Molekulární genetik Ústv biologie lékřské genetiky.lf UK VFN, Prh
Polymorfismy lidské DN vyu ívné ve vzebné nlýze, p ímé nep ímé dignostice Mikrostelity (syn. krátké tndemové repetice) STR short tndem repets, SSR simple sequence repets TGCCTCGGTCCCCCCCCGTGCTTCGTGC TGCCTCGGTCCCCCCGTGCTTCGTGCGTG Pokud se detekovtelný polymorfismus nchází dosttečně blízko lokusu, ve kterém se vyskytuje kuzální mutce pro sledovnou chorobu, bude tento polymorfismus ve vzbě s mutovnou lelou ve většině přípdů bude součsně s ní předáván z rodičů n potomky (kosegregce) bude možné jej využít jko mrker i bez znlosti molekulární podstty dného onemocnění.
Úkol č. 2, str. 8 Polycystická chorob ledvin (D, p = 5cM) 2 2 3 4 B C D ) Riziko postižení pro /3 i /4 je 50%.
Úkol č. 2, str. 8 Polycystická chorob ledvin (D, p = 5cM) 2 2 3 4 B C D ) Riziko postižení pro /3 i /4 je 50%. b) Riziko postižení pro /3 je 95%. b) Riziko postižení pro /4 je 5%.
Nondisjunkce u Downov syndromu Tři rodokmeny rodin s dětmi postiženými Downovým syndromem (prostá trisomie). Výsledek nlýzy DN tetrnukleotidového polymorfismu n chromozómu 2 - je znázorněn pod rodokmeny. Od kterého z rodičů zdědilo dítě třetí kopii chromozómu 2? V kterém meiotickém dělení došlo k nondisjunkci?
Nondisjunkce u Downov syndromu? Meióz u otce nebo u mtky
Nondisjunkce u Downov syndromu? Meióz u otce nebo u mtky Meióz u mtky
Nondisjunkce u Downov syndromu? Meióz u otce nebo u mtky Meióz u mtky Meióz u mtky
Úkol č., str. 95, PKU 2 2 3 Nemá PKU 2/3, /3 /2, /4, /4 Prentální dg. v té době nebyl možná. Riziko 25% umožňovlo rodičům požádt o ukončení těhotenství ze zdrvotních (genetických) důvodů. Screening po nrození dítěte by odhlil onemocnění, dietní optření by umožnil reltivně příznivý vývoj
Úkol č. 2, str. 95, PKU (incidence /0000) 2 3 4 /50 2 3 4 2/3 2/3 /2 /2 /50 x ½ x 2/3 x ½ = 2/600 = /300 q 2 = /0000 q = /00 2pq = 2 x 99/00 x /00 = /50 Riziko postižení nízké, zátěžové testy v přípdě PKU málo přesné, lze doporučit DN nlýzu. Je nutné mít dosttek čsu n provedení vyšetření DN v obou rodinách!! Jink není možné přistoupit k prentální dg.
Úkol č. 2b-, str. 95, PKU (incidence /0000) 2 3 4 /50 2 3 4 2/3 2/3 /2 /50 x ½ x = /00 q 2 = /0000 q = /00 2pq = 2 x 99/00 x /00 = /50
Úkol č. 2b-2, str. 95, PKU (incidence /0000) 2 3 4 /50 2 3 4 2/3 2/3 /2 /2 /50 x ½ x 2/3 x ½ = 2/600 = /300 q 2 = /0000 q = /00 2pq = 2 x 99/00 x /00 = /50
Úkol č. 3, str. 96, PKU 2 2 2 3 ) NO, rodin je informtivní z hledisk genotypu dětí. b) ntrgenová sond, dcer tedy JE heterozygotní. c) ntrgenová sond, syn tedy JE dominntní homozygot. d) Jedná se o nepřímou dignostiku, NELZE využít mimo kontext dné rodiny. 5
Úkol č. 4, str. 96 Mutovná lel R408W R408W (Sty ) * 08 bp 37 bp Normální lel + 245 bp
Úkol č. 4, str. 96-97 2 3 4 2 3 4 245? 37 08 + / + + / + + / +
Úkol č. 5, str. 97-98 výsledky SSCP pro EXON č. 6 2 3 4 2 3 4 GENOTYP? 6mut / + +/ + 6mut / + 6mut / + 6mut / + Mutce v 6. exonu (6mut) +/ + +/ + + / + + / + + / + 9
Úkol č. 4c,d, str. 97 2 3 4 2 3 4? mut / + c) Bylo by lepší znát druhou mutci v rodině snoubenky, kterou musí mít /3 nejspíše i /3. Spojením s nepřímou dignostikou bychom mohli stnovit genotyp nenrozeného potomk snoubenců. Klinický genetik rozhodne, zd v této fázi prentální vyšetření nbídnout snoubencům. d) Pátrání po druhé mutci v rodině snoubenky (ETK - poučený souhls!)
Úkol č. 5, str. 97-98 výsledky SSCP pro EXON č. 6 2 3 4 2 3 4 GENOTYP? 6mut / + +/ + 6mut / + 6mut / + 6mut / + Mutce v 6. exonu (6mut) +/ + +/ + + / + + / + + / +
Úkol č. 5, str. 97-98 b) Biopsie trofoblstu (odběr 0.-2. týden grvidity), mniocyty po 5.-6. týdnu grvidity MOŽNÉ POSTUPY nepřímá DN nlýz (RFLP), po doplnění vyšetření v rodině snoubence, pokud bude informtivní přímá DN nlýz R408W, SSCP 6.exonu kombince obou předchozích bude-li v době grvidity určen 6mut přímá nlýz sekvenování Metodu volí specilist v lbortoři.
Úkol č. 5, str. 97-98 Poznámk: Dle součsných pltných právních etických norem: c) Odběr tkáně z účelem izolce vyšetření DN je vázán n poučený souhls pcient. U nezletilých o vyšetření rozhodují zákonní zástupci. d) Od okmžiku, kdy je známo, že snoubenci jsou heterozygotní, je možno n žádost ženy indikovt ukončení grvidity ze zdrvotních (genetických) příčin pro 25% (vysoké) riziko závžné vdy či choroby plodu. Teoreticky ž do 24. týdne grvidity.