Matěj Adam...7. Jan Hendl...20 M ODEL CIRKULACE, PŘENOSU KREVNÍCH PLYNŮ A ACIDOBÁZE JAKO ZÁKLAD PRO SYS TÉM PO DPORY ROZHODOVÁNÍ. Filip Ježek...



Podobné dokumenty
ZOTERO A DALŠÍ POMOCNÍCI VÝZKUMNÍKA Jan Hendl

DOCEAR: POPIS A POROVNÁNÍ SE SYSTÉMY ZOTERO A MENDELEY Jan Hendl

EndNote Web. Stručné informace THOMSON SCIENTIFIC

DoplněkCite While You Write pro aplikaci Microsoft Word

VKLÁDÁNÍ, EDITACE, SPRÁVA ZÁZNAMŮ PUBLIKACÍ V ÚČTU RID POMOCÍ ENDNOTE WEB

Web of Science. Bibliotheca Academica

ČESKÉ VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V PRAZE. Jak citovat. Zpracovala: Mgr. Ilona Trtíková ÚSTŘEDNÍ KNIHOVNA ČVUT. - Prosinec

Citační manager - Zotero. Mgr. Ilona Trtíková

Mendeley. Barbora Ševčíková říjen mendeley.com

Seminární práce obecné a technické pokyny

Integrované vyhledávání v informačních zdrojích Národní lékařské knihovny - výzva 21. století

Bibliografických manažerů je celá řada. Tento materiál popisuje práci s nástrojem zvaným EndNote Basic.

MODUL 7. Citační manažery 2

ENDNOTE WEB QUICK REFERENCE GUIDE

Manuál k aplikaci SDO PILOT v.0.2

Citace PRO. návod na využívání citačního manažera. Místo vydání: Brno Vydavatel: Citace.com Datum vydání: Verze:

Citace PRO. představení citačního manažeru. Moravská zemská knihovna v Brně Martin Krčál martin.krcal@citace.

MapleCloud a jeho použ ití. Vladimír Žák

DUM 01 téma: Obecné vlastnosti tabulkového editoru, rozsah, zápis do buňky, klávesové zkratky

Lenka Maixnerová, Filip Kříž, Ondřej Horsák, Helena Bouzková

MANUÁL K OBSLUZE REDAKČNÍHO SYSTÉMU / wordpress

ZKUŠENOSTI Z ORGANIZACE NÁRODNÍCH PROGRAMŮ IMPLEMENTACE ELEKTRONICKÉHO ZDRAVOTNICTVÍ. Jan Hendl... 20

Přechod z Google Apps na Office 365 pro firmy

Obsah. Poděkování 11 Úvod 13 Zpětná vazba od čtenářů 15 Errata 15 Konvence použité v knize 15. Spolupráce v malé firemní síti 17

ONLINE ENDNOTE KARTA SE ZÁKLADNÍM VYSVĚTLENÍM

Úvod do počítačové grafiky

MANUÁL PRO VKLÁDÁNÍ A EDITACI DAT V SYSTÉMU INVENIO

5.1 Vyhledávací portál uživatelské rozhraní

Co je to Proquest? Tři databáze

Jak využít citační manažery pro spojení publikační činnosti a šedé literatury?

Filr 2.0 Uživatelská příručka k aplikaci Filr Web. Únor 2016

Mobilní aplikace Novell Filr Stručný úvod

BIBLIOGRAFICKÉ CITACE. Inovační kurz pro knihovníky, Havířov 14. dubna 2010

NOVÁ VERZE OBD A JEJÍ VYUŽÍVÁNÍ Ing. Martina Valášková

ZOTERO. Nástroj pro správu bibliografických citací

SPZ Uživatelská příručka

Analýza dat na PC I.

a autentizovaná proxy

Vložení identifikátorů DOI, UT WOS, UT SCOPUS a PubMed ID do záznamu

Seminární práce z fyziky stručné pokyny

Elektronické informační zdroje pro chemické obory. Seminář Agronomická fakulta, MENDELU Ústav chemie a biochemie

Vzdělávání v egoncentru ORP Louny

Zásady psaní odborného textu

Popis Mendeley. umožňuje správu dokumentů, jejich anotování a hlavně citování v různých citačních stylech.

UŽIVATELSKÁ PŘÍRUČKA INSTRUKTORE

DUM 02 téma: Úvod do textového editoru MS Word a výběr klávesových zkratek

1 Co je nového v aplikaci Filr 2.0 Desktop

Windows/OpenOffice.org

DATA ARTICLE. AiP Beroun s.r.o.

