Lékařská Mykologie. Mykologické vyšetřovací metody a zpracování materiálu

Podobné dokumenty
Odběr a transport biologického materiálu do mikrobiologické laboratoře. Jana Juránková OKM FN Brno

Odběr a transport biologického materiálu do mikrobiologické laboratoře. Jana Juránková OKM FN Brno

OBSAH DG. MIKROSKOPICKÁ /4/ NATIVNÍ PREPARÁTY BARVENÉ PREPARÁTY FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE DG. MYKOLOGICKÁ /5/ DG.

Kontakt Telefon: Služba : ATB :

V lednici (2 8 C) Do 24 hod dní BK - 50 dnů. Uricult Při pokojové teplotě Do hod dní. Při pokojové teplotě

Využití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči. Marek Protuš

Využití molekulárně-biologických postupů a multimarkerových strategií v intenzívní péči. Marek Protuš

Interpretace výsledků bakteriologických vyšetření

Odběry vzorků u pacientů s podezřením na infekci krevního řečiště

Diagnostické metody v lékařské mikrobiologii

MIKROBIOLOGICKÁ LABORATOŘ NEMOCNICE ŠUMPERK

Zkušenosti s diagnostikou sepse pomocí testu SeptiFast Test M GRADE. Zdeňka Doubková Klinická mikrobiologie a ATB centrum VFN Praha

EUC Laboratoře s.r.o. EUC Laboratoře Praha Palackého 720/5, Praha 1

VÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII

Výskyt a význam infekce Borna disease virem u pacientů léčených

Odběry biologického materiálu. Markéta Vojtová VOŠZ a SZŠ Hradec Králové

Aplikace molekulárně biologických postupů v časné detekci sepse

Diagnostika ostatních střevních patogenů. V. IBD pracovní dny, Hořovice 2019 Jana Matějková

C 16 Zásady odběrů biologického materiálu

Diagnostická laboratoř Praha. Laboratorní příručka Příloha č.1. Přehled vyšetření prováděných v Laboratoři klinické mikrobiologie

EUC Laboratoře s.r.o. EUC Laboratoře Praha Palackého 720/5, Nové Město, Praha 1

Speciální odběrové soupravy krácená verze pro tisk. Odběrové soupravy pro odběr žilní krve

Výchozí dokumenty: Definice:

Příloha č.3. název specifikace druh odebrané odběrové podmínky skladování poznámky frekvence zpracování

Syfilis přehledně. MUDr.Hana Zákoucká Odd. STI, NRL pro syfilis, Státní zdravotní ústav ROCHE

SeptiFast. rychlá detekce sepse. Olga Bálková Roche s.r.o., Diagnostics Division

Mikrobiologické vyšetření jako podklad pro racionální cílenou antibiotickou terapii. Význam správné indikace vyšetření a dodržování

IMUNOBACT s.r.o.,kamenická 566/42, Děčín II

Fakultní nemocnice Brno Laboratoře Oddělení klinické mikrobiologie Jihlavská 20, Brno

Kapitola III. Poruchy mechanizmů imunity. buňka imunitního systému a infekce

PCT kontrolovaná ATB terapie nosokomiální pneumonie ventilovaných nemocných

Mikroskopie versus kultivace, kdy, komu a proč? Jan Kestřánek PGK, FNHK

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Vyšetření: 1. Kvantitativní stanovení látkové koncentrace kyseliny močové [Kyselina močová] fotometricky

Molekulárně biologické metody v mikrobiologii. Mgr. Martina Sittová Jaro 2014

MUDr. Wezdenková Kateřina Laboratoře Mikrochem a.s., Šumperk

M a s a r y kův onko l o g i c k ý ú s t a v. Ž l u t ý k o p e c 7, B r n o, ED.9. RNDr. Martina Mrkvicová, Ph.D. Schválil dne: 4.1.

