Typizace komplexu Aeromonas caviae
|
|
- Pavla Sedláková
- před 5 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Typizace komplexu Aeromonas caviae Ivo Sedláček *, Dana Nováková, Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, Brno VZ: MSM * ivo@sci.muni.cz
2 Aeromonády - čeled Aeromonadaceae (třída Gammaproteobacteria) J Aeromonas -rodová diferenciace G-, Oxi, Off, Pte, NaCl (Mot) L Aeromonas -druhová identifikace fenospecies x genomospecies x DNA HG Doporučené minimum 50 testů (Austin a kol.)
3 Výskyt aeromonád -rozmanité vodní prostředí - půda, rostliny -potraviny -klinický materiál -humánní -veterinární Aeromonas agar (LAB M)
4 Patogenita aeromonád?????????? VZÁCNÉ nebo IGNOROVÁNY Klinický význam Ł založen na zdroji izolace
5 Patogenita aeromonád Humánní materiál střevní infekce mimostřevní infekce nosokomiální infekce Veterinární materiál } sezónní výskyt Faktory virulence -cytotoxický enterotoxin (hemolytická, cytotoxická a enterotoxická aktivita) -S-vrstva, kapsula, bičíky/fimbrie -endotoxin, hemolysiny, cytotoxiny -lipáza, fosfolipáza, proteáza, amyláza, chitináza
6 Typizace aeromonád Fenotypizace: - biotypizace (E24, API) -numerická analýza (cíleně pouze na klinické izoláty) -fagotypizace -serotypizace -SDS-PAGE - FAME - MALDI-MS Genotypizace: -sekvencování genu pro 16S rrna -sekvencování gyrb genu nebo rpod genu - ribotypizace -analýza plazmidů -DNA-DNA hybridizace -AFLP
7 Taxonomie aeromonád Aeromonas hydrophila komplex: Aeromonas caviae komplex: Aeromonas sobria komplex: A. hydrophila (subsp.) A. bestiarum A. salmonicida (subsp.) A. caviae A. eucrenophila A. encheleia A. sobria A. veroni bv. sobria "A. ichthiosmia" A. jandaei A. veroni bv. veroni A. schubertii A. enteropelogenes "A. trota" A. allosaccharophila - úhoř, stolice A. molluscorum -měkkýš A. popoffii -sladkovodní prostředí, urogenitální trakt A. simiae -feces opic A. culicicola -střevo komára, voda
8 Biotypizace aeromonád A. caviae -humánní izoláty -izoláty z vody } základní biotyp X SOR+ - izoláty z vody (pigmentující) A. encheleia -izoláty z vody
9 Ribotypizace izolátů A. caviae Dendrogram založený na shlukové analýze ribotypů při použití enzymu EcoRI A. eucrenophila CCM 4354 T P 1099 P 1071 P 1080 P 1167 P 1083 P 969 P 1077 P 1061 P 957 P 1160 P 1068 P 1075 P 1060 P 1033 P 1081 P 1065 P 1158 P 1035 P 958 P 1164 A. caviae CCM 4491 T P 1025 DB 235 DB 83 DB 169 DB 133 DB 144 DB 229 DB 318 P 1056 DB 162 DB 84 DB 76 DB 93 DB 90 DB 132 DB 75 DB 77 CCM 3653 T A. encheleia CCM 4582 T DB 230 SOR + SOR - Ekovary
10 Biotypizace presumptivní Kmen PIG GLG GLT VPT MOT IND ESL SAL TWE SCI SOR CEL MAL Identifikace P A.hydrophila komplex V A.hydrophila komplex P7 w A.caviae komplex P8 w A.caviae komplex P A.caviae komplex P1 w A.media P A.media A8/10a A.media DB A.media + = pozitivní, - = negativní, w = slabě pozitivní, PIG = hnìdý pigment, GLG = plyn z glukózy, GLT = utilizace glukonátu, VPT = Voges-Proskauer test, MOT = pohyblivost, IND = indol, ESC = hydrolýza eskulinu, SAL = kyselina ze salicinu, TWE = hydrolýza Tweenu 80, SCI = Simmons citrát, SOR = kyselina ze sorbitolu, CEL = kyselina z celobiózy, MAL = malonát pozitivní výsledky: růst v 0% a 1 % NaCl; růst při 4 a 37 C; rezistentní k O129 (150 µg); fermentace glukózy; oxidáza; kataláza; arginin dihydroláza; hydrolýza želatiny, DNA a ONPG; kyselina z mannózy, L-arabinózy, sacharózy, trehalózy a mannitolu; redukce nitrátů; asimilace glukózy, arabinózy, mannitolu, mannózy, N-acetyl-glukosaminu, glukonátu, kaprinátu a malátu negativní výsledky: růst v 6 % NaCl; růst při 42 C; hydrolýza elastinu; produkce H2S; lysin a ornitin dekarboxyláza; ureáza; malonát sodný; fenylalanin deamináza; kyselina z inositolu, adonitolu, rhamnózy, melibiózy, raffinózy a dulcitolu; asimilace adipátu a fenyl-acetátu, pyrrolidonyl arylamidáza