Obsah. Úvod Co je KORG KONTROL Editor?... 2 Požadavky na systém... 2 Instalace... 3

Software. Mgr. Renáta Rellová. Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám

Zvýšení zabezpečení počítače

Nástroj pro správu bibliografických citací

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, Vysoké Mýto

Úvod Používané konvence Seznámení s Outlookem...17

Outlook David Procházka. Vydala Grada Publishing, a.s. U Průhonu 22, Praha 7 jako svou publikaci

VYUŽITÍ REGIONÁLNÍCH FUNKCÍ A WWW ROZHRANÍ V INTEGROVANÉM KNIHOVNÍM SYSTÉMU KPWINSQL

XML jako prostředek pro citování informačních zdrojů

Ukázka knihy z internetového knihkupectví

Přednáška Tablety a chytré telefony. Ing. Michaela Mudrochová Algoritmus individuálního vzdělávání CZ.1.07/3.1.00/

Zásady formálního zpracování diplomové práce

VYHLEDÁVÁNÍ PLNÝCH TEXTŮ Mgr. Adam Kolín, NLK

Získávání dat z bibliografických databází

Uživatelský manuál Radekce-Online.cz

ZÁVAZNÉ POKYNY PRO VYPRACOVÁNÍ BAKALÁŘSKÉ, DIPLOMOVÉ A DISERTAČNÍ PRÁCE

Word podrobný průvodce. Tomáš Šimek

ISI WEB OF SCIENCE - manuál

O aplikaci Parallels Desktop 7 for Mac

Kde hledat odborné zahraniční články?

O nás. To vše a mnohem více Vám je schopna nabídnout již základní verze publikačního systému bravaweb.

Vytváření a ověřování citací pro kvalifikační práce. PhDr. Eva Valdmanová Národní lékařská knihovna

- 1 - Smlouva o dílo. uzavřená podle 536 a násl. obchodního zákoníku v účinném znění

Lenka Maixnerová, Filip Kříž, Helena Bouzková, Ondřej Horsák, Adéla Jarolímková, Eva Lesenková

BEZDRÁTOVÉ PROPOJENÍ ROZHRANÍ LABQUEST 2

IBM Connections. úvod. Petr Kunc, IBM IBM Corporation

Digitální mapa veřejné správy (DMVS) Ústeckého kraje část Nástroje pro tvorbu a údržbu Územně analytických podkladů

ÚPRAVA BAKALÁŘSKÉ A DIPLOMOVÉ PRÁCE

FAKULTA STAVEBNÍ OBOR GEODÉZIE A KARTOGRAFIE KATEDRA MAPOVÁNÍ A KARTOGRAFIE

Tento počítač. 1 Seznámení s programem. 2 Spuštění programu. Adresářové operace Popis programu Tento počítač, podstata adresářových operací.

Další servery s elektronickým obsahem

IMPLEMENTACE SYSTÉMU GROUPWISE NA PEF ČZU V PRAZE IMPLEMENTATION OF THE SYSTEM GROUPWISE ON THE PEF ČZU PRAGUE. Jiří Vaněk, Jan Jarolímek

IBM Connections pro firmy s Lotus Notes/Domino. Petr Kunc

Správa účtu ResearcherID (RID)

Nástroje pro správu bibliografických citací

Programové vybavení počítače

SYSTÉM PRO AUTOMATICKÉ OVĚŘOVÁNÍ ZNALOSTÍ


ÚVOD 3 SEZNÁMENÍ SE SYSTÉMEM 4

software Ruční měřicí přístroje Zobrazovače / Regulátory Loggery / EASYBus GDUSB FastView EASYControl net EASYBus Configurator GSOFT 3050 GSOFT 40k

Podpora vědy a výzkumu v Knihovně UTB ve Zlíně od vzniku publikačních výstupů po jejich evaluaci

Naučte se víc... Metodická příručka pro školy k aplikaci Microsoft Office Access 2007

CELOŽIVOTNÍ VZDĚLÁVÁNÍ SPECIALIZACE LÉKAŘSKÉHO KNIHOVNÍKA PODPORA ZDRAVOTNÍ GRAMOTNOSTI OBČANA OVĚŘENÉ ZDROJE INFORMACÍ O ZDRAVÍ A NEMOCI V NLK

Manuál pro používání Google Apps

ROZVOJ ICT A PDA ZAŘÍZENÍ THE DEVELOPMENT OF ICT AND PDA DEVICES Jiří Vaněk

Office podrobný průvodce. Tomáš Šimek

Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/ Název projektu: Moderní škola 21. století. Zařazení materiálu: Ověření materiálu ve výuce:

Instalační manuál. 1. Instalace hardwaru

Vítězslav Bártl. září 2012

Manuál k aplikaci WANAS

O projektu Nasazení OpenOffice.org v praxi

Transkript:

MEDSOFT 2013

O BSAH Z KU ŠEN O STI Z O RGANIZACE NÁRODNÍCH PRO G RA M Ů IM PLEM EN TACE ELEKTRONICKÉHO ZDRAVOTNICTVÍ Matěj Adam...7 ZOTERO A DALŠÍ POMOCNÍCI VÝZKUM N ÍKA Jan Hendl...20 M ODEL CIRKULACE, PŘENOSU KREVNÍCH PLYNŮ A ACIDOBÁZE JAKO ZÁKLAD PRO SYS TÉM PO DPORY ROZHODOVÁNÍ Filip Ježek... 29 PŘÍKLAD INTERO PERABILITY V OBLASTI RADIODIAGNOSTIKY Daniel Klimeš, Václav Porod, Zdeněk Mutina...49 JA K INFORMATIZOVAT ZDRAVOTNICTVÍ A NEVYTVOŘIT PŘITOM VELKÉHO BRATRA Jiří Kofránek, Ondřej Felix, Jiří Polák... 55 M O D ELICA Jiří Kofránek...64 HYBRIDN Í ARCHITEKTURA PRO W EBO VÉ SIMULÁTORY Tomáš Kulhánek, Marek Mateják, Jan Šilar, Pavol Privitzer, Martin Tribula, Filip Ježek, Jiří Kofránek... 115 DOTAZNÍKO VÝ PRŮZKUM : SPO K O JEN O ST UŽIVATELŮ S KNIH OVNICKO - INFO RM AČNÍM I SLUŽBAM I NÁRODNÍ LÉKAŘSKÉ KNIHOVNY V PRAZE Eva Lesenková, Jaromír Běláček, Vladimíra Solová, Helena Bouzková...122 DATABÁZE B IB LIO G R A PH IA M ED IC A ČECHOSLOVACA JA K O Z D R O J IN FO RM A CÍ O P U B L I KAČNÍCH VÝSTUPECH VĚDY A VÝZKUM U VE ZDRAVOTNICTVÍ Lenka Maixnerová, Filip Kříž, Helena Bouzková, Eva Lesenková, Ondřej Horsák, Adéla Jarolímková, Michal Záviška... 131 SIM ULOVANIE KETOACIDÓZY Marek Mateják...140 IM PLEM ENTACE FUNKCIONALITY E-RECEPTU JAKO SOUČÁSTI E-HEALTH Miroslav Přádka, Drahomíra Maťová... 151 SYSTÉM DRG N EJEN PRO ÚHRADY, ALE I JA KO N ÁSTRO J PRO PO D PO RU ŘÍZEN Í A ÚSPO RU NÁKLADŮ Petr Sláma...156

INTEGROVANÝ NUTRIČNÍ SYSTÉM PRO FN V MOTOLE Hudovít Szekereš... 160 E-INFRASTRUKTURA CESNET A J E J Í BUD O UCÍ VYUŽITÍ Milan Šárek, Jiří Navrátil...175 M ODELOVÁNÍ OBNOVY KMENOVÝCH BUNĚK Jan Šilar, Jiří Kofránek, Tomáš Kulhánek, Katarina Forgáčová, Emanuel Nečas...185 ÚLOŽIŠTĚ DAT A BEZPEČNOST DATABÁZÍ Miloslav Špunda...192 W E BO V Ý V ÝU K O V Ý SIM ULÁTO R KREVN ÍH O O BĚH U Martin Tribula, Filip Ježek, Pavol Privitzer, Jiří Kofránek, Josef Kolman... 197 VYUŽITÍ VIRTUÁLNÍHO PACIENTA V NELÉKAŘSKÝCH ZDRAVOTNICKÝCH OBORECH Lenka Vondrušková... 205 AKTIVITY ČSZIVI ČLS JE P V KONTEXTU PRO JEKTŮ ELEKTRONICKÉHO ZDRAVOTNICTVÍ Martin Zeman...211