Cíle: Obecné zásady při odběru vzorků pro bakteriologické vyšetření

Poslední trendy krevních odběrů. Mgr. Tomáš Grim Mgr. Zuzana Kučerová

STŘEDNÍ ZDRAVONICKÁ ŠKOLA KROMĚŘÍŽ SPECIÁLNÍ FARMAKOLOGIE KLINICKÁ PROPEDEUTIKA ANTIMYKOTIKA ROČNÍK: 3. ŠKOLNÍ ROK: 2012 / 2013

Interpretace sérologických nálezů v diagnostice herpetických virů. K.Roubalová

Lékařská mikrobiologie II

VNL. Onemocnění bílé krevní řady

Příručka k odběru biologického materiálu pro vyšetření prováděná na OKM

Automatizace v klinické mikrobiologii

Interpretace mykologických nálezů

kultivační tampon v TPA pokojová teplota, 24 hod. 3 dny sterilní zkumavka, sterilní 2-8ºC, 18 hod. pokojová teplota, 1 hod. pokojová teplota, 24 hod.

Sérologická diagnostika chřipky možnosti a diagnostická úskalí

Přínos metody ELISPOT v diagnostice lymeské boreliózy

Vyšetření likvoru u pacientů s mozkovou kryptokokózou - kasuistiky pacientů

Zkušenosti s laboratorní diagnostikou infekcí virem Zika. Hana Zelená NRL pro arboviry Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě

Příloha č.5 Seznam PCR vyšetření

Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení

SARS - Severe Acute Respiratory Syndrome (těžký akutní respirační syndrom).

PREGRADUÁLNÍ VZDĚLÁVÁNÍ V LÉKAŘSKÉ MIKROBIOLOGII

synlab czech s.r.o. U Vojenské nemocnice 1200, Praha 6

název počet, specifikace druh odebrané odběrové podmínky skladování poznámky venózní krev srážlivá krev 5 ml sterilní zkumavka

Manuál laboratorních vyšetření

Kultivační vyšetření. Chcete vědět víc?

Komplexní pohled na laboratorní diagnostiku Chlamydia pneumoniae

PERTUSE diagnostika a klinické projevy. Vilma Marešová I.infekční klinika UK 2.LF a IPVZ FN Na Bulovce, Praha

IMUNOBACT s.r.o.,kamenická 566/42, Děčín II

Metody testování humorální imunity

LÉČBA VENTILÁTOROVÉ PNEUMONIE SPOLUPRÁCE INTENZIVISTY A MIKROBIOLOGA

Metody testování humorální imunity

List provedených změn

krku, mandlí, hltanu A kultivační tampon v TPA pokojová teplota, 24 hod. 3 dny Neisseria meningitidis, MRSA - označit na žádance cílené kultivační na

Epidemiologie spály. MUDr. František BEŇA

Vystavení žádanek. Biologický materiál je možno vyšetřit

METODICKÝ LIST. TÉMA: ÚVOD punkce

Maturitní témata. Předmět: Ošetřovatelství

Dodává: GALI spol. s r.o., Ke Stadionu 179, Semily tel fax

Program. 29.dubna :00 17:00 pre-workshop

Lékařská mikrobiologie

RNDr K.Roubalová CSc.

Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 744/2017 ze dne:

Ascites Paracentéza. Tomáš Fejfar. Tato prezentace je spolufinancována Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.

Metamorfózy SIRS pohled mikrobiologa. Dana Němcová Oddělení klinické mikrobiologie PLM IKEM Ostrava

Obsah. IMUNOLOGIE Imunitní systém Anatomický a fyziologický základ imunitní odezvy... 57

LABORATORNÍ PŘÍRUČKA ODDĚLENÍ PARAZITOLOGIE,

Suchá krevní skvrna (Suchá krevní kapka, Dried Blood Spot)

Novorozenecká sepse a její diagnostická úskalí. Jan Hálek, Anna Medková Novorozenecké oddělení a Dětská klinika FNO

IFCOR-99, s.r.o. Laboratoř IFCOR-99 Viniční 235, Brno

POMOC PRO TEBE CZ.1.07/1.5.00/

Praktické využití serologických metod

Biochemická laboratoř

Varovné meze a jejich hlášení. Nahrazuje dokument I-ÚLBLD-1 Varovné meze a jejich hlášení vyd.5, zm.1 ze dne

ProGastrin-Releasing Peptide (ProGRP) u nemocných s malobuněčným karcinomem plic

prezentace OKMP 1

Virus klíšťové encefalitidy (TBEV)

LÉKAŘSKÁ VYŠETŘENÍ A LABORATORNÍ TESTY

Laboratorní diagnostika spalniček. A. Vinciková, E. Jílková Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem

VÍME VŠE O PREVENCI NEMOCNIČNÍ INFEKCÍ SPOJENÝCH S KATETRIZACÍ CENTRÁLNÍ ŽÍLY?

IMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE CYTOMEGALOVIROVÉ INFEKCE

Odečítání bakteriologie Foto: archiv MÚ

KARTA POVINNÉ PRAXE V KLINICKÉ LABORATOŘI

Příloha č.4 Seznam imunologických vyšetření. Obsah. Seznam imunologických vyšetření

Mykologická laboratoř dermatovenerologické kliniky. VFN a 1.LF FVL

AKTUÁLNÍ DOPORUČENÍ MIKROBIOLOGICKÉ DIAGNOSTIKY A ANTIBIOTICKÉ LÉČBY INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY 21ST COLOURS OF SEPSIS, OSTRAVA

Transkript:

Lékařská Mykologie Mykologické vyšetřovací metody a zpracování materiálu

Diagnostika fungálních infekcí Klinické příznaky anamnéza fyzikální vyšetření zobrazovací metody Odběr vzorku kožní a nehtové šupiny, moč, sputum, BAL, krev, mozkomíšní mok, pleurální výpotek, peritoneální tekutina, tkáňová biopsie, katetry apod. přímá mikroskopie histopatologie kultivace serodiagnostické testy PCR

ANAMNÉZA a FYZIKÁLNÍ VYŠETŘENÍ soubor všech údajů (relevantních situaci) o zdravotním stavu pacienta od narození do současnosti Základní data o pacientovi Nynější onemocnění (NO) - postupný vznik a vývoj subjektivně pociťovaných příznaků a jejich vztah k činnostem, které nemocný prováděl, jak se nemocný snažil postupovat před tím, než vyhledal lékařskou pomoc Alergologická anamnéza (AA) Abúzus / Toxikologická anamnéza (TA) Rodinná anamnéza (RA) Osobní anamnéza (OA) - prodělaná onemocnění, horečnaté stavy, úbytky na váze, nechutenství, apod. Gynekologická anamnéza (GA) Farmakologická anamnéza (FA) Pracovní anamnéza (PA) Sociální anamnéza (SA) Epidemiologická anamnéze (EA) - cestování (místo, délka pobytu), zájmy (bazény, zahradničení, bojové sporty), kontakt se zvířaty, pobyt v lese, kontakt s potenciálně infikovanými osobami apod.)

Klinické příznaky invazivních mykóz příznaky často nespecifické a opožděné u vysoce rizikových pacientů je třeba tuto infekční komplikaci předvídat závažná základní onemocnění (+ imunosupresivní léčba) hematologická onem. (hlavně s neutropenií nebo po transplantaci krvetvorných bb.) po transplantaci solidních orgánů terapie cytostatiky / imunosupresivy z různých indikací HIV, aj. porušená funkce imunity klasické klinické i laboratorní známky infekce (zánětu) se nemusí rozvinout, nebo nastupují opožděně / s jinou intenzitou

Základní laboratorní vyšetření Odběr krve, separace séra Krevní obraz (infekce, záněty, leukémie, alergie, aj.) Cholesterol, glykémie Jaterní testy (ALT, AST) Urea, kreatinin (funkce ledvin) acidobazická rovnováha, krevní plyny, laktát parametry koagulace C-reaktivní protein (CRP) - bakteriální infekce (ale někdy i u systém. mykóz) prokalcitonin (PCT) - bakteriální inf. (u mykóz se téměř nezvyšuje, nebo jen mírně)