11 Ribotypizace presumptivní Dendrogram založený na shlukové analýze ribotypů při použití enzymu EcoRI A. hydrophila komplex A. caviae komplex P 10 P 1 A8/10a P 3 DB232 A. caviae komplex P 8 A. caviae komplex P 7 CCM 3653 T A. hydrophila komplex V2 A. salmon. ssp. pectinolytica CCM 7020 T A. salmon. ssp. salmonicida CCM 1307 P 6 -do druhu patří i izoláty A. caviae komplexu -izoláty P 1 a P 6 nejsou - izolát V2 pravděpodobně patří do A. salmonicida
12 FAME presumptivní Aeromonascaviae komplex P3 Aeromonas media CCM 3653 T Aeromonas media DB232 Aeromonas media CCM 3654 Aeromonas salmonicida ssp. pectinolytica CCM 7020 T Aeromonascaviae komplex P7 Aeromonas sp.p10 Aeromonascaviae komplex P8 Aeromonas sp.v2 Aeromonas media P6 Aeromonas media A8/10a Aeromonas salmonicida ssp. salmonicida CCM 1307 Aeromonas salmonicida ssp. salmonicida CCM 1318 Aeromonas media P1 T Euclidian Distance -FAME typizace se neshoduje s biotypizací ani s ribotypizací
13 Ribotypizace presumptivní Dendrogram založený na shlukové analýze ribotypů při použití enzymu HindIII A. caviae komplex A. hydrophila komplex A. salmonicida ssp. pectinolytica A. caviae komplex A. caviae komplex A. hydrophila komplex A. salmonicida ssp. salmonicida A8/10a P3 DB232 V2 CCM 7020 T P8 P7 CCM 3653 T P6 P1 P10 CCM do druhu patří i izoláty A. caviae komplexu - izolát V2 pravděpodobně patří do A. salmonicida - problematický zůstává izolát P 1
14 Ribotypizace A. encheleia Dendrogram založený na shlukové analýze ribotypů při použití enzymu EcoRI A. encheleia P1290 A. encheleia P1292 A. encheleia CCM 4582 T A. eucrenophila CCM 4354 T A. encheleia P1291 A. encheleia P1284 A. sobria CCM 2807 T A. caviae CCM 4491 T CCM 3653 T A. hydrophila CCM 7232 T -pouze dva izoláty potvrzeny jako A. encheleia - jedná se o první záchyt A. encheleia v ČR
15 Ribotypizace A. encheleia Dendrogram založený na shlukové analýze ribotypů při použití enzymu HindIII A. encheleia P1291 A. popoffii CCM 4708 T A. salmonicida CCM 7246 T A. encheleia P1284 A. encheleia P1290 A. encheleia CCM 4582 T A. encheleia P1292 A. sobria CCM 2807 T -průkaz izolátů P1290 a P1292 jako A. encheleia
16 Typizace aeromonád J Aeromonas caviae komplex -ribotypizace je vhodnější než fenotypizace - EcoRI, HindIII, (SmaI) -značná heterogenita populace = taxonomické změny - pravděpodobně vazba ke zdroji izolace (ekovar) -ribotypy mohou reprezentovat nové genomospecies L Aeromonas caviae komplex -druhová identifikace je problematická -chybí minimální standardy pro popis druhu -některé výsledky otevírají prostor pro nové otázky
17 Pavel Dana Ivo
Polyfázová identifikace kmenů Aeromonas encheleia
Polyfázová identifikace kmenů Aeromonas encheleia D. Nováková, A. Vávrová, P. Švec a I. Sedláček Česká sbírka mikroorganismů Charakterizace aeromonád G-, pohyblivé tyčky, kokotyčky, čeleď Aeromonadaceae
VíceHmotn mot o n s o t s n t í n sp sp kt k r t ometr t ie
MALDI-TOF MS typizace rodu Aeromonas Andrea Teshim (Vávrová) 1,2 PřF MU, Brno Spoluautoři: RNDr. Ludmila Tvrzová, Ph.D. 1 RNDr. Ivo Sedláček, CSc. 2 RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. 3 Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D.
VíceVyužití DNA sekvencování v
Využití DNA sekvencování v taxonomii prokaryot Mgr. Pavla Holochová, doc. RNDr. Ivo Sedláček, CSc. Česká sbírka mikroorganismů Ústav experimentální biologie Přírodovědecká fakulta Masarykova univerzita,
VíceIvo Sedláček Brno
Ivo Sedláček 11. 12. 2008 Brno Mikroorganizmy - rezervoár mikrobiálních genetických zdrojů - všudypřítomné ve většině prostředí -zajištění stability a funkce přírodních ekosystémů - producenti látek -farmaceutický,
VíceL. acidophilus_(psmm _ TIDE):
L. acidophilus_(psmm _ TIDE): 2010-04-06 Ivo Sedláček a Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, 602 00 Brno Projekt FI-IM5/205 problematika taxonomie Polyfázová taxonomie
VíceMALDI-TOF MS typizace rodu Aeromonas Andrea Teshim 1,4
MALDI-TOF MS typizace rodu Aeromonas Andrea Teshim 1,4 Spoluautoři: RNDr. Ludmila Tvrzová, Ph.D. 1 RNDr. Ivo Sedláček, CSc. 4 Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D. 2 RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. 2 Ing. Matej Lexa, Ph.D.
