SBTengine Návod k použití M14003 GenDx Tel.: +31 302 523 799 E-mail: info@gendx.com Web: www.gendx.com Adresa: Yalelaan 48 3584 CM Utrecht Nizozemí M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 1
1 Zamýšlené použití SBTengine je softwarový balíček pro analýzu sekvence DNA, který slouží k identifikaci alel antigenů lidských leukocytů (HLA) s vysokým rozlišením. Sekvence jsou získány prostřednictvím reagentů pro typizaci založené na sekvenaci HLA (SBT). Softwarový balíček SBTengine je určen k diagnostickému použití in vitro odborným zdravotnickým personálem, jako jsou laboranti a lékaři, kteří jsou schopni pracovat podle specifikací EFI nebo ASHI nebo jsou vyškoleni v typizaci HLA a sekvenaci DNA v diagnostických laboratořích s akreditací EFI nebo ASHI. 1.1 Vysvětlení symbolů Výrobce Číslo materiálu Diagnostický zdravotnický prostředek in vitro Pozorně si přečtěte návod k použití 1.2 Omezení používání výrobku Pro zajištění maximální funkčnosti program SBTengine používejte na systému splňujícím minimální požadavky (viz kapitola 2.1 "Systémové požadavky"). Je třeba zdůraznit, že nesprávné použití filtrů a funkcí v rámci programu SBTengine může vést ke změnám v generovaných datech. Aktualizace programu slouží mimo jiné k tomu, aby bylo zajištěno použití nejaktuálnější referenční databáze. Velmi se tedy doporučuje aktualizovat program s každou novou edicí. Přiřazení možného genotypu/možných genotypů se může lišit, pokud jsou data analyzována jinými edicemi programu. SBTengine je diagnostický zdravotnický prostředek in vitro (IVD). Vygenerovaná data musí zkontrolovat kvalifikovaný zdravotnický pracovník, jako je laborant a lékař, který je vyškolen v typizaci HLA a sekvenaci DNA v diagnostické laboratoři s akreditací EFI nebo ASHI nebo je schopen pracovat podle specifikací EFI nebo ASHI. Data vygenerovaná programem SBTengine neposkytují konečné rozhodnutí ani diagnózu v jakékoli formě. Nesprávné použití programu SBTengine zahrnující mimo jiné také neautorizované změny referenční databáze, neplatnou licenci k programu atd. mohou vést k závažným změnám, které společnost GenDx nepodporuje ani za ně nemůže nést odpovědnost. Změny mohou mimo jiné způsobit chybnou analýzu dat, problémy s akreditací, regulatorní problémy a neúplné uložení dat. 1.3 Technická podpora Zákazníci společnosti GenDx Budete-li potřebovat technickou podporu a další informace, obraťte se na místního distributora společnosti GenDx (www.gendx.com) nebo na pracovníky technické podpory společnosti GenDx na support@gendx.com nebo na tel. čísle +31 (0)30-252-3799. Zákazníci společnosti Abbott Budete-li potřebovat technickou podporu a další informace, obraťte se na pracovníky technické podpory společnosti Abbott Molecular na tel. čísle 1-800-5537042 (v USA) nebo na tel. čísle +49-6122-580 (mimo USA) nebo navštivte webové stránky Abbott Molecular http://www.abbottmolecular.com. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 2
2 Instalace programu SBTengine a licence 2.1 Systémové požadavky Minimální systémové požadavky Windows Vista, Windows 7 2 GB RAM 80 MB volného prostoru na disku Síťové připojení umožňující přenos TCP/IP do portu 3500 a z něho Microsoft.NET framework 2.0 Doporučené systémové parametry Windows 7 2 GB RAM Internetové připojení pro ověření licence a automatické aktualizace 250 MB volného prostoru na disku Microsoft.NET framework 2.0 M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 3
