Heteronukleární korelační experimenty



Podobné dokumenty
Struktura a dynamika proteinů a peptidů

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

(9) X-X a X-Y korelace zvýšení spektrálního rozlišení

Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů

Homonukleární 1 H- 1 H korelační experimenty

Autor: martina urbanová, jiří brus. Základní experimentální postupy NMR spektroskopie pevného stavu

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

PRINCIPY A APLIKACE VÍCEROZMĚRNÉ NMR SPEKTROSKOPIE TUHÉHO STAVU V PŘÍRODNÍM IZOTOPOVÉM SLOŽENÍ

(10) NMR pevné fáze a proteiny

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

Základy NMR 2D spektroskopie

ZÁKLADNÍ EXPERIMENTÁLNÍ

spinový rotační moment (moment hybnosti) kvantové číslo jaderného spinu I pro NMR - jádra s I 0

Techniky přenosu polarizace cross -polarizace a spinová difuse

2D NMR spektroskopie v pevné fázi spinová difuze a separace lokálních polí

Nukleární Overhauserův efekt (NOE)

Metody spektrální. Metody molekulové spektroskopie NMR. Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti

NMR spektroskopie pevného stavu

Nukleární Overhauserův efekt (NOE)

Analýza směsí, kvantitativní NMR spektroskopie a využití NMR spektroskopie ve forenzní analýze

interakce t xx A2 A1, A4

LEKCE 7. Interpretace 13 C NMR spekter. Využití 2D experimentů. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova) ppm

Naše NMR spektrometry

LEKCE 3b. Využití 2D experimentů k přiřazení složitější molekuly. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova) ppm

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

Spektra 1 H NMR. Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský

COSY + - podmínky měření a zpracování dat ztráta rozlišení ve spektru. inphase dublet, disperzní. antiphase dublet, absorpční

Seminář NMR. Mgr. Zdeněk Moravec, Ph.D.; Ústav chemie, PřF MU,

Experimentální data pro určení struktury proteinu

Využití NMR spektroskopie pro studium biomakromolekul RCSB PDB

LEKCE 2b. NMR a chiralita, posunová činidla. Interpretace 13 C NMR spekter

Strukturní analýza. NMR spektroskopie

Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice. konfigurace na dvojné vazbě a na šestičlenných kruzích konformace furanosového kruhu TOCSY

Vybrané kapitoly z praktické NMR spektroskopie

Nukleární magnetická rezonance (NMR)

Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice

Dekapling, koherentní transfer polarizace, nukleární Overhauserův jev

NMR spektroskopie Instrumentální a strukturní analýza

Fyzika biopolymerů. Struktura a vlastnosti vody, vodíková vazba

Vznik NMR signálu a jeho další osud.

Interakce fluoroforu se solventem

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti LC-NMR 1. Jan Sýkora

Spektrální metody NMR I. opakování

Stereochemie 7. Přednáška 7

OPVK CZ.1.07/2.2.00/

Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii

Jiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)

Vznik NMR signálu a jeho další osud.

INTERAKCE IONTŮ S POVRCHY II.

NMR biomakromolekul RCSB PDB. Progr. NMR

BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ

projekce spinu magnetické kvantové číslo jaderného spinu - M I

Fluorescenční rezonanční přenos energie

12.NMR spektrometrie při analýze roztoků

Nekovalentní interakce

Optické spektroskopie 1 LS 2014/15

Nekovalentní interakce

LEKCE 2a. Interpretace 13 C NMR spekter. NMR a chiralita, posunová činidla. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova)

Měření a interpretace NMR spekter

LABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) Použití GC-MS spektrometrie

Anizotropní interakce v pevných látkách (CSA, DC, MAS, dipolární dekaplink)

Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek

Postup při interpretaci NMR spekter neznámého vzorku

Dvourozměrná NMR spektroskopie metody

Základy Mössbauerovy spektroskopie. Libor Machala

Techniky měření a interpretace NMR spekter. Bohumil Dolenský VŠCHT Praha místnost A28 linka 4110

Základy NIR spektrometrie a její praktické využití

Korelační spektroskopie jako základ multidimensionální NMR spektroskopie

Vznik NMR signálu a jeho další osud.