Jan Hendl 20 Z O TER O A D A LŠ Í P O M O C N ÍC I V Ý Z K U M N ÍK A Jan Hendl Anotace Osobní bibliografický program Zotero je volně dostupný program, který pomáhá výzkumníkům v oblasti biomedicíny shromažďovat, organizovat, citovat a sdílet dokumenty nejrůznějšího charakteru. Zotero má schopnost automaticky rozpoznat typ dokumentu a umožňuje správný způsob jeho zařazení do bibliografické databáze. Je možné s ním organizovat jednotlivé citace nebo celé dokumenty stažené z internetu nebo získané z bibliografickou databází (např. Medline). Umí také pracovat s audio a video soubory nebo s celými webovými stránkami. Data lze ukládat normálně nebo na internetovém úložišti. Zotero automaticky indexuje obsah uloženého záznamu, takže urychluje jeho pozdější vyhledání. Autor zprávy zařazuje citace do své práce podle daného standardu a vyhotovuje pomocí Zotera seznam citací v požadovaném formátu. Zotero dokáže realizovat mnoho specifických formátů vědeckých časopisů. Příspěvek identifikuje jednotlivé vlastnosti programu Zotero a porovná jejich kvalitu s ostatními podobnými programy. Klíčová slova: počítačový program, internet, bibliografie, dokumentace, Zotero, EndNote, Mendeley 1.Úvod Počítač se uplatňuje v mnoha situacích našeho života, zvláště dobře zvládá opakující se jednoduché logické operace, což lze výhodně využít při organizování literatury. Tato činnost nepochybně patří k těm nejméně oblíbeným v práci aktivního výzkumníka. Vhodný software může v této souvislosti ušetřit hodně času. Dnes máme k dispozici mnoho programů, které můžeme označit jako programy pro správu citací. Některé jejich funkce jsou více méně standardní. Uchovávat citace, sestavovat seznamy použité literatury, organizovat záznamy, vyhledávat je. Tyto programy představují fixně naprogramované databázové systémy se specifikovaným účelem. Komerční systémy tohoto typu jsou poměrně dobře známé. Jedná se například o EndNote, RefWork nebo Procite. Systémy pro organizování bibliografických záznamů mohou být jednoduché nebo velmi technicky náročné, volně dostupné nebo finančně značně nákladné. V našem příspěvku zmíníme novější program Zotero a krátce i systém Mendeley (1, 2, 3, 4). Oba tyto programy se vyznačují použitím nejmodernějších prvků pro správu bibliografických záznamů. Zotero Mezi perspektivní programy pro organizování bibliografických záznamů patří jistě Zotero. Zotero je volně šířený bibliografický software, jehož první verze byla dostupná jako plug-in pro prohlížeč FireFox. V současnosti také existuje

ZOTERO A DALŠÍ POMOCNÍCI VÝZKUMNÍKA jeho verze jako samostatného programu. Uživateli umožňuje zařazení, organizaci bibliografických záznamů a sestavování seznamů použité literatury (článků, knih, w w w stránek) při vědecké práci. Zotero vychází z toho, že dnes se provádějí rešerše většinou on-line a že se také on-line informace citují. Když vytváříme vědeckou publikaci, můžeme se odkazovat na záznamy v Zotero, který posléze automaticky sestaví seznam použité literatury. Uvedeme přehled základních funkcí a vlastností tohoto programu: Integrace do prohlížeče FireFox nebo samostatné fungování Automatické uchování bibliografických informací z webových stránek nebo knihovních katalogů Integrace mnoha elektronických formátů (pdf, video, celé W W W stránky) Integrované vyhledávání v celém textu (také u pdf souborů) Zhotovování snímků webových stránek Připojení klíčových slov a poznámek k záznamu Export biografických údajů v mnoha formátech Automatické zhotovování seznamů použité literatury v programech OpenOffice, Microsoft Word, NeoOffice Výběr mnoha citačních stylů (APA, ČSN, atd.) Možnost propojování více uživatelů Zotero se uživateli nabídne pomocí rozhranní se třemi okny (obr. 1): Obrázek 1 Tři okna uživatelského rozhranní programu Zotero 21

