NMR spektroskopie biologicky aktivních molekul
|
|
- Denis Němec
- před 6 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 NMR spektroskopie biologicky aktivních molekul
2 Jak vidí současné a budoucí uplatnění NMR spektroskopie profesor Richard Ernst. Medicine Biochemistry Nobel prize in chemistry 1991 Chemistry Physics J.W. Emsley: NMR started as the plaything of the physicists, it became the favourite toy of the chemists and finally went on to seduce biochemists.
3 Kurt Wüthrich Nobel Price Winner in Chemistry 2002 G. Wagner, K. Wüthrich Sequential resonance assignments in protein 1 H nuclear magnetic resonance spectra. Basic pancreatic trypsin inhibitor. J. Mol. Biol. 155,
4 1. Jaké typy biologický aktivních molekul? peptidy a proteiny nukleové kyseliny oligosacharidy 2. Jaký typ informace může být pomocí NMR získán? identifikace substrátu prostorová struktura molekuly studium dynamického chování systému prostorová struktura komplexu zkoumání vazby ligandu a substrátu
5 První historicky dochované NMR spektrum proteinu. Saunders M., Wishnia A. and Kirkwood J.G: J.Am.Chem.Soc. 79, 3289 (1957).
6 900 MHz magnet firmy Varian 900 MHz magnet firmy Bruker 900 MHz 1 H NMR spektrum lysozymu
7 Strategie pro určování struktur biomolekul NMR vzorek NMR experimenty Obecné informace o molekule (primární struktura, kovalentní vazby ) NMR spektra Odhad přibližné struktury Přiřazení signálů Přiřazení experimentálních NMR parametrů (NOE ) Zhodnocení kvality struktur Oprava přiřazení NMR parametrů, signálů Výpočet souboru struktur Výpočet statistických údajů pro soubor konečných struktur Porovnání s databázemi (Procheck, Whatif.) Výpočet NOESY spekter
8 Příprava vzorku proteinu pro NMR měření 1. Získání DNA proteinu 2. Příprava plasmidové DNA 3. Exprese rekombinantního proteinu v E.Coli 4. Izolace a čištění 5. Zakoncentrování vzorku 6. Testování vzorku na dlouhodobou stabilitu 7. Zopakování procesu s médiem obohaceným o izotopy 13 C, 15 N, případně i 2 H
9 Vzorek pro NMR experimenty Úspěšné řešení bezpodmínečně vyžaduje kvalitní spolupráci mezi NMR spektroskopiky a biochemiky! Vzorek musí zůstat aktivní a nedenaturovaný během NMR experimentů! rozpouštědlo ph pufr teplota aditiva koncentrace stabilita H 2 O, resp % H 2 O a 5-10% D 2 O kompromis mezi minimalizací chemické výměny mezi signály labilních protonů a signálem vody a optimem pro studovaný protein ( ) fosfátový pufr neobsahuje žádné protony acetátový pufr (nutno připravit deuterovaný) podle požadavků studovaného materiálu (15 40 C) nutná aditiva je možné zaměnit za deuterovaná analoga pro NMR experimenty musí být v rozsahu alespoň mm, vzorek nesmí podléhat agregaci, koagulaci, sebezničení v tomto konc. rozmezí nutná dlouhodobá stabilita v rozsahu minimálně několika týdnů
10 Srovnání sbalené a nesbalené struktury WVQPI 107 AA (12 kda) IMMCS správně sbalená forma proteinu 83 AA (9 kda) WVQPI 107 AA (12 kda) IMMCS nesbalená forma téhož proteinu δ( 1 H) ppm 1 H- 15 N korelace v oblasti amidických vodíků (vzorek nespecificky obohacen 15 N) δ( 15 N) δ( 1 H) ppm ppm
11 Strategie pro určování struktur biomolekul NMR vzorek NMR experimenty Obecné informace o molekule (primární struktura, kovalentní vazby ) NMR spektra Odhad přibližné struktury Přiřazení signálů Přiřazení experimentálních NMR parametrů (NOE ) Zhodnocení kvality struktur Oprava přiřazení NMR parametrů, signálů Výpočet souboru struktur Výpočet statistických údajů pro soubor konečných struktur Porovnání s databázemi (Procheck, Whatif.) Výpočet NOESY spekter
12 Biomolekulární NMR spektroskopie: měřená jádra 1 H 13 C 15 N 2 H vysoké přirozené zastoupení (99.98%) vysoká citlivost (1.00) malá disperze chemických posunů NMR signálů (~15.0 ppm) velká disperze chemických posunů NMR signálů (~200.0 ppm) nízké přirozené zastoupení (1.108%), možné uměle navýšit až na 100% nízká citlivost (1.76x10-4 ), po 100%ním izotopovém obohacení (1.59x10-2 ) menší počet atomů než 13 C střední disperze chemických posunů NMR signálů (~30.0 ppm) (oproti 13 C nezávislost na typu aminokyseliny) nízké přirozené zastoupení (0.37%), možné uměle navýšit až na 100% velmi nízká citlivost (3.85x10-6 ), po 100%ním izotopovém obohacení (1.04x10-3 ) používá se pro speciální účely
13 Potlačení signálu vody Proč H 2 O? 1. Voda je fyziologické prostředí 2. Nelze použít D 2 O z důvodů chemické výměny s amidickými protony. Signál H 2 O je násobně intenzivnější než odezva měřené molekuly. Metoda presaurace CW -ozařování 90 deg Během relaxační doby ozařujeme signál vody slabým RF polem.
