKA -0,07-0,05-0,05 0,03 0,06 HMOT -0,07-0,11-0,15 0,12 0,15 SHR 0,20 0,23 0,18-0,03-0,14 HLHR 0,07 0,06 0,02 0,07 0,02 ZAD 0,34 0,42 0,37-0,15-0,34 OPLEC 0,28 0,33 0,31-0,13-0,27 OHRBET 0,25 0,33 0,31-0,13-0,26 OZAD 0,39 0,48 0,43-0,20-0,41 TYP 0,34 0,38 0,31-0,10-0,28
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT KRIZ -0,07-0,06-0,07 0,00 0,04 DELKA -0,07-0,05-0,05 0,03 0,06 HMOT -0,07-0,11-0,15 0,12 0,15 SHR 0,20 0,23 0,18-0,03-0,14 HLHR 0,07 0,06 0,02 0,07 0,02 ZAD 0,34 0,42 0,37-0,15-0,34 OPLEC 0,28 0,33 0,31-0,13-0,27 OHRBET 0,25 0,33 0,31-0,13-0,26 OZAD 0,39 0,48 0,43-0,20-0,41 TYP 0,34 0,38 0,31-0,10-0,28
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT KRIZ -0,07-0,06-0,07 0,00 0,04 DELKA -0,07-0,05-0,05 0,03 0,06 HMOT -0,07-0,11-0,15 0,12 0,15 SHR 0,20 0,23 0,18-0,03-0,14 HLHR 0,07 0,06 0,02 0,07 0,02 ZAD 0,34 0,42 0,37-0,15-0,34 OPLEC 0,28 0,33 0,31-0,13-0,27 OHRBET 0,25 0,33 0,31-0,13-0,26 OZAD 0,39 0,48 0,43-0,20-0,41 TYP 0,34 0,38 0,31-0,10-0,28
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT KRIZ -0,07-0,06-0,07 0,00 0,04 DELKA -0,07-0,05-0,05 0,03 0,06 HMOT -0,07-0,11-0,15 0,12 0,15 SHR 0,20 0,23 0,18-0,03-0,14 HLHR 0,07 0,06 0,02 0,07 0,02 ZAD 0,34 0,42 0,37-0,15-0,34 OPLEC 0,28 0,33 0,31-0,13-0,27 OHRBET 0,25 0,33 0,31-0,13-0,26 OZAD 0,39 0,48 0,43-0,20-0,41 TYP 0,34 0,38 0,31-0,10-0,28
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT ČPROT KRIZ -0,07-0,06-0,07 0,00 0,04 DELKA -0,07-0,05-0,05 0,03 0,06 HMOT -0,07-0,11-0,15 0,12 0,15 SHR 0,20 0,23 0,18-0,03-0,14 HLHR 0,07 0,06 0,02 0,07 0,02 ZAD 0,34 0,42 0,37-0,15-0,34 OPLEC 0,28 0,33 0,31-0,13-0,27 OHRBET 0,25 0,33 0,31-0,13-0,26 OZAD 0,39 0,48 0,43-0,20-0,41 TYP 0,34 0,38 0,31-0,10-0,28
Závěr Vypočteny PH a genetické parametry Odhad PH připravený pro rutinní využití Odhadovat PH pro čistou ZMAS a PROT?
Děkuji za pozornost