2.2 Návod k instalaci 2.2.1 Návod k instalaci programu a licence Pokud máte starší verzi programu SBTengine, nejprve ji odinstalujte prostřednictvím řídícího panelu. Také je třeba odstranit licenční soubor licence.ldf (tento soubor se používal s předchozí licencí). Pokud používáte systém Windows XP, tento soubor je umístěn v C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\GenDx\Shared\Licensing. Ve všech jiných verzích systému Windows lze tento soubor najít v C:\ProgramData\GenDx\Shared\Licensing. 1. Program SBTengine instalujte pomocí odkazu, který dostanete od pracovníka vaší technické podpory. 2. Soubor SBTengine.zip rozbalte a instalujte program. Postupujte podle pokynů na obrazovce. Program SBTengine se poté automaticky spustí. 3. Při prvním použití programu SBTengine budete vyzváni k zadání licenčního aktivačního klíče, který jste dostali od společnosti GenDx. Pokud aktivační klíč nemáte, obraťte se na pracovníka vaší technické podpory. 4. Při prvním spuštění vás program vyzve k zadání uživatelského jména a hesla. K tomu musíte použít administrátorské nastavení. Uživatel: admin Heslo: GenDx (rozlišuje malá a velká písmena!) 5. Klepněte na [Administration (Správa)]: 6. Nyní můžete přidat nové uživatele, provést úpravy u současných uživatelů a přidělit úrovně pro úpravy/revize. (v části 2.2.2 je popis hierarchie úrovní oprávnění). Po přidání všech uživatelů klepněte na Quit (Ukončit). 7. Program SBTengine zavřete. 8. Program znovu otevřete a přihlaste se jako uživatel. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 4
2.2.2 Hierarchie úrovní oprávnění Při prvním spuštění vás program vyzve k zadání uživatelského jména a hesla. K tomu musíte použít administrátorské nastavení. Uživatel: admin Heslo: GenDx (rozlišuje malá a velká písmena!) Nyní můžete přidat nové uživatele, provést úpravy u současných uživatelů a přidělit úrovně pro úpravy/revize. Program SBTengine podporuje 3 úrovně pověření, "Administrátor", "První revidující" a "Konečný revidující". 1. Administrátor (admin) Administrátorovi (admin) se nezobrazují žádná data. Administrátor (admin) může pouze vytvořit uživatelské účty a definovat (nebo změnit) úroveň oprávnění každého uživatele. 2. První revidující První revidující může analyzovat, upravovat a schvalovat všechna surová data, která ještě nebyla schválena. První revidující také může analyzovat, upravovat a schvalovat všechna surová data, která již byla schválena jinými prvními revidujícími (včetně něho). Uživatel pracuje na dvou úrovních: - "Pracovní složka" je v podstatě pracovní seznam příslušného dne, který umožňuje přístup ke všem surovým datům. Po schválení je úroveň pověření u dat zvýšena na úroveň konečného revidujícího. - Úroveň "Schváleno" zpřístupňuje všechna data, která byla schválena všemi prvními revidujícími uživateli. Díky tomu lze kontrolovat a upravovat data schválená příslušným uživatelem a také všemi uživateli se stejnou úrovní pověření. 3. Konečný revidující Konečný revidující může analyzovat, upravovat a schvalovat všechna data, která byla schválena prvními revidujícími. Konečný revidující také může analyzovat, upravovat a schvalovat všechna data, která byla schválena jinými konečnými revidujícími (včetně něho). Uživatel pracuje na dvou úrovních: - "Pracovní složka" je v podstatě pracovní seznam příslušného dne, který obsahuje všechna data schválená prvními revidujícími. - Úroveň "Schváleno" zpřístupňuje všechna data, která byla schválena kterýmkoli z konečných revidujících uživatelů. Díky tomu lze kontrolovat a upravovat data schválená příslušným uživatelem a také všemi uživateli se stejnou úrovní pověření. Přehled úrovní je v následujícím schématu: Administrátor (Administrator): Může vytvořit pouze uživatelské účty a definovat/měnit úrovně oprávnění. Nemá přístup k žádným sekvenčním Tok dat Schválit Přístup k datům Úroveň pověření uživatele: První revidující (First reviewer) Konečný revidující (Final reviewer) Úro veň přístupu: Pracovní seznam pro prvního revidujícího Surová data Schválil Pracovní První revidující seznam pro Schválená data (prvním revidujícím) Schválil Konečný revidující Finálně schválená data M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 5
2.2.3 Instalace licence k programu SBTengine na počítačích bez přístupu na internet Při instalaci programu SBTengine na počítači bez přístupu na internet postupujte následovně: 1. Otevřete program SBTengine. Objeví se tato obrazovka pro aktivaci licence: 2. Pokud není detekováno připojení na internet, objeví se následující obrazovka. 3. Pokud počítač nemá přístup na internet, klepněte na No (Ne). 4. Poté se objeví další obrazovka s identifikačním číslem počítače (ID) vygenerovaným programem SBTengine (sestává z názvu počítače a náhodného specifického klíče příslušného počítače). 5. Pokud se identifikační číslo počítače (ID) neukáže, klepněte na tlačítko "Offline Activation (Aktivace offline)" na této kartě: M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 6