14 1 H spektrum proteinu po presaturaci H 2 O zbytkový signál H 2 O
15 WATERGATE: Metoda založena na selektivní manipulaci signálů vody a rozpuštěné látky spolu s gradientním echem. 90 deg 1 H τ 180 deg τ G G 1 G deg puls
16 Potlačení signálu vody: metoda WATERGATE
17 Strategie pro určování struktur biomolekul NMR vzorek NMR experimenty Obecné informace o molekule (primární struktura, kovalentní vazby ) NMR spektra Odhad přibližné struktury Přiřazení signálů Přiřazení experimentálních NMR parametrů (NOE ) Zhodnocení kvality struktur Oprava přiřazení NMR parametrů, signálů Výpočet souboru struktur Výpočet statistických údajů pro soubor konečných struktur Porovnání s databázemi (Procheck, Whatif.) Výpočet NOESY spekter
18 1D 1 H spektrum proteinu kuřecí lysozym 129 AA, M w = 14.6 kda methyl H NH-backbone aromatic H NH-SC aliphatic H CαH
19 Multidimensionální NMR spektroskopie jako nástroj pro zjednodušení spekter 1D 3D 2D F 1 ( 1 H) F 2 (X) F 2 ( 1 H) 4D F 1 ( 1 H/X) F 3 (X) F 3 ( 1 H) F 1 ( 1 H/X) Lepší rozlišení je ve vícedimenzionálních spektrech zajištěno využitím izotopového obohacení 15 N a 13 C. F 2 (X) F 4 ( 1 H) F 1 ( 1 H)
20 Přiřazování rezonancí NMR experimenty pro přiřazení signálů pracují se dvěma nebo třemi různými jádry najednou (experimenty s trojnásobnou rezonancí), tato jádra jsou navzájem zkorelována. Názvy takovýchto experimentů se tvoří podle typu jader, která korelují: HNCA koreluje amidický vodík s příslušným dusíkem a uhlíkem v pozici α. HN(CO)CA koreluje stejné typy atomů (jader) jako HNCA, ale přes CO. To naznačuje směr korelace, tj. H a N i-té aminokyseliny a C α aminokyseliny v pozici i-1. Směr přenosu magnetizace je v případě těchto experimentů H N C α a zpět. Experimenty se nazývají out and back Naproti tomu přenos magnetizace u experimentů např. CBCA(CO)NH začíná na atomu C Β (i-1) aminokyseliny a končí na amidickém H aminokyseliny následující, tj. experimenty out and stay.
21 Přiřazování rezonancí 13 C γ HNCA experiment 35Hz 13 C 13 H C 130Hz H β β β β 35Hz aminokyselinový zbytek I-1 35Hz aminokyselinový zbytek I 13 C 55Hz 13 C 15Hz α 15 N 11Hz 13 C 55Hz α 13 C H α 7Hz 90Hz H N 140Hz H α <1Hz
22 HNCA experiment Korelace ve spektru: H N i -N i -Cα i H N i -N i Cα i H x x φ 2 x x x x x x acq t 3 15 N φ 1 x φ 4 x x t τ τ 1 /2 t 1 /2 δ δ τ τ φ 4 dec x φ 3 x 13 C α t 2 /2 t 2 /2 13 CO x x přenos magnetizace vývojová perioda
23 Strategie pro určování struktur biomolekul NMR vzorek NMR experimenty Obecné informace o molekule (primární struktura, kovalentní vazby ) NMR spektra Odhad přibližné struktury Přiřazení signálů Přiřazení experimentálních NMR parametrů (NOE ) Zhodnocení kvality struktur Oprava přiřazení NMR parametrů, signálů Výpočet souboru struktur Výpočet statistických údajů pro soubor konečných struktur Porovnání s databázemi (Procheck, Whatif.) Výpočet NOESY spekter
24 Konstrukce multidimensionálních NMR spekter 3D HNCA F 2 ( 15 N ) I F 1 ( 13 C α ) F 2 ( 15 N ) I-1 F 3 ( 1 H N ) F 1 ( 13 C α ) F 3 ( 1 H N )
25 Sekvenční přiřazení hlavního řetězce HN(CO)CA HNCA missing crosspík
26 Přiřazování rezonancí 13 C γ HN(CO)CA experiment 35Hz 13 C 13 H C 130Hz H β β β β 35Hz 35Hz 13 C 55Hz 13 C 15Hz α 15 N 11Hz 13 C 55Hz α 13 C H α 7Hz 90Hz H N 140Hz H α <1Hz
27 Konstrukce multidimensionálních NMR spekter 3D HNCA/HN(CO)CA F 2 ( 15 N ) F 2 ( 15 N ) I F 1 ( 13 C) F 2 ( 15 N ) I-1 I-1 F 3 ( 1 H N ) F 1 ( 13 C) F 3 ( 1 H N )
28 Sekvenční přiřazení hlavního řetězce HN(CO)CA HNCA missing crosspík
29 Přiřazování rezonancí postranních řetězců H γ C γ H γ H γ C γ H γ H β C β H β H β C β H β C α C N C α C H α H N H α
30 Přiřazování rezonancí postranních řetězců ppm Kompletní přiřazení Prolinu 4 proteázy M-PMV pomocí hcch-cosy spektra H : ppm α H : ppm β2 Pro4CG-CB-HB2 H : ppm β3 Pro4CG-CB-HB3 H : ppm γ Pro4CG-CG-HG H : ppm δ2 Pro4CG-CD-HD2 H : ppm δ3 Pro4CG-CD-HD3 H H H H γ δ N H β α H H O 30 Pro4CB-CA-HA Pro4CB-CB-HB2 Pro4CB-CB-HB3 Pro4CB-CG-HG 30 H 3 C O D δ( 13 C) 50 Pro4CD-CG-HG Pro4CD-CD-HD2 Pro4CD-CD-HD3 50 F 2 ( 1 H) 60 Pro4CA-CA-HA Pro4CA-CB-HB2 Pro4CA-CB-HB3 60 F 1 ( 13 C) δ( 13 C) ppm F 3 ( 13 C)
31 Práce s extra velkými molekulami M w > 25 kda Práce s velkými molekulami způsobuje dvojí komplikaci velmi komplikovaná spektra rychlá spin-spinová relaxace R 2 = γ γ 2 2 H ( D) C 8r 6 CH h [ J ' s... f τ ( )] c γ H / γ D ~ 6.6 Řešení: výměna atomů vodíku za deuterium
32 Práce s extra velkými molekulami M w > 25 kda Exprese proteinu v růstovém médiu obohaceném o 13 C/ 15 N/ 2 H 13 C γ 35Hz CD 3 CD Hz C β HD β C β HD β C D 35Hz 13 55Hz 13 15Hz C α C H α D 7Hz 15 11Hz N 90Hz H N 35Hz 13 55Hz C α 140Hz H α D 13 C <1Hz N H C α D CO Teoreticky může být R 2 snížen až 44 násobně, prakticky většinou maximálně 15x.
33 Fully protonated versus perdeuterated EIN protein
34 Fully protonated versus perdeuterated EIN protein Missing crosspeaks are marked
35 Strategie pro určování struktur biomolekul NMR vzorek NMR experimenty Obecné informace o molekule (primární struktura, kovalentní vazby ) NMR spektra Odhad přibližné struktury Přiřazení signálů Přiřazení experimentálních NMR parametrů (NOE ) Zhodnocení kvality struktur Oprava přiřazení NMR parametrů, signálů Výpočet souboru struktur Výpočet statistických údajů pro soubor konečných struktur Porovnání s databázemi (Procheck, Whatif.) Výpočet NOESY spekter
36 Nukleární Overhauserův efekt r IS < 5Ǻ H H dipól - dipólová interakce mezi atomy σ IS µ 6 ο h γ τ c 6 = τ c ris π ω τ c 6 σ IS ris fi{} S = σcal r cal f cal r = r IS cal 6 σ IS - rychlost křížové relaxace, nárůstu NOE τ c - korelační čas r IS - meziatomová vzdálenost ω - pracovní frekvence NMR spektrometru Poměr intenzit NOE efektů f I {S}/f cal je úměrný poměru vzdáleností příslušných atomů vodíku pouze pro velmi krátké časy!!!