Jan Hendl Okna označíme čísly a popíšeme jejich funkci. 1. struktura složek knihovny (okno vlevo) 2. obsah aktivní složky (okno uprostřed) 3. vlastnosti právě vybrané položky ve složce (okno vpravo) Uživatel může vytvářet podsložky uvnitř okna 1), které obsahují záznamy znázorněné v oknu 2, v oknu 3) uživatel pracuje s jednotlivými záznamy. Přidáváni nových záznamů je možno řešit ručně, importem z některých jiných programů nebo přímo analýzou informací na W W W stránkách (stránky k tomuto účelu musí být přizpůsobeny). Ručně je možno přidat citační zdroj volbou správné formy citační položky (např. článek, kniha, apod.). Je však pohodlnější přidávat záznamy jako jsou webové stránky, články nebo jiné publikace přímo z internetu. To usnadňuje vyvarovat se chyb, kterých se dopouštíme, jestliže vkládáme záznamy ručně. Zotero spoluupravuje s množstvím různých bibliografických databází. Jestliže danou databázi Zotero pozná, objeví se na řádce s internetovou adresou ikona (viz obrázek 2), která signalizuje rozpoznání databáze, při otevření databáze se pak u každého záznamu databáze objeví další ikona., ^. Q ehis.ebscohost.com/ehost/detail?vid=7sihid=1038tsid=9c8dcce Q _ Obrázek 2 Ikona rozpoznané databáze systémem Zotero v prohlížeči FireFox 22 Po kliknutí na tuto ikonu se záznam automaticky zařadí do database v Zotero. Informace o článku obsahuje autora, název, abstrakt a další bibliografické informace. Můžeme použít další funkce k přidání poznámek nebo klíčových slov. Systém Zotero (dostupný na http://www.zotero.org) byl navržený pro více operačních systémů s funkcemi citačního bibliografického softwaru jako shromažďování, organizování, vyhledávání a citování. Snadno zachytí dostupnou bibliografickou informaci pomocí několika kliků myší jako jednu citaci nebo spojí více citací při prohlížení webové stránky obsahující článek nebo relevantní informace. Počet w w w stránek a bibliografických databází, které podporují takovou činnost stále roste a patří k nim například Web of Science, PubMed, ScienceDirect, GoogleScholar, Google Books, Wikipedia, Amamazon a další. V Zotero je možné synchronizovat a ukládat privátní databázi na úložišti www.zotero.org. Po vytvoření účtu je možné ji uložit online. Pomocí tohoto účtu je možné sdílet záznamy s ostatními výzkumníky a uživateli Zotero. Mnoho časopisů zařazuje jako identifikátor článku DOI značku (Digital Object Identifier) spolu s Crossref apmid (PubMed Identification Number) u časopisů indexovaných v PubMed. Každé DOI jednoznačně identifikuje informační jednotku. Citace může být přímo importována do Zotero databáze použitím DOI, PMID nebo ISBN (v případě knihy).

ZOTERO A DALŠÍ POMOCNÍCI VÝZKUMNÍKA Zotero není určen pouze pro citování. Podobně jako jiné systémy (např. program Mendeley) má funkce pro importování pdf a HTML souborů, poznámkování, indexování zachycených souborů, jejich prohledávání a také pro synchronizaci a sdílení ve volně dostupném paměťovém prostoru. Také může zobrazit studie na grafické ose podle měsíce a roku publikování, což je funkce, kterou v jiných systémech nenalezneme. Jedinečnou funkcí programu Zotero je také automatická detekce vhodných doprovodných zdrojů jako například internetové stránky vydavatelství dané knihy. V Zoteru je možné se dostat k volně dostupnému zdroji, protože Zotero automaticky zjišťuje, který kanál předplacený institucí uživatele, vede k tomuto zdroji. Tato vlastnost může ušetřit výzkumníkovi mnoho času. Porovnáni Zotero a EndNote Mnoho autorů program Zotero srovnává s komerčním systémem EndNote. Provedeme to také. EndNote je komerční referenční manažer od firmy Thomson Reuters. Jedná se o klasický profesionálně propracovaný software pro správu citací, který je pomocníkem pro tvorbu a správu citací stejně jako Zotero. EndNote je přímo napojen na Microsoft Office Word, takže citace do svých článků lze pohodlně vkládat přímo při psaní. Zároveň je možné EndNote používat v OpenOffice Writeru a má i export do BibTeXu. Vedle EndNote také známe od stejné firmy program EndNote Web jako internetovou aplikaci. Tento program je na mnoha vysokých školách licencovaný, takže je pro studenty volně dostupný. Zotero se v některých vlastnostech odlišuje od systému EndNote. Cena Zotero: zdarma EndNote : 400 Euro Hlavní systém práce Zotero: přímé ukládání záznamů z prohlížeče Endnote: vyhledávání v různých bibliografických databankách a následný import výsledku hledání z použité databanky. Křivka učení Zotero: jednoduše ovladatelný EndoNote: relativně komplexní program s plochou křivkou učení a delší doba k zaučení Kompatiblita s jinými programy Zotero: Microsoft Word (Mac i Windows), OpenOffice (Mac i Windows), NeoOffice (Mac) EndNote: Microsoft Word, Apple Pages, OpenOffice Writer 3 Profesionalita Zotero: u produktu zdarma překvapivě vysoká profesionalita zpracování, některé vlastnosti se stále vyvíjejí, například nesouhlasí někdy použité styly zcela s jejich definicí 23

