KLINICKÁ MIKROBIOLOGIE gastriontestinální a sexuálně přenosné infekce MUDr. Pavel Čermák, CSc.
Běžná flóra GIT tlusté střevo / téměř vše / dutina ústní / koky / neustálá obnova
Běžně sterilní oblasti jícen žaludek duodenum + žlučové cesty jejunum horní ileum / dolní ileum - fekální flóra / - problematická diagnostika
Střevní infekce Původce průjmu /3 /3 /3 Infekce interní onem. obžerství bakteriální inf. virové inf. bakteriální enterokolitida enterotoxikóza (S.aureus) exotoxin!!!
Patogenní střevní bakterie ČR Salmonella enteritidis 90% Salmonella typhimurium Campylobacter sp. Shigella sonnei, Shigella flexneri Yersinia enterocolitica Vibrio cholerae E. coli děti enteropatogenní, enterotoxigenní enteroinvazivní, enterohemorhag. dospělí cestovatelský průjem jiné enterobakterie = NESMYSL
Taxonomie salmonel 2005 rod Salmonella má 2 druhy: S. enterica (dříve cholerasuis) S. bongori (dříve subspec. V) S. enterica má 6 podspecies: S. enterica enterica S. enterica salamae S. enterica arizonae, S.e.diarizonae S. enterica houtenae S. enterica bongon S. enterica indica Kauffman-Whiteova klasifikace podle tělových O a bičíkových H antigenů 2000 sérotypů, zjednodušený zápis Salmonella Enteritidis (,9,2;g,m) = S. enterica enterica enteritidis
Salmonely 997 FN HK Salm. enteritidis Salm. typhimurium Salm. skup. C isolace pacienti 497 642 5 5 3
Salmonely 997 FN HK počet 800 700 600 500 400 300 200 00 0.dec. 2.dec. 3.dec. 4.dec. 5.dec. 6.dec. 7.dec. isolace pacienti
Salmonely 997 FN HK počet 450 400 350 300 250 200 50 00 50 0.dec. 2.dec. 3.dec. 4.dec. 5.dec. 6.dec. 7.dec. isol.ženy pac.ženy isol.muži pac.muži
salmonelové infekce primárně patogenní pro člověka tyfus, paratyfus Klinika - slabé střevní příznaky - bolesti hlavy, septické teploty - postižení mezenterických uzlin - rezervoár - žlučník primárně zoopatogenní průjmová onemocnění Klinika - průjmy - u oslabených sepse - metastatické infekce - nosičství až několik měsíců zdroj práci, drůbež v ČR 2x více infekcí než v záp. Evropě sporadický výskyt x epidemie
Shigella sp. 997 FN HK isolace pacienti Shigella flexneri 3 2 Shigella sonnei
shigelové infekce S. sonnei, S. flexneri, S. dysenteriae, S. boydii vředy v tlustém střevě shiga toxin Klinika - průjmy s tenesmy - hlen a krev ve stolici Abb. : Verlauf einer Shigella-Infektion () Shigella flexneri dringt durch die M-Zellen in das Dickdarmepithel ein. (2) Infektion und Apoptose des Makrophagen. (3) Infektion über die basolaterale Zellmembran und intraund interzelluläre Ausbreitung von S. flexneri mithilfe des Zellskeletts der Wirtszelle. (4) Neutrophile durchdringen das Epithel und führen zu einer neuen Welle der bakteriellen Infektion.
