Mikroskopie pro biomedicínu (výběr podskupiny bio ) Vladislav Krzyžánek

Rozměr: px

Začít zobrazení ze stránky:

Download "Mikroskopie pro biomedicínu (výběr podskupiny bio ) Vladislav Krzyžánek"

Eliška Blažková
před 5 lety
Počet zobrazení:

1 Mikroskopie pro biomedicínu (výběr podskupiny bio ) 2016 Vladislav Krzyžánek

Mikroskopie pro biomedicínu Podskupina katodoluminiscence Petr Schauer Ondřej Lalinský (doktorand) Podskupina bio Vladislav Krzyžánek Naděžda

2 Mikroskopie pro biomedicínu Podskupina katodoluminiscence Petr Schauer Ondřej Lalinský (doktorand) Podskupina bio Vladislav Krzyžánek Naděžda Vaškovicová Radim Skoupý (doktorand) Kamila Hrubanová (doktorandka) Samuel Záchej (VUT, FEKT) DP Kateřina Adámková (MU, PřF) DP Kateřina Musilová (VUT, FEKT) BP

3 Účast na řešení grantů Řešené granty v roce 2016 GAČR GA S Kvantitativní zobrazování v REM pomocí pružně rozptýlených elektronů (V. Krzyžánek; ) GAČR GA S Redukce dosvitu scintilátorů pro detektory pro detektory elektronů v SEM (P. Schauer; ) TAČR TE Elektronová mikroskopie (I. Müllerová; ) Pracovní balíček č. 1 Nové materiály (V. Krzyžánek) GAČR GA S Zapojení polyhydroxyalkanoátů do stresové odpovědi bakterií (S. Obruča; O. Samek; ) Člen řeš. týmu; cryo-sem analýza bakteriálních vzorků a tvořících se PHA plastů (různé podmínky) GAČR GA S Hydrogely s integrovanými hydrofobními nanodoménami struktura, transportní a uvolňovací vlastnosti (M. Pekař; O. Samek; ) Člen řeš. týmu; cryo-sem analýza hydrogelů Nové granty od roku 2017 GAČR Kvantitativní zobrazování radiačně senzitivních vzorků pomocí korelativní detekce signálů v cryo-sem (V. Krzyžánek; ) TAČR-ÚPT GAMA Pokročilý podpůrný systém pro kryo a in-situ aplikace v rastrovacím elektronovém mikroskopu (V. Krzyžánek; )

4 Přehled výsledků v roce 2016 Typ výsledku Počet Články s IF 9 (+5) Konferenční příspěvky 16 Resch Y. et al: Molecular, Structural and Immunological Characterization of Der p 18, a Chitinase-Like House Dust Mite Allergen. PLoS ONE 11 (2016) e Obruca S. et al: How accumulation of poly(3-hydroxybutyrate) helps bacterial cells to survive freezing. PLoS ONE 11 (2016) e Mravec F. et al: Accumulation of PHA granules in Cupriavidus necator as seen by time-resolved confocal fluorescence microscopy. FEMS Microbiology Letters 363 (2016) in print Tacke S. et al: A versatile high-vacuum cryo transfer system for cryo microscopy and analytics. Biophysical Journal 110 (2016) 758 Bok J. et al: GAGG:ce single crystalline films: New perspective scintillators for electron detection in SEM. Ultramicroscopy 163 (2016) 1 Bok J. et al: Measurements of current density distribution in shaped e-beam writers. Microelectronic Engineering 145 (2016) 117 Kucera M. et al: Scintillation response of Ce 3+ doped GdGa-LuAG multicomponent garnet films under e-beam excitation. Journal of Luminescence 169 (2016) 674 Voběrková S. et al: Biofilm formation and EPS production by Bacillus subtilis depending on nutritional conditions in the presence of polyester film. Folia Microbiologica 61 (2016) 91 Obruca S. et al: Polyhydroxyalkanoates in bacterial cells more than just storage materials. Materials Science Forum 851 (2016) 20

detektorem Měření lokální tloušťky tenkých vzorků, hmotnosti

5 Instrumentální vývoj (detektory, kryo): - Magellan (FEI) s komerčním STEM detektorem - JSM7100 (JEOL) se STEM detektorem Měření lokální tloušťky tenkých vzorků, hmotnosti nanočástic a makromolekulárních komplexů Kvantitativní STEM zobrazování

Úbytek hmoty způsobený elektronovým svazkem Obarvení vzorku těžkými kovy zvyšuje jeho citlivost a tím

nm, bez vzorku Plazmové čištění zvyšuje citlivost vzorku Naměřená změna z 89 % na 55 % u 150 nm řezu a

Poškození svazkem lze snížit ochlazením vzorku na velmi nízké teploty Efekt je měřitelný jen při

6 Úbytek hmoty způsobený elektronovým svazkem Obarvení vzorku těžkými kovy zvyšuje jeho citlivost a tím úbytek hmoty při pozorování Změna úbytku je 43 % pro 30 nm a 30 % pro 60 nm řez Embed 812, tloušťka 30 nm, bez vzorku Plazmové čištění zvyšuje citlivost vzorku Naměřená změna z 89 % na 55 % u 150 nm řezu a ze 70 % na 0 % u 60 nm řezu je velmi výrazná. Poškození svazkem lze snížit ochlazením vzorku na velmi nízké teploty Efekt je měřitelný jen při malých aplikovaných dávkách Při dávce 3000 e - /nm 2 je již úbytek hmoty srovnatelný R. Skoupy et al: in Proc. EMC 2016, Lyon, France; Ultramicroscopy (submitted)

7 Úvod do cryo-sem bakterií Cupriavidus neactor rozlomená bakterie PHB granule (plasty) Kryoprotektivní účinek PHB (práce z roku 2015) S. Obruča et al: PLoS One 11 (2016) e

8 Působení osmotického stresu na Cupriavidus neactor Kontrola NaCl 50 g/l NaCl 100 g/l C. neactor H nm C. neactor PHB-4 Magellan (Brno) 200 nm S. Obruča et al: PLoS One (submitted)

9 Působení mrazového stresu na Cupriavidus neactor Měděná trubička Plunging, síťka HPF C. neactor H16 5 µm 5 µm 5 µm Srovnání různých způsobů mražení a sledování vlivu na chování PHB granulí v bakteriích při mrazovém lomu (od extrémně pomalého mražení po high-pressure-freezing) C. neactor PHB-4 5 µm

10 Katodoluminiscence (CL) nanodiamanty volné Nanodiamanty, velikost cca 100 nm a větší SEM oblast spektra, diamanty o velikosti 100 nm, lehká kontaminace po cca 20 min snímání Nanodiamanty, velikost cca 20 nm CL oblast spektra Nanodiamanty, velikost cca 10 nm CL spektrum volných diamantů, ověření λmax= 625nm, přirozené fluorofory

11 Děkuji za pozornost Vladislav Krzyžánek

Podobné dokumenty

Mikroskopie pro biomedicínu (výběr podskupiny bio ) Vladislav Krzyžánek

Mikroskopie pro biomedicínu (výběr podskupiny bio ) 2015 Vladislav Krzyžánek Mikroskopie pro biomedicínu Podskupina katodoluminiscence Petr Schauer Ondřej Lalinský (doktorand; od 9/2015) Ondřej Lalinský