Zobrazovací metody Výpočetní tomografie (Computed Tomography, CT) proti RTG významně má vyšší senzitivitu pro IA plic (89 % vs 58), významně vyšší přesnost nálezu (90 % vs 68 %) morfologie CT nálezu u rizikových nemocných s angioinvazivní aspergilózou plic je natolik charakteristická, že na jejím základě lze vyslovit pravděpodobnou diagnózu IA Angioinvazivní aspergilóza - typický počáteční nález halo sign (světlejší zóna charakteru mléčného skla - krvácení do alveolů - obkružuje nodulární konsolidaci plicní tkáně = nekrózou v důsledku angioinvaze aspergilových hyf). Postupným vývojem dochází k retrakci ložiska, s absorpcí nekrotických hmot na periferii a vzniklý prostor je následně vyplněn vzduchem = aircrescent sign. Diagnostický význam májen u odpovídajícího klinického stavu imunoalterovaných nemocných

Srovnání RTG a CT vyšetření u stejného pacienta s IA

Výskyt CNS postiženi u nemocných po alogenní HSCT s prokázanou IA může dosahovat až 50 %. 100 % pacientů s CNS invazivní aspergilózou má postižen alespoň jeden další orgán.

ODBĚR MATERIÁLU PRO MYKOLOGICKÉ VYŠETŘENÍ FAKTORY MÍRY ÚSPĚŠNOSTI MIKROBIOLOGICKÉHO VYŠETŘENÍ VALIDNÍ KLINICKÉ + ANAMNESTICKÉ ÚDAJE + VALIDNÍ VZOREK ze správného místa optimální množství materiálu ve správný čas (před terapií) správnou technikou odběru (lege artis, asepticky) do správných souprav dodržení podmínek skladování a transportu KVALITNÍ LABORATORNÍ PROCES SPRÁVNÁ INTERPRETACE VÝSLEDKU PREANALYTICKÁ FÁZE ANALYTICKÁ FÁZE správná terapie a epidemiologická opatření

PREANALYTICKÁ FÁZE - ODBĚR MATERIÁLU Odběr materiálu: asepticky* před zahájením antimykotické terapie!!! tekutý materiál/tkáň upřednostnit před odběrem tampónem (kontaminace z kůže/sliznic, nedostatečné inokulum) transport do 2 hodin, pokojová teplota (mok 37 C) uchovávat při 4 C při transportu delším než 12-14 hodin jinak hrozí přerůstání G-bakteriemi a kontaminujícími houbami *asepse: opatření a postupy bránící kontaminaci sterilního prostředí (odebíraného vzorku) mikroorganismy; používání sterilních nástrojů, zajištění sterilního prostředí, rozdělení pracovišť na septickou a aseptickou část, dezinfekce a používání ochranných pomůcek roušek, sterilních rukavic.

ODBĚR MATERIÁLU PRO MYKOLOGICKÉ VYŠETŘENÍ Typ materiálu krev Způsob odběru Množství vzorku Transportní soupravy venepunkcí: na kultivaci do injekční stříkačky, poté do hemokultivační lahvičky; na sérologii a genetiku do zkumavky kultivace: 10 ml dospělí, 1 5 ml děti; sérologie: 4 10 ml; genetika: 2 10 ml kultivace: hemokult. lahvičky sérologie: zkumavky s akcelerátory koagulace genetika: zkumavky s EDTA likvor (CSF) lumbální punkcí 1 3 ml sterilní zkumavka sputum vykašláním, event. indukce 10 15 ml nádobka se širokým hrdlem a pevným uzávěrem bronchoa lveolární laváž (BAL) hnis, exsudát, punktát výplach bronchů fyziologickým roztokem pomocí bronchoskopu po incizi, perforaci nebo punkci aspirací do stříkačky 10 15 ml z 1. 3. porce výplachu sterilní zkumavka stříkačka se zátkou, sterilní zkumavka

ODBĚR MATERIÁLU PRO MYKOLOGICKÉ VYŠETŘENÍ Typ materiálu Způsob odběru Množství vzorku tkáň z biopsie /pitvy rohovka vnitřní oko (endoftalmitida) sliznice (nosní, orofarynx, pochva) moč zevní zvukovod skalpelem, punkční jehlou vzorky tkáně očním skalpelem po punkci sklivce aspirací do stříkačky stěr tamponem střední proud, cévkováním, suprapubickou punkcí výtěr tamponem, případně výškrab lancetou 5 10 (25 50) ml Transportní soupravy sterilní zkumavka (do sterilní vody) mikroskopická sklíčka, kultivační půdy, případně zkumavka (se sterilní vodou) sterilní zkumavka (do sterilního FR) odběrové soupravy s TP sterilní nádobka s pevným uzávěrem tampony (případně s TP), sterilní zkumavka