Campylobacter sp. 997 C.jejuni isolace 2x u 2 pacientů, v současné době některými autory považován za nejčastější mikroaerofilní vibria střevní trakt teplokrevných zvířat - drůbež, ovce, prasata inkubace 2-0 dní, často děti krátkodobá enteritida /5-7 dní/ ATB - makrolidy, chloramfenikol Dg. - transportní půda
Toxiny E. coli St. aureus Clostridium difficile Clostridium botuli enterotoxigenní terolab. a terostab. Toxin enterohemorh. - Verotoxin,2 enterotoxin toxin A - enterotoxin toxin B - nekrotoxin neurotoxin
Bakteriální střevní infekce souhrn Vehikulum Salmonelly - vajíčka + výrobky Shigelly - voda (Balkán, jih bývalého SSSR) Campylobacter - kuřata nemocný perzonál Vždy nedodržení technologie přípravy potravin nedodržení předpisů pro manipulaci a úschovu potravin
Bakteriální střevní infekce souhrn Klinika Průjem Šok Sepse Salmonella - nutná masivní infekce Shigella - stačí min. počet zárodků Enterotoxikóza - těžký průběh, rychlá restaurace Botulismus!!! - nejčastěji ze zeleniny Dg. - klasická kultivace, záchytnost silně kolísá (30-50%) Terapie - dle kliniky, symptomatická (náhrada tekutin) - ATB pouze u septických stavů, malých dětí prodlužují nosičství (Salm. jsou intracelulární, ukryjí se v bb. střev. sliz. exacerbace)
Viry - pouze patogeny - /3 průjmů Rotaviry RNA - mláďata savců - 5 skupin, nejvíce A /6serotypů/ Inkubace - 4 dny Enterotoxin - protrin NSP Očkování kojenců
Rotaviry - FN HK 997 počet 35 30 25 20 5 0 5 0. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 0.. 2. měsíce vyšetření pozit.pac.
Viry Nekultivovatelné adenoviry Caliciviry DNA typy 40 a 4 - průjmy malých dětí RNA winter womiting disease - starší děti, dospělí Norwalk virus, SRS virus Lokální epidemie gastroenteritid Mexico virus, Bristol-like virus, Garlington-like virus
hepatoviry virus zařazení genom přenos imunizace HAV Picornaviridae, Hepatovirus RNA fekálně - orální pasivní, aktivní HBV HCV Hepadnoviridae, Orthohepadnovirus Flaviviridae, Hepacivirus DNA RNA parenterální parenterální pasivní, aktivní HDV Deltovirus RNA parenterální HEV Caliciviridae RNA fekálně - orální HGV Virus přenášený transfuzí parenterální inkubační doba: HAV 5 45 dní HAB 30 80 dní přechod do chronicity 0% HCV 5 60 dní přechod do chronicity 70-90% HDV 30 80 dní
diagnostika HAV, HBV ELISA
hepatitidy terapie symptomatická HBV alfainterferon,amivudin HCV alfa interferon, ribavirin Prevence HAV hygiena nemoc špinavých rukou sexuální praktiky HBV infikovaná krev, jakékoliv tělesné tekutiny bezpečný sex HCV infikovaná krev gamaglobulin nespecifický specifický očkování
Střevní prvoci Bičíkovci Měňavky Výtrusovci Nálevníci Giardia intestinalis Chilomastix mesnili Entamoeba histolytica - amébová dysnterie Entamoeba coli, hartmanni, pelecki Endolimax nana Cryptosporidium sp. - průjmy /AIDS/ Balantidium coli - ulcerosní kolitidy
Červi - tenké střevo Motolice Fasciolopsis buski /vodní rostliny/ Hlísti oblí Trichostrongylus sp. Ascaris lumbricoides Ancylostoma duodenale Necator americanus Strongyloides stercoralis /přežvýkavci/ /člověk, prase/ /člověk/ /člověk, pes, kočka/
Červi - tenké střevo Tasemnice Diphyllobothrium latum Taeniarhynchus saginatus Taenia solium Hymenolepsis nana Diphylidum caninum / ryby / / hovězí / / vepřové / / hlodavci / / psi /
Červi - tlusté střevo 997-3560 vyšetření od 942 pacientů Hlísti oblí Enterobius vermicularis 997-439 isolací od 252 pacientů Trichiuris trichiura 997 2 isolace od 2 pacientů
Listeriové infekce nálezy listerií v potravinách zvýšený výskyt listeriových infekcí v ČR medializace problému? jaký je skutečný výskyt prokázaných listeriových infekcí => retrospektivní studie záchytu listerií mikrobiologickými metodami v letech 997-2006
