MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE

Transkript

1 MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE Česká sbírka mikroorganismů (CCM) tel.: fax DOPORUČENÉ KONTROLNÍ KMENY PRO IDENTIFIKAČNÍ TESTY V KLINICKÉ MIKROBIOLOGII - Bakteriologie K ověření kvality identifikačních souprav a testů používaných v klinické mikrobiologii Česká sbírka mikroorganismů nabízí seznam vhodných testů a doporučených kontrolních kmenů. Forma dodání: želatinové disky nebo lyofilizáty Cena (bez DPH): 1 lahvička (= 20 disků, exspirace 1-2 roky) 910,- Kč 1 lyofilizát 950,- Kč Objednávky: CCM dodává kmeny na základě objednávky zaslané poštou, faxem nebo em. U faxové nebo ové objednávky uveďte Vaše zákaznické číslo, které jste obdrželi z CCM na základě vyplněného "Zákaznického listu", který je ke stažení na Zákaznické číslo je uvedeno na každém dodacím listu jako Vaše ID. Na objednávku zřetelně vyznačte, že objednáváte kultury na discích nebo lyofilizáty a jejich počet. Kmeny jsou dodávány ihned, v případě želatinových disků maximálně do 5-ti týdnů po obdržení objednávky. PŘEHLED POUŽÍVANÝCH TESTŮ PRO KLINICKOU BAKTERIOLOGII Test ANAEROtest 23 ATB agardiluční metoda (anaeroby) ATB disková difůzní metoda CLSI ATB mikrodiluční metoda CLSI ATB metody EUCAST Beta-glukuronidáza CAMP test Deaminace fenylalaninu Dekarboxylace lysinu Dekarboxylace ornitinu; Arginin dihydroláza ENTEROtest 24, ENTEROtest 24 N ENTERO-Rapid 24 E-test Fosfatáza Hydrolýza acetamidu Hydrolýza eskulinu Hydrolýza hippurátu Hydrolýza kaseinu Hydrolýza škrobu Hydrolýza želatiny Indol Kataláza King B médium (fluorescein) Koaguláza vázaná (clumping factor) Koaguláza volná KOH test Lecithináza (Egg-yolk agar) Test Metyl-červeňový test NEFERMtest 24 N OF test ONPG Oxidace glukonátu Oxidáza Pohyblivost Protein A Pyrrolidonyl arylaminázový test (PYR) Redukce nitrátů Rezistence k bacitracinu H Rezistence k methicilinu (oxacilinu) Rezistence k novobiocinu Rezistence k optochinu Rezistence k vankomycinu (enterokoky aminoglykosidy) Růst při různých teplotách Růst při 6,5 % NaCl Simmons citrát STAPHYtest 24 STREPTOtest 24 Triple Sugar Iron Agar (TSI) Urea Christensen Agar Utilizace acetamidu Utilizace malonátu Vibriostatické agens O/129 Voges-Proskauer test (acetoin) X a V faktor IP /9

