Taxonomie rodu Lactobacillus Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14 602 00 Brno
rod Lactobacillus charakteristika Beijerinck 1901 Beijerinck, M. W. (1901). Anhäufungsversuche mit Ureumbakterien: Ureumspaltung durch Urease und durch Katabolismus. Zentralbl. Bakteriol. Parasitenkde. Infektionskrankh. Hyg. Abt. 2. 7, 33 61. grampozitivní, nesporulující negativní kataláza (pseudokataláza)
rod Lactobacillus buněčná morfologie
rod Lactobacillus metabolismus Fermentativní metabolismus -homofermentativní hexósy (> 85 %) kys. mléčná -heterofermentativní hexósy kys. mléčná + CO 2 + ethanol Klasické dělení do podrodů dnes neplatné Thermobacterium homoferm., -, 15 a 20 C; +, 45 C Streptobacterium homoferm., +, 15 a 20 C; -, 45 C Betabacterium heterofermentativní
rod Lactobacillus členění rodu obligátně homofermentativní hexósy kys. mléčná; nefermentují pentózy ani glukonát L. acidophilus, L. crispatus, L. delbrueckii, L. gasseri, L. johnsonii, L. salivarius fakultativně heterofermentativní hexósy kys. mléčná; pentózy kys. mléčná a octová plyn zglukonátu ale ne zglukózy L. casei, L. curvatus, L. paracasei, L. pentosus, L. plantarum, L. rhamnosus obligátně heterofermentativní hexósy kys. mléčná +ethanol +CO 2 plyn zglukózy ipentóz L. brevis, L. buchneri, L. fermentum, L. kefir, L. panis, L. reuteri, L. vaginalis
rod Lactobacillus fylogenetická pozice Planctomycetes Spirochetes Chlamydia Fibrobacter Proteobacteria Green Sulfur Bacteria Cytophaga/Flavobacterium/Bacteroides Cyanobacteria Gram-positive Bacteria high G+C Fusobacteria Nitrospira Gram-positive Bacteria low G+C Deinococci 10 % Green nonsulfur Bacteria Thermotogales grampozitivní bakt. snízkým obsahem G+C obsah GC vdna32 55 % Aquifex
rod Lactobacillus fylogenetická pozice Oenococcus Leuconostoc Streptococcus Lactococcus Weissella Lactobacillus Pediococcus Enterococcus Vagococcus Carnobacterium Lactosphaera Alloiococcus Dolosigranulum Aerococcus Propionibacterium Bifidobacterium 10 %
rod Lactobacillus fylogenetická pozice L. delbrueckii group L. salivarius group L. buchneri group L. perolens L. brevis L. bifermentans L. coryniformis Pediococcus dextrinicus Pediococcus L. plantarum group L. sakei group L. casei group L. reuteri group Weissella Leuconostoc 10 %
rod Lactobacillus charakteristika bohatá kultivační média - uhlovodíky,aminokyseliny,peptidy,vitamíny, - ph 4,5 6,2 - MRS, SL,APT, aerotolerantní,mikroaerofilní, anaerobní velmi početný rod typový druh Lactobacillus delbrueckii
rod Lactobacillus -103 validně popsaných druhů L. acetotolerans L. acidifarinae L. acidipiscis L. acidophilus L. agilis L. algidus L. alimentarius L. amylolyticus L. amylophilus L. amylovorus L. animalis L. antri L. arizonensis L. aviarius L. aviarius subsp. araffinosus subsp. aviarius L. bifermentans L. brevis L. buchneri L. casei L. catenaformis L. coleohominis L. collinoides L. coryniformis subsp. coryniformis subsp. torquens L. crispatus L. curvatus L. cypricasei L. coleohominis L. collinoides L. coryniformis subsp. coryniformis subsp. torquens L. crispatus L. curvatus L. cypricasei L. delbrueckii subsp. bulgaricus subsp. delbrueckii subsp. indicus subsp. lactis L. diolivorans L. durianis