6. Identifikační číslo počítače (ID) zkopírujte. 7. Jděte na počítač s přístupem na internet. 8. Otevřete prohlížeč a zadejte: https://quicklicensemanager.com/gendx/sql2/qlmasplicensesite/qlmwebactivation.aspx 9. Objeví se tento formulář: 10. Do pole "Activation Key (Aktivační klíč)" zadejte klíč, který vám došel v e-mailové zprávě. 11. Do pole "Computer ID (ID počítače)" zadejte klíč, který byl vygenerován programem SBTengine. 12. Klepněte na tlačítko Activate (Aktivovat). 13. V poli "Licence Key (Licenční klíč)" se objeví klíč, který můžete použít pro aktivaci programu SBTengine. Tento klíč zkopírujte. 14. Vraťte se zpět k počítači, na kterém chcete instalovat program SBTengine. 15. Vygenerovaný licenční klíč zadejte do dolní části obrazovky pro aktivaci licence programu SBTengine. 16. Klepněte na tlačítko Activate (Aktivovat). 17. Nyní můžete program SBTengine začít používat. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 7
3 Pracovní tok SBTengine Pracovní tok SBTengine lze rozdělit do těchto kroků: Pojmenování vzorků (3.1) Import sekvenačních souborů a výběr vzorků (3.2) Analýza dat (3.3) 1. krok: Odstranění rozdílů zarovnání (3.3.1) 2. krok: Odstranění rozdílů mezi stopami (3.3.2) Schválení výsledků (3.4) 3. krok: Kontrola/modifikace kritických poloh (3.3.3) Hlášení výsledků (3.5) 3.1 Pojmenování vzorků Než bude možné analyzovat soubory ABI sekvence (*.ab1) pomocí programu SBTengine, pro každý soubor ABI sekvence je třeba definovat vzorek a lokus. Doporučujeme používat následující formát pro pojmenování vzorků: Název vzorku_lokus_exon a sekvenované vlákno s tím, že jednotlivé položky jsou odděleny podtržítkem. Program SBTengine díky tomu bude schopen automaticky určit název vzorku a lokus pro každou stopu. Například název souboru: DNA1_HLA-C_Ex5F_dalšíinformace.ab1: Název vzorku: Lokus: DNA1 HLA-C Sekvenované vlákno: Exon 5 Forward Další informace: Závisí na nastavení sekvenátoru (zanedbáno pro účely pojmenování programem SBTengine ) Používá-li se GSSP, místo sekvenovaného vlákna přidejte označení GSSP. Například název souboru: DNA1_HLA-C_C16_dalšíinformace.ab1: Název vzorku: Lokus: Označení GSSP: Další informace: DNA1 HLA-C Stopa je získána prostřednictvím C16 GSSP Závisí na nastavení sekvenátoru (zanedbáno pro účely pojmenování programem SBTengine ) Program SBTengine poté automaticky přečte vzorky. Pro pojmenování vzorku a lokusu lze použít jiná pravidla. Projděte si prosím glosář v programu SBTengine (automatický název/přiřazení lokusu nebo ruční název/přiřazení lokusu) a zjistěte, jak to lze provést, případně se obraťte na pracovníky vaší technické podpory. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 8
3.2 Import sekvenčních souborů do programu SBTengine a výběr vzorků Doporučujeme uložit sekvenční data do vyhrazené složky pro analýzu pomocí SBTengine (např. SBTdata). Jsou-li vaše počítače síťově propojené, doporučujeme uložit sekvenční data na server pro soubory, který je přístupný z pracovní stanice s instalovaným programem SBTengine. Zajistěte pravidelné zálohování z vašeho počítače, abyste zabránili náhodné ztrátě dat. Poznámka: Bez ohledu na to, zda používáte či nepoužíváte počítač připojený k síti, v této příručce je složka obsahující sekvenační soubory označována jako složka "SBTdata". 3.2.1 Import hlavních sekvenačních souborů do programu SBTengine a výběr vzorků 1. Pro dokončení sekvenačního běhu budete muset zkopírovat celou složku s během ze sekvenačního počítače do složky SBTdata. 