ODBĚR MATERIÁLU PRO MYKOLOGICKÉ VYŠETŘENÍ Typ materiálu Způsob odběru Množství vzorku Transportní soupravy kůže suchá seškrab skalpelem nebo stěr zvlhčeným tamponem; se sekrecí stěr suchým tamponem puchýřky; abscesy po perforaci jehlou stěr suchým tamponem min. cca 30 šupinek sterilní zkumavka, tampony (případně s TP) vlasy, vousy, chlupy vytažení folikulární části pinzetou nejméně 10 sterilní zkumavka nehty výškrab hmoty z vnitřní části nehtové ploténky skalpelem větší počet drobných šupin sterilní zkumavka

ANALYTICKÁ FÁZE NEPŘÍMÝ PRŮKAZ detekce protilátek PŘÍMÝ PRŮKAZ mikroskopie kultivace průkaz antigenu průkaz DNA

ANALYTICKÁ FÁZE - NEPŘÍMÝ PRŮKAZ průkaz protilátek hlavní složka protihoubové imunity je buněčná, detekce protilátek má pouze omezený význam u imunokompromitovaných pacientů není dostatečná imunitní odpověď protilátky v séru nemusí značit aktuální onemocnění, ale jen fakt, že se hostitel s patogenem setkal - vysoká promořenost populace v případě běžných patogenů - výjimka endemické mykózy význam hlavně u endemických mykóz (ale testy nedostupné v ČR)

ANALYTICKÁ FÁZE NEPŘÍMÝ PRŮKAZ detekce protilátek PŘÍMÝ PRŮKAZ mikroskopie kultivace průkaz antigenu průkaz DNA

PŘÍMÝ PRŮKAZ - MIKROSKOPIE 1) Nativní preparát -často v KOH lze dobarvit nespecificky (Lugolovočinidlo - roztok elementárního jodu a jodidu draselného ve vodě) dobarvit specificky: MycoInk (světelný mikr.) - váže se na chitin Rylux (fluoresc. mikr.) - chitin Calcofluor - chitin a celulóza (fluoresc. mikr.) Blankophor - různé polysacharidy (fluoresc. mikr.) MykoInk barvení fluorochromem

1) Nativní preparát PŘÍMÝ PRŮKAZ - MIKROSKOPIE

PŘÍMÝ PRŮKAZ - MIKROSKOPIE 1) Nativní preparát - Candida spp. - kulaté nebo oválné buňky, často pučící nebo s pseudomyceliem (nepravá vlákna)

PŘÍMÝ PRŮKAZ - MIKROSKOPIE 1) Nativní preparát - Mukormycety (zygomycety) - neseptovaná široká vlákna s pravoúhle odstupujícím větvením, připodobňovaná ke zmačkané stuze aspergily: septovaná mycelia často dichotomického větvění (tvar V )

PŘÍMÝ PRŮKAZ - MIKROSKOPIE 2) Fixovaný preparát obecná barvení (Gram) speciální barvení (imunofluorescence, Groccot, Gram-Weigert ) barvení podle Grama (Kandidové infekce)

PŘÍMÝ PRŮKAZ - MIKROSKOPIE Výhody: rychlost (minuty), u fixovaných preparátů desítky minut až 1-2h relativně nízká cena vyšetření specificita, riziko kontaminace není velké, ale může být pozitivní i v případech, kdy houba již není životaschopná (př.dermatomykóza) Nevýhody: malá senzitivita, pozitivní obvykle až pozdějších stádiích onemocnění v materiálu lze většinou jen orientačně zařadit patogena do rodu nebo skupiny (septované x neseptované)