VíceL. acidophilus_(psmm _ TIDE): 2010-04-06
_(PSMM _ TIDE): 2010-04-06 Ivo Sedláček a Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, 602 00 Brno Projekt FI-IM5/205 problematika taxonomie Polyfázová taxonomie - taxonomie
VícePolyfázová identifikace enterokoků z prostředí
Polyfázová identifikace enterokoků z prostředí Ivo Sedláček, Pavel Švec, Marcel Kosina a Pavla Holochová Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, 602 00 Brno Erba Lachema, Mikulov,
VíceIdentifikace bakterií (biochemické testy, standardizované identifikační systémy)
Identifikace bakterií (biochemické testy, standardizované identifikační systémy) Cíl: Identifikace neznámého izolátu Identifikace MO stanovení příslušnosti k určité taxonomické skupině - čistá kultura!!!!
VíceMASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE
Česká sbírka mikroorganismů () DOPORUČENÉ KONTROLNÍ KMENY PRO IDENTIFIKAČNÍ TESTY V KLINICKÉ MIKROBIOLOGII - Bakteriologie K ověření kvality identifikačních souprav a testů používaných v klinické mikrobiologii
VíceMASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE
MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE Česká sbírka mikroorganismů (CCM) tel.: +420 549 491 430 fax +420 549 498 289 e-mail: ccm@sci.muni.cz http://www.sci.muni.cz/ccm
VíceVyužití analýzy celkových buněčných proteinů pomocí SDS-PAGE při charakterizaci fluorescentních pseudomonád izolovaných ze speleotém
Využití analýzy celkových buněčných proteinů pomocí SDS-PAGE při charakterizaci fluorescentních pseudomonád izolovaných ze speleotém Mgr. Marcel Kosina Česká sbírka mikroorganismů Masarykova univerzita,
VíceIdentifikace a klasifikace mikroorganismů založená na shlukové analýze MALDI-MS protein/peptidových profilů
Identifikace a klasifikace mikroorganismů založená na shlukové analýze MALDI-MS protein/peptidových profilů 4000 6000 8000 10000 m /z MALDI-TOF MS = Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization - - Time
VíceZubní kaz v časném dětství a mikrobiální flóra. I. Sedláček, L. Žáčková, M. Kukletová, L. Klapušová, J. Kuklová, D. Nováková, P.
Zubní kaz v časném dětství a mikrobiální flóra projekt 1M0021622409 I. Sedláček, L. Žáčková, M. Kukletová, L. Klapušová, J. Kuklová, D. Nováková, P. Švec Bakteriální mikroflóra zubů průkaz druhové diverzity
VíceVýskyt a typizace mléčných bakterií v baleném mase
Výskyt a typizace mléčných bakterií v baleném mase 1 Štegnerová, H., 2 Nápravníková, E., 2 Steinhauserová, I., 1 Švec, P. 1 MU PřF, Česká sbírka mikroorganismů (CCM) 2 VFU, FVHE, Ústav hygieny a technologie
VíceÚvod do identifikace bakterií Základní biochemické testy
Úvod do identifikace bakterií Základní biochemické testy Jméno: Skupina den/hod: Protokol by měl mít následující strukturu: stručně teorie (Úvod), Pomůcky včetně svého kmene, Použité testy každý zvlášť
VíceKonference Vodárenská biologie 2017
VETERINÁRNÍ A FARMACEUTICKÁ UNIVERZITA BRNO Fakulta veterinární hygieny a ekologie Konference Vodárenská biologie 2017 Autor : Mgr. Eva Jelínková Ústav ekologie a chorob zvěře, ryb a včel evickajelinkova@seznam.cz
VíceIdentifikace stafylokoků pomocí komerčních souprav STAPHYtest 24 a API Staph
Identifikace stafylokoků pomocí komerčních souprav STAPHYtest 24 a API Staph Ivo Sedláček 1, Petr Petráš 2, Eva Plíšková 3, Tereza Škapová 4, Jana Jančová 4, Petr Ježek 5 1 Česká sbírka mikroorganismů,
VíceStaphylococcus petrasii, nový druh stafylokoka z České republiky
ZPRÁVY CENTRA EPIDEMIOLOGIE A MIKROBIOLOGIE (SZÚ, PRAHA) 2013; 22(8) Staphylococcus petrasii, nový druh stafylokoka z České republiky Staphylococcus petrasii, a novel staphylococcal species from the Czech
VíceČeleď: Pasteurellaceae. Rod: Pasteurella
Praktikum č. 12: Mikrobiologická diagnostika veterinárně významných zástupců čeledí Pasteurellaceae (r. Pasteurella, Mannheimia, Actinobacillus, Haemophilus, Taylorella), Vibrionaceae (r. Vibrio, Plesiomonas)
Víceizolovaných z hemokultur
Identifikace mléčných bakterií izolovaných z hemokultur P. Švec 1, A. Ševčíková 2, M. Vancanneyt 3, I. Sedláček 1 1 Česká sbírka mikroorganismů, PřF MU, Brno 2 Fakultní nemocnice Brno 3 BCCM/LMG Bacteria
VíceM. Laichmanová NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ
M. Laichmanová NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ držitel certifikátu Kompletní nabídku referenčních mikroorganizmů tvoří 157 kontrolních kmenů bakterií vláknitých hub kvasinek