37 Převod intenzity NOE krospíků na vzdálenost mezi atomy. 1.8 Ǻ r 2.5 Ǻ 1.8 Ǻ r 3.5 Ǻ 1.8 Ǻ r 5.0 Ǻ Dolní mez :1.8 Ǻ Jedná se o součet vzdáleností van der Waalsovských poloměrů dvou interagujících atomů vodíku Horní mez : Nastavuje se podle intenzity příslušného krospíku. Pro větší molekuly se používá max. vzdálenost až 6 Å.
38 Editovaná NOESY spektra 4D 13 C/ 15 N-editované NOESY 15 N NOE 1 H 1 H 13 C J HN 15 N 13 C J HC 1 H 1 H 3D 15 N-editované NOESY 4D 13 C/ 15 N-editované NOESY 15 N= ppm 15 N= ppm 13 C= 45.8 ppm 15 N= ppm 13 C= 56.1 ppm G78 HN -G78 Hα G78 HN -S77 Hα
39 Nepřímá spin-spinová interakční konstanta Experimentální omezení dihedrálních úhlů Karplusova rovnice 3 J = A cos 2 Θ + Β cosθ + C Vztah mezi interakční konstantou a dihedrálními úhly peptidu H O N φ C Cα ψ H H Cβ χ 1 H χ 2 Cγ 3 J CO-NC α -H H-NC α -H H-NC α -CO H-NC α -C β ω C O 2 0 [Hz] Θ deg
40 Typické hodnoty interakčních konstant 3 J HH pro dihedrální úhel φ α-helix φ 60 deg 3 J 6 Hz typické nastavení pro úhel φ: 110 φ 10deg β-struktura skládaného listu φ 120 ο 6 J 9Hz typické nastavení pro úhel φ: 170 φ 70deg
41 Stereospecifické přiřazení diastereotopních atomů v C β H 2 skupinách -J αβ coupling -H N -H β NOE H β3 R H β2 H α CO H α CO H α CO R H β2 H β2 H β3 H β3 R N N tg (g - ) gt (t) gg (g + ) N J αβ = 9.5 cos 2 θ 1.6 cos θ (gt) 10 0 J αβ (gg) -60 (tg) J αβ2
42 Vodíkové vazby C O H N Měření: - výměnné experimenty s D 2 O - teplotní závislost výměnitelných protonů (NH, OH ) NMR experimenty:- malé molekuly -COSY - velké molekuly - 1 H- 15 N HSQC Z NMR experimentů je možné získat pouze informaci o donoru!! Akceptory jsou většinou určeny až z molekulárního modelování a výpočtů!!
43 Vodíkové vazby v pravidelných strukturách α-helix β-sheet
44 Strategie pro určování struktur biomolekul NMR vzorek NMR experimenty Obecné informace o molekule (primární struktura, kovalentní vazby ) NMR spektra Odhad přibližné struktury Přiřazení signálů Přiřazení experimentálních NMR parametrů (NOE ) Zhodnocení kvality struktur Oprava přiřazení NMR parametrů, signálů Výpočet souboru struktur Výpočet statistických údajů pro soubor konečných struktur Porovnání s databázemi (Procheck, Whatif.) Výpočet NOESY spekter
45 Jak vše poskládat dohromady???? Omezení vzdáleností (NOEs) Omezení dihedrálních úhlů (interakční konst.) Info o kovalentní struktuře Cray T3E E = E + tot kin E pot Výpočetní algoritmus: Molekulární mechanika simulované žíhání s experimentálními omezeními (vzdálenosti, dihedrální úhly ) - molekula se ohřeje na vysokou teplotu ( K) - pomalu se ochladí na teplotu blízkou nule simulované žíhání v Kartézském prostoru (Newtonovy pohybové rovnice) simulované žíhání v prostoru torsních úhlů (Lagrangeovy rovnice)
46 Růstový modulátor Granulin 1e Cyprinus carpio
47 Růstový modulátor Granulin 1e Cyprinus carpio
48 Studium dynamických jevů proteinů pomocí NMR. Proč? Molekuly nejsou statické, vykonávají pohyby v různých časových škálách. Vypočtená statická struktura je často průměrem skutečných stavů molekuly. Funkce mnoha biologicky aktivních molekul závisína jejich flexibilitě. V roztoku (fyziologické prostředí) podléhají biologicky aktivní molekuly přirozeným pohybům, které nejsou v krystalové mřížce patrné. Výhoda NMR spektroskopie nad rentgenovou krystalografií.
49
50 Studium dynamických jevů proteinů pomocí NMR Vztah relaxační rychlostí k molekulárním pohybům v různé časové škále: NMR parametr časová škála podélná relaxace R s -1 podélná relaxace během spin-locku R 1ρ s -1 příčná relaxace R s -1 Měřená jádra: 1 H téměř se neměří (obtížně definovatelné) 15 N dynamika páteře proteinu (dobře měřitelné, dobře definovatelné) 13 C dynamika postranních řetězců i páteře (obtížněji měřitelné, dobře definovatelné) 2 H - měří se ve speciálních případech (CH 3, obtížněji připravitelný vzorek, není jednoduché měřit, dobře definovatelné
51 Zpracování výsledků Lipari-Szabóův přístup Pro analýzu je nutný model pohybu molekuly jako celku a jejích částí. Jeden z nejúspěšnějších je Lipari-Szabóův bezmodelový přístup ( modelfree approach) Předpoklady Lipari-Szabóova modelu: relaxace je modulována dvěma pohyby: globálním a lokálním oba pohyby jsou statisticky nezávislé globální reorientace je izotropní molekulární pohyb je charakterizován parametry: t M korelační čas globálního pohybu S 2 parametr uspořádanosti (hodnota 0-1) t e R ex korelační čas lokálního pohybu rychlost chemické (konformační) výměny
52 Experimentální uspořádání Relaxační parametry 15 N: Měřeny relaxační časy: spin-mřížka (podélná) T 1 spin-spin (příčná) T 2 krosrelaxační rychlost (NOE) 1 H - 15 N
53 Výsledky parametr uspořádanosti a konformační výměna R ex znamená příspěvek konformační výměny k relaxační rychlosti 1/T 2 1/T 2* = 1/T 2 + R ex
54 Interpretace výsledků měření dynamiky páteře HIV-1 PR Aminokyselinové zbytky podléhající rychlým pohybům v pikosekundové časové škále (1-100 ps) o velké amplitudě Aminokyselinové zbytky podléhající pomalým pohybům (konformační výměny v mikro- až milisekundové časové škále.