2. Program SBTengine musí znát umístění složky SBTdata. Toto nastavení je třeba provést pouze jednou při instalaci programu SBTengine. Chcete-li to udělat, spusťte program SBTengine, přejděte do okna Sample Management (Správa vzorků) a vyberte složku SBTdata v levém podokně (1). NEVYBÍREJTE složku s během, protože program SBTengine by mohl zkombinovat data z několika složek s běhy. 3. V prostředním podokně (2) se objeví všechny sekvenční soubory ve složkách s běhy, které byly zkopírovány do složky SBTdata. Program SBTengine zaznamená všechny sekvenční soubory ve složce SBTdata a všech podsložkách. Sekvenční soubory umístěné hlouběji ve složce SBTdata nejsou detekovány. 4. Přehled sekvenčních souborů je uveden v pravém podokně (3): pro každý název vzorku je uveden počet souborů s ABI sekvencí na jeden lokus HLA. 5. Klepnete-li na tlačítko "Refresh (Obnovit)" (4) v dolní části pravého podokna, obnoví se okno Sample Management (Správa vzorku). Toto je užitečné zvláště v případě, kdy jsou doplněny nové složky s během za současného spuštění programu SBTengine. Seznam se automaticky aktualizuje při každém spuštění programu SBTengine. 6. Pomocí tlačítka "Advanced File Management (Pokročilá správa souboru)" (5) se můžete dostat k sekvenčním souborům v prohlížeči Windows Explorer. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 9
3.3 Analýza dat v programu SBTengine Analýza sekvenčních souborů se provádí v okně Sequence Overview (Přehled sekvencí) pomocí těchto tří hlavních kroků: 1) Odstranění rozdílů zarovnání 2) Odstranění rozdílů mezi sekvenčními stopami 3) Kontrola/modifikace kritických poloh 3.3.1 1. krok: Odstranění rozdílů zarovnání Vyberte vzorek a lokus HLA, který chcete analyzovat. Všechny ABI sekvenční soubory vybraného vzorku se poté načtou a zarovnají s databází IMGT/HLA. Určité polohy v sekvenci vzorku, které se neshodují s databází IMGT/HLA, se označují jako rozdíly zarovnání. Tyto rozdíly obecně odrážejí chybný překlad píků na jednotlivé báze v programu SBTengine kvůli nedostatečné kvalitě sekvence v těchto polohách. (Je třeba zdůraznit, že rozdíl zarovnání může být ve vzácných případech způsoben přítomností nové alely. V případě jakýchkoli pochybností se obraťte na pracovníky technické podpory). Rozdíly je třeba vyřešit před tím, než budete moci pokračovat v analýze. Program SBTengine zobrazí počet rozdílů v okně napravo od sekvenčních stop (1). V tomto případě databáze IMGT/HLA ukazuje, že v poloze 508 (2) exonu HLA-A Exon 3 by měl být přítomen [A], zatímco program SBTengine určil [M] ([M] = [A] nebo [C] pomocí kódů IUPAC-IUB). Zpětný primer (reverse primer) ve spodní stopě jasně ukazuje [A] v poloze 508, což vám s jistotou umožní určit [A] na horní stopě primeru forward. Chcete-li tuto polohu opravit, klepněte na ni kurzorem myši nebo postupujte podle seznamu v pravém podokně přehledu sekvencí (3). Zvolená poloha je označena blikajícím kurzorem v sekvenční stopě. Pomocí klávesnice (4) zadejte správné určení báze (A, T, C nebo G) a stiskněte Enter. Po stisknutí klávesy Enter program SBTengine automaticky přejde na další rozdíl zarovnání, pokud nějaký existuje. Pokud už žádné rozdíly nejsou, program SBTengine ohlásí Alignments OK (Zarovnání OK) a automaticky přejde do 2. kroku procesu analýzy dat Resolving inconsistencies between sequence traces (Odstranění rozdílů mezi sekvenčními stopami). M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 10
3.3.2 2. krok: Odstranění rozdílů mezi sekvenčními stopami Mohou se vyskytnou také rozdíly mezi soubory stop, například mezi přímou (forward) a zpětnou (reverse) sekvencí. Program SBTengine tyto rozdíly označí vpravo na obrazovce, jak je uvedeno na obrázku níže. (1) Lze je upravit dle návodu v části 3.3.1 (1. krok: Odstranění rozdílů zarovnání). Po stisknutí klávesy Enter program SBTengine automaticky přejde na další rozdíl nebo k 3. kroku procesu analýzy: Checking/ Modification of Crucial Positions (Kontrola/ modifikace kritických poloh) M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 11