VíceSpeciální mikrobiologie
Speciální mikrobiologie Bacillus cereus Charakteristika Bacillus cereus patří do rodu Bacillus, čeledi Bacillaceae. Je významným původcem kažení potravin, zejména mléčných výrobků (např. sladké srážení
Více1 Vzorek C, vaginální výtěr
Pavel Dušek, kruh 3001, 13. 17.12.2010 1 1 Vzorek C, vaginální výtěr 1.1 Úvod Kromě mikrobiálního obrazu poševního je kultivace vaginálního výtěru na Sabouraudově půdě důležitá diagnostická metoda pro
VíceVyužití rep-pcr v bakteriální taxonomii
Využití rep-pcr v bakteriální taxonomii Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU rep-pcr založeny na shlukové analýze PCR produktů získaných s primery komplementárními k rozptýleným
VíceMASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ
MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ Mezinárodní organizace sbírek kultur mikroorganizmů VÚRV Ruzyně, 29. 11. 2017 Ivo Sedláček, Monika
VíceNOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ
M. Laichmanová a S. Karpíšková Česká sbírka mikroorganismů, Ústav experimentální biologie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Tvrdého 14, 602 00 Brno NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ
VíceDiagnostika moru včelího plodu a epizootologická situace v ČR
Diagnostika moru včelího plodu a epizootologická situace v ČR Zpracoval: MVDr. Jaroslav Bzdil, Ph.D., SVÚ Olomouc, Jakoubka ze Stříbra 1, 779 00 Olomouc Tel.: 585557223, e.mail: vetmed@seznam.cz Původce
VícePSMM _ TIDE
PSMM _ TIDE 2010-02-19 Ivo Sedláček Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, 602 00 Brno mikrobiální biosféra není statická dorozumívací jazyk Prokaryota mohou, a také to dělají,
VíceUNIVERZITA PARDUBICE FAKULTA CHEMICKO TECHNOLOGICKÁ
UNIVERZITA PARDUBICE FAKULTA CHEMICKO TECHNOLOGICKÁ BAKALÁŘSKÁ PRÁCE 2012 Marie Benešová Univerzita Pardubice Fakulta chemicko - technologická Katedra analytické chemie Taxonomické zařazení rodu Shigella
VíceDiagnostické metody v lékařské mikrobiologii
Diagnostické metody v lékařské mikrobiologii Výuková prezentace z: Lékařské mikrobiologie Jan Smíšek ÚLM 3. LF UK 2009 Princip identifikace Soubor znaků s rozdílnou diskriminační hodnotou Základní problémy
VíceOBSAH. Předm luva...9
OBSAH Předm luva...9 1 ÚVOD... Il 2 M IKROBIOLOGICKÝ ROZBOR POTRAVIN - LEG ISLA TIV A...12 2.1 Nařízení EU č. 178/2002...12 2.2 Nařízení EU č. 2073/2005...12 2.2.1 Kritéria bezpečnosti potravin...13 2.2.2
VíceMetabolismus, taxonomie a identifikace bakterií. Karel Holada khola@lf1.cuni.cz
Metabolismus, taxonomie a identifikace bakterií Karel Holada khola@lf1.cuni.cz Klíčová slova Obligátní aeroby Obligátní anaeroby Aerotolerantní b. Fakultativní anaeroby Mikroaerofilní b. Kapnofilní bakterie
VíceSkupina bakterií se společnou vlastností tvorby kyseliny mléčné při fermentaci cukrů Součást mikroflóry DÚ, GIT, vaginy Potraviny, prostředí
Klinický význam mléčných bakterií izolovaných z hemokultur Alena Ševčíková OKM, FN Brno Pavel Švec CCM MU Brno Mléčné bakterie (LAB - lactic acid bacteria) Skupina bakterií se společnou vlastností tvorby
VíceSTAFYLOKOKOVÉ ENTEROTOXINY. Zdravotní nezávadnost potravin. Veronika Talianová, FPBT, kruh: 346 Angelina Anufrieva, FPBT, kruh: 336
STAFYLOKOKOVÉ ENTEROTOXINY Zdravotní nezávadnost potravin Veronika Talianová, FPBT, kruh: 346 Angelina Anufrieva, FPBT, kruh: 336 OBSAH: Základní charakteristika Staphylococcus aureus Stafylokokové enterotoxiny
VíceEnterobacter sakazakii neboli Cronobacter sakazakii. Leňková Lucie Grusová Kristýna Kruh 333
Enterobacter sakazakii neboli Cronobacter sakazakii Leňková Lucie Grusová Kristýna Kruh 333 Obsah Charakteristika Historie a taxonomie Výskyt Patogenita Legislativa Zdroje Charakteristika Čeleď: Enterobacteriaceae
VíceIDENTIFIKACE A TYPIZACE STAFYLOKOKŮ METODOU (GTG) 5 -PCR
IDENTIFIKACE A TYPIZACE STAFYLOKOKŮ METODOU (GTG) 5 -PCR Nováková Dana Česká sbírka mikroorganismů, Masarykova universita, Brno ÚVODEM O REP-PCR PCR = mnohonásobné zmnožení úseků obsahujících fragment
VíceTřída Gammaproteobacteria - pokračování Řád Vibrionales
Třída Gammaproteobacteria - pokračování Řád Vibrionales - charakteristika řádu je shodná s popisem čeledě Vibrionaceae Čeleď Vibrionaceae Doména Bacteria, kmen Proteobacteria, třída Gammaproteobacteria,
VíceMálo obvyklé nemocniční nákazy