Jan Hendl EndNote: velmi profesionální, vypořádá se i s komplikovanými řídkými případy citování. Na rozdíl od podobných programů je Zotero velmi rychlý při shromažďovaní dat, kompatibilní s mnoha operačními systémy a snadný k naučení. Podporuje volně dostupné nebo komerční slovní editory. Dokáže také exportovat data do zmíněného programu EndNote. Výzkumník, který je zvyklý na EndNote, může využít Zotero pro shromažďování citací a pak je převést do EndNote pro další zpracování. Systém Mendeley Konkurentem mezi volně dostupnými programy založených na moderní knihovnické filosofii je pro Zotero program Mendeley (dostupný na http:/www. mendeley.com). Ten má podobné vlastnosti jako Zotero. Jeho autoři ho popisují jako správce citací a publikací, který umožňuje vytvořit si vlastní publikační databázi, vyhledávat v ní a mít ji neustále synchronizovanou a dostupnou na všech počítačích, na nichž je Mendeley nainstalováno. Uveďme pro doplnění některé jeho vlastnosti. Mendeley pracuje s klientem nejen pro Windows, ale i pro Linux. Při jeho stahování a instalaci je nutné se zdarma zaregistrovat. Děláme to proto, aby se osobní databáze uživatele synchronizovala s webovým úložištěm a současně aby uživatel měl k dispozici stejné články na všech počítačích s nainstalovaným klientem Mendeley. Jednotlivé záznamy je možné buď vytvářet, nebo automaticky importovat (podobně jako v Zotero nebo v Endnote)). Máme-li plný text v elektronické podobě - pdf, uložíme-li ho do systému, ten se pokusí získat jméno dokumentu, autory a další informace a z nich poté dohledává ve vlastní databázi a doplní všechny ostatní informace jako časopis, ve kterém článek vyšel, rok, strany, citační klíč a mnohé další. Ke každému záznamu lze trvale přiložit plný text, pokud máme jeho plný text v digitální podobě. Na rozdíl od Zotero umožňuje Mendeley vytvářet sociální síť a sdílet záznamy s kolegy. Jeho síla spočívá v jednoduchém zařazení do databáze všechny pdf dokumenty, které se nacházejí v počítači nebo někde jinde na internetu. Systém Mendeley se osvědčuje při prozkoumávání databází stovek milionů zdrojů, které shromáždili jeho uživatelé. Při tomto prozkoumávání se přesvědčíme, kolik jiných výzkumníků zařadilo určitou práci do své databáze, což funguje jako jistý typ doporučení. Pro prohledávání běžných bibliografických databází tuto informaci nezískáme. Obrázek 3 obsahuje hlavní okno systému Mendeley. Je nutné vybrat si mezi Zotero a Mendeley? Toto rozhodnutí není zapotřebí provést, protože můžeme najednou využívat oba systémy. Mendeley lze nastavit tak, že každý záznam zařazený do Zotero se automaticky přehraje také do Mendeley, takže lze využít přednosti Zotero při stahování informací ze stránek internetu a používat přátelštější rozhraní systém Mendeley. Další doporučení uvedeme v následujícím odstavci 24