55 HIV-1 proteáza M-PMV proteáza (12 kda) Problém: Vyskytuje se M-PMV PR též jako homodimer nebo jen v monomerní formě? Metoda řešení pomocí NMR: Studium dynamiky proteinu.
56 Srovnání relaxačních vlastností 15 N proteáz HIV-1 a M-PMV M-PMV protease (C7/A, D26/N, C106/A) HIV-1 protease T T NOE Závěr: U proteázy viru M-PMV chybí čtyřvláknový ß-sheet ( ground floor ), který představuje hlavní stabilizační faktor homodimeru. M-PMV PR (12 kda) se vyskytuje jako monomer.
57 HIV-1 protease with indicated ground floor C C N N
COSY + - podmínky měření a zpracování dat ztráta rozlišení ve spektru. inphase dublet, disperzní. antiphase dublet, absorpční
y x COSY 90 y chem. posuv J vazba 90 x : : inphase dublet, disperzní inphase dublet, disperzní antiphase dublet, absorpční antiphase dublet, absorpční diagonální pík krospík + - - + podmínky měření a zpracování
VíceŘešení struktury proteinů pomocí NMR spektroskopie
Řešení struktury proteinů pomocí NMR spektroskopie Využití NMR spektroskopie v jednotlivých oborech podle nositele Nobelovy ceny za chemii Prof. Richarda Ernsta: Medicine Biochemistry Chemistry Physics
VíceDynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů
Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů Chemická výměna jakýkoli proces při kterém dané jádro mění svůj stav
VíceVyužití NMR spektroskopie pro studium biomakromolekul RCSB PDB
Využití NMR spektroskopie pro studium biomakromolekul RCSB PDB Uplatnění NMR spektroskopie chemická struktura kovalentní struktura konformace, geometrie molekul dynamické procesy chemické a konformační
VíceNMR biomakromolekul RCSB PDB. Progr. NMR
NMR biomakromolekul Typy biomakromolekul a možnosti studia pomocí NMR proteiny a peptidy rozmanité složení, omezení jen velikostí molekul nukleové kyseliny (RNA, DNA) a oligonukleotidy omezení malou rozmanitostí
VíceExperimentální data pro určení struktury proteinu
Experimentální data pro určení struktury proteinu přiřazení co největšího počtu rezonancí intenzita NOESY krospíků chemické posuvy J-vazby vodíkové můstky zbytková dipolární interakce... omezení vzdáleností
VíceNukleární Overhauserův efekt (NOE)
LEKCE 8 Nukleární verhauserův efekt (NE) určení prostorové struktury molekul využití REY spektroskopie projevy NE a chemické výměny v jednom systému Nukleární verhauserův efekt (NE) důsledek dipolární
VíceNukleární Overhauserův efekt (NOE)
Nukleární Overhauserův efekt (NOE) NOE je důsledek dipolární interakce mezi dvěma jádry. Vzniká přímou interakcí volně přes prostor, tudíž není ovlivněn chemickými vazbami jako nepřímá spin-spinová interakce.
VíceNaše NMR spektrometry
Naše NMR spektrometry Varian NMR System 300 MHz Varian INOVA 400 MHz Bruker Avance III 600 MHz NMR spektrometr magnet průřez supravodičem NMR spektrometr sonda Tvar spektra reálná část imaginární část
VíceLEKCE 7. Interpretace 13 C NMR spekter. Využití 2D experimentů. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova) ppm
LEKCE 7 Interpretace 13 C MR spekter Využití 2D experimentů ppm 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 ppm Zpracování, výpočet a databáze MR spekter
VíceMěření a interpretace NMR spekter
Měření a interpretace NMR spekter Bohumil Dolenský E-mail : Telefon : Místnost : www : dolenskb@vscht.cz (+420) 220 44 4110 budova A, místnost 28 http://www.vscht.cz/anl/dolensky/technmr/index.html Řešení
VíceZÁKLADNÍ EXPERIMENTÁLNÍ
Kurz praktické NMR spektroskopie 10. - 12. říjen 2011, Praha ZÁKLADNÍ EXPERIMENTÁLNÍ POSTUPY NMR ROZTOKŮ A KAPALIN Jana Svobodová Ústav Makromolekulární chemie AV ČR, v.v.i. Bruker 600 Avance III PŘÍSTROJOVÉ
Vícespinový rotační moment (moment hybnosti) kvantové číslo jaderného spinu I pro NMR - jádra s I 0
Spektroskopie NMR - teoretické základy spin nukleonů, spin jádra, kvantová čísla energetické stavy jádra v magnetickém poli rezonanční podmínka - instrumentace pulsní metody, pulsní sekvence relaxační
VíceNMR spektroskopie. Úvod
NMR spektroskopie Úvod Zkratka NMR znamená Nukleární Magnetická Rezonance. Jde o analytickou metodu, která na základě absorpce radiofrekvenčního záření vzorkem umístěným v silném magnetickém poli poskytuje
VíceZákladní parametry 1 H NMR spekter
LEKCE 1a Základní parametry 1 NMR spekter Počet signálů ve spektru (zjištění počtu skupin chemicky ekvivalentních jader) Integrální intenzita (intenzita pásů závisí na počtu jader) Chemický posun (polohy
VíceOPVK CZ.1.07/2.2.00/
18.2.2013 OPVK CZ.1.07/2.2.00/28.0184 Cvičení z NMR OCH/NMR Mgr. Tomáš Pospíšil, Ph.D. LS 2012/2013 18.2.2013 NMR základní principy NMR Nukleární Magnetická Resonance N - nukleární (studujeme vlastnosti
VíceLEKCE 3b. Využití 2D experimentů k přiřazení složitější molekuly. Zpracování, výpočet a databáze NMR spekter (ACD/Labs, Topspin, Mnova) ppm
LEKCE 3b Využití D experimentů k přiřazení složitější molekuly ppm ppm 10 1.0 1.5 15.0 130.5 3.0 135 3.5 140 4.0 4.5 145 5.0 150 5.5 155 6.0 6.5 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0.5.0 1.5 1.0 ppm 160.6.4..0
VíceKorelační spektroskopie jako základ multidimensionální NMR spektroskopie
Korelační spektroskopie jako základ multidimensionální NMR spektroskopie Richard Hrabal Laboratoř NMR spektroskopie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Technická 5, 166 28 Praha 6, tel. 220 443
VíceMetody spektrální. Metody molekulové spektroskopie NMR. Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti
Metody spektrální Metody molekulové spektroskopie NMR Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Spektroskopie NMR - teoretické základy spin nukleonů, spin jádra, kvantová čísla
VíceÚvod do strukturní analýzy farmaceutických látek
Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek Garant předmětu: doc. Ing. Bohumil Dolenský, Ph.D. A28, linka 40, dolenskb@vscht.cz Nukleární Magnetická Rezonance I. Příprava předmětu byla podpořena projektem
VíceO Minimální počet valencí potřebných ke spojení vícevazných atomů = (24 C + 3 O + 7 N 1) * 2 = 66 valencí
Jméno a příjmení:_bohumil_dolenský_ Datum:_10.12.2010_ Fakulta:_FCHI_ Kruh:_ÚACh_ 1. Sepište seznam signálů 1 H dle klesajícího chemického posunu (včetně nečistot), uveďte chemický posun, multiplicitu
VíceStrukturní analýza. NMR spektroskopie
Strukturní analýza NMR spektroskopie RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D. lavova 8, místnost 020 tel. 22195 1323 tosner@natur.cuni.cz www.natur.cuni.cz/nmr/vyuka.html Literatura Böhm, Smrčková-Voltrová: Strukturní
VíceLEKCE 1b. Základní parametry 1 H NMR spekter. Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*
Základní parametry 1 NMR spekter LEKCE 1b Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)* 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 Základní parametry 1 NMR spekter Počet signálů ve
VíceVýznam interakční konstanty, Karplusova rovnice. konfigurace na dvojné vazbě a na šestičlenných kruzích konformace furanosového kruhu TOCSY
Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice konfigurace na dvojné vazbě a na šestičlenných kruzích konformace furanosového kruhu TOCSY Karplusova rovnice ve strukturní analýze J(H,H) = A + B cos f
VíceZáklady NMR 2D spektroskopie
Základy NMR 2D spektroskopie Jaroslav Kříž Ústav makromolekulární chemie AV ČR v.v.i. puls 1D : d 1 Fourierova transformace časového rozvoje odezvy dá 1D spektrum 2D: d 1 d 1 d 1 d 0 d 0 + in 0 d 0 + 2in
VíceÚvod do strukturní analýzy farmaceutických látek
Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek Garant předmětu: doc. Ing. Bohumil Dolenský, Ph.D. A28, linka 40, dolenskb@vscht.cz Nukleární Magnetická Rezonance II. Příprava předmětu byla podpořena
VíceDekapling, koherentní transfer polarizace, nukleární Overhauserův jev
Dekapling Dekapling, koherentní transfer polarizace, nukleární Overhauserův jev Dekaplingem rozumíme odstranění vlivu J-vazby XA na na spektra jader A působením dalšího radiofrekvenčního pole ( ω X )na
VíceNMR spektroskopie Instrumentální a strukturní analýza
NMR spektroskopie Instrumentální a strukturní analýza prof. RNDr. Zdeněk Friedl, CSc. Použitá a doporučená literatura Solomons T.W.G., Fryhle C.B.: Organic Chemistry, 8th Ed., Wiley 2004. Günther H.: NMR
VícePostup při interpretaci NMR spekter neznámého vzorku
Postup při interpretaci NMR spekter neznámého vzorku VŠCT 2017, Bohumil Dolenský, dolenskb@vscht.cz Tento text byl vypracován pro projekt Inovace předmětu Semestrální práce oboru analytická chemie I. Slouží
VíceSPEKTROSKOPIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE
SPEKTROSKOPIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE Obecné základy nedestruktivní metoda strukturní analýzy zabývá se rezonancí atomových jader nutná podmínka pro měření spekter: nenulový spin atomového jádra
VíceLEKCE 2b. NMR a chiralita, posunová činidla. Interpretace 13 C NMR spekter
LEKCE 2b NMR a chiralita, posunová činidla Interpretace 13 C NMR spekter Stanovení optické čistoty Enantiomery jsou nerozlišitelné v NMR spektroskopii není možné rozlišit enantiomer od racemátu!!! Enantiotopické
VíceDvourozměrná NMR spektroskopie metody
Dvourozměrná NMR spektroskopie metody Marcela Strnadová 1D-NMR: experimentální FID je funkcí jediné časové proměnné - detekčního času t 2, spektrum získané Fourierovou transformací je funkcí frekvence
VíceNukleární magnetická rezonance (NMR)
Nukleární magnetická rezonance (NMR) Mgr. Zdeněk Moravec, Ph.D. Úvod Zkratka NMR znamená Nukleární Magnetická Rezonance. Jde o analytickou metodu, která na základě absorpce radiofrekvenčního záření vzorkem
VíceVýznam interakční konstanty, Karplusova rovnice
LEKCE 9 Význam interakční konstanty, Karplusova rovnice konfigurace na dvojné vazbě a na šestičlenných kruzích konformace furanosového kruhu TCSY T E E 1 E 1 T 0 6 T E 1 T 0 88 7 0 T E 0 0 E T 0 5 108
VíceTechniky přenosu polarizace cross -polarizace a spinová difuse
(3) jiri brus Techniky přenosu polarizace cross -polarizace a spinová difuse laboratory frame, spin rotating frame laboratory frame, spin Ω H B H ω, ω, ω 0, B H ω 0, Ω C B C ω B 0,, 0 ω B, B C B B,, Zvýšení
Více02 Nevazebné interakce
02 Nevazebné interakce Nevazebné interakce Druh chemické vazby Určují 3D konfiguraci makromolekul, účastní se mnoha biologických procesů, zodpovědné za uspořádání molekul v krystalu Síla nevazebných interakcí
Více12.NMR spektrometrie při analýze roztoků
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti 12.NMR spektrometrie při analýze roztoků Pavel Matějka pavel.matejka@vscht.cz pavel.matejka@gmail.com 12.NMR spektrometrie při analýze
VíceSpektrální metody NMR I. opakování
Spektrální metody NMR I opakování Využití NMR určování chemické struktury přírodní látky, organická syntéza konstituce, konformace, konfigurace ověření čistoty studium dynamických procesů reakční kinetika
VíceZáklady Mössbauerovy spektroskopie. Libor Machala
Základy Mössbauerovy spektroskopie Libor Machala Rudolf L. Mössbauer 1958: jev bezodrazové rezonanční absorpce záření gama atomovým jádrem 1961: Nobelova cena Analogie s rezonanční absorpcí akustických
VíceAnalýza směsí, kvantitativní NMR spektroskopie a využití NMR spektroskopie ve forenzní analýze
Analýza směsí, kvantitativní NMR spektroskopie a využití NMR spektroskopie ve forenzní analýze Analýza směsí a kvantitativní NMR NMR spektrum čisté látky je lineární kombinací spekter jejích jednotlivých
VíceStudium komplexace -cyklodextrinu s diclofenacem s využitím NMR spektroskopie