Málo obvyklé nemocniční nákazy MUDr Věra Kůrková Ambulance v terénu Zubní ordinace Léčebny dlouhodobě nemocných Hospic Priony Virové NN Bakteriální NN Mykotické NN Parazitární NN Priony Jacob-Creutzfeldt
VíceGENOTYPOVÁ REKLASIFIKACE KMENŮ Staphylococcus intermedius jako Staphylococcus pseudintermedius
Konzultační den NRL pro stafylokoky, SZÚ Praha, 3.11.2010 GENOTYPOVÁ REKLASIFIKACE KMENŮ Staphylococcus intermedius jako Staphylococcus pseudintermedius Pavel Švec 1, Roman Pantůček 2, Petr Petráš 3 1
VíceÚvod do identifikace bakterií
Úvod do identifikace bakterií Základní biochemické testy Průvodce do cvičení Salmonella typhi Proteus Yersinia pestis 1 Identifikační testy Zkumavkové Mikrotesty v 1 soupravě je 10-20 biochem. testů ENTEROtest,
VíceRod Clostridium. Prezentace pro obor: Jan Smíš. íšek
Rod Clostridium Prezentace pro obor: Všeobecné lékařství Jan Smíš íšek ÚLM 3. LF UK 2007 Morfologie Gram Morfologie Wirtz-Conklin Růst Fortnerův agar Clostridium tetani Původce tetanu Gram + sporulující
VíceEnterotoxiny Staphylococcus aureus. Jana Kotschwarová Andrea Koťová
Enterotoxiny Staphylococcus aureus Jana Kotschwarová Andrea Koťová Obsah Charakteristika Staphylococcus aureus Vlastnosti Faktory virulence Enterotoxiny Patogeneze Výskyt Metody stanovení Prevence výskytu
VíceZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN
ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN Možnosti stanovení Listeria monocytogenes popis metod a jejich princip Mária Strážiková Aleš Holfeld Obsah Charakteristika Listeria monocytogenes Listerióza Metody detekce
VícePracovní skupina pro molekulární mikrobiologii TIDE
16.9.2009 Pracovní skupina pro molekulární mikrobiologii TIDE Josef Scharfen NRL pro patogenní aktinomycety Oddělení lékařské mikrobiologie a imunologie Oblastní nemocnice Trutnov, a.s. SEMINÁŘ SLM PSMM
VíceKLASIFIKACE A IDENTIFIKACE BAKTERIÍ
Úvod KLASIFIKACE A IDENTIFIKACE BAKTERIÍ Taxonomie Věda o klasifikaci, identifikaci a nomenklatuře organismů Dva podobory Identifikace Nomenklatura Účelem klasifikace je uspořádání organismů do příbuzných
VíceG-fermentující tyčinky
G-fermentující tyčinky Jana Juránková OKM FN Brno Čeleď Enterobacteriacae Gram-negativní nesporulující tyčinky Délka 2-3µm, tloušťka 0,5-0,8µm Fakultativně anaerobní mikroby Odolné vůči prostředí Biochemicky
VícePT#M/5-3/2017 (č.986) Bakteriologická diagnostika
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Poskytovatel zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA podle ČSN EN ISO/IEC 17043, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady Zkoušení
VíceStanovení celkového počtu mikroorganismů
Stanovení celkového počtu mikroorganismů GTK agar zalití 1 ml 30 C, 72 h, aerobně počítání všech narostlých kolonií GTK agar s glukosou, tryptonem a kvasničným extraktem Typické kolonie CPM GTK agar: počítáme
VíceGramnegativní fakultativně anaerobní tyčinky
Gramnegativní fakultativně anaerobní tyčinky Čeleď Enterobacteriacae Vibrio Pasteurella Haemophilus Čeleď Enterobacteriacae Gram-negativní nesporulující tyčinky Délka 2-3µm, tloušťka 0,5-0,8µm Fakultativně
VíceBakteriologická analýza potravin
Bakteriologická analýza potravin a. Souhrn Ve studii zaměřené na bakteriologickou analýzu potravin jsme sledovali výskyt vybraných patogenních agens v potravinách z tržní sítě. Výběr vyšetřovaných komodit
VíceGRAMPOZITIVNÍ KOKY. Čeleď: STAPHYLOCOCCACEAE. Rod: Staphylococcus
GRAMPOZITIVNÍ KOKY Společnou charakteristikou baktérií této skupiny jsou především morfologie buněk (koky) a fyziologické vlastnosti (mezofilie a organofilie). Za základní znaky používané k rozlišení jednotlivých
VíceVÚVeL Brno Kontrola hygieny prostředí a bezpečnosti výrobků v mlékárenských provozech
13. 6. 2019 VÚVeL Brno Kontrola hygieny prostředí a bezpečnosti výrobků v mlékárenských provozech Kontrola výskytu a šíření bakterií v potravinářských provozech MONITORING VÝROBNÍHO PROSTŘEDÍ odběry vzorků
VíceLékařská mikrobiologie pro ZDRL
Lékařská mikrobiologie pro ZDRL Týden 4: Metody identifikace bakterií, principy biochemické identifikace Ondřej Zahradníček zahradnicek@fnusa.cz Postavení v systému metod Přímé metody (prokazujeme mikroba
VíceCíle: METODY TESTOVÁNÍ BIOLOGICKÝCH VLASTNOSTÍ BAKTERIÍ
Praktikum č. 4: Izolace bakteriálního kmene v čisté kultuře, metody průkazu fenotypových znaků (fyziologických a biochemických vlastností) bakteriálního kmene. Metody identifikace bakteriálního kmene.