02 Nevazebné interakce

LEKCE 1b. Základní parametry 1 H NMR spekter. Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

Metody analýzy povrchu

Ing.Branislav Ruttkay-Nedecký, Ph.D., Ing. Lukáš Nejdl

Spektrální metody NMR I

SPEKTROSKOPIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE

Metody analýzy povrchu

Charakterizace koloidních disperzí. Pavel Matějka

Techniky prvkové povrchové analýzy elemental analysis

Měření a interpretace NMR spekter

Chem. Listy 106, (2012) ppm. (c)

10/21/2013. K. Záruba. Chování a vlastnosti nanočástic ovlivňuje. velikost a tvar (distribuce) povrchové atomy, funkční skupiny porozita stabilita

PLYNOVÁ CHROMATOGRAFIE (GC)

Tepelné rozklady železo obsahujících sloučenin pohledem Mössbauerovy spektroskopie

Metody pro studium pevných látek

Ultrazvuková defektoskopie. Vypracoval Jan Janský


P ro te i n o vé d a ta b á ze

Metody pro studium pevných látek

Mikroskopie se vzorkovací sondou. Pavel Matějka

Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*

Základní parametry 1 H NMR spekter

Co je litografie? - technologický proces sloužící pro vytváření jemných struktur (obzvláště mikrostruktur a nanostruktur)

Řešení struktury proteinů pomocí NMR spektroskopie

O Minimální počet valencí potřebných ke spojení vícevazných atomů = (24 C + 3 O + 7 N 1) * 2 = 66 valencí

Relaxace jaderného spinu

České vysoké učení technické v Praze Fakulta jaderná a fyzikálně inženýrská. Příloha formuláře C OKRUHY

O tom, co skrývají centra galaxíı. F. Hroch. 26. březen 2015

Transkript:

() jiri brus eteronukleární korelační eperimenty = ±lg ±lg +lg -lg +lg -lg +lg +lg -lg +lg -lg +lg -lg kz AM 9 ±±±y LGPI ±±±y ±±±y : - - - - - - - - - - t t C: ±±± ±±± t f t f - - - r ττ ττ r rotor period t D korelační MR v pevné fázi 99- dekaplink Mimorezonanční podmínka LG( ) = ω Doba trvání jednoho pulsu Pak následuje změna fáze a offsetu π τ = ω LG( ) = ω τ odpovídá π rotaci kolem efektivního pole. van Rossum BJ.; Foerster.; De Groot JM. igh-field and igh-speed -MAS C MR eteronuclear Dipolar-Correlation Spectroscopy of Solids with Frequency-Switched Lee Goldburg omonuclear, J. Magn. Reson.,, (99). - - -

ptimalizace Pro výkon dekaplovacího pole pl hledáme optimální offset. Adamantan!# C /MAS MR : 9 ±y LG-CW C: ptimalizace offsetu. ffset = 9. kz. kz. kz. kz. kz 9. kz D - C ETCR Jednovazebné korelace 9 ±y ±y : - - t Velmi krátká doba přenosu polarizace kontaktní doba - µs. 9 C: t 9 9 9

D - C ETCR Vzdálené korelace Prodlužující se doba přenosu polarizace až na ms. 9 9 (A) µs -C /-C -C;C;C -C9 - C -C -C -C -C9 -C -C -C -C9 -C (B) 9 µs -C -C 9-C -C /-C /-C 9-C -C -C -C /- C -C -C -C9 -C -C -C /-C -C9 (C) µs /-C D -C ETCR Vzdálené korelace 9 ±y ±y : - - t C: LG t t Η Pro každý rozlišený spinový pár - C lze naměřit dipolární interakční konstantu a odhadnout meziatomovou vzdálenost. Χ Η Χ διπολαρ σπεχτρυµ

- C kontakty: dipolární spektroskopie Rozšířený D eperiment. ms. ms 9 ±y ±y LG. ms : - - t t C: t Strukturní fragmenty D - C -LG ETCR Form II -p -o 9 9 -m -i -p 9. ms Structural fragments determined from ssmr spectra. ms -C9 -C9 -C9. ms 9-C 9-C -C() -Ci -Ci o-ci -C -C ( )-C -C -C() -C -C ar-c -C -C C C 9 C 9 i o m p -C -C9 -C -C -C -C -C ()-C (ar)-c ar-c ar-c -C -C -C C

Strukturní fragmenty - geometrická omezení C- -LG ETCR v porovnání s XRPD výsledky Upřesněná XRPD struktura Strukturní fragmenty získané z ssmr spekter C 9 C 9 i o m p C C Ar C C C C C D - C ETCR - selektivita 9 9 D - C ETCR MR s klasickou cross-polarizací 9 ±y ±y : - - t C: t - - C C 9 9 D - C ETCR MR s mimorezonanční LG cross-polarizací 9 ±y ±y : - - LG - C C: t t