3.3.3 3. krok: Kontrola/ modifikace kritických poloh Dále budete muset zkontrolovat všechny kritické polohy (1) a ověřit, zda je určení báze v souladu se sekvenční stopou. Dle potřeby lze určení bází upravit. Program SBTengine dynamicky počítá kritické polohy a vytváří seznam všech poloh příslušných nukleotidů, které by, pokud by byly změněny, vedly k přiřazení jiné alely. Proto je velmi důležité zkontrolovat určení bází v těchto polohách ručně. Po vyhodnocení všech kritických poloh a po jednoznačném a správném určení všech poloh je přiřazení alely kompletní. Pro odstranění zbývajících nejednoznačností použijte GSSP navržené programem SBTengine (2). M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 12
Snížení pracovní zátěže Počet kritických poloh, které se mají zkontrolovat, může často překročit 100. Pro snížení pracovní zátěže lze vyzkoušet možnost Quality Value Filter (Filtr hodnoty kvality) (filtr QV). Pomocí tohoto filtru se odfiltrují píky vynikající kvality, u kterých má program SBTengine 100% jistotu, že byly správně určeny. Jak můžete vidět na obrázcích níže, je-li filtr QV vypnutý, je třeba zkontrolovat 140 kritických poloh (1). Je-li filtr QV zapnutý (2), počet kritických poloh, které je třeba zkontrolovat ručně, se dramaticky snížil na 12. 2 3.4 Schválení výsledků Když je proces přiřazení alely dokončen, první revidující může dokončit analýzu klepnutím na tlačítko [Approve (Schválit)] (vpravo dole). Jméno prvního revidujícího se automaticky objeví v poli [Approve (Schválit] (1) a dle potřeby lze doplnit komentář (2). 1 2 Jméno prvního revidujícího, který ověřil toto přiřazení alely, bude uloženo spolu s datem a přesným časem schválení. Konečný revidující (například vedoucí pracovník) se nyní může přihlásit a zkontrolovat analýzu a následně vzorek podruhé schválit. Jméno konečného revidujícího se také ve zprávě uloží spolu s datem a přesným časem. Další podrobnosti o prvním a konečném revidujícím jsou uvedeny v kapitole 2.2.2 Hierarchie úrovní oprávnění. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 13
Poté, co je přiřazení alely schváleno, se sekvenční soubory přesunou do složky archivu a je vytvořena zpráva XML. Zpráva XML je textový soubor, který má informace uložené v tagované struktuře. Soubor XML lze použít pro import informací o vzorku a přiřazení alely do různých programů (např. do systému LIMS) pro další zpracování. Program SBTengine vytvoří zprávu pro všechny schválené lokusy na kartě Typing Result (Výsledek typizace), které lze importovat do vámi zvoleného programu (např. Microsoft Word) a vytvořit dopis se zprávou pro kliniku. 3.4.1 Jak se dostat ke schváleným datům Pro přístup ke schváleným datům je třeba klepnout na tlačítko Approved (Schváleno), jak je znázorněno na následujícím obrázku: 3.4.2 Jak lze přidat další sekvenační soubor k již analyzovanému a schválenému vzorku Jestliže již bylo pro vzorek provedeno další sekvenování např. GSSP, sekvence je třeba zkombinovat s již schválenými daty vzorku. Provedete to tak, že zkopírujte složku běhu se sekvencemi GSSP do pracovní složky SBTdata. Otevřete program SBTengine a vyberte vzorek. Program SBTengine načte soubory GSSP a také automaticky obnoví všechny stopy v archivu. Analýza kombinovaných dat může změnit konečné přiřazení alely tím, že odstraní nejednoznačnosti genotypu nebo alely. Když je analýza provedena, je nutné ji znovu schválit. Nově přidané soubory se přesunou do archivní mapy a bude exportován soubor XML. Program SBTengine předpokládá, že poslední přiřazení alely bude nadřazené dřívějšímu. Starý soubor XML bude tedy automaticky přepsán. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 14