VíceSpolečnost pro lékařskou mikrobiologii ČLS JEP
Platné od: 1.7.2014 NÁRODNÍ STANDARDNÍ VYŠETŘOVACÍ POSTUP - ZÁKLADNÍ MIKROBIOLOGICKÉ VYŠETŘENÍ KOMPLEXNÍHO VZORKU STOLICE A VÝTĚRU Z REKTA METODOU MIKROSKOPICKOU A KULTIVAČNÍ Příloha 1 KULTIVAČNÍ MÉDIA,
VíceAkreditované zkoušky prováděné v Laboratořích CEM
Strana č.: 1 Nahrazuje stranu: 1 Akreditované zkoušky prováděné v Laboratořích CEM EIA - stanovení protilátek HIV-1/2, HIV-1 p24 antigenu a současné stanovení protilátek HIV-1/2 a HIV-1 p24 antigenu SOP-NRL/AIDS-01-01
VíceMASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE
MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE Česká sbírka mikroorganismů (CCM) tel.: +420 549 491 430 fax +420 549 498 289 e-mail: ccm@sci.muni.cz http://www.sci.muni.cz/ccm
VíceCitlivost a rezistence mikroorganismů na antimikrobiální léčiva
Citlivost a rezistence mikroorganismů na antimikrobiální léčiva Sylva Janovská Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra biologických a biochemických věd Centralizovaný rozvojový projekt
VíceBakteriologická analýza potravin
a. Souhrn Bakteriologická analýza potravin Ve studii zaměřené na bakteriologickou analýzu potravin jsme sledovali výskyt vybraných patogenních agens v potravinách z tržní sítě. Výběr vyšetřovaných komodit
VíceMykologická analýza potravin
Mykologická analýza potravin a. Souhrn V roce 2010 byl zahájen druhý dvouletý cyklus nově uspořádaného Monitoringu dietární expozice člověka a tím i pozměněného projektu "MYKOMON". Vzhledem k detailnějšímu
VíceVyužití antibakteriálních testů v textilním průmyslu Mgr. Irena Šlamborová, Ph.D.
Využití antibakteriálních testů v textilním průmyslu Mgr. Irena Šlamborová, Ph.D. Fakulta Přírodovědně-humanitní a pedagogická, katedra chemie OBSAH: 1. Stavba a fyziologie bakterií. 2. Kultivace bakterií,
VícePredikce epidemií listerióz molekulárně biologickými metodami
Predikce epidemií listerióz molekulárně biologickými metodami Renáta Karpíšková Tereza Gelbíčová Molekulárně-biologické metody v surveillance a šetření epidemií, SZÚ Praha, 28. 3. 2019 Listerióza invazivní
VíceMASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE
KONTROLNÍ KMENY CCM - NABÍDKOVÝ LIST Česká sbírka mikroorganismů nabízí pro práci v mikrobiologických laboratořích přibližně 190 kontrolních, referenčních a indikátorových kmenů, které dodává lyofilizované
VíceBD BBL Enterotube II
POKYNY K POUŽITÍ BBL Enterotube II BD BBL Enterotube II IA-273176.01 Rev.: Jan 2007 ÚČEL POUŽITÍ Systém BBL Enterotube II je identifikační systém k okamžitému použití určený k identifikaci Enterobacteriaceae
VíceEHK 544 Bakteriologická diagnostika-vyhodnocení
Zprávy CEM (SZÚ, Praha) 2007; 16(12): 555 557. EHK 544 Bakteriologická diagnostika-vyhodnocení Helena Žemličková, Marina Maixnerová, Jana Zavadilová, Petr Petráš, Pavla Urbášková CELKOVÉ HODNOCENÍ IDENTIFIKACÍ
VíceLABORATORNÍ DIAGNOSTIKA INFEKCÍ VYVOLANÝCH C.DIFFICILE. Otakar Nyč, Marcela Krůtová, Jana Matějková Ústav lékařské mikrobiologie FN Motol
LABORATORNÍ DIAGNOSTIKA INFEKCÍ VYVOLANÝCH C.DIFFICILE Otakar Nyč, Marcela Krůtová, Jana Matějková Ústav lékařské mikrobiologie FN Motol Clostridium difficile Sporulující obligátní anaerob Vysoká odolnost
Vícein vitro biotechnologií v ovocnářství
Metodické listy OPVK Využití moderních in vitro biotechnologií v ovocnářství 8. TEORETICKÉ ZÁKLADY IN VITRO KULTUR U OVOCNÝCH DRUHŮ Ovocné druhy lze kromě přirozených polních podmínek pěstovat také v umělých
VíceĚ ÁÁ Ú é é ý ů ý ů é ý ů é é ú Ž ý ů é ů é é Ě ÁÁ Ú é Ý ž ý ž ý ý ů ž ů ň é Ž ý Ž ů ý é é é é ý ž Í Ě ÁÁ Ú é é ň é Ž ý ž Ž Í ý é ý Í ů ý ý ý é ý é ý é ň Ž Ž Ě ÁÁ Ú é é ý Ý é é ý Ž Í Í é ž Í Ž Ě ÁÁ Ú é
VícePodíl VÚVeL Brno na řešení aktuálních zdravotních problémů v chovu prasat
Podíl VÚVeL Brno na řešení aktuálních zdravotních problémů v chovu prasat Toman M., Karpíšková R., Nedbalcová, K., Prodělalová J., Matiašovic J., Vašíčková P., Rubeš, J., Skřivánek M. VetFair 2014 jjjjjjjjj
VíceEnterobacter sakazakii alias Cronobacter sakazakii
Enterobacter sakazakii alias Cronobacter sakazakii Lencová Simona, Fialová Eliška Studijní kruh: 346 FA 2014/2015 Obsah 1. Charakteristika 2. Historie 3. Taxonomie 4. Výskyt 5. Legislativa 6. Patogenita
VíceRod Enterobacteriaceae
Enterobakterie P04 Rod Enterobacteriaceae Gramnegativní tyčinky, většinou pohyblivé (až na Shigella, Klebsiella a Y. pestis) Oxidáza negativní, (kataláza +) Biochemicky značně aktivní (záleží na patogenitě)