L. equi L. farciminis L. ferintoshensis L. fermentum L. fornicalis L. fructivorans L. frumenti L. fuchuensis L. gallinarum L. gasseri L. gastricus L. graminis L. hammesii L. hamsteri L. helveticus L. heterohiochii L. hilgardii L. homohiochii L. iners L. ingluviei L. intestinalis L. jensenii L. johnsonii L. kalixensis L. kefiranofaciens subsp. kefiranofaciens subsp. kefirgranum L. kefiri L. kimchii L. kitasatonis L. kunkeei L. leichmannii L. lindneri L. malefermentans L. manihotivorans L. mindensis L. mucosae L. murinus L. nagelii L. oris L. panis L. pantheris L. parabuchneri L. paracasei subsp. paracasei subsp. tolerans L. paracollinoides L. parakefiri L. paralimentarius L. paraplantarum L. pentosus L. perolens L. plantarum L. pontis L. psittaci L. reuteri L. rhamnosus L. rogosae L. rossii L. ruminis L. saerimneri L. sakei subsp. carnosus subsp. sakei L. salivarius L. sanfranciscensis L. satsumensis L. sharpeae L. spicheri L. suebicus L. suntoryeus L. thermotolerans L. trichodes L. ultunensis L. vaccinostercus L. vaginalis L. versmoldensis L. vitulinus L. zeae L. zymae
rod Lactobacillus identifikace biochemickýpřístup fi problematický -vysoký počet druhů, variabilní reakce -druhy biochemicky neodlišitelné L. acidifarinae xl. zymae -typ peptidoglykanu, isomery kys. mléčné
rod Lactobacillus identifikace molekulární metody -%G+C -sekvence genu pro 16S rrna L. plantarum, L. pentosus a L. paraplantarum (99,7 99,9%) L. kimchii a L. paralimentarius (99,9 %); L. mindensis a L. farciminis (99,9 %) -16S rrna fi hybridizační apcr metody -ribotypizace,aflp (amplified fragment length polymorphism) - rep-pcr, RAPD (random amplified polymorphic DNA) -DNA-DNAhybridizace -celkové buněčné proteiny SDS-PAGE
rod Lactobacillus výskyt humánní materiál -ústní dutina -trávící trakt -vagina další zdroje -živočichové (savci, ptáci, hmyz) -potraviny (fermentované výrobky,mléko, maso, zelenina) -rostliny arostlinný materiál (siláž) -půda, odpadní voda, hnůj
rod Lactobacillus význam pozitivní -fermentované potraviny (přirozeně,startovací kultury) (mléčné výrobky,ovoce azelenina, maso, ) - probiotika -antibakteriální efekt (redukce ph, bakteriociny) -fermentace rostlinných zbytků vpřírodě negativní -kažení potravin (pivo, víno, ovoce, mléko, maso, ryby ) -klinický význam (zubní kaz, sepse, abscesy )
rod Lactobacillus nové druhy International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology -leden a březen 2005 - Lactobacillus gastricus sp. nov., Lactobacillus antri sp. nov., Lactobacillus kalixensis sp. nov. and Lactobacillus ultunensis sp. nov., isolated from human stomach mucosa. Lactobacillus acidifarinae sp. nov. and Lactobacillus zymae sp. nov., from wheat sourdoughs. Lactobacillus hammesii sp. nov., isolated from French sourdough. Lactobacillus delbrueckii subsp. indicus subsp. nov., isolated from Indian dairy products. Lactobacillus satsumensis sp. nov., isolated from mashes of shochu, a traditional Japanese distilled spirit made from fermented rice and other starchy materials. Lactobacillus rossii sp. nov., isolated from wheat sourdough. Lactobacillus suntoryeus sp. nov., isolated from malt whisky distilleries.
DĚKUJI VÁM ZA POZORNOST