Jména: Datum: Studium komplexace -cyklodextrinu s diclofenacem s využitím NMR spektroskopie Cílem laboratorního cvičení je prozkoumat interakce léčiva diclofenac s -cyklodextrinem v D 2 O při tvorbě komplexu
VíceMezimolekulové interakce
Mezimolekulové interakce Interakce molekul reaktivně vzniká či zaniká kovalentní vazba překryv elektronových oblaků, mění se vlastnosti nereaktivně vznikají molekulové komplexy slabá, nekovalentní, nechemická,
VíceSpektrální metody NMR I
Spektrální metody NMR I RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D. Hlavova 8, místnost 020 tel. 22195 1323 tosner@natur.cuni.cz www.natur.cuni.cz/nmr/vyuka.html Literatura Böhm, Smrčková-Voltrová: Strukturní analýza organických
VíceNukleární magnetická rezonance (NMR)
Nukleární magnetická rezonance (NMR) Nukleární magnetické rezonance (NMR) princip ZDROJ E = h. elektro-magnetické záření E energie záření h Plankova konstanta frekvence záření VZOREK E E 1 E 0 DETEKTOR
VíceSpektra 1 H NMR. Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský
Spektra 1 MR Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský Spektra 1 MR... Počet signálů C 17 18 2 O 2 MeO Počet signálů = počet neekvivalentních skupin OMe = informace o symetrii molekuly Spektrum 1 MR... Počet
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti LC-NMR 1. Jan Sýkora
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti LC-NMR 1 Jan Sýkora LC/NMR Jan Sýkora (ÚCHP AV ČR) LC - NMR 1 H NMR (500 MHz) mez detekce ~ 1 mg/ml (5 µmol látky) NMR parametry doba
VíceMetody pro studium pevných látek
Metody pro studium pevných látek Metody Metody termické analýzy Difrakční metody ssnmr Predikce krystalových struktur Metody termické analýzy Termogravimetrie (TG) Diferenční TA (DTA) Rozdíl teplot mezi
VíceSTANOVENÍ STRUKTURY LÁTEK
STANOVENÍ STRUKTURY LÁTEK 1nm 10 10 2 10 3 10 4 10 5 10 6 10 7 (the wave) X-ray UV/VIS Infrared Microwave Radio Frequency (the transition) electronic Vibration Rotation Nuclear (spectrometer) X-ray UV/VIS
VíceZÁKLADY SPEKTROMETRIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE
ZÁKLADY SPEKTROMETRIE NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÉ REZONANCE Co to je NMR? nedestruktivní spektroskopická metoda využívající magnetických vlastností atomových jader ke studiu struktury molekul metoda č.1 pro určování
VícePočítačová chemie. výpočetně náročné simulace chemických a biomolekulárních systémů. Zora Střelcová
Počítačová chemie výpočetně náročné simulace chemických a biomolekulárních systémů Zora Střelcová Národní centrum pro výzkum biomolekul, Masarykova univerzita, Kotlářská 2, 611 37 Brno, Česká Republika
VíceNMR spektroskopie rádiové frekvence jádra spinovou rezonancí jader spinový moment lichý počet
NMR spektroskopie NMR spektroskopie Nukleární Magnetická Resonance - spektroskopická metoda založená na měření absorpce elektromagnetického záření (rádiové frekvence asi od 4 do 900 MHz). Na rozdíl od
VíceAutoři: Pavel Zachař, David Sýkora Ukázky spekter k procvičování na semináři: Tento soubor je pouze prvním ilustrativním seznámením se základními prin
Autoři: Pavel Zachař, David Sýkora Ukázky spekter k procvičování na semináři: Tento soubor je pouze prvním ilustrativním seznámením se základními principy hmotnostní spektrometrie a v žádném případě nezahrnuje
VíceSeminář NMR. Mgr. Zdeněk Moravec, Ph.D.; hugo@chemi.muni.cz Ústav chemie, PřF MU, 22.-25. 7. 2013 http://nmrlab.chemi.muni.cz/
Seminář NMR Mgr. Zdeněk Moravec, Ph.D.; hugo@chemi.muni.cz Ústav chemie, PřF MU, 22.-25. 7. 2013 http://nmrlab.chemi.muni.cz/ Osnova Úvod, základní princip Instrumentace magnety, měřící sondy, elektronika
VíceKapitoly z fyzikální chemie KFC/KFCH. VII. Spektroskopie a fotochemie
Kapitoly z fyzikální chemie KFC/KFCH VII. Spektroskopie a fotochemie Karel Berka Univerzita Palackého v Olomouci Katedra Fyzikální chemie karel.berka@upol.cz Spektroskopie Analýza světla Excitované Absorbované
VíceSkupenské stavy. Kapalina Částečně neuspořádané Volný pohyb částic nebo skupin částic Částice blíže u sebe
Skupenské stavy Plyn Zcela neuspořádané Hodně volného prostoru Zcela volný pohyb částic Částice daleko od sebe Kapalina Částečně neuspořádané Volný pohyb částic nebo skupin částic Částice blíže u sebe
VícePraktické příklady měření a interpretace chemické é výměny a relaxací. rychlostních konstant k. Měření
Praktické příklady měření a interpretace chemické é výměny a relaxací A. Chemická výměna 1. Dynamická NMR - teplotně závislá 1D spektra. Výměnná spektroskopie - EXY (EXchange pectroscopy) Měření rychlostních
VíceInterakce fluoroforu se solventem
18. Vliv solventu Interakce fluoroforu se solventem Fluorescenční charakteristiky fluoroforu se mohou měnit podle toho, jaké je jeho okolí změna kvantového výtěžku posun excitačního či emisního spektra
VíceMetody pro studium pevných látek
Metody pro studium pevných látek Metody Metody termické analýzy Difrakční metody ssnmr Predikce krystalových struktur Metody termické analýzy Termogravimetrie (TG) Diferenční TA (DTA) Rozdíl teplot mezi
VíceLaboratoř NMR Strukturní analýza a 2D NMR spektra
Laboratoř NMR Strukturní analýza a 2D NMR spektra Místo: Laboratoř NMR, místnost A28, Kontakt: doc. Ing. Bohumil DOLENSKÝ, Ph.D., Ústav analytické chemie, Vysoká škola chemicko-technologická, Technická
VíceVybrané kapitoly z praktické NMR spektroskopie
Vybrané kapitoly z praktické NMR spektroskopie DRX 500 Avance SPECTROSPIN 500 Způsob snímání dat, CW versus FT CW frekvence RF záření postupně se mění B eff 2 efektivní magnetické pole zůstává konstantní
VíceDiskutujte, jak široký bude pás spojený s fosforescencí versus fluorescencí. Udělejte odhad v cm -1.