2 Leucin aminopeptidázový test (LAP) Žluč-eskulinový test SEZNAM KMENŮ identifikační testy Bakterie CCM ŽD Bakterie CCM ŽD Acinetobacter lwoffii 5581 Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 5852 Aerococcus viridans 1914 Kytococcus sedentarius 2699 Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila 7232 Kytococcus sedentarius 2697 Bacillus cereus 2010 Lactobacillus rhamnosus 1828 Bacillus coagulans 2013 Myroides odoratus 3296 Bacillus subtilis subsp. subtilis 2216 Neisseria gonorhoeae 4500 Bacteroides fragilis 4712 Propionibacterium acnes 3343 Bacteroides thetaiotaomicron 4713 Proteus hauseri 7011 Burkholderia sp Proteus sp Clostridium perfringens 4435 Pseudomonas aeruginosa 1960 Clostridium sordellii 4611 Pseudomonas aeruginosa 3955 Cronobacter sakazakii 3461 Pseudomonas fluorescens 2115 Edwardsiella tarda 2238 Salmonella enterica subsp. enterica sérovar Enteritidis 4420 Eggerthella lenta 4714 Enterobacter cloacae subsp. cloacae 1903 Salmonella enterica subsp. enterica sérovar Typhimurium 7205 Enterococcus cecorum 3659 Enterococcus faecalis 1875 Serratia marcescens subsp. marcescens 303 Enterococcus faecalis 4224 Shigella flexneri 4422 Enterococcus faecalis 4647 Staphylococcus aureus subsp. aureus 3953 Enterococcus faecalis 7000 Staphylococcus aureus subsp. aureus 4223 Enterococcus raffinosus 4216 Staphylococcus aureus subsp. aureus 4750 Escherichia coli 3954 Staphylococcus epidermidis 2124 Escherichia coli 3988 Staphylococcus epidermidis 4418 Escherichia coli 4225 Staphylococcus gallinarum 3572 Haemophilus haemoglobinophilus 6055 Staphylococcus pseudintermedius 4710 Haemophilus influenzae 4456 Staphylococcus lugdunensis 4069 Haemophilus influenzae 4457 Staphylococcus nepalensis 7046 Haemophilus influenzae 8432 Staphylococcus saprophyticus subsp. 883 saprophyticus 883 Haemophilus paraphrophilus 6051 Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 4985 Streptococcus agalactiae 6187 Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 2318 Streptococcus constellatus subsp. constellatus 4043 Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 4415 Streptococcus pneumoniae 4501 Streptococcus pyogenes 7418 Streptococcus sanguinis 4047 Vibrio fluvialis 3689 Použitá literatura Garcia, L.S Clinical Microbiology Procedures Handbook. Third Edition. Volume 1, Volume 3. ASM Press, Washington, D.C. MacFaddin, J.F Biochemical tests for identification of medical bacteria. Third edition. Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, USA. Murray, P., Baron, J.E., Pfaller, M.A., Tenover, F.C., Yolken, R.H Manual of Clinical Microbiology. IP /9

3 7 th Edition. ASM Press, Washington, D.C. Základní identifikační testy (bakteriologie) Zkouška Kontrolní kmeny Kontrola kvality ANAEROtest 23 L. rhamnosus 1828 C. sordellii 4611 P. acnes 3343 ATB agardiluční metoda (anaeroby) B. fragilis 4712 B. thetaiotaomicron 4713 C. perfringens 4435 E. lentum 4714 ATB disková difůzní metoda CLSI E. coli 3954 E. coli 4225 S. aureus 3953 P. aeruginosa 3955 E. faecalis 4224 H. influenzae 4456 H. influenzae 4457 N. gonorhoeae 4500 S. pneumoniae 4501 ATB mikrodiluční metoda CLSI E. coli 3954 E. coli 4225 P. aeruginosa 3955 S. aureus 4223 S.aureus 4750 E. faecalis 4224 E. faecalis 4647 H. influenzae 4456 H. influenzae S. pneumoniae K. pmeumoniae 4985 N. gonorhoeae 4500 ATB EUCAST základní kontrola rozšířená kontrola E. coli 3954 E. coli 4225 P. aeruginosa 3955 K. pmeumoniae 4985 S. aureus 4223 E. faecalis 4647 E. faecalis 4224 H. influenzae 4456 S. pneumoniae 4501 H. influenzae 8432 C. jejun subsp. jejunii 6214 IP /9

4 Beta-glukuronidáza CAMP test Deaminace fenylalaninu Dekarboxylace lysinu E. coli K. pneumoniae S. agalactiae S. pyogenes S. pseudintermedius základní kmen pro test Proteus sp K. pneumoniae E. cloacae Dekarboxylace ornitinu; Arginin dihydroláza E. cloacae K. pneumoniae ENTEROtest 24 S. marcescens 303 Proteus sp S. enterica 4420 E. cloacae 1903 ENTEROtest 24 N (inovovaný) E. coli 4225 Proteus sp S. enterica 4420 E. cloacae 1903 K. pneumoniae 5852 E. tarda 2238 ENTERO-Rapid 24 E. cloacae 1903 E. coli 3988 Proteus sp S. marcescens 303 IP /9