ZOTERO A DALŠÍ POMOCNÍCI VÝZKUMNÍKA Mendeley Desktop..... L Í 1- - s* o Search... Má Files Folders Share Syne Search My Líbrary All Documents Edit Settings Re<ently Added j f FivůriCíi Groups Trash My Publications * B Authors Titte Year Published Ir DetailS Notes v c Create Folder... 'U * Create Group,,. i All Deleted Documents ř. ti" E i r o V í Quick send i s r Send PDF i and' leferentes i ř toyour Mendeley conlacts or any e-mail addftss m' Hald, P; Ha... Svačina, S;.. Brodská, H; HaskelL Wffl.. Valenta, Iři.,, Jabor, A; Ka.. TheMendel... Sadlonova,.. Beneš, J; Ka, Balik, Marti Balik, Marti... W Psotta, R; B.. í r Balik, Marti... > ; holub, Zden.. Holub, Zden.. Maratka, Z;.. ReliaMity of the SRK formula Con»parison of fcpid towering effect of si... Effeet of high-dose selenium substtuti Physical actmty and public heakh: updat... High-dose seíerajm substitution tfi seps Sutable variables far the evaluation of to.. Getting Startedwíth Mendetey Setectedmetabokc pařametos and th... Energy e*í>enditures in patient? wíh atu... 1991 Ceskoslover oftalmologie Type: Journal Artide v 2007 PragueMedl Suitable variables for the evaluation of combined acid-base disorders: Care residual anions, buffer base sera., 2007 Circulation proteins and delta bases 2011 Intensive 1990 Časopis LefcaruCe... 2011 Mendeley Desktop Authors: a. 3abor, A. Kazda, 3. Hendl View research catalog entry for thě páper Journal: časopislekaručeských vear: 1990 2008 Internationa volume: 129 1992 Časopis LekaruCe... Issue: Sl Pages: 1615-1620 2005 Kidney markér of residual i... blood pre... Abstract: Relationship between natriuretic peptides... Is repeated-spriv ability of soccer pta... Effeet of the degree of trkuswd regwgt... Effects of SetecOve BlocKage of Utero-... Lapatoscopk svgery in women iwth endo.. [ncidenceof colorectal cancer h Jabor, A) He... Prognosiíinpatitriti in intensive care fr. Hopkins, W Q Meafures of retabimy Insíjartsfňediciriea..- 2003 Blood Purification 2011 Journal of SpOrts Me... 2002 Intensive CareMedi... 2007 J5LS Journal o... 2003 European JCurnal... In 254 findings of the acid-base balance ňns and proteins, the authors evaluated mutual relatlons between the acid-base balance and cakulabon from the aruon column. Contrary to the commorly used aněon ijap value, the authors used concurrently for evaluation buffer base sera, sérum protein val nes and residual anions. The is the creation of a new term, defca bases, whtfh correlates dosely with the resjting metabolk acid-base situation. The optimal relationship of the rrtentioned parameteis to the value rf base extess is described by 1965 6ut Q,8QSBBS-0,8S2RA-0.20«ProMS.6whi(h is eonsistent with the theoretical value of delta bases. 1969 Časopis IsfcaruCe... Tags: 2000 Sports Medici ne < > 1 of 18 documents selected Obrázek 3 Hlavní okno systému Mendeley Keywords: Porovnání a doporučení (Zotero, Mendeley, EndNote) Základní vyhodnocení a doporučení k použití systémů Zotero, EndNote a Mendeley nalezneme v tabulkách 1 a 2, další podrobnější srovnání lze vyhledat na internetu (např. ve Wikipedii). URL: Potřebujem e: Použijeme: Proč:...pracovat s několika počítači nebo z několika míst....pracovat bez připojení do internetu. Zotero Mendeley Zotero Mendeley EndNote Zotero ukládá knihovnu lokálně, ale synchronizuje jí s ostatními počítači. Mendeley je program lokálně na počítači, ale synchronizuje s účtem na internetu. Zotero, Mendeley a EndNote ukládají citace lokálně..a rc h ivo vat W W W stránky a importovat citace ze zdrojů jako Amazon, Flickr, a Medline. Zotero Zotero umožňuje ukládat snímky stránek a poznámkovat je. Má výhody při stahování citačních informací z W W W stránek, z internetových publikací a některých sociálních sítí.. 25

Jan Hendl Potřebujem e: Použijeme: Proč:.p ra c o v a t na skupinových projektech nebo sdílet citace s ostatními. Zotero Mendeley Zotero um ožňuje sdílet citace prostřednictvím sdílených složek, je možné udělit svolení pro opravy a přidávání citací. Mendeley umožňuje sdílet citace a dokumenty ve skupině až 2 dalších uživatelů nebo vytvořit veřejný seznam otevřený všem. Tabulka 1 Doporučení výběru správce citací Pro doplnění uvedených doporučení poznamenejme, že jestliže chceme pečlivěji organizovat literaturu, pak program Endnote vykazuje stále určité přednosti. EndNote může například automaticky smíchávat citační pole a konvertovat je do jednoho pole. V EndNote je také možné pracovat s různými zkratkami názvu časopisu, v Zotero je možné používat v tomto směru pouze jedno označení. EndNote má také speciální uživatelské rozhraní pro změnu citačních stylů, kdežto u Zotero musíme použít jednoduchý textový editor, což není tak pohodlné. Tyto vlastnosti jsou vyžadovány uživateli a postupně se k Zotero doplňují. Vlastnosti Zotero jako volná dostupnost a široká komunita spolupracujících uživatelů toto doplňování umožňují. Požadavek Zotero http://www.zotero.ora/ Mendeley EndNote http://www.mendelev.com/ hhp:///nndnto.eom/ Založen na použití internetu? Ano, pracuje s Firefox prohlížečem nebo jako samostatný program, konektor také pro Google Chrome Ne primárně, ale dovoluje synchronizaci pomocí online účtu Ne, ale umožňuje transfér knihovny do EndNote Web Je nutné být online? Ne Ne Ne Cena Volný jako základ, náklady s rozšířením kloudové paměti Volný, náklady s rozšířením kloudové paměti Komerční Možnosti slovního editoru MS Word, Open Office, Google Docs MS Word, Open Office, LaTex MS Office, Open Office, Work Pages Import z databáze Ano Ano Přímý import ze specifických databází Poskytovaná vnější kloudová paměť Bez omezení v lokální paměti, 100MB pro synchronizaci Bez omezení v lokální paměti, 1GB osobní a 100MB sdíleného prostoru (větší paměť je spojená s jistými náklady) Neomezená lokální paměť 26