S použitím modelu volného elektronu (=částice v krabici) spočtěte vlnovou délku a vlnočet nejdlouhovlnějšího elektronového přechodu u molekuly dekapentaenu a oktatetraenu. Diskutujte polohu absorpčního
VíceAutor: martina urbanová, jiří brus. Základní experimentální postupy NMR spektroskopie pevného stavu
Autor: martina urbanová, jiří brus Základní experimentální postupy NMR spektroskopie pevného stavu Obsah přednášky anizotropní interakce v pevných látkách techniky rušení anizotropie jaderných interakcí
VíceVyužití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice. Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň
Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň Osnova Podstata nukleární magnetické rezonance (MR) Historie vývoje MR Spektroskopie MRS Tomografie MRI
VíceTypy molekul, látek a jejich vazeb v organismech
Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech Organismy se skládají z molekul rozličných látek Jednotlivé látky si organismus vytváří sám z jiných látek,
VíceZobrazování. Zdeněk Tošner
Zobrazování Zdeněk Tošner Ultrazvuk Zobrazování pomocí magnetické rezonance Rentgen a počítačová tomografie (CT) Ultrazvuk Akustické vlnění 20 khz 1 GHz materiálová defektoskopie sonar sonografie (v lékařství
VíceAnizotropie fluorescence
Anizotropie fluorescence Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 6 1 Jev anizotropie Jestliže dochází k excitaci světlem kmitajícím v jedné rovině, emise fluorescence se často
VíceMolekulární krystal vazebné poměry. Bohumil Kratochvíl
Molekulární krystal vazebné poměry Bohumil Kratochvíl Předmět: Chemie a fyzika pevných léčiv, 2017 Složení farmaceutických substancí - API Z celkového portfolia API tvoří asi 90 % organické sloučeniny,
VíceMagnetická rezonance (3)
Magnetická rezonance (3) J. Kybic, J. Hornak 1, M. Bock, J. Hozman 2008 2018 1 http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/ MRI zobrazovací techniky Multislice imaging Šikmé zobrazování Spinové echo Inversion recovery
VíceOpakování
Slabé vazebné interakce Opakování Co je to atom? Opakování Opakování Co je to atom? Atom je nejmenší částice hmoty, chemicky dále nedělitelná. Skládá se z atomového jádra obsahujícího protony a neutrony
VíceJiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)
Jiří Brus (Verze 1.0.1-2005) (neupravená a neúplná) Ústav makromolekulární chemie AV ČR, Heyrovského nám. 2, Praha 6 - Petřiny 162 06 e-mail: brus@imc.cas.cz I v roztoku probíhá řada experimentů tak že,
VíceMagnetická rezonance (3)
Magnetická rezonance (3) J. Kybic, J. Hornak 1, M. Bock, J. Hozman April 28, 2008 1 http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/ MRI zobrazovací techniky Multislice imaging Šikmé zobrazování Spinové echo Inversion
VíceJiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)
Jiří Brus (Verze 1.0.1-2005) (neupravená a neúplná) Ústav makromolekulární chemie AV ČR, Heyrovského nám. 2, Praha 6 - Petřiny 162 06 e-mail: brus@imc.cas.cz Na konci devadesátých let minulého století
VícePříloha-výpočet motoru
Příloha-výpočet motoru 1.Zadané parametry motoru: vrtání d : 77mm zdvih z: 87mm kompresní poměr ε : 10.6 atmosférický tlak p 1 : 98000Pa teplota nasávaného vzduchu T 1 : 353.15K adiabatický exponent κ
VíceChemická výměna. K ex K B
Chemická výměna K ex K B Vliv chemické výměny na NMR spektrum Pomalá vs. rychlá chemická výměna Metody měření rychlosti chemické výměny a příklady: Dynamická NMR a příklad EXY a příklady Chemická výměna
VícePřednáška IX: Elektronová spektroskopie II.
Přednáška IX: Elektronová spektroskopie II. 1 Försterův resonanční přenos energie Pravděpodobnost (rychlost) přenosu je určená jako: k ret 1 = τ 0 D R r 0 6 0 τ D R 0 r Doba života donoru v excitovaném
VícePrověřování Standardního modelu
Prověřování Standardního modelu 1) QCD hluboce nepružný rozptyl, elektron (mion) proton, strukturní funkce fotoprodukce γ proton produkce gluonů v e + e produkce jetů, hadronů 2) Elektroslabá torie interference
VíceRelaxace jaderného spinu
Relaace jaderného spinu ecitace relaace Relaační dob Metod měření relaačních dob Relaační mechanism Dipól-dipólová relaace Nukleární verhauserův efekt Příklad dnamika trisacharidu Relaační jev Relaace
VíceJiří Brus. (Verze ) (neupravená a neúplná)
Jiří Brus (Verze 1.0.1-2005) (neupravená a neúplná) Vodík-vodíkový korelační dvou-dimenzionální experiment byl prvně navržen Jeanem Jeenerem na letní škole v Basko Polje už v roce 1971. Po pěti letech
VíceStereochemie 7. Přednáška 7
Stereochemie 7 Přednáška 7 1 ptická čistota p = [ ]poz [ ]max x 100 = ee = [R] - [S] [R] + [S] x 100 p optická čistota [R], [S] molární frakce R a S enantiomerů ee + 100 %R = ee + %S = ee + 100 - %R =
VíceStředoškolská odborná činnost 2005/2006
Středoškolská odborná činnost 2005/2006 Obor 3 - chemie Autor: Martin Hejda MSŠCH, Křemencova 12 116 28 Praha 1, 3. ročník Zadavatel a vedoucí práce: Mgr. Miroslav Kašpar CSc. Fyzikální ústav AVČR Na Slovance
VíceNUKLEÁRNÍ MAGNETICKÁ REZONANCE
NUKLEÁRNÍ MAGNETICKÁ REZONANCE NMR spektrometrie PRINCIP NMR Jsou-li atomová jádra některých prvků v externím magnetickém poli vystavena vysokofrekvenčnímu elmag. záření, mohou absorbovat záření určitých.