listérie podmíněný patogen u zvířat (dobytek, ptáci, ryby) L. monocytogenes, L. ivanovii, L. inocua. problém potravinářského průmyslu prostředí masokombinátů zpracování mléka zpracování ryb kontaminace průmyslově vyráběných potravin veškeré masné výrobky (vepřové, hovězí) rybí výrobky (saláty atd) sýry (zrající)
listériové infekce Patogeneze primárně GIT infekce inaparentní až nespecifické chřipkové onemocnění intrauterinní postižení plodu Oslabení jedinci meningitídy sepse infekce novorozence velmi těžký průběh!!! Dg. kultivace, PCR (likvor, krev) Terapie ampicilin!!! fluorochinolony, azitromycin
Celkový trend výskytu onemocnění způsobená listeriemi 9 8 7 6 5 4 3 2 0 997 998 999 2000 200 2002 2003 2004 2005 2006 počet
Výsledky 33 7 9 4 3 celkem 9 7 2006 2 2005 3 2 2004 3 2003 3 2 2002 4 2 200 3 2 2000 999 2 998 3 997 meningitis sepse meningitis sepse celkem dospělý dítě
Úmrtí na listeriovou infekci dítě dospělý celkem 997 2 998 999 2000 200 3 3 2002 2003 2004 2005 2006 celkem 8 9
Rozbor diagnóz pacientů s listeriovou infekcí děti dospělí Diagnoza nízká porodní hmotnost bakterální sepse novorozence bakteriální meningitida bakteriální meningitida hematoonkolog. onemocnění selhání ledvin sepse jiná 5 3 5 (8) 2(7) 2 4 nejčastěji hematoonkologické onemocnění těžké poškození ledvin různé etiologie terapie kortikoidy (nejčastěji OCHPN) diabetes a obezita alkoholismus výjimka zdravý sportovec (alkohol + gastronomický exces???)
Záchyt listerií v klinických vzorcích vzorek hemokultura likvor PCR likvor zvukovod aspirat žaludeční pupek krk oko pochva stolice počet 36 9 5 4 4 3 2 2 2 PCR likvoru 8x pozitivní při negativní kultivaci výtěr z krku pozitivní u novorozenců generalizovaná infekce stolice generalizovaná Infekce novorozence pochva matky novorozenců s listeriovou infekcí
prediktivní mikrobiologie potravinářský průmysl normy pro přítomnost vybraných mikrobů některých bakterií se nelze zbavit..listérie jsou vždy obsaženy v potravinách!!! Problém transportu a uskladnění - v obchoníchřetězcích - v domácnosti znalost růstových vlastností bakterií - propočet kvantity v potravině do spotřeby - úprava norem, spotřební lhůty
Sexuálně přenosné infekce (STD) Původce Viry - herpesviry, retroviry (HIV,2) Patogen Bakterie - N.gonorrhoeae Treponema pallidum Chlamydia trachomatis Dysmikrobie (vaginóza) Ureaplasma urealytikum Gardnerella vaginalis streptokoky beta hemol. sk.b kvasinky
Sexuálně přenosné infekce (STD) Běžná vaginální flóra - laktobacily, PK- stafylokoky, koryneformní bakterie, alfa streptokoky (30% žen) Klinika muži ženy gonokoky +++ 0 - + chlamydie 0 - ++ 0 - ++ kvas.,strep.b, ostatní b. 0 +++ Chlamydie - eroze dělož. čípku karcinom? Gard. vagin. - vaginóza - klin. syndrom (mírný výtok, pálení, bolesti atd.)
Sexuálně přenosné infekce (STD) Dg. mikroskopie (GO) IF (chlamydie), kultivace, serol. Nejčastější přenos Terapie GO - peniciliny, cefalosporiny chlamydie, ureapl. - tetracykliny, makrolidy, chinolony ostatní - dle citlivosti Obtížné, dlouhodobé - 4 denní intracelul.cyklus!pokud možno všechny partnery!
Sexuálně přenosné infekce (STD) lidské papilomaviry (HPV) HPV 6, condylomata accuminata HPV 6, 8, 45 - karcinom děložního čípku vakcinace virus lidského imunodeficitu HIV subtypů HIV 2 3 subtytpy přenos krví, spermatem, sliny méněčasto buňky s CD4 + receptory makrofágy a lymfocyty cytotoxické T lymf. CD8 + antigen p24, vysoká virémie snadné šíření pokles virémie, rovnovážný stav vyčerpání organismu, pokles CD4+ oportunní infekce terapie inhibitory reversní transkriptázy, virové proteázy, vstupu HIV do buňky