PŘÍMÝ PRŮKAZ - KULTIVACE zlatý standard izolace, identifikace, citlivost INKUBAČNÍ TEPLOTA: 25/37 C (Buchta 2011) x 30 C (Isenberg 2009) kultivační půdy běžné bakteriologické krevní agar, BHI - brain heart infusion (pro kult. náročné) mykologické Sabouraudův glukózový agar (± ATB), SGA s cykloheximidem (dermatofytózy), tekutý Sabouraud selektivně diagnostické chromogenní půdy (dourčení někt. kvasinek) délka kultivace kvasinky: 3-5 dní oportunní vláknité houby: 14 dní dermatofyty, dimorfní houby: 3-6 týdnů

PŘÍMÝ PRŮKAZ - KULTIVACE identifikační půdy rýžový agar, chromogenní půdy, ureázový agar, ovesný agar, Čapkův agar (Czapek-Dox), Malt extrakt, bramborový agar... diagnostická kultivace mikrokultura C. albicans tvorba chlamydospor na rýžovém agaru Chromogenní medium (biomérieux),ve směru hodinových ručiček C. albicans, Trichosporon asahii, C. krusei, C. parapsilosis, C. tropicalis, C. glabrata

PŘÍMÝ PRŮKAZ - SÉROLOGIE diagnostika invazivních mykóz - zásadní význam (rychlá, poměrně vysoká senzitivita časná cílená léčba) antigeny buněčné stěny hub - v našich podmínkách: invazivní aspergilóza: galaktomannan invazivní kandidóza: mannan invazivní kryptokokóza: glukuronoxylomannan invazivní mykóza: glukan pro prognózu pacienta s invazivní mykózou je zásadní časné zahájení léčby - velký důraz je kladen na časnou diagnostiku (tj. serologické a molekulárně-biologické metody) mortalita IA vs. čas zahájení léčby

PŘÍMÝ PRŮKAZ - SÉROLOGIE Limulus - ostrorep V pobřeží USA roční kvóta např. pro Maryland cca 250,000 ostrorepů odebráno cca 30% krve stejný den vypuštěni (označeni schránky) endotoxin/glukan testování - bezpečnost potravin, léčiv, lék. nástrojů, vakcín G-test - limulus test - princip ostrorep si vytvořil obranný mechanismus, aby zabránil šíření infekce v krvi enzymová kaskáda srážení krve a tvorbu gelové substance v přítomnosti některých antigenů potenciálních parazitů (endotoxin G- bakterií, glukany hub) krev je upravena pro výrobu testovacích kitů velmi senzitivní, k detekci stačí1 pg/ml poměrně drahý test

G-test - limulus test - princip PŘÍMÝ PRŮKAZ - SÉROLOGIE

PŘÍMÝ PRŮKAZ - SÉROLOGIE Průkaz antigenu - galaktomannan (Aspergillus) polysacharidová složka BS uvolňovaná do krevního oběhu rostoucími hyfami 35-100 kda u neopouzdřených forem infekce (aspergillom - nízké hodnoty GM) vysoká citlivost zejména u pacientů hematoonkologických (neutropenie) detekován v séru semikvantitativně index pozitivity (IP) pro sérum doporučené cut-off: IP 0,7 ( 0,5 u dvou po sobě jdoucích vzorků), BAL (cut-off mezi 0,8-1) senzitivita 0-100 %, specificita 90 % snížená citlivost při současné ATM terapii falešné pozitivity - některá ATB, i.v. hydratační roztoky s glukonátem, zkřížená reakce s jinými houbami

PŘÍMÝ PRŮKAZ - SÉROLOGIE Průkaz antigenu - galaktomannan (Aspergillus) monitoring GM v průběhu léčby

PŘÍMÝ PRŮKAZ - PRŮKAZ DNA PCR detekce není zařazena jako kritérium pro diagnostiku invazivních mykóz (EORTC/MSG kritéria) nedostatečná standardizace nedostatek relevantních studií ÚSPĚŠNOST DETEKCE ZÁVISÍ NA: typ klinického materiálu metodika izolace DNA volba cílové sekvence pro PCR interpretace výsledků standardizace metod komerční dostupnost malé zkušenosti s dostupnými kity

PŘÍMÝ PRŮKAZ - POROVNÁNÍ