VíceSpeciální mikrobiologie
Speciální mikrobiologie Escherichia coli bakterie Escherichia coli se běžně vyskytuje ve střevech člověka i teplokrevných zvířat. Většina kmenů E. coli je nepatogenních, některé se pozitivně podílí na
VíceŠtěpení lipidů. - potravou přijaté lipidy štěpí lipázy gastrointestinálního traktu
METABOLISMUS LIPIDŮ ODBOURÁVÁNÍ LIPIDŮ - z potravy nebo z tukových rezerv - hydrolytické štěpení esterových vazeb - vznik glycerolu a mastných kyselin - hydrolytické štěpení LIPÁZY (karboxylesterázy) -
VícePROTOKOL 1A MENO: DÁTUM: SKUPINA:
PROTOKOL 1A NÁZOV PRÁCE: VPLYV BIOGÉNNYCH PRVKOV NA RAST VLÁKNITÝCH HÚB MENO: DÁTUM: SKUPINA: ÚLOHY: 1. Stručne uveďte význam jednotlivých biogénnych prvkov pre rast vláknitých húb: 2. Uveďte pre daný
VíceExterní kontrola kvality sekvenačních analýz
Externí kontrola kvality sekvenačních analýz Radka Bolehovská 1, Lenka Plíšková 2, Kateřina Hrochová 2 Úsek molekulární biologie, 1 Ústav klinické mikrobiologie 2 Ústav klinické biochemie a diagnostiky
VíceMASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ
MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ S. aureus S. simiae (D83357) (AY727530) S. hominis (X66101) S. haemolyticus (D83367) S. stepanoicii
VíceOd byla nabídka CCM rozšířena o 12 nových kontrolních. kultivačních médiích
M. Dřímalková, Z. Páčová NOVÉ KONTROLNÍ KMENY CCM PRO TESTOVÁNÍ KULTIVAČNÍCH PŮD Od 1.5.2005 byla nabídka CCM rozšířena o 12 nových kontrolních kmenů pro účely kontroly kvality kultivačních médiích Kompletní
VíceANTIBIOTICKÁ LÉČBA OFF-LABEL Z POHLEDU MIKROBIOLOGA. Milan Kolář Ústav mikrobiologie FNOL a LF UP v Olomouci
ANTIBIOTICKÁ LÉČBA OFF-LABEL Z POHLEDU MIKROBIOLOGA Milan Kolář Ústav mikrobiologie FNOL a LF UP v Olomouci Septický pacient s nozokomiální pneumonií Endosekret: KLPN + ESCO Terapie: PPT + GEN INTERPRETACE?
VíceTEST:Mikrobiologiepodz2cz Varianta:originál Tisknuto:02/01/2017
TEST:Mikrobiologiepodz2cz Varianta:originál Tisknuto:02/01/2017 1. #Bacillus cereus se s oblibou pomnožuje v 1) 97% 0.10 10 * - tenkém střevu člověka 2) 89% 0.40 0 * + ve vařených těstovinách 3) 97% 0.13
VíceStreptokoky - průkaz fenotypu rezistence k antibiotikům ze skupiny makrolidů, linkosamidů a streptograminub
Streptokoky - průkaz fenotypu rezistence k antibiotikům ze skupiny makrolidů, linkosamidů a streptograminub Revize 27. 1. 2014 A. Klinické vzorky pro vyšetření citlivosti Citlivost k antibiotikům (včetně
VíceStudentská vědecká konference 2015. Sekce: Technologie potravin I (přednášková) Ústav Konzervace potravin (324) 20. 11. 2015 Učebna B11, 9:00
Studentská vědecká konference 2015 Technologie potravin I (přednášková) Ústav Konzervace potravin (324) 20. 11. 2015 Učebna B11, 9:00 Sponzoři: Seznam sekcí a složení komisí ústav 324 Komise: Předseda:
VíceIMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE INFEKCE HELICOBACTER PYLORI
INFEKČNÍ SÉROLOGIE Bakteriologie IMUNOENZYMATICKÉ SOUPRAVY K DIAGNOSTICE INFEKCE HELICOBACTER PYLORI Helicobacter pylori ELISA a IMUNOBLOT soupravy jsou určeny ke stanovení specifických protilátek třídy
VíceTaxonomie prokaryot - vědecké studium mikroorganismů (systematika)
Taxonomie prokaryot - vědecké studium mikroorganismů (systematika) - charakterizovat tyto mikroorganismy - zařadit je určitým způsobem do taxonomických jednotek, tzv. taxonů Taxonomie - teoretické studium
VíceMartina Havlíčková Helena Jiřincová. NRL pro chřipku, Státní zdravotní ústav
Pandemic H1N1 2009 Martina Havlíčková Helena Jiřincová NRL pro chřipku, Státní zdravotní ústav Z historie H1N1 1916-1917 pravděpodobná cirkulace viru, malá ohniska, lokální epidemie ve vojenských táborech,
VíceBakteriologická analýza potravin
Bakteriologická analýza potravin a. Souhrn Ve studii zaměřené na bakteriologickou analýzu potravin jsme sledovali výskyt vybraných patogenních agens v potravinách z tržní sítě. Výběr vyšetřovaných komodit
VícePracoviště (1) Oddělení mikrobiologie, Přírodovědecká fakulta Masarykovy, Brno, Česká republika (2)Oddělení funkční genomiky a proteomiky, Přírodověde
MALDI-TOF MS typizace γ-proteobakterií Matrix-assisted assisted laser desorption/ionization time of flight MS (Karas a Hillenkamp, 1987) Andrea Vávrová, 4roč. Oddělení mikrobiologie MU Vedoucí DP: RNDr.
