Transkript

1 Evoluce (nejen) rostlinné buňky Martin Potocký laboratoř buněčné biologie ÚEB AV ČR, v.v.i.

2 Evoluce rostlinné buňky Vznik a evoluce eukaryotních organismů strom (kruh, síť...) života zařazení rostlin v rámci eukaryot Endosymbiotický vznik organel mitochondrie plastidy - primární (a sekundární) endosymbiosa

3 Pacino da Bonaguido, Christ and the Tree of Life, 14th century Charles Darwin 1837

4 Ernst Haeckel ( ) Zavedl mimo jiné pojem fylogeneze Ontogeneze opakuje fylogenezi

5

6 Jak ale doopravdy vypadá strom života?... a jak se to zjišťuje?

7 Studium evolučních vztahů morfologické znaky biochemické analýzy (např. izoenzymy) molekulární analýzy 16S RNA Geny kodující proteiny Celé genomy Genové fúze Další (AFLP atp.)

8 Tradiční členění organismů (Whittaker 1969) Monera (prokaryotes)/bacteria + Archaea Animalia (Metazoa) Plantae Fungi Protista ALE: skupiny nejsou monofyletické. ( Protista jsou sběrná skupina pro to, co se jinam nehodí. Některá jsou také zelená.)

9 Studium evolučních vztahů morfologické znaky biochemické analýzy (např. izoenzymy) molekulární analýzy 16S RNA Geny kodující proteiny Celé genomy Genové fúze Další (AFLP atp.) 16S ribosomal RNA

10 Woese et al.: využití sekvencí rrna crown eukaryotes protista 16S (18S) ribosomal RNAs

11 Studium evolučních vztahů morfologické znaky biochemické analýzy (např. izoenzymy) molekulární analýzy 16S RNA Geny kodující proteiny Celé genomy Genové fúze Další (AFLP atp.) 16S ribosomal RNA

12 Moderní pohled na evoluci (nejen) eukaryot Výchozí data: Sekvence MNOHA genů Srovnávání celých genomů Sledování osudu charakteristických genových fúzí

13 Hypotéza tří domén založená na stromu ribozomálních RNA. Woese et al. PNAS. 87: (1990) Návrh dvou říší, oddělujících eukaryota od prokaryot a eubakterie od archeí Mayr, D. PNAS 95: (1998). Hypotéza tří domén s kontinuálním horizontálním genovým přenosem mezi doménami. Doolittle Science 284: (1999) Martin & Embley, Nature 431: Kruh života, obsahující horizontální genový přenos ale zachovávající rozdělení prokaryot a eukaryot. Rivera MC and Lake JA. Nature 431: (2004)

14 The ring of life provides evidence for a genome fusion origin of eukaryotes Rivera, M.C. & Lake, J.A. Nature, 431; (2004) Our analyses indicate that the eukaryotic genome resulted from a fusion of two diverse prokaryotic genomes, and therefore at the deepest levels linking prokaryotes and eukaryotes, the tree of life is actually a ring of life.

15 Studium evolučních vztahů morfologické znaky biochemické analýzy (např. izoenzymy) molekulární analýzy 16S RNA Geny kodující proteiny Celé genomy Genové fúze Další (AFLP atp.) 16S ribosomal RNA

16 Současný pohled na fylogenezi eukaryot dihydrofolate reductase-thymidylate synthase (DHFR-TS) gene fusion in bikonts (Roger a Simpson 2008)

17 Tree of Life Web Project

18 Koevoluce planety a života

19 Co všechno jsou rostliny? Embryophyta + Charophyta + Chlorophyta = Viridiplantae (Fotosyntetizující zelená eukaryota) + Rhodophyta + Glaukophyta = Archaeplastida (Plantae)

20 Viridiplantae kdo je kdo (a kdy) Chlorophyta

21 Diversifikace embryophyt (-350 až -150 mil.)

22 Jak rostliny vznikly? Jedním z kritických kroků v evoluci rostlin bylo získání organely schopné fotosyntézy (plastidu)

23 Endosymbiotický původ organel: od spekulace k faktu Julius von Sachs ( ) 1882: chloroplasty se chovají jako nezávislé autonomní organismy Richard Altmann ( ) 1886/1890: bioblasty (mitochondrie) se podobají bakteriím Chybně předpokládal jádro jako shluk bioblastů mj. zavedl pojem Nukleinsäure (místo Nuklein )

24 Endosymbiotický původ organel: od spekulace k faktu Konstantin Merežkovskij ( ) 1905 teorie symbiogenese Plastidy jsou redukované cizí organismy (cyanobakterie), které se vyvinuly jako intracelulární symbionti v heterotrofním hostiteli během rané fáze evoluce buňky

25 Lynn Margulis: the endosymbiotická teorie evoluce eukaryot Lynn Sagan (1967), "On the origin of mitosing cells", J Theor Bio. 14(3):

26 Fotosyntetické organismy v rámci 5 říší Původ plastidů: jednou a přece víckrát!

27 Sekundární endosymbiosa

28 Archibald and Keeling Trends in Genetics 18:577. nm nucleomorph ch - chloroplast

29 Paulinella endosymbiosa v přímém přenosu

30 Evoluce rostlinné buňky Vznik a evoluce eukaryotních organismů strom (kruh, síť...) života zařazení rostlin v rámci eukaryot Endosymbiotický vznik organel mitochondrie plastidy - primární (a sekundární) endosymbiosa

31 Upoutávka na Buněčná stěna