3.5 Hlášení výsledků V kartě Typing Result (Výsledek typizace) můžete najít karty "Typing result for current locus (Výsledek typizace pro aktuální lokus" a "Approved loci (Schválené lokusy)". Zde jsou k dispozici informace o všech vašich výsledcích typizace. Tyto zprávy lze vytisknout přímo nebo uložit ve formátu *.rtf (Rich Text File), klepnete-li na tlačítko Print (Tisk) nebo Save (Uložit) v dolní části okna. Uložíte-li zprávu jako soubor *.rtf, můžete ji otevřít v jakémkoli textovém editoru (např. Microsoft Word) a po doplnění vlastního záhlaví a dalšího textu vytvořit zprávu pro klinického lékaře. V textovém editoru můžete případně vytvořit makro, které tento proces zautomatizuje. Přečtěte si návod k používanému textovému editoru, kde je popsán způsob vytváření maker. 3.5.1 Výsledek typizace pro aktuální lokus V tomto okně je podrobný přehled stavu typizace aktuálního vzorku, tj. vzorku, který je právě načten v okně Sequence Overview (Přehled sekvence) (1). Pokud jsou přítomny nejednoznačnosti genotypu, o jednotlivých případech nejednoznačnosti můžete najít podrobné informace (2) a GSSP (3), které mohou nejednoznačnosti odstranit. Je třeba zdůraznit, že toto NENÍ zpráva pro schválené vzorky. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 15
3.5.2 Schválené lokusy V kartě Approved Loci (Schválené lokusy) (1) můžete formou zprávy najít informace o "aktuálním vzorku" stejně jako o "všech vzorcích", klepnete-li na příslušnou kartu (2). Zatímco si v kartě Current Sample (Aktuální vzorek) můžete prohlédnout zprávu pro vzorek, který se právě analyzuje v okně Sequence Overview (Přehled sekvence), prostřednictvím karty All Samples (Všechny vzorky) se dostanete do zprávy o všech již analyzovaných vzorcích. Vzorek můžete vybrat v rozbalovací nabídce (3). V obou kartách, Current Sample (Aktuální vzorek) a All Samples (Všechny vzorky) je k dispozici několik možností zobrazení (4), mezi nimiž lze přepínat v závislosti na požadavcích zprávy. Možnosti zobrazení, mezi nimiž lze přepínat, jsou následující: Přiřazení alely: Přehled přiřazení alely HLA pro každý schválený lokus Rozlišovací strategie: které GSSP by se měly použít Použité GSSP: které GSSP byly použity Zpráva NMDP: pro uživatele kódu NMDP M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 16
Zpráva skupiny P a G: Pro uživatele skupin P a G (pro zjednodušení hlášení nejednoznačných typizací alely) Schválení: přehled osob, které schválily přiřazení alel s uvedením jejich úrovně pověření a data a přesného času schválení. Uložena je každá akce schválení. Komentář: Jakékoli přidané komentáře při schvalování typizace Databáze: přehled použitých databází IMGT/HLA včetně počtu alel Přehled: v tomto přehledu je uvedeno, které informace o sekvenci byly použity pro přiřazení alely v každém lokusu. Šipky směřující vpřed a obráceně označují přímé (forward) a zpětné (reversed) sekvence. Žlutě je označena sekvence, která byla heterozygótní, zatímco červeně je označena homozygótní sekvence. Bližší informace o použití programu SBTengine můžete najít v nápovědě v glosáři programu SBTengine. M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 17
Distributor Zákazníci společnosti GenDX CE-IVD Čísla produktů a možnosti licence můžete najít na webových stránkách www.gendx.com GenDx Yalelaan 48 3584 CM Utrecht Nizozemí Seznam všech místních distributorů GenDx je k dispozici na www.gendx.com. Zákazníci společnosti Abbott CE IVD Číslo seznamu: 08N33-02 Číslo seznamu: 08N33-01 Abbott 1300 East Touhy Avenue Des Plaines, IL 60018 USA Autorizovaný zástupce Qarad b.v.b.a. Volmolenheide 19 B-2400 Mol, Belgie +32 (0)14-3238-99 Verze 1, 09/2013 Právní omezení Společnost Genome Diagnostics B.V. učinila maximum pro to, aby byl tento návod k použití co nejpřesnější. Společnost Genome Diagnostics B.V. se zříká právní odpovědnosti za jakékoli nepřesnosti a vynechání informací, k nimž mohlo dojít. Informace v tomto návodu k použití podléhají změnám bez upozornění. Společnost Genome Diagnostics B.V. na sebe nepřebírá žádnou odpovědnost za jakékoli nepřesnosti, které mohou být obsaženy v tomto návodu k použití. Společnost Genome Diagnostics B.V. si vyhrazuje právo provádět opravy tohoto návodu k použití a/nebo produktů popsaných v tomto návodu k použití kdykoli a bez upozornění. Copyright Tato publikace včetně všech fotografií a ilustrací je chráněna mezinárodním autorským právem s tím, že všechna práva jsou vyhrazena. Tento návod k použití ani jakýkoli materiál obsažený v tomto dokumentu nesmí být reprodukován bez písemného souhlasu autora. Copyright 2014 M-14003 SBTN-IFU-V1-2014-01 18