VíceRNDr. Ivo Rudolf, Ph.D. Oddělení mikrobiologie a molekulární biotechnologie
RNDr. Ivo Rudolf, Ph.D. Oddělení mikrobiologie a molekulární biotechnologie Zaměření oboru: Oddělení mikrobiologie a molekulární biotechnologie výchova erudovaných mikrobiologů se širokou perspektivou
VíceBrno e) Správná odpověď není uvedena. c) KHPO4. e) Správná odpověď není uvedena. c) 49 % e) Správná odpověď není uvedena.
Brno 2019 1. Vyberte vzoreček hydrogenfosforečnanu draselného. a) K2HP4 d) K3P4 b) K(HP4)2 c) KHP4 2. Vyjádřete hmotnostní procenta síry v kyselině thiosírové. Ar(S) = 32, Ar() = 16, Ar(H) = 1 a) 28 %
VíceSeminář potravinářské mikrobiologie
Seminář potravinářské mikrobiologie Třešť 16.5.-18.5.2011 program Novinky v potravinářské mikrobiologii (i formou přehledových referátů) Kulatý stůl problémy v praxi a jak na ně Referáty PhD studentů Presentace
VíceVyužití metody ELFA při stanovení bakterií Salmonella spp. v potravinách
Využití metody ELFA při stanovení bakterií Salmonella spp. v potravinách Chemie a mikrobiologie potravin, III. ročník Ústav hygieny a technologie mléka, FVHE, VFU Brno Říjen 2013 Technika ELFA Enzyme Linked
VíceInfekce, patogenita a nástroje virulence bakterií. Karel Holada
Infekce, patogenita a nástroje virulence bakterií Karel Holada khola@lf1.cuni.cz Klíčová slova Komenzalismus Mutualismus Parazitismus Normální flóra Patogenita Saprofyt Obligátní patogen Oportunní patogen
VíceMolekulární biotechnologie č.10c. Využití poznatků molekulární biotechnologie. Využití škrobu, cukrů a celulózy.
Molekulární biotechnologie č.10c Využití poznatků molekulární biotechnologie. Využití škrobu, cukrů a celulózy. Využití škrobu, cukrů a celulózy Zejména v potravinářském průmyslu Škrob je hydrolyzován
VíceCZ.1.07/1.5.00/34.0527
Projekt: Příjemce: Digitální učební materiály ve škole, registrační číslo projektu CZ.1.07/1.5.00/34.0527 Střední zdravotnická škola a Vyšší odborná škola zdravotnická, Husova 3, 371 60 České Budějovice
VíceCíle: Obecné zásady při odběru vzorků pro bakteriologické vyšetření
Praktikum č. 8: Diagnostika ve veterinární mikrobiologii (odběr, zasílání a zpracování vzorků určených k bakteriologickému vyšetření. Metody kultivačního stanovení koncentrace bakterií. Cíle: 1. Seznámit
VíceAlimentární onemocnění
Alimentární onemocnění Salmonella spp. Salmonely jsou významnými původci alimentárních onemocnění. Roční incidence salmonelóz se v humánní populaci pohybuje kolem 270 případů na 100 000 obyvatel. Některé
VícePřídatné a pomocné látky při výrobě cereálií
Přídatné a pomocné látky při výrobě cereálií Doc. Ing. Josef Příhoda, CSc. Ing. Marcela Sluková, Ph.D. Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Fakulta potravinářské a biochemické technologie Ústav
VíceBIOCHEMICKÁ IDENTIFIKACE ENTEROBAKTERIÍ VÝVOJ A POROVNÁNÍ METODIK
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové katedra biologických a lékařských věd BIOCHEMICKÁ IDENTIFIKACE ENTEROBAKTERIÍ VÝVOJ A POROVNÁNÍ METODIK BAKALÁŘSKÁ PRÁCE Autor práce: Martina
VícePolysacharidy. monosacharidy disacharidy stravitelné PS nestravitelné PS (vláknina) neškrobové PS resistentní škroby Potravinové zdroje
Klasifikace a potravinové zdroje sacharidů Dělení Jednoduché sacharidy Polysacharidy (PS) monosacharidy disacharidy stravitelné PS nestravitelné PS (vláknina) Zástupci glukóza fruktóza galaktóza maltóza
VíceStafylokoky v současné době patří mezi důležité bakteriální patogeny. Např. u nozokomiálních infekcí krevního řečiště jsou spolu s enterokoky
Grampozitivní bakterie Rod Staphylococcus Stafylokoky v současné době patří mezi důležité bakteriální patogeny. Např. u nozokomiálních infekcí krevního řečiště jsou spolu s enterokoky etiologickým agens
Více