ZOTERO A DALŠÍ POMOCNÍCI VÝZKUMNÍKA Požadavek Zotero http://www.zotero.org/ Mendeley http://www.mendeley.com/ EndNote http://endnote.com/ Připojuje plné texty v PDF (a další) Ano, s volbou připojit automaticky Ano, umožňuje anotovat PDF Ano, může anotovat PDF dokumenty Vyhledává v plných textech PDF Ano Ano Ano Vytváří skupinovou nebo sdílenou knihovnu Ano Ano, volný pro až tříčlennou skupinu (větší skupiny za poplatek) Ano, s účtem pro EndNote Web Vytváří bibliografii v různých stylech Automatická extrakce z PDF textu Ano Ano Ano Ano Ano Ano Jiné vlastnosti Synchronizuje knihovny s více počítači, používá klíčová slova pro vyhledávání Synchronizuje s více počítači a databází Zotero Vkládá obrázky a grafy integrovaným slovním editorem Tabulka 2 Vlastnosti programů Zotero, Mendeley, EndNote. Závěr Zotero byl vytvořen jako pomocník výzkumníka a může být uplatněn v několika kontextech. Zotero se především využije při ukládání zdrojů a vytváření biografií. Příslušné akce se naučí uživatel ve velmi krátké době. Funkcionalita Zoteru umožňuje vytvářet poznámky pod čarou nebo odkazy v textu, následně pak vytvořit seznam použité literatury v mnoha stylech. Možnosti Zotero usnadňují vytváření takového seznamu za každou kapitolou u delších prací. Systematické doplňování bibliografické databáze pomáhá výzkumníkovi sledovat vývoj v oboru a navrhovat nové projekty. Knihovníkům pomáhá Zotero při sledování práce pracovníků instituce například v tom, že umožňuje ukládat odkazy na práce, které citují články zaměstnanců instituce. Zotero poskytuje funkcionalitu pro přidávání metadat k obrázkům, takže k vlastnímu obrázku uloží jméno autora, poznámku a další informace. Totéž je možné u zvukových nahrávek a videa. Funkční možnosti Zotero přinášejí výhody nejenom pro uživatele z akademické oblasti. Usnadňuje kreativní práci každému, kdo potřebuje organizovat informační objekty všeho druhu. Rychlá a pohodlná možnost stahovat data a kompatibilita systému Zotero 27

Jan Hendl s ostatními podobnými aplikacemi vede k synergii a urychluje proceduru psaní vědeckého článku. Tato procedura patří mezi životně důležité v době, která se řídí heslem publish or perish!". Proto jsme čtenáři o tomto systému poskytli základní informace a doplnili je údaji o podobně perspektivním systému Mendeley. Každý výzkumník má osobitý přístup k práci s bibliografickými informacemi. Existuje mnoho prostředků, které pomáhají zvolit vlastní cestu. Vedle programů jako Zotero, Mendeley a EndNote jsou vhodné také volné programy jako Evernote, Diigo a Instapaper. Organizace informací v počítači je kritickým bodem v každém výzkumném projektu. Proto se doporučuje, zamyslet se nad jejich možnostmi a vybrat ty, které nám mohu ušetřit jinde potřebný čas. Literatura [ 1.] Ahmed KK, Al Dhubaib BE. Zotero: a bibliographic assistant to researcher. J Pharmacol Pharmacother 2011;2:303-5. [2.] Gilmour R, Cobus-Kuo L. Reference management software: a comparative analysis of four products. Issues in Science & Technology Librarianship 2011;66:63-75. [3.] Kern MK, Hensley MK. Citation Management Software: features and futures. Reference & User Services Quarterly 2011;50:204-8.Ahmed, 2011 [4.] Puckett, J. Zotero: a guide for librarians, researches and educators. American LibraryAss. 2011 Kontakt: J. Hendl FTVS UK José Martiho 31 162 52 Praha 6 e-mail: hendl@ftvs.cuni.cz 28