VíceZákladní parametry 1 H NMR spekter
LEKCE 6 Základní parametry 1 NMR spekter Počet signálů ve spektru (zjištění počtu skupin chemicky ekvivalentních jader) Integrální intenzita (intenzita pásů závisí na počtu jader) Chemický posun (polohy
VíceSymetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)*
Základní parametry 1 NMR spekter NMR a chiralita, posunová činidla Symetrie v NMR spektrech: homotopické, enantiotopické, diastereotopické protony (skupiny)* 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 Základní parametry 1 NMR
Více(9) X-X a X-Y korelace zvýšení spektrálního rozlišení
(9) X-X a X-Y korelace zvýšení spektrálního rozlišení 90 ±y 1 H: CP Decoupling (TPPM) 13 C: 180 t t t 1 180 t t Acquisition t 2 ppm 6 1 11 15 17 9 5 3 4 13 2 19 7 140 6/ 7 7/ 6 160 180 200 220 240 260
Vícejako modelové látky pro studium elektronických vlivů při katalytických hydrogenacích
Pt(0) komplexy jako modelové látky pro studium elektronických vlivů při katalytických hydrogenacích David Karhánek Školitelé: Ing. Petr Kačer, PhD.; Ing. Marek Kuzma Katalytické hydrogenace eterogenní
VíceKovy - model volných elektronů
Kovy - model volných elektronů Kovová vazba 1. Preferuje ji většina prvků vyskytujících se v přírodě. Kov je tvořen kladně nabitými ionty (s konfigurací vzácného plynu) a relativně velmi volnými elektrony.
VíceProgram. Materiály ke studiu NMR. Data, Soubory. Seminář z Analytické chemie B. \\PYR\SCRATCH\
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Seminář z Analytické chemie B Tento materiál vznikl za podpory projektu CHEMnote PPA CZ..7/../48 Inovace bakalářského studijního programu
VíceNáboj a hmotnost elektronu
1911 změřil náboj elektronu Pomocí mlžné komory q = 1.602 177 10 19 C Náboj a hmotnost elektronu Elektrický náboj je kvantován, Každý náboj je celistvým násobkem elementárního náboje (elektronu) z hodnoty
Více10A1_IR spektroskopie
C6200-Biochemické metody 10A1_IR spektroskopie Petr Zbořil IR spektroskopie Excitace vibračních a rotačních přechodů Valenční vibrace n Deformační vibrace d IR spektroskopie N atomů = 3N stupňů volnosti
VíceChemická vazba. Molekula vodíku. Elektronová teorie. Oktetové pravidlo (Kossel, Lewis, 1916) Pevnost vazby vazebná energie.
Elektronová teorie ktetové pravidlo (Kossel, Lewis, 1916) Chemická vazba sdílení 2 valenčních e - opačného spinu 2 atomy za vzniku stabilní elektronové konfigurace vzácného plynu Spojení atomů prvků v
VíceP ro te i n o vé d a ta b á ze
Proteinové databáze Osnova Základní stavební jednotky proteinů Hierarchie proteinové struktury Stanovení proteinové struktury Důležitost proteinové struktury Proteinové strukturní databáze Proteinové klasifikační
VíceJiří Brus. (Verze 1.0.1-2005) (neupravená a neúplná)
Jiří Brus (Verze 1.0.1-2005) (neupravená a neúplná) Ústav makromolekulární chemie AV ČR, Heyrovského nám. 2, Praha 6 - Petřiny 162 06 e-mail: brus@imc.cas.cz Na konci 80 a začátkem 90-tých let se v NMR
Vícedoc. Ing. Richard Hrabal, CSc. Ing. Hana Dvořáková, CSc. doc. RNDr. Jan Lang, PhD. Ing. Jan Prchal, Ph.D.
Vyučující: doc. Ing. Richard rabal, CSc. Ing. ana Dvořáková, CSc. doc. RNDr. Jan Lang, PhD. Ing. Jan Prchal, Ph.D. Číslo dveří A 42, telefon 3805, e-mail hrabalr@vscht.cz Termín: každý čtvrtek od 10,00
VíceFyzika IV. 1) orbitální magnetický moment (... moment proudové smyčky) gyromagnetický poměr: kvantování: Bohrův magneton: 2) spinový magnetický moment
λ=21 cm 1) orbitální magnetický moment (... moment proudové smyčky) μ I S gyromagnetický poměr: kvantování: Bohrův magneton: 2) spinový magnetický moment 2 Zeemanův jev - rozštěpení spektrálních čar v
Více4. Stanovení teplotního součinitele odporu kovů
4. Stanovení teplotního součinitele odporu kovů 4.. Zadání úlohy. Změřte teplotní součinitel odporu mědi v rozmezí 20 80 C. 2. Změřte teplotní součinitel odporu platiny v rozmezí 20 80 C. 3. Vyneste graf
VíceOptické spektroskopie 1 LS 2014/15
Optické spektroskopie 1 LS 2014/15 Martin Kubala 585634179 mkubala@prfnw.upol.cz 1.Úvod Velikosti objektů v přírodě Dítě ~ 1 m (10 0 m) Prst ~ 2 cm (10-2 m) Vlas ~ 0.1 mm (10-4 m) Buňka ~ 20 m (10-5 m)
Vícedoc. Ing. Richard Hrabal, CSc.
doc. Ing. Richard rabal, CSc. NMR laboratoř, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, číslo dveří 42 telefon 220 443 805, e-mail hrabalr@vscht.cz) 15. říjen 2015 základy NMR spektroskopie přístrojové
VíceRelaxace II. a chemická výměna
Relaxace II. a chemická výměna excitace relaxace Relaxační mechanismy pokračování Dipól-dipólová relaxace Nukleární verhauserův efekt+ příklady hemická výměna + příklady Kvadrupolární interakce Multipólový
VíceMolekulární dynamika vody a alkoholů
Molekulární dynamika vody a alkoholů Pavel Petrus Katedra fyziky, Univerzita J. E. Purkyně, Ústí nad Labem 10. týden 22.4.2010 Modely vody SPC SPC/E TIP4P TIP5P Modely alkoholů OPLS TraPPE Radiální distribuční
Více