D - C ETCR - C Štafetový přenos polarizace 9 9 9 -C 9 9-C 9-C /-C 9-C /-C /-C - Během delší doby se velká část magnetizace rozfázuje, ale také nastává spinová difuze a magnetizace se šíří mezi vodíky a teprve po jisté době se přenese do vzdálenějších C. Korelační signály reflektují - - C transfer. To je výhodné pro detekci intermolekulárních kontaktů. D - C ETCR krystalový disorder Chlorofyl a/ Alifatické řetězce Korelační signály jsou trošku skloněny disperze a C posunů je korelovaná malé nehomogenní rozšíření: nepatrné změny v konformaci alifatických ocásků. Polycylikcká část Korelační signály jsou paralelní s osou žádná disperze C posunů zcela krystalické konformačně uniformní: protorová separace obou částí molekuly.

Aplikace: nano-heterogeneous networks Epoy-siloane networks D MAS MR spectrum - C ETCR C : t 9 Miing LG. ( ) C: t t m = ms. ( ) Aplikace: ano-heterogeneous networks I..... Epoy-siloane networks Spin diffusion t / eq = ms / t eq / = ms/... q, nm - signál @ 9 C;. I SAXS q =. nm - ξ =.9 nm. t m /,µs /. nm : t 9 Miing LG C: t nm nm Brus J. et al., Self-organization, structure, dynamic properties, and surface morphology of silica/epoy films as seen by solid-state MR, SAXS, and AFM, Macromolecules (); :.

Aplikace: uspořádání v lipidové membráně Colicin Ia Částečně zabořený do lipidové membrány rychlá spinová difuze. : T filter 9 t Miing LG C: t DA Řetězce jsou pouze na povrchu pomalá spinová difuze. Daniel uster, Xiaolan Yao, and Mei ong. Membrane Protein Topology Probed by Spin Diffusion from Lipids Using Solid-State MR Spectroscopy, J. Am. Chem. Soc., VL.,.,. Aplikace: mikrokrystalické proteiny Lokalizace vody detekce MR signálu A. Böckmann, M. Juy, E. Bettler, L. Emsley, A. Galinier, F. Penin, A. Lesage, Water Protein ydrogen Echange in the Micro-Crystalline Protein Crh as bserved by Solid State MR Spectroscopy, Journal of Biomolecular MR, 9 (). Mikrokrystalický protein Crh (catabolite repression histidine containing phsphocarrier protein) Anne Lesage,Lyndon Emsley,Francois Penin,and Anja Bockmann, Investigation of Dipolar-Mediated Water-Protein Interactions in Microcrystalline Crh by Solid-State MR Spectroscopy, J Am Chem Soc, (). D - C ETCR mikrokrystalický systém Detekce imobilizovaných i pohyblivých molekul (rezidenčníčas jednotky ns) Přímá chemická výměna - Detekce zcela imobilizovaných a fiovaných molekul (rezidenčníčas jednotky µs)

D - C MQC-J-MAS maimální selektivita 9 ±y : - - - - ±y C: τ τ o o 9 ( ) τ, J IS,, MAS 9 ( ) I z I S I zs y ( ) J IS MAS I S y Ω ( ), o (C) I S y 9 o τ I zs y,,, S MQC-J-MAS. C magnetizace (S ). t S podle skalární interakce J C na anti-fázovou I z S y. a MAS - potlačí II a IS dipolární interakce + CSA. 9 ( ) - anti-fázovou I z S y na dvoukvantovou I S y. t koherence I S y se vyvíjí podle chemického posunu. ( C) refokusace C chemického posunu. DQ koherence necitlivá na J C,, MAS a ( C). 9 ( ) - dvoukvantovou I S y na anti-fázovou I z S y 9. t anti-fázová I z S y se refokusuje podle J C na S. detekce Inverzní detekce a gradientová spektroskopie Veniamin Chevelkov, et al. Detection in MAS Solid-State MR Spectroscopy of Biomacromolecules Employing Pulsed Field Gradients for Residual Solvent Suppression, J. Am. Chem. Soc.,. Speciální podmínky pro inverzní eperiment:. /MAS sonda s gradientovými cívkami. Peptidy, proteiny.. Plné obohacení deuteriem + následná výměna labilních D na.. Potlačení signálů zbytkové vody vzorky musí být hydratované 9

C C C Ar C C Souhrn a jeho optimalizace D ETCR 9 ±±±y ±±±y : - - t C: t Selektivita, LG a MQC-J-MAS 9 ±y : - - - - ±y C: τ τ Solid-state MR and. D ETCR Spinová difuse a morfologie polymerů Inverzní detekce