5 E-test E. coli 3954 E. coli 4225 P. aeruginosa 3955 S. aureus 4223 E. faecalis 4224 E. faecalis 4647 H. influenzae 4456 H. influenzae 4457 N. gonorhoeae 4500 S. pneumoniae 4501 Fosfatáza Hydrolýza acetamidu Hydrolýza eskulinu Hydrolýza hippurátu Hydrolýza kaseinu Hydrolýza škrobu Hydrolýza želatiny Indol Kataláza S. saprophyticus P. aeruginosa P. fluorescens A. hydrophila P. aeruginosa S. agalactiae S. pyogenes B. subtilis E. coli B. subtilis E. coli P. aeruginosa P. aeruginosa S. pyogenes IP /9

6 King B médium (fluorescein) P. aeruginosa Koaguláza vázaná (clumping factor) S. epidermidis Koaguláza volná KOH test S. epidermidis E. coli S. aureus Lecithináza (Egg-yolk agar) B. cereus Leucin aminopeptidázový test (LAP) E. faecalis A. viridans Metyl-červeňový test NEFERMtest 24 N OF test ONPG K. pneumoniae P. aeruginosa 1960 M. odoratus 3296 Burkholderia sp C. sakazakii 3461 Fermentace glukózy Oxidace glukózy K. pneumoniae P. aeruginosa A. lwoffii Proteus sp IP /9

7 Médium Kontrolní kmeny Kontrola kvality Oxidace glukonátu Oxidáza Pohyblivost Protein A P. aeruginosa E. coli P. aeruginosa S. aureus S. epidermidis Pyrrolidonyl arylaminázový test (PYR) E. faecalis S. agalactiae Redukce nitrátů P. aeruginosa A. lwoffii Rezistence k bacitracinu H Vlastnost S. pyogenes 7418 citlivý H. influenzae 4457 rezistentní Rezistence k methicilinu (oxacilinu) Vlastnost S. aureus 4750 rezistentní S. aureus 4223 citlivý Rezistence k novobiocinu Rezistence k optochinu Vlastnost S. saprophyticus 883 rezistentní S. aureus 3953 citlivý Vlastnost S. pneumoniae 4501 rezistentní S. constellatus 4043 citlivý Rezistence k vankomycinu (enterokoky aminoglykosidy) E. faecalis 4224 E. faecalis 4647 citlivý rezistentní IP /9

8 Růst při různých teplotách Vlastnost B. coagulans 2013 růst při 56 C P. aeruginosa 1960 růst při 37 i 42 C P. fluorescens 2115 růst při 5 C Růst při 6,5 % NaCl Simmons citrát STAPHYtest 24 STREPTOtest 24 Růst E. faecalis S. sanguinis E. cloacae S. epidermidis 4418 S. gallinarum 3572 S. lugdunensis 4069 S. nepalensis 7046 S. sciuri K. sedentarius 2699 E. cecorum 3659 E. raffinosus 4216 S. sanguinis 4047 E. faecalis 1875 K. sedentarius 2699 Triple Sugar Iron Agar (TSI) Růst ŠA Vpich Plyn H 2 S * šikmý agar S. enterica S. flexneri P. aeruginosa Urea Christensen Agar Utilizace acetamidu Růst Barva - P. hauseri (červená) S. enterica P. aeruginosa IP /9

9 Utilizace malonátu K. pneumoniae Vibriostatické agens O/129 Vlastnost A. hydrophila 7232 rezistentní V. fluvialis 3689 citlivý Voges-Proskauer test (acetoin) K. pneumoniae X a V faktor Žluč-eskulinový test Vlastnost H. haemoglobinophilus 6055 vyžaduje pouze X faktor H. paraphrophilus 6051 vyžaduje pouze V faktor Růst E. faecalis S. sanguinis Dotazy: bacteria@sci.muni.cz Objednávky: order@sci.muni.cz Brno 2/2015 IP /9